number organism aminoacid anticodon nucleotides
D00010948 Aeropyrum_pernix_K1 Val CAC -GGGCCCGTCGTCTAGCCTGGTT-AGGACGCCGCCCTCACACGGCGGAG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCGGGCCCACC-
D00003095 Archaeoglobus_fulgidus Val CAC -GGGCTCGTGGTCTAGT--GGTT-ATGACGCCTGCCTCACACGCAGGAG-------------------GTCCCCGGTTCGAATCCGGGCGAGCCCA---
D00010951 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Val CAC -GGGCTCGTGGTCTAGT--GGTT-ATGACGCCTGCCTCACACGCAGGAG-------------------GTCCCCGGTTCGAATCCGGGCGAGCCCA---
D00010954 Halobacterium_sp._NRC-1 Val CAC -GGGTCGGTGGTCTAGTCCGGTT-ATGACGGCTCCTTCACACGGAGCAG-------------------GTCGGCGGTTCAACTCCGCCCCGACCCA---
D00003098 Methanocaldococcus_jannaschii Val CAC -GGGCTCGTGGTCTAGT--GGCT-ATGACGCCGCCCTCACAAGGCGGTG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGCCGAGCCCA---
D00010960 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Val CAC -GGGCTCGTGGTCTAGT--GGCT-ATGACGCCGCCCTCACAAGGCGGTG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGCCGAGCCCACC-
D00011923 Methanosarcina_acetivorans_C2A Val CAC -GGGCTCGTGGTCTAGAC-GGTT-ATGACGTCGCCTTCACACGGCGGAG-------------------GTCCTGAGTTCGAATCTCAGCGGGCCCA---
D00011035 Methanosarcina_mazei_Go1 Val CAC -GGGCTCGTGGTCTAGAC-GGTT-ATGACGTCGCCTTCACACGGCGGAG-------------------GTCCTGAGTTCGAATCTCAGCGGGCCCA---
D00011958 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Val CAC -GGGCTCGTGGTCTAGCT-GGTT-ATGACGTCGCCTTCACACGGCGGAG-------------------ATCCTGAGTTCGAATCTCAGCGGGCCCA---
D00010957 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Val CAC -GGGCCGGTGGTCTAGG--GGT--ATGATACCTCGCTCACACCGAGGTG-------------------GTCACGAGTTCGAATCTCGTCCGGCCCA---
D00011992 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Val CAC -GGGCCCGTAGTCTAGG--GGT--ATGACGCCGCCCTCACGAGGCGGAG-------------------GTCCGGGGTTCGAATCCCCGCGGGCCCA---
D00010965 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Val CAC -GGGCCCGTAGTCTAGC--GGT--ATGATGCCCGCCTCACGCGCGGGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGCCCA---
D00010967 Pyrococcus_abyssi_GE5 Val CAC -GGGCCCGTGGTCTAGACTGGTT-ATGACGCCGCCCTCACAAGGCGGAG-------------------GTCCGGGGTTCGAATCCCCGCGGGCCCACC-
D00010970 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Val CAC -GGGCCCGTGGTCTAGACTGGTT-ATGACGCCGCCCTCACAAGGCGGAG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCGGGCCCACC-
D00010973 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Val CAC -GGGCCCGTGGTCTAGACTGGTT-ATGACGCCGCCCTCACAAGGCGGAG-------------------GTCCGGGGTTCGAATCCCCGCGGGCCCACCA
D00012020 Staphylothermus_marinus_F1 Val CAC -GGGCCCGTGGTCTAGCCTGGTT-AGGACGCCGCCCTCACACGGCGGAG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCGGGCCCACCA
D00012039 Staphylothermus_marinus_F1 Val CAC -GGGGCCGTAGTCTAGCCTGGCT-AGGATGCGGGGCACACTCCCCCGTG-------------------ACCCGGGGTTCAAATCCCCGCGGCCCCA---
D00012086 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Val CAC -GGGCCCGTAGTCTAGCCTGGTT-AGGACGCTGCCCTCACACGGCAGAA-------------------GTCCCGAGTTCAAATCTCGGCGGGCCCA---
D00010976 Sulfolobus_solfataricus_P2 Val CAC -GGGCCCGTCGTCTAGCTTGGTT-AGGACGTCGCCCTCACACGGCGAAG-------------------ATCCTGGGTTCAAGTCCCAGCGGGCCC----
D00011051 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Val CAC -GGGCCCGTCGTCTAGTCTGGTT-AGGACGCCACCCTCACACGGTGGAG-------------------ATCCGGGGTTCAAGTCCCCGCGGGCCCA---
D00010979 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Val CAC -GGGCTTGTGGTCCAGT--GGCT-ACGACGTCTCCCTCACACGGAGAAG-------------------ATCGCCGGTTCAAATCCGGCCAGGCCCA---
D00010982 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Val CAC -GGGCTTGTGGTCCAGT--GGCT-ACGACGTCTCCCTCACACGGAGAAG-------------------ATCGCCGGTTCGAATCCGGCCAGGCCCA---
D00011072 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Val CAC -GGGCGATTGGCGCAGC--GGCT-AGCGCACTTCGTTCACACCGAAGGG-------------------GTCGTAGGTTCGATTCCTACATCGCCCA---
D00011076 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Val CAC -GGGCGATTGGCGCAGC--GGCT-AGCGCACTTCGTTCACACCGAAGGG-------------------GTCGTAGGTTCGATTCCTACATCGCCCA---
D00011103 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Val CAC -GGGCGCATAGCTCAGC--GGG--AGAGCGTTCCCTTCACACGGGAGAG-------------------GTCCAAGGTTCGATCCCTTGTGCGCCCACCA
D00010922 Brucella_melitensis_16M Val CAC -GGGCGCGTAGCTCAGC--GGG--AGAGCACTCCCTTCACACGGGAGGG-------------------GTCACAGGTTCAATCCCTGTCGCGCCCACCA
D00011079 Brucella_suis_1330 Val CAC -GGGCGCGTAGCTCAGC--GGG--AGAGCACTCCCTTCACACGGGAGGG-------------------GTCACAGGTTCAATCCCTGTCGCGCCCACCA
D00010879 Caulobacter_crescentus_CB15 Val CAC -GGATGCGTAGCTCAGC--GGG--AGAGCACCTCGTTCACACCGAGGGG-------------------GTCACAGGTTCAATCCCTGTCGCATCCACCA
D00011032 Chlorobium_tepidum_TLS Val CAC -GGACAATTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTTCGCTTCACACGCGAGAG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTACATTGTCCACCA
D00011164 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Val CAC -GGTCCTATGGCTCAGT--GGA--AGAGCGTTCCGTTCACACCGGAAAG-------------------GTCGCTGGTTCGATCCCAGCTAGGACCA---
D00011081 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Val CAC -GGTCCTATGGCTCAGT--GGA--AGAGCGTTCCGTTCACACCGGAAAG-------------------GTCGCTGGTTCGAACCCAGCTAGGACCA---
D00011043 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Val CAC -GGTCCTATGGCTCAGT--GGA--AGAGCGTTCCGTTCACACCGGAAAG-------------------GTCGCTGGTTCGAACCCAGCTAGGACCA---
D00010882 Deinococcus_radiodurans_R1 Val CAC -GGGCGGTTAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTCGCTTCACACGCGAAGG-------------------GTCGTAGGTTCAAGTCCTATACCGCCCACCA
D00011210 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Val CAC -GGGCAGTTAGCTCAGCT-GGA--AGAGCACCGCCTTCACACGGCGGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAGCCCTGCACCGCCCACCA
D00011183 Geobacter_sulfurreducens_PCA Val CAC -GGGCGCTTAGCTCAGC--GGG--AGAGCACTGCCTTCACACGGCAGGG-------------------GTCACTGGTTCAATCCCAGTAGCGCCCACCA
D00011186 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Val CAC -GGGCGATTGGCGCAGTT-GGT--AGCGCGCTTCCTTCACACGGAAGAG-------------------GTCATCGGTTCGAGTCCGGTATCGCCCACCA
D00010925 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Val CAC -GGGCGATTAGCTCAGC--GGG--AGAGCACACCCTTCACACGGGTGGG-------------------GTCGCAGGTTCAATCCCTGCATCGCCCACCA
D00011123 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Val CAC -GGTCCCGTGGCTCAGT--GGG--AGAGCGTCCGCTTCACACGCGGAAG-------------------GTCGCTGGTTCGATCCCAGCCGGGACCA---
D00010853 Mycobacterium_leprae_TN Val CAC -GGTCCCGTGGCTCAGT--GGA--AGAGCGTCCGCTTCACACGCGGAAG-------------------GTCGCTGGTTCGACCCCAGCCGGGACCACCA
D00010841 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Val CAC -GGTCCCGTGGCTCAGT--GGG--AGAGCGTCCGCTTCACACGCGGAAG-------------------GTCGCTGGTTCGATCCCAGCCGGGACCA---
D00011169 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Val CAC -GGTCCCGTGGCTCAGT--GGG--AGAGCGTCCGCTTCACACGCGGAAG-------------------GTCGCTGGTTCGATCCCAGCCGGGACCA---
D00011151 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Val CAC -AGGCGGTTAACTCAGC--GGT--AGAGTGTCACCTTCACACGGTGGAA-------------------GTCATTGGTTCGATTCCAGTACCGCCTACCA
D00011218 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Val CAC -GGGCGGTTGGCGCAGT--GGT--AGCGCACTTCGTTCACACCGAAGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAACCCCGCATCGCCCA---
D00010935 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Val CAC -GGGTGGTTAGCTCAGC--GGT--AGAGCACTGCCTTCACACGGCAGGG-------------------GTCACAGGTTCAATCCCTGTACCACCCACCA
D00011146 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Val CAC -GGGCGATTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCTGCTTTCACACGGCAGAG-------------------GTCACAGATTCGAATTCTGTATCGCCCA---
D00011176 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Val CAC -GGGCGCATAGCTCAGC--GGG--AGAGCGTTCCCTTCACACGGGAGAG-------------------GTCCAAGGTTCGATCCCTTGTGCGCCCACCA
D00003115 Staphylococcus_aureus Val CAC -GGGGGCTTAGCTCAGCTGGGAG-AGCGCCTGCTTTGCACGCAGG-AGG-------------------T-CAGCGGTTCGATCCCGCTAGTCTCCACCA
D00011136 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Val CAC -GGGCGATTAGCTCAGT--GGG--AGAGCGCTTTGTTCACGCCGAAGAG-------------------CTCACTGGGTCGAACCCAGTATCGCCCA---
D00011141 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Val CAC -GGGCGATTAGCTCAGC--GGG--AGAGCGCTTCGTTCACACCGAAGAG-------------------GTCACTGGTTCGAACCCAGTATCGCCCA---
D00011142 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Val CAC -GGGCGATTAGCTCAGT--GGG--AGAGCGCTTCGTTCACACCGAAGAG-------------------GTCACTGGTTCGAACCCAGTATCGCCCA---
D00011087 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Val CAC -GGGCGATTAGCTCAGT--GGG--AGAGCGCTTCGTTCACACCGAAGAG-------------------GTCACTGGTTCGAACCCAGTATCGCCCA---
D00011195 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Val CAC -GGGCGGTTAGCTCAGC--GGG--AGAGCACTTGCTTCACACGCAAGGG-------------------GTCACTGGTTCGATCCCAGTACCGCCCACCA
D00011056 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Val CAC -GGGGTCATAGCTCAGCT-GGTC-AGAGCGCTGCGCTCACATCGCAGAG-------------------GTCACAGGTTCGACTCCTGTTGACCCCACCA
D00011049 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Val CAC -GGGCGATTAGCACAGT--GGT--AGCGCACTTCCTTCACACGGAAGGG-------------------GTCACTGGTTCGAATCCAGTATCGCCCA---
D00010896 Thermotoga_maritima_MSB8 Val CAC -GGGTGCGTAGCTCAGG--GGG--AGAGCGCTTCCCTCACGAGGAAGAG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCCGCACCCACCA
D00011221 Thermus_thermophilus_HB27 Val CAC CGGGCGGCTAGCTCAGC--GGA--AGAGCGCTCGCCTCACACGCGAGAG-------------------GTCGTAGGTTCAAGTCCTACGCCGCCCACCA
D00003109 Treponema_pallidum Val CAC -GGACGATTAACTCAGT--GGT--AGAGTGTTACCTTCACACGGTAGAA-------------------GTCATCGGTTCAAGTCCGGTATCGTCCA---
D00010889 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Val CAC -GGACGATTAACTCAGT--GGT--AGAGTGTTACCTTCACACGGTAGAA-------------------GTCATCGGTTCAAGTCCGGTATCGTCCA---
D00011114 Tropheryma_whipplei_str._Twist Val CAC -GGGCGATTGGCGCAGT--GGT--AGCGCGCTTCCTTCACACGGAAGAG-------------------GTCACTGGTTCGAGTCCAGTATCGCCCA---
D00011115 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Val CAC -GGGCGATTGGCGCAGT--GGT--AGCGCGCTTCCTTCACACGGAAGAG-------------------GTCACTGGTTCGAGTCCAGTATCGCCCA---
D00011062 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Val CAC -GGGCGGTTAGCTCAGC--GGT--AGAGCATTGCCTTCACACGGCAAGG-------------------GTCACAGGTTCGAACCCTGTACCGCCCACCA
D00011059 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Val CAC -GGGCGGTTAGCTCAGC--GGT--AGAGCATTGCCTTCACACGGCAAGG-------------------GTCACAGGTTCGATCCCTGTACCGCCCACCA
D00010899 Xylella_fastidiosa_9a5c Val CAC -GGGCGGTTAGCTCAGC--GGT--AGAGCATTGCCTTCACACGGCAAGG-------------------GTCGCAGGTTCGAACCCTGCATCGCCCACCA
D00011119 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Val CAC -GGGCGGTTAGCTCAGC--GGT--AGAGCATTGCCTTCACACGGCAAGG-------------------GTCGCAGGTTCGAACCCTGCATCGCCCACCA
D00003251 Caenorhabditis_elegans Val CAC -ATTGAATTAGCCTACA--GTGC-AATGTTAGTTCATCACG_GAAGTAT-------------------A-TTATAGTTCGAAATTGTAATTTAATA---
D00011011 Caenorhabditis_elegans Val CAC -GGTCCTCTGGTGTAGT--GGTT-ATCACGTCTGCTTCACACGCAGAAG-------------------GTCGCCGGTTCGAACCCGGCGAGGACC----
D00011012 Caenorhabditis_elegans Val CAC -GGTCCTGTGGTGTAGT--GGTT-ATCACGTCTGCTTCACACGCAGAAG-------------------GTCGCCGGTTCGAACCCGGCCAGGACC----
D00011204 Candida_glabrata_CBS_138 Val CAC -GTTCCAATGGTGTAGT--GGCT-ATCACGTTGCCTTCACACGGCAAAG-------------------GTCCCGAGTTCGAACCTCGGTTGGAACA---
D00003255 Drosophila_melanogaster Val CAC -GTTTTCGTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTGTGCTTCACACGCACAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAACCCGGGCGAAAACA---
D00011023 Drosophila_melanogaster Val CAC -GTTTCCGTAGTGTAGC--GGTT-ATCACGTGTGCTTCACACGCACAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAACCCGGGCGGGAAC----
D00011024 Drosophila_melanogaster Val CAC -GTTTTCGTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTGTGCTTCACACGCACAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAACCCGGGCGAAAACA---
D00011066 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Val CAC -GCTTTTGTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTATCCTTCACACGGATGAG-------------------GTCCTCGGTTCGAACCCGAGCAAAAGCA---
D00011244 Gallus_gallus Val CAC -GTTTCTGTAGTGTAGC--GGTT-ATCACGTTCGCCTCACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCAATCCCGGGCAGAAACA---
D00011245 Gallus_gallus Val CAC -GTTTCCATAGTGTAGC--GGTT-ATCACGTTTGCCTCACACGCAAAAG-------------------GTCCCTGGTTCGATCCCAGGTGGAAACA---
D00011246 Gallus_gallus Val CAC -GTTTCCGTAGTGTAGC--GGTT-ATCACGTTCGCCTCACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGATCCCGGGCGGAAACA---
D00011247 Gallus_gallus Val CAC -GTTTCTGTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTTCGCCTCACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAAACCGGGCAGAAACA---
D00003260 Homo_sapiens Val CAC -GTTTCCGTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTTCGCCTCACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAAACCGGGCGGAAACA---
D00003263 Homo_sapiens Val CAC -GCTTCTGTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTTCGCCTCACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAAACCGGGCAGAAGCA---
D00003264 Homo_sapiens Val CAC -GTTTCCGTAGTGTAGC--GGTT-ATCACATTCGCCTCACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGATCCCGGGCGGAAACA---
D00010992 Homo_sapiens Val CAC -TTTTCTGTAGTGTAGTT-GTT--AACACGTTCGCCTCACACGCTTAAA--------G----------TTCTCTGGTTGGATACCAGATGGAAAT----
D00010993 Homo_sapiens Val CAC -GTTTCTGTGGTGTAGT--GGTT-ATCATGTTCGCCTCACACGAGAAAA-------------------GTCCCTGATTCGAGACTGGGTGGGAAC----
D00010994 Homo_sapiens Val CAC -GTTTCTGTAGTATGGT--GGTT-ATCACGTTAGTCTCACACGTGAAAG-------------------GTCCCTGGTTCGAAACCAGGTGGAAAC----
D00010995 Homo_sapiens Val CAC -GTTTCCGTAGTGTAGT--GGTT-ATTATGTTCGCCTCACACGCGAAAA-------------------GTCCCCGGTTCGAAATCAGGCGGGAAC----
D00010996 Homo_sapiens Val CAC -GTTTCCGTAGTGGAGT--GGTT-ATCACGTTCGCCTCACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTTGAAACCAGGCGGAAAC----
D00010997 Homo_sapiens Val CAC -GTTTCCGTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTTCGCCTCACACGCGTAAA--------G----------GTCCCCGGTTCGAAACCGGGCGGAAAC----
D00010998 Homo_sapiens Val CAC -GTTTCCGTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTTCGCCTCACACGAGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAAACCGGGCGGAAACA---
D00010999 Homo_sapiens Val CAC -GTTTCCGTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTTCGCCTCACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAAACTGGGCGGAAACA---
D00011000 Homo_sapiens Val CAC -GTTTCCGTAGTGTAGC--GGTT-ATCACATTCGCCTCACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGATCCCGGGCGGAAACA---
D00011001 Homo_sapiens Val CAC -GCTTCTGTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTTCGCCTCACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAAACCGGGCAGAAGCA---
D00011002 Homo_sapiens Val CAC -GTTTCCGTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTTCGCCTCACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAAACCGGGCGGAAACA---
D00011269 Pan_troglodytes Val CAC -TTTTCTGTAGTGTAGTT-GTT--AACACGTTCGCCTCACACGCTAAAG-------------------TTCTCTGGTTGGATACCAGATGGAAATG---
D00011270 Pan_troglodytes Val CAC -GTTTCTGTGATGTAGT--GGTT-ATCATGTTCGCCTCACACGAGAAAA-------------------GTCCCTGGTTCGAGACTGGGTGGGAACC---
D00011271 Pan_troglodytes Val CAC -GTTTCTGTAGTATGGT--GGTT-ATGACGTTAGTCTCACACGTGAAAG-------------------GTCCCTGGTTCGAAACCAGGTGGAAACA---
D00011272 Pan_troglodytes Val CAC -GTTTCTGTGGTGTAGT--GGTT-ATCATGTTCGCCTCACGCGAGAAAA-------------------GTCCCTGGTTCGAGACTGGGTGGGAACG---
D00011273 Pan_troglodytes Val CAC -GTTTCCGTAGTGTAGT--GGTT-ATTACGTTAGCCTCACACGCGAAAA-------------------GTCCCCGGTTCAAAACCGGGCGGGAACA---
D00011274 Pan_troglodytes Val CAC -GTTTCCGTAGTGGAGT--GGTT-ATCACGTTCGCCTCACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTTGAAACCGGGGGGAAACA---
D00011275 Pan_troglodytes Val CAC -GTTTCTGTAGTGTAGG--GGTT-ATCACGTTCGCCTCACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAAACCGGGCAGAAGCA---
D00011276 Pan_troglodytes Val CAC -GTTTCCGTAGTGTAGC--GGTT-ATCACGTTCGCCTCACACGCGAAAG-------------------GTCTCCGGTTCGATCCCGGGCGGAAACA---
D00011277 Pan_troglodytes Val CAC -GTTTCCGTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTTCGCCTCACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAAACCGGGCGGAAACA---
D00011278 Pan_troglodytes Val CAC -GTTTCCGTGGTGTAGT--GGTT-ATCACGTTCGCCTCACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAAACCGGGCGGAAACA---
D00011232 Plasmodium_falciparum_3D7 Val CAC -GCGAGCATGGTCTAGT--GGCT-ATGACGTTCGCCTCACACGCGAAAG-------------------ATCCCGAGTTCGATCCTCGGTGCTCGTA---
D00011019 Saccharomyces_cerevisiae Val CAC -GTTCCAATAGTGTAGC--GGCT-ATCACGTTGCCTTCACACGGCAAAG-------------------GTCCCGAGTTCGATCCTCGGTTGGAAC----
D00011028 Schizosaccharomyces_pombe Val CAC -AGTCCCGTGTTCTAGT--GGT--ATGATTTCTCCTTCACACGGAGAAG-------------------GTCCCGGGTTCGATCCCCGGCGGGACT----
D00011256 Takifugu_rubripes Val CAC -AGCACGGTGGTGTAGT--GGTC-AGCACTTTTGCCTCACAGCCAAAAG-------------------GTTGTGGGTTTGATCCCCGTCTGTGTTG---
D00011257 Takifugu_rubripes Val CAC -GTTTCCGTAGTGCAGT--GGTT-ATCACGTTCGCCTCACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAAACCGGGCGGAAACA---
D00011258 Takifugu_rubripes Val CAC -GTTTCCGTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTTCGCCTCACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAAACCGGGCGGAAACA---
D00003241 Trypanosoma_brucei Val CAC -GCGATGGTCGTCTAGT--GGTT-AGGACATTCGCCTCACACGCGAGAG-------------------ATCGCGGGTTCGATCCCCGCCCGTCGTA---
D00003256 Xenopus_laevis Val CAC -GTTTCTGTAGTGTAGC--GGTT-ATCACGTTCGCCTCACATGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAAACCGGGCAGAAACA---
D00010950 Aeropyrum_pernix_K1 Val TAC -GGGCCCGTCGTCTAGCCTGGTT-AGGACGCCGCCCTTACACGGCGGAG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCGGGCCCACC-
D00003096 Archaeoglobus_fulgidus Val TAC -GGGCTCGTGGTCTAGC--GGTT-ATGACGTCGCCCTTACAAGGCGGAG-------------------ATCGCCGGTTCGAATCCGGCCGAGCCCA---
D00010953 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Val TAC -GGGCTCGTGGTCTAGC--GGTT-ATGACGTCGCCCTTACAAGGCGGAG-------------------ATCGCCGGTTCGAATCCGGCCGAGCCCA---
D00010956 Halobacterium_sp._NRC-1 Val TAC -GGGTTCGTGGTCTAGTC-GGTC-ATGACGCGGCCTTTACAAGGCCGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAATCCGCCCGAACCCA---
D00003099 Methanocaldococcus_jannaschii Val TAC -GGGCCCATGGTCTAGCT-GGCT-ATGACGTCGCCCTTACAAGGCGAAG-------------------G-TCGCCGTTCGAATCCGGCTGGGCCCA---
D00010962 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Val TAC -GGGCCCATGGTCTAGCT-GGCT-ATGACGTCGCCCTTACAAGGCGAAG-------------------GTCGCCGGTTCGAATCCGGCTGGGCCC----
D00011851 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Val TAC -GGACCCATGGTCTAGTT-GGCT-ATGACATCGCCCTTACAAGGCGAGG-------------------GTCGCCGGTTCGAATCCGGCTGGGTCCA---
D00010964 Methanococcus_maripaludis Val TAC -GGACCTATGGTCTAGTT-GGCT-ATGACATCGCCCTTACAAGGCGAGG-------------------GTCGCCGGTTCGAATCCGGCTAGGTCCACC-
D00003101 Methanococcus_vannielii Val TAC -GGACTCATGGTCTAGTT-GGCT-ATGACATCGCCCTTACAAGGCGAGG-------------------GTCGCCGGTTCGAATCCGGCTGGGTCCA---
D00011071 Methanopyrus_kandleri_AV19 Val TAC -GGGCCCGCAGTTCAGCCCGGC--AGAACGCCGGCCTTACGAGCCGGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGCCCACCA
D00011887 Methanosarcina_acetivorans_C2A Val TAC -GGGCTCGTGGTCTAGTC-GGTC-ATGACATCGCCTTTACACGGCGGGG-------------------ATCCTGAGTTCGAATCTCAGCGGGCCCA---
D00011037 Methanosarcina_mazei_Go1 Val TAC -GGGCTCGTGGTCTAGTC-GGTT-ATGACATCGCCTTTACACGGCGGGG-------------------ATCCTGAGTTCGAATCTCAGCGGGCCCA---
D00011931 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Val TAC -GGGCCTATGGTCTAGTT-GGTT-ATGACACCGCCTTTACACGGCGGAG-------------------GTCGCCGGTTCGAATCCGGCTGGGCCCA---
D00010959 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Val TAC -GGGCCGGTGGTCTAGG--GGT--ATGATACCTCGCTTACAACGAGGTG-------------------GTCACGAGTTCGAATCTCGTCCGGCCCA---
D00012003 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Val TAC -GGGCCCGTAGTCTAGG--GGT--ATGACGCCGCCCTTACAAGGCGGAG-------------------GTCCGGGGTTCGAATCCCCGCGGGCCCA---
D00010966 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Val TAC -GGGCCCGTAGTCTAGC--GGT--ATGATGCCCGCCTTACACGCGGGTG-------------------GTCCCGGGTTCGAATCCCGGCGGGCCCA---
D00010969 Pyrococcus_abyssi_GE5 Val TAC -GGGCCCGTGGTCTAGTT-GGTT-ATGACGCCGCCCTTACGAGGCGGAG-------------------GTCCGGGGTTCGAATCCCCGCGGGCCCACC-
D00010972 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Val TAC -GGGCCCGTGGTCTAGCT-GGTT-ATGACGCCGCCCTTACGAGGCGGAG-------------------GTCCGGGGTTCGAATCCCCGCGGGCCCACC-
D00010975 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Val TAC -GGGCCCGTGGTCTAGTT-GGTC-ATGACGCCGCCCTTACGAGGCGGAG-------------------GTCCGGGGTTCGAATCCCCGCGGGCCCACCA
D00012054 Staphylothermus_marinus_F1 Val TAC -GGGCCCGTCGTCTAGCCTGGTT-AGGACGCCGCCCTTACGAGGCGGAG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCGGGCCCA---
D00012090 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Val TAC -GGGCCCGTCGTCTAGCCTGGTT-AGGACGTCGCCCTTACAAGGCGGAG-------------------GTCCTGGGTTCAAATCCCAGCGGGCCCA---
D00010978 Sulfolobus_solfataricus_P2 Val TAC -GGGCCCGTCGTCTAGCCTGGTT-AGGACGCTGCCCTTACGAGGCAGAG-------------------GTCCTGGGTTCAAATCCCAGCGGGCCC----
D00011053 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Val TAC -GGGCCCGTCGTCTAGCCTGGTT-AGGACGCCGCCCTTACAAGGCGGAG-------------------GTCCTGGGTTCAAGTCCCAGCGGGCCCA---
D00010981 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Val TAC -GGGCTCGTGGTCCAGT--GGTT-ACGACGTCGCCCTTACAAGGCGGAG-------------------ATCACCGGTTCGATCCCGGTCGGGCCCA---
D00010984 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Val TAC -GGGCTCGTAGTCCAGT--GGTT-ACGACGTCGCCCTTACAAGGCGGAG-------------------ATCACCGGTTCGAATCCGGTCGGGCCCA---
D00003106 Acholeplasma_laidlawii Val TAC -GGAGGATTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCACCTGCCTTACAAGCAGGGG-------------------GTCGGCGGTTCAAGCCCGTCATCCTCCACCA
D00011228 Acinetobacter_sp._ADP1 Val TAC -GGGCGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGTCTGCCTTACAAGCAGAAT-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCAGCGCCCACCA
D00010940 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Val TAC -GGGCGATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCCTCGTTTACACCGAGGAT-------------------GTCGGGAGTTCGAGTCTCTCATCGCCCACCA
D00010906 Aquifex_aeolicus_VF5 Val TAC -AGGCGGGTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCCGCCCTTACAAGGCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGCCCCGCCTACCA
D00003124 Azospirillum_lipoferum Val TAC -GGAGGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCGGCGGTTCGAGCCCGCCATCCTCCACCA
D00011158 Bacillus_anthracis_str._Ames Val TAC -GGAGGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCCTTACAAGCAGGGG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCCTCCACCA
D00011179 Bacillus_anthracis_str._Sterne Val TAC -GGAGGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCCTTACAAGCAGGGG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCCTCCACCA
D00011207 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Val TAC -GGAGGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCCTTACAAGCAGGGG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCCTCCACCA
D00011209 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Val TAC -GGAGGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCCTTACAAGCAGGGG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCCTCCACCA
D00011128 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Val TAC -GGAGGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCCTTACAAGCAGGGG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCCTCCACCA
D00011100 Bacillus_halodurans_C-125 Val TAC -GGAGGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCCTTACAAGCAGGGG-------------------GTCGGCAGTTCGATCCTGTCATCCTCCACCA
D00011101 Bacillus_halodurans_C-125 Val TAC -GGAGGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCCTTACAAGCAGGGG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCCTCCACCA
D00011102 Bacillus_halodurans_C-125 Val TAC -GGAGGGTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCCTTACAAGCAGGGG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCACCCTCCACCA
D00003120 Bacillus_sp._PS3 Val TAC -GGAGGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACTTGCCTTACAAGCAAGGG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCCTCCACCA
D00003119 Bacillus_subtilis Val TAC -GGAGGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCGGCGGTTCGAGCCCGTCATCCTCCACCA
D00010837 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Val TAC -GGAGGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATTTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCGGCGGTTCGAGCCCGTCATCCTCCACCA
D00010838 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Val TAC -GGAGGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCGGCGGTTCGAGCCCGTCATCCTCCACCA
D00011154 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Val TAC -GGGCGCTTAGCTCAGCT-GGTTCAGAGCATCTGGTTTACACCCAGAGG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCAGCGCCCA---
D00011155 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Val TAC -GGGCGCTTAGCTCAGCT-GGTTCAGAGCATCTGGTTTACACCCAGAGG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCAGCGCCCA---
D00011161 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Val TAC -GGGCGATTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCGCCTCGTTTACACCGAGGAT-------------------GTCGGGAGTTCGAGTCTCTCATCGCCCACCA
D00011235 Bartonella_quintana_str._Toulouse Val TAC -GGGCGATTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCGCTTCGTTTACACCGAAGAT-------------------GTCGGGAGTTCGAGTCTCTCATCGCCCACCA
D00011163 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Val TAC -AGGGAGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCCACCCTTACAAGGTGGAT-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTACTCCCTACCA
D00011074 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Val TAC -GGGCAATTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCCACCTTTACACGGTGGAT-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCCTCATTGCCCA---
D00003110 Borrelia_burgdorferi Val TAC -GGGCTCATAGCTCAGTT-GGTC-AGAGCGCCTGCCTTACAAGCAGGAT-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCTCTGGGCCCA---
D00010876 Borrelia_burgdorferi_B31 Val TAC -GGGCTCATAGCTCAGTT-GGTC-AGAGCGCCTGCCTTACAAGCAGGAT-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCTCTGGGCCCA---
D00011181 Borrelia_garinii_PBi Val TAC -GGGCTCATAGCTCAGTT-GGTC-AGAGCGCCTGCCTTACAAGCAGGAT-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCTCTGGGCCCA---
D00011104 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Val TAC -GGGCGGTTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCATCTCGTTTACACCGAGAGG-------------------GTCCGCGGTTCGAATCCGTGACCGCCCACCA
D00010923 Brucella_melitensis_16M Val TAC -GGGCGATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCTTCGTTTACACCGAAGAT-------------------GTCGGGAGTTCGAGTCTCTCATCGCCCACCA
D00011078 Brucella_suis_1330 Val TAC -GGGCGATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCTTCGTTTACACCGAAGAT-------------------GTCGGGAGTTCGAGTCTCTCATCGCCCACCA
D00010840 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Val TAC -GGGTGATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCTCCTCCTTTACACGGAGGAA-------------------GTCGGCGGTTCGAGTCCGTCATCACCCA---
D00011131 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Val TAC -GGGTGATTAGCTCAATT-GGT--AGAGCATCTCCTTTACACGGAGAAG-------------------GTCGGCGGTTCGAGACCGTCATCACCCA---
D00011038 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Val TAC -AGGTGATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCTCCTCCTTTACACGGAGGAA-------------------GTCGGCGGTTCGAGTCCGTCATCACCTACCA
D00010878 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Val TAC -GGTCGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCCACCCTTACAAGGTGGAT-------------------GTCATAAGTTCGAGTCTTATAGTGACCACCA
D00011237 Candidatus_Blochmannia_floridanus Val TAC -AGGTGATTAGCTCAATA-GGT--AGAGTATCTCTCTTACAAGGAGAAG-------------------GTCGGCGGTTCAAATCCGCCATCACCTA---
D00011172 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Val TAC -GGGCGTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCTCCTGTCTTACACACAGGTG-------------------GTCATAGGTTCGAGTCCTTTTGCGCCCA---
D00010881 Caulobacter_crescentus_CB15 Val TAC -GGGCAGTTAGCTCAGC--GGT--AGAGCGTCTCGTTTACACCGAGAGG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCACTGCCCACCA
D00010915 Chlamydia_muridarum_Nigg Val TAC -GGATGCGTAGCTCAGC--GGTT-AGAGCACCTGTCTTACACACAGGGG-------------------GTCATAGGTTCAAATCCTGTCGTGTCCA---
D00010835 Chlamydia_trachomatis Val TAC -GGATGCGTAGCTCAGC--GGTT-AGAGCACCTGTCTTACACACAGGGG-------------------GTCATAGGTTCAAATCCTGTCGTGTCC----
D00010833 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Val TAC -GGATGCGTAGCTCAGC--GGTT-AGAGCACCTGTCTTACACACAGGGG-------------------GTCATAGGTTCAAATCCTGTCGTGTCCA---
D00010829 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Val TAC -GGATGCGTAGCTCAGC--GGTT-AGAGCACCTGTCTTACACACAGGGG-------------------GTCATAGGTTCAAATCCTGTCGTGTCCA---
D00010831 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Val TAC -GGATGCGTAGCTCAGC--GGTT-AGAGCACCTGTCTTACACACAGGGG-------------------GTCATAGGTTCAAATCCTGTCGTGTCCA---
D00010858 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Val TAC -GGATGCGTAGCTCAGC--GGTT-AGAGCACCTGTCTTACACACAGGGG-------------------GTCATAGGTTCAAATCCTGTCGTGTCCA---
D00011030 Chlorobium_tepidum_TLS Val TAC -GGGTCTCTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGACTGGTTTACACCCAGTAG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCGGGACCCA---
D00010918 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Val TAC -GGGCGCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCACAGGTTCGAGCCCTGTAGTGCCCACCA
D00010919 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Val TAC -GGGCGTTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCACAGGTTCGAGCCCTGTAATGCCCA---
D00010913 Clostridium_perfringens_str._13 Val TAC -GGTCGCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCCTTACAAGCAGGGG-------------------GTCACAGGTTCGATCCCTGTTGCGACCACCA
D00011106 Clostridium_tetani_E88 Val TAC -GGGCGCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCCTTACAAGCAGGGG-------------------GTCACAGGTTCGAGCCCTGTTGTGCCCACCA
D00011166 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Val TAC -GCGCCTTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCAGCTGGTTTACACCCAGCAG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCAGGGCGCA---
D00011082 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Val TAC -GCGCCTTTAGCTCAGCT-GGA--AGAGCAGCTGGTTTACACCCAGCAG-------------------GTCGGCGGTTCGAGCCCGTCAGGGCGCA---
D00011044 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Val TAC -GCGCCTTTAGCTCAGCT-GGA--AGAGCAGCTGGTTTACACCCAGCAG-------------------GTCGGCGGTTCGAGCCCGTCAGGGCGCA---
D00011127 Coxiella_burnetii_RSA_493 Val TAC -GGGTGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGTCGCCCTTACAAGGCGAAT-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCAGCACCCA---
D00010884 Deinococcus_radiodurans_R1 Val TAC -GGGCGATTAGCTCAGC--GGT--AGAGCGCTCGCCTTACAAGCGATTG-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCTCATCGCCCACCA
D00011212 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Val TAC -GGGCGGTTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCGTCGGCCTTACAAGCCGAAT-------------------GCCGGGGGTTCGATCCCCTCACCGCCCACCA
D00011107 Enterococcus_faecalis_V583 Val TAC -GGAGGTTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCCTTACAAGCAGGGG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCA---
D00003121 Escherichia_coli Val TAC -GGGTGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA
D00011133 Escherichia_coli_CFT073 Val TAC -GGGTGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA
D00010861 Escherichia_coli_K12 Val TAC -GGGTGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA
D00010864 Escherichia_coli_O157:H7 Val TAC -GGGTGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGG-------------------GGCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA
D00010865 Escherichia_coli_O157:H7 Val TAC -GGGTGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA
D00010868 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Val TAC -GGGTGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGG-------------------GGCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA
D00010869 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Val TAC -GGGTGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA
D00011033 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Val TAC -GGTCGCATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCACCTGCCTTACAAGCAGGGG-------------------GTCATAGGTTCAAGTCCTATTGTGACCACCA
D00011034 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Val TAC -GGTCGCATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCACCTGCCTTACAAGCAGGGG-------------------GTCATAGGTTCAAGTCCTATTGCGACCACCA
D00011184 Geobacter_sulfurreducens_PCA Val TAC -GGGCGAATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCAGCCTTACAAGCTGGAT-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCTTCGCCCACCA
D00003125 Haemophilus_influenzae Val TAC -GGGCGATTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGG-------------------GTCACTGGTTCGAGACCGGTATCGCCCACCA
D00010875 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Val TAC -GGGCGATTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGG-------------------GTCACTGGTTCGAGACCGGTATCGCCCACCA
D00003118 Helicobacter_pylori Val TAC -GGTCGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCTACCCTTACAAGGTAGAT-------------------GTCATAAGTTCGAGTCTTATAGCGACCACCA
D00010871 Helicobacter_pylori_26695 Val TAC -GGTCGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCTACCCTTACAAGGTAGAT-------------------GTCATAAGTTCGAGTCTTATAGCGACCACCA
D00010873 Helicobacter_pylori_J99 Val TAC -GGTCGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCTACCCTTACAAGGTAGAT-------------------GTCATAAGTTCGAGTCTTATAGCGACCACCA
D00003116 Lactobacillus_delbrueckii_subsp._bulgaricus Val TAC -GGAGGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCTCCA---
D00011185 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Val TAC -GGAGGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGGAG-------------------GTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCTCCA---
D00011108 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Val TAC -GGAGGATTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCTCCA---
D00011109 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Val TAC -GGAGGATTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCTCCA---
D00011188 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Val TAC -GGGCCTTTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCGCCACGTTTACACCGTGGAT-------------------GTCGTCGGTTCGAACCCGGCAAGGCCCA---
D00011083 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Val TAC -GGGCGATTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCGCCTGCCTTACAAGCAGGAT-------------------GTCGGCAGTTCGATCCTGTCATCGCCCA---
D00010907 Listeria_innocua_Clip11262 Val TAC -GGAGGTTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCA---
D00010908 Listeria_innocua_Clip11262 Val TAC -GGAGGTTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCACCA
D00010910 Listeria_monocytogenes_EGD-e Val TAC -GGAGGTTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCA---
D00010911 Listeria_monocytogenes_EGD-e Val TAC -GGAGGTTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCACCA
D00011213 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Val TAC -GGAGGTTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCA---
D00011214 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Val TAC -GGAGGTTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCACCA
D00011216 Mesoplasma_florum_L1 Val TAC -GGAGTGCTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCTCCTGCCTTACAAGCAGGCG-------------------GTCAGCGGTTCGAGCCCGTTGCACTCCACCA
D00010927 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Val TAC -GGGCGATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCTTCGTTTACACCGAAGAT-------------------GTCGGCGGTTCGAGCCCGTCATCGCCCACCA
D00011122 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Val TAC -GGGCGCGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCTCTGGTTTTACACACCAGCG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCCGCGCCCA---
D00010855 Mycobacterium_leprae_TN Val TAC -GGGCGCGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCTCTGGTTTTACACACCAGCG-------------------GTCGGCGGTTCGATACCGTCCGCGCCCACCA
D00003113 Mycobacterium_tuberculosis Val TAC -GGGCGCGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCTCTGGTTTTACACACCAGCG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCCGCGCCCA---
D00010843 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Val TAC -GGGCGCGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCTCTGGTTTTACACACCAGCG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCCGCGCCCA---
D00011168 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Val TAC -GGGCGCGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCTCTGGTTTTACACACCAGCG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCCGCGCCCA---
D00003103 Mycoplasma_capricolum Val TAC -GGAGTGTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCTCCTGCCTTACAAGCAGGCG-------------------GTCATAGGTTCAAGTCCTATACACTCCACCA
D00011121 Mycoplasma_gallisepticum_R Val TAC -GGAGTGTTAGCTCAGGT-GGG--AGAGCATATGCCTTACAAGCATAGG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCACACTCCACCA
D00010885 Mycoplasma_genitalium_G37 Val TAC -GGATTGTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATATGCCTTACAAGCATAGG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCACAATCCACCA
D00003104 Mycoplasma_mycoides Val TAC -GGAGTGTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCTCCTGCCTTACAAGCAGGCG-------------------GTCATAGGTTCAAGTCCTATACACTCCACCA
D00003105 Mycoplasma_pneumoniae Val TAC -GGATTGTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATATGCCTTACAAGCATAGG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCACAATCCACCA
D00010886 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Val TAC -GGATTGTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATATGCCTTACAAGCATAGG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCACAATCCACCA
D00010939 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Val TAC -GGAAGATTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCATCGCCCTTACAAGGCGAGG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCTCATCTTCCACCA
D00010845 Neisseria_meningitidis_MC58 Val TAC -GGGTGATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGTGTCTGCCTTACAAGCAGAAT-------------------GTCGGCGGTTCGACTCCGTCATCACCCACCA
D00010846 Neisseria_meningitidis_MC58 Val TAC -GGGTGATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGTCTGCCTTACAAGCAGAAT-------------------GTCGGCGGTTCGACTCCGTCATCACCCACCA
D00010848 Neisseria_meningitidis_Z2491 Val TAC -GGGTGATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGTCTGCCTTACAAGCAGAAT-------------------GTCGGCGGTTCGACTCCGTCATCACCCACCA
D00011152 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Val TAC -GGGTGCTTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCGTCGCCCTTACAAGGCGAAT-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCAGCACCCACCA
D00010936 Nostoc_sp._PCC_7120 Val TAC -AGCCCTGTAACTCAATT-GGT--AGAGTGCCTCTCTTACAAAGAGGAT-------------------GTAGCGGGTTCAAATCCTGTCAGGGCTACCA
D00010937 Nostoc_sp._PCC_7120 Val TAC -GGGCGGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCCTGCCTTACAAGCAGGAT-------------------GTCATCAGTTCGAGTCTGGTACTGCCCA---
D00011085 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Val TAC -GGAGGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCCTTACAAGCAGGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAGCCCTGCATCCTCCACCA
D00011167 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M Val TAC -AGAGGATTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTCTGCCTTACAAGCAGAAT-------------------GTCGGGGGTTCAAGTCCCTCATCCTCTACCA
D00010888 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Val TAC -GGGCGATTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGG-------------------GTCACTGGTTCGAGACCGGTATCGCCCACCA
D00011173 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Val TAC -GGGCGATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTCCCTTACAAGGAGGGG-------------------GTCATCAGTTCGAATCTGGTATCGCCCACCA
D00011189 Porphyromonas_gingivalis_W83 Val TAC -GGGCCTATAGCTCAGCT-GGTTTAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCATAGGTTCGAATCCTATTGGGCCCA---
D00011190 Porphyromonas_gingivalis_W83 Val TAC -GGGCCTATAGCTCAGCT-GGTTTAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCATAGGTTCGAATCCTATTGGGCCCA---
D00011219 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Val TAC -GGGCGTATAGCTCAGTT-GGTC-AGAGCGCCTGCCTTACACGCTGGAG-------------------GTCGCCGGTTCGAGCCCGGCTGCGCCCA---
D00010893 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Val TAC -GGGTGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA
D00011157 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Val TAC -GGGTGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCAGCTGCCTTACAAGCAGCGG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA
D00010934 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Val TAC -GGGTGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGGCGCCCTTACAAGGCGTAG-------------------GTCGGGAGTTCGAGCCTCTCAGCACCCACCA
D00011147 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Val TAC -GGGCGATTAGCTCAGTT-GGCT-AGAGCGTCTCGTTTACACCGAGAAT-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCCTCATCGCCCA---
D00011149 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Val TAC -GGTCCTGTGGTCCAAC--GGCG-ACGACACCTGTTTTACACGCAGGAA-------------------A-CGATGGTTCGATTCCATCCGGGACTA---
D00011177 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Val TAC -GGGCGGCTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCATCTCGTTTACACCGAGAGG-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCTCGCCGCCCACCA
D00010921 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Val TAC -GGGCGATTAGCTCAGCT-GGT--AGAGTATCTCGTTTACACCGAGAGT-------------------GTCGGCGGTTCGAGTCCGTCATCGCCCACCA
D00011040 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Val TAC -GGGCGATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGTATCTCGTTTACACCGAGAAT-------------------GTCGGCGGTTCGAGTCCGTCATCGCCCACCA
D00011192 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Val TAC -GGGCGATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGTATCTCGTTTACACCGAGAAT-------------------GTCGGCGGTTCAAGTCCGTCATCGCCCACCA
D00010944 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Val TAC -GGGTGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGG-------------------GTCGGCGGTTCGATACCGTCATCACCCACCA
D00010945 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Val TAC -GGGTGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA
D00011143 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Val TAC -GGGTGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA
D00010931 Salmonella_typhimurium_LT2 Val TAC -GGGTGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA
D00010932 Salmonella_typhimurium_LT2 Val TAC -GGGTGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA
D00011092 Shewanella_oneidensis_MR-1 Val TAC -GGTCGCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGG-------------------GTCAGTGATTCGATCCCAGTAGCGACCACCA
D00011093 Shewanella_oneidensis_MR-1 Val TAC -GGTCGCTTAGCTCAGCC-GGG--AGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGG-------------------GTCACTGGTTCGATCCCAGTAGCGACCACCA
D00011094 Shewanella_oneidensis_MR-1 Val TAC -GGTCGCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGG-------------------GTCACTGGTTCGATCCCAGTAGCGACCACCA
D00011095 Shigella_flexneri_2a_str._301 Val TAC -GGGTGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA
D00010946 Sinorhizobium_meliloti_1021 Val TAC -GGGCGATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCCTCGTTTACACCGAGGAT-------------------GTCGGGAGTTCGAGTCTCTCATCGCCCACCA
D00003114 Staphylococcus_aureus Val TAC -GGAGAATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCACCA
D00011178 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Val TAC -GGAGAATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCACCA
D00011045 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Val TAC -GGAGAATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCACCA
D00010852 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Val TAC -GGAGAATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCACCA
D00011110 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Val TAC -GGAGAATTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCACCA
D00011111 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Val TAC -GGAGAATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCGGCGGTTCGAACCCGTCATTCTCCACCA
D00011097 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Val TAC -GGGAGTTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACTCCCA---
D00011046 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Val TAC -GGGAGTTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACTCCCA---
D00011098 Streptococcus_mutans_UA159 Val TAC -GGGAGTTTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCAGCGGTTCGAGCCCGTTAACTCCCA---
D00010917 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Val TAC -GGGAGTTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACTCCCA---
D00010916 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Val TAC -GGGAGTTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACTCCCA---
D00011047 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Val TAC -GGGAGTTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACTCCCA---
D00011125 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Val TAC -GGGAGTTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACTCCCA---
D00011090 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Val TAC -GGGTGCGTAGCTCAGG--GGT--AGAGCGCCTGCCTTACAAGCAGGAT-------------------GTCGGCGGTTCGAAACCGTCCGCGCCCACCA
D00011196 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Val TAC -GGTCGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGTGCTTTACACGCATGGG-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCCTCAGCGACCACCA
D00003129 Synechococcus_sp. Val TAC -GGGCGCTTAACTCAGC--GGT--AGAGTGGCTGCCTTACAAGCAGTAA-------------------GTCACTGGTTCGAATCCAGTAGTGCCCA---
D00003127 Synechocystis_sp. Val TAC -GGGCGATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCCTGCCTTACAAGCAGGAT-------------------GTCGGCGGTTCGAGCCCGTCATCGCCCA---
D00010895 Synechocystis_sp._PCC_6803 Val TAC -GGGCGATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCCTGCCTTACAAGCAGGAT-------------------GTCGGCGGTTCGAGCCCGTCATCGCCCA---
D00011054 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Val TAC -GGTCGTGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCCTTACAAGCAGGGG-------------------GTCATAGGTTCGAGTCCTATCGCGACCACCA
D00011055 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Val TAC -GGTCGTGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCCTTACAAGCAGGGG-------------------GTCATAGGTTCAAGTCCTATCGCGACCACCA
D00011048 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Val TAC -GGGCGGTTAACTCAGTT-GGT--AGAGTATCTCGTTTACACCGAGGCT-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCCTCACCGCCCA---
D00010898 Thermotoga_maritima_MSB8 Val TAC -GGGAGCGTAGCTCAGG--GGA--AGAGCGCCTGCCTTACAAGCAGGAG-------------------GTCGTAGGTTCAAGTCCTGCCGCTCCCACCA
D00011222 Thermus_thermophilus_HB27 Val TAC CGGGCGGCTAGCTCAGCT-GGCC-AGAGCACTCGCCTTACAAGCGAGGG-------------------GTCAGAGGTTCAAGTCCTCTGCCGCCCACCA
D00011224 Treponema_denticola_ATCC_35405 Val TAC -GGGCGCTTAGCTCAGCT-GGTA-CGAGCGTCTGGTTTACACCCAGAAT-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCAGCGCCCA---
D00003108 Treponema_pallidum Val TAC -GGGCGCTTAGCTCAGC--GGGC-AGAGCGCTTGGTTTACACCCAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCAAACCCGTTAGCGCCCA---
D00010891 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Val TAC -GGGCGCTTAGCTCAGC--GGGC-AGAGCGCTTGGTTTACACCCAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCAAACCCGTTAGCGCCCA---
D00011112 Tropheryma_whipplei_str._Twist Val TAC -GGGCCTTTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGCCACGTTTACACCGTGGAG-------------------GTCATCGGTTCGAGTCCGGTAGGGCCCA---
D00011117 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Val TAC -GGGCCTTTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGCCACGTTTACACCGTGGAG-------------------GTCATCGGTTCGAGTCCGGTAGGGCCCA---
D00010856 Ureaplasma_parvum_serovar_3 Val TAC -GGAGTGCTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCATTTGCCTTACAAGCAAAGG-------------------GTCAGGGGTTCGAGTCCCTTGCACTCCACCA
D00010851 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Val TAC -GGGCGATTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCACCTGCCTTACAAGCAGGGG-------------------GTCACTGGTTCGAACCCGGTATCGCCCACCA
D00011226 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Val TAC -GGGCAATTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCATCTCGTTTACACCGAGGAG-------------------GTCGGCAGTTCAAGTCTGTCATTGCCCA---
D00011061 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Val TAC -GGGTGCTTAGCTCAGC--GGT--AGAGCGTCTCCCTTACACGGAGAGG-------------------GTCGGGGGTTCGAAACCCTCAGCACCCACCA
D00011058 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Val TAC -GGGTGCTTAGCTCAGC--GGT--AGAGCGTCTCCCTTACACGGAGAGG-------------------GTCGGGGGTTCGAAACCCTCAGCACCCACCA
D00010901 Xylella_fastidiosa_9a5c Val TAC -GGGTGCTTAGCTCAGC--GGT--AGAGCGTCTCCCTTACAAGGAGAGG-------------------GTCGGGGGTTCGAAACCCTCAGCACCCACCA
D00010904 Xylella_fastidiosa_9a5c Val TAC -GGGTGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA
D00011118 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Val TAC -GGGTGCTTAGCTCAGC--GGT--AGAGCGTCTCCCTTACAAGGAGAGG-------------------GCCGGGGGTTCGAAACCCTCAGCACCCACCA
D00011199 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Val TAC -GGGCGATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTCCTTTACACGGAGGGG-------------------GTCATCAGTTCGAATCTGGTATCGCCCACCA
D00010930 Yersinia_pestis_CO92 Val TAC -GGGCGATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTCCTTTACACGGAGGGG-------------------GTCATCAGTTCGAATCTGGTATCGCCCACCA
D00011067 Yersinia_pestis_KIM Val TAC -GGGCGATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTCCTTTACACGGAGGGG-------------------GTCATCAGTTCGAATCTGGTATCGCCCACCA
D00011202 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Val TAC -GGGCGATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTCCTTTACACGGAGGGG-------------------GTCATCAGTTCGAATCTGGTATCGCCCACCA
D00003253 Caenorhabditis_elegans Val TAC -GGTCCTATGGTGTAGT--GGTT-ATCACGTCTGCTTTACACGCAGAAG-------------------ATCGCCGGTTCGAACCCGGCTAGGACCT---
D00011013 Caenorhabditis_elegans Val TAC -GGTCCTGTGGTGTAGT--GGTT-ATCACGTCTGCTTTACACGCAGTAG-------------------GCCGCCGGTTCGATCCCGGCCAGGACC----
D00011014 Caenorhabditis_elegans Val TAC -GGTCCTATGGTGTAGT--GGTT-ATCACGTCTGCTTTACACGCAGAAG-------------------ATCGCCGGTTCGAACCCGGCTAGGACCT---
D00011015 Caenorhabditis_elegans Val TAC -GGTCCTGTGGTGTAGT--GGTT-ATCACGTCTGCTTTACACGCAGAAG-------------------ATCGCCGGTTCGATCCCGGCCAGGACC----
D00011016 Caenorhabditis_elegans Val TAC -GGTCCTGTGGTGTAGT--GGTT-ATCACGTCTGCTTTACACGCAGAAG-------------------ATCGCCGGTTCGAACCCGGCCAGGACCT---
D00011205 Candida_glabrata_CBS_138 Val TAC -GGTCCAATAGTCCAGT--GGTTTAAGACGTCGTCTTTACACGGCGAAG-------------------ATCCCGAGTTCGAACCTCGGTTGGATCA---
D00011206 Candida_glabrata_CBS_138 Val TAC -GGTCCAATAGTCCAGT--GGTTTAAGACGTCGCCTTTACACGGCGAAG-------------------ATCCCGAGTTCGAACCTCGGTTGGATCA---
D00003244 Dictyostelium_discoideum Val TAC -GGTCGGATGGTGTAGTC-GGTT-ATCACGGTTGCTTTACACGCAACAG-------------------GTCTCGAGTTCGATCCTCGGTCGGATCA---
D00003257 Dromaius_novaehollandiae Val TAC -CAAGACGTAGCTATAAATCC---AGAGCATTCAGCTTACACCTGAAAG--------AT---------GATGTCTACATAAT-AAGACCGCCTTGA---
D00011025 Drosophila_melanogaster Val TAC -GGTTCCATAGTGTAGC--GGTT-ATCACGTCTGCTTTACACGCAGAAG-------------------GTCTCCGGTTCGATCCCGGATGGAACC----
D00011064 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Val TAC -GCCCTTGTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGCATCCTTTACACGGATGAG-------------------GTCCTTGGTTCGATCCCGAGCGGGGGCA---
D00011248 Gallus_gallus Val TAC -GGTTCCATAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTCTGCTTTACACGTAGAAG-------------------GTCCTGGGTTCGAGCCCCAGTGGAACCA---
D00011249 Gallus_gallus Val TAC -GGTTCCATAGTGTAGT--GGTT-ATCACATCTGCTTTACACGCAGAAG-------------------GTCCTGAGTTCGATCCTCAGTGGAACCA---
D00011250 Gallus_gallus Val TAC -GGTTCCATAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTCTGCTTTACACGCAGAAG-------------------GTCCTGGGTTCGAGCCCCAGTGGAACCA---
D00011003 Homo_sapiens Val TAC -GCTCGCTTAGTTTATAT-GGT--AAAGCCCCATCCTTACAAGTTGGTG-------------------A-AGAAGGTTCAAGTCCTTCAGCGAGT----
D00011004 Homo_sapiens Val TAC -GTTTCCGTGGTGTAGT--GGTT-ATCACATTCGCCTTACACGCGAAAG-------------------GTCCTCGGGTCGAAACCGAGCGGAAAC----
D00011005 Homo_sapiens Val TAC -GGTTCCATAGTGTAGC--GGTT-ATCACGTCTGCTTTACACGCAGAAG-------------------GTCCTGGGTTCGAGCCCCAGTGGAACC----
D00011006 Homo_sapiens Val TAC -GGTTCCATAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTCTGCTTTACACGCAGAAG-------------------GTCCTGGGTTCGAGCCCCAGTGGAACC----
D00003242 Leishmania_tarentolae Val TAC -GCGTGGGTGATCTAGT--GGTT-ATGATGTCTGCTTTACACGCAGAAC-------------------GTCGCGGGTTCGAACCCCGCCCCGCGTA---
D00003249 Leptomonas_collosoma Val TAC -GCGTGGGTGATCTAGT--GGTT-ATGATGTCTGCTTTACACGCAGAAC-------------------GTCGCGGGTTCGAACCCCGCCCCGCGTA---
D00011279 Pan_troglodytes Val TAC -GGTTCTGTAGTGTAGCA-GTT--ATCACGTCTGCTTTACATGCAGAAG-------------------GTCCTGGGTTCGAGCCGCAGTGGAACCA---
D00011280 Pan_troglodytes Val TAC -GTTTCCGTGGTGTAGT--GGTT-ATCACATTCACCTTACACGCGAAAG-------------------GTCCTCGGGTCGAAACCGAGCGGAAACA---
D00011281 Pan_troglodytes Val TAC -GGTTCCATAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTCTGCTTTACACGCAGAAG-------------------GACCTGGGTTCGAGCCCCAGTGGAACCA---
D00011282 Pan_troglodytes Val TAC -GGTTCCATAGTGTAGT--GGTT-ATCACATCTGCTTTACACGCAGAAG-------------------GTCCTGGGTTCAAGCCCCAGTGGAACCA---
D00011283 Pan_troglodytes Val TAC -GGTTCCATAGTGTAGC--GGTT-ATCACGTCTGCTTTACACGCAGAAG-------------------GTCCTGGGTTCGAGCCCCAGTGGAACCA---
D00011284 Pan_troglodytes Val TAC -GGTTCCATAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTCTGCTTTACACGCAGAAG-------------------GTCCTGGGTTCGAGCCCCAGTGGAACCA---
D00011285 Pan_troglodytes Val TAC -GCTCCAGTGGCTCAATC-GGTT-AGCGCTTGGTACTTACAATGCCAAG-------------------GTTGTGAGTTCGACCCTCACCTGGAGCA---
D00003239 Plasmodium_falciparum Val TAC -AAGTAATTAACTTAGA--GGT--AAAGTTTCTGCTTTACATACAGAAG-------------------ACCATTGGTTCGAATCCAATATTACTTA---
D00011233 Plasmodium_falciparum_3D7 Val TAC -GCGGGCATGGTCTAGT--GGCT-ATGACGCCTGCCTTACACGCAGGAG-------------------ATCCCGAGTTCGATCCTCGGTGCCCGTA---
D00003247 Saccharomyces_cerevisiae Val TAC -GGTCCAATGGTCCAGT--GGTTCAAGACGTCGCCTTTACACGGCGAAG-------------------ATCCCGAGTTCGAACCTCGGTTGGATCA---
D00011020 Saccharomyces_cerevisiae Val TAC -GGTCCAATGGTCCAGT--GGTTCAAGACGTCGCCTTTACACGGCGAAG-------------------ATCCCGAGTTCGAACCTCGGTTGGATCA---
D00011029 Schizosaccharomyces_pombe Val TAC -GCATCTGTAGTCTAGT--GGTT-ATGATTTCTGCTTTACACGCAGACG-------------------GTCCCAGGTTCGATCCCTGGTAGATGC----
D00011259 Takifugu_rubripes Val TAC -GGTTCCATAGTGTAGA--GGTC-ATCACGTCTGCTTTACACGCAGAAG-------------------GACCTGGGTTCAATTCCCAGTGGAGCCA---
D00011260 Takifugu_rubripes Val TAC -GGTTTCATAGTGTAGC--GGTT-ATCATGTCTGCTTTACACGCAGGAG-------------------GTCCTGGGTTCGAGCCCCAGTGGAACCA---
D00011261 Takifugu_rubripes Val TAC -GGTTCTGTAGTGTAGC--GGTT-ATCACGTCTGCTTTACACGCAGAAG-------------------GTCCTGGGTTCGAGCCCCAGTAGAACCA---
D00011262 Takifugu_rubripes Val TAC -GGTTCCATGGTGTAGA--GGTC-ATCATGTCTGCTTTACACGCAGAAG-------------------GTCCTGGGTTCGATTCCCAGTGGAACCA---
D00011263 Takifugu_rubripes Val TAC -GGTTCCATAGTGTAGC--GGTT-ATCACGTCTGCTTTACACGCAGAAG-------------------GTCCTGGGTTCGAGCCCCAGTGGAACCA---
D00003258 Tinamus_tao Val TAC -CAGGACGTAGTATAAA--CTT--AAAGCACTCAGCTTACACCTGAGAG-------------------A-TGCCTTCTAATA-CAGGCCGACCTGA---
D00003240 Trypanosoma_brucei Val TAC --GCGTG_TGATCTAGT--GGTT-ATGATGTCTGCTTTACACGCAGAAC-------------------GTCGCGGGTTCGAACCCCGCCCGCGTAG---
D00010949 Aeropyrum_pernix_K1 Val GAC -GGGCCCGTCGTCTAGCCTGGTT-AGGACGCCGCCCTGACGCGGCGGAG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCGGGCCCACC-
D00003097 Archaeoglobus_fulgidus Val GAC -GGGCTCGTGGTCTAGG--GGTC-ATGACGTCGCCTTGACGAGGCGAAG-------------------GTCGCCCGTTCGAATCGGGCCGAGCCCA---
D00010952 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Val GAC -GGGCTCGTGGTCTAGG--GGTC-ATGACGTCGCCTTGACGAGGCGAAG-------------------GTCGCCCGTTCGAATCGGGCCGAGCCCA---
D00010955 Halobacterium_sp._NRC-1 Val GAC -GGGTTGGTGGTCTAGTCAGGCT-ATGACACCTCCTTGACATGGAGGAG-------------------GTCGGCGGTTCAAATCCGCCCCAACCCA---
D00003100 Methanocaldococcus_jannaschii Val GAC -GGGCTCGTGGTCTAGAT-GGCT-ATGATGCCGCCCTGACACGGCGGTG-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCCCCGAGCCCA---
D00010961 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Val GAC -GGGCTCGTGGTCTAGAT-GGCT-ATGATGCCGCCCTGACACGGCGGTG-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCCCCGAGCCCACC-
D00011877 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Val GAC -GAGCTCGTGGTCTAGTT-GGCT-ATGATACCGCCTTGACTCGGCAGTG-------------------ATCGGGAGTTCAAATCTCTCCGAGCTCACCA
D00010963 Methanococcus_maripaludis Val GAC -GAGTTCGTGGTCTAGTT-GGCT-ATGATACCGCCCTGACACGGCGGTG-------------------ATCGGGAGTTCGAATCTCCCCGGACTCACC-
D00011070 Methanopyrus_kandleri_AV19 Val GAC -GGGCCCGCAGTTCAGCCCGGC--AGAACGCCGGCCTGACGAGCCGGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGCCCA---
D00011890 Methanosarcina_acetivorans_C2A Val GAC -GGGCTCGTGGTCTAGAC-GGTT-ATGACGTCGCCTTGACATGGCGGAG-------------------GTCCTGAGTTCGAATCTCAGCGGGCCCA---
D00011036 Methanosarcina_mazei_Go1 Val GAC -GGGCTCGTGGTCTAGAC-GGTT-ATGACGTCGCCTTGACATGGCGGAG-------------------GTCCTGAGTTCGAATCTCAGCGGGCCCA---
D00011953 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Val GAC -GGGCTCGTGGTCTAGCT-GGTT-ATGACGTCGCCTTGACATGGCGGAG-------------------ATCCTGAGTTCGAATCTCAGCGAGCCCA---
D00010958 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Val GAC -GGGCCGGTGGTCTAGG--GGT--ATGATACCTCCCTGACACGGAGGTG-------------------ATCACGAGTTCGAATCTCGTCCGGCCCA---
D00011989 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Val GAC -GGGCCCGTAGTCTAGG--GGT--ATGACGCCGCCCTGACGAGGCGGAG-------------------GTCCGGGGTTCGAATCCCCGCGGGCCCA---
D00010968 Pyrococcus_abyssi_GE5 Val GAC -GGGCCCGTGGTCTAGACTGGTT-ATGACGCCACCCTGACAAGGTGGAG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCGGGCCCACC-
D00010971 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Val GAC -GGGCCCGTGGTCTAGACTGGTT-ATGACGCCACCCTGACAAGGTGGAG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCGGGCCCACC-
D00010974 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Val GAC -GGGCCCGTGGTCTAGACTGGTT-ATGACGCCACCCTGACAAGGTGGAG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCGGGCCCACCA
D00012036 Staphylothermus_marinus_F1 Val GAC -GGGCCCGTCGTCTAGCCTGGTT-AGGACGCCGCCCTGACGAGGCGGAG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCGGGCCCA---
D00012089 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Val GAC -GGGCCCGTCGTCTAGCCTGGTT-AGGACGCTGCCCTGACGCGGCAGAA-------------------ATCCTGGGTTCAAGTCCCAGCGGGCCCA---
D00003102 Sulfolobus_solfataricus Val GAC -GGGCCCGTCGTCTAGCCTGGTT-AGGACGCTGCCCTGACGCGGCAGAA-------------------ATCCTGGGTTCAAGTCCCAGCGGGCCCA---
D00010977 Sulfolobus_solfataricus_P2 Val GAC -GGGCCCGTCGTCTAGCCTGGTT-AGGACGTCGCCCTGACACGGCGGAG-------------------GTCCTGGGTTCAAATCCCAGCGGGCCC----
D00011052 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Val GAC -GGGCCCGTCGTCTAGCCTGGTT-AGGACGCCGCCCTGACGCGGCGGAG-------------------GTCCTGGGTTCAAGTCCCAGCGGGCCCA---
D00010980 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Val GAC -GGGCTCGTAGTCTAGT--GGT--ATGATGTCGCCCTGACACGGCGGAG-------------------GTCACCGGTTCGAATCCGGTCGGGCCCA---
D00010983 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Val GAC -GGGCTCGTAGTCTAGT--GGT--ATGATGTCGCCCTGACACGGCGGAG-------------------GTCACCGGTTCGAATCCGGTCGGGCCCA---
D00011227 Acinetobacter_sp._ADP1 Val GAC -AGGCGTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCTACGTTGACATCGTAGAG-------------------GTCTCCAGTTCGAGTCTGGATATGCCTACCA
D00010941 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Val GAC -GGGCGTGTAGCTCAGC--GGG--AGAGCACTACGTTGACATCGTAGGG-------------------GTCACAGGTTCAATCCCTGTCACGCCCACCA
D00010905 Aquifex_aeolicus_VF5 Val GAC -AGGCGCGTAGCTCAGTA-GGG--AGAGCGCCGGCCCGACACGCCGGAG-------------------GTCGGGGGTTCAAGTCCCCCCGCGCCTACCA
D00011229 Bacillus_anthracis_str._A2012 Val GAC -GATCCCGTAGCTCAGCA-GGG--AGAGCGCCACCTTGACAGGGTGGAG-------------------GTCGTGAGTTCGAGCCTCTCCGGGATCA---
D00011159 Bacillus_anthracis_str._Ames Val GAC -GATCCCGTAGCTCAGCA-GGG--AGAGCGCCACCTTGACAGGGTGGAG-------------------GTCGTGAGTTCGAGCCTCTCCGGGATCA---
D00011180 Bacillus_anthracis_str._Sterne Val GAC -GATCCCGTAGCTCAGCA-GGG--AGAGCGCCACCTTGACAGGGTGGAG-------------------GTCGTGAGTTCGAGCCTCTCCGGGATCA---
D00011208 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Val GAC -GATCCCGTAGCTCAGCA-GGG--AGAGCGCCACCTTGACAGGGTGGAG-------------------GTCGTGAGTTCGAGCCTCTCCGGGGTCA---
D00011129 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Val GAC -TCTCCCGTAGCTCAGCA-GGG--AGAGCGCCACCTTGACAGGGTGGAG-------------------GTCGTGAGTTCGAGCCTCTCCGGGGTCA---
D00011130 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Val GAC -GATCCCGTAGCTCAGCA-GGG--AGAGCGCCACCTTGACAGGGTGGAG-------------------GTCGCTGGTTCGAGACCAGTCGGGGTCA---
D00011099 Bacillus_halodurans_C-125 Val GAC -GATCCGTTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCTACCTTGACAGGGTAGAG-------------------GTCACTGGTTCGAGCCCAGTACGGGTCA---
D00010836 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Val GAC -GATTCCGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTACCTTGACAGGGTAGAG-------------------GTCGCTGGTTCGAGCCCAGTCGGAATCA---
D00011230 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Val GAC -GATCCCGTAGCTCAGCA-GGG--AGAGCGCCACCTTGACAGGGTGGAG-------------------GTCGTGAGTTCGAACCTCTCCGGGGTCA---
D00011160 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Val GAC -GGGCGTGTAGCTCAGC--GGG--AGAGCACTACGTTGACATCGTAGGG-------------------GTCACAGGTTCAATCCCTGTCACGCCCACCA
D00011234 Bartonella_quintana_str._Toulouse Val GAC -GGGCGTGTAGCTCAGC--GGG--AGAGCACTACGTTGACATCGTAGGG-------------------GTCACAGGTTCGATCCCTGTCACGCCCACCA
D00011162 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Val GAC -GCGGATATAGCGTAGTT-GGT--AGCGCGCTTCCTTGACATGGAAGAG-------------------GTCACTGGTTCAAGTCCAGTTATTCGCACCA
D00011073 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Val GAC -GGGCGGTTGGCGCAGT--GGT--AGCGCACTTCCCTGACACGGAAGGG-------------------GTCACAAGTTCGAATCTTGTATCGCCCA---
D00011075 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Val GAC -GGGCGGTTGGCGCAGT--GGT--AGCGCACTTCCCTGACACGGAAGGG-------------------GTCACAAGTTCGAATCTTGTATCGCCCA---
D00011105 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Val GAC -GGGCACGTAGCTCAGC--GGG--AGAGCACTACCTTGACATGGTAGGG-------------------GTCACAGGTTCGATCCCTGTCGTGCCCACCA
D00010924 Brucella_melitensis_16M Val GAC -GGGCGTGTAGCTCAGC--GGG--AGAGCACTACGTTGACATCGTAGGG-------------------GTCACAGGTTCAATCCCTGTCACGCCCACCA
D00011077 Brucella_suis_1330 Val GAC -GGGCGTGTAGCTCAGC--GGG--AGAGCACTACGTTGACATCGTAGGG-------------------GTCACAGGTTCAATCCCTGTCACGCCCACCA
D00010839 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Val GAC -ACGTTCGTAGCTCAATT-GGTT-AGAGCGCTACCATGACATGGTAGAA-------------------GTTAGTGGTTCAAGTCCACTCGAACGTA---
D00011132 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Val GAC -ATGTCCGTAACTCAGTCAGGT--AGAGTGCCATCATGACATGATGGAA-------------------GTCAGTGGTTCAATTCCACTCGGACATACCA
D00011039 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Val GAC -ACGTTCGTAGCTCAATA-GGTT-AGAGCATTACCATGACATGGTAGAG-------------------GTTAGTGGTTCAAGTCCACTCGAACGTA---
D00010877 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Val GAC -GGTTCCGTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCACTACCTTGACATGGTAGTG-------------------GCCGTTGGTTCAAGTCCAATCGGAGCCACCA
D00011236 Candidatus_Blochmannia_floridanus Val GAC -GCGTTCTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGTGCTACCGTGACATGGTAGAG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTAGAACGCA---
D00011171 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Val GAC -GAGATATTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCCACGTTGACATCGTGGAG-------------------GTCAGCTGTTCGAGTCAGCTATATCTCA---
D00010880 Caulobacter_crescentus_CB15 Val GAC -GGACGCGTAGCTCAGC--GGG--AGAGCACTACGTTGACATCGTAGGG-------------------GTCACAGGTTCAATCCCTGTCGCGTCCACCA
D00010914 Chlamydia_muridarum_Nigg Val GAC -GGGGTATTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTCACGTTGACATCGTGAAG-------------------GTCAGCTGTTCAAGTCAGCTATATCCCA---
D00010834 Chlamydia_trachomatis Val GAC -GGGGTATTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTCACGTTGACATCGTGAAG-------------------GTCAGCTGTTCAAGTCAGCTATATCCC----
D00010832 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Val GAC -GGGGTATTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTCACGTTGACATCGTGAAG-------------------GTCAGCTGTTCAAGTCAGCTATATCCCA---
D00010828 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Val GAC -GGGGTATTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTCACGTTGACATCGTGAAG-------------------GTCAGCTGTTCAAGTCAGCTATATCCCA---
D00010830 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Val GAC -GGGGTATTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTCACGTTGACATCGTGAAG-------------------GTCAGCTGTTCAAGTCAGCTATATCCCA---
D00010857 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Val GAC -GGGGTATTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTCACGTTGACATCGTGAAG-------------------GTCAGCTGTTCAAGTCAGCTATATCCCA---
D00011031 Chlorobium_tepidum_TLS Val GAC -GGGCGGTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCTACCTTGACACGGTAGAG-------------------GTCAGAAGTTCGAATCTTCTATCGCCCA---
D00011165 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Val GAC -GCGCGTTTAGCTCAGC--GGG--AGAGCGCTTCCCTGACACGGAAGAG-------------------GTCACTGGTTCAATCCCAGTATCGCGCA---
D00011080 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Val GAC -GCGCGTTTAGCTCAGC--GGG--AGAGCGCTTCCCTGACACGGAAGAG-------------------GTCACTGGTTCAATCCCAGTATCGCGCACCA
D00011042 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Val GAC -GCGCGTTTAGCTCAGC--GGG--AGAGCGCTTCCCTGACACGGAAGAG-------------------GTCACTGGTTCAATCCCAGTATCGCGCACCA
D00011126 Coxiella_burnetii_RSA_493 Val GAC -AGGCACGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGTTGGTTCGATACCAATCGTGCCTACCA
D00010883 Deinococcus_radiodurans_R1 Val GAC -AGAACCGTAGCTCAGG--GGT--AGAGCACTACCTTGACACGGTAGGG-------------------GTCAGGGGTTCAAATCCCCTCGGTTCTACCA
D00011211 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Val GAC -AGGCGCGTAGCTCAGG--GGG--AGAGCACTTCCTTGACACGGAAGGG-------------------GTCAGCAGTTCAAATCTGCTCGTGCCTACCA
D00003122 Escherichia_coli Val GAC -GCGTCCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGGACGCACCA
D00003123 Escherichia_coli Val GAC -GCGTTCATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGAACGCACCA
D00011134 Escherichia_coli_CFT073 Val GAC -GCGTTCATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGAACGCACCA
D00011135 Escherichia_coli_CFT073 Val GAC -GCGTCCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGGACGCACCA
D00010859 Escherichia_coli_K12 Val GAC -GCGTTCATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGAACGCACCA
D00010860 Escherichia_coli_K12 Val GAC -GCGTCCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGGACGCACCA
D00010862 Escherichia_coli_O157:H7 Val GAC -GCGTTCATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGAACGCACCA
D00010863 Escherichia_coli_O157:H7 Val GAC -GCGTCCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGGACGCACCA
D00010866 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Val GAC -GCGTTCATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGAACGCACCA
D00010867 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Val GAC -GCGTCCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGGACGCACCA
D00011182 Geobacter_sulfurreducens_PCA Val GAC -AGGCGCGTAGCTCAGG--GGG--AGAGCGCTACCTTGACACGGTAGAG-------------------GTCGGCGGTTCGAGACCGCCCGCGCCTACCA
D00003126 Haemophilus_influenzae Val GAC -GCGACTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCACTGGTTCGAGTCCAGCTAGTCGCACCA
D00010874 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Val GAC -GCGACTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCACTGGTTCGAGTCCAGCTAGTCGCACCA
D00003117 Helicobacter_pylori Val GAC -GGTCGCGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACTACCTTGACATGGTAGTG-------------------GCCGCTGGTTCAAGTCCAGTCGTGGCCACCA
D00010870 Helicobacter_pylori_26695 Val GAC -GGTCGCGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACTACCTTGACATGGTAGTG-------------------GCCGCTGGTTCAAGTCCAGTCGTGGCCACCA
D00010872 Helicobacter_pylori_J99 Val GAC -GGTCGCGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACTACCTTGACATGGTAGTG-------------------GCCGCTGGTTCAAGTCCAGTCGTGGCCACCA
D00011187 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Val GAC -GGGCGATTGGCGCAGC--GGT--AGCGCGCTTCCCTGACACGGAAGAG-------------------GTCACTGGTTCGATCCCAGTATCGCCCA---
D00011084 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Val GAC -GGGGGATTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCTACCTTGACATGGTAGAG-------------------GTCACTGGTTCGATCCCAGTATCTCCCACCA
D00010909 Listeria_innocua_Clip11262 Val GAC -GGTCCTGTAGCTCAGTT-GGG--AGAGTATCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGCTGGTTCGAGACCAGTCGGGACCA---
D00010912 Listeria_monocytogenes_EGD-e Val GAC -GGTCCTGTAGCTCAGTT-GGG--AGAGTATCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGCTGGTTCGAGACCAGTCGGGACCA---
D00011215 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Val GAC -GGTCCTGTAGCTCAGTT-GGG--AGAGTATCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGCTGGTTCGAGACCAGTCGGGACCA---
D00010926 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Val GAC -GGGCGTGTAGCTCAGC--GGG--AGAGCACTGCATTGACATTGCAGGG-------------------GTCACAGGTTCAATCCCTGTCACGCCCACCA
D00011124 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Val GAC -GCGCGATTAGCTCAGC--GGG--AGAGCGCTTCCCTGACACGGAAGAG-------------------GTCACTGGTTCAATCCCAGTATCGCGCACCA
D00010854 Mycobacterium_leprae_TN Val GAC -GCGCGATTAGCTCAGC--GGG--AGAGCACTTCCCTGACACGGAAGAG-------------------GTCACTGGTTCAATCCCAGTATCGCGCACCA
D00010842 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Val GAC -GCGCGATTAGCTCAGC--GGG--AGAGCGCTTCCCTGACACGGAAGAG-------------------GTCACTGGTTCAATCCCAGTATCGCGCACCA
D00011170 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Val GAC -GCGCGATTAGCTCAGC--GGG--AGAGCGCTTCCCTGACACGGAAGAG-------------------GTCACTGGTTCAATCCCAGTATCGCGCACCA
D00010844 Neisseria_meningitidis_MC58 Val GAC -AGGCACGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGTTGGTTCGAATCCAATCGTGCCTACCA
D00010847 Neisseria_meningitidis_Z2491 Val GAC -AGGCACGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGTTGGTTCGAATCCAATCGTGCCTACCA
D00011153 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Val GAC -AGGCGCGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGTTGGTTCGAGTCCAATCGCGCCTACCA
D00010938 Nostoc_sp._PCC_7120 Val GAC -GGACGTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCTACGTTGACATCGTAGAG-------------------GTCACTGGTTCGAATCCAGTTACGTCCA---
D00011086 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Val GAC -GATTCCGTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCCACCTTGACAGGGTGGAG-------------------GTCGTTGGTTCGAGCCCAATCGGAATCA---
D00010887 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Val GAC -GCGACTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCACTGGTTCGAGTCCAGCTAGTCGCACCA
D00011174 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Val GAC -GCGTCCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGGACGCACCA
D00011217 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Val GAC -GGGCGGTTGGCGCAGT--GGT--AGCGCGCTTCCCTGACACGGAAGAG-------------------GTCGCCAGTTCAAACCTGGCATCGCCCA---
D00010892 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Val GAC -AGGCACGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGTTGGTTCGAATCCAATCGTGCCTACCA
D00011156 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Val GAC -AGGCACGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGTTGGTTCGAGTCCAATCGCGCCTACCA
D00010933 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Val GAC -AGGCTCGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGTTGGTTCGAGTCCAATCGAGCCTACCA
D00011148 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Val GAC -GATCGCGTGGTCCAGC--GGCT-AAGACGCCTGTGTGACAAGCAGGAG-------------------ACCGATGGTTCGATTCCATCCGTGATCA---
D00011150 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Val GAC -GGGCGATTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCCACGTTGACATCGTGGAG-------------------GTCACAGATTCGAGTTCTGTATCGCCCA---
D00011175 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Val GAC -GGGCGCGTAGCTCAGC--GGG--AGAGCACCTCGTTGACATCGAGGGG-------------------GTCACAGGTTCGATCCCTGTCGCGCCCACCA
D00010920 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Val GAC -GGGTGATTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCATTACGTTGACATCGTAAAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGCCCACTATCACTCACCA
D00011041 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Val GAC -GGGTGATTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCATTACGTTGACATCGTAAAG-------------------GTCAGTGGTTCGAGTCCACTATCACCCACCA
D00011191 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Val GAC -GGGTGATTAGCTCAGTT-GGTC-AGAGTATTACGTTGACATCGTAAAG-------------------GTCAGTGGTTCGAACCCACTATCACCCACCA
D00010942 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Val GAC -GCGTTCATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGAACGCACCA
D00010943 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Val GAC -GCGTCTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTCAGACGCACCA
D00011144 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Val GAC -GCGTCTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTCAGACGCACCA
D00011145 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Val GAC -GCGTTCATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGAACGCACCA
D00011091 Shewanella_oneidensis_MR-1 Val GAC -GCACCCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACTACCTTGACATGGTAGGG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGGGTGTACCA
D00011096 Shigella_flexneri_2a_str._301 Val GAC -GCGTTCATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGGACGCACCA
D00010947 Sinorhizobium_meliloti_1021 Val GAC -GGGCGTGTAGCTCAGC--GGG--AGAGCACTACGTTGACATCGTAGGG-------------------GTCACAAGTTCGATCCTTGTCACGCCCACCA
D00011137 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Val GAC -GGGCGCGTAGCTCAGG--GGT--AGAGCGCCGCCCTTACAAGGCGGAT-------------------GTCGGCGGTTCGAAACCGTCCGCGCCCACCA
D00011138 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Val GAC -GCGCGATTAGCTCAGC--GGG--AGAGCGCTTCCCTGACACGGAAGAG-------------------GTCACTGGTTCAATCCCAGTATCGCGCACCA
D00011139 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Val GAC -GCGCGATTAGCTCAGC--GGG--AGAGCGCTTCCCTGACACGGAAGAG-------------------GTCACTGGTTCAATCCCAGTATCGCGCA---
D00011140 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Val GAC -GGACGATTAGCTCAGC--GGG--AGAGCGCTTCCCTGACACGGAAGAG-------------------GTCACTGGTTCAATCCCAGTATCGTCCA---
D00011088 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Val GAC -GGACGATTAGCTCAGC--GGG--AGAGCGCTTCCCTGACACGGAAGAG-------------------GTCACTGGTTCAATCCCAGTATCGTCCA---
D00011089 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Val GAC -GCGCGATTAGCTCAGC--GGG--AGAGCGCTTCCCTGACACGGAAGAG-------------------GTCACTGGTTCAATCCCAGTATCGCGCA---
D00003111 Streptomyces_lividans Val GAC -GGACGATTAGCTCAGC--GGG--AGAGCGCTTCCCTGACACGGAAGAG-------------------GTCACTGGTTCAATCCCAGTATCGTCCA---
D00003112 Streptomyces_lividans Val GAC -GCGCGATTAGCTCAGC--GGG--AGAGCGCTTCCCTGACACGGAAGAG-------------------GTCACTGGTTCAATCCCAGTATCGCGCA---
D00011193 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Val GAC -GCGCGGTTAGCTCAGAT-GGG--AGAGCGCGTGATTGACGTTCACGAG-------------------GTCAGAGGTTCGATCCCTCTACCGCGCACCA
D00011194 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Val GAC -GCGCGGTTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCATGATTGACGTTCATGAG-------------------GTCAGAGGTTCGATCCCTCTACCGCGCACCA
D00003128 Synechocystis_sp. Val GAC -GGACGTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGTACATCGTTGACATCGATGGG-------------------GTCACTGGTTCGAATCCAGTTACGTCCA---
D00010894 Synechocystis_sp._PCC_6803 Val GAC -GGACGTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGTACATCGTTGACATCGATGGG-------------------GTCACTGGTTCGAATCCAGTTACGTCCA---
D00011057 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Val GAC -GGGGTCATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCTACGTTGACATCGTAGAG-------------------GCCACAGGTTCAAGTCCTGTTGACCCCACCA
D00011050 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Val GAC -GGACGCATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACGTTGACATCGTGGGG-------------------GTCACTGGTTCGAGTCCAGTTGTGTCCA---
D00010897 Thermotoga_maritima_MSB8 Val GAC -GGGTGCGTAGCTCAGT--GGG--AGAGCGCTTCCTTGACGAGGAAGAG-------------------GTCGCAGGTTCAATCCCTGCCGCACCCACCA
D00011220 Thermus_thermophilus_HB27 Val GAC -GGGCGCGTAGCTCAGGT-GGCT-AGAGCACTACCTTGACACGGTAGGG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACTCGCGCCCACCA
D00011223 Treponema_denticola_ATCC_35405 Val GAC -GGGCAATTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGTACAAGCATGACACGCTTGGG-------------------GTCACTGGTTCGATTCCAGTATTGCCCA---
D00003107 Treponema_pallidum Val GAC -GGGCAATTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGTACAAGCATGACACGCTTGGG-------------------GTCACTGGTTCGATCCCAGTATTGCCCA---
D00010890 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Val GAC -GGGCAATTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGTACAAGCATGACACGCTTGGG-------------------GTCACTGGTTCGATCCCAGTATTGCCCA---
D00011113 Tropheryma_whipplei_str._Twist Val GAC -GGGCGATTGGCGCAGT--GGT--AGCGCGCTTCCTTGACACGGAAGAG-------------------GTCACTGGTTCGAGTCCAGTATCGCCCA---
D00011116 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Val GAC -GGGCGATTGGCGCAGT--GGT--AGCGCGCTTCCTTGACACGGAAGAG-------------------GTCACTGGTTCGAGTCCAGTATCGCCCA---
D00010849 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Val GAC -GCGTCTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTTAGACGCACCA
D00010850 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Val GAC -GCGTCCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGGACGCACCA
D00011225 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Val GAC -GGGTAATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACTTGCTTGACGTGCAAGCG-------------------GTCGCTGGTTCGAACCCAGTGTTACCCA---
D00011063 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Val GAC -GGGCGGTTAGCTCAGC--GGT--AGAGCACTACCTTGACATGGTAGGG-------------------GTCACAGGTTCGAACCCTGTACCGCCCACCA
D00011060 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Val GAC -GGGCGGTTAGCTCAGC--GGT--AGAGCACTACCTTGACATGGTAGGG-------------------GTCACAGGTTCGAACCCTGTACCGCCCACCA
D00010900 Xylella_fastidiosa_9a5c Val GAC -GGGCGGTTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACTACCTTGACATGGTAGGG-------------------GTCACAGGTTCGAACCCTGTACCGCCCACCA
D00010902 Xylella_fastidiosa_9a5c Val GAC -GCGTTCATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGAACGCACCA
D00010903 Xylella_fastidiosa_9a5c Val GAC -GCGTCCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGGACGCACCA
D00011120 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Val GAC -GGGCGGTTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACTACCTTGACATGGTAGGG-------------------GTCACAGGTTCGAGCCCTGTACCGCCCACCA
D00011197 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Val GAC -GCGTCCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTCGGACGCACCA
D00011198 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Val GAC -GCGTCCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTAGAACGCACCA
D00010928 Yersinia_pestis_CO92 Val GAC -GCGTCCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTCGGACGCACCA
D00010929 Yersinia_pestis_CO92 Val GAC -GCGTCCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTAGAACGCACCA
D00011068 Yersinia_pestis_KIM Val GAC -GCGTCCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTAGAACGCACCA
D00011069 Yersinia_pestis_KIM Val GAC -GCGTCCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTCGGACGCACCA
D00011200 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Val GAC -GCGTCCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTCGGACGCACCA
D00011201 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Val GAC -GCGTTCTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCACCTTGACATGGTGGGG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTAGAACGCACCA
D00003250 Arabidopsis_thaliana Val AAC -GGTTTCGTGGTGTAGTT-GGTT-ATCACGTCAGTCTAACACACTGAAG-------------------GTCTCCGGTTCGAACCCGGGCGAAGCCA---
D00003252 Caenorhabditis_elegans Val AAC -GGTCTCGTGGTGTAGT--GGTT-ATCACATCTGTCTAACACACAGAAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGCCCGCCCGAGATCA---
D00011007 Caenorhabditis_elegans Val AAC -GGTTTCGTGGTGTAGT--GGTT-ATCACATCTGTCTAACACACAGAAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGCCCGCCCGAGATCT---
D00011008 Caenorhabditis_elegans Val AAC -GGTTTCGTGGTGTAGT--GGTT-ATCACATCTGTCTAACACACAGAAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGCCCGCCCGAGATCA---
D00011009 Caenorhabditis_elegans Val AAC -GGTCTCGTGGTGTAGT--GGTT-ATCACATCTGTCTAACACACAGAAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGCCCGCCCGAGATCA---
D00011010 Caenorhabditis_elegans Val AAC -GGTCTCGTGGTGTAGT--GGTT-ATCACATCTGTCTAACACACAGAAG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGCCCGAGATCA---
D00011203 Candida_glabrata_CBS_138 Val AAC -GGTTTCGTGGTCTAGTC-GGTT-ATGGCATCTGCTTAACACGCAGAAC-------------------GTCCCCAGTTCGATCCTGGGCGAAATCA---
D00003243 Dictyostelium_discoideum Val AAC -GTTCGGATGGTGTAGTC-GGTT-ATCACGAATCCTTAACACGGATTAG-------------------GTCGTGGGTTCGATTCCCGCTCTGAATA---
D00003254 Drosophila_melanogaster Val AAC -GTTTCCGTGGTGTAGT--GGTT-ATCACATCCGCCTAACACGCGGAAG-------------------GCCCCCGGTTCAATCCCGGGCGGAAACA---
D00011021 Drosophila_melanogaster Val AAC -GTTTCCGTGGTGTAGC--GGTT-ATCACATCTGCCTAACACGCAGAAG-------------------GCCCCCGGTTCGATCCCGGGCGGAAAC----
D00011022 Drosophila_melanogaster Val AAC -GTTTCCGTGGTGTAGT--GGTT-ATCACATCCGCCTAACACGCGGAAG-------------------GCCCCCGGTTCAATCCCGGGCGGAAACA---
D00011065 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Val AAC -GTGACCTTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTTCGCCTAACACGCGGAAG-------------------GTCCCCAGTTCGAGCCTGGGAGGTCGCA---
D00011238 Gallus_gallus Val AAC -GTTTCCGTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTCCGCCTAACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAAACCGGGCGGAAACA---
D00011239 Gallus_gallus Val AAC -GTTTCTGTAGTGTAGT--GGTC-ATCACATTCGCCTAACACGCGAAAG-------------------GTCCCTGGTTCGAAACCAGGCAGAAACA---
D00011240 Gallus_gallus Val AAC -GTTTCTGTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTTCGCCTAACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAAACCGGGCAGAAACA---
D00011241 Gallus_gallus Val AAC -GTTTCCGTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTTCGCCTAACACGCGAAAG-------------------GTCCCTGGTTCGAAACCAGGCGGAAACA---
D00011242 Gallus_gallus Val AAC -GTTTCCGTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTTCGCCTAACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAAACCGGGCGGAAACA---
D00011243 Gallus_gallus Val AAC -GCATCCATGGCTGAAT--GGT--GAAAGCGCCCACCAACCATGGGTAA-------------------AAAGTAGGTTCGATTCCTGCCGGATGCA---
D00003259 Homo_sapiens Val AAC -GTTTCCGTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTTCGCCTAACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAAACCGGGCGGAAACA---
D00003261 Homo_sapiens Val AAC -GTTTCCGTAGTGTAGT--GGTC-ATCACGTTCGCCTAACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAAACCGGGCGGAAACA---
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D00010986 Homo_sapiens Val AAC -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGTATGCTTAACATTCATGAG-------------------GCTCTGGGTTCGATCCCCAGCACTTCC----
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D00011264 Pan_troglodytes Val AAC -GTTTCCATAGTGTACT--GGTT-ATCACATTCACCTAACACGCGAAAG-------------------GTCCTTGGTTTGAAACCAGGCAGAAACA---
D00011265 Pan_troglodytes Val AAC -GTTTCCGTAGTGTAGT--GGTT-ATCGCGTTCGCCTAACACGCGAAAG-------------------GTTCCTGGTTCGAAACCAGGCGGAAACA---
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D00011267 Pan_troglodytes Val AAC -GTTTCCGTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTTCACCTAACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAAACCGGGCGGAAACA---
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D00011231 Plasmodium_falciparum_3D7 Val AAC -GCGGGCATGGTCTAGT--GGCT-ATGACGCCTGCCTAACACGCAGGAG-------------------ATCCCGAGTTCGATCCTCGGTGCCCGTA---
D00003245 Saccharomyces_cerevisiae Val AAC -GGTTTCGTGGTCTAGTC-GGTT-ATGGCATCTGCTTAACACGCAGAAC-------------------GTCCCCAGTTCGATCCTGGGCGAAATCA---
D00003246 Saccharomyces_cerevisiae Val AAC -GGTTTCGTGGTCTAGTC-GGTT-ATGGCATCTGCTTAACACGCAGAAC-------------------GTCCCCAGTTCGATCCTGGGCGAAATCG---
D00011017 Saccharomyces_cerevisiae Val AAC -GGTTTCGTGGTCTAGTC-GGTT-ATGGCATCTGCTTAACACGCAGAAC-------------------GTCCCCAGTTCGATCCTGGGCGAAATCG---
D00011018 Saccharomyces_cerevisiae Val AAC -GGTTTCGTGGTCTAGTC-GGTT-ATGGCATCTGCTTAACACGCAGAAC-------------------GTCCCCAGTTCGATCCTGGGCGAAATCA---
D00003248 Schizosaccharomyces_pombe Val AAC -GGTCGTGTGGTTTAGAT-GGTT-ATAATTTCTGCTTAACACGCAGACG-------------------GTCCCAAGTTCGAGTCTTGGCACGATCA---
D00011026 Schizosaccharomyces_pombe Val AAC -GGTCGTGTGGTTTAGAT-GGTT-ATAATTTCTGCTTAACACGCAGACG-------------------GTCCCAAGTTCGAGTCTTGGCACGATCA---
D00011027 Schizosaccharomyces_pombe Val AAC -GGTCGTGTGGTTTAGAT-GGTT-ATAATTTCTGCTTAACACGCAGACG-------------------GTCCCAAGTTCGAGTCTTGGCACGATCA---
D00011251 Takifugu_rubripes Val AAC --GTTTCATAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTCTGCCTAACACGCAGAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAAACCGGGTGTAAACA---
D00011252 Takifugu_rubripes Val AAC -GTTTCCGTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTTCGCCTAACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAGACCGGGCGGGAACA---
D00011253 Takifugu_rubripes Val AAC -GTTTCCGTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTTCGCCTAACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAGACCGGGCGGAAACA---
D00011254 Takifugu_rubripes Val AAC -GTTTCCATAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTCTGCCTAACACGCAGAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAAACCGGGTGGAAACA---
D00011255 Takifugu_rubripes Val AAC -GTTTCCGTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTTCGCCTAACACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAAACCGGGCGGAAACA---
D00007415 Aeropyrum_pernix_K1 Met CAT -AGCGGGGTAGGGTAGCCTGGC--AGCCCGCGGGGCTCATAACCCCGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAATCCACCCCCCGCTACC-
D00007416 Aeropyrum_pernix_K1 Met CAT -GCCGCCGTAGCTCAGCCTGGC--AGAGCGCCGGACTCATAATCCGGAG-------------------GTCCCGGGTTCGAATCCCGGCGGCGGCACC-
D00007417 Aeropyrum_pernix_K1 Met CAT -GGGCCCGTAGCTCAGCCAGGT--AGAGCGCCCGGCTCATAACCGGGTG-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCCCCGGGCCCACC-
D00001780 Archaeoglobus_fulgidus Met CAT -AGCGGGGTGGGGTAGTCAGGTG-ATCCCGGCGGGCTCATAACCCGCAG-------------------ATCCGTGGTTCAAATCCACGCCCCGCTA---
D00001781 Archaeoglobus_fulgidus Met CAT -GCCGAGGTAGCCTAGCT-GGTT-GGGGCGCCTGACTCATAATCAGGAG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCCCCCTCGGCA---
D00001782 Archaeoglobus_fulgidus Met CAT -GGGCCCGTAGCTTAGCCAGGTC-AGAGCGCCCGGCTCATAACCGGGCG-------------------GTCGAGGGTTCGAATCCCTCCGGGCCCA---
D00007418 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Met CAT -AGCGGGGTGGGGTAGTCAGGTG-ATCCCGGCGGGCTCATAACCCGCAG-------------------ATCCGTGGTTCAAATCCACGCCCCGCTA---
D00007419 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Met CAT -GCCGAGGTAGCCTAGCT-GGTT-GGGGCGCCTGACTCATAATCAGGAG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCCCCCTCGGCA---
D00007420 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Met CAT -GGGCCCGTAGCTTAGCCAGGTC-AGAGCGCCCGGCTCATAACCGGGCG-------------------GTCGAGGGTTCGAATCCCTCCGGGCCCA---
D00007421 Halobacterium_sp._NRC-1 Met CAT -AGCGGGATGGGATAGCCAGGAG-ATTCCGCCGGGCTCATAACCCGGAG-------------------ATCGGTAGTTCAAATCTACCTCCCGCTA---
D00007422 Halobacterium_sp._NRC-1 Met CAT -GGGCCCTTAGCTTAGTCCGGTTCAAAGCCCCCGGCTCATAACCGGGTG-------------------AGCGGTGGTTCAAATCCGCCAGGGCCCA---
D00007423 Halobacterium_sp._NRC-1 Met CAT -GCCCGGGTGGCTTAGCT-GGTC-ATAGCGCCGCACTCATAATGCGGAG-------------------ATCGAGGGTTCAAAACCCTCCCCGGGCA---
D00001783 Methanocaldococcus_jannaschii Met CAT -GGGCCCGTAGCTCAGCCTGGTC-AGAGCGCTCGGCTCATAACCGAGTG-------------------GTCAAGGGTTCAAATCCCTTCGGGCCCA---
D00001784 Methanocaldococcus_jannaschii Met CAT -GCCGAGGTGGCTTAGCT-GGTT-ATAGCGCCCGGCTCATACCCGGGAG-------------------GTCGAGGGTTCGAATCCCTCCCTCGGCA---
D00007427 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Met CAT -AGCGGGGTAGGGTAGCCAGGTCCATCCCGCCGGGCTCATAACCCGGAG-------------------ATCGGAGGTTCAAATCCTCCCCCCGCTA---
D00007428 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Met CAT -GGGCCCGTAGCTCAGCCTGGTC-AGAGCGCTCGGCTCATAACCGAGTG-------------------GTCAAGGGTTCAAATCCCTTCGGGCCCACC-
D00007429 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Met CAT -GCCGAGGTGGCTTAGCT-GGTT-ATAGCGCCCGGCTCATAACCGGGAG-------------------GTCGAGGGTTCGAATCCCTCCCTCGGCACC-
D00011847 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Met CAT -AGCGAGGTAGGGTAGCCAGGCCCATCCCGCCGGGCTCATAACCCGGAG-------------------ATCCGAAGTTCGAATCTTCGCCTCGCTA---
D00011856 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Met CAT -GGGACCATAGCTCAGCCTGGTT-GGAGCGCTCGGCTCATAACCGAGTG-------------------GTCAAGGGTTCAAATCCCTTTGGTCCCA---
D00011859 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Met CAT -GCCGAGGTGGCTTAGGCTGGTT-ATAGCGCTCGGCTCATAACCGAGAG-------------------GCCGGGGGTTCGAGTCCCCCCCTCGGCA---
D00007430 Methanococcus_maripaludis Met CAT -AGCGAGGTAGGGTAGCCAGGCCTATCCCGCCGGGCTCATAACCCGGAG-------------------ATCAGAAGTTCAAATCTTCTCCTCGCTACC-
D00007431 Methanococcus_maripaludis Met CAT -GGGCCCGTAGCTCAGGCTGGTT-AGAGTGCTCGGCTCATAACCGAGTG-------------------GTCATGGGTTCAAATCCCATCGGGCCCA---
D00007432 Methanococcus_maripaludis Met CAT -GCCGAGGTGGCTTAGGCTGGTT-ATAGCGCTCGGCTCATAACCGAGAG-------------------GTCGGGGGTTCAAGTCCCCCCCTCGGC----
D00007531 Methanopyrus_kandleri_AV19 Met CAT -AGCGGGGCGGGGTAGCCAGGTCCATCCCGCCGGGCTCATAACCCGGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCCCGCTACCA
D00007532 Methanopyrus_kandleri_AV19 Met CAT -GGGCCCGCAGCTCAGTCCGGTT-AGAGCGCGGGGCTCATAACCCCGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGCCCA---
D00011881 Methanosarcina_acetivorans_C2A Met CAT -GCCCGGATAGCCTAGTC-GGTT-GGGGCGCCAGACTCATAATCTGGAG-------------------GTCGCGTGTTCGAGTCACGCTCCGGGCA---
D00011895 Methanosarcina_acetivorans_C2A Met CAT -GGGCCCGTAGCTCAGTCAGGTT-AGAGCGCTCGGCTCATAACCGAGCG-------------------GTCACCGGTTCAAATCCGGTCAGGCCCA---
D00011899 Methanosarcina_acetivorans_C2A Met CAT -AGCGGGGTGGGGTAGCCAGGAG-ATCCCGACGGGCTCATAACCCGTAG-------------------ACCGATGGTTCGAATCCATCCCCCGCTA---
D00007490 Methanosarcina_mazei_Go1 Met CAT -AGCGGGGTGGGGTAGCCAGGAG-ATCCCGACGGGCTCATAACCCGTAG-------------------ACCGATGGTTCGAATCCATCCCCCGCTA---
D00007491 Methanosarcina_mazei_Go1 Met CAT -GGGCCTGTAGCTCAGTCAGGTT-AGAGCGCTCGGCTCATAACCGAGCG-------------------GTCACCGGTTCAAATCCGGTCAGGCCCA---
D00007492 Methanosarcina_mazei_Go1 Met CAT -GCCCGGATAGCCTAGTC-GGTT-GGGGCGCCAGACTCATAATCTGGAG-------------------GTCGCGTGTTCGAGTCACGCTCCGGGCA---
D00011949 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Met CAT -GGGCCTGTAGCTTAGC--GGTG-AGAGCGCCCGGCTCATAACCGGGCG-------------------GTCATGCGTTCGAATCGCATCAGGCCCA---
D00011954 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Met CAT -GCTGTTGTGGCCTAGCT-GGTT-AGGGCGCCAGACTCATAATCTGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGGATCCCGTCAACAGCA---
D00011962 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Met CAT -AGCGAGGTGGGGTAGTCAGGAT-ATCCCGACGGGCTCATAACCCGTAG-------------------ACCGATGGTTCAAATCCATCCCTCGCTA---
D00007424 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Met CAT -AGCGGGGTGGGGTAGTCTGGTG-ATCCCGCGGGGCTCATAACCCCGAG-------------------ATCCCTAGTTCAAATCTAGGCCCCGCTA---
D00007425 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Met CAT -GGGCCCATAGCTTAGCCAGG---TAGAGGCCCGGCTCATAACCGGGCG-------------------GCCATGGGTTCGAATCCCATTGGGCCCA---
D00007426 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Met CAT -GCCGGGGTGGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGGCTCATAACCGTGAG-------------------GCCGCGGGTTCGAATCCCGCCCCCGGCA---
D00001785 Methanothermus_fervidus Met CAT -GGGCCCAT_GCTTAGCCAGGT--AGAGCGCCCGGCTCATAACCGGGCG-------------------GTCATGGGTTCGAATCCCATTGGGCCCA---
D00011986 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Met CAT -GCCGCCGTAGCTCAGC--GGTC-AGAGCGCCCGGCTCATAACCGGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGCCGGCGGCA---
D00007433 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Met CAT -GCCGCCGTAGCTCAGCCTGGA--AGAGCGCTCGGCTCATAACCGGGTT-------------------GCCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCGGCA---
D00007434 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Met CAT -GGGCCCGTAGCTTAGCCAGGT--AGAGCGCCCGGCTCATAACCGGGCG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGCCCA---
D00007435 Pyrococcus_abyssi_GE5 Met CAT -AGCGGGGTGGGGCAGCTAGGAG-TGCCCGCCGGGCTCATAACCCGGAG-------------------GTCCGAGGTTCAAATCCTCGCCCCGCTACC-
D00007436 Pyrococcus_abyssi_GE5 Met CAT -GGGCCCGTAGCTCAGCCTGGTC-AGAGCGCGCGGCTCATAACCGCGTG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCGGGCCCACC-
D00007437 Pyrococcus_abyssi_GE5 Met CAT -GCCGGGGTAGCTTAGCCTGGTC-AAAGCGCCCGGCTCATAACCGGGAG-------------------ATCCGGGGTTCGAAGCCCCGCCCCGGCACC-
D00007438 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Met CAT -AGCGGGGTGGGGCAGCTAGGAG-TGCCCGCCGGGCTCATAACCCGGAG-------------------GTCCGAGGTTCAAATCCTCGGCCCGCTACC-
D00007439 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Met CAT -GGGCCCGTAGCTCAGCCTGGTC-AGAGCGCGCGGCTCATAACCGCGTG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCGGGCCCACC-
D00007440 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Met CAT -GCCGGGGTAGCTTAGCCTGGTC-AAAGCGCCCGGCTCATAACCGGGAG-------------------ATCCGGGGTTCGAAGCCCCGCCCCGGCACC-
D00007441 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Met CAT -AGCGGGGTGGGGCAGCTAGGAG-TGCCCGCCGGGCTCATAACCCGGAG-------------------GTCCGAGGTTCAAATCCTCGCCCCGCTACCA
D00007442 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Met CAT -GGGCCCGTAGCTCAGCCTGGTC-AGAGCGCGCGGCTCATAACCGCGTG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCGGGCCCACCA
D00007443 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Met CAT -GCCGGGGTAGCTTAGCCTGGTC-AAAGCGCCCGGCTCATAACCGGGAG-------------------ATCCGGGGTTCGAAGCCCCGCCCCGGCACCA
D00012038 Staphylothermus_marinus_F1 Met CAT -GCCGCCGTAGCTCAGCCTGGC--AGAGCGCCGGACTCATAATCCGGTT-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCGGCA---
D00012049 Staphylothermus_marinus_F1 Met CAT -GGGCCCGTAGCTCAGCCAGGT--AGAGCGCCGGGCTCATAACCCGGTG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCCCCGGGCCCA---
D00012062 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Met CAT -GGGCCCGTAGCTTAGCCCGGT--AGAGCGCCCGGCTCATAACCGGGTG-------------------GTCCGGGGTTCAAGTCCCCGCGGGCCCA---
D00012069 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Met CAT -GCCGCCGTAGCTCAGCCTGGTT-AGAGCGCCGGACTCATAATCCGGTT-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCGGCGGCA---
D00012094 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Met CAT -AGCGGCGTAGGGAAGCCTGGT--ATCCCGCAGGGCTCATAACCCTGAG-------------------GTCCCTGGTTCAAATCCAGGCGCCGCTA---
D00007444 Sulfolobus_solfataricus_P2 Met CAT -GGGCCCGTAGCTTAGCTCGGT--AGAGCGCTCGGCTCATAACCGAGTG-------------------GTCAGGGGTTCAAATCCCCTCGGGCCC----
D00007445 Sulfolobus_solfataricus_P2 Met CAT -AGCGGGGTGGGCTAGCCTGGTA-AGGCCGCGGGGCTCATAACCCCGAG-------------------GTCCCTGGTTCAAATCCAGGCCCCGCTACC-
D00007446 Sulfolobus_solfataricus_P2 Met CAT -GCCGCCGTAGCTCAGCCTGGTT-AGAGCGCCGGACTCATAATCCGGTT-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCGGCGGC----
D00007513 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Met CAT -GCCGCCGTAGCTCAGCCTGGTT-AGAGCGCCGGACTCATAATCCGGTT-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCGGCGGCA---
D00007514 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Met CAT -AGCGGCGTAGGGCAGCCTGGT--AGCCCGCGGGGCTCATAACCCCGAG-------------------GTCCCTGGTTCAAGTCCAGGCGCCGCTA---
D00007515 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Met CAT -GGGCCCGTAGCTTAGCCCGGT--AGAGCGCCCGGCTCATAACCGGGTG-------------------GTCCGGGGTTCAAGTCCCCGCGGGCCCA---
D00001787 Thermofilum_pendens Met CAT -GCCGGGGTCGCCTAGCCTGGTCAAGGGCGCCGGACTCATAATCCGGTC-------------------TTCCCGGGTTCGAATCCCGGCCCCGGCACCA
D00001786 Thermoplasma_acidophilum Met CAT -AGCGGGGTGGGGTAGTCAGGA--AATCCGATGGGCTCATAACCCGTAG-------------------ATCGATGGTTCAAATCCATCCCCCGCTA---
D00007447 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Met CAT -AGCGGGGTGGGGTAGTCAGGAA-ATCCCGATGGGCTCATAACCCGTAG-------------------ATCGATGGTTCAAATCCATCCCCCGCTA---
D00007448 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Met CAT -GCCGGGGTGGCTCAGCT-GGA--GGAGCGCCGGACTCATAATCCGGAG-------------------GTCTCGGGTTCGATCCCCGATCCCGGCA---
D00007449 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Met CAT -AGCGGGGTGGGGTAGTCAGGAG-ATCCCGATGGGCTCATAACCCGTAG-------------------ATCGATGGTTCAAATCCATCCCCCGCTA---
D00007450 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Met CAT -GGGGATGTAGCTCAGCTAGGC--AGAGCGCCTGGCTCATAACCAGGTG-------------------GTCATCGGTTCAAACCCGGTCATCCCCA---
D00007451 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Met CAT -GCCGGGGTGGCTTAGCT-GGA--GGAGCGCCGGACTCATAATCCGGAG-------------------GTCTCGGGTTCGATCCCCGATCCCGGCA---
D00001795 Acholeplasma_laidlawii Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTGCGGTTCATACCCGCAAG-------------------GTCGAGGGTTCAAGTCCCCCCGCCGCTACCA
D00001796 Acholeplasma_laidlawii Met CAT -CGCGGGATAGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGATGGTTCAAATCCATCTCCCGCAACCA
D00007738 Acinetobacter_sp._ADP1 Met CAT -TGCGGGGTGGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCGGCCCCCGCATCCA
D00007739 Acinetobacter_sp._ADP1 Met CAT -GGGCCTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAGCGGACTCATAATCCGTTG-------------------GTCCCGTGTTCAAGTCACGGTGGGCCCACCA
D00007740 Acinetobacter_sp._ADP1 Met CAT -GGCTATGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCGCACTCATAATGCGGGG-------------------GTCACAGGTTCAAGTCCCGTCATAGCCACCA
D00007408 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCCGGT--AGCTCGTCAGGCTCATAACCTGAAG-------------------GCCGCAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAACCA
D00007409 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Met CAT --GGCCTGTAGCTCAAT--GGTT-AGAGCCGGCGGCTCATAACCGCTTG-------------------GTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGGGCCCACCA
D00007410 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Met CAT -GGCGGGGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCAGCGGAATCATAATCCGCGT-------------------GTCGGGGGTTCAAGTCCCTCTCCCGCTACCA
D00007370 Aquifex_aeolicus_VF5 Met CAT -GGCGGCGTAGCTCAGCT-GGTC-AGAGCGGGGATCTCATAAGTCCCAG-------------------GTCGGAGGTTCGAGTCCTCCCGCCGCCACCA
D00007371 Aquifex_aeolicus_VF5 Met CAT -GGGCGCGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCGGGCGGCTCATAACCGCCCG-------------------GTTGGGGGTTCGAGTCCTCCCGCGCCCACCA
D00007741 Bacillus_anthracis_str._A2012 Met CAT -GGACCCTTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACAGGGTCCA---
D00007645 Bacillus_anthracis_str._Ames Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTACGGTTCATACCCGTGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCCGCCGCTA---
D00007646 Bacillus_anthracis_str._Ames Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCACGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCCCCGCAACCA
D00007647 Bacillus_anthracis_str._Ames Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCACGTT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCCCCGCAACCA
D00007648 Bacillus_anthracis_str._Ames Met CAT -GGACCCTTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACAGGGTCCA---
D00007649 Bacillus_anthracis_str._Ames Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCCCCGCAACCA
D00007650 Bacillus_anthracis_str._Ames Met CAT -GGACCTTTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACAAGGTCCACCA
D00007651 Bacillus_anthracis_str._Ames Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCTAGGCT-AGAGCGTATGGTTCATACCCGTGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCCGCCGCTACCA
D00007682 Bacillus_anthracis_str._Sterne Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTACGGTTCATACCCGTGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCCGCCGCTA---
D00007683 Bacillus_anthracis_str._Sterne Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCACGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCCCCGCAACCA
D00007684 Bacillus_anthracis_str._Sterne Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCACGTT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCCCCGCAACCA
D00007685 Bacillus_anthracis_str._Sterne Met CAT -GGACCCTTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACAGGGTCCA---
D00007686 Bacillus_anthracis_str._Sterne Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCCCCGCAACCA
D00007687 Bacillus_anthracis_str._Sterne Met CAT -GGACCTTTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACAAGGTCCACCA
D00007688 Bacillus_anthracis_str._Sterne Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTATGGTTCATACCCGTGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCCGCCGCTACCA
D00007717 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTACGGTTCATACCCGTGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCCGCCGCTA---
D00007718 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Met CAT -GGACCCTTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACAGGGTCCA---
D00007719 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Met CAT -GGACCTTTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACAAGGTCCACCA
D00007720 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTACGGTTCATACCCGTGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCCGCCGCTACCA
D00007612 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTACGGTTCATACCCGTGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCCGCCGCTA---
D00007613 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCACGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCCCCGCAACCA
D00007614 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Met CAT -GGACCCTTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACAGGGTCCA---
D00007615 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Met CAT -GGACCTTTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACAAGGTCCACCA
D00007616 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTACGGTTCATACCCGTGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCCGCCGCTACCA
D00007567 Bacillus_halodurans_C-125 Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTACGGTTCATACCCGTGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATTCCCTCCGCCGCTA---
D00007568 Bacillus_halodurans_C-125 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGGCGGTTCAAATCCGTCCCCCGCAA---
D00007569 Bacillus_halodurans_C-125 Met CAT -GGACCCTTAGCTCAGTT-GGTC-AGAGCAGTCGGCTCATAACCGATCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACAGGGTCCACCA
D00001805 Bacillus_subtilis Met CAT -GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACAAGGTCCACCA
D00001806 Bacillus_subtilis Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTACGGTTCATACCCGTGAG-------------------GT.GGGGGTTCGATCCCCTCCGCCGCTACCA
D00007298 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTACGGTTCATACCCGTGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCCGCCGCTACCA
D00007299 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Met CAT -GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACAAGGTCCACCA
D00007742 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTACGGTTCATACCCGTGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCCGCCGCTA---
D00007743 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTACGGTTCATACCCGTGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCCGCCGCTACCA
D00007744 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Met CAT -GGACCCTTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACAGGGTCCA---
D00007745 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCCCCGCAACCA
D00007746 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Met CAT -GGACCTTTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACAAGGTCCACCA
D00007638 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Met CAT -GGCGGGATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCATGATTCATAATCATGAG-------------------GTCCCCGGTTCAATCCCGGGTCCCGCTA---
D00007639 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Met CAT -GGACTTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAACAGACTCATAATCTGGAG-------------------GTCCCTGGTTCAAGCCCAGGCTGGTCCA---
D00007640 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Met CAT -CGCGGAGTGGAGCAGTT-GGT--AGCTCGTTGGGCTCATAACCCAAAG-------------------GTCATTCGTTCGAGTCGGATCTCCGCAA---
D00007652 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Met CAT -GGGCCTGTAGCTCAATT-GGTT-AGAGCCAGCGGCTCATAACCGCTTG-------------------GTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCGGGCCCACCA
D00007653 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Met CAT -GGCGGAGTAGCTCAGTA-GGTT-AGAGCAGAGGAATCATAATCCTTGT-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCTCCTCCGCTACCA
D00007654 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCCGGT--AGCTCGTCAGGCTCATAACCTGAAG-------------------GCCGCAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAACCA
D00007749 Bartonella_quintana_str._Toulouse Met CAT -GGCGGAGTAGCTCAGTA-GGTT-AGAGCAGAGGAATCATAATCCTTGT-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCTCCTCCGCTACCA
D00007750 Bartonella_quintana_str._Toulouse Met CAT -GGGCCTGTAGCTCAATT-GGTT-AGAGCCAGCGGCTCATAACCGCTTG-------------------GTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCGGGCCCACCA
D00007655 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Met CAT -GGGGGGCTAGCTTAGTT-GGTT-AAAGCACGGTGCTCATAACACTGGG-------------------ATCGGGGGTTCAAGTCCCTCGCCCCCTACCA
D00007656 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GCCGTAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAACCA
D00007657 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Met CAT -GGTGGGGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCAACGGAATCATAATCCGTAG-------------------GTCGGCGGTTCAAGTCCGCCTCTCACTACCA
D00007533 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Met CAT -GGCGGGGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTACGACTCATAATCGTAAG-------------------GTCAAGAGTTCGAGCCTCTTCCTCGCTA---
D00007534 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTCGGT--AGCTCGCTGGGCTCATAACCCAGAG-------------------GTCCATGGTTCAAATCCATGCCCCGCTACCA
D00007535 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Met CAT -GGGGCCGTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCATGCGACTCATAATCGCCCG-------------------GTCCAGGGTTCAAGCCCCTGCGGCCCCA---
D00001800 Borrelia_burgdorferi Met CAT -GGGCCCATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCCGACTCATAATCGGTAG-------------------GTCCCAGGTTCAAGTCCTGGTGGGCCCA---
D00001801 Borrelia_burgdorferi Met CAT -GCTGATGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACTCGGCTCATATCCGAGTT-------------------GTCGTGGGTTCAAGTCCCTCCATCAGCA---
D00007341 Borrelia_burgdorferi_B31 Met CAT -CGCAGGGTAGAGCAGTT-GGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCATAGGTTCGAGTCCTATCCCTGCTA---
D00007342 Borrelia_burgdorferi_B31 Met CAT -GCTGATGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACTCGGCTCATATCCGAGTT-------------------GTCGTGGGTTCAAGTCCCTCCATCAGCA---
D00007343 Borrelia_burgdorferi_B31 Met CAT -GGGCCCATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCCGACTCATAATCGGTAG-------------------GTCCCAGGTTCAAGTCCTGGTGGGCCCA---
D00007689 Borrelia_garinii_PBi Met CAT -GGGCCCATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCCGACTCATAATCGGTAG-------------------GTCCCAGGTTCAAGTCCTGGTGGGCCCA---
D00007690 Borrelia_garinii_PBi Met CAT -CGCAGGGTAGAGCAGTT-GGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCATAGGTTCGAGTCCTATCCCTGCTA---
D00007691 Borrelia_garinii_PBi Met CAT -GCTGATGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACTCGGCTCATATCCGAGTT-------------------GTCGTGGGTTCAAGTCCCTCCATCAGCA---
D00007570 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Met CAT -GGGCCTGTAGCTCAAT--GGTT-AGAGCCGGCCGCTCATAACGGTCTG-------------------GTTGCAGGTTCGAGTCCTGCCGGGCCCACCA
D00007571 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Met CAT -GGCGGGGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCACGGGAATCATAATCCTGGG-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCCTCTCCCGCTACCA
D00007572 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCCGGT--AGCTCGTCAGGCTCATAACCTGAAG-------------------GTCATAGGTTCAAATCCTATCCCCGCAACCA
D00007392 Brucella_melitensis_16M Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCCGGT--AGCTCGTCAGGCTCATAACCTGAAG-------------------GCCGCAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAACCA
D00007393 Brucella_melitensis_16M Met CAT -GGCGGAGTAGCTCAGTA-GGTT-AGAGCAGAGGAATCATAATCCTTGT-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCTCCGCTACCA
D00007394 Brucella_melitensis_16M Met CAT -GGGCCTGTAGCTCAATT-GGTT-AGAGCCGGCGGCTCATAACCGCTTG-------------------GTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCGGGCCCACCA
D00007536 Brucella_suis_1330 Met CAT -GGGCCTGTAGCTCAATT-GGTT-AGAGCCGGCGGCTCATAACCGCTTG-------------------GTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCGGGCCCACCA
D00007537 Brucella_suis_1330 Met CAT -GGCGGAGTAGCTCAGTA-GGTT-AGAGCAGAGGAATCATAATCCTTGT-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCTCCGCTACCA
D00007538 Brucella_suis_1330 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCCGGT--AGCTCGTCAGGCTCATAACCTGAAG-------------------GCCGCAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAACCA
D00007300 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Met CAT -GGCCCTTTAGCTCAGT--GGTA-AGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCGCTGGTTCAAATCCAGCAAGGGCCA---
D00007301 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Met CAT -GGCTACGTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCACAGCACTCATAACGCTGGG-------------------GTCATGGGTTCGAGTCCCGTCGTAGCTACCA
D00007617 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Met CAT -GGCTACGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACAGCACTCATAACGCTGAG-------------------GTCACAGGTTCAATTCCTGTCGTAGCTA---
D00007618 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTTTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGACCCCCGCAACCA
D00007619 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Met CAT -GGCCTCTTAGCTCAGT--GGTA-AGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCGCTGGTTCAAATCCAGCAGGGGCCA---
D00007493 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Met CAT -GGCTACGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACAGCACTCATAACGCTGGG-------------------GTCATGGGTTCAATTCCCGTCGTAGCCA---
D00007494 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCAGCCCCCGCAACCA
D00007495 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Met CAT -GGCCCTTTAGCTCAGT--GGTC-AGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCGCTGGTTCAAATCCAGCAAGGGCCA---
D00007344 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Met CAT -GTCAGGGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCTGGTCTCATAAGCCGGAG-------------------GTCGGGAGTTCAAGTCTCCCCCTTGACACCA
D00007345 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Met CAT -GGATTTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAACCGGCTCATAACCGGTTG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCTAAATCCACCA
D00007751 Candidatus_Blochmannia_floridanus Met CAT -GGCTACGTAGCTCAGAT-GGTT-AGAGCGCAGCACTCATAATGCTGAG-------------------GGCACAGGTTCAAATCCTGTCGTAGCTA---
D00007752 Candidatus_Blochmannia_floridanus Met CAT -GGCCCTTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCACTGGTTCAAATCCAGTAAGGGCCA---
D00007667 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Met CAT -GGGGCAATAGCTCAGT--GGTT-AGAGCAGCGGACTCATAACCCGCTG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTACTTGCCCCA---
D00007668 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGG--GGTT-AGCTCGTTGGGCTCATAACCCAAAG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTTCCCCCGCTA---
D00007669 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Met CAT -GGCGGTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACGGAATCATAATCCGTGT-------------------GTCGTCGGTTCAAGTCCGGCTGCCGCTA---
D00007346 Caulobacter_crescentus_CB15 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCCGGT--AGCTCGTCAGGCTCATAACCTGAAG-------------------GTCACAGGTTCAAATCCTGTCCCCGCACCCA
D00007347 Caulobacter_crescentus_CB15 Met CAT -GGGCCTGTAGCTCAAT--GGTT-AGAGCCGACCGCTCATAACGGTCTG-------------------GTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCGGGCCTACCA
D00007348 Caulobacter_crescentus_CB15 Met CAT -GGCTGGGTAGCTCAGAT-GGTT-AGAGCGGTGGATTCATAACCCACAG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGCCCCCCGCCACCA
D00007381 Chlamydia_muridarum_Nigg Met CAT -GGCGGTATAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCAGCGGAATCATAATCCGCGT-------------------GTCGTTGGTTCAAGTCCGACTACCGCTA---
D00007382 Chlamydia_muridarum_Nigg Met CAT -CGCGGGATAGAGTAGT--GGTC-ATCTCGTTGGGCTCATAACCCAAAG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTTCTCCCGCTA---
D00007383 Chlamydia_muridarum_Nigg Met CAT -GGGGCAATAGCTCAGC--GGTT-AGAGCTGCGGACTCATAACCCGTAG-------------------GTCCCTGGTTCAAATCCAGGTTGCCCCA---
D00007296 Chlamydia_trachomatis Met CAT -GGCGGTATAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCAGCAGAATCATAATCTGCGT-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCGACTACCGCT----
D00007297 Chlamydia_trachomatis Met CAT -GGGGCGGTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCTGCGGACTCATAACCCGTAG-------------------GTCACAGGTTCAAATCCTGTCCGCCCC----
D00007294 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Met CAT -GGCGGTATAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCAGCGGAATCATAATCCGCGT-------------------GTCGTTGGTTCAAGTCCGACTACCGCTA---
D00007295 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Met CAT -GGGGCAATAGCTCAGC--GGTT-AGAGCTGCGGACTCATAACCCGTAG-------------------GTCCCTGGTTCAAATCCAGGTTGCCCCA---
D00007290 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Met CAT -GGCGGTATAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCAGCAGAATCATAATCTGCGT-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCGACTACCGCTA---
D00007291 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Met CAT -GGGGCGGTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCTGCGGACTCATAACCCGTAG-------------------GTCACAGGTTCAAATCCTGTCCGCCCCA---
D00007292 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Met CAT -GGCGGTATAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCAGCAGAATCATAATCTGCGT-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCGACTACCGCTA---
D00007293 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Met CAT -GGGGCGGTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCTGCGGACTCATAACCCGTAG-------------------GTCACAGGTTCAAATCCTGTCCGCCCCA---
D00007317 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Met CAT -GGCGGTATAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCAGCAGAATCATAATCTGCGT-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCGACTACCGCTA---
D00007318 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Met CAT -GGGGCGGTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCTGCGGACTCATAACCCGTAG-------------------GTCACAGGTTCAAATCCTGTCCGCCCCA---
D00007483 Chlorobium_tepidum_TLS Met CAT -GGGCCCTTAGCTCAGTT-GGTC-AGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGG-------------------GTCGTAGGTTCAAGTCCTACAGGGCCCACCA
D00007484 Chlorobium_tepidum_TLS Met CAT -CGTGGGGTGGAGCAATT-GGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTTGCAGGTTCAAGTCCTGTCCCCACCA---
D00007485 Chlorobium_tepidum_TLS Met CAT -CGTGGGGTGGAGCAATT-GGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTTGCAGGTTCAAGTCCTGTCCCCACCACCA
D00007486 Chlorobium_tepidum_TLS Met CAT -GGTGAGGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACAGGATTCATAACCCTGAG-------------------GTCGAGGGTTCAACTCCCTCCCTCACCA---
D00007388 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Met CAT -GGATCTTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAACCGGCTCATAACCGGTCG-------------------GTCCGGGGTTCGAGTCCCTGAAGGTCCACCA
D00007389 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Met CAT -GGCGGAATAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCATTCGGTTCATACCCGAAGT-------------------GTCGTAGGTTCAAGTCCTATTTCCGCTACCA
D00007378 Clostridium_perfringens_str._13 Met CAT -GGATCTTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAACCGGCTCATAACCGGTAG-------------------GTCCGGGGTTCGAGTCCCTGAAGGTCCACCA
D00007379 Clostridium_perfringens_str._13 Met CAT -GGCGGGATAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCATTCGGTTCATACCCGAAGG-------------------GTCGCAAGTTCGAATCTTGTTCCCGCTACCA
D00007380 Clostridium_perfringens_str._13 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCT-GGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCAAGTCCTGCCCCCGCAACCA
D00007573 Clostridium_tetani_E88 Met CAT -GGATCTTTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCAACCGGCTCATAACCGGTAG-------------------GTCCGGGGTTCGAGTCCCTGAAGGTCCACCA
D00007574 Clostridium_tetani_E88 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCT-GGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCAAGTCCTACCTCCGCAACCA
D00007575 Clostridium_tetani_E88 Met CAT -GGCGGAATAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCATTCGGTTCATACCCGAAGT-------------------GTCGTAGGTTCAAGTCCTATTTCCGCTACCA
D00007658 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCAAACGACTCATAATCGTTGT-------------------GTCGAGAGTTCAATTCTCTCCATCGCTA---
D00007659 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTCGGT--AGCTCGCTGGGCTCATAACCCAGAG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTGCCCCCGCTA---
D00007660 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Met CAT -GGGGCTATAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCCGCGGACTCATAATCCGTTG-------------------GTCCCGGGTTCGAGCCCCGGTGGCCCCA---
D00007539 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGT-------------------GTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTA---
D00007540 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTCGGT--AGCTCGCTGGGCTCATAACCCAGAG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTGCCCCCGCTA---
D00007541 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Met CAT -GGGGCTATAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCTACGGACTCATAATCCGTTG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGCTGGCCCCA---
D00007499 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGT-------------------GTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTA---
D00007500 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTCGGT--AGCTCGCTGGGCTCATAACCCAGAG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTGCCCCCGCTA---
D00007501 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Met CAT -GGGGCTATAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCCGTGGACTCATAATCCATTG-------------------GTCCCGGGTTCGAGCCCCGGTGGCCCCA---
D00007609 Coxiella_burnetii_RSA_493 Met CAT -TGCGGGGTGGAGCAGTCTGGC--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTACCCCCGCTACCA
D00007610 Coxiella_burnetii_RSA_493 Met CAT -GGGCCCATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGATCGACTCATAATCGACAG-------------------GTCCCAGGTTCAAGTCCTGGTGGGCCCACCA
D00007611 Coxiella_burnetii_RSA_493 Met CAT -GGCTATGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACGGCATTCATAATGCCGGT-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACCCATAGCCA---
D00007349 Deinococcus_radiodurans_R1 Met CAT -GGGCTCTTAGCTCAAC--GGTC-AGAGCAGTCGGCTCATAACCGATTG-------------------GTTGCCGGTTCAAATCCGGCAGGGCCCACCA
D00007350 Deinococcus_radiodurans_R1 Met CAT -GGCGACGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGACTCATAATCGTGAG-------------------GTCGARAGTTCAAGTCTCTCTGTCGCCACCA
D00007721 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Met CAT -GGGCCCATAGCTCAATT-GGC--AGAGCCCTCGGCTCATAACCGATTT-------------------GTTGCAGGTTCGAGTCCTGCTGGGCCCACCA
D00007722 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Met CAT -GGCGAGGTAGCTCAGTT-GGTC-AGAGCATGCGGCTCATATCCGCAGT-------------------GTCGGGGGTTCAATTCCCTCCCTCGCTACCA
D00007576 Enterococcus_faecalis_V583 Met CAT -CGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTCCGGTTCATACCCGGGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCCGCCGCGA---
D00007577 Enterococcus_faecalis_V583 Met CAT -GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACAAGGTCCA---
D00007578 Enterococcus_faecalis_V583 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTCAGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAA---
D00007579 Enterococcus_faecalis_V583 Met CAT -GGACCATTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAAACGGCTCATAACCGTTCG-------------------GTCACAGGTTCGAGCCCTGTATGGTCCA---
D00007580 Enterococcus_faecalis_V583 Met CAT -GGACCATTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCAAACGGCTCATAACCGTTCG-------------------GCCACAGGTTCGAGTCCTGTATGGTCCA---
D00007581 Enterococcus_faecalis_V583 Met CAT -GGACCATTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCAAACGGCTCATAACCGTTCG-------------------GTCGATGGTTCGAATCCGTCGTGGTCCA---
D00007582 Enterococcus_faecalis_V583 Met CAT -GGACCATTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCAAACGGCTCATGACTATTCG-------------------GTCGATGGTTCGAATTCATCATGGTCGA---
D00007583 Enterococcus_faecalis_V583 Met CAT -GTACCATTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCAAACGGCTCATAACCGTTCG-------------------GTCACAGGTTCGAGTCCTGTATGGTCCA---
D00001807 Escherichia_coli Met CAT -GGCTACGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACATCACTCATAATGATGGG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCCGTCGTAGCCACCA
D00007620 Escherichia_coli_CFT073 Met CAT -GGCTACGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACATCACTCATAATGATGGG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCCGTCGTAGCCACCA
D00007621 Escherichia_coli_CFT073 Met CAT -GGCCCTTTAGCTCAGT--GGTG-AGAGCGAGCGACTCATAATCGCCAG-------------------GTCGCTGGTTCAAATCCAGCAAGGGCCACCA
D00007622 Escherichia_coli_CFT073 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00007623 Escherichia_coli_CFT073 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCATGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00007624 Escherichia_coli_CFT073 Met CAT -GGCCCCTTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAGGGGCCACCA
D00007319 Escherichia_coli_K12 Met CAT -GGCCCCTTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAGGGGCCACCA
D00007320 Escherichia_coli_K12 Met CAT -GGCCCTTTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAAGGGCCACCA
D00007321 Escherichia_coli_K12 Met CAT -GGCTACGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACATCACTCATAATGATGGG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCCGTCGTAGCCACCA
D00007322 Escherichia_coli_O157:H7 Met CAT -GGCCCTTTAGCTCAGT--GGTG-AGAGCGAGCGACTCATAATCGCCAG-------------------GCCGCTGGTTCAAATCCAGCAAGGGCCACCA
D00007323 Escherichia_coli_O157:H7 Met CAT -GGCCCTTTAGCTCAGC--GGTG-AGAGCGAGCGACTCATAATCGCCAG-------------------GTCGCTGGTTCAAATCCAGCAAGGGCCACCA
D00007324 Escherichia_coli_O157:H7 Met CAT -GGCCCTTTAGCTCAGT--GGTG-AGAGCGAGCGACTCATAATCGCCAG-------------------GTCGCTGGTTCAAATCCAGCAAGGGCCACCA
D00007325 Escherichia_coli_O157:H7 Met CAT -GGCCCTTTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCAGGCGACTCATAATCGTCCG-------------------GTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAAGGGCCACCA
D00007326 Escherichia_coli_O157:H7 Met CAT -GGCCCCTTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAGGGGCCACCA
D00007327 Escherichia_coli_O157:H7 Met CAT -GGCTACGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACATCACTCATAATGATGGG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCCGTCGTAGCCACCA
D00007328 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Met CAT -GGCCCTTTAGCTCAGT--GGTG-AGAGCGAGCGACTCATAATCGCCAG-------------------GCCGCTGGTTCAAATCCAGCAAGGGCCACCA
D00007329 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Met CAT -GGCCCTTTAGCTCAGC--GGTG-AGAGCGAGCGACTCATAATCGCCAG-------------------GTCGCTGGTTCAAATCCAGCAAGGGCCACCA
D00007330 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Met CAT -GGCCCTTTAGCTCAGT--GGTG-AGAGCGAGCGACTCATAATCGCCAG-------------------GTCGCTGGTTCAAATCCAGCAAGGGCCACCA
D00007331 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Met CAT -GGCCCTTTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCAGGCGACTCATAATCGTCCG-------------------GTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAAGGGCCACCA
D00007332 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Met CAT -GGCCCCTTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAGGGGCCACCA
D00007333 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Met CAT -GGCTACGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACATCACTCATAATGATGGG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCCGTCGTAGCCACCA
D00007487 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Met CAT -GGATCCATAGCTCAGTTTGGTC-AGAGCACTCGGCTCATAACCGAGTG-------------------GTCGCTGGTTCGAGTCCAGCTGGATCCACCA
D00007488 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Met CAT -CGCGGGGTAGAGCAGTCTGGC--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTAAGTTCAAATCTTACCCCCGCCACCA
D00007489 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Met CAT -GCCTAGGTAGCTCAGTT-GGCT-AGAGCATACGGTTCATACCCGTACG-------------------GTCGATGGTTCGAATCCATTCCTAGGCACCA
D00007692 Geobacter_sulfurreducens_PCA Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCATACGGCTCATATCCGTAGT-------------------GTCCGGGGTTCAAGTCCCTGCACCGCCACCA
D00007693 Geobacter_sulfurreducens_PCA Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCAGAGGTTCAAATCCTCTCCCCGCAACCA
D00007694 Geobacter_sulfurreducens_PCA Met CAT -GGGCCTATAGCTCAGTT-GGCT-AGAGCAACCGGCTCATAACCGGTCG-------------------GTCCCAGGTTCGAGTCCTGGTGGGCCCACCA
D00001809 Haemophilus_influenzae Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GCCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00001810 Haemophilus_influenzae Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCAGCCCCCGCAACCA
D00001811 Haemophilus_influenzae Met CAT -GGCTACATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACAACACTCATAATGTTGGG-------------------GTCGCAAGTTCGAATCTCGCTGTAGCCACCA
D00001812 Haemophilus_influenzae Met CAT -CCCCCCTTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCACTGGTTCAAGTCCGGTAGGGGGGACCA
D00007338 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GCCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00007339 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Met CAT -CCCCCCTTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCACTGGTTCAAGTCCGGTAGGGGGGACCA
D00007340 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Met CAT -GGCTACATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACAACACTCATAATGTTGGG-------------------GTCGCAAGTTCGAATCTCGCTGTAGCCACCA
D00007603 Helicobacter_hepaticus_ATCC_51449 Met CAT -CGCGGGATAGAGCAGTCCGGT--AGCTCGTTGGGCTCATAACCCAAAG-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCTCTCCCGCAACCA
D00001803 Helicobacter_pylori Met CAT -GTCAAGGTAGCTCAGCT-GGTTTAGAGCGCTGGTCTCATAAGCCGGAG-------------------GTCGGGGGTTCAAGTCCCCCTCTTGACACCA
D00001804 Helicobacter_pylori Met CAT -GGATTCTTAGCTCAGCT-GGTC-AGAGCACTCGGCTCATAACCGATTG-------------------GTCGTAGGTTCAAGTCCTACAGAATCCACCA
D00007334 Helicobacter_pylori_26695 Met CAT -GTCAAGGTAGCTCAGCT-GGTTTAGAGCGCTGGTCTCATAAGCCGGAG-------------------GTCGGGGGTTCAAGTCCCCCTCTTGACACCA
D00007335 Helicobacter_pylori_26695 Met CAT -GGATTCTTAGCTCAGCT-GGTC-AGAGCACTCGGCTCATAACCGATTG-------------------GTCGTAGGTTCAAGTCCTACAGAATCCACCA
D00007336 Helicobacter_pylori_J99 Met CAT -GTCAAGGTAGCTCAGCT-GGTTTAGAGCGCTGGTCTCATAAGCCGGAG-------------------GTCGGGGGTTCAAGTCCCCCTCTTGACACCA
D00007337 Helicobacter_pylori_J99 Met CAT -GGATTCTTAGCTCAGCT-GGTC-AGAGCGCTCGGCTCATAACCGATTG-------------------GTCGTAGGTTCAAGTCCTACAGAATCCACCA
D00007695 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Met CAT -CGCGGGATGGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCATAGGTTCAAATCCTGTTCCCGCAA---
D00007696 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Met CAT -GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAGACGGCTCATAACCGTCGG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACAAGGTCCA---
D00007697 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTCCGGTTCATACCCGGGAG-------------------GTCGAGGGTTCGATCCCCCCCGCCGCTA---
D00007698 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Met CAT -CGCGGGATGGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCATAGGTTCAAATCCTATTCCCGCAA---
D00007584 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Met CAT -CGCGGGATGGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGCAGGTTCAAACCCTGCTCCCGCAA---
D00007585 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Met CAT -GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGCCCTACAAGGTCCA---
D00007586 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Met CAT -CGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTCCGGTTCATACCCGGGAG-------------------GTCGAGGGTTCGATTCCCCCTGCCGCGA---
D00007587 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Met CAT -GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTC-AGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCT-------------------GTCGTTGGTTCGAGTCCAACAAGGTCCA---
D00007699 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Met CAT -GGCGGGGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCACACGGCTCATAATCGTGGT-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGCCCTCGCTA---
D00007700 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Met CAT -GGGGCGGTAGCTCAGCT-GGTC-AGAGCATCGGACTCATAATCCGCCG-------------------GTCACGGGTTCAAATCCCGTCCGCCCTA---
D00007701 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTCGGT--AGCTCGCTGGGCTCATAACCCAGAG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAACCA
D00007542 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Met CAT -GGCGACGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCAACGGAATCATAATCCGCAG-------------------GTCCGGGGTTCGAATCCCTGCGTCGCTA---
D00007543 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Met CAT -GGGCCTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGGCAGACTCATAATCTGCGG-------------------GTCGAAGGTTCAAGTCCTTCTGGGCCCA---
D00007372 Listeria_innocua_Clip11262 Met CAT -GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCAAGGTCCA---
D00007373 Listeria_innocua_Clip11262 Met CAT -GGCGGCGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTTCGGTTCATACCCGAGAG-------------------GTCGTGGGTTCGATTCCCTCCGCCGCTA---
D00007374 Listeria_innocua_Clip11262 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAA---
D00007375 Listeria_monocytogenes_EGD-e Met CAT -GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCAAGGTCCA---
D00007376 Listeria_monocytogenes_EGD-e Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCATTCGGTTCATACCCGAAAG-------------------GTCGTGGGTTCGACTCCCTCCGCCGCTA---
D00007377 Listeria_monocytogenes_EGD-e Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAA---
D00007723 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Met CAT -GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCAAGGTCCA---
D00007724 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCATTCGGTTCATACCCGAAAG-------------------GTCGTGGGTTCGACTCCCTCCGCCGCTA---
D00007725 Mesoplasma_florum_L1 Met CAT -GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCATCCGGCTCATAACCGGACG-------------------GTCATTGGTTCAAGTCCAATAAGGTCCACCA
D00007726 Mesoplasma_florum_L1 Met CAT -GGCGGGGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTTCGGTTCATACCCGAAAG-------------------GTCGCGAGTTCAAATCTCGCCCCCGCTACCA
D00007395 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Met CAT -GGGCCTGTAGCTCAAT--GGTT-AGAGCCGGCGGCTCATAACCGCTTG-------------------GTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCGGGCCCACCA
D00007396 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Met CAT -GGCGGGGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACGGGAATCATAATCCTGGG-------------------GTCGGGGGTTCAAGTCCCTCTCCCGCTACCA
D00007604 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Met CAT -GGCGATGTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCGAACGACTCATAATCGTTAG-------------------GTCGCCGGTTCGAGTCCGGCCATCGCTA---
D00007605 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Met CAT -GGGGCGGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCCGCGGACTCATAATCCGTTG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGCCCGCCCCA---
D00007312 Mycobacterium_leprae_TN Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTCGGT--AGCTCGCTGGGCTCATAACCCAGAG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCCCCGCTACCA
D00007313 Mycobacterium_leprae_TN Met CAT -GGCGATGTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCGAACGACTCATAATCGTTAG-------------------GTCGCCGGTTCGAGTCCGGCCATCGCTA---
D00007314 Mycobacterium_leprae_TN Met CAT -GGGGCGGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCCGCGGACTCATAATCCGTTG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGCCCGCCCCA---
D00007302 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Met CAT -GGCGATGTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCGAACGACTCATAATCGTTAG-------------------GTCGCCGGTTCGAGTCCGGCCATCGCTA---
D00007303 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Met CAT -GGGGCGGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCCGCGGACTCATAATCCGTTG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGCCCGCCCCA---
D00007664 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Met CAT -GGCGATGTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCGAACGACTCATAATCGTTAG-------------------GTCGCCGGTTCGAGTCCGGCCATCGCTA---
D00007665 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Met CAT -GGGGCGGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCCGCGGACTCATAATCCGTTG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGCCCGCCCCA---
D00007666 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTCGGT--AGCTCGCTGGGCTCATAACCCAGAG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCCCCGCTACCA
D00001790 Mycoplasma_capricolum Met CAT -GGCGGGGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTTCGGTTCATACCCGAAAG-------------------GTCGAGAGTTCAAATCTCTCCCCCGCTACCA
D00007600 Mycoplasma_gallisepticum_R Met CAT -GGCTGGATACCTCAGTT-GGTT-AGAGGGCTCGGTTCATACCCGAGTT-------------------GTCGTGAGTTCGAGTCTCACTCCAGCCACCA
D00007601 Mycoplasma_gallisepticum_R Met CAT -GGATCTATAGCTCAAT--GGTT-AGAGCCCCCGACTCATAATCGGTTG-------------------GTTACAGGTTCAAGTCCTGTTAGATCCACCA
D00007602 Mycoplasma_gallisepticum_R Met CAT -CGCGGGATAGAGCAGTTCGGT--AGCTCGTCAGGCTCATAATCTGAAG-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCAGCTCCCGCAACCA
D00001791 Mycoplasma_genitalium Met CAT -GGATCTATAGCTCAATTGGTT--AGAGCCCCCGACTCATAATCGGTCT-------------------GTTACAGGTTCAAGTCCTGTTAGATCCACCA
D00001792 Mycoplasma_genitalium Met CAT -CGCGGGATAGAGCAGTT-GGTC-AGCTCGTCAGGCTCATAATCTGAAG-------------------GTCGAGGGTTCAAATCCCTCTCCCGCAACCA
D00007351 Mycoplasma_genitalium_G37 Met CAT -GGATCTATAGCTCAATTGGTT--AGAGCCCCCGACTCATAATCGGTCT-------------------GTTACAGGTTCAAGTCCTGTTAGATCCACCA
D00007352 Mycoplasma_genitalium_G37 Met CAT -GGCTGGATACCTCAGTT-GGTT-AGAGGGCCCGGTTCATACCCGGGTT-------------------GTCGTGAGTTCGAGTCTCACTCCAGCCACCA
D00001793 Mycoplasma_mycoides Met CAT -GGCGGGGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTTCGGTTCATACCCGAAAG-------------------GTCGAGAGTTCAACTCTCTCCCCCGCTACCA
D00001794 Mycoplasma_pneumoniae Met CAT -GGCTGGATACCTCAGTT-GGTT-AGAGGACCCGGTTCATACCCGGGTT-------------------GTCGTGAGTTCGAATCTCACTCCAGCCACCA
D00007353 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Met CAT -GGATCTATAGCTCAAT--GGTT-AGAGCCCCCGACTCATAATCGGTCT-------------------GTTACAGGTTCGAGTCCTGTTAGATCCACCA
D00007354 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Met CAT -GGCTGGATACCTCAGTT-GGTT-AGAGGACCCGGTTCATACCCGGGTT-------------------GTCGTGAGTTCGAATCTCACTCCAGCCACCA
D00007406 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Met CAT -GGCGCTGTAGCTTAGTT-GGTT-AGAGCATCCGGTTCATACCCGGAAG-------------------GTCAAGGGTTCGACTCCCTTTGGCGCCACCA
D00007407 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Met CAT -GGACCTATAACTCAAT--GGTT-AGAGTACCCGGCTCATAACCGGTAG-------------------GTTGCTGGTTCAAGTCCAGCTGGGTCCACCA
D00007304 Neisseria_meningitidis_MC58 Met CAT -GGGTCTGTAGCTCAGG--GGTT-AGAGCAGGGGACTCATAATCCCTTG-------------------GTCGTGGGTTCGAACCCCACCGGACCCACCA
D00007305 Neisseria_meningitidis_MC58 Met CAT -GGCGAATTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCAGAGGAATCATAATCCTTGT-------------------GTCCGGGGTTCGAGTCCCTGATTCGCCACCA
D00007306 Neisseria_meningitidis_Z2491 Met CAT -GGCGAATTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCAGAGGAATCATAATCCTTGT-------------------GTCCGGGGTTCGAGTCCCTGATTCGCCACCA
D00007635 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Met CAT -GGGTCTGTAGCTCAGTT-GGTC-AGAGCAGGGGACTCATAATCCCTTG-------------------GTCGTAGGTTCAAGTCCTACCAGACCCACCA
D00007636 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Met CAT -GGCGAATTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCAGCGGAATCATAATCCGTTG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCTGATTCGCCACCA
D00007637 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTCTGGC--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAACCA
D00007404 Nostoc_sp._PCC_7120 Met CAT -GGCTCAGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACGGGACTCATAAGCCTGGG-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCGACCTGAGCCA---
D00007405 Nostoc_sp._PCC_7120 Met CAT -CCAGGGTTGGCCGAGC--GGTT-GAGGCAGCGAACTCATAATTCGCCC-------------------AAGGCAGGTTCAACTCCTGCACCCTGGA---
D00007544 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Met CAT -GGACCCTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCTATCGGCTCATAACCGATCG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCAGGGTCCACCA
D00007545 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCG-AGAGCGTACGGTTCATACCCGTGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCCGCCGCTACCA
D00007546 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCG-AGAGCGTACGGTTCATACCCGTGAG-------------------GTCGTGGGTTCGATCCCCTCCGCCGCTA---
D00007661 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M Met CAT -CGCGGGGTAGAGCAGTTTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAATCCGAAG-------------------GTCATAGGTTCGAATCCTATCCCCGCAACCA
D00007662 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M Met CAT -GGACCTGTAGCTCAGCT-GGTC-AGAGCTACCGGCTCATAACCGGTTG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTACCGGGTCCACCA
D00007663 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCG-AGAGTGTACGGTTCATACCCGTGAG-------------------GTCGAGGGTTCGAATCCCTCTGCCGCTACCA
D00007355 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Met CAT -GCCCCCATAGCTCAGTC-GGTC-AGAGCAGTCGACTCATAATCGATTG-------------------GTCACAGGTTCAAGTCCTGTTGGGGGCACCA
D00007356 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Met CAT -GGCTATGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACAACACTCATAATGTTGGG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCCGTCATAGCCACCA
D00001808 Photobacterium_leiognathi Met CAT -GGCTACGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACATCACTCATAATGATGGG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCCGTCGTAGCCACCA
D00007670 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00007671 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Met CAT -CGCGGGATGGAGCAGCTTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCTCCCGCAACCA
D00007672 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Met CAT -CGCGGGATGGAGCAGCCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCTCCCGCAACCA
D00007673 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Met CAT -GGCTACGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCACAGCACTCATAATGCTGGG-------------------GTCACAGGTTCGATTCCCGTCGTAGCCACCA
D00007674 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Met CAT -GGCCCCTTAGCTCAGTT-GGTC-AGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCACTGGTTCAAGTCCAGTAGGGGCCACCA
D00007675 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Met CAT -CGCGGGATGGAGCAGCATGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCTCCCGCAACCA
D00007702 Porphyromonas_gingivalis_W83 Met CAT -GGTCCTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCTGACTCATAATCAGGGA-------------------GTCCTTGGTTCAAGCCCAAGTGGGACCA---
D00007703 Porphyromonas_gingivalis_W83 Met CAT -GGCGAGATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCATGATTCATAATCATGAG-------------------GTCCCCGGTTCAATCCCGGGTCTCGCTA---
D00007704 Porphyromonas_gingivalis_W83 Met CAT -CGCGGAGTGGAGCAGT--GGT--AGCTCGTTGGGCTCATAACCCAAAG-------------------GTCGTAAGTTCGAGTCTTGCCTCCGCAA---
D00007727 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Met CAT -GGGGCGTTAGCTCAGCC-GGTC-AGAGCAGGGGACTCATAATCCCTGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGCACGCCCCA---
D00007728 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Met CAT -GGCGGGGTAGCTCAGG--GGT--AGAGCAAGCGGCTCATAATCGCTGT-------------------GTCGCGGGTTCGATTCCCGCTCCCGCTACCA
D00007359 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Met CAT -GGCTACATAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCGCAGCATTCATAATGCTGAT-------------------GTCCCAGGTTCAAGTCCCGGTGTAGCCACCA
D00007360 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Met CAT -GGGCCTATAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCAGAGGACTCATAATCCTTTG-------------------GTCCACGGTTCGAGTCCGTGTGGGCCCACCA
D00007641 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Met CAT -GGGCCCATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAGAGGACTCATAATCCTTTG-------------------GTCCACGGTTCGAGTCCGTGTGGGCCCACCA
D00007642 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Met CAT -GGCTACATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCATAGCATTCATAATGCTGGG-------------------GTCCGGGGTTCAAGTCCCTGTGTAGCCACCA
D00007643 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Met CAT -CGCGGGATGGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCTCCCGCAACCA
D00007644 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTTTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCAGCCCCCGCAACCA
D00007402 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Met CAT -GGCGAATTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCGACGGAATCATAATCCGCAG-------------------GTCCGGGGTTCGAGTCCCTGATTCGCCACCA
D00007403 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Met CAT -GGGCCTGTAGCTCAGG--GGTT-AGAGCAGACGACTCATAATCGTTTG-------------------GTCGTGGGTTCGAAACCCACCGGGCCCACCA
D00007631 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Met CAT -GGGGCTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCTGGGAACTCATAATTCCTAG-------------------GTCGCGGGTTCAAGTCCTGCCAGCCCTA---
D00007632 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Met CAT -GGCGGCATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCAGCGGAATCATAATCCGCGT-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCCTCTGCCGCTA---
D00007633 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Met CAT -GCCCCCTTCGTCTAGT--GGCC-CAGGACATCGGCCCATATCCGGTCG--------GA---------AACGCTCGTTCGAATCGGGCAGGGGGTA---
D00007634 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Met CAT -CGCGGGATGGAGCAGCCCGGT--AGCTCGCGAGGCTCATAACCTCGAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCTCCCGCAA---
D00007676 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Met CAT -GGCGGGGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCACGGGAATCATAATCCTGGG-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCCTCTCCCGCTACCA
D00007677 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Met CAT -GGGCCTGTAGCTCAAT--GGTT-AGAGCCGACCGCTCATAACGGTCTG-------------------GTTGCAGGTTCGAGTCCTGCCGGGCCCACCA
D00007678 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCCGGT--AGCTCGTCAGGCTCATAACCTGAAG-------------------GTCATAGGTTCAAATCCTATCCCCGCAACCA
D00007390 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Met CAT -GGCGGGGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGACGGAATCATAATCCGTGT-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCTCCCTCGCTACCA
D00007391 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Met CAT -GGGGCTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACGCCGCTCATAACGGTGTG-------------------GTCGTAGGTTCAAGTCCTACCAGCCCCACCA
D00007496 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Met CAT -TGCGGGGTGGAGCAGTTCGGT--AGCTCGTCAGGCTCATAACCTGAAG-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCAGCCCCCGCTACCA
D00007497 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Met CAT -GGCGGGGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAACGGAATCATAATCCGTGT-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCTCTCCCGCTACCA
D00007498 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Met CAT -GGGGCTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACGCCGCTCATAACGGTGTG-------------------GTCGTAGGTTCAAGTCCTACCAGCCCCACCA
D00007705 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Met CAT -GGCGGGGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCAACGGAATCATAATCCGTGT-------------------GTCGTGGGTTCAAATCCCTCTCCCGCTACCA
D00007706 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Met CAT -GGGGCTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACGCCGCTCATAACGGTGTG-------------------GTCGTAGGTTCAAGTCCTACCAGCCCCACCA
D00007411 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Met CAT -GGCTACGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACATCACTCATAATGATGGG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCCGTCGTAGCCACCA
D00007412 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Met CAT -GGCCCCTTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAGGGGCCACCA
D00007628 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Met CAT -GGCTACGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACATCACTCATAATGATGGG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCCGTCGTAGCCACCA
D00007629 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00007630 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Met CAT -GGCCCCTTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAGGGGCCACCA
D00007399 Salmonella_typhimurium_LT2 Met CAT -GGCTACGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACATCACTCATAATGATGGG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCCGTCGTAGCCACCA
D00007400 Salmonella_typhimurium_LT2 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00007401 Salmonella_typhimurium_LT2 Met CAT -GGCCCCTTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAGGGGCCACCA
D00007551 Shewanella_oneidensis_MR-1 Met CAT -CGCGGGATGGAGCAGCATGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCTCCCGCAACCA
D00007552 Shewanella_oneidensis_MR-1 Met CAT -CGCGGGATGGAGCAGCATGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCAGCTCCCGCAACCA
D00007553 Shewanella_oneidensis_MR-1 Met CAT -GGCAATGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCACAGCACTCATAATGCTGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAGTCCCGCCATTGCTACCA
D00007554 Shewanella_oneidensis_MR-1 Met CAT -GGCCCCTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACGACTCATAATCGTTAG-------------------GTCCACGGTTCAAGTCCGTGAGGGGCCACCA
D00007555 Shigella_flexneri_2a_str._301 Met CAT -GGCCCTTTAGCTCAGT--GGTG-AGAGCGAGCGACTCATAATCGCCAG-------------------GTCGCTGGTTCAAATCCAGCAAGGGCCACCA
D00007556 Shigella_flexneri_2a_str._301 Met CAT -GGCCCTTTAGCTCAGTT-GGTC-AGAGCGAGCGACTCATAATCGCCAG-------------------GTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAAGGGCCACCA
D00007557 Shigella_flexneri_2a_str._301 Met CAT -GGCCCTTTAGCTCAGT--GGTG-AGAGCGAGCGACTCATAATCGCCAG-------------------GTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAAGGGCCACCA
D00007558 Shigella_flexneri_2a_str._301 Met CAT -GGCCCCTTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAGGGGCCACCA
D00007559 Shigella_flexneri_2a_str._301 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00007560 Shigella_flexneri_2a_str._301 Met CAT -GGCCCTTTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAAGGGCCACCA
D00007561 Shigella_flexneri_2a_str._301 Met CAT -GGCTACGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACATCACTCATAATGATGGG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCCGTCGTAGCCACCA
D00007413 Sinorhizobium_meliloti_1021 Met CAT -GGGCCTGTAGCTCAAT--GGTT-AGAGCCGGCGGCTCATAACCGCTTG-------------------GTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCGGGCCCACCA
D00007414 Sinorhizobium_meliloti_1021 Met CAT -GGCGGAGTAGCTCAGTA-GGTT-AGAGCAGAGGAATCATAATCCTTGT-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCTCCGCTACCA
D00001797 Spiroplasma_melliferum Met CAT -GGCGGGATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCTCGGCTCATACCCGGGAG-------------------GTCAAGAGTTCAAGTCTCTTTCTCGCTACCA
D00001802 Staphylococcus_aureus Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTACGGTTCATACCCGTGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCCACCGCCA---
D00007679 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Met CAT -CGCGGGATGGAGCAGTTCGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGGTGGTTCAAATCCGCCTCCCGCAA---
D00007680 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Met CAT -GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCTAACGGCTCATAACCGTTCG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCAAGGTCCA---
D00007681 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTACGGTTCATACCCGTGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCCACCGCCA---
D00007502 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Met CAT -CGCGGGATGGAGCAGTTCGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGGTGGTTCAAATCCGCCTCCCGCAA---
D00007503 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Met CAT -GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCTAACGGCTCATAACCGTTCG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCAAGGTCCA---
D00007504 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTACGGTTCATACCCGTGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCCACCGCCA---
D00007310 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTACGGTTCATACCCGTGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCCACCGCCA---
D00007311 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Met CAT -GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCTAACGGCTCATAACCGTTCG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCAAGGTCCA---
D00007588 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Met CAT -CGCGGGATGGAGCAGTTCGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGGTGGTTCAAATCCGCCTCCCGCAA---
D00007589 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Met CAT -GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCTAACGGCTCATAACCGTTCG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCAAGGTCCA---
D00007590 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTACGGTTCATACCCGTGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCCACCGCCA---
D00007562 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTCCGGTTCATACCCGGGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCCGCCGCTA---
D00007563 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Met CAT -GGACCTTTAGCTCAACT-GGTT-AGAGCACTCGGCTCATAACCGAGCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACAAGGTCCA---
D00007564 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Met CAT -CGCGGGATGGAGCAGCTAGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTGCTCCCGCAA---
D00007505 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTCCGGTTCATACCCGGGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCCGCCGCTA---
D00007506 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Met CAT -GGACCTTTAGCTCAACT-GGTT-AGAGCACTCGGCTCATAACCGAGCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACAAGGTCCA---
D00007507 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Met CAT -CGCGGGATGGAGCAGCTAGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTGCTCCCGCAA---
D00007565 Streptococcus_mutans_UA159 Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTCCGGTTCATACCCGGGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTTCGCCGCTA---
D00007566 Streptococcus_mutans_UA159 Met CAT -GGACCTTTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCACTCGGCTCATAACCGAGCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACAAGGTCCA---
D00007385 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Met CAT -GGACCTTTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCTCTCGGCTCATAACCGAGTG-------------------GTCGTAGGTTCAAGTCCTACAAGGTCCA---
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D00007387 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Met CAT -CGCGGGATGGAGCAGCTCGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTGCTCCCGCAA---
D00007384 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Met CAT -CGCGGGATGGAGCAGTTAGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTGCTCCCGCAA---
D00007508 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTCCGGTTCATACCCGGGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTTCGCCGCTA---
D00007509 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Met CAT -GGACCTTTAGCTCAACT-GGTT-AGAGCACTCGGCTCATAACCGAGCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACAAGGTCCA---
D00007510 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Met CAT -CGCGGGATGGAGCAGTTAGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTGCTCCCGCAA---
D00007606 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Met CAT -GGCGGTGTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGTCCGGTTCATACCCGGGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTTCGCCGCTA---
D00007607 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Met CAT -GGACCTTTAGCTCAACT-GGTT-AGAGCACTCGGCTCATAACCGAGCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACAAGGTCCA---
D00007608 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Met CAT -CGCGGGATGGAGCAGTTAGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTGCTCCCGCAA---
D00007625 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTCGGT--AGCTCGCTGGGCTCATAACCCAGAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCCCCGCTA---
D00007626 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Met CAT -AGCGGTGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAAGCGGCTCATAATCGCTGT-------------------GTCACCGGTTCAAGTCCGGTCACCGCTA---
D00007627 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Met CAT -GGGGCGGTAGCTCAGCC-GGTT-AGAGCAGCGGACTCATAATCCGTCG-------------------GCCGTGGGTTCGAGTCCCACCCGCCCCA---
D00007547 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTCGGT--AGCTCGCTGGGCTCATAACCCAGAG-------------------GTCGCAGATTCAAATCCTGTCCCCGCTA---
D00007548 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Met CAT -AGCGGTGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAAGCGGCTCATAATCGCTGT-------------------GTCACCGGTTCAAGTCCGGTCACCGCTA---
D00007549 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTCGGT--AGCTCGCTGGGCTCATAACCCAGAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCCCCGCTA---
D00007550 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Met CAT -GGGGCGGTAGCTCAGCC-GGTT-AGAGCAGCGGACTCATAATCCGTCG-------------------GCCGTGGGTTCGAGTCCCACCCGCCCCA---
D00007707 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Met CAT -GGCGGCGTAGCTCAGCT-GGTC-AGAGCATGCGGTTCATACCCGCAGT-------------------GTCGCTGGTTCGAATCCAGCCGCCGCTACCA
D00007708 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCAGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGGAG-------------------GTCGAGGGTTCAAATCCCTCCCCCGCAACCA
D00007709 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Met CAT -GGGCCCTTAGCTCAGC--GGTC-AGAGCTGCCGGCTCATAACCGGTTG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTACAGGGCCCACCA
D00007361 Synechocystis_sp._PCC_6803 Met CAT -CCAGGGTTGGCCGAGC--GGTT-GAGGCAGCGAACTCATAATTCGCCC-------------------TAGACAGGTTCAACTCCTGTACCCTGGA---
D00007362 Synechocystis_sp._PCC_6803 Met CAT -GGCTTGGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAGGGGACTCATAAGCCCAAG-------------------GTCGGCGGTTCAAATCCGCCCCGAGCCA---
D00007516 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Met CAT -GGGCCTTTAGCTCAGCT-GGC--AGAGCGGTCGGCTCATAACCGATTG-------------------GTCCGGGGTTCGAATCCCTGAAGGCCCACCA
D00007517 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Met CAT -GGGCCTTTAGCTCAGCT-GGC--AGAGCGGTCGGCTCATAACCGATTG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCTGAAGGCCCACCA
D00007518 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTCCGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGGAG-------------------GTCGTGGGTTCAAATCCCACCCCCGCAACCA
D00007519 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Met CAT -GGCGGCGTAGCTCAGGT-GGCT-AGAGCATGCGGTTCATACCCGCAGT-------------------GTCGGTGGTTCGAATCCACTCGCCGCTACCA
D00007511 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Met CAT -CCAGGGTTGGCCGAGC--GGAT-GAGGCAGCGAACTCATAATTCGCCA-------------------TAGGCTGGTTCGACTCCAGCACCCTGGA---
D00007512 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Met CAT -GGCTCAGTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCAGGGGACTCATAAGCCCAAG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCCGCCTGAGCCA---
D00001788 Thermotoga_maritima Met CAT -GGGCTCGTAGCTCAGTT-GGC--ACAGCGCCCGGCTCATAACCGGGTG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCTCCCGAGCCCACCA
D00001789 Thermotoga_maritima Met CAT -GGCGGCGTAGCTCAGC--GGCG-AGAGCGGGTCATTCATAATCACCGT-------------------GTCGTGGGTTCGAGTCCCACCGCCGCCA---
D00007363 Thermotoga_maritima_MSB8 Met CAT -GGCGGCGTAGCTCAGC--GGCG-AGAGCGGGTGATTCATAATCACCGT-------------------GTCGTGGGTTCGAGTCCCACCGCCGCCA---
D00007364 Thermotoga_maritima_MSB8 Met CAT -GGGCTCGTAGCTCAGTT-GGC--AGAGCGCCCGGCTCATAACCGGGTG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCTCCCGAGCCCACCA
D00007729 Thermus_thermophilus_HB27 Met CAT -GGGCCGTTAGCTCAAC--GGTC-AGAGCAGCCGGCTCATAACCGGTAG-------------------GTTGCAGGTTCGAATCCTGCACGGCCCACCA
D00007730 Thermus_thermophilus_HB27 Met CAT --GCGGCGTAGCTCAGGT-GGTC-AGAGCACACGACTCATAATCGTGGT-------------------GTCGTGGGTTCGAGTCCCACCGCCGCCACCA
D00007731 Thermus_thermophilus_HB27 Met CAT --GCGGGGTGGAGCAGCCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGCCCCCGCAACCA
D00007732 Treponema_denticola_ATCC_35405 Met CAT -GGCGGTATAGCTCAGTT-GGC--AGAGCAAACGGCTCATATCCGTTAG-------------------GTCATAGGTTCAAGCCCTATTGCCGCTA---
D00007733 Treponema_denticola_ATCC_35405 Met CAT -CGCAGGGTAGAGCAGTT-GGC--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGGAG-------------------GTCGGAGGTTCGAGTCCTCTCCCTGCTA---
D00007734 Treponema_denticola_ATCC_35405 Met CAT -GGGCCCATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAGCGGACTCATAATCCGCGG-------------------GTCGCCGGTTCAAGTCCAGCTGGGCCCA---
D00001798 Treponema_pallidum Met CAT -GGCGGCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGCGGCTCATATCCGCGCT-------------------GTCATAGGTTCAATCCCTATTGCCGCTA---
D00001799 Treponema_pallidum Met CAT -GGGCCTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAGCGGACTCATAATCCGCGG-------------------GTCGCCGGTTCAAGTCCAGCTGGGCCCA---
D00007357 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Met CAT -GGCGGCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGCGGCTCATATCCGCGCT-------------------GTCATAGGTTCAATCCCTATTGCCGCTA---
D00007358 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Met CAT -GGGCCTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAGCGGACTCATAATCCGCGG-------------------GTCGCCGGTTCAAGTCCAGCTGGGCCCA---
D00007591 Tropheryma_whipplei_str._Twist Met CAT -GGCGGGATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACGGCTCATAATCGTGGG-------------------GTCACGGGTTCGAATCCCGTTCCCGCTACCA
D00007592 Tropheryma_whipplei_str._Twist Met CAT -GGGGCGGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCTGCGAACTCATAATTCGTCG-------------------GTCACGGGTTCGAGTCCCGTCCGCCCCA---
D00007593 Tropheryma_whipplei_str._Twist Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTTCGGT--AGCTCGCTGGGCTCATAACCCAGAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAA---
D00007594 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Met CAT -GGCGGGATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACGGCTCATAATCGTGGG-------------------GTCACGGGTTCGAATCCCGTTCCCGCTACCA
D00007595 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Met CAT -GGGGCGGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCTGCGAACTCATAATTCGTCG-------------------GTCACGGGTTCGAGTCCCGTCCGCCCCA---
D00007596 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTTCGGT--AGCTCGCTGGGCTCATAACCCAGAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAA---
D00007315 Ureaplasma_parvum_serovar_3 Met CAT -GGCTGGATAGCTCAACT-GGTT-AGAGCGCTCGGTTCATACCCGGGAG-------------------GTTCAGAGTTCAAATCTCTGTCCAGCCACCA
D00007316 Ureaplasma_parvum_serovar_3 Met CAT -GCTTCTATAGCTCAATTTGGTT-AGAGCCCCCGACTCATAATCGGTTG-------------------GTTACAGGTTCAAGTCCTGTTAGAAGCACCA
D00007307 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Met CAT -GGCCCCTTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCCCCAGTTCGAACCTGGGAGGGGCCACCA
D00007308 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Met CAT -GGCTACGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACATCACTCATAATGATGGG-------------------GTCACAGGTTCAAATCCCGTCGTAGCCACCA
D00007309 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Met CAT -GGCTACGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACATCACTCATAATGATGGG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCCGTCGTAGCCACCA
D00007735 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Met CAT -GGCTGAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGGAGGATCATAATCTCTTG-------------------GTCGGGGGTTCAAGTCCCTCCTCAGCCA---
D00007736 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Met CAT -GGGATTGTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCAGTTCGCTCATAACGAATTG-------------------GCCGTAGGTTCGAGTCCTACCAATCCCACCA
D00007737 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Met CAT -CGCGGGATGGAGCAGCTCGGT--AGCTCGTCAGGCTCATAACCTGAAG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTACTCCCGCAACCA
D00007523 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Met CAT -GGCTATGTAGCTCAGCC-GGTT-AGAGCACAGCACTCATAATGCTGGG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACCCATAGCCACCA
D00007524 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Met CAT -TGCGGGGTGGAGCAGTCTGGC--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCTACCA
D00007525 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Met CAT -GGGCCTATAGCTCAAC--GGTT-AGAGCAGAGGACTCATAATCCTTTG-------------------GTTCCAGGTTCGAATCCTGGTGGGCCCACCA
D00007520 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Met CAT -GGCTATGTAGCTCAGCC-GGTT-AGAGCACAGCACTCATAATGCTGGG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACCCATAGCCACCA
D00007521 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Met CAT -TGCGGGGTGGAGCAGTCTGGC--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCTACCA
D00007522 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Met CAT -GGGCCTATAGCTCAAC--GGTT-AGAGCAGAGGACTCATAATCCTTTG-------------------GTTCCAGGTTCGAATCCTGGTGGGCCCACCA
D00007365 Xylella_fastidiosa_9a5c Met CAT -GGCTATGTAGCTCAGCA-GGTT-AGAGCACAGCACTCATAATGCTGGG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACCCATAGCCACCA
D00007366 Xylella_fastidiosa_9a5c Met CAT -GGGCCTATAGCTCAATT-GGTT-AGAGCAGCGGACTCATAATCCGTTG-------------------GTTGCAGGTTCAAGTCCTGCTGGGCCCACCA
D00007367 Xylella_fastidiosa_9a5c Met CAT -GGCCCCTTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAGGGGCCACCA
D00007368 Xylella_fastidiosa_9a5c Met CAT -GGCCCTTTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAAGGGCCACCA
D00007369 Xylella_fastidiosa_9a5c Met CAT -GGCTACGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACATCACTCATAATGATGGG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCCGTCGTAGCCACCA
D00007597 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Met CAT -GGGCCTATAGCTCAATT-GGTT-AGAGCAGCGGACTCATAATCCGTTG-------------------GTTGCAGGTTCAAGTCCTGCTGGGCCCACCA
D00007598 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Met CAT -TGCGGGGTGGAGCAGTCTGGC--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCTACCA
D00007599 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Met CAT -GGCTATGTAGCTCAGCA-GGTT-AGAGCACAGCACTCATAATGCTGGG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACCCATAGCCACCA
D00007710 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00007711 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Met CAT -GGCTACGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCACAGCACTCATAATGCTGGG-------------------GTCACAGGTTCGATTCCCGTCGTAGCCACCA
D00007712 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Met CAT -GGCCCCTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCACTGGTTCAAGTCCAGTAGGGGCCACCA
D00007397 Yersinia_pestis_CO92 Met CAT -GGCCCCTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCACTGGTTCAAGTCCAGTAGGGGCCACCA
D00007398 Yersinia_pestis_CO92 Met CAT -GGCTACGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCACAGCACTCATAATGCTGGG-------------------GTCACAGGTTCGATTCCCGTCGTAGCCACCA
D00007528 Yersinia_pestis_KIM Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00007529 Yersinia_pestis_KIM Met CAT -GGCTACGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCACAGCACTCATAATGCTGGG-------------------GTCACAGGTTCGATTCCCGTCGTAGCCACCA
D00007530 Yersinia_pestis_KIM Met CAT -GGCCCCTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCACTGGTTCAAGTCCAGTAGGGGCCACCA
D00007713 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Met CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00007714 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Met CAT -GGCTACGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCACAGCACTCATAATGCTGGG-------------------GTCACAGGTTCGATTCCCGTCGTAGCCACCA
D00007715 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Met CAT -GGCCCCTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCACTGGTTCAAGTCCAGTAGGGGCCACCA
D00001922 Arabidopsis_thaliana Met CAT -GGGGTGGTGGCGCAGTT-GGCT-AGCGCGTAGGTCTCATAATCCTGAG-------------------GTCGAGAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCA---
D00007461 Arabidopsis_thaliana Met CAT -GGGCTTATAGTTTAATT-GGTT-GAAACGTACCGCTCATAACGGTTAT-------------------ATTGTAGGTTCGAGCCCTACTAAGCCTA---
D00007462 Arabidopsis_thaliana Met CAT -ATCAAAGTGGTGCAGC--GGA--AGCGTGATGGGCCCATAACCCACAG-------------------GTCACAGGATCGAAACCTGTCTTTGAT----
D00007463 Arabidopsis_thaliana Met CAT -ACCTACTTGACTCAGC--GGTT-AGAGTATCGCTTTCATACGGCGAGA-------------------GTCATTGGTTCAAATCCAATAGTAGGTA---
D00007464 Arabidopsis_thaliana Met CAT -AGCGGGGTAGAGGAATT-GGTC-AACTCATCAGGCTCATGACCTGAAG-------------------ATTACAGGTTCGAATCCTGTCCCCGCAT---
D00007465 Arabidopsis_thaliana Met CAT -ATCAGAGTGGCGCAGC--GGA--AGCGTGGTGGGCCCATAACCCACAG-------------------GTCCCAAGATCGAAACTTGGCTCTGATA---
D00007466 Arabidopsis_thaliana Met CAT -ATCAGAGTGGCGCAGC--GGA--AGCGTGGTGGGCCCATAACCCACAG-------------------GTCCCAGGATCGAAACCTGGCTCTGATA---
D00007467 Arabidopsis_thaliana Met CAT -AGCAGAGTGGCGCAGC--GGA--AGCGTGGTGGGCCCATAACCCACAG-------------------GTCCCAGGATCGAAACCTGGCTCTGCTA---
D00007468 Arabidopsis_thaliana Met CAT -GGGGTGGTGGCGCAGTT-GGCT-AGCGCGTAGGTCTCATAATCCTGAG-------------------GTCGAGAGTTCGAGCCTCTCTCACCCC----
D00007469 Arabidopsis_thaliana Met CAT -GGGGTGGTGGCGCAGTT-GGCT-AGCGCGTAGGTCTCATAATCCTGAG-------------------GTCGAGAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCA---
D00007470 Caenorhabditis_elegans Met CAT ------GGTCCTGTAGT--GGTT-ATCACGTCTGCTTCATACACAGAAG-------------------GTCGCCGGTTCGAACCCGGCCAGGACC----
D00007471 Caenorhabditis_elegans Met CAT -AGCAGCGTGGCGCAGT--GGA--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCGGTGGATCGAAACCACTCGCTGCT----
D00007472 Caenorhabditis_elegans Met CAT -GCTTCCGTAGCGCAGTA-GGC--AGCGCGTCAGTCTCATAATCTGAAG-------------------GTCGTGAGTTCGAGCCTCACCGGGAGC----
D00007716 Candida_glabrata_CBS_138 Met CAT -GCTTCTGTAGCTCAGTC-GGA--AGAGCGTCAGTCTCATAATCTGAAG-------------------GTCGAGAGTTCGAACCTCCCCAGGAGCA---
D00001918 Dictyostelium_discoideum Met CAT -AGCTTCTTAACTCAGG--GGT--AGAGTGCGAGGCCCATAACCTCGAG-------------------GTCCTAGGATCGAAACCTAGAGAAGCTA---
D00001924 Drosophila_melanogaster Met CAT -AGCAGAGTGGCGCAGT--GGA--AGCGTGCTGGTCCCATAACCCAGAG-------------------GTCCGAGGATCGAAACCTTGCTCTGCTA---
D00007475 Drosophila_melanogaster Met CAT -AGCAGAGTGGCGCAGT--GGA--AGCGTGCTGGGCCCATAACTCAGAG-------------------GTCCGAGGATCGAAACCTTGCTCTGCTA---
D00007476 Drosophila_melanogaster Met CAT -AGCAGAGTGGCGCAGT--GGA--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCCGAGGATCGAAACCTTGCTCTGCTA---
D00007477 Drosophila_melanogaster Met CAT -GCCTCGATGGCGCAGTT-GGC--AGCGCGTAAGTCTCATAATCTTAAG-------------------GTCGTGAGTTCGAGCCTCACTCGGGGC----
D00007478 Drosophila_melanogaster Met CAT -GCCTCGGTGGCGCAGTT-GGC--AGCGCGTAAGTCTCATAATCTTAAG-------------------GTCGTGAGTTCGAGCCTCACCCGGGGC----
D00007526 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Met CAT -AGCATGGTAGCGCAAC--GGA--AGCGCGCTGGGCTCATAACCCAGAG--------G----------TTGTGTGGTTCGAATCCCACCCATGCTA---
D00007527 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Met CAT -GTGACATTGGCGCAATA-GGT--AGCGCGCTGGTCTCATAATCCAGAG-------------------GTTGCGAGTTCGAGTCTCGCATGTCGCA---
D00007753 Gallus_gallus Met CAT -GTTGCTATGGCACAGT--GGA--AGTTTGCTGGGCCCATAACCCAGAC-------------------GTTGATGGATCGAAACCATCTACCAACA---
D00007754 Gallus_gallus Met CAT -AGCAGAGTGGCACAGT--GCA--AGCATACTGAGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCGATGGATTGAAACCATCCTCTGCTT---
D00007755 Gallus_gallus Met CAT -GGGCTTATAGTTTAATT-GGTT-GAAACGTACCGGTCATAACGGTGAT-------------------ATTGTAGGTTCGAGCCCTACTAAGCCCA---
D00007756 Gallus_gallus Met CAT -ACCTACTTGACTCAGC--GGTT-AGAGTATCGCTTTCATACGGCGAGA-------------------GTCATTGGTTCAAATCCAATAGTAGGTA---
D00007757 Gallus_gallus Met CAT -AGCAGAGTGGCGCAGC--GGG--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCGATGGATCAAAACCATCCTCTGCTA---
D00007758 Gallus_gallus Met CAT -AGCAGAGTGGCGCAGC--GGA--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCGATGGATCGAAACCTTCCTCTGCTA---
D00007759 Gallus_gallus Met CAT -AGCAGAGTGGCGCAGC--GGA--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCGATGGATCGAAACCATCCTCTGCTA---
D00007760 Gallus_gallus Met CAT -GCCCTCTTAGCGCAGCA-GGC--AGCGCGTCAGTCTCATAATCTGAAG-------------------GTCCTGAGTTCGAGCCTCAGAGAGGGCA---
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D00007764 Gallus_gallus Met CAT -AGCAGAGTGGTACAATA-GG---AGCATTCTGGACCCATAATTCAGAG-------------------GCTGATGGATTGAAACCACTCTCTGCTA---
D00001923 Glycine_max Met CAT -GGGGTGGTGGCGCAGTT-GGGC-AGCGCGTAGGTCTCATAATCCTGAG-------------------GTCGAGAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCA---
D00007452 Homo_sapiens Met CAT -AGCAGAGTGGTGCAGT--GGA--AGCATACTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTTGATGGATGGAAACCATCCTCTGCT----
D00007453 Homo_sapiens Met CAT -AGCAGAGTGGCGCAGC--GGA--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCGATGGATCTAAACCATCCTCTGCTA---
D00007454 Homo_sapiens Met CAT -GCCCTCTTAGTGCAGCT-GGC--AGCGCGTCAGTTTCATAATCTGAAA-------------------GTCCTGAGTTCAAGCCTCAGAGAGGGC----
D00007455 Homo_sapiens Met CAT -AGCAGAGTGGCGCAGC--GGA--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCGATGGATCGAAACCATCCTCTGCTA---
D00007456 Homo_sapiens Met CAT -GCCTCGTTAGCGCAGTA-GGC--AGCGCGTCAGTCTCATAATCTGAAG-------------------GTCGTGAGTTCGAGCCTCACACGGGGC----
D00007457 Homo_sapiens Met CAT -GCCCTCTTAGCGCAGCT-GGC--AGCGCGTCAGTCTCATAATCTGAAG-------------------GTCCTGAGTTCAAGCCTCAGAGAGGGC----
D00007458 Homo_sapiens Met CAT -GCCCTCTTAGCGCAGCG-GGC--AGCGCGTCAGTCTCATAATCTGAAG-------------------GTCCTGAGTTCGAGCCTCAGAGAGGGC----
D00007459 Homo_sapiens Met CAT -GCCTCCTTAGCGCAGTA-GGC--AGCGCGTCAGTCTCATAATCTGAAG-------------------GTCCTGAGTTCGAACCTCAGAGGGGGC----
D00007460 Homo_sapiens Met CAT -GCCTCGTTAGCGCAGTA-GGT--AGCGCGTCAGTCTCATAATCTGAAG-------------------GTCGTGAGTTCGATCCTCACACGGGGC----
D00007781 Pan_troglodytes Met CAT -AGCGGAGTGGTGCAGT--GGA--AGCATACTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTTGATGGATGGAAACCATCCTCTGCTA---
D00007782 Pan_troglodytes Met CAT -AGCACAGTGGCGCAGC--GGA--AGTGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCGGTGGGTCGAAACCATCCTGGGCTA---
D00007783 Pan_troglodytes Met CAT -GCCTCCTTAGTGCAGTA-GGT--AGTGCGTCAGTCTCATAAATCCGAA--------G----------GTCCTGAGTTCGAGCCTCAGAGGGGGCA---
D00007784 Pan_troglodytes Met CAT -GCCCTCTTAGCGCAGTG-GGC--AGCGCGTCAGTCTCATAATCTGAAG-------------------GTTCTGAGTTCGAGCATCAGAGACGGTA---
D00007785 Pan_troglodytes Met CAT -GTCCTCTTAGCGCAGTG-GGC--AGCACGTCAGTCTCATAATCTGAAG-------------------GTCCTGAGTTCGAGCCTCAGAGACGGCA---
D00007786 Pan_troglodytes Met CAT -GTCCTCTTAGCGCAGTG-GGC--AGCGCGTCAGTCTCATAATCTGAAG-------------------GTCCTGAGTTCGAGCCTCAGAGACGGCA---
D00007787 Pan_troglodytes Met CAT -AGCAGAGTGGCGCAGC--GGA--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCGATGGATCGAAACCATCCTCTGCTA---
D00007788 Pan_troglodytes Met CAT -GCCCTCTTAGTGCAGCT-GGC--AGCGCGTCAGTCTCATAACCTGAAG-------------------GTCCTGAGTTCAAGCCTCAGAGAGGGCA---
D00007789 Pan_troglodytes Met CAT -GTCCTCTTAGCGCAGTG-GGC--AGCGCGTCAGTCTCATAATCTGAAG-------------------GTCCTGAGTTCGAGCCTCAGAGAGGGCA---
D00007790 Pan_troglodytes Met CAT -GCCTTCTTAGCGCAGTA-GGC--AGCGCGTCAGTCTCATAATCTGAAG-------------------GTCCTGAGTTCGAACCTCAGAGGGGGCA---
D00007791 Pan_troglodytes Met CAT -GCCTCGTTAGCGCAGTA-GGC--AGCGCGTCAGTCTCATAATCTGAAG-------------------GTCGTGAGTTCGAGCCTCACACGGGGCA---
D00007792 Pan_troglodytes Met CAT -GCCCTCTTAGCGCAGCT-GGC--AGCGCGTCAGTCTCATAATCTGAAG-------------------GTCCTGAGTTCAAGCCTCAGAGAGGGCA---
D00007793 Pan_troglodytes Met CAT -GCCTCCTTAGCGCAGTA-GGC--AGCGCGTCAGTCTCATAATCTGAAG-------------------GTCCTGAGTTCGAACCTCAGAGGGGGCA---
D00007794 Pan_troglodytes Met CAT -GCCCTCTTAGCGCAGTG-GGC--AGCGCGTCAGTCTCATAATCTGAAG-------------------GTCCTGAGTTCGAGCCTCAGAGAGGGCA---
D00001916 Plasmodium_falciparum Met CAT -AGCGAAATAGAGCATAA-GGAA-AGTTCGTCGGATTCATGCTCCGAAG-------------------GTAATCGGTTCAATTCCGTTTTTCGCTT---
D00001917 Plasmodium_falciparum Met CAT -ACATTTATAGCTAAGT--GGTCGAAAGCAATGGACTCATAATTCATTTTC------GAT------CAT-CAGTAGTTCGAATCTACTTAAATGTA---
D00007747 Plasmodium_falciparum_3D7 Met CAT -AGCAGCGTAGCTCAGA--GGA--AGAGTGGGGGGCTCATAACCCCCAG-------------------GACCGTGGATCGAAACCACGCGCTGCTA---
D00007748 Plasmodium_falciparum_3D7 Met CAT -GGGTAATTGGCGCAGTT-GGTT-AGCGCGCGGGTCTCATAATCCCGAG-------------------GTCGTGAGTTCGATCCTCACATTACCCA---
D00001919 Saccharomyces_cerevisiae Met CAT -GCTTCAGTAGCTCAGTA-GGA--AGAGCGTCAGTCTCATAATCTGAAG-------------------GTCGAGAGTTCGAACCTCTCCTGGAGCA---
D00001920 Saccharomyces_cerevisiae Met CAT -GCTTCAGTAGCTCAGTA-GGA--AGAGCGTCAGTCTCATAATCTGAAG-------------------GTCGAGAGTTCGAACCTCCCCTGGAGCA---
D00007473 Saccharomyces_cerevisiae Met CAT -GCTTCAGTAGCTCAGTA-GGA--AGAGCGTCAGTCTCATAATCTGAAG-------------------GTCGAGAGTTCGAACCTCCCCTGGAGCA---
D00007474 Saccharomyces_cerevisiae Met CAT -AGCGCCGTGGCGCAGT--GGA--AGCGCGCAGGGCTCATAACCCTGAT-------------------GTCCTCGGATCGAAACCGAGCGGCGCTA---
D00001925 Salmo_salar Met CAT AAGCAGAGTGGCGCAGC--GGA--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCGATGGATCGAAACCATCCTCTGCTA---
D00001926 Salmo_salar Met CAT AAGCAGAGTGGCGCAGC--GGA--AGCATGCTGGGCCCATAACCCAAAG-------------------GTCGATGGATCGAAACCATCCTCTGCTA---
D00001927 Salmo_salar Met CAT AAGCAGAGTGGCGCAGC--GGA--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCGATGGATCGATACCATCCTCTGCTA---
D00001921 Schizosaccharomyces_pombe Met CAT -TGCGCGGTAGGAGAGT--GGA--ACTCCGACGGGCTCATAACCCGTAG-------------------GTCCCAGGATCGAAACCTGGCCGCGCAA---
D00007479 Schizosaccharomyces_pombe Met CAT -TGCGCGGTAGGAGAGT--GGA--ACTCCGACGGGCTCATAACCCGTAG-------------------GTCCCAGGATCGAAACCTGGCCGCGCAA---
D00007480 Schizosaccharomyces_pombe Met CAT -GCTTCTGTAGCTCAGTC-GGTG-GTAGCATCCCTCTCATAAGGGGAAG-------------------GTCGTGAGTTCGAGCCTCACCAGGAGC----
D00007481 Schizosaccharomyces_pombe Met CAT -GCTTCTGTAGCTCAGTC-GGTG-GTAGCATCCCTCTCATAAGGGGAAG-------------------GTCGTGAGTTCGAGCCTCACCAGGAGC----
D00007482 Schizosaccharomyces_pombe Met CAT -GCTTCTGTAGCTCAGTC-GGTG-GTAGCATCCCTCTCATAAGGGGAAG-------------------GTCGTGAGTTCGAGCCTCACCAGGAGC----
D00007765 Takifugu_rubripes Met CAT -AGCAAAATTGCCCCAGC-GGA--AGCNTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCGATGGATCGAAACCATCCTCTGCTA---
D00007766 Takifugu_rubripes Met CAT -AGCAGAATGGCGCAGC--GGA--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GAAGATGGATCAAACCCATGCTCTGCTC---
D00007767 Takifugu_rubripes Met CAT -GGCATTGTAGCTTAGCT-GGTC-AAAGTACTTGCCTCATAAACAGGAA-------------------ATACTGGGTTCAAATCCCAGCAGTGTCT---
D00007768 Takifugu_rubripes Met CAT -AGCAGAGTGGCGCAGA--GGA--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCAATGGATCGAAACCATCCTCTGCTA---
D00007769 Takifugu_rubripes Met CAT -AGCAGAGTGGCGCAGC--GGA--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GACGATGGATCGAAACCATCCTCTGCTA---
D00007770 Takifugu_rubripes Met CAT -AGCAGAGTGGCGCAGC--GGG--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GGCGATGGATCGAAACCATCCTCTGCTA---
D00007771 Takifugu_rubripes Met CAT -AGCAGAGTGGCGCAGC--GGG--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GCCGATGGATCGAAACCATCCTCTGCTA---
D00007772 Takifugu_rubripes Met CAT -AGCAGAGTGGCGCAGC--GGA--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCAGTGGATCGAAACCATTCTCTGCTA---
D00007773 Takifugu_rubripes Met CAT -AGCAGAGTGGCGCAGA--GGG--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCGATGGATCGAAACCATCCTCTGCTA---
D00007774 Takifugu_rubripes Met CAT -GGCATTGTAGCTTAGCT-GGTC-AAAGTACTTGCCTCATAAACAGGAG-------------------ATCCTGGGTTCAAATCCCAGCAGTGCCT---
D00007775 Takifugu_rubripes Met CAT -AGCAGAGTGGCGCAGA--GGA--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCGATGGATCGAAACCATCCTCTGCTA---
D00007776 Takifugu_rubripes Met CAT -AGCAGAGTGGCGCAGC--GGG--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCGATGGATCGAAACCATCCTCTGCTA---
D00007777 Takifugu_rubripes Met CAT -AGCAGAGTGGCGCAGC--GGA--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCGATGGATCGAAACCATCCTCTGCTA---
D00007778 Takifugu_rubripes Met CAT -GTCTCGTTGGCGCAGTA-GGC--AGCGCGTCAGTCTCATAATCTGAAG-------------------GTCGTGAGTTCGAGCCTCACACGGGGCA---
D00007779 Takifugu_rubripes Met CAT -GCCTTGTTGGCGCAGCA-GGC--AGCGCGTCAGTCTCATAATCTGAAG-------------------GTCGTGAGTTCGAGCCTCACACAGGGCA---
D00007780 Takifugu_rubripes Met CAT -GCCTCGTTGGCGCAGTA-GGC--AGCGCGTCAGTCTCATAATCTGAAG-------------------GTCGTGAGTTCGAGCCTCACACGGGGCA---
D00003413 Methanocaldococcus_jannaschii Ini CAT -AGCGGGGTAGGGTAGCCAGGTCCATCCCGCCGGGCTCATAACCCGGAG-------------------ATCGGAGGTTCAAATCCTCCCCCCGCTA---
D00011538 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Ini CAT -AGCGGGGTAGGCCAGCCTGGT--AGGCCGCGGGGCTCATAGCCCCGAG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGCCCCGCTA---
D00003414 Sulfolobus_solfataricus Ini CAT -GGGCCCGTAGCTTAGCCCGGT--AGAGCGCCCGGCTCATAACCGGGTG-------------------GTCCGGGGTTCAAGTCCCCGCGGGCCCA---
D00003415 Thermoproteus_tenax Ini CAT -AGCGGGGTAGGCCAGCCAGGT--AGGCCGCGGGGCTCATA.CCCCGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCCCGCTA---
D00011555 Acinetobacter_sp._ADP1 Ini CAT -TGCGGGATGGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCAGCTCCCGCTACCA
D00011535 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCCGGT--AGCTCGTCAGGCTCATAACCTGAAG-------------------GCCGCAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAACCA
D00011521 Aquifex_aeolicus_VF5 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCTGGT--AGCTCGCCGGGCTCATAACCCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGCCCCCGCAACCA
D00011556 Bacillus_anthracis_str._A2012 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCACGTT--AGCTCACGGGCNTCATAANCCCGAA--------G----------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCCCCGCAACCA
D00011548 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCACGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCCCCGCAACCA
D00011549 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCACGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCCGAA--------G----------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCCCCGCAACCA
D00011550 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCCCCGCAACCA
D00011544 Bacillus_halodurans_C-125 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGGCGGTTCAAATCCGTCCCCCGCAACCA
D00003428 Bacillus_subtilis Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTTCGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAACCA
D00011487 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTTCGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAACCA
D00011557 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCACGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCCCCGCAACCA
D00003416 Bartonella_bacilliformis Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCCGGT--AGCTCGTCAGGCTCATAACCTGAAG-------------------GCCGCAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAACCA
D00011558 Bartonella_quintana_str._Toulouse Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCCGGT--AGCTCGTCAGGCTCATAACCTGAAG-------------------GCCGCAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAACCA
D00003422 Borrelia_burgdorferi Ini CAT -CGCAGGGTAGAGCAGTT-GGT--AGCTCGTCGGGATCATAACCCGAAG-------------------GTCATAGGTTCGAGTCCTATCCCTGCTA---
D00011528 Brucella_melitensis_16M Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCCGGT--AGCTCGTCAGGCTCATAACCTGAAG-------------------GCCGCAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAACCA
D00011488 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCAGCCCCCGCAACCA
D00011508 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Ini CAT -CGCGAAGTAGAGCAGT--GGTT-AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGGGAGTTCAAATCTCCCCTTCGCAACCA
D00011559 Candidatus_Blochmannia_floridanus Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTATGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCGACCCCCGCAACCA
D00011486 Chlamydia_trachomatis Ini CAT -CGCGGGATAGAGTAGT--GGTC-ATCTCGTTGGGCTCATAACCCAAAG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTTCTCCCGCT----
D00011485 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Ini CAT -CGCGGGATAGAGTAGT--GGTC-ATCTCGTTGGGCTCATAACCCAAAG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTTCTCCCGCTA---
D00011483 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Ini CAT -CGCGGGATAGAGTAGT--GGTC-ATCTCGTTGGGCTCATAACCCAAAG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTTCTCCCGCTA---
D00011484 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Ini CAT -CGCGGGATAGAGTAGT--GGTC-ATCTCGTTGGGCTCATAACCCAAAG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTTCTCCCGCTA---
D00011498 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Ini CAT -CGCGGGATAGAGTAGT--GGTC-ATCTCGTTGGGCTCATAACCCAAAG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTTCTCCCGCTA---
D00011526 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCT-GGC--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCACAGGTTCAAGTCCTGTCCCCGCAACCA
D00011524 Clostridium_perfringens_str._13 Ini CAT -CGCGGGATGGAGCAGCT-GGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCAAGTCCTGCTCCCGCAACCA
D00011509 Deinococcus_radiodurans_R1 Ini CAT -CGCAGGGTAGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGGAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCCCTGCAACCA
D00011551 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCACGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAACCA
D00003429 Escherichia_coli Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------ATCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00003430 Escherichia_coli Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00011499 Escherichia_coli_K12 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------ATCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00011500 Escherichia_coli_K12 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00011501 Escherichia_coli_O157:H7 Ini CAT -AGCCCTTTAGCTCAGT--GGTG-AGAGCGAGCGACTCATAATCGCCAG-------------------GTCGCTGGTTCAAATCCAGCAAGGGCCACCA
D00011502 Escherichia_coli_O157:H7 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00011503 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Ini CAT -AGCCCTTTAGCTCAGT--GGTG-AGAGCGAGCGACTCATAATCGCCAG-------------------GTCGCTGGTTCAAATCCAGCAAGGGCCACCA
D00011504 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00003431 Haemophilus_influenzae Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GCCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00003432 Haemophilus_influenzae Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCAGCCCCCGCAACCA
D00011507 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCAGCCCCCGCAACCA
D00003426 Helicobacter_pylori Ini CAT -CGCGGAGTAGAGCAGTCCGGT--AGCTCGTTGGGCTCATAACCCAAAG-------------------GTCAGTGGTTCAAATCCATTCTCCGCAACCA
D00011505 Helicobacter_pylori_26695 Ini CAT -CGCGGAGTAGAGCAGTCCGGT--AGCTCGTTGGGCTCATAACCCAAAG-------------------GTCAGTGGTTCAAATCCATTCTCCGCAACCA
D00011506 Helicobacter_pylori_J99 Ini CAT -CGCGGAGTAGAGCAGTCCGGT--AGCTCGTTGGGCTCATAACCCAAAG-------------------GTCAGTGGTTCAAATCCATTCTCCGCAACCA
D00003427 Lactococcus_lactis Ini CAT -CGCGGGATGGAGCAGCTAGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------T-CATAGGTTCAAATCCTATTCCCGCAA---
D00011540 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Ini CAT -CGCGCGGTGGAGCAGCT-GGT--AGCTCGTTGGGCTCATAACCCAAAG-------------------GTCATAGGTTCGAATCCTGTCCGCGCTA---
D00011522 Listeria_innocua_Clip11262 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAA---
D00011523 Listeria_monocytogenes_EGD-e Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAA---
D00011552 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAA---
D00011553 Mesoplasma_florum_L1 Ini CAT -CGCGGGGTAGAGCAGTT-GGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCAAGTCCTGCCCCCGCAACCA
D00011529 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCCGGT--AGCTCGTCAGGCTCATAACCTGAAG-------------------GTCACAGGTTCAAATCCTGTCCCCGCAACCA
D00011545 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTCGGT--AGCTCGCTGGGCTCATAACCCAGAG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCCCCGCTACCA
D00011489 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTCGGT--AGCTCGCTGGGCTCATAACCCAGAG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCCCCGCTACCA
D00003417 Mycoplasma_capricolum Ini CAT -CGCGGGGTAGAGCAGTT-GGT--AGCTCGCCGGGCTCATAACCCGGAG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCCCCCGCAACCA
D00011510 Mycoplasma_genitalium_G37 Ini CAT -CGCGGGATAGAGCAGTT-GGTC-AGCTCGTCAGGCTCATAATCTGAAG-------------------GTCGAGGGTTCAAATCCCTCTCCCGCAACCA
D00003418 Mycoplasma_mycoides Ini CAT -CGCGGGGTAGAGCAGTT-GGT--AGCTCGCCGGGCTCATAACCCGGAG-------------------GCCGCAGGTTCGAGTCCTGCCCCCGCAACCA
D00003419 Mycoplasma_pneumoniae Ini CAT -CGCGGGATAGAGCAGTC-GGTT-AGCTCGTCAGGCTCATAATCTGAAG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTCCCGCAACCA
D00011511 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Ini CAT -CGCGGGATAGAGCAGTC-GGTT-AGCTCGTCAGGCTCATAATCTGAAG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTCCCGCAACCA
D00011534 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Ini CAT -AGCGGAGTGGAGCAGTT-GGC--AGCTCGTCGGGCTCATAATCCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTACCTCCGCAACCA
D00011490 Neisseria_meningitidis_MC58 Ini CAT -CGCGGGATGGAGCAGCATGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTGCTCCCGCAACCA
D00011491 Neisseria_meningitidis_Z2491 Ini CAT -CGCGGGATGGAGCAGCATGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTGCTCCCGCAACCA
D00011532 Nostoc_sp._PCC_7120 Ini CAT -CGCGGAGATAGAGCTAT-GGTG-CGCTCTGGGGTCTCATAAGCCTTCA--------C----------GTACCGGGTTCAAATCCCGGCTCCGCTACCA
D00011533 Nostoc_sp._PCC_7120 Ini CAT -CGCGGGATAGAGCAGCCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCAGTGGTTCAAATCCACTTCCCGCCACCA
D00011541 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTTGGGCTCATAACCCAAAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAACCA
D00011512 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GCCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00011513 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00011554 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTTCGGT--AGCTCGCCGGGCTCATAACCCGGAG-------------------GTCACAGGTTCAAATCCTGTCCCCGCTACCA
D00011515 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Ini CAT -CGCGGGATGGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCAGCTCCCGCAACCA
D00011516 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCAGCCCCCGCAACCA
D00011531 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGTCTGGC--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAACCA
D00011527 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Ini CAT -TGCGGGGTGGAGCAGCTTGGT--AGCTCGTCAGGCTCATAACCTGAAG-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCAGCCCCCGCTACCA
D00011546 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Ini CAT -TGCGGGGTGGAGCAGTTCGGT--AGCTCGTCAGGCTCATAACCTGAAG-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCAGCCCCCGCTACCA
D00011536 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00011542 Shewanella_oneidensis_MR-1 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00011537 Sinorhizobium_meliloti_1021 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCCGGT--AGCTCGTCAGGCTCATAACCTGAAG-------------------GCCGCAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAACCA
D00003420 Spiroplasma_melliferum Ini CAT -CGTGGGGTGGAGCAGTT-GGT--AGCTCGTTGGGCTCATAACCCAAAG-------------------GTCGCAGGTTCAAGTCCTGCCCCCGCAACCA
D00003425 Staphylococcus_aureus Ini CAT -CGCGGGATGGAGCAGTTCGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGGTGGTTCAAATCCGCCTCCCGCAA---
D00011496 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Ini CAT -CGCGGGATGGAGCAGTTCGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGGTGGTTCAAATCCGCCTCCCGCAA---
D00011543 Streptococcus_mutans_UA159 Ini CAT -CGCGGGATGGAGCAGTTAGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTGCTCCCGCAA---
D00011525 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Ini CAT -CGCGGGATGGAGCAGCTCGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTGCTCCCGCAA---
D00003423 Streptomyces_rimosus Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTCGGT--AGCTCGCTGGGCTCATAACTCAGAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCCCCGCTA---
D00003424 Streptomyces_rimosus Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTCGGT--AGCTCGCTGGGCTCATAACCCAGAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATTCTGTCCCCGCTA---
D00003433 Synechocystis_sp. Ini CAT -CGCGGGATAGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGGTGGTTCAAATCCGCCTCCCGCCA---
D00003434 Synechocystis_sp. Ini CAT -CGCGGGATAGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGGTGGTTCAAATCCGCCTCCCGCCA---
D00011539 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Ini CAT -CGCGGGGTAGAGCAGTCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCCATGGTTCAAATCCATGCCCCGCCA---
D00011517 Thermotoga_maritima_MSB8 Ini CAT -TGCGGGGTGGAGCAGTCTGGC--AGCTCGTTGGGCTCATAACCCAAAG-------------------GTCGTGGGTTCAAATCCCACCCCCGCTACCA
D00003421 Treponema_pallidum Ini CAT -CGCAGGGTGGAGCAGTT-GGC--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGGAG-------------------GCCGGAGGTTCGAGTCCTCTCCCTGCTA---
D00011514 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Ini CAT -CGCAGGGTGGAGCAGTT-GGC--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGGAG-------------------GCCGGAGGTTCGAGTCCTCTCCCTGCTA---
D00011497 Ureaplasma_parvum_serovar_3 Ini CAT -CGCGGGATAGAGCAGCTTGGT--AGCTCGTCAGGCTCATAATCTGGAG-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCTCTCCCGCAACCA
D00011492 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00011493 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Ini CAT -CGCGGGATGGAGCAGCTTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCAGCTCCCGCAACCA
D00011494 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCAGCCCCCGCAACCA
D00011495 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCTTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00011518 Xylella_fastidiosa_9a5c Ini CAT -TGCGGGGTGGAGCAGTCTGGC--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCTACCA
D00011519 Xylella_fastidiosa_9a5c Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------ATCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00011520 Xylella_fastidiosa_9a5c Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00011530 Yersinia_pestis_CO92 Ini CAT -CGCGGGGTGGAGCAGCCTGGT--AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCCCCCGCAACCA
D00003498 Arabidopsis_thaliana Ini CAT -ATCAGAGTGGCGCAGC--GGA--AGCGTGGTGGGCCCATAACCCACAG-------------------GTCCCAGGATCGAAACCTGGCTCTGATA---
D00003500 Caenorhabditis_elegans Ini CAT -AGCAGCGTGGCGCAGT--GGA--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCGGTGGATCGAAACCACTCGCTGCTACCA
D00011547 Candida_glabrata_CBS_138 Ini CAT -AGCGCCGTGGCGCAGT--GGA--AGCGCGCAGGGCTCATAACCCTGAT-------------------GTCCCTAGATCGAAACTAGGCGGCGCTA---
D00003501 Drosophila_melanogaster Ini CAT -AGCAGAGTGGCGCAGT--GGA--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCCGAGGATCGAAACCTTGCTCTGCTA---
D00003499 Glycine_max Ini CAT -ATCAGAGTGGCGCAGC--GGA--AGCGTGGTGGGCCCATAACCCACAG-------------------GTCCCAGGATCGAAACCTGGCTCTGATA---
D00003505 Homo_sapiens Ini CAT -AGCAGAGTGGCGCAGC--GGA--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCGATGGATCGAAACCATCCTCTGCTA---
D00003506 Homo_sapiens Ini CAT -AGCAGAGTGGCGCAGC--GGA--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCGATGGATCTAAACCATCCTCTGCTA---
D00003504 Mus_musculus Ini CAT -AGCAGAGTGGCGCAGC--GGA--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCGATGGATCGAAACCATCCTCTGCTA---
D00003494 Physarum_polycephalum Ini CAT -CTCGGGGTAGTGTAAA--GGTT-CGCATACAGGGCTCATAACCCTATG-------------------G-TCTTGGTTCGATTCCAGGCCCCGACA---
D00003495 Saccharomyces_cerevisiae Ini CAT -GGCGCCGTGGCGCAGT--GGA--AGCGCGCAGGGCTCATAACCCTGAT-------------------GTCCTCGGATGGAAACCGAGCGGCGCTA---
D00003496 Saccharomyces_cerevisiae Ini CAT -AGCGCCGTGGCGCAGT--GGA--AGCGCGCAGGGCTCATAACCCTGAT-------------------GTCCTCGGATCGAAACCGAGCGGCGCTA---
D00003497 Schizosaccharomyces_pombe Ini CAT -TGCGCGGTAGGAGAGT--GGA--ACTCCGACGGGCTCATAACCCGTAG-------------------GTCCCAGGATCGAAACCTGGCCGCGCAA---
D00003502 Xenopus_laevis Ini CAT -AGCAGAGTGGCGCAGC--GGA--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCGATGGATCGAAACCATTCTCTGCTA---
D00003503 Xenopus_laevis Ini CAT -AGCAGAGTGGCGCAGC--GGA--AGCGTGCTGGGCCCATAACCCAGAG-------------------GTCGATGGATCGAAACCATCCTCTGCTA---
D00011981 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Ile TAT -GGGCCCGTGGCTCAGCCTGGG--AGAGCGCCGGCCTTATAAGCCGGAG-------------------GTCCCGGGTTCGAATCCCGGCGGGCCCA---
D00005978 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Ile TAT -GCGAGCGTAGTTCAAC--GGT--AGAACAGTACTCCTATGAATTGCTAACTAGA--TAC--TTTCAGA-CGTAGGTTCGACTCCTGCCGCTCGCT---
D00005979 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Ile TAT -GCGAGCGTAGTTCAAC--GGT--AGAACAGTACTCCTATGAATTGCTAACTAGA--TAC--TTTCAGA-TGCAGGTTCGACTCCTGCCGCTCGCT---
D00005887 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Ile TAT -CCACGGATAGCTCAGTTTGGTT-AGAGCATCAGACTTATAATCTGACT-------------------GTCGAAGGTTCGATTCCTTCTCCAACGG---
D00005993 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Ile TAT -CGGCGTGTAGCTCAAG--GGTG-AGAGCGGCGTCCTTATAAAGCGACC-------------------GTTGCGGGTTCGATTCCCGCCACGCCGA---
D00005995 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Ile TAT -CGGCGTGTAGCTCAGG--GGTA-AGAGCGGCGTCCTTATAAGGCGACG-------------------GTCGCGGGTTCAATTCCCGCCACGCCGA---
D00005926 Arabidopsis_thaliana Ile TAT -GCTCCCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTTGGTCTTATGAGCCGAAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGCCGGAAGC----
D00005927 Arabidopsis_thaliana Ile TAT -GGTCCCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTTGGTCTTATGAGCCGAAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGCCGGGACC----
D00001327 Caenorhabditis_elegans Ile TAT -GCCCCATTGGCGCAGTC-GGTT-AGCGCGTGGTACTTATA_TGCCAAG-------------------GTCGCCAGTTCGAGCCTGGCATGGGGCA---
D00005930 Caenorhabditis_elegans Ile TAT -GCCCCGGTGGCCGAGC--GGTCGAAGGCGTGAGACTTATGATCTCATTGGGT----TAA----ACCAGTCGCGGGTTCGAATCCCGCCCGGGGC----
D00005931 Caenorhabditis_elegans Ile TAT -GCCCCATTGGCGCAGTC-GGTT-AGCGCGTGGTACTTATAATGCCAAG-------------------GTCGCCAGTTCGAGCCTGGCATGGGGCA---
D00005932 Caenorhabditis_elegans Ile TAT -GCCCCATTGGCGCAGTC-GGTT-AGCGCGTGGTACTTATAATGCCAAG-------------------GTCGCCAGTTCGAGCCTGGCATGGGGC----
D00005933 Caenorhabditis_elegans Ile TAT -GCCCCATTGGCGCAGTC-GGTT-AGCGCGTGGTACTTATAATGCCAAG-------------------GTCGCCAGTTCGAGCCTGGCATGGGGCA---
D00006022 Candida_glabrata_CBS_138 Ile TAT -GCTCGTGTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCTTCGTGCTTATAGCACGCGA--------CC---------GTCGTGGGTTCAAACCCCACCTCGAGCA---
D00006023 Candida_glabrata_CBS_138 Ile TAT -GCTCGTGTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCTTCGTGCTTATAGCACGCGA--------CC---------GTCGTGGGTTCAATCCCCACCTCGAGCA---
D00005938 Drosophila_melanogaster Ile TAT -GCTCCAGTGGCGCAATT-GGTT-AGCGCACGGTACTTATAATGCCGGG-------------------GTTGTGAGTTCGAGCCTCACCTGGAGC----
D00005939 Drosophila_melanogaster Ile TAT -GCTCCAGTGGCGCAATT-GGTT-AGCGCACGGTACTTATAATGCCGGG-------------------GTTGTGAGTTCGAGCCTCACCTGGAGC----
D00005959 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Ile TAT -GCCCCCGTAGCTCAGTC-GGTC-AGAGCGTGGTACTTATAATGCCAAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGCTGGAGGCA---
D00006042 Gallus_gallus Ile TAT -GCTCCAGTGGCGCAATC-GGTT-AGCGCGCGGTACTTATAATGCCGAG-------------------GTTGTGAGTTCGAGCCTCACCTGGAGCA---
D00005920 Homo_sapiens Ile TAT -GCTCCAGTGGCGCAATC-GGTT-AGCGCGCGGTACTTATAATGCCGAG-------------------GTTGTGAGTTCGAGCCTCACCTGGAGC----
D00005921 Homo_sapiens Ile TAT -GCTCCAGTGGCGCAATC-GGTT-AGCGCGCGGTACTTATAATGCCGAG-------------------GTTGTGAGTTCAAGCCTCACCTGGAGC----
D00005922 Homo_sapiens Ile TAT -GCTCCAGTGGCGCAATC-GGTT-AGCGCGCGGTACTTATAATGCCGAG-------------------GTTGTGAGTTCGAGCCTCACCTGGAGC----
D00005923 Homo_sapiens Ile TAT -GCTCCAGTGGCGCAATC-GGTT-AGCGCGCGGTACTTATAATGCCGAG-------------------GTTGTGAGTTCGATCCTCACCTGGAGC----
D00001318 Leishmania_tarentolae Ile TAT -GCTCCCGTGGTCTAGTT-GGTT-AGGACGCTGGTCTTATGAACCGGAT-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGCCGGGAGCA---
D00006062 Pan_troglodytes Ile TAT -GCTCCAGTGGCGCAATC-GGTT-AGCGCGCGGTACTTATAATGCCGAG-------------------GTTGTGAGTTCGAGCCTCACCTGGAGCA---
D00006063 Pan_troglodytes Ile TAT -GCTCCAGTGGCGCAATC-GGTT-AGCGCGCGGTACTTATAATGCCGAG-------------------GTTGTGAGTTCAAGCCTCACCTGGAGCA---
D00006064 Pan_troglodytes Ile TAT -GCTCCAGTGGCGCAATC-GGTT-AGCGCGCGGTACTTATAATGCCGAG-------------------GTTGTGAGTTCGATCCTCACCTGGAGCA---
D00006037 Plasmodium_falciparum_3D7 Ile TAT -GATCCATTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCGTCGGTCTTATGTACCGAAG-------------------GTCGTGGGTTCGAAACCCACATGGATCA---
D00001321 Saccharomyces_cerevisiae Ile TAT -GCTCGTGTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCTTCGTGCTTATAACGCGACC-------------------GTCGTGGGTTCAATCCCCACCTCGAGCA---
D00005935 Saccharomyces_cerevisiae Ile TAT -GCTCGTGTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCTTCGTGCTTATAACGCGACC-------------------GTCGTGGGTTCAATCCCCACCTCGAGCA---
D00005936 Saccharomyces_cerevisiae Ile TAT -GCTCGTGTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCTTCGTGCTTATAACGCGACC-------------------GTCGTGGGTTCAAACCCCACCTCGAGCA---
D00005942 Schizosaccharomyces_pombe Ile TAT -GCTCCCGTGGCCAAGCT-GGTT-AAGGCCTCATGCTTATAACGTGGAA-------------------ATCGCGAGTTCGATCCTCGCCGGGAGC----
D00006050 Takifugu_rubripes Ile TAT -GCCTGGATAGCTCAGTT-GGT--GGAGCATCAGACTTATAATCTGAGG-------------------CTCTAGGGTTGCAGTCCCTGTTAAGGTT---
D00006051 Takifugu_rubripes Ile TAT -GCTCCAGTGGCGCAATC-GGTC-AGCGCGCGGTACTTATAATGCCGAG-------------------GTTGTGAGTTCGAGCCTCACCTGGAGCA---
D00006052 Takifugu_rubripes Ile TAT -GCTCCAGTGGCGCAATC-GGTT-AGCGCGCGGTACTTATAATGCCGAG-------------------GTTGTGAGTTCGAGCCTCACCTGGAGCA---
D00006053 Takifugu_rubripes Ile TAT -GCTCCTGTGGCGCAATC-GGTC-AGCGCGCGGTACTTATAATGCCGAG-------------------GTTGTGAGTTCGAGCCTCACCTGGAGCA---
D00005899 Aeropyrum_pernix_K1 Ile GAT -GGGCCCGTAGCTCAGCCTGGT--AGAGCGCCCGGCTGATAACCGGGAG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCCCCGGGCCCACC-
D00001120 Archaeoglobus_fulgidus Ile GAT -GGGCCCGTGGCTCAGCCTGGTT-AGAGCGCTCGCCTGATAAGCGAGAG-------------------T-CCGGGGTTCGAACCCCCGCGGGCCCA---
D00005900 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Ile GAT -GGGCCCGTGGCTCAGCCTGGTT-AGAGCGCTCGCCTGATAAGCGAGAG-------------------GTCCGGGGTTCGAACCCCCGCGGGCCCA---
D00005901 Halobacterium_sp._NRC-1 Ile GAT -GGGTCAGTAGCTCAACTAGGT--AGAGCGCCACTCTGATAAGGTGGAG-------------------GCTTGCGGTTCAAATCCGCACTGACCCA---
D00001121 Methanocaldococcus_jannaschii Ile GAT -AGGGCGGTGGCTCAGCCTGGTT-AGAGTGCTCGGCTGATAACCGAGTG-------------------GTCCGGGGTTCGAATCCCCGCCGCCCTA---
D00005903 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Ile GAT -AGGGCGGTGGCTCAGCCTGGTT-AGAGTGCTCGGCTGATAACCGAGTG-------------------GTCCGGGGTTCGAATCCCCGCCGCCCTACC-
D00011849 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Ile GAT -AGGGCGGTGGCTTAGACTGGTT-ATAGTGCTCGGCTGATAACCGAGTG-------------------GTCCGGGGTTCGAATCCCCGCCGCCCTA---
D00005904 Methanococcus_maripaludis Ile GAT -AGGGCAGTGGCTCAGCCTGGTT-AGAGTGCTCGGCTGATAACCGAGTG-------------------GTCCGGGGTTCGAATCCCCGCTGCCCTA---
D00005961 Methanopyrus_kandleri_AV19 Ile GAT -GGGCCCGCAGCTCAGCCAGGTT-AGAGCGCGGGGCTGATAACCCCGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGCCCACCA
D00011910 Methanosarcina_acetivorans_C2A Ile GAT -GGGCCCGTAGCTTAGCCTGGT--GGAGCGCACGGCTGATAACCGTGAG-------------------GTCCTGCGTTCGAATCGCAGCGGGCCCACCA
D00005945 Methanosarcina_mazei_Go1 Ile GAT -GGGCCCGTAGCTTAGCCTGGT--GGAGCGCACGGCTGATAACCGTGAG-------------------GTCCTGCGTTCGAATCGCAGCGGGCCCA---
D00005946 Methanosarcina_mazei_Go1 Ile GAT -GGGCCCGTAGCTTAGCCTGGT--GGAGCGCACGGCTGATAACCGTGAG-------------------GTCCTGCGTTCGAATCGCAGCGGGCCCACCA
D00011965 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Ile GAT -GGGCCCGTAGCATAGCCAGGT--GGTGCACCCGGCTGATAACCGGGAG-------------------GTCATGCGTTCGAATCGCATCGGGCCCA---
D00005902 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Ile GAT -GGGCCCGTGGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACGGCTGATAACCGTGAG-------------------GCCCTGGGTTCGAATCCCAGCGGGCCCA---
D00012012 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Ile GAT -GGGCCCGTGGCTCAGCCTGGC--AGAGCGCCCGGCTGATAACCGGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGCCGGGCCCA---
D00005905 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Ile GAT -GGGCCCGTGGCTTAGCCCGGTT-AGAGCGCCCGGCTGATAACCGGGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGCCCA---
D00005906 Pyrococcus_abyssi_GE5 Ile GAT -GGGCCCGTGGCTCAGCCTGGTT-AGAGCGCCCGCCTGATAAGCGGGAG-------------------GTCCGGGGTTCGAAGCCCCGCGGGCCCACC-
D00005907 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Ile GAT -GGGCCCGTGGCTCAGCCTGGTC-AGAGCGCCCGCCTGATAAGCGGGAG-------------------GTCCGGGGTTCGAAGCCCCGCGGGCCCACC-
D00005908 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Ile GAT -GGGCCCGTGGCTCAGCCTGGTT-AGAGCGCCCGCCTGATAAGCGGGAG-------------------GTCCGGGGTTCGAAGCCCCGCGGGCCCACCA
D00012042 Staphylothermus_marinus_F1 Ile GAT -GGGCCCGTAGCTCAGCCTGGT--GGAGCGCCCGGCTGATAACCGGGAG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCCCCGGGCCCA---
D00012080 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Ile GAT -GGGCCCGTAGCTTAGCCTGGT--AGAGCGTCCGGCTGATAACCGGAAG-------------------GCCGTGGGTTCAAATCCCACCGGGCCCA---
D00005909 Sulfolobus_solfataricus_P2 Ile GAT -GGGCCCGTAGCTTAGCTTGGT--GGAGCGCCCGGCTGATAACCGGGAG-------------------GTCACGGGTTCAAATCCCGTCGGGCCC----
D00005954 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Ile GAT -GGGCCCGTAGCTTAGCTTGGT--AGAGCGCCCGGCTGATAACCGGGAG-------------------GTCGCGGGTTCAAGTCCCGCCGGGCCCA---
D00005910 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Ile GAT -GGGGTTGTAGCTTAGACAGGCT-ATAGCACTCGGCTGATAACCGAGAG-------------------GTCACCGGTTCGAATCCGGTCAACCCCA---
D00005911 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Ile GAT -GGGGTTGTAGCTTAGACAGGCT-ATAGCACTCGGCTGATAACCGAGAG-------------------GTCACCGGTTCGAATCCGGTCAACCCCA---
D00001132 Acetobacter_aceti Ile GAT -GGGCTAGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACGCTTGATAAGCGTGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCTGGCCCACCA
D00001141 Acholeplasma_laidlawii Ile GAT -GGGCCTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACTCGCTTGATAAGCGAGGG-------------------GTCGATGGTTCAAG-TCGTTCAGGCCCACCA
D00001161 Acidithiobacillus_ferrooxidans Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCACACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCAGTGGTTCGAGTCCACTTGGGCCCACCA
D00006034 Acinetobacter_sp._ADP1 Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACGCTTGATAAGCGTGGG-------------------GTCACAAGTTCAAGTCTTGTCAGACCCACCA
D00001169 Aeromonas_hydrophila Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTCAGACCCACCA
D00005896 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Ile GAT -GGGCCCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACGCTTGATAAGCGTGGG-------------------GTCGGTAGTTCGAGTCTACCCGGGCCCACCA
D00005876 Aquifex_aeolicus_VF5 Ile GAT -GGGCCTCTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGTGCCCCTGATAAGGGCAAG-------------------GTCCCAGGTTCGAGTCCTGGGAGGCCCA---
D00005999 Bacillus_anthracis_str._Ames Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTTAGGCCCACCA
D00006000 Bacillus_anthracis_str._Ames Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTTAGACCCACCA
D00006009 Bacillus_anthracis_str._Sterne Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTTAGGCCCACCA
D00006010 Bacillus_anthracis_str._Sterne Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTTAGACCCACCA
D00006025 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTTAGGCCCACCA
D00006026 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTTAGGCCCACCA
D00005988 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTTAGGCCCACCA
D00005972 Bacillus_halodurans_C-125 Ile GAT -GGGCCTGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCCACCA
D00005973 Bacillus_halodurans_C-125 Ile GAT -GGGCCTGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTCAGGCCCACCA
D00001154 Bacillus_subtilis Ile GAT -GGGCCTGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTCAGGCCCACCA
D00001155 Bacillus_subtilis Ile GAT -GGGCCTGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTCAGGCCCACCA
D00005845 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Ile GAT -GGGCCTGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTCAGGCCCACCA
D00005846 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Ile GAT -GGGCCTGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTCAGGCCCACCA
D00006035 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTTAGGCCCACCA
D00005997 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Ile GAT -AGTCCTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCTACACTGATAATGTAGAG-------------------GTCGGCAGTTCAACTCTGCCTGGGACTA---
D00001124 Bartonella_bacilliformis Ile GAT -GGGCTTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCGCGCTTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCAGGCCCACCA
D00001125 Bartonella_elizabethae Ile GAT -GGGCTTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCGCGCTTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCAGGCCCACCA
D00001126 Bartonella_henselae Ile GAT -GGGCTTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCGCGCTTGATAAGCGTGAG-------------------T-CGGAGGTTCAAGTCCTCCCAGGCCCACCA
D00006001 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Ile GAT -GGGCTTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCGCGCTTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCAGGCCCACCA
D00001127 Bartonella_quintana Ile GAT -GGGCTTGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCGCGCTTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCAGGCCCACCA
D00006038 Bartonella_quintana_str._Toulouse Ile GAT -GGGCTTGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCGCGCTTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCAGGCCCACCA
D00006002 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Ile GAT -GGGCCTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACGCTTGATAAGCGTGGG-------------------GTCGGAAGTTCGAGTCTTCCCAGGCCCACCA
D00005962 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Ile GAT -GGGCCCGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCATCCCTGATAAGGATGAG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCGGGCCCA---
D00001145 Borrelia_burgdorferi Ile GAT -GGGATCATAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCAGGTCTGATAAACCTGAG-------------------GTCGGATCTTCAACTCATCCTGGTCCCA---
D00001146 Borrelia_burgdorferi Ile GAT -GGGATCATAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCAGGTCTGATAAACCTGAG-------------------GTCGGATGTTCAACTCATCCTGGTCCCA---
D00005864 Borrelia_burgdorferi_B31 Ile GAT -GGGATCATAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCAGGTCTGATAAACCTGAG-------------------GTCGGATGTTCAACTCATCCTGGTCCCA---
D00006011 Borrelia_garinii_PBi Ile GAT -GGGATCATAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCAGGTCTGATAAACCTGAG-------------------GTCGGATGTTCAACTCATCCTGGTCCCA---
D00005974 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Ile GAT -GGGCTTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCGCGCTTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGAAGTTCAAGTCTTCCCAGGCCCACCA
D00001182 Brucella_abortus Ile GAT -GGGCTTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACGCTTGATAAGCGTGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCAGGCCCACCA
D00001183 Brucella_abortus Ile GAT -GGGCTTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACACGCTTGATAAGCGTGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCAGGCCCACCA
D00001181 Brucella_melitensis Ile GAT -GGGCTTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACGCTTGATAAGCGTGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCAGGCCCACCA
D00005885 Brucella_melitensis_16M Ile GAT -GGGCTTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACGCTTGATAAGCGTGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCAGGCCCACCA
D00005886 Brucella_melitensis_16M Ile GAT -GGGCTTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACGCTTGATAAGCGTGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCAGGCCCACCA
D00001180 Brucella_suis Ile GAT -GGGCTTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACGCTTGATAAGCGTGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCAGGCCCACCA
D00005963 Brucella_suis_1330 Ile GAT -GGGCTTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACGCTTGATAAGCGTGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCAGGCCCACCA
D00005847 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Ile GAT -AGGCTTGTAGCTCAGAT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAATTCCACTCAGGCCTACCA
D00005989 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Ile GAT -AGGCTTGTAGCTCAGCTTGGTC-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAATTCCACTCAGGCCTA---
D00005947 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Ile GAT -AGGCTTGTAGCTCAGAT-GGTA-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAACTCCACTCAGGCCTACCA
D00001147 Burkholderia_cepacia Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCACCGTCTTGATAAGGCGGGG-------------------GTCGTTGGTTCGAATCCAACCAGACCCACCA
D00001171 Burkholderia_cepacia Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCACCGTCTTGATAAGGCGGGG-------------------GTCGTTGGTTCGAATCCAACCAGACCCACCA
D00001174 Burkholderia_gladioli Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCACCGTCTTGATAAGGCGGGG-------------------GTCGTTGGTTCGAATCCAACCAGACCCACCA
D00001176 Burkholderia_mallei Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCACCGTCTTGATAAGGCGGGG-------------------GTCGTTGGTTCGAATCCAACCAGACCCACCA
D00001177 Campylobacter_jejuni Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGTGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCACAAGTTCAAGTCTTGTTAGGCCCACCA
D00005865 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGTGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCACAAGTTCAAGTCTTGTTAGGCCCACCA
D00006039 Candidatus_Blochmannia_floridanus Ile GAT -AGGCTTGTAGCTCAGCC-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTA---
D00005866 Caulobacter_crescentus_CB15 Ile GAT -AGGCCTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGTACGCCTGATAAGCGTAAG-------------------GTCGGCAGTTCGAGTCTGCCCAGGCCTACCA
D00001179 Caulobacter_vibrioides Ile GAT -AGGCCTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGTACGCCTGATAAGCGTAAG-------------------GTCGGCAGTTCGAGTCTGCCTAGGCCTACCA
D00005880 Chlamydia_muridarum_Nigg Ile GAT -GCGGTTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCGACACTGATAATGTCGAG-------------------GTCCCAAGTTCAAGTCTTGGTAACCGCA---
D00005844 Chlamydia_trachomatis Ile GAT -GCGGTTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCGACACTGATAATGTCGAG-------------------GTCCCAAGTTCAAGTCTTGGTAACCGC----
D00005843 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Ile GAT -GCGGTTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCGACACTGATAATGTCGAG-------------------GTCCCAAGTTCAAGTCTTGGTAACCGCA---
D00005841 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Ile GAT -GCGGTTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCGACACTGATAATGTCGAG-------------------GTCCCAAGTTCAAGTCTTGGTAACCGCA---
D00005842 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Ile GAT -GCGGTTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCGACACTGATAATGTCGAG-------------------GTCCCAAGTTCAAGTCTTGGTAACCGCA---
D00005857 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Ile GAT -GCGGTTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCGACACTGATAATGTCGAG-------------------GTCCCAAGTTCAAGTCTTGGTAACCGCA---
D00005943 Chlorobium_tepidum_TLS Ile GAT -GGGCCTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCAGTGGTTCAAATCCACTCAGGCCCACCA
D00005879 Clostridium_perfringens_str._13 Ile GAT -GGGTCTATAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTTAGACCCACCA
D00005975 Clostridium_tetani_E88 Ile GAT -GGGCTTATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTTAAGCCCACCA
D00006003 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCGCATCGCTGATAACGATGAG-------------------GTCGCAAGTTCGATTCTTGCTAGGCCCACCA
D00005964 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCGCATCGCTGATAACGATGAG-------------------GTCGCAAGTTCGATTCTTGCTAGGCCCACCA
D00005949 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCGCATCGCTGATAACGATGAG-------------------GTCGCAAGTTCGATTCTTGCTAGGCCCACCA
D00001148 Coxiella_burnetii Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACCCCTGATGGGGGTGAG-------------------GTCGGAAGTTCAAATCTTCCCAGACCCACCA
D00005987 Coxiella_burnetii_RSA_493 Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGAAGTTCAAATCTTCCCAGACCCACCA
D00005867 Deinococcus_radiodurans_R1 Ile GAT -GCGAGTGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCCCCAGTTCAAGTCTGGGCATTCGCACCA
D00006027 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Ile GAT -GGGCCTGTAGCTCAGGT-GGCT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGAAGTTCAAGTCTTCCCAGGCCCACCA
D00005976 Enterococcus_faecalis_V583 Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTTAGGCCCA---
D00001163 Escherichia_coli Ile GAT -AGGCTTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCA
D00005990 Escherichia_coli_CFT073 Ile GAT -AGGCTTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCA
D00005858 Escherichia_coli_K12 Ile GAT -AGGCTTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCA
D00005859 Escherichia_coli_O157:H7 Ile GAT -AGGCTTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCA
D00005860 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Ile GAT -AGGCTTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCA
D00005944 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Ile GAT -GCGTTTGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCACACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAAACGCACCA
D00006012 Geobacter_sulfurreducens_PCA Ile GAT -GGGCTTGTAGCTCAGTT-GGCT-AGAGCACACGACTGATAATCGTGAG-------------------GTCGCTGGTTCGAGTCCAGCCAGGCCCACCA
D00001133 Gluconacetobacter_europaeus Ile GAT -GGGCTAGTATCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACGCTTGATAAGCGTGGG-------------------GTCGGCGGTTCAACTCCTCCCTGGCCCACCA
D00001135 Gluconacetobacter_hansenii Ile GAT -GGGCTAGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACGCTTGATAAGCGTGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCTGGCCCACCA
D00001138 Gluconacetobacter_liquefaciens Ile GAT -GGGCTAGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACGCTTGATAAGCGTGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCTGGCCCACCA
D00001139 Gluconacetobacter_liquefaciens Ile GAT -GGGCTAGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACGCGCTTGATAAGCGTGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCTGGCCCACCA
D00001142 Gluconacetobacter_xylinus Ile GAT -GGGCTAGTAGCTCATGT-GGTT-AGAGCACACGCTTGATAAGCGTGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCTGGCCCACCA
D00001149 Gluconobacter_oxydans Ile GAT -GGGCTAGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACGCTTGATAAGCGTGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCTGGCCCACCA
D00001189 Haemophilus_influenzae Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGACCCACCA
D00005863 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGACCCACCA
D00001152 Helicobacter_pylori Ile GAT -GGGCTTATAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGAGGTTCAACTCCTCCTAAGCCCACCA
D00005861 Helicobacter_pylori_26695 Ile GAT -GGGCTTATAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGAGGTTCAACTCCTCCTAAGCCCACCA
D00005862 Helicobacter_pylori_J99 Ile GAT -GGGCTTATAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGAGGTTCAACTCCTCCTAAGCCCACCA
D00001157 Lactobacillus_acidophilus Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGCTGGTTT-AGAGC_CACGCCTGATAAGCGTG_G-------------------T-CGATGGTTCAAGTCCATTTAGGCCCA---
D00001158 Lactobacillus_casei Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCACGCTTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGATGGTTCAAGTCCATCTAGGCCCA---
D00001160 Lactobacillus_curvatus Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCACGCTTGATCCGCGTGAG-------------------GTCGATGGTTCAAGTCCATCTAGGCCCA---
D00001151 Lactobacillus_delbrueckii_subsp._bulgaricus Ile GAT -GGGCCTGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCTTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGATGGTTCAAGTCCATCCAGGCCCA---
D00001162 Lactobacillus_helveticus Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGCT-GGTTTAGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGATGGTTCAAGTCCATTTAGGCCCA---
D00006013 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGATGGTTCAAGTCCATTTAGGCCCA---
D00005977 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGCT-GGTTTAGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGATGGTTCAAGTCCATTTAGGCCCA---
D00001153 Lactococcus_lactis Ile GAT -GGGAGTTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACTGTGTTGATAACGCAGGG-------------------GTCCCAGGTTCGAATCCTGGAATTCCCA---
D00006014 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Ile GAT -GGGGATATAGCTCAGGC-GGTT-AGAGCGCTTCGCTGATAACGAAGAG-------------------GTCCGAGGTTCAAGTCCTCGTATCCCCACCA
D00005965 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Ile GAT -GGGCCTGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCACACGCTTGATAAGCGTGGG-------------------GTCATGTGTTCAAATCACATCAGGCCCA---
D00005877 Listeria_innocua_Clip11262 Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTTAGGCCCA---
D00005878 Listeria_monocytogenes_EGD-e Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTTAGGCCCA---
D00006028 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATTTAGGCCCA---
D00006029 Mesoplasma_florum_L1 Ile GAT -CGGAATATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCACTCCGCTGATAACGGAGAG-------------------GTCGTTGGTTCAAGTCCAATTATTCCGACCA
D00005888 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Ile GAT -GGGCTTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCGCGCTTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCAGGCCCACCA
D00005985 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGGC-GGTT-AGAGCGCTTCGCTGATAACGAAGAG-------------------GTCGGAGGTTCGAGTCCTCCTAGGCCCA---
D00001165 Mycobacterium_leprae Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGGC-GGTT-AGAGCACTTCGATGATAACGAAGAG-------------------GTCGGAGGTTCGAGTCCTCCTAGGCCCA---
D00005855 Mycobacterium_leprae_TN Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGGC-GGTT-AGAGCACTTCGCTGATAACGAAGAG-------------------GTCGGAGGTTCGAGTCCTCCTAGGCCCA---
D00005848 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGGC-GGTT-AGAGCGCTTCGCTGATAACGAAGAG-------------------GTCGGAGGTTCGAGTCCTCCTAGGCCCA---
D00006005 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGGC-GGTT-AGAGCGCTTCGCTGATAACGAAGAG-------------------GTCGGAGGTTCGAGTCCTCCTAGGCCCA---
D00001129 Mycoplasma_capricolum Ile GAT -CGGAATATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCATTCCGCTGATAACGGAGAG-------------------GTCGTTGGTTCAAGTCCAATTATTCCGACCA
D00005984 Mycoplasma_gallisepticum_R Ile GAT -GGAAGTATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCACACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGATGGTTCAAGTCCATTTACTTCCACCA
D00001130 Mycoplasma_genitalium Ile GAT -GGAAGTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGATGGTTCAAGTCCATTTACTTCCACCA
D00005868 Mycoplasma_genitalium_G37 Ile GAT -GGAAGTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGATGGTTCAAGTCCATTTACTTCCACCA
D00001137 Mycoplasma_pneumoniae Ile GAT -GGAAGTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGATGGTTCAAGTCCATTTACTTCCACCA
D00005869 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Ile GAT -GGAAGTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGATGGTTCAAGTCCATTTACTTCCACCA
D00005895 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Ile GAT -GGGAGCATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCACACGACTGATAATCGTGAG-------------------GTCGATGGTTCAAGTCCATTTGTTCCCACCA
D00001167 Mycoplasma_sp. Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCGCTTAGGCCCACCA
D00005849 Neisseria_meningitidis_MC58 Ile GAT -GGGTTTGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCACACGCTTGATAAGCGTGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCAGACCCACCA
D00005850 Neisseria_meningitidis_MC58 Ile GAT -GGGTTTGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCACACGCTTGATAAGCGTGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCAGACCCACCA
D00005851 Neisseria_meningitidis_Z2491 Ile GAT -GGGTTTGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCACACGCTTGATAAGCGTGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCAGACCCACCA
D00005852 Neisseria_meningitidis_Z2491 Ile GAT -GGGTTTGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCACACGCTTGATAAGCGTGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCAGACCCACCA
D00005996 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACGCTTGATAAGCGTGGG-------------------GTCGGTGGTTCAAATCCACCCAGACCCACCA
D00005894 Nostoc_sp._PCC_7120 Ile GAT -GGGCTATTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCCCTGGTTCGAGTCCAGGATGGCCCA---
D00005966 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Ile GAT -GGGCCTGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTCAGGCCCACCA
D00001185 Ochrobactrum_anthropi Ile GAT -GGGCTTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACGCTTGATAAGCGTGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCCCAGGCCCACCA
D00006004 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCATTTAGGCCCACCA
D00005870 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGACCCACCA
D00006006 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Ile GAT -AGGCTTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCA
D00001168 Phytoplasma_sp. Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCATTTAGGCCCACCA
D00006015 Porphyromonas_gingivalis_W83 Ile GAT -AGTCCTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCTACACTGATAATGTAGAG-------------------GTCGGCAGTTCAACTCTGCCTGGGACTA---
D00001170 Prevotella_ruminicola Ile GAT -AGGCTTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCA
D00006030 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCGCCGCCCTGATAAGGCGGAG-------------------GTCACTGGTTCAAGTCCAGTTAGGCCCA---
D00001172 Pseudomonas_aeruginosa Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGCAGTTCGAATCTGCCCAGACCCACCA
D00005872 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGCAGTTCGAATCTGCCCAGACCCACCA
D00001175 Pseudomonas_fluorescens Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGCAGTTCGAATCTGCCCAGACCCACCA
D00001178 Pseudomonas_mendocina Ile GAT -AGGTCTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGCAGTTCAAATCTGCCCAGACCTACCA
D00001187 Pseudomonas_pseudoalcaligenes Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCACCGTCTTGATAAGGCGGGG-------------------GTCGTTGGTTCGAATCCAACCAGACCCACCA
D00005998 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGCAGTTCGAATCTGCCCAGACCCACCA
D00001186 Ralstonia_pickettii Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCACCGTCTTGATAAGGCGGGG-------------------GTCGTAGGTTCAAGTCCTACCAGACCCACCA
D00005891 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCACCGTCTTGATAAGGCGGGG-------------------GTCGTAGGTTCAAGTCCTACCAGACCCACCA
D00005892 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCACCGTCTTGATAAGGCGGGG-------------------GTCGTAGGTTCAAGTCCTACCAGACCCACCA
D00005893 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Ile GAT -GGGGGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGTCATCCTCCACC-
D00005994 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Ile GAT -GGGCGTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCGTCGCTGATAACGACGAG-------------------GTCCCAGATTCGAGTTCTGGCACGCCCA---
D00006007 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Ile GAT -GGGCTTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCGCGCTTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGAAGTTCAAGTCTTCCCAGGCCCACCA
D00001159 Rhodothermus_marinus Ile GAT -GGGGCTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAACTCCACCCAGCCCCA---
D00005884 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Ile GAT -GGGTTTGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCACACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGAAGTTCAAGTCTTCTCAAACCCACCA
D00005948 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Ile GAT -GGGTTTGTAGCTCAGAT-GGTT-AGAGCACACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGAAGTTCAAGTCTTCTCAAACCCACCA
D00006016 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Ile GAT -GGGTTTGTAGCTCAGAT-GGTT-AGAGCACACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGAAGTTCAAGTCTTCTCAAACCCACCA
D00005897 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Ile GAT -AGGCTTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCA
D00005992 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Ile GAT -AGGCTTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCA
D00001190 Salmonella_enteritidis Ile GAT -AGGCTTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCA
D00005890 Salmonella_typhimurium_LT2 Ile GAT -AGGCTTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCA
D00005968 Shewanella_oneidensis_MR-1 Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACTCTGACCCACCA
D00005969 Shigella_flexneri_2a_str._301 Ile GAT -AGGCTTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCA
D00005898 Sinorhizobium_meliloti_1021 Ile GAT -GGGCCCGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGCAGTTCGAGTCTGCCCGGGCCCACCA
D00006008 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTTAGGCCCACCA
D00005950 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTTAGGCCCACCA
D00005854 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTTAGGCCCACCA
D00005980 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Ile GAT -GGGCCTATAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTTAGGCCCACCA
D00001191 Stenotrophomonas_maltophilia Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCCACCCTGATAAGGTGGAG-------------------GTCGGTAGTTCGAGTCTACCCAGACCCACCA
D00005970 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Ile GAT -GGGCGCGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGTGCCCA---
D00005951 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Ile GAT -GGGCGCGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGTGCCCA---
D00005971 Streptococcus_mutans_UA159 Ile GAT -GGGCGCGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGTGCCCA---
D00005883 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Ile GAT -GGGCGCGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGTGCCCA---
D00005881 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Ile GAT -GGGCGCGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGTGCCCA---
D00005882 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Ile GAT -GGGCGCGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGTGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGTGCCCA---
D00005952 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Ile GAT -GGGCGCGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGTGCCCA---
D00005986 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Ile GAT -GGGCGCGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGTGCCCA---
D00005991 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Ile GAT -GGGGCTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCATCCCTGATAAGGATGAG-------------------GCCACAGGTTCAAATCCTGTTAGCCCCACCA
D00005967 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Ile GAT -GGGGCTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCATCCCTGATAAGGATGAG-------------------GCCACAGGTTCAAATCCTGTTAGCCCCACCA
D00006017 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Ile GAT -GCGAGGGTAGCTCAGTA-GGCC-AGAGCACTCGGCTGATAACCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCGAATCCCGGCCCTCGCACCA
D00006018 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Ile GAT -GCGAGGGTAGCTCAGT--GGGCCAGAGCACTCGGCTGATAACCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCGAATCCCGGCCCTCGCACCA
D00006019 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Ile GAT -GCGAGGGTAGCTCAGTC-GGC--AGAGCACACGGCTGATAACCGTGAG-------------------GTCCCGAGTTCGAATCTCGGCTCTCGCACCA
D00001193 Synechococcus_elongatus_PCC_6301 Ile GAT -GGGCTATTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCCCTGGTTCAAGTCCAGGATGGCCCA---
D00001195 Synechocystis_sp. Ile GAT -GGGCTATTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCTCTGGTTCAAGTCCAGAATGGCCCA---
D00001196 Synechocystis_sp. Ile GAT -GGGCTATTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCTCTGGTTCAAGTCCAGAATGGCCCC---
D00005873 Synechocystis_sp._PCC_6803 Ile GAT -GGGCTATTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCTCTGGTTCAAGTCCAGAATGGCCCA---
D00005955 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Ile GAT -GGGCTTATAGCTCAGTT-GGTC-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGATGGTTCGAATCCATCTAAGCCCACCA
D00005953 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Ile GAT -GGGCTATTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCCCTGGTTCGAGTCCAGGATGGCCCA---
D00005874 Thermotoga_maritima_MSB8 Ile GAT -GGGCTCGTAGCTCAGTC-GGTC-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACCCGAGCCCACCA
D00006031 Thermus_thermophilus_HB27 Ile GAT -GGGCGATTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACCATCGCCCACCA
D00006032 Treponema_denticola_ATCC_35405 Ile GAT -GGGCCTGTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCACTTCTCTGATAAGGAAGGG-------------------GTCATTAGTTCAACTCTAATCAGGCCCA---
D00001144 Treponema_pallidum Ile GAT -GGGCTTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACTTCTCTGATAAGGAAGGG-------------------GTCATTAGTTCAACTCTAATCAAGCCCA---
D00005871 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Ile GAT -GGGCTTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACTTCTCTGATAAGGAAGGG-------------------GTCATTAGTTCAACTCTAATCAAGCCCA---
D00001166 Trichodesmium_sp. Ile GAT -GGGCTATTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCCCTGGTTCAAGTCCAGGATAGCCCA---
D00005981 Tropheryma_whipplei_str._Twist Ile GAT -GGGGTTATAGCTCAGAT-GGTT-AGAGCGCTTCACTGATAATGAAGAG-------------------GCCCCAGGTTCAAGTCCTGGTAACCCCA---
D00005982 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Ile GAT -GGGGTTATAGCTCAGAC-GGTT-AGAGCGCTTCACTGATAATGAAGAG-------------------GCCCCAGGTTCAAGTCCTGGTAACCCCA---
D00005856 Ureaplasma_parvum_serovar_3 Ile GAT -GGAAGTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGCCCACTTATTTCCACCA
D00005853 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGTACGCCTGATAAGCGTAAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCACTCAGACCCACCA
D00006033 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAG-------------------GTCGGAGGTTCAACTCTTCCCAGACCCACCA
D00005957 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCTCCCAGACCCACCA
D00001192 Xanthomonas_campestris Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCTCCCAGACCCACCA
D00005956 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTAGTTCGAGTCTACCCAGACCCACCA
D00005875 Xylella_fastidiosa_9a5c Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCTCCCAGACCCACCA
D00005983 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGTCCTCCCAGACCCACCA
D00006020 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGACCCACCA
D00005889 Yersinia_pestis_CO92 Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGACCCACCA
D00005960 Yersinia_pestis_KIM Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGACCCACCA
D00006021 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Ile GAT -GGGTCTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGACCCACCA
D00001197 Cyanophora_paradoxa Ile GAT -GGGCTATTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GCCCCTGGTTCGAATCCAGGATGGCCCA---
D00005919 Homo_sapiens Ile GAT -GGCCGGTTAGCTCAGTT-GGTA-AGAGCGTGGTGCTGATAACACCAAG-------------------GTCGCGGGCTCGACTCCCGCACCGGCC----
D00001326 Mantoniella_squamata Ile GAT -GGGCTATTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GTCTCTGGTTCAAGTCCAGAATAGCCCA---
D00006060 Pan_troglodytes Ile GAT -GGCCTGTTAGCTTGGTT-GGTT-AGAGCATGGTGCTGATAACACTAAG-------------------GTCACAAGTTCAATCCCCATACAGGCCA---
D00006061 Pan_troglodytes Ile GAT -GGCCGGTTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCGTGGTGCTGATAACACCAAG-------------------GTCGCGGGCTCGACTCCCGCACTGGCCA---
D00001317 Plasmodium_falciparum Ile GAT -AGGTTTTTAGTTTAAT--GGTT-AAAACATACTCTTGATAAGGGTAAA-------------------A-TTTTAGTTCAATTCTAAAAAAACCTA---
D00001198 Pylaiella_littoralis Ile GAT -GGGCTATTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAG-------------------GGCCCTGGTTCAAATCCAGGATGGCCCA---
D00005924 Arabidopsis_thaliana Ile AAT -GGCCTATTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTCGTGCTAATAACGCGAAG-------------------GTCACAGGTTCGATCCCTGTATAGGCC----
D00005925 Arabidopsis_thaliana Ile AAT -GGCCCATTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTCGTGCTAATAACGCGAAG-------------------GTCGCAGGTTCGAAACCTGCATGGGCC----
D00005928 Caenorhabditis_elegans Ile AAT -GCCGCCATAGCCCAGTC-GGTT-AGAGCGTGGGTCTAATAAGCCCAAG-------------------GTCGCAGGTTCGACCCCTGCTGGCGGC----
D00005929 Caenorhabditis_elegans Ile AAT -GCCGCCATAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCGTGGGTCTAATAAGCCCAAG-------------------GTCGCAGGTTCGACCCCTGCTGGCGGC----
D00001319 Candida_albicans Ile AAT -GGTCCCTTGGCCCAGTT-GGTT-AAGGCGTGGTGCTAATAAGTTTAATTTGTT---ACGC--CAAGAT-CAGCAGTTCGATCCTGCTAGGGACCA---
D00006024 Candida_glabrata_CBS_138 Ile AAT -GGTCTCTTGGCCCAGTT-GGTT-AAGGCACCGTGCTAATAACGCGGGG-------------------ATCAGCGGTTCGATCCCGCTAGAGACCA---
D00001323 Crithidia_fasciculata Ile AAT -GCTCTCATAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCGTGGGTCTAATAAGCCCAAG-------------------GTCACAGGTTCGACCCCTGTTGGGAGCA---
D00001328 Drosophila_melanogaster Ile AAT -GGCCCATTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTCGTGCTAATAACGCGAAG-------------------GTCGCGGGTTCGATCCCCTCATGGGCCA---
D00005937 Drosophila_melanogaster Ile AAT -GGCCCATTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTCGTGCTAATAACGCGAAG-------------------GTCGCGGGTTCGATCCCCTCATGGGCCA---
D00005958 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Ile AAT -GTTCTGGTAGCTCAGTC-GGTC-AGAGCGTCGTGCTAATAACGCGAAG-------------------GTCCAGGGTTCGAGCCCCTGTCGGAACA---
D00006040 Gallus_gallus Ile AAT -GGCCGGTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTGGTGCTAATAACGCCAAG-------------------GTCGCGGGTTCGTTCCCCGTACGGGCCA---
D00006041 Gallus_gallus Ile AAT -GGCCGGTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTGGTGCTAATAACGCCAAG-------------------GTCGCGGGTTCGATCCCCGTACGGGCCA---
D00005912 Homo_sapiens Ile AAT -GGCTGGTTAGTTCAGTT-GGTT-AGAGCGTGGTGCTAATAACGCCAAG-------------------GTCGTGGGTTCGATCCCCATATCGGCC----
D00005913 Homo_sapiens Ile AAT -GGCCGGTTAGCTCAGTC-GGCT-AGAGCGTGGTGCTAATAACGCCAAG-------------------GTCGCGGGTTCGATCCCCGTACGGGCCA---
D00005914 Homo_sapiens Ile AAT -GGCCGGTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTGGTGCTAATAACGCTAAG-------------------GTCGCGGGTTCGATACCCGTACTGGCC----
D00005915 Homo_sapiens Ile AAT -GGCCGGTTAGCTCAGTT-GGTC-AGAGCGTGGTGCTAATAACGCCAAG-------------------GTCGCGGGTTCGATCCCCGTACGGGCCA---
D00005916 Homo_sapiens Ile AAT -GGCCGGTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTGGTGCTAATAACGCCAAG-------------------GTCGCGGGTTCGATCCCCGTACGGGCCA---
D00005917 Homo_sapiens Ile AAT -GGCTGGTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTGGTGCTAATAACGCCAAG-------------------GTCGCGGGTTCGATCCCCGTACTGGCCA---
D00005918 Homo_sapiens Ile AAT -GGCCGGTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTGGTGCTAATAACGCCAAG-------------------GTCGCGGGTTCGATCCCCGTACTGGCCA---
D00001324 Leptomonas_collosoma Ile AAT -GCTCTCATAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCGTGGGTCTAATAAGCCCAAG-------------------GTCACAGGTTCGACCCCTGTTGGGAGCA---
D00001325 Leptomonas_seymouri Ile AAT -GCTCTCATAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCGTGGGTCTAATAAGCCCAAG-------------------GTCACAGGTTCGACCCCTGTTGGGAGCA---
D00001329 Mus_musculus Ile AAT -GGCCGGTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTGGTGCTAATAACGCCAAG-------------------GTCGCGGGTTCGATCCCCGTACGGGCCA---
D00006054 Pan_troglodytes Ile AAT -GGCCGGTTAGTTCAGTT-GGTT-AGAGCGTGGTGCTAATAATGCCAAG-------------------GTCGTGGCTATAAGGCCCATATCGGCCA---
D00006055 Pan_troglodytes Ile AAT -GGCCGGTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTGTTGCTAATAACGTCAAG-------------------GTCGCAGGTTCTAACCCCGTACGGGCCA---
D00006056 Pan_troglodytes Ile AAT -GGCCGGTTAGCTCAGTT-GGCT-AGAGCGTGGTGCTAATAACGCCAAG-------------------GTCGCGGGTTCGATCCCCGTACGGGCCA---
D00006057 Pan_troglodytes Ile AAT -GGCCGGTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTGGTGCTAATAACGCCAAG-------------------GTCGCGGGTTCGATCCCCGTACGGGCCA---
D00006058 Pan_troglodytes Ile AAT -GGCTGGTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTGGTGCTAATAACGCCAAG-------------------GTCGCGGGTTCGATCCCCGTACTGGCCA---
D00006059 Pan_troglodytes Ile AAT -GGCCGGTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTGGTGCTAATAACGCCAAG-------------------GTCGCGGGTTCGATCCCCGTACCGGCCA---
D00006036 Plasmodium_falciparum_3D7 Ile AAT -GGTCCTATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTACGGCTAATAACCGTAAG-------------------GTCGGCGGTTCGAGACCGCCTGGGACCA---
D00001320 Saccharomyces_cerevisiae Ile AAT -GGTCTCTTGGCCCAGTT-GGTT-AAGGCACCGTGCTAATAACGCGGGG-------------------ATCAGCGGTTCGATCCCGCTAGAGACCA---
D00005934 Saccharomyces_cerevisiae Ile AAT -GGTCTCTTGGCCCAGTT-GGTT-AAGGCACCGTGCTAATAACGCGGGG-------------------ATCAGCGGTTCGATCCCGCTAGAGACCA---
D00001322 Schizosaccharomyces_pombe Ile AAT -GGTCGCAT-ATGTAGTC-GGTT-ATCATGTCGATCTAATAAGTCGAAT-------------------GTCGCCGGTTCGAACCCGGCTGTGACCA---
D00005940 Schizosaccharomyces_pombe Ile AAT -GGTCGCATGATGTAGTC-GGTT-ATCATGTCGATCTAATAAGTCGAAT-------------------GTCGCCAGTTCGAACCTGGCTGTGACC----
D00005941 Schizosaccharomyces_pombe Ile AAT -GGTCGCATGATGTAGTC-GGTT-ATCATGTCGATCTAATAAGTCGAAT-------------------GTCGCCGGTTCGAACCCGGCTGTGACC----
D00006043 Takifugu_rubripes Ile AAT -GNNTANNNNGCTCAGAT-GGTT-AGAGCGTGGTGCTAATAACGCCAAG-------------------GTCATGGGTTCAAACCCCATACTGGCCA---
D00006044 Takifugu_rubripes Ile AAT -GGCCGGTTAGCTCAGAT-GGTT-AGAGTGTGTTGCTAATAATGCTAAG-------------------GTCATAGGTTCAACCCCCATACTGGCCA---
D00006045 Takifugu_rubripes Ile AAT -GGCCGGTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTGGTGCTAATAACGCCAAG-------------------GTCGCGGGTTCGATCCCCGTANNNNNNN---
D00006046 Takifugu_rubripes Ile AAT -GGCCGGTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGGGGTGCTAATAACGCCAAG-------------------GTCGCGGGTTCGATCCCCGTACGGGCCA---
D00006047 Takifugu_rubripes Ile AAT -GGCCGGTTAGCTCAGAT-GGTT-AGAGCGTGGTGCTAATAACGCCAAG-------------------GTCATGGGTTCAAACCCCATACTGGCCA---
D00006048 Takifugu_rubripes Ile AAT -GGCCGGTTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGTGGTGCTAATAACGCCAAG-------------------GTCGCGGGTTCGATCCCCGTACGGGCCA---
D00006049 Takifugu_rubripes Ile AAT -GGCCGGTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTGGTGCTAATAACGCCAAG-------------------GTCGCGGGTTCGATCCCCGTACGGGCCA---
D00001122 Methanococcus_vannielii Ile CAT -GGGCTCGTAGCTCAGGCTGGTT-AGAGTGCTCGGCTCATAACCGAGTG-------------------GTCATGGGTTCAAATCCCATCGGGCCCA---
D00001123 Methanothermus_fervidus Ile CAT -GGGCCCATAGCTTAGCCAGGT--AGAGCGCCCGGCTCATAACCGGGCG-------------------GTCATGGGTTCGAATCCCATTGGGCCCA---
D00001140 Acholeplasma_laidlawii Ile CAT -GGACCCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCTACCGGCTCATAACCGGTCG-------------------GTCGTTGGTTCGAGTCCAACCGGGTCCACCA
D00001184 Azoarcus_sp._BH72 Ile CAT -GGGCCTCTAGCTCATGCTTGGTTAGAGCAGCGGACTCATAATCCGTTG-------------------GTGCTGGGTTCGACTCCCAGGGGGCCCACCA
D00001156 Bacillus_subtilis Ile CAT -GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACAAGGTCCACCA
D00001164 Escherichia_coli Ile CAT -GGCCCCTTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAGGGGCCACCA
D00001188 Haemophilus_influenzae Ile CAT -CCCCCCTTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTG-------------------GTCACTGGTTCAAGTCCGGTAGGGGGGACCA
D00001128 Mycoplasma_capricolum Ile CAT -GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCATCCGGCTCATAACCGGACG-------------------GTCATTGGTTCAAGTCCAATAAGGTCCACCA
D00001131 Mycoplasma_genitalium Ile CAT -GGCTGGATACCTCAGTT-GGTT-AGAGGGCCCGGTTCATACCCGGGTT-------------------GTCGTGAGTTCGAGTCTCACTCCAGCCACCA
D00001134 Mycoplasma_mycoides Ile CAT -GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCATCCGGCTCATAACCGGACG-------------------GTCATTGGTTCAAGTCCAATAAGGTCCACCA
D00001136 Mycoplasma_pneumoniae Ile CAT -GGATCTATAGCTCAAT--GGTT-AGAGCCCCCGACTCATAATCGGTCT-------------------GTTACAGGTTCGAGTCCTGTTAGATCCACCA
D00001173 Pseudomonas_aeruginosa Ile TGC -CGGGCCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGGAGTTCGATCCTCCTTGGCTCCACCA
D00001143 Spiroplasma_melliferum Ile CAT -GGACCCTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCATCCGGCTCATAACCGGATG-------------------GTCACTGGTTCAAGTCCAGTAGGGTCCACCA
D00001150 Staphylococcus_aureus Ile CAT -GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCTAACGGCTCATAACCGTTCG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCAAGGTCCA---
D00001194 Synechocystis_sp. Ile CAT -CCAGGGTTGGCCGAGC--GGTT-GAGGCAGCGAACTCATAATTCGCCC-------------------TAGACAGGTTCAACTCCTGTACCCTGGA---
D00006675 Aeropyrum_pernix_K1 Leu CAG -GCGGGGGTGCCCGAGCCTGGCCAAAGGGGTCGGGCTCAGGACCCGATGGCG-----TAGG----CCTG-CGTGGGTTCAAATCCCACCCCCCGCACC-
D00001486 Archaeoglobus_fulgidus Leu CAG -GCGGGGGTTGCCGAGC--GGACAAAGGCGCGGGATTCAGGGTCCCGTCCCG-----TAG-----GGGTTCGAGGGTTCGAATCCCTCCCCCCGCA---
D00006680 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Leu CAG -GCGGGGGTTGCCGAGC--GGACAAAGGCGCGGGATTCAGGGTCCCGTCCCG-----TAG-----GGGTTCGAGGGTTCGAATCCCTCCCCCCGCA---
D00001489 Haloarcula_marismortui Leu CAG -GCAGGGATAGCCAAGTTTGGCCAACGGCGCAGCGTTCAGGGCGCTGTCCCG-----TAG-----GGGTCCGCAGGTTCAAATCCTGCTCCCTGCA---
D00006685 Halobacterium_sp._NRC-1 Leu CAG -GCAGGGATAGCCAAGTTTGGCCAAAGGCGCAGCGTTCAGGGCGCTGTCCCG-----TAG-----GGGTTCGCAGGTTCAAATCCTGCTCCCTGCA---
D00011893 Methanosarcina_acetivorans_C2A Leu CAG -GCGAGAGTTGCCCAGCCAGGTCAAAGGCGCCAGGTTCAGAGCCTGGTCTTG-----TAG-----GAGTTCGTGCGTTCGAATCGCACCTCTCGCA---
D00006833 Methanosarcina_mazei_Go1 Leu CAG -GCGAGAGTTGCCCAGCCAGGTCAAAGGCGCCAGGTTCAGAGCCTGGTCTTG-----TAG-----GAGTTCGTGCGTTCGAATCGCACCTCTCGCA---
D00011972 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Leu CAG -GCGAGGATCGCCGAGCCAGGTCAAAGGCGTTAGGTTCAGGGCCTAATCCCG-----TAG-----GGGTTCGCCGGTTCAAATCCGGCTCCTCGCA---
D00006700 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Leu CAG -GCGGGGGTGCCCGAGCCAGGTCAAAGGGGCAGGGTTCAGGTCCCTGTGGCG-----TAGG----CCTG-CGTGGGTTCAAATCCCACCCCCCGCACCA
D00006705 Pyrococcus_abyssi_GE5 Leu CAG -GCGGGGGTTGCCGAGCCTGGTCAAAGGCGCGGGATTCAGGGTCCCGTCCCG-----TAG-----GGGTTCCGGGGTTCAAATCCCCGCCCCCGCACC-
D00006710 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Leu CAG -GCGGGGGTTGCCGAGCCTGGTCAAAGGCGCGGGATTCAGGGTCCCGTCCCG-----TAG-----GGGTTCCGGGGTTCAAATCCCCGCCCCCGCACC-
D00006715 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Leu CAG -GCGGGGGTTGCCGAGCCTGGTCAAAGGCGCGGGATTCAGGGTCCCGTCCCG-----TAG-----GGGTTCCGGGGTTCAAATCCCCGCCCCCGCACCA
D00012014 Staphylothermus_marinus_F1 Leu CAG -GCGGGGGTGCCCGAGCATGGTCAAAGGGGTCGGGCTCAGGACCCGATGGCG-----TAGG----CCTG-CGTGGGTTCAAATCCCACCCCCCGCACCA
D00012061 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Leu CAG -GCGGGGGTGCCCGAGCAAGGTCAAAGGGGTCGGGCTCAGGCCCCGATGGTG-----TAGG----CCTG-CGTGGGTTCAAATCCCACCCCCCGCA---
D00001496 Sulfolobus_solfataricus Leu CAG -GCGGGGGTGCCCGAGCAAGGTCAAAGGGGTCGGGCTCAGGCCCCGATGGTG-----TAGG----CCTG-CGTGGGTTCAAATCCCACCCCCCGCA---
D00006720 Sulfolobus_solfataricus_P2 Leu CAG -GCGGGGGTGCCCGAGCTAGGTCGAAGGGGGTAGGCTCAGGCCCTACTGGTG-----AAGG----CCTT-CGCGGGTTCAAATCCCGCCCCCCGC----
D00006869 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Leu CAG -GCGGGGGTGCCCGAGCAAGGTCAAAGGGGTCGGGCTCAGGCCCCGATGGCA-----TAG-----GCCTGCGTGGGTTCAAGTCCCACCCCCCGCA---
D00006725 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Leu CAG -GCGGAGGTTGTCGAGACTGGCCAAAGGCGATGGATTCAGGGTCCATTCCCG-----AAG-----GGGTTCGAGGGTTCAAATCCCTCCCTCCGCA---
D00006730 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Leu CAG -GCGGAGGTTGTCGAGACTGGCCAAAGGCGATGGATTCAGGGTCCATTCCC------GCAG-----GGTTCGAGGGTTCAAATCCCTCCCTCCGCA---
D00001498 Thermoproteus_tenax Leu CAG -GCGGGGGTGCCCGAGCCAGGTA-AAGGGGCAGGGTTCAGGTCCCTGTGGCG-----TAGG----CCTG-CGTGGGTTCAAATCCCACCCCCCGCA---
D00001541 Aeromonas_hydrophila Leu CAG -GCGAAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGCCC-----CCC-----GGGTGTGAGGGTTCGAGTCCCTCTCTTCGCACCA
D00006658 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Leu CAG -GCCCAGATGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCCAGCTTCAGGTGCTGGTACTC-----GAAA----GGGTGTGGAGGTTCGAGTCCTCTTCTGGGCACCA
D00006581 Aquifex_aeolicus_VF5 Leu CAG -GCGGGTGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCGCCGGACTCAGGATCCGGTGCCC-----GCAA----GGGCGTGCGGGTTCGACTCCCGCCACCCGCACCA
D00001527 Bacillus_subtilis Leu CAG -GCGGATGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCGCTAGAATCAGGCTCTAGTGTCT-----TTAC----AGACGTGGGGGTTCAAGTCCCTTCATCCGCACCA
D00006448 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Leu CAG -GCGGATGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCGCTAGAATCAGGCTCTAGTGTCT-----TTAC----AGACGTGGGGGTTCAAGTCCCTTCATCCGCACCA
D00007055 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Leu CAG -GCCCAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCACGTTTCAGGTGCGTGTGTC------GAGA-----GGCATGCAGGTTCGAGTCCTGTTCTGGGCA---
D00007073 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Leu CAG -GCCCAGATGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCAGGTTTCAGGTACCTGTGCC------GCAA-----GGCGTGGAGGTTCGAGTCCTCTTTTGGGCACCA
D00007225 Bartonella_quintana_str._Toulouse Leu CAG -GCCCAGATGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCAGGTTTCAGGTACCTGTGCC------GTAA-----GGCGTGGAGGTTCGAGTCCTCTTTTGGGCACCA
D00007078 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Leu CAG -GCGCGGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCAGGTCTCAGAAGCCTGTGGGA-----GAAA----TCCTGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCTCGCGCACCA
D00006903 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Leu CAG -GCGAGTGTGGCGGAAT--GGTA-GACGCGCTGTCTTCAGGTGGCAGTGAGT-----GTAT----GCTCGTGGGGGTTCAACTCCCCCCACTCGCACCA
D00001544 Bordetella_pertussis Leu CAG -GCCCAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCATGGTTCAGGTCCATGTGCC------GCAA-----GGTGTGGAGGTTCGAGTCCTCTCCTGGGCACCA
D00006961 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Leu CAG -GCCCAGGTGGTGGAATT-GGTA-GACGCGCTGGCTTCAGGTGCCAGTGGCT-----TAAC----GGCCGTGAAGGTTCGAGTCCTTTCCTGGGCACCA
D00006625 Brucella_melitensis_16M Leu CAG -GCCCAGATGGCGGAATT-GGTA-GACGCACCAGCTTCAGGTGCTGGCGCTC-----GCAA----GGGCGTGGAGGTTCGAGTCCTCTTCTGGGCACCA
D00006908 Brucella_suis_1330 Leu CAG -GCCCAGATGGCGGAATT-GGTA-GACGCACCAGCTTCAGGTGCTGGCGCTC-----GCAA----GGGCGTGGAGGTTCGAGTCCTCTTCTGGGCACCA
D00007230 Candidatus_Blochmannia_floridanus Leu CAG -GCGAAGGTGGCGAAATA-GGTA-GACGCACTAGCTTCAGGGGTTAGTGTCTTG---TAT---GTAGACGTAAGGGTTCAAATCCCTTCCTTCGTA---
D00007094 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Leu CAG -GCGGCCATGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGATTCAGGTTCTAGTCGGG-----GTAA----CTCGGTGGATGTTCGAGTCATCTTGGCCGCA---
D00006534 Caulobacter_crescentus_CB15 Leu CAG -GCCCAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTGGCTTCAGGTGCCAGTGACC-----GAAA----GGTCGTGGAGGTTCGAGTCCTCTCCTGGGCACCA
D00006603 Chlamydia_muridarum_Nigg Leu CAG -GCAGCTATGGCGGAACC-GGTA-GACGCGCTAGATTCAGGTTCTAGTGAGC-----TTTT----GCTCATGGAAGTTCAAGTCTTCTTAGCTGCA---
D00006443 Chlamydia_trachomatis Leu CAG -GCAGCTATGGCGAAATC-GGTA-GACGCGCTAGATTCAGGTTCTAGTGAGC-----TTAT----GCTCATGGAAGTTCAAGTCTTCTTAGCTGC----
D00006438 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Leu CAG -GCAGCTATGGCGGAACC-GGTA-GACGCGCTAGATTCAGGTTCTAGTGAGC-----TTTT----GCTCATGGAAGTTCAAGTCTTCTTAGCTGCA---
D00006428 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Leu CAG -GCAGCTATGGCGAAATC-GGTA-GACGCGCTAGATTCAGGTTCTAGTGAGC-----TTAT----GCTCATGGAAGTTCAAGTCTTCTTAGCTGCA---
D00006433 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Leu CAG -GCAGCTATGGCGAAATC-GGTA-GACGCGCTAGATTCAGGTTCTAGTGAGC-----TTAT----GCTCATGGAAGTTCAAGTCTTCTTAGCTGCA---
D00006493 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Leu CAG -GCAGCTATGGCGAAATC-GGTA-GACGCGCTAGATTCAGGTTCTAGTGAGC-----TTAT----GCTCATGGAAGTTCAAGTCTTCTTAGCTGCA---
D00006828 Chlorobium_tepidum_TLS Leu CAG -GCCCGAATGGCGGAACT-GGTA-GACGCACTCGTTTCAGGGGCGAGCGCC------GAGA-----GGTGTAGGAGTTCGAATCTCCTTTCGGGCACCA
D00006612 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Leu CAG -GCGGATATGGCGGAATT-GGCA-TACGCGCTAGTTTCAGGTACTAGTGA-------GAAA------TCATGCAGGTTCGAATCCTGTTATCCGCACCA
D00007080 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Leu CAG -GCCCAGGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCGCTGGCTTCAGGTGCCAGTGTTC-----GCAA----GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCTGGGCA---
D00006912 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Leu CAG -GCCCGGGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTGGCTTCAGGTGCCAGTGTCC-----GCAA----GGGCGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCGGGCA---
D00006844 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Leu CAG -GCCCGGGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCGCTGGCTTCAGGTGCCAGTGTTC-----GCAA----GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCGGGCACCA
D00007012 Coxiella_burnetii_RSA_493 Leu CAG -GCCGAGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCAAGTTTCAGGTACTTGTGGGGG----AAA----CCCCG-TGGAGGTTCAAGTCCTCTCCTCGGCA---
D00006539 Deinococcus_radiodurans_R1 Leu CAG -GCCGAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCACTAGTTTCAGGGACTAGCGCC------GCGA-----GGTGTGTGGGTTCAAATCCCATCCTCGGCACCA
D00007177 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Leu CAG -GCCGAAGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTAGGTTCAGGGTCTAGTTGGG-----GTTC----CCCAGTGGGAGTTCGAGTCTCCCCTTCGGCACCA
D00001533 Escherichia_coli Leu CAG -GCGAAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCC-----TTAC----GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCA
D00007026 Escherichia_coli_CFT073 Leu CAG -GCGAAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCC-----TTAC----GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCA
D00007028 Escherichia_coli_CFT073 Leu CAG -GCGAAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTC-----TTAC----GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCA
D00006498 Escherichia_coli_K12 Leu CAG -GCGAAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTC-----TTAC----GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCA
D00006499 Escherichia_coli_K12 Leu CAG -GCGAAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCC-----TTAC----GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCA
D00006504 Escherichia_coli_O157:H7 Leu CAG -GCGAAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCC-----TTAC----GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCA
D00006509 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Leu CAG -GCGAAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCC-----TTAC----GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCA
D00007125 Geobacter_sulfurreducens_PCA Leu CAG -GCCGAAGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCAAGATTCAGGATCTTGTGCGG-----GCAA----CCGTGTGCTGGTTCGAGTCCAGTCTTCGGCACCA
D00007130 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Leu CAG -GCCTCAATGGCGGAATT-GGCA-GACGCGCAGCGTTCAGGTCGCTGTTCAC-----GCAA----GTGAGTGCAGGTTCGACTCCTGTTTGAGGCA---
D00006978 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Leu CAG -GCCCCAGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCGCAGCGTTCAGGTCGCTGTATTG-----GAAA----CAATGTACAGGTTCGAATCCTGCCTGGGGCA---
D00007135 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Leu CAG -GCGCGAGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCGCTGGCTTCAGGTGCCAGTGCCC-----GCAA----GGGCGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCTCGCGCA---
D00006921 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Leu CAG -GCCGAAGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCACTGGCTTCAGGTGCCAGCGACC-----GCAA----GGTTGTGGGGGTTCGAGTCCCTTCTTCGGCA---
D00006630 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Leu CAG -GCCCAGATGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCACGGTTCAGGTCCGTGTTCC------GCAA-----GGAGTGGAGGTTCGAGTCCTCTTCTGGGCACCA
D00007001 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Leu CAG -GGGCGAGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTGGCTTCAGGTGCCAGTGTCC-----TTCG----GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCTTCGCCCA---
D00001539 Mycobacterium_leprae Leu CAG -GGGCGAGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTGGCTTCAGGTGCCAGTGTCC-----CTCG----GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCTTCGCCCA---
D00006485 Mycobacterium_leprae_TN Leu CAG -GGGCGAGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTGGCTTCAGGTGCCAGTGTCC-----CTCG----GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCTTCGCCCA---
D00006458 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Leu CAG -GGGCGAGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTGGCTTCAGGTGCCAGTGTCC-----TTCG----GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCTTCGCCCA---
D00007089 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Leu CAG -GGGCGAGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTGGCTTCAGGTGCCAGTGTCC-----TTCG----GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCTTCGCCCA---
D00006463 Neisseria_meningitidis_MC58 Leu CAG -GCCCGGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGCTAGTATCC-----TCAC----GGGTGTGGAAGTTCGAGTCTTCTCCCGGGCACCA
D00006464 Neisseria_meningitidis_MC58 Leu CAG -GCCCGGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCCAGCTTCAGGTGCTGGTATCC-----TCAT----GGGTGTGGAAGTTCGAGTCTTCTCCCGGGCACCA
D00006467 Neisseria_meningitidis_Z2491 Leu CAG -GCCCGGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGCTAGTATCC-----TCAC----GGGTGTGGAAGTTCGAGTCTTCTCCCGGGCACCA
D00006468 Neisseria_meningitidis_Z2491 Leu CAG -GCCCGGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCCAGCTTCAGGTGCTGGTATCC-----TCAC----GGGTGTGGAAGTTCGAGTCTTCTCCCGGGCACCA
D00007052 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Leu CAG -GCCCAGATGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCATGGTTCAGGTCCATGTGCC------TTCG-----GGTGTGGAGGTTCGAGTCCTCTTCTGGGCACCA
D00006651 Nostoc_sp._PCC_7120 Leu CAG -GCGGAACTGGCGGAATT-GGCA-GACGCGCTAGATTCAGGTTCTAGTGCC------GCAA-----GGCTTCCGGGTTCAAGTCCCGGGTTCCGCA---
D00007101 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Leu CAG -GCGAGGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCC-----TTAC----TGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCTTCGCACCA
D00007102 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Leu CAG -GCGAGGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCC-----TTAC----GGACGTGAGGGTTCAAGTCCCTCCTTTCGCACCA
D00007105 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Leu CAG -GCGAGGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCC-----TTAC----GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCTTTCGCACCA
D00007144 Porphyromonas_gingivalis_W83 Leu CAG -GCCCGGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTCGTTTCAGGTGCGAGTGTTC-----AAA-----AGACGTGCAGGTTCGATTCCTGTCCCGGGCA---
D00007193 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Leu CAG -GCGCGAGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTGGCTTCAGGTGCCAGTGTCC-----CTTG----GGACGTGGAGGTTCAACTCCTCTCTCGCGCA---
D00006560 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Leu CAG -GCCCAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCACTAGGTTCAGGTCCTAGCGGTG-----GCAA----CACCGTGGAAGTTCGAGTCTTCTCCTGGGCACCA
D00007064 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Leu CAG -GCCCAGATGGTGAAATT-GGTA-GACACGCCAGCTTCAGGTGCTGGTGACC-----GCAA----GGTCGTGGAAGTTCGAGTCTTCTTCTGGGCACCA
D00006642 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Leu CAG -GCCCAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCACTAGTTTCAGGTACTAGCGGG------TAAC-----TCCGTGGAGGTTCGAGTCCTCTCCTGGGCACCA
D00007042 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Leu CAG -GCGGATGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCGCTAGACTCAGGATCTAGTGCCCG----ATA----AGGGCGTGGAGGTTCGAATCCTCTCATCCGTA---
D00007047 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Leu CAG -AGCCAAGTGGTGGAACT-GGTA-GACACGCGACACTCAGAATGTCGTGCCC-----ACAG----CGGCGTGCGAGTTCAACTCTCGCCTTGGCTA---
D00007106 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Leu CAG -GCCCAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTGGTTTCAGGTACCAGTGGGT-----AAC-----ACCG-TGGAGGTTCGAGTCCTCTCCTGGGCACCA
D00006666 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Leu CAG -GCGAAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCC-----TTAC----GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCA
D00006668 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Leu CAG -GCGAAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTC-----TTAC----GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCA
D00007037 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Leu CAG -GCGAAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCC-----TTAC----GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCA
D00007039 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Leu CAG -GCGAAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTC-----TTAC----GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCA
D00001538 Salmonella_typhimurium Leu CAG -GCGAAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCC-----TTAC----GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCA
D00006640 Salmonella_typhimurium_LT2 Leu CAG -GCGAAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCC-----TTAC----GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCA
D00006934 Shewanella_oneidensis_MR-1 Leu CAG -GCAGGTGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCCAGCTTCAGGTGCTGGTGCCC-----TTGC----GGGCGTGGAGGTTCAAGTCCTCTCACCTGTACCA
D00006935 Shewanella_oneidensis_MR-1 Leu CAG -GCAGATGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCCAGCTTCAGGTGCTGGTGCCC-----TTGC----GGGCGTGGAGGTTCAAGTCCTCTCATCTGTACCA
D00006942 Shigella_flexneri_2a_str._301 Leu CAG -GCGAAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCC-----TTAC----GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCA
D00001542 Sinorhizobium_meliloti Leu CAG -GCCCAGATGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCCAGCTTCAGGTGCTGGTACTC-----GAAA----GGGTGTGGAGGTTCGAGTCCTCTTCTGGGCACCA
D00006669 Sinorhizobium_meliloti_1021 Leu CAG -GCCCAGATGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCCAGCTTCAGGTGCTGGTACTC-----GAAA----GGGTGTGGAGGTTCGAGTCCTCTTCTGGGCACCA
D00006950 Streptococcus_mutans_UA159 Leu CAG -GCGGAGATGGTGGAAC--GGCA-GACACGCATGCTTCAGGCGCATGTGCTC-----GTAT----GAGCGTGAGGGTTCAAATCCCTTTCTCCGCA---
D00007031 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Leu CAG -GCGCGGGTGGCGGAATA-GGCA-GACGCGCTGGATTCAGGTTCCAGTGCCC-----GCAA----GGGCGTGGGGGTTCAACTCCCCCCTCGCGCA---
D00006928 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Leu CAG -GCGCGGGTGGCGGAATA-GGCA-GACGCGCTGGATTCAGGTTCCAGTGCCC-----GCAA----GGGCGTGGGGGTTCAACTCCCCCCTCGCGCACCA
D00007148 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Leu CAG -GCAGATGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCGCACGGCTCAGGACCGTGTCGGGTA---ACCA--CTCCCGGTGGGAGTTCGAGTCTCCCCATCTGCACCA
D00001554 Synechocystis_sp. Leu CAG -GCGGAACTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGATTCAGGTTCTAGTGTTC-----GTAA----GGACTTCCGGGTTCAAGTCCCGGGTTCCGCA---
D00006566 Synechocystis_sp._PCC_6803 Leu CAG -GCGGAACTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGATTCAGGTTCTAGTGTTC-----GTAA----GGACTTCCGGGTTCAAGTCCCGGGTTCCGCA---
D00006872 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Leu CAG -GCGGGAGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCGCTAGATTCAGGTTCTAGTGCCC-----GAAA----GGGCTTATGGGTTCAAGTCCCGTCTCCCGCACCA
D00006867 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Leu CAG -GCGGAACTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGATTCAGGTTCTAGTGTCC-----GCAA----GGACTTCGGGGTTCAAGTCCCCGGTTCCGCA---
D00006571 Thermotoga_maritima_MSB8 Leu CAG -GCCGAGGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCGCATGACTCAGGATCATGTGGGGG----TTT----CCCCG-TGCGGGTTCAAGTCCCGCCCTCGGCACCA
D00007197 Thermus_thermophilus_HB27 Leu CAG TGCCGGGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCATGATTCAGGGTCATGTGCCC-----GCAA----GGGCGTGCGGGTTCAAGTCCCGCCCCCGGCACCA
D00007199 Treponema_denticola_ATCC_35405 Leu CAG -GCCCCGATGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTAGTTTCAGGTACTAGTGCT------TAAC-----GGCATGGGGGTTCAAGTCCCCCTCAGGGCA---
D00001514 Treponema_pallidum Leu CAG -GCCTCGATGGTGGAATT-GGCA-GACACGCTAGCTTCAGGTGCTAGTGCCT-----TCAC----CGGCGTGGGAGTTCAAGTCTCCCTCGAGGCA---
D00006555 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Leu CAG -GCCTCGATGGTGGAATT-GGCA-GACACGCTAGCTTCAGGTGCTAGTGCCT-----TCAC----CGGCGTGGGAGTTCAAGTCTCCCTCGAGGCA---
D00006986 Tropheryma_whipplei_str._Twist Leu CAG -GCGCGAGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCACGGTTCAGGTCCGTGTGTCT-----GCGA----AGACATGGGGGTTCAAGTCCCCCCTCGCGCA---
D00006991 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Leu CAG -GCGCGAGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCACGGTTCAGGTCCGTGTGTCT-----GCGA----AGACATGGGGGTTCAAGTCCCCCCTCGCGCA---
D00006473 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Leu CAG -GCGGTGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCC-----TTC-----GGACGTGAGGGTTCAAGTCCCTCCTTCCGCACCA
D00006474 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Leu CAG -GCGGTGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCC-----TTA-----GGACGTGAGGGTTCAAGTCCCTCCTTCCGCACCA
D00007208 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Leu CAG -GCCCGGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGCTAGTAACTT----TTT----AAGTTGTGGAAGTTCAAGTCTTCTCTCGGGCA---
D00006884 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Leu CAG -GCCCAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCACTAGCTTCAGGTGCTAGCGGGGG----CAA----CTTCG-TGGAGGTTCGAGTCCTCTCCTGGGCACCA
D00006885 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Leu CAG -GCCCAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCACTAGCTTCAGGTGCTAGCGGGGG----CAA----CTTCG-TGGAGGTTCGAGTCCTCTTCTGGGCACCA
D00006878 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Leu CAG -GCCCAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCACTAGCTTCAGGTGCTAGCGGGGG----CAA----CTTCG-TGGAGGTTCGAGTCCTCTCCTGGGCACCA
D00006879 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Leu CAG -GCCCAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCACTAGCTTCAGGTGCTAGCGGGGG----CAA----CTTCG-TGGAGGTTCGAGTCCTCTTCTGGGCACCA
D00006576 Xylella_fastidiosa_9a5c Leu CAG -GCCCAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCACTAGTTTCAGGTACTAGCGGGT-----AAA-----ACCG-TGGAGGTTCGAGTCCTCTCTTGGGCACCA
D00006995 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Leu CAG -GCCCAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCACTAGTTTCAGGTACTAGCGGGT-----AAA-----ACCG-TGGAGGTTCGAGTCCTCTCTTGGGCACCA
D00007158 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Leu CAG -GCGATGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCC-----TTAC----GGACGTGAGGGTTCAAGTCCCTCCCTTCGCACCA
D00007159 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Leu CAG -GCGATGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTC-----TTAC----GGACGTGAGGGTTCAAGTCCCTCCCTTCGCACCA
D00006631 Yersinia_pestis_CO92 Leu CAG -GCGATGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTC-----TTAC----GGACGTGAGGGTTCAAGTCCCTCCCTTCGCACCA
D00006636 Yersinia_pestis_CO92 Leu CAG -GCGATGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCC-----TTAC----GGACGTGAGGGTTCAAGTCCCTCCCTTCGCACCA
D00006894 Yersinia_pestis_KIM Leu CAG -GCGATGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCC-----TTAC----GGACGTGAGGGTTCAAGTCCCTCCCTTCGCACCA
D00006899 Yersinia_pestis_KIM Leu CAG -GCGATGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTC-----TTAC----GGACGTGAGGGTTCAAGTCCCTCCCTTCGCACCA
D00007160 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Leu CAG -GCGATGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCC-----TTAC----GGACGTGAGGGTTCAAGTCCCTCCCTTCGCACCA
D00007163 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Leu CAG -GCGATGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTC-----TTAC----GGACGTGAGGGTTCAAGTCCCTCCCTTCGCACCA
D00006768 Arabidopsis_thaliana Leu CAG -GTCAAGATGGCCGAGTT-GGTCTAAGGCGCCAGTTTCAGGTACTGGTCC-------GAAA------GGGCGTGGGTTCAAATCCCACTCTTGAC----
D00001764 Caenorhabditis_elegans Leu CAG -GCCGTTCTGGCCGAGT--GGTCTAAGGCGCTGCGTTCAGGTCGCAGTCCTC-----TCCG----GAGGGCGCAGGTTCGAATCCTGCGGACGGCA---
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D00006791 Caenorhabditis_elegans Leu CAG -GCCGTTCTGGCCGAGT--GGTCTAAGGCGCTGCGTTCAGGTCGCAGTCCTC-----TCCG----GAGGGCGCAGGTTCGAATCCTGCGGACGGCA---
D00001753 Candida_albicans Leu CAG -GAUACGAUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRAAGGAUGCAGKPPCCUUUGGGC-----AUU-----GCCCG?GCAGGTPCG"ACCCUGCUCGUGUCGCCA
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D00001758 Clavispora_lusitaniae Leu CAG -GATGTGGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTGAGGTGCAGGTCCTCATGAGC-----TCT-----GCTCTCGCAGGTTCGAATCCTGTCCACGTCG---
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D00006810 Drosophila_melanogaster Leu CAG -GTCAGGATGGCCGAGT--GGTCTAAGGCGCTGCGTTCAGGTCGCAGTCTAC-----TCT-----GTAGGCGTGGGTTCGAATCCCACTTCTGACA---
D00006892 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Leu CAG -GTCAGGATGGCCGAGT--GGTCTAAGGCGGTACGTTCAGGTCGTATTCTC------ATT------GAGGCACGGGTTCGAATCCCGTTTCTGACA---
D00007238 Gallus_gallus Leu CAG -GTCAGGATGGCCGAGC--GGTCTAAGGCGCTGTGTTCAGGTCGCAGTCTCC-----CCT-----GGAGAAGGGTGTTTGAATCCCCCCTTTGACA---
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D00001775 Rattus_norvegicus Leu CAG -GTCAGGATGGCCGAGC--GGTCTAAGGCGCTGCGTTCAGGTCGCAGTCTCC-----CCT-----GGAGGCGTGGGTTCGAATCCCACTCCTGACA---
D00006819 Schizosaccharomyces_pombe Leu CAG -GGCGAAGTGGCCGAGT--GGTCTATGGCGCTAGCTTCAGGTGCTAGTCTAC-----GTAT----GTGGGCGTGGGTTCGAACCCCACCTTCGTC----
D00007252 Takifugu_rubripes Leu CAG -GTCAGGATGCCCGAGT--GTTCCAAGGCCCTGTGTTCAGTTCGCAGTCTCC-----TCCT----GGAGGCATGGGTTCAAATCCCACTTCTGCCT---
D00007253 Takifugu_rubripes Leu CAG -GTCAGGATGGCCGAGC--GGTT-AAGGCGCTGCGTTCAGTTCGCAGTCTCC-----TCT-----GGAGGCGTTGGTTCGGATCCCACTTCTGACA---
D00007254 Takifugu_rubripes Leu CAG -GTCAGGATGGCCGAGC--GGTCCAAGGCGCTGCGGTCAGGTCGCAGTCTCT-----CTG-----AGAGGCGTGGGTTCGAATCCCACTTCTGACA---
D00007255 Takifugu_rubripes Leu CAG -GTCAGGATGGCCGAGC--GGTCGAAGGCGCTGTGGTCAGGTCGCAGTCTCC-----ACT-----GGAGGCGTGGGTTCGAATCCCACTTCTGACA---
D00007256 Takifugu_rubripes Leu CAG -GTCAGAATGGCCGAGC--GGTCCAAGGCGCTGCGTCCAGGTTGCAGTCTCC-----TCT-----GGAGGCGTGGGTTCGAATCCCACTTCTGACA---
D00007257 Takifugu_rubripes Leu CAG -GTCAGGATGGCCGAGC--GNCT-AAGGCGCTGCGTTCAGGTCGCAGTCTCC-----TCT-----GGAGGCGTGGGTTCGAATCCCACTTCTGACA---
D00001771 Xenopus_laevis Leu CAG -GTCAGGATGGCCGAGC--GGTCTAAGGCGCTGCGTTCAGGTCGCAGTCTCC-----CCT-----GGAGGCGTGGGTTCGAATCCCACTTCTGACA---
D00006678 Aeropyrum_pernix_K1 Leu TAG -GCGGGGGTGCCCGAGCCTGGCCAAAGGGGTCGGGCTTAGGACCCGATGGCG-----TAGG----CCTG-CGTGGGTTCAAATCCCACCCCCCGCACC-
D00001484 Archaeoglobus_fulgidus Leu TAG -GCGGGGGTTGCCGAGC--GGCCAAAGGCGCTGGATTTAGGGTCCAGTCCCG-----TAG-----GGGTTCGAGGGTTCGAATCCCTCCCCCCGCA---
D00006683 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Leu TAG -GCGGGGGTTGCCGAGC--GGCCAAAGGCGCTGGATTTAGGGTCCAGTCCCG-----TAG-----GGGTTCGAGGGTTCGAATCCCTCCCCCCGCA---
D00006688 Halobacterium_sp._NRC-1 Leu TAG -GCGCGGGTAGCCAAGCCAGGAA-ACGGCGTAGCGCTTAGGACGCTATCCCG-----TAG-----GGGTCCGCCGGTTCAAATCCGGTCCCGCGCA---
D00001490 Methanocaldococcus_jannaschii Leu TAG -GCAGGGGTCGCCAAGCCTGGCCAAAGGCGCTGGGCCTAGGACCCAGTCCCG-----TAG-----GGGTTCCAGGGTTCAAATCCCTGCCCCTGCA---
D00006694 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Leu TAG -GCAGGGGTCGCCAAGCCTGGCCAAAGGCGCTGGGCCTAGGACCCAGTCCCG-----TAG-----GGGTTCCAGGGTTCAAATCCCTGCCCCTGCACC-
D00011857 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Leu TAG -GCAGGGGTTGTCGAGCCTGGCCAAAGACGCAGGACTTAGAATCCTGTCCTA-----TAG-----TGGTTCCAGGGTTCAAATCCCTGCCCCTGCA---
D00006697 Methanococcus_maripaludis Leu TAG -GCAGGGGTTGTCGAGCCTGGCCAAAGATGCAGGACTTAGAATCCTGTCCAG-----TAG-----TGGTTCCAGGGTTCAAATCCCTGCCCCTGCA---
D00006698 Methanococcus_maripaludis Leu TAG -GCAGGGGTTGTCGAGCCTGGCCAAAGATGCAGGACTTAGAATCCTGTCCAG-----TAG-----TGGTTCCAGGGTTCAAATCCCTGCCCCTGCA---
D00001493 Methanococcus_vannielii Leu TAG -GCAGGGGTTGTCGAGCCTGGCCAAAGATGCAGGACTTAGAATCCTGTCCAG-----TAG-----TGGTTCCAGGGTTCAAATCCCTGCCCCTGCA---
D00006902 Methanopyrus_kandleri_AV19 Leu TAG -GCGGGGGCGCCCGAGCCTGGTCAAAGGGGCGGGACTTAGGATCCCGTGGCCG----TAG----GGCCGTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCCCCGCACCA
D00011907 Methanosarcina_acetivorans_C2A Leu TAG -GCGAGGGTTGCCCAGCTAGGTCAAAGGCGATGGGCTTAGGACCCATTTTCG-----TAG-----GAATTCGTGCGTTCGAATCGCACCCCTCGCA---
D00006837 Methanosarcina_mazei_Go1 Leu TAG -GCGAGGGTTGCCCAGCCAGGTCAAAGGCGATGGGCTTAGGACCCATTTTCG-----TAG-----GAATTCGTGCGTTCGAATCGCACCCCTCGCA---
D00011947 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Leu TAG -GCGAGGATTGCCGAGCCAGGTCAAAGGCGACGGATTTAGGGTCCGTTCCCG-----AAG-----GGGTCCGGGTGTTCAAATCGCCCTCCTCGCA---
D00006691 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Leu TAG -GCGGGGGTGCCCGAGCT-GGCCAAAGGGGACAGGCTTAGGACCTGTTGGCG-----TAGG----CCTA-CCAGGGTTCGAATCCCTGCCCCCGCA---
D00001494 Methanothermus_fervidus Leu TAG -GCGGGGGTGCCCGAGT--GGTCAAAGGGGACAGGCTTAGGACCTGTTGGCG-----TTA-----GGCTTCCAGGGTTCGAATCCCTGCCCCCGCA---
D00011978 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Leu TAG -GCGGCCGTGCCCGAGC--GGTCGAAGGGGTCGGGCTTAGGACCCGATGGGT-----TAGT----CCCGTCCGGGGTTCGAATCCCCGCGGCCGCA---
D00006703 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Leu TAG -GCGGGGGTGCCCGAGCCAGGTCAAAGGGGCAGGGTTTAGGTCCCTGTGGCG-----TAGG----CCTG-CGTGGGTTCAAATCCCACCCCCCGCACCA
D00006708 Pyrococcus_abyssi_GE5 Leu TAG -GCGGGGGTTGCCGAGCCTGGCCAAAGGCGCGGGATTTAGGGTCCCGTCCCG-----TAG-----GGGTTCCGGGGTTCAAATCCCCGCCCCCGCACC-
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D00006718 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Leu TAG -GCGGGGGTTGCCGAGCCTGGTCAAAGGCGCGGGATTTAGGGTCCCGTCCCG-----TAG-----GGGTTCCGGGGTTCAAATCCCCGCCCCCGCACCA
D00012053 Staphylothermus_marinus_F1 Leu TAG -GCGGGGGTGCCCGAGCCTGGTCAAAGGGGTCGGGCTTAGGACCCGATGGCG-----TAGG----CCTG-CGTGGGTTCAAATCCCACCCCCCGCACCA
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D00006723 Sulfolobus_solfataricus_P2 Leu TAG -GCGGGGGTGCCCGAGCTAGGTCAAAGGGGGCAGGCTTAGGCCCTGCTGGCG-----AAGG----CCTG-CACGGGTTCAAATCCCGTCCCCCGC----
D00006871 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Leu TAG -GCGGGGGTGCCCGAGCAAGGTCAAAGGGGTCGGGCTTAGGCCCCGATGGCA-----TAG-----GCCTGCGTGGGTTCAAGTCCCACCCCCCGCA---
D00006728 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Leu TAG -GCGGAGGTTGTCGAGACTGGCCAAAGGCGATGGATTTAGGGTCCATTCCCG-----AAG-----GGGTTCGAGGGTTCAAATCCCTCCCTCCGCA---
D00006733 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Leu TAG -GCGGAGGTTGTCGAGACTGGCCAAAGGCGATGGATTTAGGGTCCATTCCCG-----CAG-----GGTTTCGAGGGTTCAAATCCCTCCCTCCGCA---
D00001508 Acholeplasma_laidlawii Leu TAG -GCGGGTGTGGCGAAATT-GGCA-GACGCACTAGACTTAGGATCTAGCGCT------TTAC-----GGCATGCAGGTTCAAGTCCTGTCACCCGCACCA
D00007212 Acinetobacter_sp._ADP1 Leu TAG -GGGGGCGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCACTGGATTTAGGTTCCAGCGCC------GCAA-----GGTGTAAGAGTTCGAGTCTCTTCGCCCCCACCA
D00006662 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Leu TAG --CGGGTATGGCGGAATT-GGTA-GACGCATTGGTTTTAGGTACCAACGC-------TTCG------GCGTGGGAGTTCGAGTCTCTCTACCCGCACCA
D00006584 Aquifex_aeolicus_VF5 Leu TAG -GCGGGTGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCGCCGGACTTAGGATCCGGTGCCC-----GTAA----GGGCGTGCGGGTTCGACTCCCGCCACCCGCACCA
D00007067 Bacillus_anthracis_str._Ames Leu TAG -GCGGGTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCACTAGACTTAGGATCTAGCGCC------TTT------GGCGTGGGGGTTCGACTCCCTTCACCCGCA---
D00007069 Bacillus_anthracis_str._Ames Leu TAG -GCGGGTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCACCAGACTTAGGATCTGGCGCC------TTT------GGCGTGGGGGTTCGACTCCCTTCACCCGCA---
D00007118 Bacillus_anthracis_str._Sterne Leu TAG -GCGGGTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCACTAGACTTAGGATCTAGCGCC------TTT------GGCGTGGGGGTTCGACTCCCTTCACCCGCA---
D00007120 Bacillus_anthracis_str._Sterne Leu TAG -GCGGGTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCACCAGACTTAGGATCTGGCGCC------TTT------GGCGTGGGGGTTCGACTCCCTTCACCCGCA---
D00007172 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Leu TAG -GCGGGTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCACTAGACTTAGGATCTAGCGCC------TTT------GGCGTGGGGGTTCGACTCCCTTCACCCGCA---
D00007175 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Leu TAG -GCGGGTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCACCAGACTTAGGATCTGGCGCC------TTT------GGCGTGGGGGTTCGACTCCCTTCACCCGCA---
D00007015 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Leu TAG -GCGGGTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCACTAGACTTAGGATCTAGCGCC------TTT------GGCGTGGGGGTTCGACTCCCTTCACCCGCA---
D00007019 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Leu TAG -GCGGGTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCACCAGACTTAGGATCTGGCGCC------TTT------GGCGTGGGGGTTCGACTCCCTTCACCCGCA---
D00006959 Bacillus_halodurans_C-125 Leu TAG -GCGGGTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCGCTAGACTTAGGATCTAGTGTCC-----TTG-----TGACGTGGGGGTTCGACTCCCTTCACCCGCA---
D00006960 Bacillus_halodurans_C-125 Leu TAG -GCGGGTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCGCTAGACTTAGGATCTAGTGTCC-----TTG-----TGACGTGGGGGTTCGACTCCCTTCACCCGCACCA
D00001531 Bacillus_subtilis Leu TAG -GCGGGTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCGCTAGACTTAGGATCTAGTGTCT-----TTA-----TGACGTGGGGGTTCAAGTCCCTTCACCCGCA---
D00006452 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Leu TAG -GCGGGTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCGCTAGACTTAGGATCTAGTGTCT-----TTA-----TGACGTGGGGGTTCAAGTCCCTTCACCCGCA---
D00006453 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Leu TAG -GCGGGTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCGCTAGACTTAGGATCTAGTGTC------TTAC-----GACGTGGGGGTTCGAGTCCCTTCACCCGCA---
D00007217 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Leu TAG -GCGGGTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCACTAGACTTAGGATCTAGCGCC------TTT------GGCGTGGGGGTTCGACTCCCTTCACCCGCA---
D00007218 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Leu TAG -GCGGGTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCACCAGACTTAGGATCTGGCGCC------TTT------GGCGTGGGGGTTCGACTCCCTTCACCCGCA---
D00007058 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Leu TAG -GCGGATGTGGCGTAATT-GGTA-GCCGCGCCAGACTTAGGATCTGGTGCC------GTGA-----GGCGTGTAGGTTCGAGTCCTATCATCCGCA---
D00007070 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Leu TAG -GCGGATGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCACCAGATTTAGGTTCTGGCGGG------AGA------CCG-TGGGGGTTCGAGTCCCTCCATCCGCACCA
D00007228 Bartonella_quintana_str._Toulouse Leu TAG -GCGGATGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCACCAGATTTAGGTTCTGGCGGG------AGA------CTG-TGGGGGTTCGAGTCCCTCCATCCGCACCA
D00007075 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Leu TAG -GCCCCGCTGGTGAAATT-GGCA-GACACGCTAGACTTAGGATCTAGTGC-------GCAA------GCGTGGGGGTTCAAGTCCCTCGCGGGGCACCA
D00006907 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Leu TAG -GCGCGAGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCAGGATTTAGGTTCCTGTGTC------TTT------GACGTGTGGGTTCAAGTCCCATCTCGCGCA---
D00001517 Borrelia_burgdorferi Leu TAG -CCAGGAGTGGTGGAATT-GGCA-GACACGCTAGACTTAGGATCTAGTGCC------TTT------GGCGTGTGGGTTCGACTCCCACCTTCTGTA---
D00006528 Borrelia_burgdorferi_B31 Leu TAG -CCAGGAGTGGTGGAATT-GGCA-GACACGCTAGACTTAGGATCTAGTGCC------TTT------GGCGTGTGGGTTCGACTCCCACCTTCTGTA---
D00007122 Borrelia_garinii_PBi Leu TAG -GCAGGAGTGGTGGAATT-GGCA-GACACGCTAGACTTAGGATCTAGTGCT------TTT------GGCGTGTGGGTTCGACTCCCACCTTCTGTA---
D00006963 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Leu TAG -GCGGGCGTGGCGGAACT-GGTA-GACGCGCTGGATTTAGGTTCCAGTGAC------GAAA-----GTTGTGGGGGTTCGAGTCCCTCCGCCCGCACCA
D00006624 Brucella_melitensis_16M Leu TAG -GCGGATGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCACCAGATTTAGGTTCTGGCGGG------AGA------CCG-TGGGGGTTCGAGTCCCTCCATCCGCACCA
D00006909 Brucella_suis_1330 Leu TAG -GCGGATGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCACCAGATTTAGGTTCTGGCGGG------AGA------CCG-TGGGGGTTCGAGTCCCTCCATCCGCACCA
D00006456 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Leu TAG -GCGGGAGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCACCAGATTTAGGTTCTGGCGCC------GAAA-----GGTGTGCGAGTTCAAATCTCGCCTCCCGTA---
D00007022 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Leu TAG -GCGGAAGTGGCGAAATT-GGTA-AACGCACCAGATTTAGGTTCTGGCGTCAT----TAT----TGGCTTTGCGAGTTCGAATCTCGCCTTCCGTACCA
D00006840 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Leu TAG -GCGGGAGTGGCGAAATA-GGTA-GACGCACCAGATTTAGGTTCTGGCGCC------GTAA-----GGTGTGCGAGTTCAAATCTCGCCTCCCGTA---
D00006532 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Leu TAG -GCGGATGTGGTGAAATT-GGCA-GACACGCCAGACTTAGGATCTGGTGCA------GCAA-----TGCGTGAAGGTTCAAGTCCTTTCATCCGCACCA
D00007233 Candidatus_Blochmannia_floridanus Leu TAG -ACGGGAGTGGCGAAATA-GGTA-GACGCGTCAGAGTTAGAGTCTGATATC------CTTA-----GATATGCGAGTTCAAATCTCGCCTCCCGTA---
D00007098 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Leu TAG -GCCCAGATGGTGAAATT-GGTA-GACACGCCAGATTTAGGTTCTGGTGCC------GTAA-----GGTGTGTAGGTTCGAGTCCTATTCTGGGCA---
D00006537 Caulobacter_crescentus_CB15 Leu TAG -GCGGATGTGGCGAAACT-GGTA-GACGCACTGGATTTAGGTTCCAGCGCC------GCGA-----GGCGTGGAGGTTCGAGTCCTCTCATCCGCACCA
D00006599 Chlamydia_muridarum_Nigg Leu TAG -GCCCAGGTGGTGAAATT-GGTA-GACACGCTGGATTTAGGATCCAGTGCT------TTGC-----GGCATGTAGGTTCAAGTCCTATCCTGGGCA---
D00006446 Chlamydia_trachomatis Leu TAG -GCCCAGGTGGTGAAATT-GGTA-GACACGCTGGATTTAGGATCCAGTGCT------TTCG-----GGCATGTAGGTTCAAGTCCTATCCTGGGC----
D00006441 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Leu TAG -GCCCAGGTGGTGAAATT-GGTA-GACACGCTGGATTTAGGATCCAGTGCT------TCGC-----GGCATGTAGGTTCAAGTCCTATCCTGGGCA---
D00006431 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Leu TAG -GCCCAGGTGGTGAAATT-GGTA-GACACGCTGGATTTAGGATCCAGTGCT------TTCG-----GGCATGTAGGTTCAAGTCCTATCCTGGGCA---
D00006436 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Leu TAG -GCCCAGGTGGTGAAATT-GGTA-GACACGCTGGATTTAGGATCCAGTGCT------TTCG-----GGCATGTAGGTTCAAGTCCTATCCTGGGCA---
D00006496 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Leu TAG -GCCCAGGTGGTGAAATT-GGTA-GACACGCTGGATTTAGGATCCAGTGCT------TTCG-----GGCATGTAGGTTCAAGTCCTATCCTGGGCA---
D00006827 Chlorobium_tepidum_TLS Leu TAG -GCGAGAGTGGTGAAATT-GGTA-TACACGCTAGTCTTAGGAACTAGTGCC------GTGA-----GGCGTAAGGGTTCGAGTCCCTTCTCTCGCA---
D00006615 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Leu TAG -GCAGGTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCACTAGACTTAGGATCTAGCGCC------TAC------GGCGTGGGGGTTCGACTCCCTTCACCTGCACCA
D00006596 Clostridium_perfringens_str._13 Leu TAG -GCAGATGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCACTAGACTTAGGATCTAGCGCC------TAC------GGCGTGGGGGTTCGACTCCCTTCATCTGCACCA
D00006597 Clostridium_perfringens_str._13 Leu TAG -GCAGGTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCACTAGACTTAGGATCTAGCGCC------TAC------GGCGTGGGGGTTCGACTCCCTTCACCTGCACCA
D00006969 Clostridium_tetani_E88 Leu TAG -GCAGGTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCACTAGACTTAGGATCTAGCGCC------TTT------GGCGTGGGGGTTCGACTCCCTTCACCTGCACCA
D00007084 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Leu TAG -GCGCCCGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCGCTGGATTTAGGTTCCAGTGTC------TTAG-----GACGTGAGAGTTCAAGTCTCTCCGGGCGCA---
D00006915 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Leu TAG -GCGCCTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCGCTGGATTTAGGTTCCAGTGTC------CCAG-----GACGTGAGAGTTCAAGTCTCTCCAGGCGCA---
D00006849 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Leu TAG -GCGCTTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCGCTGGATTTAGGTTCCAGTGTC------CTAG-----GACGTGAGAGTTCAAGTCTCTCCAGGCGCA---
D00007010 Coxiella_burnetii_RSA_493 Leu TAG -GCGAGAGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTGGATTTAGGTTCCAGTAGG------TTAG-----CCTGTGAGAGTTCGAGTCTCTCCTCTCGCACCA
D00006542 Deinococcus_radiodurans_R1 Leu TAG -GCGAGGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCACTAGACTTAGGATCTAGTATCC-----GTA-----GGATGTGAGGGTTCAAGTCCCTTCTCTCGCACCA
D00007178 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Leu TAG -GCGAGAGTGGCGGAATA-GGTA-GACGCACTGGACTTAGAATCCAGCGCC------TTTG-----TGCGTGGGAGTTCGAGTCTCCCCTCTCGCACCA
D00006970 Enterococcus_faecalis_V583 Leu TAG -GCGGGTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCACTAGATTTAGGATCTAGCGCC------GCAA-----GGCGTGGGGGTTCAAGTCCCTTCACCCGCA---
D00001534 Escherichia_coli Leu TAG -GCGGGAGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCACCAGATTTAGGTTCTGGCGCC------GCAA-----GGTGTGCGAGTTCAAGTCTCGCCTCCCGCACCA
D00007023 Escherichia_coli_CFT073 Leu TAG -GCGGGAGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCACCAGATTTAGGTTCTGGCGCC------GCAA-----GGTGTGCGAGTTCAAGTCTCGCCTCCCGCACCA
D00006502 Escherichia_coli_K12 Leu TAG -GCGGGAGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCACCAGATTTAGGTTCTGGCGCC------GCAA-----GGTGTGCGAGTTCAAGTCTCGCCTCCCGCACCA
D00006507 Escherichia_coli_O157:H7 Leu TAG -GCGGGAGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCACCAGATTTAGGTTCTGGCGCC------GCAA-----GGTGTGCGAGTTCAAGTCTCGCCTCCCGCACCA
D00006512 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Leu TAG -GCGGGAGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCACCAGATTTAGGTTCTGGCGCC------GCAA-----GGTGTGCGAGTTCAAGTCTCGCCTCCCGCACCA
D00006830 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Leu TAG -GCGGGGATGGCGGAATT-GGCA-GACGCGCTAGACTTAGGATCTAGTGTC------CCA------GACGTGAGAGTTCAAGTCTCTCTCTCCGCACCA
D00007128 Geobacter_sulfurreducens_PCA Leu TAG -GCGAGAGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCACTGGACTTAGGATCCAGCGGG------CAA------CCG-TAGGGGTTCGACTCCCCTCTCTCGCACCA
D00001549 Haemophilus_influenzae Leu TAG -GCGGGACTGGCGAAATT-GGTA-GACGCACCAGATTTAGGTTCTGGCGCC------GGAA-----GGTGTGTGGGTTCAAGTCCCTCGTCCCGCACCA
D00006524 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Leu TAG -GCGGGACTGGCGAAATT-GGTA-GACGCACCAGATTTAGGTTCTGGCGCC------GAGA-----GGTGTGTGGGTTCAAGTCCCTCGTCCCGCACCA
D00001526 Helicobacter_pylori Leu TAG -GCGGAAGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCACTAGACTTAGGATCTAGCGCC------GCAA-----GGCATGAAGGTTCGATTCCTTTCTTCCGCACCA
D00006516 Helicobacter_pylori_26695 Leu TAG -GCGGAAGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCACTAGACTTAGGATCTAGCGCC------GCAA-----GGCATGAAGGTTCGATTCCTTTCTTCCGCACCA
D00006520 Helicobacter_pylori_J99 Leu TAG -GCGGAAGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCACTAGACTTAGGATCTAGCGCC------GCAA-----GGCATGAAGGTTCGATTCCTTTCTTCCGCACCA
D00007133 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Leu TAG -GCGGGTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCGCTAGATTTAGGTTCTAGTGTT------TTCG-----GACGTGTGGGTTCAAGTCCCACCACCCGTACCA
D00006975 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Leu TAG -GCGGGTGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCGCTAGATTTAGGTTCTAGTGTC------TTAC-----GACGTGGGGGTTCGAGTCCCTTCACCCGCA---
D00007138 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Leu TAG -GCGGGAGTGGTGAAACT-GGCA-GACACGCAGGATTTAGGTTCCTGTGC-------TTCG------GCGTGAGGGTTCGAGTCCCTTCTCCCGCA---
D00006919 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Leu TAG -GCGAGTATGGTGAAATT-GGTA-GACACGCCAGATTTAGGTTCTGGTGCA------GAAA-----TGTGTGGGGGTTCGAGTCCCTCTACTCGCA---
D00006585 Listeria_innocua_Clip11262 Leu TAG -GCGGGTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCACCAGATTTAGGATCTGGCGCC------GCGA-----GGCGTGGGGGTTCAAGTCCCTTCACCCGCA---
D00006589 Listeria_monocytogenes_EGD-e Leu TAG -GCGGGTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCACCAGATTTAGGATCTGGCGCC------GCGA-----GGCGTGGGGGTTCAAGTCCCTTCACCCGCA---
D00007182 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Leu TAG -GCGGGTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCACCAGATTTAGGATCTGGCGCC------GCGA-----GGCGTGGGGGTTCAAGTCCCTTCACCCGCA---
D00007186 Mesoplasma_florum_L1 Leu TAG -GCGGGATTGGCGGAATT-GGCA-GACGCACTAGACTTAGGATCTAGCGTC------TTC------GACGTAAGGGTTCGAGTCCCTTATCCCGCACCA
D00006627 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Leu TAG -GCGGATGTGGCGGAACT-GGTA-GACGCCCTGGATTTAGGTTCCAGTGCC------GAAA-----GGCGTGGGGGTTCGAGTCCCTTCATCCGCACCA
D00007003 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Leu TAG -GCGGGCGTGATGAAATT-GGCA-AACATGCCGGTTTTAGGTGCCGGTGCTC-----GAAA----GAGTTTGAGGGTTCGAGTCCCTCCGCCCGCA---
D00006488 Mycobacterium_leprae_TN Leu TAG -GCGGGCGTGATGGAAT--GGCA-GACATGCCGGCTTTAGGTGCCGGTGCTT-----GAAA----GAGCGTGAGGGTTCGACTCCCTCCGCCCGCA---
D00006461 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Leu TAG -GCGGGCGTGATGAAATT-GGCA-AACATGCCGGTTTTAGGTGCCGGTGCTC-----GAAA----GAGTTTGAGGGTTCGAGTCCCTCCGCCCGCA---
D00007091 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Leu TAG -GCGGGCGTGATGAAATT-GGCA-AACATGCCGGTTTTAGGTGCCGGTGCTC-----GAAA----GAGTTTGAGGGTTCGAGTCCCTCCGCCCGCA---
D00001500 Mycoplasma_capricolum Leu TAG --GGGGATTGGCGGAATT-GGCA-GACGCACTAGACTTAGGATCTAGCGTC------TTT------GACGTAAGGGTTCAAGTCCCTTATCCCCCACCA
D00006998 Mycoplasma_gallisepticum_R Leu TAG -GCACTCGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCGCTAGACTTAGGATCTAGTATCA-----TTA-----CGATGTGGGGGTTCAAGTCCCTTCGAGTGCACCA
D00001502 Mycoplasma_genitalium Leu TAG -GCACTCGTGGCGGAAT--GGTA-GACGCGCTAGACTTAGGATCTAGTTTCA-----TCT-----AGAAGTGGGGGTTCAAGTCCCTTCGGGTGCACCA
D00006546 Mycoplasma_genitalium_G37 Leu TAG -GCACTCGTGGCGGAAT--GGTA-GACGCGCTAGACTTAGGATCTAGTTTCA-----TCT-----AGAAGTGGGGGTTCAAGTCCCTTCGGGTGCACCA
D00001505 Mycoplasma_pneumoniae Leu TAG -GCACTCGTGGCGGAAT--GGTA-GACGCGCTAGACTTAGGATCTAGTTTCA-----TTG-----TGGAGTGGGGGTTCAAGTCCCTTCGAGTGCACCA
D00006550 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Leu TAG -GCACTCGTGGCGGAAT--GGTA-GACGCGCTAGACTTAGGATCTAGTTTCA-----TTG-----TGGAGTGGGGGTTCAAGTCCCTTCGAGTGCACCA
D00006657 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Leu TAG -GCGCGAGTGGTGAAATT-GGCA-GACACGCTAGATTTAGGCTCTAGTGCT------TTAC-----AGTGTGAGGGTTCAAGTCCCTCCTCGTGCACCA
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D00006466 Neisseria_meningitidis_MC58 Leu TAG -GCGGACGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCACCAGATTTAGGTTCTGGCGCC------GAGA-----GGTGTGAGAGTTCGAGTCTCTCCGTCCGCACCA
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D00007051 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Leu TAG -GCGAAAGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCACCAGATTTAGGTTCTGGCGCCG-----ATG-----AGGTGTGGGGGTTCGAGTCCCCCCTTTCGCACCA
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D00006653 Nostoc_sp._PCC_7120 Leu TAG -GCGGATGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCGCTAGATTTAGGTTCTAGTTCC------GAGA-----GGAGTGAAGGTTCAAGTCCTTTCATCCGCA---
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D00001491 Methanocaldococcus_jannaschii Leu GAG -GCGGGGGTCGCCAAGCCAGGTCAAAGGCGCCAGATTGAGGGTCTGGTCCCG-----TAG-----GGGTTCGCGGGTTCAAATCCCGTCCCCCGCA---
D00006692 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Leu GAG -GCGGGGGTCGCCAAGCCAGGTCAAAGGCGCCAGATTGAGGGTCTGGTCCCG-----TAG-----GGGTTCGCGGGTTCAAATCCCGTCCCCCGCACC-
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D00006695 Methanococcus_maripaludis Leu GAG -GCGAGGGTTGCCAAGCCTGGTTAAAGGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTCTCA-----TAG-----GAGTTCGAGGGTTCGAATCCCTTCCCTCGC----
D00001495 Methanopyrus_kandleri Leu GAG -GCGGGGGCGCCCGAGCCTGGTCAAAGGGGCGGGAATGAGGATCCCGTGGCC-----GTAG----GGCGTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCCCCGCACCA
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D00011883 Methanosarcina_acetivorans_C2A Leu GAG -GCGAGGGTTGCCCAGCCAGGTCAAAGGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTTTCG-----TAG-----GAATTCGTGGGTTCGAATCCCATCCCTCGCACCA
D00011884 Methanosarcina_acetivorans_C2A Leu GAG -GCGAGGGTTGCCCAGCCAGGTCAAAGGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTTTCG-----TAG-----GAATTCGTGGGTTCGAATCCCATCCCTCGCA---
D00006834 Methanosarcina_mazei_Go1 Leu GAG -GCGAGGGTTGCCCAGCCAGGTCAAAGGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTTTCG-----TAG-----GAATTCGTGGGTTCGAATCCCATCCCTCGCA---
D00006835 Methanosarcina_mazei_Go1 Leu GAG -GCGAGGGTTGCCCAGCCAGGTCAAAGGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTCTTG-----TAG-----GAGTTCGTGGGTTCGAATCCCATCCCTCGCACCA
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D00006689 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Leu GAG -GCAGGGGTGGTCGAGC--GGTCAAAGGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTGGGGG----AGT----CCCTT-CGCGGGTTCGAATCCCGTCCCCTGCA---
D00011990 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Leu GAG -GCGGCCGTGCCCGAGC--GGACAAAGGGGCCAGGTTGAGGTCCTGGTGGGG-----TAGT----CCCTGCCGGGGTTCGAATCCCCGCGGCCGCA---
D00006701 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Leu GAG -GCGGGGGTGCCCGAGCCAGGTCAAAGGGGCAGGGTTGAGGTCCCTGTGGCG-----TAGG----CCTG-CGTGGGTTCAAATCCCACCCCCCGCACCA
D00006706 Pyrococcus_abyssi_GE5 Leu GAG -GCGGGGGTTGCCGAGCCTGGTCAAAGGCGCGGGATTGAGGGTCCCGTCCCG-----TAG-----GGGTTCCGGGGTTCAAATCCCCGCCCCCGCACC-
D00006711 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Leu GAG -GCGGGGGTTGCCGAGCCTGGTCAAAGGCGCGGGATTGAGGGTCCCGTCCCG-----TAG-----GGGTTCCGGGGTTCAAATCCCCGCCCCCGCACC-
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D00012021 Staphylothermus_marinus_F1 Leu GAG -GCGGGGGTGCCCGAGCCTGGTCAAAGGGGCCGGGTTGAGGACCCGGTGGCG-----TAGG----CCTG-CGTGGGTTCAAATCCCACCCCCCGCACCA
D00012066 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Leu GAG -GCGGGGGTGCCCGAGCAAGGTCAAAGGGGGCGGACTGAGGCTCCGCTGGTG-----TAGG----CCTG-CGTGGGTTCAAGTCCCACCCCCCGCA---
D00006721 Sulfolobus_solfataricus_P2 Leu GAG -GCGGGGGTGCCCGAGCTAGGGCAAAGGGGGCGGACTGAGGCTCCGCTGGCG-----AAGG----CCTG-CACGGGTTCAAATCCCGTCCCCCGC----
D00006726 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Leu GAG -GCGGAGGTTGTCGAGACTGGTCAAAGGCGCCAGATTGAGGGTCTGGTTCCG-----TAG-----GGATGCGAGGGTTCAAATCCCTCCCTCCGCA---
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D00006661 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Leu GAG --CGGTCGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCAGCGTTGAGGTCGCTGTGGGG-----CAA-----CCCG-TGGAAGTTCGAGTCTTCTCGACCGCACCA
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D00007065 Bacillus_anthracis_str._Ames Leu GAG -GCGGTCGTGGCGGAAC--GGCA-GACGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTGGGGG----AAA----CCCCG-TGGAGGTTCAAGTCCTCTCGGCCGCA---
D00007116 Bacillus_anthracis_str._Sterne Leu GAG -GCGGTCGTGGCGGAAC--GGCA-GACGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTGGGGG----AAA----CCCCG-TGGAGGTTCAAGTCCTCTCGGCCGCA---
D00007170 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Leu GAG -GCGGTCGTGGCGGAAC--GGCA-GACGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTGGGGG----AAA----CCCCG-TGGAGGTTCAAGTCCTCTCGGCCGCA---
D00007017 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Leu GAG -GCGGTCGTGGCGGAAC--GGCA-GACGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTGGGGG----AAA----CCCCG-TGGAGGTTCAAGTCCTCTCGGCCGCA---
D00006956 Bacillus_halodurans_C-125 Leu GAG -GCGGTTGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTGGGGG----TTGA---CCCCG-TGGAGGTTCGAGTCCTCTCAACCGCA---
D00001532 Bacillus_subtilis Leu GAG -GCGGTCGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTGGG_TAGT-GGT_ATAACCCG-TGGAGGTTCAAGTCCTCTCGGCCGCA---
D00006449 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Leu GAG -GCGGTCGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTGGGTG----AAT----AACCCGTGGAGGTTCAAGTCCTCTCGGCCGCA---
D00007215 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Leu GAG -GCGGTCGTGGCGGAAC--GGCA-GACGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTGGGGG----AAA----CCCCG-TGGAGGTTCAAGTCCTCTCGGCCGCACCA
D00007056 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Leu GAG -GGAGAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTACTTTGAGGGGGTAGTGACA-----GTTA----TGTCGTGGGAGTTCGAGTCTCCTTCTCTTCA---
D00007071 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Leu GAG -GCGGTCGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCAGCGTTGAGGTCGCTGTGGGG-----CAC-----CCCG-TGGAAGTTCGAGTCTTCTCGACCGCACCA
D00007226 Bartonella_quintana_str._Toulouse Leu GAG -GCGGTCGTGGCGGAAGT-GGTA-GACGTGCAGCGTTGAGGTCGCTGTGGGG-----CAA-----CCCG-TGGAAGTTCGAGTCTTCTCGACCGCACCA
D00007079 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Leu GAG -GCGCGGATGGTGGAATT-GGTA-GACACGTACGTTTGAGGGGCGTATGC-------GCAA------GCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTCCGCGCACCA
D00006904 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Leu GAG -GCCCGGGTGGCGGAAT--GGTA-GACGCGCTAGCTTGAGGTGCTAGTGCCTATT--TTA--TACAGGCGTACGGGTTCAAGTCCCGTCTCGGGCA---
D00001515 Borrelia_burgdorferi Leu GAG -GCTGTGGTGGTGGAAGT-GGTA-GACACGCTAGCTTGAGGGGCTAGTGGGC-----GCAA----GCCCGTGCTGGTTCAAGTCCAGTTCACAGCA---
D00006526 Borrelia_burgdorferi_B31 Leu GAG -GCTGTGGTGGTGGAAGT-GGTA-GACACGCTAGCTTGAGGGGCTAGTGGGC-----GCAA----GCCCGTGCTGGTTCAAGTCCAGTTCACAGCA---
D00007121 Borrelia_garinii_PBi Leu GAG -GCTGTGGTGGTGGAAGT-GGTA-GACACGCTAGCTTGAGGGGCTAGTGGGC-----GTAA----GCCCATGCTGGTTCAAGTCCAGTTCACAGCA---
D00006964 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Leu GAG -GCGCTCGTGGCGGAACT-GGTA-GACGCGCTGCCTTGAGGTGGCAGTGAGT-----AAA-----ATCG-TGGGGGTTCGAGTCCCTCCGAGCGCACCA
D00006621 Brucella_melitensis_16M Leu GAG -GCGGTCATGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCAGCGTTGAGGTCGCTGTGGGG-----CAA-----CCCG-TGGAAGTTCGAGTCTTCTCGACCGCACCA
D00006622 Brucella_melitensis_16M Leu GAG -GCGGTCGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCAGCGTTGAGGTCGCTGTGGGG-----CAA-----CCCG-TGGAAGTTCGAGTCTTCTCGACCGCACCA
D00006454 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Leu GAG -GCCGAGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGCCG-----AAT-----AGGCGTGTGGGTTCGAGTCCCATTCTCGGTACCA
D00007021 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Leu GAG -GCCGAGGTGGTGAAACT-GGTA-AACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTTCCTA----TTTT---TAGGTATGCGGGTTCAAATCCCGTCCTCGGTA---
D00006839 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Leu GAG -ACCGAGGTGGTGAAATT-GGTA-GACACGCTATCTTGAGGGGATAGTGCC------TTTA-----GGCATATGGGTTCAAGTCCCATCCTCGGTA---
D00006530 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Leu GAG -GCGGTTATGGTGGAATT-GGTA-GACACGCCATCTTGAGGGGGTGGTGCGC-----TCC-----GCGTGTGCGAGTTCAAATCTCGCTAACCGCACCA
D00007231 Candidatus_Blochmannia_floridanus Leu GAG -GCCGAGATGGTGAAATTTGGTA-TACACGCTACTTTGAGGGGGTAGTCCGG-----TTA-----ATGGTTGCGGGTTCAAATCCCGTTCTCGGCA---
D00007096 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Leu GAG -GCGAAGGTGGCGGAATT-GGTA-TACGCGCTACTTTGAGGTGGTAGTGAGG-----GTTT----CCTCGTAGGGGTTCAAGTCCCCTCTTTCGCA---
D00006535 Caulobacter_crescentus_CB15 Leu GAG -GCGGTCGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCAGCGTTGAGGTCGCTGTGGGG-----CAA-----CCCG-TGGAAGTTCGAGTCTTCTCGACCGCACCA
D00006601 Chlamydia_muridarum_Nigg Leu GAG -GCGGAAGTGGCGGAATT-GGTA-TACGCGCTATCTTGAGGTGGTAGTGGA------GCTT-----TCCTTAGGGGTTCGAGTCCCCTCTTTCGCA---
D00006444 Chlamydia_trachomatis Leu GAG -GCGGAAGTGGCGGAATT-GGTA-TACGCGCTATCTTGAGGTGGTAGTGGA------GCTT-----TCCTTAGGGGTTCGAGTCCCCTCTTTCGC----
D00006439 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Leu GAG -GCGGAAGTGGCGGAATT-GGTA-TACGCGCTATCTTGAGGTGGTAGTGGA------GCTT-----TCCTTAGGGGTTCGAGTCCCCTCTTTCGCA---
D00006429 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Leu GAG -GCGGAAGTGGCGGAATT-GGTA-TACGCGCTATCTTGAGGTGGTAGTGGA------GCTT-----TCCTTAGGGGTTCGAGTCCCCTCTTTCGCA---
D00006434 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Leu GAG -GCGGAAGTGGCGGAATT-GGTA-TACGCGCTATCTTGAGGTGGTAGTGGA------GCTT-----TCCTTAGGGGTTCGAGTCCCCTCTTTCGCA---
D00006494 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Leu GAG -GCGGAAGTGGCGGAATT-GGTA-TACGCGCTATCTTGAGGTGGTAGTGGA------GCTT-----TCCTTAGGGGTTCGAGTCCCCTCTTTCGCA---
D00006825 Chlorobium_tepidum_TLS Leu GAG -GCCCGAGTGGTGGAATT-GGTA-GACACACCATCTTGAGGGGGTGGCGCC------GTTA-----GGTGTAGGAGTTCGAATCTCCTCTCGGGCA---
D00006613 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Leu GAG -GCGAGAGTGCTGGAATC-GGCA-GACAGGCACGTTTGAGGGGCGTGTGTC------ATT------GACGTACGGGTTCAAGTCCCGTCTCTCGCACCA
D00006595 Clostridium_perfringens_str._13 Leu GAG -GCAGATATGGTGGAAT--GGCA-GACACGATATCTTGAGGGGGTATTACTT-----TTAG----GAGTGTGCGGGTTCAAGTCCCGCTATCTGCACCA
D00006967 Clostridium_tetani_E88 Leu GAG -GCAGGTGTGCTGGAATT-GGCA-GACAGGCACGCTTGAGGTGCGTGTGTTC-----AAC-----GAACGTATGGGTTCAAGTCCCTTCACCTGCACCA
D00007083 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Leu GAG -GCCCGGGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTAGCTTGAGGTGCTAGTGTCCTA---CTA---ACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCTCGGGCA---
D00006916 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Leu GAG -GCCCGGGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTAGCTTGAGGTGCTAGTGTCCTA---TTA---ACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCTCGGGCA---
D00006917 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Leu GAG -GCCCAGGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTAGCTTGAGGTGCTAGTGTCCTA---TTA---ACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCTCTGGGCA---
D00006847 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Leu GAG -GCCCGGGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTAGCTTGAGGTGCTAGTGTCCTA---TTA---ACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCGGGCA---
D00006848 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Leu GAG -GCCCGGGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTAGCTTGAGGTGCTAGTGTCCTA---TTA---ACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCGGGCA---
D00007014 Coxiella_burnetii_RSA_493 Leu GAG -GCCGAAGTGGTGGAACT-GGTA-GACACGCTGTCTTGAGGGGGCAGTGGGG-----AAA-----CCCG-TGCCGGTTCGAGTCCGGCCTTCGGCA---
D00006540 Deinococcus_radiodurans_R1 Leu GAG -GCTCGGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCACGTTTGAGGGGCGTGTGGG------TAA------CCG-TGTGGGTTCAAGTCCCATCTCGAGCACCA
D00007179 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Leu GAG -GCCGAGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGGGA-----GAAA----TCCCGTGAGGGTTCGAGTCCCTCCTTCGGCACCA
D00007181 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Leu GAG -GCCGAGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGGGA-----GAAA----TCCCGTGAGGGTTCGAGTCCCTCCCTCGGCACCA
D00006973 Enterococcus_faecalis_V583 Leu GAG -GCAGATGTGTTGGAATT-GGCA-GACAAGCATGATTGAGGGTCATGTGGAC-----AGAT----GTCCGTGTGGGTTCGAGTCCCATCATCTGCA---
D00001536 Escherichia_coli Leu GAG -GCCGAGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTACCTTGAGGTGGTAGTGCCC-----AATA----GGGCTTACGGGTTCAAGTCCCGTCCTCGGTACCA
D00007025 Escherichia_coli_CFT073 Leu GAG -GCCGAGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTACCTTGAGGTGGTAGTGCCC-----AATA----GGGCTTACGGGTTCAAGTCCCGTCCTCGGTACCA
D00006500 Escherichia_coli_K12 Leu GAG -GCCGAGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTACCTTGAGGTGGTAGTGCCC-----AATA----GGGCTTACGGGTTCAAGTCCCGTCCTCGGTACCA
D00006505 Escherichia_coli_O157:H7 Leu GAG -GCCGAGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTACCTTGAGGTGGTAGTGCCC-----AATA----GGGCTTACGGGTTCAAGTCCCGTCCTCGGTACCA
D00006510 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Leu GAG -GCCGAGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTACCTTGAGGTGGTAGTGCCC-----AATA----GGGCTTACGGGTTCAAGTCCCGTCCTCGGTACCA
D00007127 Geobacter_sulfurreducens_PCA Leu GAG -GCGGTAGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCACCAGCTTGAGGGGCTGGCGGGGG----TTA----CCCCG-TGATGGTTCGAGTCCATTCTACCGCACCA
D00001547 Haemophilus_influenzae Leu GAG --CTCTGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACC-----ACA-----GGTCGTGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCA
D00006522 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Leu GAG -GCTCTGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACC-----ACA-----GGTCGTGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCA
D00001525 Helicobacter_pylori Leu GAG -GCACTGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCCATCTTGAGGGGGTGGTGGGA-----GCAA----TCTCGTGCGAGTTCGAGTCTCGCCCAGTGCACCA
D00006514 Helicobacter_pylori_26695 Leu GAG -GCACTGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCCATCTTGAGGGGGTGGTGGGA-----GCAA----TCTCGTGCGAGTTCGAGTCTCGCCCAGTGCACCA
D00006518 Helicobacter_pylori_J99 Leu GAG -GCACTGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCCATCTTGAGGGGGTGGTGGGA-----GCAA----TCTCGTGCGAGTTCGAGTCTCGCCCAGTGCACCA
D00007136 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Leu GAG -GTCCGGGTGGCGGAAATGGCA--GACGCGCTAGCTTGAGGTGCTAGTGCCCG----TAT----AGGGCGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCTCGGACA---
D00006920 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Leu GAG -GCTCGGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCAAGCTTGAGGTGCTTGTGCCG-----TTT-----AGGTGTAGGGGTTCGAGTCCCCTCTCGAGCA---
D00006587 Listeria_innocua_Clip11262 Leu GAG -GCGGTCGTGGCGGAATC-GGCA-GACGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTGAGGT----AAA----ACTCG-TGGAGGTTCAAGTCCTCTCGGCCGCA---
D00006591 Listeria_monocytogenes_EGD-e Leu GAG -GCGGTCGTGGCGGAATC-GGCA-GACGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTGGGGT----AAA----ACCCG-TGGAGGTTCAAGTCCTCTCGGCCGCA---
D00007184 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Leu GAG -GCGGTCGTGGCGGAATC-GGCA-GACGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTGGGGT----AAA----ACCCG-TGGAGGTTCAAGTCCTCTCGGCCGCA---
D00006628 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Leu GAG -GCGGTCGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCAGCGTTGAGGTCGCTGTGGGG-----CAA-----CCCG-TGGAAGTTCGAGTCTTCTCGACCGCACCA
D00007005 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Leu GAG -GTCCGAGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTAGCTTGAGGTGCTAGTGCCCTA---CTAA--TGGGCG-TGGGGGTTCAAGTCCCCCCTCGGACA---
D00006486 Mycobacterium_leprae_TN Leu GAG -GTCCGAGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTAGCTTGAGGTGCTAGTGCCCTA---CTAA--TGGGCG-TGGGGGTTCAAATCCCCCCTCGGACA---
D00006459 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Leu GAG -GTCCGAGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTAGCTTGAGGTGCTAGTGCCCTA---CTAA--TGGGCG-TGGGGGTTCAAGTCCCCCCTCGGACA---
D00007093 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Leu GAG -GTCCGAGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTAGCTTGAGGTGCTAGTGCCCTA---CTAA--TGGGCG-TGGGGGTTCAAGTCCCCCCTCGGACA---
D00001503 Mycoplasma_genitalium Leu GAG -GTCGGAGTGGTGGAAT--GGTA-GACACGCAAGCTTGAGGTGCTTGTGGTCG----TTAA---AGACTGTGCCAGTTCAAGTCTGGTCTCCGACACCA
D00006544 Mycoplasma_genitalium_G37 Leu GAG -GTCGGAGTGGTGGAAT--GGTA-GACACGCAAGCTTGAGGTGCTTGTGGTCG----TTAA---AGACTGTGCCAGTTCAAGTCTGGTCTCCGACACCA
D00006548 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Leu GAG -GTCGGAGTGGTGGAAT--GGTA-GACACGCAAGCTTGAGGGGCTTGTGGTC-----GCAA----GACTGTGCCAGTTCAAGTCTGGTCTCCGACACCA
D00006469 Neisseria_meningitidis_Z2491 Leu GAG -GCCGACATGGTGAAATT-GGTA-GACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGGCC-----GTA-----GGCTGTGCGAGTTCAAATCTCGCTGTCGGCACCA
D00007054 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Leu GAG -GCCGACGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCCGTCTTGAGGGGGCGGTGGC------GAAA-----GCTGTGCGAGTTCGATTCTCGCCGTCGGCACCA
D00006647 Nostoc_sp._PCC_7120 Leu GAG -GCTCCCGTGGCGAAATT-GGTA-AACGCTTCCGTTTGAGGGACGAAAT--------T----------TTTACTCTTTCAACTCCTGTCGGGAGTACCA
D00006652 Nostoc_sp._PCC_7120 Leu GAG -GCGGATGTGGCGGAATT-GGTA-TACGCGCACGCTTGAGGTGCGTGTGGC------TTT------GCCTTGCGAGTTCGAGTCTCGCCATCCGCA---
D00006925 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Leu GAG -GCGGTCGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTGGGCG----TAT----AGCCCGTGTGGGTTCAAATCCCACTGACCGCA---
D00007088 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M Leu GAG -GCGGATATGACGGAAC--GGTA-GACGTGCATGCTTGAGGGGCATGTAAGA-----AATA----TCTTGTGTGAGTTCAAATCTCACTATCCGCACCA
D00007104 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Leu GAG -GCCGAGGTGGTGAAATT-GGTA-GACACGCTACCTTGAGGTGGTAGTGCCCA----CACT---AGGGCTTACGGGTTCAAGTCCCGTCCTCGGTACCA
D00007143 Porphyromonas_gingivalis_W83 Leu GAG -GCGCGGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTACTTTGAGGGGGTAGTGCCG-----GTTA----CGGTGTGTGAGTTCAAATCTCATCTCGCGTA---
D00007191 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Leu GAG -GTCCGGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTAGCTTGAGGTGCTAGTGGCCG----ATTA---AGGCTGTGGAGGTTCAAGTCCTCTCTCGGACA---
D00006561 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Leu GAG -GCCGAGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTACCTTGAGGTGGTAGTGGCC-----ATA-----GGCTGTAGGGGTTCGAGTCCCCTCCTCGGTACCA
D00006564 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Leu GAG -GTAGAGCTGGCTAAGCA-TGT--AGAACCGATAGCGGAGAGCTGGCGG-------------------A-CGGGGGTTCAAATCCCCCCGGCTCCACCA
D00007063 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Leu GAG -GCCGAGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCAACCTTGAGGTGGTTGTGCCC-----AAT-----GGGTGTAGGGGTTCGAGTCCCCTTCTCGGTACCA
D00006644 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Leu GAG -GCCGACGTGGTGAAATT-GGTA-GACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGGC------GAAA-----GCTGTGCGAGTTCGAGTCTCGCCGTCGGCACCA
D00007044 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Leu GAG -GCGGCCGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTGGGAG----TTA----ATCCCGTGGAGGTTCGAGTCCTCTCGGCCGCA---
D00007046 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Leu GAG -GGTCGAGTACGCAAACA-GGCA-AAGCGGCAAGCATGAGAGGCTTGTG--------AT---------TTTGCAGGTTCGACTCCTGTCTCGACTA---
D00007109 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Leu GAG -GCGCTCGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCTGCCTTGAGGTGGCAGTGAGT-----AAA-----ATCG-TGGGGGTTCGAGTCCCTCCGAGCGCACCA
D00006617 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Leu GAG -GCGGTCGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCGCAGCATTGAGGGTGCTGTTCTG-----TAAA----AAGATTGGAAGTTCAAGTCTTCTCGACCGCACCA
D00006841 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Leu GAG -GCGGTCGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCGCAGCATTGAGGGTGCTGTTCTG-----TAAA----AGGATTGGAAGTTCAAATCTTCTCGACCGCACCA
D00007145 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Leu GAG -GCGGTCGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCGCAGCATTGAGGGTGCTGTTCTG-----TAAA----AGGATTGGAAGTTCAAATCTTCTCGACCGCACCA
D00006665 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Leu GAG -GCCGAGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTACCTTGAGGTGGTAGTGCCT-----AATA----GGGCTTACGGGTTCAAGTCCCGTCCTCGGTACCA
D00007036 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Leu GAG -GCCGAGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTACCTTGAGGTGGTAGTGCCT-----AATA----GGGCTTACGGGTTCAAGTCCCGTCCTCGGTACCA
D00006639 Salmonella_typhimurium_LT2 Leu GAG -GCCGAGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTACCTTGAGGTGGTAGTGCCC-----AATA----GGGCTTACGGGTTCAAGTCCCGTCCTCGGTACCA
D00006933 Shewanella_oneidensis_MR-1 Leu GAG -GCCGAGGTGGTGAAATT-GGTA-GACGCGCAGCCTTGAGGTGGCTGTGTCC-----TAAC----GGACGTGCGGGTTCAAGTCCCGCTCTCGGCACCA
D00006941 Shigella_flexneri_2a_str._301 Leu GAG -GCCGAGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTACCTTGAGGTGGTAGTGCCC-----AATA----GGGCTTACGGGTTCAAGTCCCGTCCTCGGTACCA
D00006670 Sinorhizobium_meliloti_1021 Leu GAG -GCGGTCGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCAGCGTTGAGGTCGCTGTGGGG-----CAA-----CCCG-TGGAAGTTCGAGTCTTCTCGACCGCACCA
D00007115 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Leu GAG -GCGGTCGTGGCGGAAT--GGCA-GATGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTGGGA-----GAAG----TCCCGTGGAGGTTCAAGTCCTCTCGGCCGCA---
D00006854 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Leu GAG -GCGGTCGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTGGGA-----GAAA----TCCCGTGGAGGTTCAAGTCCTCTCGGCCGCA---
D00006480 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Leu GAG -GCGGTCGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTGGGA-----GAAA----TCCCGTGGAGGTTCAAGTCCTCTCGGCCGCA---
D00006982 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Leu GAG -GCGGTCGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTGGGAG----TTA----ATCCCGTGGAGGTTCAAGTCCTCTCGGCCGCACCA
D00007029 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Leu GAG -GTCCGGGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTAGCTTGAGGTGCTAGTGCCCT----TTAT---CGGGCGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCTCGGACACCA
D00006929 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Leu GAG -GTCCGGGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTAGCTTGAGGTGCTAGTGCCCT----TTAT---CGGGCGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCTCGGACA---
D00006930 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Leu GAG -GTCCGGGTGGCGGAAT--GGCA-GACGCGCTAGCTTGAGGTGCTAGTGCCCT----TTAT---CGGGCGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCTCGGACACCA
D00007151 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Leu GAG -GTCGGAGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCGTACGTTTGAGGGGCGTATGGG------CAA------CCG-TGCGGGTTCAAGTCCCGCCTCCGACACCA
D00007152 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Leu GAG -GTCGGAGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCGTACGTTTGAGGGGCGTATGGG------TTT------CCCGTGCGGGTTCAAGTCCCGCCTCCGACACCA
D00001551 Synechocystis_sp. Leu GAG -GCGGATGTGGCGGAATT-GGTA-TACGCGCACGTTTGAGGGGCGTGTGGC------TTT------GCCTTGCGAGTTCGAGTCTCGCCATCCGCA---
D00006567 Synechocystis_sp._PCC_6803 Leu GAG -GCGGATGTGGCGGAATT-GGTA-TACGCGCACGTTTGAGGGGCGTGTGGC------TTT------GCCTTGCGAGTTCGAGTCTCGCCATCCGCA---
D00006874 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Leu GAG -GCGGCGGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCGTACGTTTGAGGGGCGTATGGGC-----TAA-----TCCCGTGTGGGTTCAAGTCCCACCCGCCGCACCA
D00006864 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Leu GAG -GCGGATGTGGCGGAATT-GGTA-TACGCGCACGTTTGAGGGGCGTGTGGC------TTT------GCCTTGCGAGTTCGAGTCTCGCCATCCGCA---
D00006572 Thermotoga_maritima_MSB8 Leu GAG -GCCGAGGTGGTGGAACT-GGCA-GACACGCATGGTTGAGGGCCATGTGGGC-----TTCG----GCCCGTGCGGGTTCAAGTCCCGCCCTCGGCACCA
D00007198 Thermus_thermophilus_HB27 Leu GAG CGCCGGGGTGGTGGAACT-GGTA-GACACGCCATCTTGAGGGGGTGGTGCCC-----GCAA----GGGCGTGCGGGTTCAAGTCCCGCCCCCGGCACCA
D00007201 Treponema_denticola_ATCC_35405 Leu GAG -GCGGCGGTGGTGGAAT--GGTA-GACACGTCAGCTTGAGGTGCTGATGCCT-----TAAC----GGGTGTGCTGGTTCAAGTCCAGTTCGCCGCA---
D00001511 Treponema_pallidum Leu GAG -GCGGCGGTGGTGGAAGT-GGTA-TACACGCTAGCTCGAGGTGCTAGTGCC------GTAA-----GGCTTGCTGGTTCAAGTCCAGTCCGCCGCA---
D00006556 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Leu GAG -GCGGCGGTGGTGGAAGT-GGTA-TACACGCTAGCTCGAGGTGCTAGTGCC------GTAA-----GGCTTGCTGGTTCAAGTCCAGTCCGCCGCA---
D00006984 Tropheryma_whipplei_str._Twist Leu GAG -GCGCGGGTGGCGGAATC-GGTA-GACGCGCTAGCTTGAGGTGCTAGTGCCAAT---TTG---AAAGGCGTAGGGGTTCAAGTCCCCTCTCGCGCA---
D00006988 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Leu GAG -GCGCGGGTGGCGGAATC-GGTA-GACGCGCTAGCTTGAGGTGCTAGTGCCAAT---TTG---AAAGGCGTAGGGGTTCAAGTCCCCTCTCGCGCA---
D00006475 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Leu GAG -GCCGAGATGGTGAAATT-GGTA-GACACACTAGCATGAGGTGCTAGCGCC------TTA------GGTGTGAGGGTTCGAGTCCCTCTCTCGGCACCA
D00007204 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Leu GAG -GCGGCCGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCAGCGTTGAGGTCGCTGTGGCTC----ATA----AGGCCTTGGAAGTTCAAGTCTTCTCGGCCGCACCA
D00006888 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Leu GAG -GCCCAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCACTACCTTGAGGTGGTAGCGAC------TTAG-----GTCGTAGGGGTTCGAGTCCCCTCTTGGGCACCA
D00006882 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Leu GAG -GCCCAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCACTACCTTGAGGTGGTAGCGAC------TTAG-----GTCGTAGGGGTTCGAGTCCCCTCTTGGGCACCA
D00006577 Xylella_fastidiosa_9a5c Leu GAG -GCCCAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCACTACCTTGAGGTGGTAGCGAC------GTAA-----GTCGTAGGGGTTCGAGTCCCCTCTTGGGCACCA
D00006993 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Leu GAG -GCCCAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCACTACCTTGAGGTGGTAGCGAC------GTAA-----GTCGTAGGGGTTCGAGTCCCCTCTTGGGCACCA
D00007154 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Leu GAG -GCCGGGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTACCTTGAGGTGGTAGTGCCC-----GATT----GGGCTTACGGGTTCAAGTCCCGTCCTCGGTACCA
D00006635 Yersinia_pestis_CO92 Leu GAG -GCCGGGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTACCTTGAGGTGGTAGTGCCC-----GATT----GGGCTTACGGGTTCAAGTCCCGTCCTCGGTACCA
D00006895 Yersinia_pestis_KIM Leu GAG -GCCGGGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTACCTTGAGGTGGTAGTGCCC-----GATT----GGGCTTACGGGTTCAAGTCCCGTCCTCGGTACCA
D00007161 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Leu GAG -GCCGGGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTACCTTGAGGTGGTAGTGCCC-----GATT----GGGCTTACGGGTTCAAGTCCCGTCCTCGGTACCA
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D00007270 Pan_troglodytes Leu AAG -GGTAGCGTGGCCGAGC--GGTCTAAGGCGCTGGATTAAGGCTCCAGTCTC------TTCG-----GAGGCGTGGGTTCGAATCCCACCGCTGCCA---
D00007219 Plasmodium_falciparum_3D7 Leu AAG -GACAGAATGGCCGAGT--GGTCTAAGGCGCAACGTTAAGGCCGTTGTCC-------GAAA------GGGCGTGGGTTCGAACCCCACTTCTGTCA---
D00006816 Schizosaccharomyces_pombe Leu AAG -GGAAGGTTGTCCGAGT--GGTT-ATGGAGCTAGTTTAAGGCACTAGTGC-------GAAA------GCTCGTGGGTTCGAGTCCCACACCTTTC----
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D00007247 Takifugu_rubripes Leu AAG -GGTAGCGTGGCCGAGC--GGTCCAAGGCGCTGGATTAAGGCTCTAGTCTCT-----TCG-----GGGG-CGTGGGTTCAAATCCCACCGCTGCCA---
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D00011964 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Leu CAA -GCGGGGATAGCCAAGT--GGTCAAAGGCGAACGCCTCAAGAGCGTTTCTCG-----TAG-----GAGTTCAGGGGTTCGACTCCCTTTCCCCGCA---
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D00007224 Bartonella_quintana_str._Toulouse Leu CAA -GCGGGTGTGGTGGAACT-GGTA-GACGCGCCAGACTCAAAATCTGGTTCC------GAGA-----GGAGTGTCGGTTCGAGTCCGACCACCCGCACCA
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D00007011 Coxiella_burnetii_RSA_493 Leu CAA -GCCGAGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCGCCGGACTCAAAATCCGGTGGTG-----GCAA----CACCGTGAGGGTTCGAGTCCCTCCCTCGGTACCA
D00006538 Deinococcus_radiodurans_R1 Leu CAA -GCCGATATGGCGGAATT-GGTA-GACGCACTCGACTCAAAATCGAGCGGG------AAA------CCG-TAAGGGTTCGAGTCCCTTTATCGGCACCA
D00007180 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Leu CAA -GCCGGAATGGTGGAATT-GGTA-GACGCAGCGGACTCAAAATCCGCCGGTG-----GCAA----CACCTTGTCAGTTCGAGTCTGACTTCCGGTACCA
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D00006497 Escherichia_coli_K12 Leu CAA -GCCGAAGTGGCGAAATC-GGTA-GACGCAGTTGATTCAAAATCAACCGTA------GAAA-----TACGTGCCGGTTCGAGTCCGGCCTTCGGCACCA
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D00006831 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Leu CAA -GCCTGAGTGGTGGAATT-GGTA-GACGCACCAGACTCAAAATCTGGAATTC-----TTCG----GAATGTGCGGGTTCAAGTCCCGCCTCAGGCACCA
D00007126 Geobacter_sulfurreducens_PCA Leu CAA -GCCGGAGTGGTGAAACT-GGTA-GACGCAGCGGACTCAAAATCCGCCGGGGG----CAA----CCCCG-TGTCGGTTCGATTCCGACCTCCGGCACCA
D00001548 Haemophilus_influenzae Leu CAA -GCCTGGGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCAGCGGATTCAAAATCCGCCGTTG-----AAT-----AAACGTGTCGGTTCGAGTCCGACCCTAGGCACCA
D00006521 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Leu CAA -GCCTGGGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCAGCGGATTCAAAATCCGCCGTTG-----AAT-----AAACGTGTCGGTTCGAGTCCGACCCTAGGCACCA
D00001524 Helicobacter_pylori Leu CAA -GCCGAAGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTAGACTCAAAATCTGGTGGGA-----GCAA----TCCCGTGTCGGTTCGAGTCCGACCTTCGGCACCA
D00006513 Helicobacter_pylori_26695 Leu CAA -GCCGAAGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTAGACTCAAAATCTGGTGGGA-----GCAA----TCCCGTGTCGGTTCGAGTCCGACCTTCGGCACCA
D00006517 Helicobacter_pylori_J99 Leu CAA -GCCGAAGTGGTGGAATT-GGTA-GACACGCTAGACTCAAAATCTGGTGGGA-----GCAA----TCCCGTGTCGGTTCGAGTCCGACCTTCGGCACCA
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D00006682 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Leu TAA -GCGGGGGTTGCCGAGCCAGGAA-AAGGCGCAGGGCTTAAGACCCTGTCCCG-----AAG-----GGGTCCGCGGGTTCGAATCCCGCCCCCCGCA---
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D00001492 Methanocaldococcus_jannaschii Leu TAA -GCAGGGGTCGCCAAGCCTGGCCAAAGGCGCCGGACTTAAGATCCGGTCCCG-----TAG-----GGGTTCGGGGGTTCAAATCCCCTCCCCTGCA---
D00006693 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Leu TAA -GCAGGGGTCGCCAAGCCTGGCCAAAGGCGCCGGACTTAAGATCCGGTCCCG-----TAG-----GGGTTCGGGGGTTCAAATCCCCTCCCCTGCACC-
D00011850 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Leu TAA -GCAGGGGTTGCCAAGCCTGGCCAACGGCGCTGGACTTAAGATCCAGTCTCA-----TAG-----GAGTTCGGGGGTTCAAATCCCTTCCCCTGCA---
D00006696 Methanococcus_maripaludis Leu TAA -GGAGGGATTGCCAAGCCTGGTCAAAGGCGTCGGACTTAAGATCCGATCCGG-----TAG-----CGGTTCGAGGGTTCAAATCCCTTTCCCTCC----
D00006900 Methanopyrus_kandleri_AV19 Leu TAA -GCGGGGGCGCCCGAGCCTGGTCGAAGGGGGCGGACTTAAGATCCGCTGGCCG----TAG----GGCCGTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCCCCGCACCA
D00011916 Methanosarcina_acetivorans_C2A Leu TAA -GCGAGGGTTGCCCAGCCAGGCCAAAGGCGCCAGACTTAAGATCTGGTATCG-----AAG-----GATTTCGTGGGTTCGAATCCCACCCCTCGCA---
D00006836 Methanosarcina_mazei_Go1 Leu TAA -GCGAGGGTTGCCCAGCCAGGCCAAAGGCGTCGGACTTAAGATCCGATATCG-----AAG-----GATTTCGTGGGTTCGAATCCCACCCCTCGCA---
D00011930 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Leu TAA -GCGAGGGTACCAAAGCCTGGCCAAATGGGCCGGACTTAAGATCCGGTTTCG-----AAG-----GAATCCAAGGGTTCAAATCCCTTCCCTCGCA---
D00006690 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Leu TAA -GCAGGGGTGCCCGAGC--GGCCAAAGGGGGAGGACTTAAGATCCTCTGGCG-----CAGG----CCTT-CGAGGGTTCGAATCCCTTCCCCTGCA---
D00011997 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Leu TAA -GCGGCCGTGCCCGAGCT-GGCCAAAGGGGTCGGGCTTAAGACCCGATGGGG-----TAGT----CCCTGCCGGGGTTCGAATCCCCGCGGCCGCA---
D00006702 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Leu TAA -GCGGGGGTGCCCGAGCCAGGTCAAAGGGGCAGGGCTTAAGACCCTGTGGCG-----TAGG----CCTG-CGTGGGTTCAAATCCCACCCCCCGCACCA
D00006707 Pyrococcus_abyssi_GE5 Leu TAA -GCGGGGGTGCCCGAGCCTGGCCAAAGGGGCCGGACTTAAGATCCGGTGCC------GTAG-----GCTGCGCGGGTTCGAATCCCGCCCCCCGCACC-
D00006712 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Leu TAA -GCGGGGGTGCCCGAGCCTGGCCAAAGGGGCCGGACTTAAGATCCGGTGCCG-----TAG-----GGCTGCGCGGGTTCGAATCCCGCCCCCCGCACC-
D00006717 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Leu TAA -GCGGGGGTGCCCGAGCCTGGCCAAAGGGGCCGGACTTAAGATCCGGTGCCG-----TAG-----GGCTGCGCGGGTTCGAATCCCGCCCCCCGCACCA
D00012026 Staphylothermus_marinus_F1 Leu TAA -GCGGGGGTGCCCGAGCCTGGTCAAAGGGGGCGGACTTAAGATCCGCTGGCG-----TAGG----CCTG-CGTGGGTTCAAATCCCACCCCCCGCACCA
D00012059 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Leu TAA -GCGGGGGTGCCCGAGCA-GGTCAAAGGGGGCGGACTTAAGATCCGCTGGCG-----TAGG----CCTG-CGTGGGTTCAAATCCCACCCCCCGCA---
D00006722 Sulfolobus_solfataricus_P2 Leu TAA -GCGGGGGTGCCCGAGCCTGGTCAAAGGGGGCGGACTTAAGATCCGCTGGCG-----AAGG----CCTG-CACGGGTTCAAATCCCGTCCCCCGC----
D00006870 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Leu TAA -GCGGGGGTGCCCGAGCT-GGTCAAAGGGGGCGGACTTAAGATCCGCTGGCG-----AAGG----CCTG-CGTGGGTTCAAGTCCCACCCCCCGCA---
D00006727 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Leu TAA -GCGAGGGTAACTAAGCCAGGCCAACAGTGCAGGACTTAAGATCCTGTCCCG-----AAG-----GGGTTCGCGGGTTCAAATCCCGCCCCTCGCA---
D00006732 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Leu TAA -GCGAGGGTAACTAAGCCAGGCCAACAGTGCAGGACTTAAGATCCTGTCCCG-----CAG-----GGGTTCGCGGGTTCAAATCCCGCCCCTCGCA---
D00001509 Acholeplasma_laidlawii Leu TAA -GCCCGGGTGGTGAAATC-GGTA-GACACGCAGGACTTAAAATCCTGTGGCA-----TAAA----AGCCATGTCGGTTCAAGTCCGACCCCGGGCACCA
D00007211 Acinetobacter_sp._ADP1 Leu TAA -GCCCGGGTGGTGAAATA-GGTA-GACACAGGGGATTTAAAATCCCCCGCCC-----TCA-----AAGCGTGCCGGTTCGAGTCCGGCCCCGGGCACCA
D00006659 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Leu TAA -GCCCGCATGGTGAAATT-GGTA-AACACATCGCACTTAAAATGCGCCGCC------TCT------GGCTTGCCGGTTCAAGTCCGGCTGCGGGCACCA
D00006583 Aquifex_aeolicus_VF5 Leu TAA -GGGGGTGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCGGGGGACTTAAAATCCCCTGGGCG----AAA----AGCCCGTGAGGGTTCGACTCCCTCCACCCCCACCA
D00001543 Azoarcus_sp._BH72 Leu TAA -GCCGGGCTGGCGGAATC-GGTA-GACACAACGGATTTAAAATCCTGCGGTAG----GTGA---CTACCGTGCCGGTTCAAGTCCGGCCCTCGGCA---
D00007068 Bacillus_anthracis_str._Ames Leu TAA -GCCGGGGTGGCGGAACA-GGCA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGTGG----GTGA---CCACCGTGCGGGTTCGACCCCCGCCCTCGGCACCA
D00007119 Bacillus_anthracis_str._Sterne Leu TAA -GCCGGGGTGGCGGAACA-GGCA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGTGG----GTGA---CCACCGTGCGGGTTCGACCCCCGCCCTCGGCACCA
D00007173 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Leu TAA -GCCGGGGTGGCGGAACA-GGCA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGTGG----GTGA---CCACCGTGCGGGTTCGACCCCCGCCCTCGGCACCA
D00007174 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Leu TAA -GCCGGGGTGGCGGAACA-GGCA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGTGG----GTGA---CCACCGTGCGGGTTCGACCCCCGCCCTCGGCACCA
D00007016 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Leu TAA -GCCGGGGTGGCGGAACA-GGCA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGTGG----GTGA---CCACCGTGCGGGTTCGACCCCCGCCCTCGGCACCA
D00006957 Bacillus_halodurans_C-125 Leu TAA -GCCGGGGTGGTGGAATT-GGCA-GACACACAGGACTTAAAATCCTGCGGTAG----GTGA---CTACCGTGCCGGTTCAAGTCCGGCCCTCGGCACCA
D00006958 Bacillus_halodurans_C-125 Leu TAA -GCCGGGGTGGTGGAATT-GGCA-GACACACAGGACTTAAAATCCTGCGGTAG----GTGA---CTACCGTGCCGGTTCGAGTCCGGCCCTCGGCACCA
D00001528 Bacillus_subtilis Leu TAA -GCCGGGGTGGTGGAATT-GGCA-GACACACAGGACTTAAAATCCTGCGGTAG----GTGA---CTACCGTGCCGGTTCAAGTCCGGCCCTCGGCA---
D00001529 Bacillus_subtilis Leu TAA -GCCGGGGTGGTGGAATT-GGCA-GACACACAGGACTTAAAATCCTGCGGTAG----GTGA---CTACCGTGCCGGTTCAAGTCCGGCCCTCGGCACCA
D00006450 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Leu TAA -GCCGGGGTGGTGGAATT-GGCA-GACACACAGGACTTAAAATCCTGCGGTAG----GTGA---CTACCGTGCCGGTTCAAGTCCGGCCCTCGGCA---
D00006451 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Leu TAA -GCCGGGGTGGTGGAATT-GGCA-GACACACAGGACTTAAAATCCTGCGGTAG----GTGA---CTACCGTGCCGGTTCAAGTCCGGCCCTCGGCACCA
D00007216 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Leu TAA -GCCGGGGTGGCGGAACA-GGCA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGTGG----GTGA---CCACCGTGCGGGTTCGACCCCCGCCCTCGGCACCA
D00007059 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Leu TAA -GCTCGAATGGTGGAAT--GGTA-GACACGAAGGACTTAAAATCCTTTGGCCA----TTG----CGGCTGTGCGGGTTCAAGTCCCGCTTCGAGTA---
D00007072 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Leu TAA -GCGGACGTGATGAAATC-GGTA-AACATAGCAGACTTAAAATCTGCCGGTC-----TAA-----GACCTTGCGGGTTCAAGTCCCGCCGTCCGCACCA
D00007227 Bartonella_quintana_str._Toulouse Leu TAA -GCGGATGTGATGAAATC-GGTA-AACATAGCAGACTTAAAATCTGCCGGTC-----TAA-----GACCTTGCGGGTTCAAGTCCCGCCGTCCGCACCA
D00007077 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Leu TAA -GCCCCGGTGGCGAAATC-GGTA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGAGCTTCGT--TTAA-ACGGGCG-TGCCGGTTCAAGTCCGGCCCGGGGCACCA
D00006906 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Leu TAA -GCCTCCGTGGCGAAAT--GGTA-TACGCAGTCGACTTAAAATCGATCGC-------TTCG------GCTTGTGGGTTCGAGTCCCACCGGAGGCA---
D00001518 Borrelia_burgdorferi Leu TAA -GCCGAAGTGGTGGAATT-GGTA-GACACACAGGACTTAAAATCCTGAGGAG-----GAAG----CTCG-TACCGGTTCAAGTCCGGTCTTCGGTA---
D00006527 Borrelia_burgdorferi_B31 Leu TAA -GCCGAAGTGGTGGAATT-GGTA-GACACACAGGACTTAAAATCCTGAGGAG-----GAAG----CTCG-TACCGGTTCAAGTCCGGTCTTCGGTA---
D00007123 Borrelia_garinii_PBi Leu TAA -GCCGAAGTGGTGGAAGT-GGTA-GACACACAGGACTTAAAATCCTGAGGAG-----GAAG----CTCCGTACCGGTTCAAGTCCGGTCTTCGGTA---
D00006965 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Leu TAA -GCGGGCATGGCGGAATT-GGTA-GACGCAAGGGACTTAAAATCCCTCGGTGC----GCAA---GCGCTGTGCCGGTTCGACCCCGGCTGCCCGCACCA
D00006623 Brucella_melitensis_16M Leu TAA -GCGGTCGTGGCGAAATT-GGTA-TACGCAACGGACTTAAAATCCGTCGTCT-----TTA-----AGACTTGCGGGTTCAAGTCCCGCCGACCGCACCA
D00006911 Brucella_suis_1330 Leu TAA -GCGGTCGTGGCGAAATT-GGTA-TACGCAACGGACTTAAAATCCGTCGTCT-----TTA-----AGACTTGCGGGTTCAAGTCCCGCCGACCGCACCA
D00006455 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Leu TAA -GCCCGGATGGTGAAATT-GGTA-GACACAAGGGACTTAAAATCCCTCGGCC-----TTAT----GGCTTTGCGGGTTCAAGTCCCGCTCCGGGTA---
D00007020 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Leu TAA -GCCCGGATGGTGAAATC-GGTA-AACACAAGGGATTTAAAATCCCTCGGCC-----TTAT----GGCTTTGCGGGTTCAAGTCCCGCTCCGGGTA---
D00006838 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Leu TAA -GCCCGGATGGTGAAATT-GGTA-GACACAAGGGACTTAAAATCCCTCGGCTT----TTA----AAGCTTTGCGGGTTCAAGTCCCGCTCCGGGTACCA
D00006531 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Leu TAA -GCCCGGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACAAGGGACTTAAAATCCCTCGGAAT----TTTT---CTTCCGTGCCGGTTCAAGTCCGGCCTCGGGCACCA
D00007232 Candidatus_Blochmannia_floridanus Leu TAA -GCCCGGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACAAGGGACTTAAAATCCCTCAGTT-----TTA-----TACTGTACGAGTTCAAGTCTCGTCCCGGGTA---
D00007097 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Leu TAA -GCTCGGGTGGTGGAAT--GGTA-GACACAAGAGACTTAAAATCTCTTGCTCA----TTT----TGGGCGTGAAGGTTCGAGTCCTTTCCCGAGCA---
D00006536 Caulobacter_crescentus_CB15 Leu TAA -GGGGACGTGGCGGAATC-GGTA-GACGCGCCGGACTTAAAATCCGTTGGA------GCAA-----TCCGTGTGGGTTCGAGTCCCACCGTCCCTACCA
D00006602 Chlamydia_muridarum_Nigg Leu TAA -GCTCAGATGGTGGAAT--GGTA-GACACTAGGGACTTAAAATCCCTTGGGC-----TTTG----GCCCGTGCAAGTTCGAGTCTTGTTCTGAGCA---
D00006445 Chlamydia_trachomatis Leu TAA -GCTCAGATGGTGGAAT--GGTA-GACACTAGGGACTTAAAATCCCTTGGGC-----GTAG----GCCCGTGCAAGTTCGAGTCTTGTTCTGAGC----
D00006440 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Leu TAA -GCTCAGATGGTGGAAT--GGTA-GACACTAGGGACTTAAAATCCCTTGGGC-----TTTG----GCCCGTGCAAGTTCGAGTCTTGTTCTGAGCA---
D00006430 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Leu TAA -GCTCAGATGGTGGAAT--GGTA-GACACTAGGGACTTAAAATCCCTTGGGC-----GTAG----GCCCGTGCAAGTTCGAGTCTTGTTCTGAGCA---
D00006435 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Leu TAA -GCTCAGATGGTGGAAT--GGTA-GACACTAGGGACTTAAAATCCCTTGGGC-----GTAG----GCCCGTGCAAGTTCGAGTCTTGTTCTGAGCA---
D00006495 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Leu TAA -GCTCAGATGGTGGAAT--GGTA-GACACTAGGGACTTAAAATCCCTTGGGC-----GTAG----GCCCGTGCAAGTTCGAGTCTTGTTCTGAGCA---
D00006823 Chlorobium_tepidum_TLS Leu TAA -GCCGAAGTAGCGGAACT-GGTA-AACGCCCGAGACTTAAAATCCCGTGTTCA----GCAA---TGGACGTGCAGGTTCGATTCCTGCCTTCGGCACCA
D00006824 Chlorobium_tepidum_TLS Leu TAA -GCCGAAGTGGCGGAACT-GGTA-GACGCCCGGGACTTAAAATCCCGTGTTCA----GCAA---TGGACGTGCGGGTTCGATTCCCGCCTTCGGCA---
D00006616 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Leu TAA -GCCGAAGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGATGCT---AAT---CACATCGTACCGGTTCGATTCCGGTCTTCGGCACCA
D00006593 Clostridium_perfringens_str._13 Leu TAA -GCCGAAGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGTGC----TAAC---ACACCGTACCGGTTCGATTCCGGTCTTCGGCACCA
D00006598 Clostridium_perfringens_str._13 Leu TAA -GCCGAAGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGATGC----TAAC---ACATCGTACCGGTTCGATTCCGGTCTTCGGCACCA
D00006966 Clostridium_tetani_E88 Leu TAA -GCCGAAGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGTGTT---TTGA--AGCACCGTACCGGTTCGATTCCGGTCTTCGGCACCA
D00007081 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Leu TAA -GCCCCCATAGCCCAATC-GGCA-GAGGCAATCGACTTAAAATCGATTC-------------------AGTGTGGGTTCGAGTCCCACTGGGGGCACCA
D00006913 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Leu TAA -GCCCCCATAGCCCAATC-GGCA-GAGGCGGTTGACTTAAAATCAATTC-------------------AGTGTGGGTTCGAGTCCCACTGGGGGCA---
D00006845 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Leu TAA -GCCCCCATAGCCCAATC-GGCA-GAGGCGGTTGACTTAAAATCAATAC-------------------AGTGTGGGTTCGAGTCCCACTGGGGGCACCA
D00007013 Coxiella_burnetii_RSA_493 Leu TAA -GCCCGGGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCAAGGGACTTAAAATCCCTCGGGTG----AAT----AACCCGTGCCGGTTCGAGTCCGGCCCCGGGCACCA
D00006541 Deinococcus_radiodurans_R1 Leu TAA -GTCGGGATGGCGGAATC-GGTA-GACGCATTCGACTTAAAATCGACCGAG------GCAA-----CTCGTGCGGGTTCAAGTCCCGTTCCCGGCACCA
D00007176 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Leu TAA -GCCCGGATGGCGGAACT-GGCA-GACGCAAGGGACTTAAAATCCCTCGGCC-----TTCG----GGCTGTACGAGTTCAATCCTCGTTCCGGGTACCA
D00006971 Enterococcus_faecalis_V583 Leu TAA -GCCGGGGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGTGA----GTGA---TCACCGTACCGGTTCGATTCCGGTCCTCGGCA---
D00001537 Escherichia_coli Leu TAA -GCCCGGATGGTGGAATC-GGTA-GACACAAGGGATTTAAAATCCCTCGGCG-----TTCG----CGCTGTGCGGGTTCAAGTCCCGCTCCGGGTACCA
D00007024 Escherichia_coli_CFT073 Leu TAA -GCCCGGATGGTGGAATC-GGTA-GACACAAGGGATTTAAAATCCCTCGGCG-----TTCG----CGCTGTGCGGGTTCAAGTCCCGCTCCGGGTACCA
D00006501 Escherichia_coli_K12 Leu TAA -GCCCGGATGGTGGAATC-GGTA-GACACAAGGGATTTAAAATCCCTCGGCG-----TTCG----CGCTGTGCGGGTTCAAGTCCCGCTCCGGGTACCA
D00006506 Escherichia_coli_O157:H7 Leu TAA -GCCCGGATGGTGGAATC-GGTA-GACACAAGGGATTTAAAATCCCTCGGCG-----TTCG----CGCTGTGCGGGTTCAAGTCCCGCTCCGGGTACCA
D00006511 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Leu TAA -GCCCGGATGGTGGAATC-GGTA-GACACAAGGGATTTAAAATCCCTCGGCG-----TTCG----CGCTGTGCGGGTTCAAGTCCCGCTCCGGGTACCA
D00006829 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Leu TAA -GCCTGGATGGCGGAATA-GGTA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGTGGTAC----TTA----GTACCGTGCCGGTTCGATTCCGGCTCTAGGCACCA
D00007129 Geobacter_sulfurreducens_PCA Leu TAA -GCCCGGATGGTGGAACT-GGTA-GACACAAGGGATTTAAAATCCCTCGGCA-----GCAA----TGCTGTGCCGGTTCGAGCCCGGCTCCGGGCACCA
D00001545 Haemophilus_influenzae Leu TAA -GCCCGAGTGGTGGAATC-GGTA-GACACAAGGGATTTAAAATCCCTCGCCT-----TTCG----ACGCGTGCCAGTTCAAGTCTGGCTTCGGGCACCA
D00001546 Haemophilus_influenzae Leu TAA -GCCCGAGTGGTGGAATC-GGTA-GACACAAGGGATTTAAAATCCCTCGCCT-----TTCG----AGGCGTGCCAGTTCAAGTCTGGCTTCGGGCACCA
D00006523 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Leu TAA -GCCCGAGTGGTGGAATC-GGTA-GACACAAGGGATTTAAAATCCCTCGCCT-----TTCG----AGGCGTGCCAGTTCAAGTCTGGCTTCGGGCACCA
D00001523 Helicobacter_pylori Leu TAA -GCCCAGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACAAGGGACTTAAAATCCCTCGGTA-----GCAA----TACCGTGCCGGTTCAAGTCCGGCTTTGGGCACCA
D00006515 Helicobacter_pylori_26695 Leu TAA -GCCCAGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACAAGGGACTTAAAATCCCTCGGTA-----GCAA----TACCGTGCCGGTTCAAGTCCGGCTTTGGGCACCA
D00006519 Helicobacter_pylori_J99 Leu TAA -GCCCAGGTGGTGGAATT-GGTA-GACACAAGGGACTTAAAATCCCTCGGTA-----GCAA----TACCGTGCCGGTTCAAGTCCGGCTTTGGGCACCA
D00007132 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Leu TAA -GCCGGGGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCACGGGACTTAAAATCCCGCGGTTG----GTGA---CAACCGTACCGGTTCGATTCCGGTCCTCGGCA---
D00006976 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Leu TAA -GCCGGGGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGTTA----GTGA---TAACCGTACCGGTTCGATCCCGGTCCTCGGCA---
D00007139 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Leu TAA -GCCCCCATAGCCCAATC-GGCA-GAGGCAGGCGACTTAAAATCGCTTC-------------------AGTGTGGGTTCGAATCCCGCTGGGGGCA---
D00006918 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Leu TAA -GCCTGGATGGTGGAAT--GGTA-GACACCCAGGACTTAAAATCCTGTGAGA-----GCAA----TCTCGTGCGAGTTCGAGTCTCGCTCCAGGTACCA
D00006586 Listeria_innocua_Clip11262 Leu TAA -GCCGGGGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGATA----GTGA---TATCCGTACCGGTTCGATTCCGGTCCTCGGCA---
D00006590 Listeria_monocytogenes_EGD-e Leu TAA -GCCGGGGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGATA----GTGA---TATCCGTACCGGTTCGATTCCGGTCCTCGGCA---
D00007183 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Leu TAA -GCCGGGGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGATA----GTGA---TATCCGTACCGGTTCGATTCCGGTCCTCGGCA---
D00007188 Mesoplasma_florum_L1 Leu TAA -CCCCAAGTGGCGGAATC-GGTA-GACGCAGTGGACTTAAAATCCACCGGGCT----TTAT---CTCCCGTGCCAGTTCAAGTCTGGCCTTGGGGACCA
D00006626 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Leu TAA -GCGGACGTGGCGGAATT-GGTA-GACGCAAGGGACTTAAAATCCCTCGATC-----TCT-----GATCGTACGGGTTCGATTCCCGTCGTCCGCACCA
D00007002 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Leu TAA -GCCCCCATAGCCCAATT-GGCA-GAGGCAGCGGACTTAAAATCCGTCA-------------------AGTGTCGGTTCGAGTCCGACTGGGGGCA---
D00006487 Mycobacterium_leprae_TN Leu TAA -GCCCCCATAGCCCAATT-GGCA-GAGGCAGCGGACTTAAAATCCGTCA-------------------AGTGTCGGTTCGAGTCCGACTGGGGGCA---
D00006460 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Leu TAA -GCCCCCATAGCCCAATT-GGCA-GAGGCAGCGGACTTAAAATCCGTCA-------------------AGTGTCGGTTCGAGTCCGACTGGGGGCA---
D00007090 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Leu TAA -GCCCCCATAGCCCAATT-GGCA-GAGGCAGCGGACTTAAAATCCGTCA-------------------AGTGTCGGTTCGAGTCCGACTGGGGGCA---
D00001499 Mycoplasma_capricolum Leu TAA -CCCCAAGTGGCGGAATA-GGTA-GACGCATTGGACTTAAAATCCAACGGGCT----TAAT---ATCCTGTGCCGGTTCAAGTCCGGCCTTGGGGACCA
D00006999 Mycoplasma_gallisepticum_R Leu TAA -GCCCAAGTGACGGAAT--GGTA-GACGTACAGGACTTAAAATCCTGGGGTA-----GCGA----TACCGTGCCGGTTCAAGTCCGGCTTTGGGCACCA
D00001501 Mycoplasma_genitalium Leu TAA -GCCCAAGTGGCGGAAT--GGTA-GACGCATGGGATTTAAGATCCCACGCCA-----GTAA----TGGTGTGCCGGTTCAAGTCCGGCTTTGGGCACCA
D00006545 Mycoplasma_genitalium_G37 Leu TAA -GCCCAAGTGGCGGAAT--GGTA-GACGCATGGGATTTAAGATCCCACGCCA-----GTAA----TGGTGTGCCGGTTCAAGTCCGGCTTTGGGCACCA
D00001504 Mycoplasma_pneumoniae Leu TAA -GCCCAAGTGGCGGAAT--GGTA-GACGCATGGGATTTAAGATCCCACGCTA-----GCAA----TAGCGTGCCGGTTCAAGTCCGGCTTTGGGCACCA
D00006549 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Leu TAA -GCCCAAGTGGCGGAAT--GGTA-GACGCATGGGATTTAAGATCCCACGCTA-----GCAA----TAGCGTGCCGGTTCAAGTCCGGCTTTGGGCACCA
D00006656 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Leu TAA -GCCCGGGTGGCGGAATA-GGTA-GACGCAGGGGACTTAAAATCCCCCGGCA-----GTAG----TGCCGTGCTGGTTCAATTCCAGTTCCGGGTACCA
D00006465 Neisseria_meningitidis_MC58 Leu TAA -GCCCGGGTGGTGAAATA-GGTA-GACACAACGGACTTAAAATCCGTCGGGACT---AAA---CATCCCGTGCCGGTTCGATTCCGGCTCCGGGCACCA
D00006470 Neisseria_meningitidis_Z2491 Leu TAA -GCCCGGGTGGTGAAATA-GGTA-GACACAACGGACTTAAAATCCGTCGGGACT---AAA---CATCCCGTGCCGGTTCGATTCCGGCTCCGGGCACCA
D00007050 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Leu TAA -GCCCGGGTGGTGAAATT-GGTA-GACACAAGGGACTTAAAATCCCTCGGACA----TTAA---CGTCCGTGCCGGTTCGATTCCGGCCCCGGGCACCA
D00006646 Nostoc_sp._PCC_7120 Leu TAA -ACCCCTGTGATGCAATT-GGCA-GACATGACCTGCTTAAAACGGGTTT-------------------TCTACAGGTTCAAATCCTGTCAGGGGTA---
D00006654 Nostoc_sp._PCC_7120 Leu TAA -GGGGGTGTGGCGGAAT--GGTA-GACGCTACGGACTTAAAATCCGTTGACCT----TAAA---CGGTCGTGTGGGTTCAAGTCCCTCCACCCCCA---
D00006924 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Leu TAA -GCCGGGGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGTAG----GTGA---CTACCGTACCGGTTCGATTCCGGTCCTCGGCACCA
D00007087 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M Leu TAA -GCCTGGATGGTGGAATC-GGTA-GACACGTGGGACTTAAAATCCCATGGTT-----TAT-----AGCCGTGTCGGTTCAAGTCCGACTCCAGGTACCA
D00006552 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Leu TAA -GCCCGAGTGGTGAAATC-GGTA-GACACAAGGGATTTAAAATCCCTCGCTT-----TTCG----AAGCGTGCCAGTTCAAGTCTGGCCTCGGGCACCA
D00007100 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Leu TAA -GCCCAGGTGGTGAAATC-GGTA-GACACAAGGGATTTAAAATCCCTCGGCT-----GTAA----GGCTGTGCGGGTTCAAGTCCCGCCCTGGGCACCA
D00007140 Porphyromonas_gingivalis_W83 Leu TAA -GCCCGGATGGTGGAAT--GGTA-GACACGAAGGACTTAAAATCCTTTGGCCA----TTAT---CGGCTGTGCGGGTTCAAGTCCCGCTCCGGGTA---
D00007189 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Leu TAA -GCCCCCGTAGCCCAACC-GGCA-GAGGCAGACGGCTTAAACCCGTCCC-------------------AGTGCGGGTTCGAATCCCGTCGGGGGTA---
D00006562 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Leu TAA -GCCCGGATGGCGAAATC-GGTA-GACGCAAGGGACTTAAAATCCCTCGGGGG----TAA----CCCCG-TGCCGGTTCGACCCCGGCTCCGGGCACCA
D00007061 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Leu TAA -GCCCCGATGGCGAAATT-GGTA-GACGCAAGGGACTTAAAATCCCTCGTCC-----TTT-----GGACGTGCCGGTTCGACCCCGGCTCGGGGCACCA
D00006641 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Leu TAA -GCCCGAGTGGTGAAATT-GGTA-GACACCGCGGACTTAAAATCCGCTGCGCCC---TCAC--CGGCGCGTGCCGGTTCGACCCCGGCCTCGGGCACCA
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D00007049 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Leu TAA -GCTTAGATACGCCAACC-GGCC-GAGCGGCTCGACTTAAACCCGAGTG-------------------TTCGCAGGTTCGACTCCTGCTCTGGGCA---
D00007110 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Leu TAA -GCGGGCGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCAAGGGACTTAAAATCCCTCGGCTC----GAAA---GAGCTGTGCCGGTTCGACCCCGGCCGCCCGCACCA
D00006618 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Leu TAA -GCCCGCGTGATGGAAT--GGTA-GACATAACGGACTTAAAATCCGTGGAGC-----GTAA----GCTCTTGCCGGTTCAAGTCCGGCCGCGGGTACCA
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D00006944 Shigella_flexneri_2a_str._301 Leu TAA -GCCCGGATGGTGGAATC-GGTA-GACACAAGGGATTTAAAATCCCTCGGCG-----TTCG----CGCTGTGCGGGTTCAAGTCCCGCTCCGGGTACCA
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D00006980 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Leu TAA -GCCGGGGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGTGA----GAGA---TCACCGTACCGGTTCGATTCCGGTCCTCGGCACCA
D00006946 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Leu TAA -GCCGGGGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGATGG----TAA----ACATCGTACCGGTTCGATTCCGGTCCTCGGCA---
D00006856 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Leu TAA -GCCGGGGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGATGG----TAA----ACATCGTACCGGTTCGATTCCGGTCCTCGGCA---
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D00006605 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Leu TAA -GCCGGGGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGATGG----TTT----ACATCGTACCGGTTCGATTCCGGTCCTCGGCA---
D00006859 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Leu TAA -GCCGGGGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGATGG----TTT----ACATCGTACCGGTTCGATTCCGGTCCTCGGCA---
D00007007 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Leu TAA -GCCGGGGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGATGG----TTT----ACATCGTACCGGTTCGATTCCGGTCCTCGGCA---
D00007030 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Leu TAA -GCCCGGATGGTGGAAT--GCA--GACACGGCGAGCTTAAACCTCGCTGCCCC----TCG----CGGGCGTACCGGTTCAAGTCCGGTTCCGGGCA---
D00001519 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Leu TAA -GCCCGGATGGTGGAA---TGCA-GACACGGCGAGCTTAAACCTCGCTGCCCCT---TCG---AGGGCG-TGCCGGTTCAAGTCCGGCTCCGGGCACCA
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D00006568 Synechocystis_sp._PCC_6803 Leu TAA -GGGGGTGTGGCGGAAT--GGTA-GACGCTGCGGATTTAAAATCCGTTGAGCCT---TAT---AAGCTCGTGAGAGTTCGAGTCTCTCCACCCCCA---
D00006876 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Leu TAA -GCCGGAGTGGCGGAACT-GGCA-GACGCACAGGACTTAAAATCCTGGGGGCTG---AAT---AAGCCCGTACCGGTTCAAGTCCGGTCTCCGGCACCA
D00006866 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Leu TAA -GGGGGCGTGGCGGAAT--GGTA-GACGCTGCGGACTTAAGAAAATCCGTTGACC--TTAA-ACAAGTCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCCGCCCCCA---
D00006573 Thermotoga_maritima_MSB8 Leu TAA -GCCGGGGTGGCGGAATT-GGCA-GACGCAGCGGACTTAAAATCCGCTGGGGTT---CAC---AACCCCGTGTCGGTTCGAGTCCGATCCCCGGCACCA
D00007196 Thermus_thermophilus_HB27 Leu TAA -GCCGGGGTGGCGGAAC--GGTA-GACGCTGCGGACTTAAAATCCGCTGGGGGG---TAG---CCCCCG-TACGGGTTCGAGTCCCGTCCCCGGCACCA
D00007202 Treponema_denticola_ATCC_35405 Leu TAA -GCTGAAGTGGTGGAATA-GGTA-GACACTAGGGACTTAAAATCCCTTGGCA-----GTAA----TGCCGTACGGGTTCAATTCCCGTCTTCAGCA---
D00001510 Treponema_pallidum Leu TAA -GCTGGAGTGATGGAATT-GGTA-GACATCAGGGACTTAAAATCCCTTGACCG----GCAG---CGGTCGTACGAGTTCAAGTCTCGTCTCCAGCA---
D00006557 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Leu TAA -GCTGGAGTGATGGAATT-GGTA-GACATCAGGGACTTAAAATCCCTTGACCG----GCAG---CGGTCGTACGAGTTCAAGTCTCGTCTCCAGCA---
D00006987 Tropheryma_whipplei_str._Twist Leu TAA -GCCCTCGTAGCCCAATC-GGCA-GAGGCAGACGACTTAAAATCGTCCC-------------------AGTGTGGGTTCGAGTCCCACCGAGGGCA---
D00006992 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Leu TAA -GCCCTCGTAGCCCAATC-GGCA-GAGGCAGACGACTTAAAATCGTCCC-------------------AGTGTGGGTTCGAGTCCCACCGAGGGCA---
D00006490 Ureaplasma_parvum_serovar_3 Leu TAA -GCTGGAGTGGCGGAAT--GGTA-GACGCACTGGACTTAAAATCCAGTGACT-----TCAC----GGTCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTTCCAGCACCA
D00006476 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Leu TAA -GCCCTGGTGGTGAAATC-GGTA-GACACAAGGGATTTAAAATCCCTCGACT-----TTCG----AGTCGTGCCGGTTCAAGTCCGGCCCGGGGCACCA
D00007207 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Leu TAA -GCCCGTGTGGCGGAATC-GGTA-GACGCAGCGGACTTAAAATCCGTGGGTT-----TTGC----GACCTTGGGAGTTCAAGTCTCCCCATGGGCACCA
D00006887 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Leu TAA -GCCCGGGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCAAGGGACTTAAAATCCCTCAGCT-----GTGA----GGCTATGCGGGTTCGACCCCCGCCCCGGGCACCA
D00006880 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Leu TAA -GCCCGGGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCAAGGGACTTAAAATCCCTCAGCC-----GCAA----GGCTATGCGGGTTCGACCCCCGCCCCGGGCA---
D00006578 Xylella_fastidiosa_9a5c Leu TAA -GCCCGGGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCAAGGGACTTAAAATCCCTCGACC-----TTTA----GGTTATGCGGGTTCGACTCCCGCCCCGGGCACCA
D00006996 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Leu TAA -GCCCGGGTGGCGAAATT-GGTA-GACGCAAGGGACTTAAAATCCCTCGACC-----TTTA----GGTTATGCGGGTTCGACTCCCGCCCCGGGCACCA
D00007157 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Leu TAA -GCCCGGGTGGTGAAATC-GGTA-GACACAAGGGATTTAAAATCCCTCGGCT-----TAT-----GGCTGTGCGGGTTCAAGTCCCGCCCCGGGCACCA
D00006632 Yersinia_pestis_CO92 Leu TAA -GCCCGGGTGGTGAAATC-GGTA-GACACAAGGGATTTAAAATCCCTCGGCT-----TAT-----GGCTGTGCGGGTTCAAGTCCCGCCCCGGGCACCA
D00006898 Yersinia_pestis_KIM Leu TAA -GCCCGGGTGGTGAAATC-GGTA-GACACAAGGGATTTAAAATCCCTCGGCT-----TAT-----GGCTGTGCGGGTTCAAGTCCCGCCCCGGGCACCA
D00007165 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Leu TAA -GCCCGGGTGGTGAAATC-GGTA-GACACAAGGGATTTAAAATCCCTCGGCT-----TAT-----GGCTGTGCGGGTTCAAGTCCCGCCCCGGGCACCA
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D00006772 Arabidopsis_thaliana Leu TAA -GTCAGTATGGCCGAGT--GGTCTAAGGCGCCAGACTTAAGTTCTGGTCCTC-----TTAC----GAGGGCGTGGGTTCAAACCCCACTGCTGAC----
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D00006793 Caenorhabditis_elegans Leu TAA -AGCACGATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTTGGCCTTAAGTTCCAATGGTGG----ATA----ACACCGCGTGGGTTCGAACCCCACTCGTGCTA---
D00006794 Caenorhabditis_elegans Leu TAA -AGCACGATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTTGGACTTAAGTTCCAATGGTGG----ATA----ACACCTCGTGGGTTCGAACCCCACTCGTGCTA---
D00007167 Candida_glabrata_CBS_138 Leu TAA -GGAGGGTTGGCCGAGT--GGTCTAAGGCGGCAGACTTAAGATCTGTTGGAC-----GGTT----GTCCGCGCGAGTTCGAACCTCGCATCCTTCA---
D00001762 Cyanidium_caldarium Leu TAA -GGGGATGTGGTGGAAT--GGTA-GACACAACAGACTTAAAATCTGTTGATTCC---TTTT--TAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCCATCCCCA---
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D00001751 Dictyostelium_discoideum Leu TAA -GCAAGGGTAGGAAAGTCTGGTTAAATCCGTGTGACTTAAGATCTCATCCA------TTC------GGTTCGCGAGTTCGAATCTCGCCTCTTGCA---
D00006811 Drosophila_melanogaster Leu TAA -GTCAGGTTGGCCGAGC--GGTCTAAGGCGCCAGATTTAAGCTCTGGTTCTC-----GAGA----GGGAGCGTGGGTTCGAACCCCACACCTGAC----
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D00006813 Drosophila_melanogaster Leu TAA -GCCAGGTTGGCCGAGC--GGTCTAAGGCGCCAGATTTAAGCTCTGGTTCTC-----GAGA----GAGAGCGTGGGTTCGAACCCCACACCTGGC----
D00006814 Drosophila_melanogaster Leu TAA -GCCAGGTTGGCCGAGC--GGTCTAAGGCGCCAGATTTAAGCTCTGGTTCTC-----GTGA----GAGAGCGTGGGTTCGAACCCCACACCTGGC----
D00006891 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Leu TAA -GGTGGTGTGGCCGAGC--GGTCTAAGGCGGCAGACTTAAGATCTGTTATCG-----GGAG----ATAT-CGTGGGTTCGAATCCCATCGCCACCA---
D00007243 Gallus_gallus Leu TAA -ACCAGGATGGCCGAGT--GGTG-AAGGCGTTGGACTTAAGATCCAATGGGC-----GCAT----GCCCGCGTGGGTTCGAACCCCACTTCTGGTA---
D00007244 Gallus_gallus Leu TAA -ACCAGGATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTTGGACTTAAGATCCAATGGAC-----GTAT----GTCCGCGTGGGTTCGAACCCCACTCCTGGTA---
D00007245 Gallus_gallus Leu TAA -GTTCTGGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCAAAGGACTTAAAGCCCTTGAA-------ATCC------TT-CAGTGGTTCGAATCCACATCTGAGCG---
D00006752 Homo_sapiens Leu TAA -GTTAAGATGGCAGAGCCCGGCA-ATTGCATAAGACTTAAAACTTTATA-------------------ATCAGAGGTTCAACTCCTCTCATTAAC----
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D00006755 Homo_sapiens Leu TAA -ACCGGGATGGCTGAGT--GGTT-AAGGCGTTGGACTTAAGATCCAATGGAC-----AGGT----GTCCGCGTGGGTTCGAGCCCCACTCCCGGT----
D00006756 Homo_sapiens Leu TAA -ACCAGAATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTTGGACTTAAGATCCAATGGAT-----TCAT----ATCCGCGTGGGTTCGAACCCCACTTCTGGT----
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D00006758 Homo_sapiens Leu TAA -ACCAGGATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTTGGACTTAAGATCCAATGGAC-----ATAT----GTCCGCGTGGGTTCGAACCCCACTCCTGGT----
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D00007286 Pan_troglodytes Leu TAA -ACCAGGATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTTGGACTTAAGATCCAATGGAC-----ATAT----GTCCGCGTGGGTTCGAACCCCACTCCTGGTA---
D00007222 Plasmodium_falciparum_3D7 Leu TAA -GCACGGGTGCCCGAGT--GGTT-AAGGGGGTGGACTTAAGATCCTCTGGTC-----ACTA----GACCGCGTGGGTTCGAACCCCACCTCGTGCA---
D00001755 Saccharomyces_cerevisiae Leu TAA -GGAGGGTTGGCCGAGC--GGTCTAAGGCGGCAGACTTAAGATCTGTTGGAC-----GGTT----GTCCGCGCGAGTTCGAACCTCGCATCCTTCA---
D00001756 Saccharomyces_cerevisiae Leu TAA -GGAGGGTTGGCCGAGT--GGTCTAAGGCGGCAGACTTAAGATCTGTTGGAC-----GGTT----GTCCGCGCGAGTTCGAACCTCGCATCCTTCA---
D00006802 Saccharomyces_cerevisiae Leu TAA -GGAGGGTTGGCCGAGT--GGTCTAAGGCGGCAGACTTAAGATCTGTTGGAC-----GGTT----GTCCGCGCGAGTTCGAACCTCGCATCCTTCA---
D00006820 Schizosaccharomyces_pombe Leu TAA -GCGGCTATGCCCGAGT--GGTCTAAGGGGGCAGATTTAAGCCCTGCTGTT------GTAA-----AACGCGAGAGTTCGAACCTCTCTGGCCGC----
D00006821 Schizosaccharomyces_pombe Leu TAA -GCGGCTATGCCCGAGT--GGTCTAAGGGGGCAGATTTAAGCCCTGCTGTT------GTAA-----AACGCGAGAGTTCGAACCTCTCTGGCCGC----
D00007258 Takifugu_rubripes Leu TAA -GTTGTTGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTTAAAATCCATTGGGG-----TCT-----TCCTGCGTAGGGTCGAATCCTGCCATCAATG---
D00007259 Takifugu_rubripes Leu TAA -ACCAGAATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTTGGACTTAAGATCCAATGGAC-----GAAC----GTCCACGTGGGTTCGAGCCCCACTTCTGGTA---
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D00007261 Takifugu_rubripes Leu TAA -ACCAGGATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTTGGACTTAAGATCCAATGGAC-----AATT----GTCCACGTGGGTTCGAGCCCCACTCCTGGTA---
D00007262 Takifugu_rubripes Leu TAA -ACCAGGATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTTGGACTTAAGATCCAATGGAC-----GTAT----GTCCGCGTGGGTTCGAACCCCACTCCTGGTA---
D00004977 Aeropyrum_pernix_K1 Phe GAA -GCCGCCGTAGCTCAGC--GGG--AGAGCGCCCGGCTGAAGACCGGGTG-------------------GTCCGGGGTTCGAATCCCCGCGGCGGCACC-
D00000669 Archaeoglobus_fulgidus Phe GAA -GCCCGGGTAGCTCAGCCAGGG--AGAGCGTGCGGCTGAAGACCGCATA-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGTCCGGGCA---
D00004978 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Phe GAA -GCCCGGGTAGCTCAGCCAGGG--AGAGCGTGCGGCTGAAGACCGCATA-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGTCCGGGCA---
D00004979 Halobacterium_sp._NRC-1 Phe GAA -GCCGCCTTAGCTCAGACTGGG--AGAGCACTCGACTGAAGATCGAGCT-------------------GTCCCTGGTTCAAATCCGGGAGGCGGCA---
D00000670 Methanocaldococcus_jannaschii Phe GAA -GCCGCGGTAGTTCAGCCTGGG--AGAACGCTGGACTGAAGATCCAGTT-------------------GTCGGGTGTTCAAATCACCCCCGCGGCA---
D00004981 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Phe GAA -GCCGCGGTAGTTCAGCCTGGG--AGAACGCTGGACTGAAGATCCAGTT-------------------GTCGGGTGTTCAAATCACCCCCGCGGCACC-
D00011868 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Phe GAA -GCCGTGGTAGTTCAGCCTGGG--AGAACGCTGGACTGAAGATCCAGTT-------------------GTCGGGTGTTCGAATCACCCCCACGGCA---
D00004982 Methanococcus_maripaludis Phe GAA -GCCAAGGTAGTTCAGCCTGGG--AGAACGCTGGACTGAAGATCCAGTT-------------------GTCGGGTGTTCGAATCACCCCCTTGGCA---
D00000671 Methanococcus_vannielii Phe GAA -GCCAAGGTAGTTCAGCCTGGG--AGAACGCTGGACTGAAGATCCAGTT-------------------GTCGGGTGTTCGAATCACCCCCTTGGCA---
D00005031 Methanopyrus_kandleri_AV19 Phe GAA -GCCGCGGCAGCTCAGCCTGGG--AGAGCGCCGGACTGAAGATCCGGTG-------------------GGCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGCGGCACCA
D00011891 Methanosarcina_acetivorans_C2A Phe GAA -GCCCAGGTAGCTCAGT--GGG--AGAGCGCTGCCCTGAAGAGGCAGTT-------------------GTCCCCGGTTCGAATCCGGGTCTGGGCACCA
D00005016 Methanosarcina_mazei_Go1 Phe GAA -GCCCAGGTAGCTCAGT--GGG--AGAGCGCTGCCCTGAAGAGGCAGTT-------------------GTCCCCGGTTCGAATCCGGGTCTGGGCACCA
D00011959 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Phe GAA -GCCTCAGTAGCTCAGACTGGG--AGAGCGCCAGACTGAAGATCTGGTT-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGCTGAGGCA---
D00004980 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Phe GAA -GCCGTGGTAGTTCAGTT-GGG--AGAACGCCAGACTGAAGATCTGGAT-------------------GTCGCTGGTTCAAGTCCGGCCCACGGCA---
D00012011 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Phe GAA -GGGGCGGTAGCTCAGC--GGG--AGAGCGCCCGGCTGAAGACCGGGAG-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCCCCCGCCCCA---
D00004983 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Phe GAA -GCGGCCGTAGCTCAGC--GGG--AGAGCGCCCGGCTGAAGACCGGGCG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCGCACCA
D00004984 Pyrococcus_abyssi_GE5 Phe GAA -GGGGCGGTAGCTCAGCCTGGG--AGAGCACCGGACTGAAGATCCGGGT-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCCCCCGCCCCACC-
D00004985 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Phe GAA -GGGGCGGTAGCTCAGCCTGGG--AGAGCACCGGACTGAAGATCCGGGT-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCCCCCGCCCCACC-
D00004986 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Phe GAA -GGGGCGGTAGCTCAGCCTGGG--AGAGCACCGGACTGAAGATCCGGGT-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCCCCCGCCCCACCA
D00012047 Staphylothermus_marinus_F1 Phe GAA -GCCGCCGTAGCTCAGCCTGGG--AGAGCGCCCGGCTGAAGACCGGGTT-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCGGCGGCA---
D00012091 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Phe GAA -GCCGCCGTAGCTCAGCCCGGG--AGAGCGCCCGGCTGAAGACCGGGTT-------------------GTCCGGGGTTCAAGTCCCCGCGGCGGCA---
D00000672 Sulfolobus_solfataricus Phe GAA -GCCGCCGTAGCTCAGCCCGGG--AGAGCGCCCGGCTGAAGACCGGGTT-------------------GTCCGGGGTTCAAGTCCCCGCGGCGGCA---
D00004987 Sulfolobus_solfataricus_P2 Phe GAA -GCCGCCGTAGCTCAGCCCGGG--AGAGCGCCCGGCTGAAGACCGGGTT-------------------GTCCGGGGTTCAAGTCCCCGCGGCGGCA---
D00005024 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Phe GAA -GCCGCCGTAGCTCAGCCCGGG--AGAGCGCCCGGCTGAAGACCGGGTT-------------------GTCCGGGGTTCAAGTCCCCGCGGCGGCA---
D00004988 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Phe GAA -GCCGTGGTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCCAGACTGAAGATCTGGAG-------------------GTCGCTGGTTCGATCCCGGCCCACGGCA---
D00004989 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Phe GAA -GCCGTGGTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCCAGACTGAAGATCTGGAG-------------------GTCGCTGGTTCGATCCCGGCCCACGGCA---
D00000676 Acholeplasma_laidlawii Phe GAA -GGCTCTGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGTGGCCTGAAGAGCCTCGT-------------------CGTAG-GGTTCGATTCCGCTTGGAGCCACCA
D00005105 Acinetobacter_sp._ADP1 Phe GAA -GGCGCGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAACGGATTGAAAATCCGTGT-------------------GTCGGCAGTTCGATCCTGCCTCACGCCACCA
D00004974 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Phe GAA -GCCCGGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCGGATTGAAAATCCGCGT-------------------GTCGGTGGTTCAAATCCGCCTCCGGGCACCA
D00004956 Aquifex_aeolicus_VF5 Phe GAA -GGCCCGGTAGCTCAGGT-GGT--AGAGCACCCGGCTGAAAACCGGGGT-------------------GTCGGCGGTTCGACTCCGCCCTGGGCCACCA
D00005106 Bacillus_anthracis_str._A2012 Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGATCCACCA
D00005107 Bacillus_anthracis_str._A2012 Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGAGCCACCA
D00005108 Bacillus_anthracis_str._A2012 Phe GAA -AGGGGCATAGTTTAAA--GGT--AGAACTGAGGTCTGAAAACCTCCAG---------------------TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCCTGCCA
D00005067 Bacillus_anthracis_str._Ames Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGAGCCACCA
D00005068 Bacillus_anthracis_str._Ames Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGATCCACCA
D00005069 Bacillus_anthracis_str._Ames Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGAGCCA---
D00005079 Bacillus_anthracis_str._Sterne Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGAGCCACCA
D00005080 Bacillus_anthracis_str._Sterne Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGATCCACCA
D00005081 Bacillus_anthracis_str._Sterne Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGAGCCA---
D00005095 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGAGCCACCA
D00005096 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGAGCCACCA
D00005097 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGAGCCA---
D00005057 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGAGCCACCA
D00005058 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGAGCCA---
D00005041 Bacillus_halodurans_C-125 Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAATGGACTGAAAATCCATGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGAGCCACCA
D00000684 Bacillus_subtilis Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACGGACTGAAAATCCGTGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGAGCCACCA
D00000685 Bacillus_subtilis Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACGGACTGAAAATCCGTGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGAGCCA---
D00004921 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACGGACTGAAAATCCGTGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGAGCCA---
D00004922 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTT-GGT--AAAGCAACGGACTGAAAATCCGTGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGAGCCACCA
D00004923 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACGGACTGAAAATCCGTGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGAGCCACCA
D00005109 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGAGCCA---
D00005110 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGAGCCACCA
D00005065 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Phe GAA -GGTGCCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAAAGGACTGAAAATCCTTGT-------------------GTCCCCGGTTCGATTCCTGGTGGCACCA---
D00005070 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Phe GAA -GCCCAGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCGGACTGAAAATCCGCGT-------------------GTCCGTGGTTCGAATCCGCGTCTGGGCACCA
D00005112 Bartonella_quintana_str._Toulouse Phe GAA -GCCCAGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCGGACTGAAAATCCGCGT-------------------GTCCGTGGTTCGAATCCGCGTCTGGGCACCA
D00005071 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Phe GAA -GGCTTGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTTGT-------------------GTCGGCGGTTCAATTCCGTCTCAAGCCACCA
D00005032 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Phe GAA -GGCTCTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGAGCGACTGAAAATCGCTAG-------------------GTCAACGGATCGACGCCGTTCGGAGCCACCA
D00000679 Borrelia_burgdorferi Phe GAA -GCTGCTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATAGGACTGAAAATCCTTGT-------------------GTCAGGAGTTCGATTCTCCTCGGCAGCA---
D00000680 Borrelia_burgdorferi Phe GAA -GTCGCTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATAGGACTGAAAATCCTTGT-------------------GTCAGGAGTTCGATTCTCCTCGGCGACA---
D00004942 Borrelia_burgdorferi_B31 Phe GAA -GTCGCTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATAGGACTGAAAATCCTTGT-------------------GTCAGGAGTTCGATTCTCCTCGGCGACA---
D00004943 Borrelia_burgdorferi_B31 Phe GAA -GCTGCTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATAGGACTGAAAATCCTTGT-------------------GTCAGGAGTTCGATTCTCCTCGGCAGCA---
D00005082 Borrelia_garinii_PBi Phe GAA -GCTGCTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATAGGACTGAAAATCCTTGT-------------------GTCAGGAGTTCGATTCTCCTCGGCAGCA---
D00005083 Borrelia_garinii_PBi Phe GAA -GTCGCTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATAGGACTGAAAATCCTTGT-------------------GTCAGGAGTTCGATTCTCCTCGGCGACA---
D00005042 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Phe GAA -GCCCAGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATGCGACTGAAAATCGCAGT-------------------GTCGGTGGTTCGATTCCGCCCCTGGGCACCA
D00005043 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Phe GAA -GCAGGAGTAGCTCAT---GG---AGAGCGTCGGGCTGAACGCCCGAAG-------------------G-CATCGGTTCGATTCCGGTCTCTTGCACAA
D00004965 Brucella_melitensis_16M Phe GAA -GCCCGGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCGGATTGAAAATCCGCGT-------------------GTCGGTGGTTCGAATCCGCCTCCGGGCACCA
D00004924 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Phe GAA -GCCCGGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGGGGACTGAAAATCCCCGT-------------------GTCGGTGGTTCAATTCCGCCTCCGGGCA---
D00005059 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Phe GAA -GCCTGAATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGGTGGTTCGATTCCGCCTTCAGGCA---
D00005017 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Phe GAA -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGACTGAAAATCCCCGT-------------------GTCGGTGGTTCAATTCCGCCTCCGGGCA---
D00004944 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Phe GAA -GGTTGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGCAGACTGAAAATCTGCGT-------------------GTCGGCAGTTCGATTCTGCCTCTAACCACCA
D00005113 Candidatus_Blochmannia_floridanus Phe GAA -GCCCAGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAGATCCTCGT-------------------GTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCTGGGCACCA
D00005075 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Phe GAA -GGCCAGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTTGT-------------------GTCGCTGGTTCGATTCCAGTTCTGGCCA---
D00004945 Caulobacter_crescentus_CB15 Phe GAA -GCCTGGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCGGATTGAAAATCCGCGT-------------------GTCGCTGGTTCGATTCCGGCCCCAGGCACCA
D00004960 Chlamydia_muridarum_Nigg Phe GAA -GGCTAGATAGCTCAGCT-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAGATCCTTGT-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGGCTCTGGCCA---
D00004920 Chlamydia_trachomatis Phe GAA -GGCTAGATAGCTCAGAT-GGT--AGAGCAGAGGATTGAAGATCCTTGT-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGGCTCTGGCC----
D00004919 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Phe GAA -GGCTAGATAGCTCAGCT-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAGATCCTTGT-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGGCTCTGGCCA---
D00004917 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Phe GAA -GGCTAGATAGCTCAGAT-GGT--AGAGCAGAGGATTGAAGATCCTTGT-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGGCTCTGGCCA---
D00004918 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Phe GAA -GGCTAGATAGCTCAGAT-GGT--AGAGCAGAGGATTGAAGATCCTTGT-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGGCTCTGGCCA---
D00004933 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Phe GAA -GGCTAGATAGCTCAGAT-GGT--AGAGCAGAGGATTGAAGATCCTTGT-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGGCTCTGGCCA---
D00005014 Chlorobium_tepidum_TLS Phe GAA -GGACAGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAAAGGACTGAAAATCCTTGT-------------------GTCGGGGGTTCGATTCCCTCTCTGTCCACCA
D00004963 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Phe GAA -GGCCAGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCCCTGGTTCGATTCCTGGTCTGGCCACCA
D00004959 Clostridium_perfringens_str._13 Phe GAA -GGCTCGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGCTGGTTCGATTCCTGCTCGAGCCACCA
D00005044 Clostridium_tetani_E88 Phe GAA -GGCTCGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCCCTGGTTCGATTCCTGGTCGAGCCACCA
D00005072 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Phe GAA -GGCCAGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCACACGCCTGAAAAGTGTGGG-------------------GTCGCCAGTTCGATCCTGGCTCTGGCCA---
D00005033 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Phe GAA -GGCCAGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGTTCGCCTGAAAAGTGAAAG-------------------GTCGCCGGTTCGATCCCGGCTCTGGCCA---
D00005019 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Phe GAA --GCCAGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGTTCGCCTGAAAAGTGAAAG-------------------GTCGCCGGTTCGATCCCGGCTCTGGCCACCA
D00005056 Coxiella_burnetii_RSA_493 Phe GAA -GGCCAGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGGCAGTTCGATTCTGCCTCTGGCCACCA
D00004946 Deinococcus_radiodurans_R1 Phe GAA -GGCTAGGTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCAAACGACTGAAAATCGTTGG-------------------GTCGCCGGTTCAAGTCCGGCCCTGGCCACCA
D00005098 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Phe GAA -GCCGAGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGGGGACTGAAAATCCCCGT-------------------GTCGGGAGTTCAATTCTCTCCCTCGGCACCA
D00005045 Enterococcus_faecalis_V583 Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGT-------------------GTCGGCAGTTCGATTCTGTCCCGCGCCA---
D00005046 Enterococcus_faecalis_V583 Phe GAA -GGCGTGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACGGATTGAAGCTCCGTGT-------------------GTCGGCAGTTCGACTCTGTCTCACGCCA---
D00000686 Escherichia_coli Phe GAA -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCA
D00005060 Escherichia_coli_CFT073 Phe GAA -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCA
D00004934 Escherichia_coli_K12 Phe GAA -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCA
D00004935 Escherichia_coli_O157:H7 Phe GAA -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCCTTGGTTCAATTCCGAGTCCGGGCACCA
D00004936 Escherichia_coli_O157:H7 Phe GAA -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCA
D00004937 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Phe GAA -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCCTTGGTTCAATTCCGAGTCCGGGCACCA
D00004938 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Phe GAA -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCA
D00005015 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Phe GAA -GCCCAGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGACTGAAAATCCCCGT-------------------GTCGGTGGTTCGATTCCGCCTCTGGGCACCA
D00000689 Geobacillus_stearothermophilus Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTC-GGD--AGAGCAAAGGACTGAAAATCCTTGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGAGCCACCA
D00005084 Geobacter_sulfurreducens_PCA Phe GAA -GCCCAGATAGCTCAGCT-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCTGGGCACCA
D00000687 Haemophilus_influenzae Phe GAA -CCCTCGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCGGTGGTTCGATTCCGCCTCGAGGCACCA
D00000688 Haemophilus_influenzae Phe GAA -GCCTCGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCGGTGGTTCGATTCCGCCTCGAGGCACCA
D00004941 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Phe GAA -GCCTCGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCGGTGGTTCGATTCCGCCTCGAGGCACCA
D00000682 Helicobacter_pylori Phe GAA -GGCTTGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAAGACTGAAAATCTTCGT-------------------GTCGGTGGTTCGATTCCGCCTCAAGCCACCA
D00004939 Helicobacter_pylori_26695 Phe GAA -GGCTTGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAAGACTGAAAATCTTCGT-------------------GTCGGTGGTTCGATTCCGCCTCAAGCCACCA
D00004940 Helicobacter_pylori_J99 Phe GAA -GGCTTGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAAGACTGAAAATCTTCGT-------------------GTCGGTGGTTCGATTCCGCCTCAAGCCACCA
D00005085 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Phe GAA -GGCAACTTAGCTCAGTA-GGT--AGAGCGTTAGAGTGAAGTTCTAAGT--------C----------GTCGGTGGTTCGATCCCATCAGTTACCA---
D00005086 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Phe GAA -GGCTCGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAAAGGATTGAAGCTCCTTGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGCGCCA---
D00005047 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGCGCCA---
D00000683 Lactococcus_lactis Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGCGCCA---
D00005087 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Phe GAA -GGCTCTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGTTCGACTGAAAATCGAAAG-------------------GTCACCGGATCGATGCCGGTCGGAGCCA---
D00005034 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Phe GAA -GGCCTTGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTTGT-------------------GTCGGGAGTTCGATTCTCTCCGAGGCCA---
D00004957 Listeria_innocua_Clip11262 Phe GAA -GGCTTGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACTTGATTGAAGCTCAAGGT-------------------GTCGGCAGTTCGATTCTGTCCCAAGCCA---
D00004958 Listeria_monocytogenes_EGD-e Phe GAA -GGCTTGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACTTGATTGAAGCTCAAGGT-------------------GTCGGCAGTTCGATTCTGTCCCAAGCCA---
D00005099 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Phe GAA -GGCTTGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACTTGATTGAAGCTCAAGGT-------------------GTCGGCAGTTCGATTCTGTCCCAAGCCA---
D00005100 Mesoplasma_florum_L1 Phe GAA -GGTTGTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCAGATTGAAGCTCTGCGT-------------------GTCGGCGGTTCAATTCCGTCCACAACCACCA
D00004966 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Phe GAA -GCCCAGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCGGACTGAAAATCCGCGT-------------------GTCGGTGGTTCGAATCCGCCTCTGGGCACCA
D00005054 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Phe GAA -GGCCAGGTAGCTCAGTC-GGTA-TGAGCGTCCGCCTGAAAAGCGGAAG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGCCCCTGGCCACCA
D00004931 Mycobacterium_leprae_TN Phe GAA -GGCCAGGTAGCTCAGTC-GGTA-TGAGCGTCCGCCTGAAAAGCGGAAG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGCCCCTGGCTA---
D00004925 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Phe GAA -GGCCAGGTAGCTCAGTC-GGTA-TGAGCGTCCGCCTGAAAAGCGGAAG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGCCCCTGGCCACCA
D00005074 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Phe GAA -GGCCAGGTAGCTCAGTC-GGTA-TGAGCGTCCGCCTGAAAAGCGGAAG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGCCCCTGGCCACCA
D00000673 Mycoplasma_capricolum Phe GAA -GGTCGTGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGCAGACTGAAGCTCTGCGT-------------------GTCGGCGGTTCAATTCCGTCCACGACCACCA
D00005053 Mycoplasma_gallisepticum_R Phe GAA -GGTCTTGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAATGGTCTGAAGAACCATGT-------------------GTCGGCAGTTCGATTCTGCCCGAGACCACCA
D00000674 Mycoplasma_genitalium Phe GAA -GGTCTTGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAACGGTCTGAAGAACCGTGT-------------------GTCGGCAGTTCGATTCTGCCCGAGACCACCA
D00004947 Mycoplasma_genitalium_G37 Phe GAA -GGTCTTGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAACGGTCTGAAGAACCGTGT-------------------GTCGGCAGTTCGATTCTGCCCGAGACCACCA
D00000675 Mycoplasma_mycoides Phe GAA -GGTCGTGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGCAGACTGAAGCTCTGCGT-------------------GTCGGCGGTTCAATTCCGTCCACGACCACCA
D00004948 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Phe GAA -GGTCTTGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAACGGTCTGAAGAACCGTGT-------------------GTCGGCAGTTCGATTCTGCCCGAGACCACCA
D00004973 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Phe GAA -GGCTCTGTAGCTCAGTA-GGT--AGAGCAACGGATTGAAGCTCCGTGT-------------------GTCGCTGGTTCGATTCCTGCCGGAGCCACCA
D00004926 Neisseria_meningitidis_MC58 Phe GAA -GGCCAGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACGGATTGAAAATCCGTGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGCCTCTGGCCACCA
D00004927 Neisseria_meningitidis_Z2491 Phe GAA -GGCCAGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACGGATTGAAAATCCGTGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGCCTCTGGCCACCA
D00005064 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Phe GAA -GGCCAAGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTTGT-------------------GTCGGTGGTTCGATTCCGCCCTTGGCCACCA
D00004971 Nostoc_sp._PCC_7120 Phe GAA -CCCCTGGTAGCTCAGTT-GGTA-GTAGCGCCTGTTTGAAGAACAGGAG-------------------GTCATCCGTTCAATCCGGATCTGGGGGA---
D00004972 Nostoc_sp._PCC_7120 Phe GAA -GCCGGGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCACGAGTTCAAGTCTCGTTCCTGGCA---
D00005035 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Phe GAA -GGCTTGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTTGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGAGCCA---
D00005073 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M Phe GAA -GGCTCTGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGTGGCCTGAAGAGCCTCGT-------------------GTCGACAGTTCGATTCTGTCCGGAGCCACCA
D00004949 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Phe GAA -GCCTCGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCGGTGGTTCGATTCCGCCTCGAGGCACCA
D00005076 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Phe GAA -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGATTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGGTGGTTCGATTCCGCCTCCGGGCACCA
D00005088 Porphyromonas_gingivalis_W83 Phe GAA -GGTGCCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAAAGGACTGAAAATCCTTGT-------------------GTCCCCGGTTCGATTCCTGGTGGCACCA---
D00005101 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Phe GAA -GGCCGGGTAGCTCAGTT-GGTA-GTAGCGTTCGCCTGAAAAGTGAAAG-------------------GTCACCGGTTCGACCCCGGTCCCGGCCA---
D00004951 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Phe GAA -GCCCAGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCTGGGCACCA
D00005066 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Phe GAA -GCCCAGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCTGGGCACCA
D00004970 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Phe GAA -GGCCCGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCGGATTGAAAATCCGCGT-------------------GTCGGTGGTTCGATTCCGCCCCAGGCCACCA
D00005063 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Phe GAA -GGTTAGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGGCCCTGAAAAGGCCGGT-------------------GTCGGCGGTTCGAGCCCGCCTCTAACCA---
D00005077 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Phe GAA -GCCCAGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATGCGACTGAAAATCGCAGT-------------------GTCGGTGGTTCGATCCCGCCCCTGGGCACCA
D00004964 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Phe GAA -GGCCACGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAAAGGACTGAAAATCCTTGT-------------------GTCGTTGGTTCAATTCCAACCGTGGCCACCA
D00005018 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Phe GAA -GGCCACGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAAAGGACTGAAAATCCTTGT-------------------GTCGTTGGTTCAATTCCAACCGTGGCCACCA
D00005089 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Phe GAA -GGCCACGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAAAGGACTGAAAATCCTTGT-------------------GTCGTTGGTTCAATTCCAACCGTGGCCACCA
D00004975 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Phe GAA -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCA
D00005062 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Phe GAA -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCA
D00004968 Salmonella_typhimurium_LT2 Phe GAA -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCA
D00004969 Salmonella_typhimurium_LT2 Phe GAA ------GATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCA
D00005037 Shewanella_oneidensis_MR-1 Phe GAA -GCCCGAATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGATTGAAAATCCTCGT-------------------GTCCCTGGTTCGATTCCGGGTTCGGGCACCA
D00005038 Shigella_flexneri_2a_str._301 Phe GAA -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCA
D00004976 Sinorhizobium_meliloti_1021 Phe GAA -GCCCGGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCGGATTGAAAATCCGCGT-------------------GTCGGTGGTTCAAATCCGCCTCCGGGCACCA
D00000677 Spiroplasma_melliferum Phe GAA -GGTTCAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATTTGATTGAAGCTCAAAGT-------------------GTCGGCAGTTCAATTCTGTCCTGAACCACCA
D00000681 Staphylococcus_aureus Phe GAA -GGTTCAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGT-------------------GTCGGCAGTTCGACTCTGTCCTGAACCA---
D00005078 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Phe GAA -GGTTCAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGT-------------------GTCGGCAGTTCGACTCTGTCCTGAACCA---
D00005020 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Phe GAA -GGTTCAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGT-------------------GTCGGCAGTTCGACTCTGTCCTGAACCA---
D00004930 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Phe GAA -GGTTCAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGT-------------------GTCGGCAGTTCGACTCTGTCCTGAACCA---
D00005048 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Phe GAA -GGTTCAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGT-------------------GTCGGCAGTTCGACTCTGTCCTGAACCA---
D00005049 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Phe GAA -GGTTCAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGT-------------------GTCGGCAGTTCGATTCTGTCCTGAACCA---
D00005039 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGCGCCA---
D00005021 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGCGCCA---
D00005040 Streptococcus_mutans_UA159 Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGCGCCA---
D00004962 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGCGCCA---
D00004961 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGCGCCA---
D00005022 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGCGCCA---
D00005055 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Phe GAA -GGCTCGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGCGCCA---
D00005061 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Phe GAA -GGCTGGGTAGCTCAGTT-GGTA-CGAGCGATCGCCTGAAAAGCGATAG-------------------GTCGCCGGTTCGACCCCGGCCCCAGCCA---
D00005036 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Phe GAA -GGCTGGGTAGCTCAGTT-GGTA-CGAGCGATCGCCTGAAAAGCGATAG-------------------GTCGCCGGTTCGACCCCGGCCCCAGCCA---
D00005090 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Phe GAA -GGCCCGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGCGACTGAAAATCGCGGT-------------------GTCGCCAGTTCGATTCTGGCCTGGGCCACCA
D00005091 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Phe GAA -GGCCCGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGCGACTGAAAATCGCGGT-------------------GTCGCCGGTTCGATTCCGGCCTGGGCCACCA
D00000690 Synechocystis_sp. Phe GAA -GCCGGGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGGCGGTTCAAGTCCGCCTCCTGGCA---
D00004952 Synechocystis_sp._PCC_6803 Phe GAA -GCCGGGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGGCGGTTCAAGTCCGCCTCCTGGCA---
D00005025 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Phe GAA -GCCCCGATAGCTCAGTA-GGT--AGAGCAAGGGACTGAAAATCCCTGT-------------------GTCAGTGGTTCGATTCCACTTCGGGGCACCA
D00005026 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Phe GAA -GCCTCGATAGCTCAGTA-GGT--AGAGCAAGGGACTGAAAATCCCTGT-------------------GTCAGTGGTTCGATTCCACTTCGAGGCACCA
D00005023 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Phe GAA -GCCGGGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGCCAGTTCAATTCTGGCTCCTGGCA---
D00004953 Thermotoga_maritima_MSB8 Phe GAA -GGCCAGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACTGGACTGAAAATCCAGGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGCCCCTGGCCACCA
D00005102 Thermus_thermophilus_HB27 Phe GAA ---CGAGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATGCGACTGAAAATCGCAGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGCCCCTCGGCACCA
D00005103 Treponema_denticola_ATCC_35405 Phe GAA -GCCGTTGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAAAGGACTGAAAATCCTTGT-------------------GTCGACAGTTCGATTCTGTCCGACGGCA---
D00000678 Treponema_pallidum Phe GAA -GCCGTTGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAAAGGACTGAAAATCCTTGT-------------------GTCGACAGTTCGATTCTGTCCGACGGCA---
D00004950 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Phe GAA -GCCGTTGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAAAGGACTGAAAATCCTTGT-------------------GTCGACAGTTCGATTCTGTCCGACGGCA---
D00005050 Tropheryma_whipplei_str._Twist Phe GAA -GGCTCTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGTTCGACTGAAAATCGAAAG-------------------GTCACCGGATCGATACCGGTCGGAGCCA---
D00005051 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Phe GAA -GGCTCTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGTTCGACTGAAAATCGAAAG-------------------GTCACCGGATCGATACCGGTCGGAGCCA---
D00004932 Ureaplasma_parvum_serovar_3 Phe GAA -GGTTTCGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAACGGACTGAAGATCCGTGT-------------------GTCGACAGTTCGATTCTGTCCGAAACCACCA
D00004928 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Phe GAA -GCCTCGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGATTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGGTGGTTCGATTCCGCCTCGAGGCACCA
D00004929 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Phe GAA -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAGGATTGAAAATCCTCGT-------------------GTCGGTGGTTCGATTCCGCCTCCGGGCACCA
D00005104 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Phe GAA -GGCCTGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAAAGGACTGAAAATCCTTGT-------------------GTCGCTGGTTCGATTCCTGCTCAGGCCA---
D00005028 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Phe GAA -GGCCGAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCTCGGCCACCA
D00005027 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Phe GAA -GGCCGAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCTCGGCCACCA
D00004954 Xylella_fastidiosa_9a5c Phe GAA -GGCCGGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGGGGACTGAAAATCCCCGT-------------------GTCGGGGGTTCGATTCCCTCCCCGGCCACCA
D00004955 Xylella_fastidiosa_9a5c Phe GAA -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCA
D00005052 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Phe GAA -GGCCGGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGACTGAAAATCCCCGT-------------------GTCGGGGGTTCGATTCCCTCCCCGGCCACCA
D00005092 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Phe GAA -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCA
D00004967 Yersinia_pestis_CO92 Phe GAA -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCA
D00005030 Yersinia_pestis_KIM Phe GAA -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCA
D00005093 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Phe GAA -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGT-------------------GTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCA
D00000792 Arabidopsis_thaliana Phe GAA -GCGGGGATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTCAGACTGAAGATCTGAAG-------------------GTCGCGTGTTCGATCCACGCTCACCGCA---
D00004998 Arabidopsis_thaliana Phe GAA -GCGGGGATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTGACACTGAAGATCTGAAG-------------------GTCGCGTGTTCGATCCACGCTCACCGCA---
D00004999 Arabidopsis_thaliana Phe GAA -GCGGGGATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTCAGACTGAAGATCTGAAG-------------------GTCGCGTGTTCGATCCACGCTCACCGCA---
D00005000 Caenorhabditis_elegans Phe GAA -GCCTCGATAGCTCAGTT-GGGG-TGAGCGTACGACTGAAAATCGTTAG-------------------GTCACCAGTTCGATCCTGGTTCGGGC-----
D00005001 Caenorhabditis_elegans Phe GAA -GCCTCGATAGNTCAGTT-GGG--AGAGCGCACGACTGAAGATCGTGAG-------------------GTCACCAGTTCGATCCTGGTTCGGGGC----
D00005002 Caenorhabditis_elegans Phe GAA -GCCTCAATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTACGACTGAAGATCGTAAG-------------------GTCACCAGTTCGATCCTGGTTTGGGGC----
D00005003 Caenorhabditis_elegans Phe GAA -GCCTCGATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTACGACTGAAGATCGTAAG-------------------GTCACCAGTTCGATCCTGGTTCGGGGC----
D00005004 Caenorhabditis_elegans Phe GAA -GCCTCGATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCACGACTGAAGATCGTGAG-------------------GTCACCAGTTCGATCCTGGTTCGGGGC----
D00005094 Candida_glabrata_CBS_138 Phe GAA -GCGGTTTTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCCAGACTGAAGATCTGGAG-------------------GTCCTGTGTTCGATCCACAGAAATCGCA---
D00000793 Drosophila_melanogaster Phe GAA -GCCGAAATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAG-------------------GTCCCCGGTTCAATCCCGGGTTTCGGCA---
D00005010 Drosophila_melanogaster Phe GAA -GCCGAAATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAG-------------------GTCCCCGGTTCAATCCCGGGTTTCGGNN---
D00005011 Drosophila_melanogaster Phe GAA -GCCGAAATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAG-------------------GTCCCCGGTTCAATCCCGGGTTTCGGCA---
D00005029 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Phe GAA -GCTGGATTAGCTCAGT--GGA--AGAGCACTAGACTGAAGATCTAGGT-------------------GTCCCCGGTTCGAACCCGGGATCTAGCA---
D00000796 Gallus_gallus Phe GAA -GCCGAAATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAG-------------------GTCCCTGGTTCGATCCCGGGTTTCGGCA---
D00005114 Gallus_gallus Phe GAA -GCTGAAATAGCTCAGGT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAG-------------------GTTCCTGGTTCAGTCCTGGGTCACAGCA---
D00005115 Gallus_gallus Phe GAA -GTCAGGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGT-------------------GTCACCAGTTCAAATCTGGTTCCTGGCA---
D00005116 Gallus_gallus Phe GAA -GCTGAAGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAG-------------------GTCCCTGGTTCAACCCCGGGCTTCAGCA---
D00005117 Gallus_gallus Phe GAA -GCTGAAGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAG-------------------GTCCCTGGTTCAATCCCGGGCTTCAGCA---
D00005118 Gallus_gallus Phe GAA -GCCGAAATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAG-------------------GTCCCTGGTTCAATCCCGGGTTTCGGCA---
D00005119 Gallus_gallus Phe GAA -GCCGAAATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAG-------------------GTCCCTGGTTCGATCCCGGGTTTCGGCA---
D00004990 Homo_sapiens Phe GAA -GCTGAAATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTTACACTGAAGATCTTAAA--------G----------TTCCCTGGTTCAACCCTGGGTTTCAGC----
D00004991 Homo_sapiens Phe GAA -GCCGAAATAGCTCAATT-GGG--AGAGTGTTAGACTGAAGATCTTCTG--------CAG--------GTCTCTGGTTCAATTCCGGGTTTCGAC----
D00004992 Homo_sapiens Phe GAA -GCTGAAATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTTAAA--------G----------TTCCCTGGTTCAACCCTGGGTTTCAGC----
D00004993 Homo_sapiens Phe GAA -GCCAAAATTGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAG-------------------GTCCCTGGTTCGATCCCGGGTTTCACC----
D00004994 Homo_sapiens Phe GAA -GCCGAAATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTTAGACCGAAGATCTTAAA--------G----------GTCCCTGGTTCAATCCCGGGTTTCGGC----
D00004995 Homo_sapiens Phe GAA -GCCGAGATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAG-------------------GTCCCTGGTTCAATCCCGGGTTTCGGCA---
D00004996 Homo_sapiens Phe GAA -GCCGAAATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAG-------------------GTCCCTGGTTCAATCCCGGGTTTCGGCA---
D00004997 Homo_sapiens Phe GAA -GCCGAAATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAG-------------------GTCCCTGGTTCGATCCCGGGTTTCGGCA---
D00000784 Neurospora_crassa Phe GAA -GCGGGTTTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTCAGACTGAAGATCTGAAG-------------------GTCGTGTGTTCGATCCACACAAACCGCA---
D00005129 Pan_troglodytes Phe GAA -TGCCTGGTTGTCTAGT--GGCT-AGGATTCGGTGCTGAAAGCGCCACG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGTCAGGGAA---
D00005130 Pan_troglodytes Phe GAA -GCCGAAATAGCTCAATT-GGG--AGAGTGTTAGACTGAAGATCTTCTG--------CAG--------GTCTCTGGTTCAATTCCGGGTTTCGACA---
D00005131 Pan_troglodytes Phe GAA -GTCGAAATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCATTAGACTGAAGATCTAAAG-------------------GTCCCTGGTTCGATCCCGGGTTTCAGCA---
D00005132 Pan_troglodytes Phe GAA -GCCGAAATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAG-------------------GTCCCTGGTTCAATCCCGGGTTTTGGCA---
D00005133 Pan_troglodytes Phe GAA -GCCGAAATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAG-------------------GTCCCTGGTTCGATCCCGGGTTTTGGCA---
D00005134 Pan_troglodytes Phe GAA -GCCGAAATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAG-------------------GTCCCTGGTTCAATCCCGGGTTTCGGCA---
D00005135 Pan_troglodytes Phe GAA -GCCGAAATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAG-------------------GTCCCTGGTTCGATCCCGGGTTTCGGCA---
D00005111 Plasmodium_falciparum_3D7 Phe GAA -GCCGTGATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTCAGACTGAAGATCTGAAG-------------------GTCCCTGGTTCGATCCCTGGTCACGGCA---
D00000795 Podocoryne_carnea Phe GAA -GCCGTGATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTCAGACTGAAGATCTGAAG-------------------GTCCCTGGTTCAATCCCGGGTCGCGGCA---
D00000797 Rattus_norvegicus Phe GAA -GCCGAAATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAA-------------------G_CCCTGGTTCGATCCCGGGTTTCGGCA---
D00000785 Saccharomyces_cerevisiae Phe GAA -GCGGATTTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCCAGACTGAAGATCTGGAG-------------------GTCCTGTGTTCGATCCACAGAATTCGCA---
D00000786 Saccharomyces_cerevisiae Phe GAA -GCGGATTTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCCAGACTGAAGATCTGGAG-------------------GTCCTGTGTTCGATCCACAGAGTTCGCA---
D00000787 Saccharomyces_cerevisiae Phe GAA -GCGGATTTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCCAGACTGAAGCTTCGGTC-------------------GTCCTGTGTTCGATCCACAGAATTCGCA---
D00000788 Saccharomyces_cerevisiae Phe GAA -GCGGATTTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCCAGACTGAAGATTCGGTC-------------------GTCCTGTGTTCGATCCACAGAATTCGCA---
D00005005 Saccharomyces_cerevisiae Phe GAA -GCGGACTTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCCAGACTGAAGATCTGGAG-------------------GTCCTGTGTTCGATCCACAGAGTTCGCA---
D00005006 Saccharomyces_cerevisiae Phe GAA -GCGGATTTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCCAGACTGAAGATCTGGAG-------------------GTCCTGTGTTCGATCCACAGAATTCGCA---
D00005007 Saccharomyces_cerevisiae Phe GAA -GCGGATTTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCCAGACTGAAGATCTGGAG-------------------GTCCTGTGTTCGATCCACAGAATTCGCA---
D00005008 Saccharomyces_cerevisiae Phe GAA -GCGGATTTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCCAGACTGAAGATCTGGAG-------------------GTCCTGTGTTCGATCCACAGAATTCGCA---
D00005009 Saccharomyces_cerevisiae Phe GAA -GCGGACTTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCCAGACTGAAGATCTGGAG-------------------GTCCTGTGTTCGATCCACAGAGTTCGCA---
D00000789 Schizosaccharomyces_pombe Phe GAA -GTCGCAATGGTGTAGTT-GGG--AGCATGACAGACTGAAGATCTGTTG-------------------GTCATCGGTTCGATCCCGGTTTGTGACA---
D00000790 Schizosaccharomyces_pombe Phe GAA -GTCGCGATGGTGTAGTT-GGG--AGCATGACAGACTGAAGATCTGTTG-------------------GTCATCGGTTCGATCCCGGTTCGTGACA---
D00005012 Schizosaccharomyces_pombe Phe GAA -GTCGCAATGGTGTAGTT-GGG--AGCATGACAGACTGAAGATCTGTTG-------------------GTCATCGGTTCGATCCCGGTTTGTGACA---
D00005013 Schizosaccharomyces_pombe Phe GAA -GTCGCGATGGTGTAGTT-GGG--AGCATGACAGACTGAAGATCTGTTG-------------------GTCATCGGTTCGATCCCGGTTCGTGACA---
D00005120 Takifugu_rubripes Phe GAA -GCTGAAATAGCTCCATT-GGG--AGAGTGTTAGACTGAAGTTCTGAAG-------------------G-TCCCGGTTCAATTCTGGGTTCCAGCA---
D00005121 Takifugu_rubripes Phe GAA -GCCCAAATACCTCAGAT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAG-------------------GTCCCTGGTTTGATCCCGGGGTTCGGCA---
D00005122 Takifugu_rubripes Phe GAA -GCCGAAATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGTTCTAAAG-------------------GACCCTCGTTCAACCCTGGGTTTTGGCA---
D00005123 Takifugu_rubripes Phe GAA -GCCGAAATAGCTCAGTTTGGG--AGAGCGTTAGACTGAAGCTCTAAAG-------------------GTCCCTGGTTCGATCCCGGGTTTCGGCA---
D00005124 Takifugu_rubripes Phe GAA -GCCGAAATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTGAAG-------------------GTCCCTGGTTCGATCCCGGGTTTCGGCA---
D00005125 Takifugu_rubripes Phe GAA -GCTGGAATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAG-------------------GTCCCTGGTTCAATCCCGGGTTCCAGCA---
D00005126 Takifugu_rubripes Phe GAA -GCCGAAATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAG-------------------GTCCCTGGTTCAATCCCGGGTTTCGGCA---
D00005127 Takifugu_rubripes Phe GAA -GCCGAAATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTCAGACTGAAGATCTGAAG-------------------GTCCCTGGTTCGATCCCGGGTTTCGGCA---
D00005128 Takifugu_rubripes Phe GAA -GCCGAAATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAG-------------------GTCCCTGGTTCGATCCCGGGTTTCGGCA---
D00000791 Toxoplasma_gondii Phe GAA -GTTGAAATAGCTCAAT--GGT--AGAGCAAAGGACTGAAGATCCTTAA-------------------T-TATCAGTTCAATTCTGATTTTCAACA---
D00000794 Xenopus_laevis Phe GAA -GCCGAAATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTTAGACTGAAGATCTAAAG-------------------GTCCCTGGTTCGATCCCGGGTTTCGGCA---
D00003794 Aeropyrum_pernix_K1 Ala CGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGA--AGAGCGCCGCCCTCGCACGGCGGAG-------------------GCCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCACC-
D00000006 Archaeoglobus_fulgidus Ala CGC -GGGCTCGTAGCTCAGC--GGG--AGAGCGCCGCCTTCGCGAGGCGGAG-------------------GCCGCGGGTTCAAATCCCGCCGAGTCCA---
D00003797 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Ala CGC -GGGCTCGTAGCTCAGC--GGG--AGAGCGCCGCCTTCGCGAGGCGGAG-------------------GCCGCGGGTTCAAATCCCGCCGAGTCCA---
D00003800 Halobacterium_sp._NRC-1 Ala CGC -GGGCTCGTAGATCAGC--GGT--AGATCGCTTCCTTCGCAAGGAAGAG-------------------GCCCTGGGTTCAAATCCCAGCGAGTCCA---
D00011917 Methanosarcina_acetivorans_C2A Ala CGC -GGGCTCGTAGATCAGG--GGA--AGATCGTTACGTTCGCAACGTAAAG-------------------GCCGCGGGTTCAAATCCCGCCGAGTCCA---
D00003899 Methanosarcina_mazei_Go1 Ala CGC -GGGCTCGTAGATCAGG--GGA--AGATCGTTACGTTCGCAACGTAAAG-------------------GCCGCGGGTTCAAATCCCGCCGAGTCCA---
D00011963 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Ala CGC -GGGCTCGTAGATCAGT--GGG--AGATCGCTGTGTTCGCAACGCAGAG-------------------GCCGCGGGTTCAAATCCCGCCGGGTCCA---
D00012010 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Ala CGC -GGGCCCGTAGTCCAGC--GGT--AGGACGCCGCCCTCGCAAGGCGGAG-------------------GCCCCGGGTTCGAATCCCGGCGGGTCCA---
D00003809 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Ala CGC -GGGCCGGTAGTCTAGC--GGA--AGGATGCCCGCCTCGCGCGCGGGAG-------------------ATCCCGGGTTCGAATCCCGGCCGGTCCACCA
D00003812 Pyrococcus_abyssi_GE5 Ala CGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGG--AGAGCGCCGCCCTCGCAAGGCGGAG-------------------GCCGCGGGTTCAAATCCCGCCCGGTCCACC-
D00003815 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Ala CGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGA--AGAGCGCCGCCCTCGCAAGGCGGAG-------------------GCCGCGGGTTCAAATCCCGCCCGGTCCACC-
D00003818 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Ala CGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGG--AGAGCGCCGCCCTCGCAAGGCGGAG-------------------GCCGCGGGTTCAAATCCCGCCCGGTCCACCA
D00012043 Staphylothermus_marinus_F1 Ala CGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGA--AGAGCGCCGCCCTCGCAAGGCGGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCACCA
D00012072 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Ala CGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGA--AGAGTGCTTGGCTCGCACCCAAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCA---
D00003821 Sulfolobus_solfataricus_P2 Ala CGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGA--AGAGTGCTCGGTTCGCACCCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCC----
D00003915 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Ala CGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGA--AGAGTGCTCGGCTCGCACCCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCA---
D00003824 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Ala CGC -GGGCCGGTAGATCAGC--GGT--AGATCGCCTGCTTCGCAAGCAGGAG-------------------GCCTCGGGTTCAAATCCCGACCGGTCCA---
D00003827 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Ala CGC -GGGCCGGTAGATCAGC--GGT--AGATCGCCTGCTTCGCAAGCAGGAG-------------------GCCTCGGGTTCAAATCCCGACCGGTCCA---
D00000024 Thermoproteus_tenax Ala CGC -GGGCCGGTAGTCTAGC--GGA--AGGACGCCCGCCTCGCGCGCGGGAG-------------------ATCCCGGGTTCGAATCCCGGCCGGTCCA---
D00003937 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Ala CGC -GGGGCTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCTTCGTTCGCATCGAAGAG-------------------GTCGCGGTTTCGACTACCGTCAGCTCCA---
D00003962 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Ala CGC -GGGGCCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCGTCGTTCGCAATGACGAG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGCCTGGCTCCACCA
D00003769 Brucella_melitensis_16M Ala CGC -GGGGCTGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCGTCGTTCGCAATGACGAG-------------------GTCAGGGGTTCGATCCCCCTCAGCTCCACCA
D00003940 Brucella_suis_1330 Ala CGC -GGGGCTGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCGTCGTTCGCAATGACGAG-------------------GTCAGGGGTTCGATCCCCCTCAGCTCCACCA
D00003730 Caulobacter_crescentus_CB15 Ala CGC -GGGGCCGTAGCTCAGAT-GGT--AGAGCGCCTCGTTCGCAATGAGGAG-------------------GTCAGGGGTTCGATTCCCCTCGGCTCCACCA
D00003895 Chlorobium_tepidum_TLS Ala CGC -GGGGCTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGTCTCGTTCGCAATGAGAAG-------------------GTCAGGGGTTCGACTCCCCTAAGCTCCA---
D00003733 Deinococcus_radiodurans_R1 Ala CGC -GGGGTCGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCGTCGTTCGCAATGACGAG-------------------GTCAGGGGTTCGATCCCCCTCGACTCCACCA
D00004063 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Ala CGC -GGGGATGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCAGCGTTCGCAATGCTGAA-------------------GTCAGGGGTTCAATCCCCCTCATCTCCACCA
D00004034 Geobacter_sulfurreducens_PCA Ala CGC -GGGGACGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGATGCGTTCGCAACGCATAG-------------------GTCGAGGGTTCGATCCCCTTCGTCTCCACCA
D00003969 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Ala CGC -GGGCCCTTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCCTGCTTCGCATGCAGGAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGTAGGGTCCA---
D00004039 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Ala CGC -GGGGCTATGGCGCAGTT-GGT--AGCGCGCTTCGTTCGCATCGAAGAG-------------------GTCAGGAGTTCGAATCTCCTTAGCTCCA---
D00003772 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Ala CGC -GGGGCTGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCATCGTTCGCAATGATGAG-------------------GTCAGGGGTTCGATCCCCCTCAGCTCCACCA
D00003983 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Ala CGC -GGGGCTATGGCGCAGTT-GGT--AGCGCGACTCGTTCGCATCGAGTAG-------------------GTCAGGGGTTCGAATCCCCTTAGCTCCACCA
D00003709 Mycobacterium_leprae_TN Ala CGC -GGGGCTATGGCGCAGTT-GGT--AGCGCGACTCGTTCGCATCGAGTAG-------------------GTCAGGGGTTCGATTCCCCTTAGCTCCA---
D00003696 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Ala CGC -GGGGCTATGGCGCAGTT-GGT--AGCGCGACTCGTTCGCATCGAGTAG-------------------GTCAGGGGTTCGAATCCCCTTAGCTCCACCA
D00004021 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Ala CGC -GGGGCTATGGCGCAGTT-GGT--AGCGCGACTCGTTCGCATCGAGTAG-------------------GTCAGGGGTTCGAATCCCCTTAGCTCCACCA
D00003785 Nostoc_sp._PCC_7120 Ala CGC -GGGGAATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCTGCGATCGCACCGCAGAG-------------------GTCAGGGATTCGAGTTCCCTATTCTCCA---
D00004068 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Ala CGC -GGGGCATTGGCGCAGTT-GGT--AGCGCGTCTCGTTCGCAATGAGAAG-------------------GTCAGGGGTTCGAATCCCCTATGCTCCA---
D00003781 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Ala CGC -GGGGCGGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGTCGCGTTCGCAATGCGAAG-------------------GTCGGGAGTTCGATCCTCCTCCGCTCCACCA
D00004004 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Ala CGC -GCACTGATGGTCTAAC--GGC--AAGACTCCTCCGTCGCGAGCGAGGT-------------------GATGCGGGTTCGATTCCGGCTCGGTGCT---
D00004027 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Ala CGC -GGGGCCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCATCGTTCGCAATGATGAG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGCCTGGCTCCACCA
D00003793 Sinorhizobium_meliloti_1021 Ala CGC -GGGGTCGTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCCGCAATCGCACTGCGGAG-------------------GTCGAGGGTTCGACTCCCTTCGGCTCCACCA
D00003995 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Ala CGC -GGGCCTGTGGCGCAGTCTGGT--AGCGCACCTCGTTCGCATCGAGGGG-------------------GTCTGGGGTTCAAATCCCCACAGGTCCA---
D00003949 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Ala CGC -GGGCCTGTGGCGCAGTCTGGT--AGCGCACCTCGTTCGCATCGAGGGG-------------------GTCTGGGGTTCAAATCCCCACAGGTCCA---
D00004047 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Ala CGC -GGGGCTATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCGTGAATCGCACTCACGAG-------------------GTCAGGGGTTCGAATCCCCTTAGCTCCACCA
D00004050 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Ala CGC -GGGGCTATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCGTGAATCGCACTCACGAG-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCCCTTAGCTCCACCA
D00000092 Synechocystis_sp. Ala CGC -GGGGAATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCTGCGATCGCACCGCAGAG-------------------GTCAGGGATTCGAGTTCCCTATTCTCCA---
D00003745 Synechocystis_sp._PCC_6803 Ala CGC -GGGGAATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCTGCGATCGCACCGCAGAG-------------------GTCAGGGATTCGAGTTCCCTATTCTCCA---
D00003913 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Ala CGC -GGGGAGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGTCGCGATCGCACCGCGAAG-------------------GTCAGGGATTCGAGTTCCCTACTCTCCA---
D00003748 Thermotoga_maritima_MSB8 Ala CGC -GGGGCCGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTACCTTCGCACGGTAGAG-------------------GTCGTGGGTTCAAGTCCCATCGGCTCCACCA
D00004072 Thermus_thermophilus_HB27 Ala CGC -GGGGCCGTGGCGCAGTT-GGG--AGCGCGCCTGAATCGCACTCAGGAG-------------------GTCAGGGGTTCGAATCCCCTCGGCTCCACCA
D00004074 Treponema_denticola_ATCC_35405 Ala CGC -GGGGAATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGATTGGTTCGCAATCAATAG-------------------GTCGTGGGTTCGATTCCCATATTCTCCA---
D00000040 Treponema_pallidum Ala CGC -GGGGAATTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCGTTTGGTTCGCAATCAAGAG-------------------GTCAGGGGTTCGACTCCCCTATTCTCCA---
D00003740 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Ala CGC -GGGGAATTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCGTTTGGTTCGCAATCAAGAG-------------------GTCAGGGGTTCGACTCCCCTATTCTCCA---
D00003973 Tropheryma_whipplei_str._Twist Ala CGC -GGGGCTATGGCGCAGGCTGGT--AGCGCGTCTCGTTCGCAATGAGAAG-------------------GTCAGGGGTTCGAATCCCCTTAGCTCCA---
D00003975 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Ala CGC -GGGGCTATGGCGCAGGCTGGT--AGCGCGTCTCGTTCGCAATGAGAAG-------------------GTCAGGGGTTCGAATCCCCTTAGCTCCA---
D00003925 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Ala CGC -GGGGCGGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGTCGCGTTCGCATCGCGAAG-------------------GTCGAGGGTTCGATCCCCTTCCGCTCCACCA
D00003922 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Ala CGC -GGGGCGGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGTCGCGTTCGCATCGCGAAG-------------------GTCGAGGGTTCGATCCCCTTCCGCTCCACCA
D00003751 Xylella_fastidiosa_9a5c Ala CGC -GGGGAAGTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCGCGTCGTTCGCAATGACGAG-------------------GTCGGGAGTTCGATCCTCCTCTTCTCCACCA
D00003978 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Ala CGC -GGGGAAGTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCGCGTCGTTCGCAATGACGAG-------------------GTCGGGAGTTCGATCCTCCTCTTCTCCACCA
D00003867 Arabidopsis_thaliana Ala CGC -GGGGGTGTAGCTCATAT-GGT--AGAGCGCTCGTTTCGCATGCGAGAG-------------------GCACGGGGTTCGATTCCCCGCACCTCC----
D00003868 Arabidopsis_thaliana Ala CGC -GGGGATGTAGCTCATAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTCGCATGCGAGAG-------------------GCACGGGGTTCGATTCCCCGCATCTCC----
D00003869 Arabidopsis_thaliana Ala CGC -GGGGGTGTAGCTCATAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTCGCATGCGAGAG-------------------GCACGGGGTTCGATTCCCCGCACCTCC----
D00000226 Caenorhabditis_elegans Ala CGC -GGGGGCATAGCTCAGG--GGT--AGACGCGTCGCTTCGCATGCGAGAA-------------------GTCCGGGGTTCAATTCCCCGTGCCTCCA---
D00003878 Caenorhabditis_elegans Ala CGC -GGGGGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCGCTCGCTTCGCATGTGAGAA-------------------GTCTGGGGTTCAATTCCCCATACCTCC----
D00003879 Caenorhabditis_elegans Ala CGC -GGGGGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCGCTCGCTTCGCATGCGAGAA-------------------GTCTGGGGTTCAATTCCCCATACCTCCA---
D00003880 Caenorhabditis_elegans Ala CGC -GGGGGCATAGCTCAGA--GGT--AGAGCGCCCGCTTCGCATGCGGGAA-------------------GTCCGGGGTTCAATCCCCCGTGCCTCC----
D00003881 Caenorhabditis_elegans Ala CGC -GGGGGCATAGCTCAGG--GGT--AGAGCGCTCGCTTCGCATGCGAGAA-------------------GTCCGGGGTTCAATTCCCCGTGCCTCC----
D00003889 Drosophila_melanogaster Ala CGC -GGGGACGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCTCGCTTCGCATGTGAGAA-------------------GTCCCGGGTTCAAACCCCGGCGTCTCC----
D00003930 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Ala CGC -GGGGGATTATCTTAGT--GGT--AGAGTGTTTGCTTCGCATGCAAGTG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCTGGATCCTCCA---
D00004092 Gallus_gallus Ala CGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCATGCTTCGCATGTGTGAG-------------------GTCCCAGGTTCAATCCCTGGCATCTCCA---
D00004093 Gallus_gallus Ala CGC -GGGGATGTAGCTCAGC--GGG--AGAGCGCTTGCTTCGCATGTAAGAG-------------------GTCCTGGGTTCAATCCCCAGCATCTCCA---
D00004094 Gallus_gallus Ala CGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCGCGCTTCGCATGTGTGAG-------------------GTCCCGGGTTCAATCCCCGGCATCTCCA---
D00003852 Homo_sapiens Ala CGC -GGGGGTGTAGATCAGT--GGT--AGAGCGCATGCTTCGCATGTACGAG-------------------GTCCCTGGTTCAATCCCTGGTACCTCC----
D00003853 Homo_sapiens Ala CGC -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCGTGCTTCGCATGTACGAG-------------------GCCCCGGGTTCGACCCCCGGCTCCTCC----
D00003854 Homo_sapiens Ala CGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCGCGCTTCGCATGTGTGAG-------------------GTCCCGGGTTCAATCCCCGGCATCTCC----
D00003855 Homo_sapiens Ala CGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCATGCTTCGCATGTATGAG-------------------GCCCCGGGTTCGATCCCCGGCATCTCCA---
D00003856 Homo_sapiens Ala CGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCATGCTTCGCATGTATGAG-------------------GTCCCGGGTTCGATCCCCGGCATCTCCA---
D00000234 Mus_musculus Ala CGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCATGCTTCGCATGTATGAG-------------------GCCCCGGGTTCGATCCCCGGCATCTCCA---
D00004133 Pan_troglodytes Ala CGC -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCGTGCTTCGCATGTACGAG-------------------GCCCCGGGTTCGACCCCCGGCTCCTCCA---
D00004134 Pan_troglodytes Ala CGC -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCGTGCTTCGCATGTACGAG-------------------GTCCCTGGTTCAATCCCTGGCACCTCCA---
D00004135 Pan_troglodytes Ala CGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCGCGCTTCGCATGTGTGAG-------------------GTCCCGGGTTCAATCCCCGGCATCTCCA---
D00004136 Pan_troglodytes Ala CGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCATGCTTCGCATGTATGAG-------------------GCCCCGGGTTCGATCCCCGGCATCTCCA---
D00004137 Pan_troglodytes Ala CGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCATGCTTCGCATGTATGAG-------------------GTCCCGGGTTCGATCCCCGGCATCTCCA---
D00004082 Plasmodium_falciparum_3D7 Ala CGC -GGGCTAGTAGTGTAGT--GGT--ATCACGTTCGCTTCGCATGCGAAAG-------------------TTCCCGGGTTCGATTCCCGGCTGGTCCA---
D00003893 Schizosaccharomyces_pombe Ala CGC -GGGGATGTAGTTTAGG--GGT--ATAACGTTTCATTCGCATTGAAAAG-------------------GTCCCGGGTTCGATTCCCGGCATCTCC----
D00004104 Takifugu_rubripes Ala CGC -TCCCTGGTGGTCCAGT--GGTT-AGGATACGGCACTCGCACTGCCGTG-------------------G-CCTGTGTCCAA-TTCCAGTCAGGGAA---
D00004105 Takifugu_rubripes Ala CGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGTGTGCTTCGCATGTATGAG-------------------GTCCTGGGTTCAATCCCCAGCATCTCCA---
D00004106 Takifugu_rubripes Ala CGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGTGTGTGCTTCGCATGCATGAG-------------------GTCCTGGGTTCAATCCCCAGCATCTCCA---
D00004107 Takifugu_rubripes Ala CGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCGTGCTTCGCATGTATGAG-------------------GTCCCGGGTTCAATCCCCGGCATCTCCA---
D00003796 Aeropyrum_pernix_K1 Ala TGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGA--AGAGCGCCCGGCTTGCACCCGGGAG-------------------GCCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCACC-
D00000005 Archaeoglobus_fulgidus Ala TGC -GGGCTCGTAGCTCAGC--GGG--AGAGCGCCGCCTTTGCGAGGCGGAG-------------------GCCGCGGGTTCAAATCCCGCCGAGTCCA---
D00003799 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Ala TGC -GGGCTCGTAGCTCAGC--GGG--AGAGCGCCGCCTTTGCGAGGCGGAG-------------------GCCGCGGGTTCAAATCCCGCCGAGTCCA---
D00000011 Halobacterium_salinarum Ala TGC -GGGCCCATAGCTCAGT--GGT--AGAGTGCCTCCTTTGCAAGGAGGAT-------------------GCCCTGGGTTCGAATCCCAGTGGGTCCA---
D00000013 Halobacterium_salinarum Ala TGC -GGGCCCATAGCTCAGT--GGT--AGAGTGCCTCCTTTGCAAGGAGGAT-------------------GCCCTGGGTTGGAATCCCAGTGGGTCCA---
D00003802 Halobacterium_sp._NRC-1 Ala TGC -GGGCCCATAGCTCAGT--GGT--AGAGTGCCTCCTTTGCAAGGAGGAT-------------------GCCCTGGGTTCGAATCCCAGTGGGTCCA---
D00000002 Halorubrum_distributum Ala TGC -GGGCTCATAGCTCAGC--GGT--AGAGTGCCTCCCTTGCAAGGAGGAT-------------------GCCCTGGGTTCGAATCCCAGTGAGTCCA---
D00000003 Halorubrum_lacusprofundi Ala TGC -GGGCTCATAGCTCAGC--GGT--AGAGTGCCTCCTTTGCAAGGAGGAT-------------------GCCCTGGGTTCGAATCCCAGTGAGTCCA---
D00000004 Halorubrum_saccharovorum Ala TGC -GGGCTCATCGCTCAGC--GGT--AGAGTGCCTCCCTTGCAAGGAGGAT-------------------GCCCTGGGTTCGAATCCCAGTGAGTCCA---
D00000008 Halorubrum_sodomense Ala TGC -GGGCTCATAGCTCAGC--GGT--AGAGTGCCTCCCTTGCAAGGAGGAT-------------------GCCCTGGGTTCGAATCCCAGTGAGTCCA---
D00000009 Halorubrum_vacuolatum Ala TGC -GGGCTCATAGCTCAGC--GGT--AGAGTGCCTCCCTTGCAAGGAGGAT-------------------GCCCTGGGTTCGAATCCCAGTGAGTCCA---
D00000014 Methanobacterium_formicicum Ala TGC -GGGCCCGTAGCTCAGACTGGG--AGAGCGCCGCCCTTGCAAGGCGGAG-------------------GCCCCGGGTTCAAATCCCGGTGGGTCCA---
D00000015 Methanobacterium_thermaggregans Ala TGC -GGGCCCGTAGCTCAGACTGGG--AGAGCGCCGCCCTTGCAAGGCGGAG-------------------GCCCCGGGTTCAAATCCCGGTGGGTCCA---
D00000016 Methanocaldococcus_jannaschii Ala TGC -GGGCCCGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCGGCCTTGCAAGCCGGAG-------------------GCCGTGGGTTCAAATCCCACCGGGTCCA---
D00003806 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Ala TGC -GGGCCCGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCGGCCTTGCAAGCCGGAG-------------------GCCGTGGGTTCAAATCCCACCGGGTCCA---
D00011869 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Ala TGC -GGGCCCGTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCCGCCCTTGCAAGGCGGAG-------------------GCCGTGGGTTCAAATCCCGCCGGGTCCA---
D00003808 Methanococcus_maripaludis Ala TGC -GGGCCCGTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCCGCCCTTGCAAGGCGGAG-------------------CTCGTGGGTTCTAATCCCGCCTAGGCT----
D00000018 Methanococcus_vannielii Ala TGC -GGGCCCGTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCTGCCCTTGCAAGGCAGAG-------------------GCCGTGGGTTCAAATCCCGCCGGGTCCA---
D00003935 Methanopyrus_kandleri_AV19 Ala TGC -GGGCCCGCAGCTCAGTCTGGC--AGAGCGCGGCCCTTGCGAGGCCGTG-------------------GCCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGTCCACCA
D00000019 Methanosaeta_concilii Ala TGC -GGGCTTGTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCGCCGCCTTTGCAAGGCGGAG-------------------GCCCTGGGTCCGAATCCCAGCAAGTCCA---
D00011886 Methanosarcina_acetivorans_C2A Ala TGC -GGGCTTGTAGATCAGCT-GGA--AGATCGCTGCCTTTGCAAGGCAGAG-------------------GCCCTGGGTTCGAGTCCCAGCAAGTCCA---
D00003901 Methanosarcina_mazei_Go1 Ala TGC -GGGCTTGTAGATCAGCT-GGA--AGATCGCTGCCTTTGCAAGGCAGAG-------------------GCCCTGGGTTCGAGTCCCAGCAAGTCCA---
D00000021 Methanospirillum_hungatei Ala TGC -GGGCTCGTAGCTCAGCT-GGA--AGAGCGCGGCGTTTGCAACGCCGAG-------------------GCCTGGGGTTCAAATCCCCACGGGTCCA---
D00011928 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Ala TGC -GGGCTCGTAGCTCAGCT-GGA--AGAGCGCGGCGTTTGCAACGCCGAG-------------------GCCTGGGGTTCAAATCCCCACGGGTCCA---
D00003804 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Ala TGC -GGGCCCGTAGCTCAGACTGGG--AGAGCGCCGCCCTTGCAAGGCGGAG-------------------GCCCCGGGTTCAAATCCCGGTGGGTCCA---
D00000020 Methanothermus_fervidus Ala TGC -GGGCCCATAGCTCAGCCTGGG--AGAGCGCCGCCCTTGCAAGGCGGAG-------------------GCCCCGGGTTCAAATCCCGGTGGGTCCA---
D00012006 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Ala TGC -GGGCCCGTAGTCCAGC--GGT--AGGACGCCGCCCTTGCAAGGCGGAG-------------------GCCCCGGGTTCGAATCCCGGCGGGTCCA---
D00000010 Natronobacterium_gregoryi Ala TGC -GGGCCCATAGCTCAGT--GGG--AGAGTGCCTCCTTTGCAAGGAGGAT-------------------GCCCTGGGTTCGAATCCCAGTGGGTCCA---
D00000012 Natronomonas_pharaonis Ala TGC -GGGCCCATAGCTCAGT--GGT--AGAGTGCCTCCTTTGCAAGGAGGAT-------------------GCCCTGGGTTCGAATCCCAGTGGGTCCA---
D00003811 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Ala TGC -GGGCCGGTAGTCTAGC--GGA--AGGATGCCCGCCTTGCACGCGGGTG-------------------ATCCCGGGTTCGAATCCCGGCCGGTCCACCA
D00003814 Pyrococcus_abyssi_GE5 Ala TGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGTA-TGAGCGCCGCCCTTGCAAGGCGGAG-------------------GCCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCACC-
D00003817 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Ala TGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGTA-TGAGCGCCGCCCTTGCAAGGCGGAG-------------------GCCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCACC-
D00003820 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Ala TGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGTA-TGAGCGCCGCCCTTGCAAGGCGGAG-------------------GCCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCACCA
D00012029 Staphylothermus_marinus_F1 Ala TGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGA--AGAGCGCCGCCCTTGCAAGGCGGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCACCA
D00012079 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Ala TGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGA--AGAGTGCTTGGCTTGCAACCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCA---
D00003823 Sulfolobus_solfataricus_P2 Ala TGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGA--AGAGTGCTCGGTTTGCACCCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCC----
D00003917 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Ala TGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGA--AGAGTGCTCGGCTTGCAACCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCA---
D00000022 Thermococcus_celer Ala TGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGG--AGAGCGTCGGCTTTGCAAGCCGAAG-------------------GCCCCGGGTTCGAATCCCGGCCGGTCCACCA
D00003826 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Ala TGC -GGGCCGGTAGATCAGC--GGT--AGATCGCCTGCTTTGCAAGCAGGAG-------------------GCCTCGGGTTCAAACCCCGACCGGTCCA---
D00003829 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Ala TGC -GGGCCGGTAGATCAGC--GGT--AGATCGCCTGCTTTGCAAGCAGGAG-------------------GCCTCGGGTTCAAACCCCGACCGGTCCA---
D00000023 Thermoproteus_tenax Ala TGC -GGGCCGGTAGTCTAGC--GGA--AGGACGCCCGCCTTGCGCGCGGGAG-------------------ATCCCGGGTTCGAATCCCGGCCGGTCCA---
D00000029 Acetobacter_aceti Ala TGC -GGGGGCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGAACCCGTCTGCCTCCACCA
D00000036 Acholeplasma_laidlawii Ala TGC -GGGGCTTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGAT-CCGCTAAGCTCCACCA
D00000037 Acholeplasma_laidlawii Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGAT-CCGCTAGGCTCCACCA
D00000063 Acidithiobacillus_ferrooxidans Ala TGC -GGGGCTGTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCATCGGTTCGAGACCGGTCAGCTCCACCA
D00004078 Acinetobacter_sp._ADP1 Ala TGC -GGGGACTTAGCTTAGTT-GGT--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGGAGTTCGACTCTCCTAGTCTCCACCA
D00000071 Aeromonas_hydrophila Ala TGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCA
D00003787 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Ala TGC -GGGGCTGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTCAGCTCCACCA
D00003755 Aquifex_aeolicus_VF5 Ala TGC -GGGGGTGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCAAGCAGGAG-------------------GTCGTGGGTTCGAGTCCCACCACCTCC----
D00004011 Bacillus_anthracis_str._Ames Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCA
D00004012 Bacillus_anthracis_str._Ames Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00004030 Bacillus_anthracis_str._Sterne Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCA
D00004031 Bacillus_anthracis_str._Sterne Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00004032 Bacillus_anthracis_str._Sterne Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00004058 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCA
D00004059 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00004060 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00003988 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCA
D00003989 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00003961 Bacillus_halodurans_C-125 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCA
D00000056 Bacillus_subtilis Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00000057 Bacillus_subtilis Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCA
D00000058 Bacillus_subtilis Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGT-CGA-CCCGCTAGGCTCCACCA
D00003692 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00003693 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCA
D00004079 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00004080 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCA
D00004007 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Ala TGC -GGGGGATTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCATCTGCCTTGCACGCAGAGG-------------------GTCAACGGTTCGAATCCGTTATTCTCCA---
D00000025 Bartonella_elizabethae Ala TGC -GGGGCCGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGTCCGGCTCCACCA
D00004014 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Ala TGC -GGGGCCGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGTCCGGCTCCACCA
D00000026 Bartonella_quintana Ala TGC -GGGGCCGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGTCCGGCTCCACCA
D00004085 Bartonella_quintana_str._Toulouse Ala TGC -GGGGCCGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGTCCGGCTCCACCA
D00004016 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Ala TGC -GGGGGCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGATTTGCATTCAGAAG-------------------GTCGCAGGTTCGATCCCTGTTGCCTCCACCA
D00003938 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Ala TGC -GGGGCTATAGCGCAGCT-GGT--AGCGCATCTGCTTTGCAAGCAGAGG-------------------GTCGCCGGTTCGAACCCGGCTAGCTCCA---
D00000044 Bordetella_sp. Ala TGC -GGGGGTGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCAAGCAGATG-------------------T-CATCGGTCAGATCCCGTTCACCTCCACCA
D00000043 Borrelia_burgdorferi Ala TGC -GGGGGTTTAGCTCAGTT-GGCT-AGAGCATCGGCTTTGCAAGCCGAGG-------------------GTCAAGGGTTCGAGTCCCTTAACCTCCA---
D00003727 Borrelia_burgdorferi_B31 Ala TGC -GGGGGTTTAGCTCAGTT-GGCT-AGAGCATCGGCTTTGCAAGCCGAGG-------------------GTCAAGGGTTCGAGTCCCTTAACCTCCA---
D00004033 Borrelia_garinii_PBi Ala TGC -GGGGGTTTAGCTCAGTT-GGCT-AGAGCATCGGCTTTGCAAGCCGAGG-------------------GTCAAGGGTTCGAGTCCCTTAACCTCCA---
D00003964 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Ala TGC -GGGGCCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCGTGCTTTGCAAGCATGAG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGTCTGGCTCCACCA
D00000083 Brucella_abortus Ala TGC -GGGGCCGTAGCTCAGCT-GG---AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGTCCGGCTCCACCA
D00000084 Brucella_abortus Ala TGC -GGGGCCGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGTCCGGCTCCACCA
D00000082 Brucella_melitensis Ala TGC -GGGGCCGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGTCCGGCTCCACCA
D00003770 Brucella_melitensis_16M Ala TGC -GGGGCCGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGTCCGGCTCCACCA
D00000081 Brucella_suis Ala TGC -GGGGCCGTAGCTCAGCTGGG---AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGGAGGTTCGATCCCGTCCGGCTCCACCA
D00003939 Brucella_suis_1330 Ala TGC -GGGGCCGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGTCCGGCTCCACCA
D00003695 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Ala TGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCAATCCCGCTTAGCTCCA---
D00003991 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Ala TGC -GGGGTTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCTTTGCACGCAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAACTCCA---
D00003903 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Ala TGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCAATCCCGCTTAGCTCCA---
D00000045 Burkholderia_cepacia Ala TGC -GGGGGCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------T-CGTCGGTTCGATCCCGTCTGCCTCCACCA
D00000073 Burkholderia_cepacia Ala TGC -GGGGGCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------T-CGTCGGTTCGATCCCGTCTGCCTCCACCA
D00000075 Burkholderia_gladioli Ala TGC -GGGGGCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------T-CGTCGGTTCGATCCCGTCTGCCTCCACCA
D00000077 Burkholderia_mallei Ala TGC -GGGGGCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------T-CGTCGGTTCGATCCCGTCTGCCTCCACCA
D00000078 Campylobacter_jejuni Ala TGC -GGGGCATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTATTCTCCACCA
D00003729 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Ala TGC -GGGGAATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTATTCTCCACCA
D00004086 Candidatus_Blochmannia_floridanus Ala TGC -GGGGCTATAGCTCAATT-GGG--AGAGCATCTGTTTTGCACACAGAAG-------------------GTTAGCGGTTCGATTCCGCTTAGCTCCA---
D00003732 Caulobacter_crescentus_CB15 Ala TGC -GGGGCCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCCTGCTTTGCAAGCAGGAT-------------------GTCGTCGGTTCGAATCCGTCTGGCTCCACCA
D00000080 Caulobacter_vibrioides Ala TGC -GGGGCCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCCTGCTTTGCAAGCAGGTG-------------------T-CGTCGGTTCGAATCCGTCTGGCTCCACCA
D00003763 Chlamydia_muridarum_Nigg Ala TGC -GGGGACTTAGCTTAGTT-GGT--AGAGCGTCTGATTTGCATTCAGAAG-------------------GTCAGGAGTTCGAATCTCCTAGTCTCCA---
D00003690 Chlamydia_trachomatis Ala TGC -GGGGACTTAGCTTAGTT-GGT--AGAGCGTCTGATTTGCATTCAGAAG-------------------GTCAGGAGTTCGAATCTCCTAGTCTCC----
D00003688 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Ala TGC -GGGGACTTAGCTTAGTT-GGT--AGAGCATCTGATTTGCATTCAGAAG-------------------GTCAGGAGTTCGAATCTCCTAGTCTCCA---
D00003684 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Ala TGC -GGGGACTTAGCTTAGTT-GGT--AGAGCGTCTGATTTGCATTCAGAAG-------------------GTCAGGAGTTCGAATCTCCTAGTCTCCA---
D00003686 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Ala TGC -GGGGACTTAGCTTAGTT-GGT--AGAGCGTCTGATTTGCATTCAGAAG-------------------GTCAGGAGTTCGAATCTCCTAGTCTCCA---
D00003714 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Ala TGC -GGGGACTTAGCTTAGTT-GGT--AGAGCGTCTGATTTGCATTCAGAAG-------------------GTCAGGAGTTCGAATCTCCTAGTCTCCA---
D00003896 Chlorobium_tepidum_TLS Ala TGC -GGGGCTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGCTTTGCAAGCAGAGG-------------------GTCAACGGTTCGAGTCCGTTAAGCTCCA---
D00003766 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Ala TGC -GGGGGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCCTTGCACGCAGGGG-------------------GTCAAGAGTTCGAATCTCTTATTCTCCACCA
D00003761 Clostridium_perfringens_str._13 Ala TGC -GGGGGTATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCACCTGCCTTGCACGCAGGGG-------------------GTCAGGAGTTCGAATCTCCTTACCTCCACCA
D00003965 Clostridium_tetani_E88 Ala TGC -GGGGGTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCCTTGCACGCAGGGG-------------------GTCAAGAGTTCGAATCTCTTTATCTCCACCA
D00003966 Clostridium_tetani_E88 Ala TGC -GGGGGTATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCACCTGCCTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCAGGAGTTCGAATCTCCTTATCTCCACCA
D00004017 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Ala TGC -GGGGCATTAGCTCAATT-GGT--AGAGCATCTGCTTTGCAAGCAGAAG-------------------GTCAGGAGTTCGATTCTCCTATGCTCCA---
D00003942 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Ala TGC -GGGGCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGAT-------------------GTCAGGAGTTCGATTCTCCTATGCTCCA---
D00003906 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Ala TGC -GGGGCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGAT-------------------GTCAGGAGTTCGATTCTCCTATGCTCCA---
D00000046 Coxiella_burnetii Ala TGC -GGGGCCATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCATCTGCCTTGCAAGCAGAGG-------------------GTCGGCGGTTCGACTCCGCCTGGCTCCACCA
D00003987 Coxiella_burnetii_RSA_493 Ala TGC -GGGGCCATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCATCTGCCTTGCAAGCAGAGG-------------------GTCGGCGGTTCGACTCCGCCTGGCTCCACCA
D00003735 Deinococcus_radiodurans_R1 Ala TGC -GGGGGCTTAGCTCAGC--GGG--AGAGCATCCGCTTTGCAAGCGGAGG-------------------GTCTAGGGTTCGAATCCCTAAGCCTCCACCA
D00004062 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Ala TGC -GGGGGCGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCCTTGCACGCAGGGG-------------------GTCAACGGTTCAATCCCGTTCGCCTCCACCA
D00003967 Enterococcus_faecalis_V583 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00000048 Enterococcus_hirae Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00000066 Escherichia_coli Ala TGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCA
D00003992 Escherichia_coli_CFT073 Ala TGC -TGAGTGAAAGTCAGCT--GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCA
D00003994 Escherichia_coli_CFT073 Ala TGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCA
D00003716 Escherichia_coli_K12 Ala TGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCA
D00003718 Escherichia_coli_O157:H7 Ala TGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCA
D00003720 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Ala TGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCA
D00003898 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Ala TGC -GGGGATATAGCTCAGTTTGGG--AGAGCGACGCACTTGCACTGCGTAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTATCTCCACCA
D00004035 Geobacter_sulfurreducens_PCA Ala TGC -GGGGGTGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCATCGGTTCGAACCCGTTCACCTCCACCA
D00000030 Gluconacetobacter_europaeus Ala TGC -GGGGGCGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGTCCGCCTCCACCA
D00000032 Gluconacetobacter_hansenii Ala TGC -GGGGGCGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGTCCGCCTCCACCA
D00000034 Gluconacetobacter_liquefaciens Ala TGC -GGGGGCGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGAACCCGTCCGCCTCCACCA
D00000035 Gluconacetobacter_liquefaciens Ala TGC -GGGGGCGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGAACCCGTCCGTCTCCACCA
D00000038 Gluconacetobacter_xylinus Ala TGC -GGGGGCGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGTCCGCCTCCACCA
D00000047 Gluconobacter_oxydans Ala TGC -GGGGGCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGAACCCGTCTGCCTCCACCA
D00000089 Haemophilus_influenzae Ala TGC -GGGGATATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------T-CAGCGGTTCGATCCCGCTTATCTCCACCA
D00003682 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00003726 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Ala TGC -GGGGATATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTATCTCCACCA
D00000052 Helicobacter_pylori Ala TGC -GGGGAATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTATTCTCCACCA
D00003722 Helicobacter_pylori_26695 Ala TGC -GGGGAATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTATTCTCCACCA
D00003724 Helicobacter_pylori_J99 Ala TGC -GGGGAATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTATTCTCCACCA
D00000059 Lactobacillus_acidophilus Ala TGC -GGGGGCTTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCATCGGTTCGAACCCGTTAGCCTCCA---
D00000060 Lactobacillus_casei Ala TGC -GGGGGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCAAGCAGGAG-------------------GTCATCGGTTCGATCCCGTTATCCTCCA---
D00000062 Lactobacillus_curvatus Ala TGC -GGGGGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCAAGCAGGAG-------------------GTCATCGGTTCGATCCCGTTATCCTCCA---
D00000050 Lactobacillus_delbrueckii_subsp._bulgaricus Ala TGC -GGGGGCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGAG-------------------GTCATCGGTTCGATCCCGTTTGCCTCCA---
D00000064 Lactobacillus_helveticus Ala TGC -GGGGGCTTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCATCGGTTCGAACCCGTTAGCCTCCA---
D00004037 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Ala TGC -GGGGGCTTAGCTCAGAT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCATCGGTTCGATCCCGTTAGCCTCCA---
D00003968 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Ala TGC -GGGGAATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTATTCTCCA---
D00000053 Lactococcus_lactis Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCCCTAGGCTCCA---
D00000054 Lactococcus_lactis Ala TGC -GGGGCCGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGTCCGGCTCCACCA
D00000055 Lactococcus_lactis Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00004038 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCCTGCTTTGCAAGCAGGAT-------------------GTCAGGAGTTCGAATCTCCTAGGCTCCA---
D00003945 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Ala TGC -GGGGCTTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCATCTGATTTGCATTCAGAAG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGACAAGCTCCA---
D00000065 Leuconostoc_lactis Ala TGC -GGGGAATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTATTCTCCA---
D00000068 Leuconostoc_mesenteroides Ala TGC -GGGGAATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTATTCTCCA---
D00003756 Listeria_innocua_Clip11262 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCA
D00003757 Listeria_innocua_Clip11262 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCA
D00003758 Listeria_innocua_Clip11262 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCA
D00003759 Listeria_monocytogenes_EGD-e Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCA
D00003760 Listeria_monocytogenes_EGD-e Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00004064 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCA
D00004065 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00004066 Mesoplasma_florum_L1 Ala TGC -GGGCCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCCTTGCACGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGATAGGGTCCACCA
D00003771 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Ala TGC -GGGGCCGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCAAGCAGGAT-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGTCCGGCTCCACCA
D00003982 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACTGCCTTTGCAAGGCAGGG-------------------GTCAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGCTCCA---
D00000069 Mycobacterium_leprae Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCACTGCCTTTGCAAGGCAGAT-------------------GTCAGGGGTTCGATTCCCCTAGGCTCCA---
D00003711 Mycobacterium_leprae_TN Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCACTGCCTTTGCAAGGCAGAT-------------------GTCAGGGGTTCGATTCCCCTAGGCTCCA---
D00003698 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACTGCCTTTGCAAGGCAGGG-------------------GTCAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGCTCCA---
D00004020 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACTGCCTTTGCAAGGCAGGG-------------------GTCAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGCTCCA---
D00000027 Mycoplasma_capricolum Ala TGC -GGGCCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCCTTGCACGCAGGGG-------------------GTCGACGGTTCGATCCCGTTAGGGTCCACCA
D00003980 Mycoplasma_gallisepticum_R Ala TGC -GGGGACGTAGCTCAATT-GAT--AGAGCACCTGATTTGCACTCAGGAG-------------------GTCGAGGGTTTGACCCCCTTCGTCTCCACCA
D00000028 Mycoplasma_genitalium Ala TGC -GGGGATGTAGCTCAACT-GAT--AGAGCACCTGATTTGCACTCAGGAG-------------------GTTGAGGGTTTGAGACCCTTCATCTCCACCA
D00003736 Mycoplasma_genitalium_G37 Ala TGC -GGGGATGTAGCTCAACT-GAT--AGAGCACCTGATTTGCACTCAGGAG-------------------GTTGAGGGTTTGAGACCCTTCATCTCCACCA
D00000031 Mycoplasma_mycoides Ala TGC -GGGCCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCCTTGCACGCAGGGG-------------------GTCGACGGTTCGATCCCGTTAGGGTCCACCA
D00000033 Mycoplasma_pneumoniae Ala TGC -GGGGATGTAGCTCAACT-GAT--AGAGCACCTGATTTGCACTCAGGAG-------------------GTTGAGGGTTTGAGACCCTTCATCTCCACCA
D00003737 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Ala TGC -GGGGATGTAGCTCAACT-GAT--AGAGCACCTGATTTGCACTCAGGAG-------------------GTTGAGGGTTTGAGACCCTTCATCTCCACCA
D00003786 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Ala TGC -GGGGGGGTAGCTCACCT-GGCT-AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTAGAGGGTTCGACTCCCTTCCTCTCCACCA
D00003700 Neisseria_meningitidis_MC58 Ala TGC -GGGGGCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCATCGGTTCGATCCCGTTTGCCTCCACCA
D00003701 Neisseria_meningitidis_MC58 Ala TGC -GGGGGCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCATCGGTTCGATCCCGTTTGCCTCCACCA
D00003703 Neisseria_meningitidis_Z2491 Ala TGC -GGGGGCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCATCGGTTCGATCCCGTTTGCCTCCACCA
D00003704 Neisseria_meningitidis_Z2491 Ala TGC -GGGGGCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCATCGGTTCGATCCCGTTTGCCTCCACCA
D00004005 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Ala TGC -GGGGGTGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCATCGGTTCGATCCCGTTCACCTCCACCA
D00003782 Nostoc_sp._PCC_7120 Ala TGC -GGGGTCATAGCTCAACT-GGCT-AGAGCGTCCGCCTTGCAAGCGGGAG-------------------GTTAGGGGTTCAAATCCCCTTGATTCCA---
D00003783 Nostoc_sp._PCC_7120 Ala TGC -GGGGGTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCCTGCTTTGCAAGCAGGAT-------------------GTCAGCGGTTCGAGTCCGCTAACCTCCA---
D00003946 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCA
D00003947 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00000085 Ochrobactrum_anthropi Ala TGC -GGGGCCATAGCTCAGCTGGG---AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGTCTGGCTCCACCA
D00004019 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M Ala TGC -GGGGCTTTAGCTCAGCT-GGA--AGAGCATCTGTCTTGCACACAGAAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAAGCTCCACCA
D00003739 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Ala TGC -GGGGATATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTATCTCCACCA
D00004024 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Ala TGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCA
D00004041 Porphyromonas_gingivalis_W83 Ala TGC -GGGGGATTAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCATCGGTTCGAATCCGATATTCTCCA---
D00004043 Porphyromonas_gingivalis_W83 Ala TGC -GGGGGATTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCATCGGTTCGAATCCGATATTCTCCA---
D00000072 Prevotella_ruminicola Ala TGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCA
D00004067 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Ala TGC -GGGGCATTGGCGCAGTT-GGT--AGCGCGGCTGCTTTGCAAGCAGTAG-------------------GTCAGGGGTTCGAGTCCCCTATGCTCCA---
D00000074 Pseudomonas_aeruginosa Ala TGC -GGGGCCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGGAGTTCGATCCTCCTTGGCTCCACCA
D00003744 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Ala TGC -GGGGCCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGGAGTTCGATCCTCCTTGGCTCCACCA
D00000076 Pseudomonas_fluorescens Ala TGC -GGGGCCATAGCTCAGCTGGGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAACGGTTCGATCCCGTTTGGCTCCACCA
D00000079 Pseudomonas_mendocina Ala TGC -CGGGCCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGCTCCACCA
D00000087 Pseudomonas_pseudoalcaligenes Ala TGC -GGGGGCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------T-CGTCGGTTCGATCCCGTCTGCCTCCACCA
D00004009 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Ala TGC -GGGGCCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGCTCCACCA
D00000086 Ralstonia_pickettii Ala TGC -GGGGGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------T-CGTCGGTTCGATCCCGTCATCCTCCACCA
D00003779 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Ala TGC -GGGGGATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGTCATCCTCCACCA
D00003780 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Ala TGC -GGGTCTGTAGCTCAGGT-GGTT-AGAGCACCGTCTTGATAAGGCGGGG-------------------GTCGTAGGTTCAAGTCCTACCAGACCCACCA
D00004000 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Ala TGC -GGGGCGCTCGTCCAAC--GGG--AAGACGTCTGTTTTGCACGCAGAAA-------------------A-TCGGGGTTCGATTCCCCGGTGCTCCA---
D00004002 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Ala TGC -GGGGGTATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTCTGCTTTGCAAGCAGAAT-------------------GTCGTCGGTTCGAGTCCGTCTACCTCCA---
D00004003 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Ala TGC -GGGGCGCTCGTCCAAC--GGG--AAGACATCTGTTTTGCACGCAGAAA-------------------A-TCGGGGTTCGATTCCCCGGTGCTCCA---
D00004028 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Ala TGC -GGGGCCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCGTGCTTTGCAAGCATGAG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGTCTGGCTCCACCA
D00000061 Rhodothermus_marinus Ala TGC -GGGGTTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCCGGCTTTGCAAGCCGGAG-------------------GTCGTCGGTTCGAATCCGACTAACTCCACCA
D00003768 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Ala TGC -GGGGGCATAGCTCAGG--GGT--AGAGCATCTGCTTTGCACGCAGAGG-------------------GTCAAGGGTTCGATTCCCTTTGCCTCCACCA
D00003905 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Ala TGC -GGGGGCATAGCTCAGG--GGT--AGAGCATCTGCTTTGCACGCAGAGT-------------------GTCAAGGGTTCGATTCCCTTTGCCTCCACCA
D00004045 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Ala TGC -GGGGGCATAGCTCAGG--GGT--AGAGCATCTGCTTTGCACGCAGAGT-------------------GTCAAGGGTTCGATTCCCTTTGCCTCCACCA
D00003790 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Ala TGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCA
D00003999 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Ala TGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCA
D00003777 Salmonella_typhimurium_LT2 Ala TGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCA
D00003953 Shewanella_oneidensis_MR-1 Ala TGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCA
D00003956 Shigella_flexneri_2a_str._301 Ala TGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCA
D00003791 Sinorhizobium_meliloti_1021 Ala TGC -GGGGCTGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTCAGCTCCACCA
D00000039 Spiroplasma_melliferum Ala TGC -GGGCCCGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCCTTGCACGCAGGGG-------------------GTCGACGGTTCGATCCCGTTCGGGTCCACCA
D00000049 Staphylococcus_aureus Ala TGC -GGGGGCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGTCTCCACCA
D00004029 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Ala TGC -GGGGGCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGTCTCCACCA
D00003908 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Ala TGC -GGGGGCTTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGTCTCCACCA
D00003909 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Ala TGC -GGGGGCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGTCTCCACCA
D00003708 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Ala TGC -GGGGGCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGTCTCCACCA
D00003970 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Ala TGC -GGGGGCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGTCTCCACCA
D00000090 Stenotrophomonas_maltophilia Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------T-CGTCGGTTCGATCCCGACAGGCTCCACCA
D00003958 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00003910 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00003959 Streptococcus_mutans_UA159 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00000096 Streptococcus_pneumoniae Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00003765 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00003764 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00003911 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00003985 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00000095 Streptococcus_salivarius Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGGT-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCA---
D00003996 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCTGTCTTTGCATGGCAGAT-------------------GTCAGGGGTTCGACTCCCCTAGGCTCCA---
D00003950 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCTGTCTTTGCATGGCAGAT-------------------GTCAGGGGTTCGACTCCCCTAGGCTCCA---
D00004051 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Ala TGC -GGGGCTGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCAGCGCCTTTGCAAGGCGAAG-------------------GTCGAGGGTTCGAGTCCCTTCAGCTCCACCA
D00000091 Synechococcus_elongatus_PCC_6301 Ala TGC -GGGGGTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCCTGCTTTGCAAGCAGGAT-------------------GTCAGCGGTTCGAGTCCGCTAACCTCCACCA
D00000094 Synechocystis_sp. Ala TGC -GGGGGTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCCTGCTTTGCAAGCAGGAT-------------------GTCAGCGGTTCGAGTCCGCTAATCTCCA---
D00003747 Synechocystis_sp._PCC_6803 Ala TGC -GGGGGTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCCTGCTTTGCAAGCAGGAT-------------------GTCAGCGGTTCGAGTCCGCTAATCTCCA---
D00003919 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Ala TGC -GGGGACGTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCACCTGCCTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCCTCGTCTCCACCA
D00003920 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Ala TGC -GGGGGTGTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCACCTGCCTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCAGGAGTTCGAATCTCCTCATCTCCACCA
D00003914 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Ala TGC -GGGGGTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCTGCTTTGCACGCAGGGG-------------------GTCAGCGGTTCGAGTCCGCTTACCTCCA---
D00003750 Thermotoga_maritima_MSB8 Ala TGC -GGGGACGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCTTTGCAAGCAGGAG-------------------GTCAGGGGTTCGAATCCCCTCGTCTCCACCA
D00004070 Thermus_thermophilus_HB27 Ala TGC ---GGCGGTAGCTCAGA--GGG--AGAGCACCCGCCTTGCAAGCGGGAG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCCGCTCCACCA
D00004073 Treponema_denticola_ATCC_35405 Ala TGC -GGGGATATAGCTCAGCT-GGCT-AGAGCGGCGGCTTTGCAAGCCGTAG-------------------GTCAGGGGTTCGAATCCCCTTATCTCCA---
D00000042 Treponema_pallidum Ala TGC -GGGGGTATAGCTCAACT-GGCT-AGAGCGACGGCTTTGCAGGTCGTAG-------------------GTCAGGGGTTCGAGTCCCCTTATCTCCA---
D00003742 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Ala TGC -GGGGGTATAGCTCAACT-GGCT-AGAGCGACGGCTTTGCAGGTCGTAG-------------------GTCAGGGGTTCGAGTCCCCTTATCTCCA---
D00000070 Trichodesmium_sp. Ala TGC -GGGGGTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCTGCCTTTGCAAGGCAGAA-------------------GTCAGCGGTTCGA.TCCGCTTACCCCCA---
D00003971 Tropheryma_whipplei_str._Twist Ala TGC -GGGGATGTAGCTCAGTTAGGC--AGAGCGCCTGCTTTGCAAGCAGGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATTCCCCTCATCTCCACCA
D00003974 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Ala TGC -GGGGATGTAGCTCAGTTAGGC--AGAGCGCCTGCTTTGCAAGCAGGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATTCCCCTCATCTCCACCA
D00003712 Ureaplasma_parvum_serovar_3 Ala TGC -GGGGACGTAGCTCAAT--TGAT-AGAGCACCTGATTTGCACTCAGGAG-------------------GTCGTGGGTTTGACCCCCATCGTCTCCACCA
D00003706 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Ala TGC -GGGGTTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGAGG--------T----------CTGCGGTGTACGATCCCGCATAACTCCACCA
D00003707 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Ala TGC -GGGGTTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCTGCGGTTCGATCCCGCATAACTCCACCA
D00004076 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Ala TGC -GGGGGTATAGCTCAGCT-GGT--AGAGCATCTGTTTTGCACGCAGAAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGCCTCCACCA
D00003926 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGACAGGCTCCACCA
D00003927 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Ala TGC CCACTGGATAGCTCAATT-GGT--AGAGCAGCAGATTTGCAATCTGTTA-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGCTCCATGCA---
D00003923 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGACAGGCTCCACCA
D00003753 Xylella_fastidiosa_9a5c Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGACAGGCTCCACCA
D00003977 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Ala TGC -GGGGCCTTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCACCTGCTTTGCAAGCAGGGG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGACAGGCTCCACCA
D00004052 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Ala TGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCA
D00003775 Yersinia_pestis_CO92 Ala TGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCA
D00003931 Yersinia_pestis_KIM Ala TGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCA
D00004054 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Ala TGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCCTTGCACGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCA
D00000222 Arabidopsis_thaliana Ala TGC -GGGGATGTAGCTCATAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTTGCATGCGAGAG-------------------GCACAGGGTTCGATTCCCTGCATCTCCA---
D00003870 Arabidopsis_thaliana Ala TGC -GGGGATGTAGCTCATAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTTGCATGCGAGAG-------------------GCACAGGGTTCGATTCCCTGCATCTCCA---
D00003871 Arabidopsis_thaliana Ala TGC -GGGGATGTAGCTCAAAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTTGCATGCGAGAG-------------------GCACGGGGTTCGATCCCCCGCATCTCC----
D00000223 Brassica_napus Ala TGC -GGGGATGTAGCTCATAT-GGT--AGAGCACTCGATTTGCATGCGAGAG-------------------GCACAGGGTTCGATTCCCTGCATCTCCA---
D00000225 Caenorhabditis_elegans Ala TGC -GGGGGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCGCTCGCTTTGCATGCGAGAA-------------------GTCTGGGGTTCGATTCCCCATACCTCCA---
D00003882 Caenorhabditis_elegans Ala TGC -GGGCACATGGCGCAGTT-GGT--AGCGCGCTTCTCTTGCAAGGAAGAG-------------------T-CATCGGTTCGATTCTGGTTGCGTCC----
D00003883 Caenorhabditis_elegans Ala TGC -GGGGGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCGCTCGCTTTGCATGCGAGAA-------------------GTCTGGGGTTCGATTCCCCATACCTCCA---
D00003884 Caenorhabditis_elegans Ala TGC -GGGCACATGGCGCAGTT-GGT--AGCGCGCTTCCCTTGCAAGGAAGAG-------------------GTCATCGGTTCGATTCCGGTTGCGTCCA---
D00004057 Candida_glabrata_CBS_138 Ala TGC -GGGCACATGGCGCAGTT-GGT--AGCGCGCTTCCCTTGCAAGGAAGAG-------------------GTCATCGGTTCGATTCCGGTTGCGTCCA---
D00000097 Cyanophora_paradoxa Ala TGC -GGGGGTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCTGCCTTTGCAAGGCAGAT-------------------GTCAGCGGTTCGAGTCCGCTTACCTCCA---
D00003890 Drosophila_melanogaster Ala TGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCTCGCTTTGCATGTGAGAG-------------------GCCCCGGGTTCAATCCCCGGCATCTCC----
D00003891 Drosophila_melanogaster Ala TGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCTCGCTTTGCATGTGAGAG-------------------GCCCCGGGTTCGATCCCCGGCATCTCC----
D00003928 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Ala TGC -GGGGTTGTGGTCTAGT--GGT--ATGATACCTGCTTTGCACGCAGTTG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCTGGCAACTCCA---
D00000232 Gallus_gallus Ala TGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGTGCGCATGCTTTGCATGTATGAG-------------------GCCCCGGGTTCAATCCCCGGCATCTCCA---
D00000233 Gallus_gallus Ala TGC -GGGGATGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCGCATGCTTTGCATGTATGAG-------------------GTCCCGGGTTCAATCCCCGGCATCTCCA---
D00004096 Gallus_gallus Ala TGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACACGCTTTGCACGTATGAG-------------------GTCTCGGGTTTAATCCCTGGCATCTCCA---
D00004097 Gallus_gallus Ala TGC -GGGGATGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCGCCTGCTTTGCATGCAGGAG-------------------GCCCTGGGTTCAACCCCCAGCATCTCCA---
D00004098 Gallus_gallus Ala TGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCATGCTTTGCATGTATGAG-------------------GCCCCGGGTTCAATCCCCGGCATCTCCA---
D00004099 Gallus_gallus Ala TGC -GGGGATGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCGCATGCTTTGCATGTATGAG-------------------GTCCCGGGTTCAATCCCCGGCATCTCCA---
D00000241 Homo_sapiens Ala TGC -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCATGCTTTGCATGTATGAG-------------------G-CCTCGGTTCGATCCCCGACACCTCCA---
D00003857 Homo_sapiens Ala TGC -GGGGATGTAGTTTACAT-GGTT-AAAACATAAGTTTTGCAAACTTAAG-------------------T-ACAGGGTTCAATTCCCTGCTTCTCC----
D00003858 Homo_sapiens Ala TGC -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCATGCTTTGCATGTATGAG-------------------GCCTCGG-TTCGATCCCCGACACCTCCA---
D00003859 Homo_sapiens Ala TGC -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACATGCTTTGCATGTGTGAG-------------------GCCCCGGGTTCGATCCCCGGCACCTCC----
D00003860 Homo_sapiens Ala TGC -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCATGCTTTGCATGTATGAG-------------------GCCTCGGGTTCGATCCCCGACACCTCC----
D00003861 Homo_sapiens Ala TGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCATGCTTTGCATGTATGAG-------------------GCCCCGGGTTCGATCCCCGGCATCTCCA---
D00003862 Homo_sapiens Ala TGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCATGCTTTGCATGTATGAG-------------------GTCCCGGGTTCGATCCCCGGCATCTCCA---
D00003863 Homo_sapiens Ala TGC -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCATGCTTTGCATGTATGAG-------------------GTCCCGGGTTCGATCCCCGGCACCTCCA---
D00004138 Pan_troglodytes Ala TGC -GGCGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGGGCACATGCTTTGCATGTGTGAG-------------------GCCCCGGGTTCGATCCCCGGCACCACCA---
D00004139 Pan_troglodytes Ala TGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCATGCTTTGCATGTATGAG-------------------GCCCTGGGTTCGATCCCCGGCATCTCCA---
D00004140 Pan_troglodytes Ala TGC -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCATGCTTTGCATGTATGAG-------------------GCCTCGGGTTCGATCCCCGACACCTCCA---
D00004141 Pan_troglodytes Ala TGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCATGCTTTGCATGTATGAG-------------------GCCCCGGGTTCAATCCCCGGCATCTCCA---
D00004142 Pan_troglodytes Ala TGC -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACATGCTTTGCATGTATGAG-------------------GCCCCGGGTTCGATCCCCGGCACCTCCA---
D00004143 Pan_troglodytes Ala TGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCATGCTTTGCATGTATGAG-------------------GCCCCGGGTTCGATCCCCGGCATCTCCA---
D00004144 Pan_troglodytes Ala TGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCATGCTTTGCATGTATGAG-------------------GTCCCGGGTTCGATCCCCGGCATCTCCA---
D00000215 Plasmodium_falciparum Ala TGC -GGGAATATAGTTTAAT--GGT--AAAATCTTATTTTTGCATAATAAAG-------------------A-TAGTAGTTCAATTCTACTTATTTCCA---
D00004083 Plasmodium_falciparum_3D7 Ala TGC -GGGCAGGTGGTGTAGT--GGT--ATCACGCTTGATTTGCATTCAAGAG-------------------GTCCGGGGTTCAATTCCCCGTCTGTCCA---
D00000098 Pylaiella_littoralis Ala TGC -GGGGGTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGTTGCTTTTGCATAGCAGAC-------------------GTCAGCAGTTCGAGTCTGCTTATCTCCA---
D00000218 Saccharomyces_cerevisiae Ala TGC -GGGCACATGGCGCAGTT-GGT--AGCGCGCTTCCCTTGCAAGGAAGAG-------------------GTCATCGGTTCGATTCCGGTTGCGTCCA---
D00003886 Saccharomyces_cerevisiae Ala TGC -GGGCACATGGCGCAGTT-GGT--AGCGCGCTTCCCTTGCAAGGAAGAG-------------------GTCATCGGTTCGATTCCGGTTGCGTCCA---
D00003894 Schizosaccharomyces_pombe Ala TGC -GGGCATGTGATGCAGT--GGT--AGCATGCTCGCTTTGCATGCGAGTC-------------------GTCCTGGGTTCAATCCCCAGCGTGTCC----
D00000224 Solanum_tuberosum Ala TGC -GGGGATGTAGCTCATAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTTGCATGCGAGAG-------------------GTACAGGGTTCGATCCCCTGCATCTCCA---
D00004108 Takifugu_rubripes Ala TGC -GGGGAATTAGCTCAAAA-GGT--AGAGCGCTCGCTTTGCATGTGAGAG-------------------GTAGTGGGATCGATGCCCACATTCTCCA---
D00004109 Takifugu_rubripes Ala TGC -GGGGAATTAGCTCAAGT-GGT--AGAGCGCTCGCTTTGCATGTGAGAG-------------------GTAGTGGGATCGATGCCCACATTCTCCA---
D00004110 Takifugu_rubripes Ala TGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCATGCTTTGCATGTATGAG-------------------GCCCCGGGTTCAATCCCCGGCATCTCCA---
D00004111 Takifugu_rubripes Ala TGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCTTGCTTTGCATGTAAGCG-------------------GTCCTGGGTTCAATCCCCAGCATCTCCA---
D00000221 Toxoplasma_gondii Ala TGC -AGGGATATAGCTCAGGA-GGT--AGAGCACTTTTTTTGCAAAAAAGAA-------------------ATTTACGGTTCAAGTCCGTTTATCTCCA---
D00000231 Xenopus_laevis Ala TGC -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCATGCTTTGCATGTATGAG-------------------GTCTTGGGTTCAATCCCCAGCATCTCCA---
D00003795 Aeropyrum_pernix_K1 Ala GGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGA--AGAGCGCCCGGTTGGCATCCGGGAG-------------------GCCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCACC-
D00000007 Archaeoglobus_fulgidus Ala GGC -GGGCCGGTAGCTCAGTCTGGT--AGAGCGTCGCCTTGGCATGGCGAAG-------------------GCCTGGGGTTCAAATCCCCACCGGTCCA---
D00003798 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Ala GGC -GGGCCGGTAGCTCAGTCTGGT--AGAGCGTCGCCTTGGCATGGCGAAG-------------------GCCTGGGGTTCAAATCCCCACCGGTCCA---
D00003801 Halobacterium_sp._NRC-1 Ala GGC -GGGCTCGTAGATCAGT--GGT--AGATCATCCCCCTGGCACGGGGAAG-------------------GCCTCGGGTTCAAATCCCGACGAGTCCA---
D00000017 Methanocaldococcus_jannaschii Ala GGC -GGGCTGGTAGCTCAGACTGGG--AGAGCGCCGCATTGGCTGTGCGGAG-------------------GCCGCGGGTTCAAATCCCGCCCAGTCCA---
D00003805 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Ala GGC -GGGCTGGTAGCTCAGACTGGG--AGAGCGCCGCATTGGCTGTGCGGAG-------------------GCCGCGGGTTCAAATCCCGCCCAGTCCACC-
D00011875 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Ala GGC -GGGCTGATAGCTCAGCTTGGG--AGAGTGCCGCATTGGCTATGCGGAA-------------------GCCGCGGGTTCAAATCCCGCTCAGTCCA---
D00003807 Methanococcus_maripaludis Ala GGC -GGGCTGATAGCTCAGACTGGG--AGAGTGCCGCATTGGCTATGCGGAT-------------------GCCGCGGGTTCAAATCCCGCTCAGTCC----
D00003934 Methanopyrus_kandleri_AV19 Ala GGC -GGGCCCGCAGCTCAGCCTGGC--AGAGCGCGGCCTTGGCGCGGCCGTG-------------------GCCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGTCCACCA
D00011889 Methanosarcina_acetivorans_C2A Ala GGC -GGGCCGGTAGATCAGG--GGA--AGATCGCTACCTTGGCATGGTAGAG-------------------GCCTCGGGTTCAATTCCCGACCGGTCCA---
D00003900 Methanosarcina_mazei_Go1 Ala GGC -GGGCCGGTAGATCAGG--GGA--AGATCGCTACCTTGGCATGGTAGAG-------------------GCCTCGGGTTCAATTCCCGACCGGTCCA---
D00011938 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Ala GGC -GGGCCGGTAGATCAGT--GGG--AGATCGCTACCTTGGCATGGTAGAG-------------------GCCGCGGGTTCAATTCCCGCTCGGTCCA---
D00003803 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Ala GGC -GGGCTGGTAGCTCAGGTTGGT--AGAGCGTCGCCTTGGCATGGCGGAG-------------------GCCCCGGGTTCAAATCCCGGCCAGTCCA---
D00011999 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Ala GGC -GGGCCCGTAGTCCAGC--GGT--AGGACGCCGCCCTGGCACGGCGGAG-------------------GCCCCGGGTTCGAATCCCGGCGGGTCCA---
D00003810 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Ala GGC -GGGCCGGTAGTCTAGC--GGA--AGGATGCCCGCTTGGCGTGCGGGAG-------------------ATCCCGGGTTCGAATCCCGGCCGGTCCA---
D00003813 Pyrococcus_abyssi_GE5 Ala GGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGTA-TGAGCGCCGCCTTGGCAAGGCGGAG-------------------GCCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCACC-
D00003816 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Ala GGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGTA-TGAGCGCCGCCTTGGCAAGGCGGAG-------------------G-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCACC-
D00003819 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Ala GGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGTA-TGAGCGCCGCCTTGGCAAGGCGGAG-------------------GCCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCACCA
D00012024 Staphylothermus_marinus_F1 Ala GGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGA--AGAGCGCTCGGTTGGCATCCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCACCA
D00012064 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Ala GGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGA--AGAGTGCGTGGTTGGCATCCACGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCA---
D00003822 Sulfolobus_solfataricus_P2 Ala GGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGA--AGAGTGCTCGGTTGGCATCCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCC----
D00003916 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Ala GGC -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGA--AGAGTGCTCGGTTGGCATCCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCA---
D00003825 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Ala GGC -GGGCCGGTAGATCAGA--GGT--AGATCGCTTCCTTGGCATGGAAGAG-------------------GCCAGGGGTTCAAATCCCCTCCGGTCCA---
D00003828 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Ala GGC -GGGCCGGTAGATCAGA--GGT--AGATCGCTTCCTTGGCATGGAAGAG-------------------GCCATGGGTTCAAATCCCATCCGGTCCA---
D00004077 Acinetobacter_sp._ADP1 Ala GGC -GGGGTCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCTACAATGGCATTGTAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGCTCCACCA
D00003788 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCA
D00003754 Aquifex_aeolicus_VF5 Ala GGC -GGGGCGGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCGATATGGCATGTCGGAG-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCCCTCCGCTCCACCA
D00003960 Bacillus_halodurans_C-125 Ala GGC -GGGGCATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTCGCTGGCAGCGAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGAGCCCGCTATGCTCCACCA
D00003691 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Ala GGC -GGGGCCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTACGCTGGCAGCGTAGAG-------------------GTCAGGGGTTCGAGCCCCCTTGGCTCCA---
D00004008 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Ala GGC -GGGGCGTTAGCTCATCT-GGCT-AGAGCGCGACACTGGCAGTGTCGAG-------------------GTGATCGGTTCGAGTCCGATACGCTCCA---
D00004013 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCA
D00004084 Bartonella_quintana_str._Toulouse Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCA
D00004015 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Ala GGC -GGGGCCGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCAACGCTGGCAGTGTTGAG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGATCGGCTCCACCA
D00003936 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Ala GGC -GGGGCTATAGCGCAGCT-GGT--AGCGCATCTCCATGGCATGGAGAGG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCCCTAGCTCCA---
D00003963 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Ala GGC -GGGGCCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGCCTGGCTCCACCA
D00003941 Brucella_suis_1330 Ala GGC -GGGGCCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGCTCCACCA
D00003694 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Ala GGC -GGGGCTATAGCTCATTT-GGT--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAT-------------------GTCAGCGGTTCGATTCCGCTTAGCTCCA---
D00003990 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Ala GGC -GGGGTTATAGCTCAATT-GGT--AGAGCGTTTGCATGGCATGCAAAGG-------------------GTTAGCGGTTCAAATCCGCTTAACTCCA---
D00003902 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGA--GGC--AGAGTTCTTGCATGGCATGCAAGAT-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGCCTAGCTCCA---
D00003728 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Ala GGC -GGGGCATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCACAACGCTGGCAGCGTTGGG-------------------GTCAGCGGTTCGAACCCGCTATGCTCCACCA
D00004023 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Ala GGC -GGGGCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAACAATGGCATTGTTGAG-------------------GTCAACGGTTCGACTCCGTTACGCTCCA---
D00003731 Caulobacter_crescentus_CB15 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGT--AGAGCGCTTGAATGGCATTCAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGACTCCGCTTAGCTCCACCA
D00003762 Chlamydia_muridarum_Nigg Ala GGC -GGGGTATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAACAATGGCATTGTTGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTATGCTCCA---
D00003689 Chlamydia_trachomatis Ala GGC -GGGGTATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAACAATGGCATTGTTGAG-------------------GTCAGCGGTTCGACCCCGCTATGCTCC----
D00003687 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Ala GGC -GGGGTATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAACAATGGCATTGTTGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTATGCTCCA---
D00003683 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Ala GGC -GGGGTATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAACAATGGCATTGTTGAG-------------------GTCAGCGGTTCGACCCCGCTATGCTCCA---
D00003685 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Ala GGC -GGGGTATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAACAATGGCATTGTTGAG-------------------GTCAGCGGTTCGACCCCGCTATGCTCCA---
D00003713 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Ala GGC -GGGGTATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAACAATGGCATTGTTGAG-------------------GTCAGCGGTTCGACCCCGCTATGCTCCA---
D00003897 Chlorobium_tepidum_TLS Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATTTGCATGGCATGCAAAGG-------------------GTCAGGAGTTCGAGTCTCCTTAGCTCCA---
D00004018 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Ala GGC -GGGGCTATGGCGCAGCT-GGT--AGCGCATCACACTGGCAGTGTGGGG-------------------GTCACGGGTTCGAATCCCGTTAGCTCCA---
D00003943 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Ala GGC -GGGGCTATGGCGCAGCT-GGT--AGCGCACCACACTGGCAGTGTGGGG-------------------GTCACGGGTTCGAATCCCGTTAGCTCCA---
D00003907 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Ala GGC -GGGGCTATGGCGCAGCT-GGT--AGCGCACCACACTGGCAGTGTGGGG-------------------GTCACGGGTTCGAATCCCGTTAGCTCCA---
D00003986 Coxiella_burnetii_RSA_493 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCA---
D00003734 Deinococcus_radiodurans_R1 Ala GGC -GGGGCTGTGGCGCAGTT-GGG--AGCGCGTCTGAATGGCATTCAGAAG-------------------GTCAGGGGTTCGAATCCCCTCAGCTCCACCA
D00004061 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Ala GGC -GGGGCTGTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCTTGAATGGCATTCAAGAG-------------------GTCAGGAGTTCAATTCTCCTCAGCTCCACCA
D00000067 Escherichia_coli Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCA
D00003993 Escherichia_coli_CFT073 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCA
D00003715 Escherichia_coli_K12 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCA
D00003717 Escherichia_coli_O157:H7 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCA
D00003719 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCA
D00004036 Geobacter_sulfurreducens_PCA Ala GGC -GGGGCTGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGAATGGCATTCAAGAG-------------------GTCGTCAGTTCGATCCTGATCAGCTCCACCA
D00000088 Haemophilus_influenzae Ala GGC -GGGGATATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCTTGAATGGCATTCAAGAG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGATTATCTCCACCA
D00003725 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Ala GGC -GGGGATATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCTTGAATGGCATTCAAGAG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGATTATCTCCACCA
D00003981 Helicobacter_hepaticus_ATCC_51449 Ala GGC -GGGGTGTTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCAACGCTGGCAGCGTTGAG-------------------GTCAGGGGTTCGAACCCCCTACACTCCACCA
D00000051 Helicobacter_pylori Ala GGC -GGGGTGTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCAACGCTGGCAGCGTTGAG-------------------GTCAGGGGTTCGAACCCCCTACACTCCACCA
D00003721 Helicobacter_pylori_26695 Ala GGC -GGGGTGTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCAACGCTGGCAGCGTTGAG-------------------GTCAGGGGTTCGAACCCCCTACACTCCACCA
D00003723 Helicobacter_pylori_J99 Ala GGC -GGGGTGTTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCAACGCTGGCAGCGTTGAG-------------------GTCAGGGGTTCGAACCCCCTACACTCCACCA
D00004040 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Ala GGC -GGGTCTGTGGCGCAGCT-GGT--AGCGCACCTGCATGGCATGCAGGGG-------------------GTCAGGGGTTCGAGTCCCCTCAGATCCACCA
D00003944 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Ala GGC -GGGGACGTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCATTTGAATGGCATTCAAAAG-------------------GTCGGGGGTTCGATTCCCCTCGTCTCCA---
D00003773 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Ala GGC -GGGGCCATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCTTGAATGGCATTCAAGAG-------------------GTCGTCGGTTCGATTCCGATTGGCTCCACCA
D00003984 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Ala GGC -GGGGCTATGGCGCAGCT-GGT--AGCGCACCACACTGGCAGTGTGGGG-------------------GTCAGGGGTTCGAGTCCCCTTAGCTCCA---
D00003710 Mycobacterium_leprae_TN Ala GGC -GGGGCTATGGCGCAGCT-GGT--AGCGCACCACACTGGCAGTGTGGGG-------------------GTCAGGGGTTCGAGTCCCCTTAGCTCCA---
D00003697 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Ala GGC -GGGGCTATGGCGCAGCT-GGT--AGCGCACCACACTGGCAGTGTGGGG-------------------GTCAGGGGTTCGAGTCCCCTTAGCTCCA---
D00004022 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Ala GGC -GGGGCTATGGCGCAGCT-GGT--AGCGCACCACACTGGCAGTGTGGGG-------------------GTCAGGGGTTCGAGTCCCCTTAGCTCCA---
D00003699 Neisseria_meningitidis_MC58 Ala GGC -GGGGGTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTACCTCCACCA
D00003702 Neisseria_meningitidis_Z2491 Ala GGC -GGGGGTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATTCCGCTTACCTCCACCA
D00004006 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Ala GGC -GGGGGTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTATCTCCACCA
D00003784 Nostoc_sp._PCC_7120 Ala GGC -GGGGTTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACTTCAATGGCATTGAAGGG-------------------GTCAGCGGTTCGAATCCGCTTAACTCCA---
D00003948 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Ala GGC -GGGGCATTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTCACTGGCAGTGAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGAGCCCGCTATGCTCCA---
D00003738 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Ala GGC -GGGGATATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGATTATCTCCACCA
D00004025 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCA
D00004042 Porphyromonas_gingivalis_W83 Ala GGC -GGGGTATTAGCTCATCT-GGCT-AGAGCGCGACACTGGCAGTGTCGAG-------------------GTGAGCGGTTCGAGTCCGCTATACTCCA---
D00004069 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Ala GGC -GGGGCATTGGCGCAGTT-GGT--AGCGCGCTTCCATGGCATGGAAGAG-------------------GTCAGGGGTTCGAATCCCCTATGCTCCA---
D00003743 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCGACGGTTCGATCCCGTCTAGCTCCACCA
D00004010 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Ala GGC -GGGGCTTTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTAAGCTCCACCA
D00003778 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCA
D00004001 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Ala GGC -GGGGGATTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGACGCGCTGGCAGCGCGTAG-------------------GTCATCGGTTCAAGTCCGTTATCCTCCA---
D00004026 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Ala GGC -GGGGCCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGCCTGGCTCCACCA
D00003767 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Ala GGC -GGGGTCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGTGTTTGAATGGCATTCAAAAG-------------------GTCGGGGGTTCGACTCCCCCTGGCTCCACCA
D00003904 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Ala GGC -GGGGTCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGTATTTGAATGGCATTCAAAAG-------------------GTTAGGGGTTCGATTCCCCTTGACTCCACCA
D00004044 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Ala GGC -GGGGTCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGTATTTGAATGGCATTCAAACG-------------------GTCGGGGGTTCGATTCCCCTTGACTCCACCA
D00003789 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCA
D00003998 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCA
D00003776 Salmonella_typhimurium_LT2 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCA
D00003954 Shewanella_oneidensis_MR-1 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCGACGGTTCGATCCCGTCTAGCTCCACCA
D00003955 Shewanella_oneidensis_MR-1 Ala GGC -GGGGGTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCGACGGTTCGATCCCGTCTAGCTCCACCA
D00003957 Shigella_flexneri_2a_str._301 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCA
D00003792 Sinorhizobium_meliloti_1021 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCA
D00003951 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAG-------------------GTCAGGAGTTCAATTCTCCTTAGCTCCA---
D00003952 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAG-------------------GTCAGGAGTTCAATTCTCCTTAGCTCCA---
D00004046 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCTTGAATGGCATTCAAGAG-------------------GTCAGGGGTTCGAATCCCCTTAGCTCCACCA
D00004048 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCTTGAATGGCATTCAAGAG-------------------GTCAGGGGTTCGACTCCCCTTAGCTCCACCA
D00004049 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Ala GGC -GGGGCTGTAGCTCAGAT-GGG--AGAGCGCTTGAATGGCATTCAAGAG-------------------GTCAGGGGTTCGATTCCCCTCAGCTCCACCA
D00000093 Synechocystis_sp. Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACTTGCATGGCATGCAAGGG-------------------GTCAGCGGTTCGAGCCCGCTTAGCTCCA---
D00003746 Synechocystis_sp._PCC_6803 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACTTGCATGGCATGCAAGGG-------------------GTCAGCGGTTCGAGCCCGCTTAGCTCCA---
D00003918 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Ala GGC -GGGGCTGTAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGCCACAATGGCATTGTGGAG-------------------GCCGTGGGTTCAAGTCCCATCAGCTCCACCA
D00003912 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACTTCAATGGCATTGAAGGG-------------------GTCAGCGGTTCGAATCCGCTTAGCTCCA---
D00003749 Thermotoga_maritima_MSB8 Ala GGC -GGGGCCGTAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTACCATGGCACGGTAGAG-------------------GTCGTGGGTTCAAGTCCCATCGGCTCCACCA
D00004071 Thermus_thermophilus_HB27 Ala GGC TGGGGCCGTGGCGCAGTT-GGG--AGCGCGCCTCAATGGCATTGAGGAG-------------------GTCAGGGGTTCGAATCCCCTCGGCTCCACCA
D00004075 Treponema_denticola_ATCC_35405 Ala GGC -GGGGATATAGCTCAATT-GGT--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCAGGGGTTCAATTCCCCTTATCTCCA---
D00000041 Treponema_pallidum Ala GGC -GGGGATGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCAGGGGTTCGATTCCCCTCATCTCCA---
D00003741 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Ala GGC -GGGGATGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCAGGGGTTCGATTCCCCTCATCTCCA---
D00003972 Tropheryma_whipplei_str._Twist Ala GGC -GGGGCTGTGGCGCAGCT-GGT--AGCGCATCTGCATGGCATGCAGAGG-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCCCTCAGCTCCA---
D00003976 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Ala GGC -GGGGCTGTGGCGCAGCT-GGT--AGCGCATCTGCATGGCATGCAGAGG-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCCCTCAGCTCCA---
D00003705 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCA
D00003924 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Ala GGC -GGGGCCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGCCTGGCTCCACCA
D00003921 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Ala GGC -GGGGCCATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAG-------------------GTCGGCGGTTCGATCCCGCCTGGCTCCACCA
D00003752 Xylella_fastidiosa_9a5c Ala GGC -GGGGCCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCGCCGGTTCGACCCCGGCTGGCTCCACCA
D00003979 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Ala GGC -GGGGCCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCGCCGGTTCGACCCCGGCTGGCTCCACCA
D00004053 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCGACGGTTCGATCCCGTCTAGCTCCACCA
D00003774 Yersinia_pestis_CO92 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCGACGGTTCGATCCCGTCTAGCTCCACCA
D00003932 Yersinia_pestis_KIM Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCGACGGTTCGATCCCGTCTAGCTCCACCA
D00003933 Yersinia_pestis_KIM Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCGACGGTTCGATCCCGTCTAGCTCCACCA
D00004055 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Ala GGC -GGGGCTATAGCTCAGCT-GGG--AGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAG-------------------GTCGACGGTTCGATCCCGTCTAGCTCCACCA
D00004095 Gallus_gallus Ala GGC -GTTTCTGTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGTTCTCAAGGCACGCGAAAG-------------------GTCCCCGGTTCGAAACCGGGCAGAAACA---
D00003997 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Ala AGC -GGGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAG-------------------GTCAGGAGTTCAATTCTCCTTAGCTCCA---
D00003864 Arabidopsis_thaliana Ala AGC -GGGGATGTAGCTCAGAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAG-------------------GCACGGGGATCGATACCCCGCATCTCC----
D00003865 Arabidopsis_thaliana Ala AGC -GGGGATGTAGCTCAAAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAG-------------------GTACGGGGATCGATACCCCGCATCTCC----
D00003866 Arabidopsis_thaliana Ala AGC -GGGGATGTAGCTCAGAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAG-------------------GTACGGGGATCGATACCCCGCATCTCCA---
D00000228 Bombyx_mori Ala AGC -GGGGGCGTAGCTCAGAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAG-------------------GTACCGGGATCGATACCCGGCGCCTCCA---
D00000229 Bombyx_mori Ala AGC -GGGGGCGTAGCTCAGAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGTGAGAG-------------------GTACCGGGATCGATACCCGGCGCCTCCA---
D00000227 Caenorhabditis_elegans Ala AGC -GGGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCTCCCTTAGCATGGGAGAG-------------------GGCTGGGGTTCAATTCCCCATACCTCCA---
D00003872 Caenorhabditis_elegans Ala AGC -----GTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCTCCCTTAGCATGGGAGAG-------------------GGCTGGGGTTCAATTCCCCATAACTCC----
D00003873 Caenorhabditis_elegans Ala AGC -GGGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCTCCCTTAGCATGGGAGAG-------------------GGCTGGGGTTCAATTCCCATTTTCCGT----
D00003874 Caenorhabditis_elegans Ala AGC -GGGGGTATAACTCAGT--GGT--AGATCGCTCCCTTAGCATGGGAGAG-------------------GGCTGGGGTTCAATTCCCCAAACCTCC----
D00003875 Caenorhabditis_elegans Ala AGC -GGGGGTATAGCTCAGT--AGT--AGAGCGCTCCCTTAGCATGGGAGAG-------------------GGCTGGGGTTCAATTCCCCATACCTCCA---
D00003876 Caenorhabditis_elegans Ala AGC -CGGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCTCCCTTAGCATGGGAGAG-------------------GGCTGGGGTTCAATTCCCCATACCTCCA---
D00003877 Caenorhabditis_elegans Ala AGC -GGGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCTCCCTTAGCATGGGAGAG-------------------GGCTGGGGTTCAATTCCCCATACCTCCA---
D00000217 Candida_albicans Ala AGC -GGGCGTGTGGCGTAGTT-GGT--AGCGCGTTCCCTTAGCATGGGAAAG-------------------GTCATGAGTTCGACTCTTATCTCGTCCA---
D00004056 Candida_glabrata_CBS_138 Ala AGC -GGGCGTGTGGCGTAGTT-GGT--AGCGCGCTCCCTTAGCATGGGAGAG-------------------GTCTTGGGTTCGATTCCCAACTCGTCCA---
D00000216 Dictyostelium_discoideum Ala AGC -GGGGAAGTAGCTCAGAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAG-------------------GTAAAGGGTTCGATACCCTTCTTCCTCA---
D00000230 Drosophila_melanogaster Ala AGC -GGGGATGTAGCTCAGAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGTGAGAG-------------------GTACGGGGATCGATGCCCCGCATCTCCA---
D00003887 Drosophila_melanogaster Ala AGC -GGGGATGTAGCTCAGAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGTGAGAG-------------------GTACGGGGATCGATGCCCCGCATCTCCA---
D00003888 Drosophila_melanogaster Ala AGC -GGGGATGTAGCTCAGAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGTGAGAG-------------------GTACGGGGATCGATACCCCGCATCTCCA---
D00003929 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Ala AGC -GGGGAGTTAGCTCAGC--GGT--AGAGCGCTTGCTTAGCATGTAAGAG-------------------GTCATGGGTTCAAATCCCATATTCTCCA---
D00004087 Gallus_gallus Ala AGC -GGGGAATTAGCTCAAGT-GGT--AGAGCGCTTGCTTAGCATGTGAGAG-------------------GCAGCGGGATCGATGCCCGCATTCTCCA---
D00004088 Gallus_gallus Ala AGC -GGGGAATTAGCTCAAGT-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGTGAGAG-------------------GCAGTGGGATCGATGCCCGCATTCTCCA---
D00004089 Gallus_gallus Ala AGC -GGGGAATTAGCTCAAAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGTGAGAG-------------------GTAGCGGGATCAATGCCCGCATTCTCCA---
D00004090 Gallus_gallus Ala AGC -GGGGAATTAGCTCAAAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAG-------------------GTAGCGGGATCGATGCCCGCATTCTCCA---
D00004091 Gallus_gallus Ala AGC -GGGGGATTAGCTCAAAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAG-------------------GTAGCGGGATCGATGCCCGCATCCTCCA---
D00003830 Homo_sapiens Ala AGC -GGGGGATTAGCTCAAGC-GGT--AGGGTGCCTGCTTAGCATGCAAGAG-------------------GTAGCAGGATCGACGCCTGCATTCTCC----
D00003831 Homo_sapiens Ala AGC -GGGGGTGTAGATCAGT--GGT--AGGGCGCACGCTTAGCATGCATGAG-------------------G-CCCTGGGTCAATCCCCAGCACCTCC----
D00003832 Homo_sapiens Ala AGC -GGGGAATTAGCTCAGGC-GGTGGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAGGT---------------------AGCGAGATCGACGCCCGCATTCTCC----
D00003833 Homo_sapiens Ala AGC -GGGGGATTAGCTCAAAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAG-------------------GTAGCGGGATCGATGCCCG-ATCCTCC----
D00003834 Homo_sapiens Ala AGC -GGGGAATTGGCTCAAGC-GGT--AGAGCGCTTGCTTAGCATGCAAGAG-------------------GTAGCAGGATCGACGCCTGCACTCTCC----
D00003835 Homo_sapiens Ala AGC -GGGGAATTAGCGCAAGT-GGT--AGAGTGCTTGCTTAGCATGCAAGAG-------------------GTAGTGGGATCGATGCCCACATTCTCC----
D00003836 Homo_sapiens Ala AGC -GGGGAATTAGCCCAAGT-GGT--AGAGCGCTTGCTTAGCATGCAAGAG-------------------GTAGTGGGATCGATGCCCACATTCTCC----
D00003837 Homo_sapiens Ala AGC -GGGGAATTAGCTCAAGT-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAG-------------------GTAGTGGGATCGATGCCCGCATTCTCC----
D00003838 Homo_sapiens Ala AGC -GGGGAATTAGCTCAAGT-GGT--AGAGCGCTTGCTTAGCATGCAAGAG-------------------GTAGTGGGATCAATGCCCACATTCTCC----
D00003839 Homo_sapiens Ala AGC -GGGGAATTAGCTCAAGC-GGT--AGAGCGCTTGCTTAGCATGCAAGAG-------------------GTAGTGGGATCGATGCCCACATTCTCC----
D00003840 Homo_sapiens Ala AGC -GGGGAATTAGCTCAAGT-GGT--AGAGCGCTTGCTTAGCATGCAAGAG-------------------GTAGTGGGATCGATGCCCACATTCTCC----
D00003841 Homo_sapiens Ala AGC -GGGGAATTAGCTCAAAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAG-------------------GTAGCGGGATCGATGCCCGCATTCTCC----
D00003842 Homo_sapiens Ala AGC -GGGGAATTAGCTCAAGT-GGT--AGAGCGCTTGCTTAGCACGCAAGAG-------------------GTAGTGGGATCGATGCCCACATTCTCC----
D00003843 Homo_sapiens Ala AGC -GGGGAATTAGCTCAGGC-GGTAGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAGGT---------------------AGCGGGATCGACGCCCGCATTCTCC----
D00003844 Homo_sapiens Ala AGC -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGTATGCTTAGCATTCATGAG-------------------GCTCTGGGTTCGATCCCCAGCACTTCC----
D00003845 Homo_sapiens Ala AGC -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCGTGCTTAGCATGCACGAG-------------------GCCCCGGGTTCAATCCCTGGCACCTCC----
D00003846 Homo_sapiens Ala AGC -GGGGGTATAGCTCAGC--GGT--AGAGCGCGTGCTTAGCATGCACGAG-------------------GTCCTGGGTTCAATCCCCAATACCTCC----
D00003847 Homo_sapiens Ala AGC -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCGTGCTTAGCATGCACGAG-------------------GCCCTGGGTTCAATCCCCAGCACCTCC----
D00003848 Homo_sapiens Ala AGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCATGCTTAGCATGCATGAG-------------------GTCCCGGGTTCGATCCCCAGCATCTCC----
D00003849 Homo_sapiens Ala AGC -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCGTGCTTAGCATGTACGAG-------------------GTCCCGGGTTCAATCCCCGGCACCTCC----
D00003850 Homo_sapiens Ala AGC -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCGTGCTTAGCATGCACGAG-------------------GCCCCGGGTTCAATCCCCGGCACCTCC----
D00003851 Homo_sapiens Ala AGC -GGGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCGTGCTTAGCATGCACGAG-------------------GTCCTGGGTTCGATCCCCAGTACCTCC----
D00000237 Nephila_clavipes Ala AGC -GGGGGCGTAGCTCAGAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAG-------------------GTACGGGTATCGATACCCCGCGCTTCCA---
D00000238 Nephila_clavipes Ala AGC -GGGGGCGTAGCTCAGAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAG-------------------GTACGGGGATCGATACCCCGCGCTTCCA---
D00000239 Nephila_clavipes Ala AGC -GGGGGCGTAGCTCAGAT-GTT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAG-------------------GTACGGGGATCGATACCCCGCGTCTCCA---
D00000240 Nephila_clavipes Ala AGC -GGGGGCGTAGCTCAGAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAG-------------------GTACGGGGATCGATACCCCGCCCTTCCA---
D00000236 Oryctolagus_cuniculus Ala AGC -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGTT-AGAGCGCGTGCTTAGCATGCACGAG-------------------GCCCCGGGTTCAATCCCCGGCACCTCCACCA
D00004112 Pan_troglodytes Ala AGC -GGGGAATGAGCTCAAGC-GGT--AGAGCGCTTGCTTAGCATGCAAGAG-------------------GTAGCAGGATCGACGCCTGCACTCTCCA---
D00004113 Pan_troglodytes Ala AGC -GGGGGATTAGCTCAAGC-GGT--AGAGCGCCTGCTTAGCATGCAAGAG-------------------GTGGCAGGATCGACGCCTGCATTCTCCA---
D00004114 Pan_troglodytes Ala AGC -AGGGAATTAGCTCAGGC-GGT--AGAGCGCTCGCTCAGCATGCGAGAG-------------------GTAGCGGGATCGACGCCCGCATTCTCCG---
D00004115 Pan_troglodytes Ala AGC -GGGGAATTAGCTCAAGT-GGT--AGAGCGCTTGCTTAGCATGCAAAGA--------G----------GTAGTGGGATCGATGCCCACATTCTCCA---
D00004116 Pan_troglodytes Ala AGC -GTGGGATTAGCTCAAGC-GGT--AGAGCGCTTGCTTAGCATGCAAGAG-------------------GTAGCAGGATCGACGCCTGCATTCTCCA---
D00004117 Pan_troglodytes Ala AGC -GGGGGTGTAGATCAGT--GGT--AGGGCGCATGCTTAGCATGCATGAG-------------------G-CCCTGGGTCAATCCCCAGCACCTCCA---
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D00004119 Pan_troglodytes Ala AGC -GGGGGTATAGCTCAGC--GGT--AGAGCTCGTGCTTAGCATGCACAAG-------------------GTCCTGGGTTCAATCCTCAGCACCTCCT---
D00004120 Pan_troglodytes Ala AGC -GGGGAATTAGCTCAAGT-GGT--AGAGCGCTTGCTTAGCATGCAAGAG-------------------GTAGTGGGATCAATGCCCACATTCTCCA---
D00004121 Pan_troglodytes Ala AGC -GGGGAATTAGCTCAAGT-GGT--AGAGCGCTTGCTTAGCATGCAAGAG-------------------GTAGTGGGATCGATGCCCACATTCTCCA---
D00004122 Pan_troglodytes Ala AGC -GGGGAATTAGCTCAAAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAG-------------------GTAGCGGGATCGATGCCCGCATTCTCCA---
D00004123 Pan_troglodytes Ala AGC -GGGGAATTAGCTCAGGC-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAG-------------------GTAGCGGGATCGACGCCCGCATTCTCCA---
D00004124 Pan_troglodytes Ala AGC -GGGGGATTAGCTCAAAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAG-------------------GTAGCGGGATCGATGCCCGCATCCTCCA---
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D00004126 Pan_troglodytes Ala AGC -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCGTGCTTAGCATGCACGAG-------------------GCCCTGGGTTCAATCCCCGCCACCTCCA---
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D00004128 Pan_troglodytes Ala AGC -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGTATGCTTAGCATGCATGAG-------------------GCCCTGGGTTCGATCCCCAGCACCTCCA---
D00004129 Pan_troglodytes Ala AGC -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCGTGCTTAGCATGCACGAG-------------------GCCCTGGGTTCAATCCCCAGCACCTCCA---
D00004130 Pan_troglodytes Ala AGC -GGGGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCATGCTTAGCATGCATGAG-------------------GTCCCGGGTTCGATCCCCAGCATCTCCA---
D00004131 Pan_troglodytes Ala AGC -GGGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCGTGCTTAGCATGCACGAG-------------------GCCCTGGGTTCGATCCCCAGTACCTCCA---
D00004132 Pan_troglodytes Ala AGC -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCGTGCTTAGCATGCACGAG-------------------GCCCCGGGTTCAATCCCCGGCACCTCCA---
D00004081 Plasmodium_falciparum_3D7 Ala AGC -GGGCGACTAGCTCAAGT-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAG-------------------GTACGGGGATCGATACCCCGGTCGTCCA---
D00000219 Saccharomyces_cerevisiae Ala AGC -GGGCGTGTGGCGTAGTC-GGT--AGCGCGCTCCCTTAGCATGGGAGAG-------------------GTCTCCGGTTCGATTCCGGACTCGTCCA---
D00003885 Saccharomyces_cerevisiae Ala AGC -GGGCGTGTGGCGTAGTC-GGT--AGCGCGCTCCCTTAGCATGGGAGAG-------------------GTCTCCGGTTCGATTCCGGACTCGTCCA---
D00000220 Schizosaccharomyces_pombe Ala AGC -GGGCATGTGGTGTAGAT-GGTT-ATCACGCTTCCTTAGCATGGAAGAG-------------------GTCCCAGATTCGAGTTCTGGCTTGTCCA---
D00003892 Schizosaccharomyces_pombe Ala AGC -GGGCATGTGGTGTAGAT-GGTT-ATCACGCTTCCTTAGCATGGAAGAG-------------------GTCCCAGATTCGAGTTCTGGCTTGTCCA---
D00004100 Takifugu_rubripes Ala AGC -NNNNNNNNTGCTCAAAT-GGT--AAAGCGCTCGCTTAGCACGCGAGAG-------------------GTAGCGGGATCGATGCCCGCATCCTTCA---
D00004101 Takifugu_rubripes Ala AGC -GGGGAATTAGCTCAAAA-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGTGAGAG-------------------GTAGTGGGATCGATGCCCACATTCTCCA---
D00004102 Takifugu_rubripes Ala AGC -GGGGAATTAGCTCAAAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAG-------------------GTAGCGGGATCGATGCCCGCATTCTCCA---
D00004103 Takifugu_rubripes Ala AGC -GGGGGATTAGCTCAAAT-GGT--AGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAG-------------------GTAGCGGGATCGATGCCCGCATCCTCCA---
D00000235 Asterina_amurensis Ala GCT -GAAACTTATAGGT-T---------TATTTTAGTCCTGCTAAGTCTTAA--------A----------ATCTGTGGTTCAAATCCATAGAGTTTCACCA
D00010441 Aeropyrum_pernix_K1 Thr CGT -GCCGCCGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCGCCGGCCTCGTAAGCCGGTG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGCCGGCGGCTCC-
D00002921 Archaeoglobus_fulgidus Thr CGT -GCCGCCGTGGCTCAGCT-GGC--AGAGCGGGTGATTCGTAATCACCAG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGCCGGCGGCT---
D00010444 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Thr CGT -GCCGCCGTGGCTCAGCT-GGC--AGAGCGGGTGATTCGTAATCACCAG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGCCGGCGGCT---
D00010447 Halobacterium_sp._NRC-1 Thr CGT -GCCGGTGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCGATTCCTTCGTAAGGAATAG-------------------GCCGAGGGTTCAAATCCCTCCACCGGCT---
D00011879 Methanosarcina_acetivorans_C2A Thr CGT -GCCGTCGTGGCTTAGT--GGT--ATAGCGGCTGATTCGTAATCAGCAG-------------------GCCGAGGGTTCGAGTCCCTCCGGCGGCT---
D00010531 Methanosarcina_mazei_Go1 Thr CGT -GCCGTCGTGGCTTAGC--GGT--ATAGCGGCTGATTCGTAATCAGCAG-------------------GCCGAGGGTTCAAATCCCTCCGGCGGCG---
D00011937 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Thr CGT -GCCGTTGTGGCTTAGC--GGT--ATAGCGGCTGATTCGTAATCAGCAG-------------------GTCGGGGGTTCAAGTCCCCCCAGCGGCT---
D00010450 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Thr CGT -GCCTCGGTAGCTTAGGT-GGG--AGAGCGCGGGATTCGTAATCCCGAG-------------------GTCGCGGGTTCAATCCCCGCCCGGGGCT---
D00012001 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Thr CGT -GCCGCCGTAGCTTAGT--GGT--AGAGCGGCGGCCTCGTAAGCCGCAG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGCCGGCGGCT---
D00010457 Pyrococcus_abyssi_GE5 Thr CGT -GCCGGGATAGCCTAGCCTGGT--GGGGCGGGGGACTCGTAATCCCCAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGTCCCGGCTCC-
D00010460 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Thr CGT -GCCGGGATAGCCTAGCCTGGT--GGGGCGGGGGACTCGTAATCCCCAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGTCCCGGCTCC-
D00010463 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Thr CGT -GCCGGGATAGCCTAGCCTGGT--GGGGCGGGGGACTCGTAATCCCCAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGTCCCGGCTCCA
D00012050 Staphylothermus_marinus_F1 Thr CGT -GCCGCCGTAGCTCAGCTCGGT--AGAGCGCCGGCCTCGTAAGCCGGTG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGCCGGCGGCT---
D00012087 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Thr CGT -GCCGCCGTAGCTCAGCACGGTC-AGAGCGCCGGCCTCGTAAGCCGGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCGGCT---
D00010466 Sulfolobus_solfataricus_P2 Thr CGT -GCCGCCGTAGCTCAGCCTGGTT-AGAGCGCCGGCCTCGTAAGCCGGCG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGCCGGCGGC----
D00010550 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Thr CGT -GCCGCCGTAGCTCAGTCTGGT--AGAGCGCCGGCCTCGTAAGCCGGTG-------------------GTCCGGGGTTCAAGTCCCCGCGGCGGCT---
D00010469 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Thr CGT -GCCACTGTAGCTCAGTA-GGT--AGAGCAGCTGATTCGTAATCAGCAG-------------------GTCGGGGGATCGATGCCCTCCAGTGGCT---
D00010472 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Thr CGT -GCCACTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCTGATTCGTAATCAGCAG-------------------GTCGGGGGATCGATGCCCTCCAGTGGCT---
D00010431 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Thr CGT -GCCGCTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGTCATTCGTAATGACGGG-------------------GTCACGTGTTCGAGTCACGTAAGCGGCACCA
D00010386 Aquifex_aeolicus_VF5 Thr CGT -GCCGGCGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCGCGGGCTTCGTAAGCCTGAG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCACCGCCGGCT---
D00010664 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Thr CGT -GCCGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACGCATTCGTAACGCGTAG-------------------GTCGCCAGTTCAAGTCTGGCTAGCGGCT---
D00010674 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Thr CGT -GCCGCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACATCATTCGTAATGATGGG-------------------GTCGCTGGTTCGAATCCGGCATGCGGCACCA
D00010770 Bartonella_quintana_str._Toulouse Thr CGT -GCCGCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACATCATTCGTAATGATGGG-------------------GTCGCTGGTTCGAACCCGGCATGCGGCA---
D00010570 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Thr CGT -GCCACCTTAGCTCAGT--GGT--AGAGCATCCCCCTCGTTCGTGGGAA--------G----------GTCGGTAGTTCGATTCTATCGGGTGGCT---
D00010573 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Thr CGT -GCCACTTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGGCTCACTCGTAATGAGCAG-------------------GTCGTCAGTTCGATTCTGACAAGTGGCT---
D00010607 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Thr CGT -GCCGCAATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCACGTCATTCGTAATGACGGG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTTGCGGCACCA
D00010413 Brucella_melitensis_16M Thr CGT -GCCGCTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACATCATTCGTAATGATGGG-------------------GTCGCGTGTTCGAGTCACGCAAGCGGCACCA
D00010574 Brucella_suis_1330 Thr CGT -GCCGCTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACATCATTCGTAATGATGGG-------------------GTCGCGTGTTCGAGTCACGCAAGCGGCACCA
D00010773 Candidatus_Blochmannia_floridanus Thr CGT -GCCGATATAGCTTAATT-GGT--AGAGCAATGCATTCGTAATGCAAAG-------------------GTTGTAGGTTCGAATCCTATTGTCGGCA---
D00010352 Caulobacter_crescentus_CB15 Thr CGT -GCCGCCTTAGCTCAGCC-GGT--AGAGCGGCGCATTCGTAATGCGTAG-------------------GTCAGGTGTTCGAGTCACCTAGGCGGCACCA
D00010397 Chlamydia_muridarum_Nigg Thr CGT -GCCTAAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACGCATTCGTAACGCGTAG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGGCTTTGGGCA---
D00010299 Chlamydia_trachomatis Thr CGT -GCCTAAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACACATTCGTAACGTGTAG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGGCTTTGGGC----
D00010296 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Thr CGT -GCCTAAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACGCATTCGTAACGCGTAG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGGCTTTGGGCA---
D00010290 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Thr CGT -GCCTAAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACACATTCGTAACGTGTAG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGGCTTTGGGCA---
D00010293 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Thr CGT -GCCTAAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACACATTCGTAACGTGTAG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGGCTTTGGGCA---
D00010326 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Thr CGT -GCCTAAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACACATTCGTAACGTGTAG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGGCTTTGGGCA---
D00010529 Chlorobium_tepidum_TLS Thr CGT -GCCACCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACTGTTTCGTAAATAGTAG-------------------GTCGTGGGTTCAAGTCCCTCAGGTGGCT---
D00002946 Clostridium_acetobutylicum Thr CGT -GCTCCAGTAGCGCAGTT-GGT--AGCGCAGCTGATTCGTAATCAGTTG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTATCTGGAGCTCCA
D00010407 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Thr CGT -GCTCCTGTAGCGCAGTT-GGT--AGCGCAGCTGATTCGTAATCAGTTG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTATCTGGAGCACCA
D00010679 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Thr CGT -GCCGCCTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGCTTCACTCGTAATGAAAAG-------------------GTCGCGAGTTCGATTCTCGCAGGCGGCT---
D00010576 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Thr CGT -GCCGCTTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGTCTCACTCGTAATGAGAAG-------------------GTCAGGAGTTCGATTCTCCTAAGCGGCTCCA
D00010539 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Thr CGT -GCCGCTTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGTCTCACTCGTAATGAGAAG-------------------GTCGCGAGTTCGATTCTCGCAAGCGGCTCCA
D00010637 Coxiella_burnetii_RSA_493 Thr CGT -GCCGGTGTAGCTCAGGT-GGT--AGAGCAACTGATTCGTAATCAGTAG-------------------GTCCGCAGTTCGAGTCTGCGCACCGGCA---
D00010355 Deinococcus_radiodurans_R1 Thr CGT -GCCGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCAACTGATTCGTAATCAGTAG-------------------GTCGTCGGTTCAAGTCCGACCCTCGGCTCCA
D00010741 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Thr CGT -GCCAGCTTAGCTCAGAT-GGT--AGAGCAACTGATTCGTAATCAGTAG-------------------GTCGGGAGTTCAATTCTCCCAGCTGGCTCCA
D00010614 Enterococcus_faecalis_V583 Thr CGT -GCCAGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACGCACTCGTAACGCGTAG-------------------GTCGTAGGTTCGAACCCTATAGCTGGCA---
D00002959 Escherichia_coli Thr CGT -GCCGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCA
D00010646 Escherichia_coli_CFT073 Thr CGT -GCCGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCA
D00010329 Escherichia_coli_K12 Thr CGT -GCTCAAGTAGTTAAAAA-TGCA-TTAACATCGCATTCGTAATGCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCA
D00010330 Escherichia_coli_K12 Thr CGT -GCCGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCA
D00010334 Escherichia_coli_O157:H7 Thr CGT -GCCGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCA
D00010338 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Thr CGT -GCCGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCA
D00010704 Geobacter_sulfurreducens_PCA Thr CGT -GCCACCGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGCTGATTCGTAATCAGCAG-------------------GTCGTCCGTTCAAGTCGGATCGGTGGCTCCA
D00010710 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Thr CGT -GCTGAATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCTTCCCTCGTAAAGAAGAG-------------------GTCGCCAGTTCGATCCTGGCATTCAGCA---
D00010615 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Thr CGT -GCCGGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCGGTATCGTAAACCGAGG-------------------GTCATCAGTTCGACTCTGGTAGCCGGCA---
D00010713 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Thr CGT -GCCGCCCTAGCTCAGTC-GGC--AGAGCATCTCACTCGTAATGAGAAG-------------------GTCGAGGGTTCGATTCCCTCGGGCGGCTCCA
D00010581 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Thr CGT -GCCCGCTTAGCTCAGG--GGT--AGAGCATTTCCCTCGTAATGAAAAG-------------------GTCGCCGGTTCAATTCCGGCAGCGGGCT---
D00010390 Listeria_innocua_Clip11262 Thr CGT -GCCGACTTAGCTCAATCTGGT--AGAGCAACTGAATCGTAATCAGTAG-------------------GTTGCGGGTTCAATTCCTGCAGTCGGCA---
D00010393 Listeria_monocytogenes_EGD-e Thr CGT -GCCGACTTAGCTCAATCTGGT--AGAGCAACTGAATCGTAATCAGTAG-------------------GTTGCGGGTTCAATTCCTGCAGTCGGCA---
D00010745 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Thr CGT -GCCGACTTAGCTCAATCTGGT--AGAGCAACTGAATCGTAATCAGTAG-------------------GTTGCGGGTTCAATTCCTGCAGTCGGCA---
D00010415 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Thr CGT -GCCGCTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACATCATTCGTAATGATGGG-------------------GTCAGGTGTTCGAGTCACCTAAGCGGCACCA
D00010634 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Thr CGT -GCCGCCTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGATTCACTCGTAATGAATAG-------------------GTCAGGAGTTCGATTCTCCTAGGCGGCTCCA
D00010322 Mycobacterium_leprae_TN Thr CGT -GCCGCCTTAGCTCAATC-GGT--AGAGCGATTCACTCGTAATGAATAG-------------------GTCGGGGGTTCGATTCCCCCAGGCGGCT---
D00010308 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Thr CGT -GCCGCCTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGATTCACTCGTAATGAATAG-------------------GTCAGGAGTTCGATTCTCCTAGGCGGCTCCA
D00010686 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Thr CGT -GCCGCCTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGATTCACTCGTAATGAATAG-------------------GTCAGGAGTTCGATTCTCCTAGGCGGCTCCA
D00002935 Mycoplasma_genitalium Thr CGT -GCCGAATTAGCTCAAG--GGC--AGAGCGATGCACTCGTAATGCATAG-------------------GCTACAGGTTCAATTCCTGTATTCGGCACCA
D00010358 Mycoplasma_genitalium_G37 Thr CGT -GCCGAATTAGCTCAAG--GGC--AGAGCGATGCACTCGTAATGCATAG-------------------GCTACAGGTTCAATTCCTGTATTCGGCACCA
D00002937 Mycoplasma_pneumoniae Thr CGT -GCCGAATTAGCTCAAG--GGT--AGAGCGATGCACTCGTAATGCATAG-------------------GCTACAGGTTCAATTCCTGTATTCGGCACCA
D00010361 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Thr CGT -GCCGAATTAGCTCAAG--GGT--AGAGCGATGCACTCGTAATGCATAG-------------------GCTACAGGTTCAATTCCTGTATTCGGCACCA
D00010311 Neisseria_meningitidis_MC58 Thr CGT -GCCGGTGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGCGCATTCGTAACGCGAAG-------------------GTCGGGGGTTCGATTCCCTTCTCCGGCACCA
D00010314 Neisseria_meningitidis_Z2491 Thr CGT -GCCGGTGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGCGCATTCGTAACGCGAAG-------------------GTCGGGGGTTCGATTCCCTTCTCCGGCACCA
D00010662 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Thr CGT -GCCGCAGTAACTCAGTT-GGT--AGAGTAGCTGATTCGTAATCAGCAA-------------------GTCGGAGGTTCGACTCCTCTCTGCGGCACCA
D00010717 Porphyromonas_gingivalis_W83 Thr CGT -GCCGAAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATTCATTCGTAATGAATAG-------------------GTCGCCGGTTCGAGTCCGGCTTTCGGCT---
D00010749 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Thr CGT -GCCAACTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGACGCTCTCGTAAAGCGTAG-------------------GTCACGGGTTCGATTCCCGTAGTTGGCTCCA
D00002964 Pseudomonas_aeruginosa Thr CGT -GCCGGATTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGCTCATTCGTAATGAGAAG-------------------GTCGGGGGTTCGATTCCTCTATCCGGCACCA
D00010369 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Thr CGT -GCCGGATTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGCTCATTCGTAATGAGAAG-------------------GTCGGGGGTTCGATTCCTCTATCCGGCACCA
D00010423 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Thr CGT -GCCGGTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCGACTCCTATCTCCGGCACCA
D00010657 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Thr CGT -GCCAGCGTAGCTTCAATTGGC--AGAGCATCGCATTCGTAATGCGAGG-------------------GTTGCCGGTTCAAATCCGGCCGCTGGCT---
D00010693 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Thr CGT -GCCGCAATAGCTCAGCT-GGT--AGAGCACGTCATTCGTAATGACGGG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTTGCGGCACCA
D00010409 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Thr CGT -GCCGATGTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCGGCGCATTCGTAATGCGTAG-------------------GTCTGGGGTTCAAATCCCCACATTGGCACCA
D00010536 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Thr CGT -GCCGATGTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCGGTGCATTCGTAATGCGTAG-------------------GTCTGGGGTTCAAATCCCCACATTGGCACCA
D00010719 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Thr CGT -GCCGATGTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCGGTGCATTCGTAATGCGTAG-------------------GTCTGGGGTTCAAATCCCCACATTGGCACCA
D00010434 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Thr CGT -GCCGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCA
D00010653 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Thr CGT -GCCGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCA
D00010598 Shigella_flexneri_2a_str._301 Thr CGT -GCCGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCA
D00010438 Sinorhizobium_meliloti_1021 Thr CGT -GCCGCTTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCACATCATTCGTAATGATGGG-------------------GTCACGTGTTCGAGTCACGTAAGCGGCACCA
D00010601 Streptococcus_mutans_UA159 Thr CGT -GCCGATTTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCAACGCACTCGTAACGCGTAG-------------------GTCACAGGTTCAAGTCCTGCAATCGGCA---
D00010651 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Thr CGT -GCCGCCTTAGCTCAGAT-GGCC-AGAGCAACGCACTCGTAATGCGTAG-------------------GTCTCGGGTTCGAATCCCGAAGGCGGCT---
D00010584 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Thr CGT -GCCGCCTTAGCTCAGAT-GGCC-AGAGCAACGCACTCGTAATGCGTAG-------------------GTCTCGGGTTCGAATCCCGAAGGCGGCT---
D00010721 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Thr CGT -GCTGGTGTAGCTCAGCC-GGT--AGAGCAGCTGATTCGTAATCAGCAG-------------------GTCGCCGGTTCGAGTCCGGCCACCAGCT---
D00010725 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Thr CGT -GCCGATGTAGCTCAGCC-GGT--AGAGCAGCCGATTCGTAATCGGCAG-------------------GTCAGGGGTTCGAGCCCCCTCATCGGCTCCA
D00002971 Synechocystis_sp. Thr CGT -GCCGAAGTAGCTCAGT--GGT--AGAGTAGCTGATTCGTAATCAGTTG-------------------GCCGTGGGTTCAAATCCCATCTTCGGCT---
D00010372 Synechocystis_sp._PCC_6803 Thr CGT -GCCGAAGTAGCTCAGT--GGT--AGAGTAGCTGATTCGTAATCAGTTG-------------------GCCGTGGGTTCAAATCCCATCTTCGGCT---
D00010553 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Thr CGT -GCTAGCGTGGCTCAGA--GGC--AGAGCAGCTGATTCGTAATCAGCAG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCACCGCTAGCTCCA
D00010547 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Thr CGT -GCCGATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACTCGATTCGTAATCGAGCG-------------------GTCGTGAGTTCGAATCTCATCATCGGCT---
D00010375 Thermotoga_maritima_MSB8 Thr CGT -GCCAGCGTAGCTCAACC-GGC--AGAGCGGCGCATTCGTAATGCGCAG-------------------GTTGTGGGTTCGAGTCCCACCGCTGGCTCCA
D00010752 Thermus_thermophilus_HB27 Thr CGT --CCGGTGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCAACCGCCTCGTAAGCGGTAG-------------------GCCGCCGGTTCAAATCCGGCCACCGGCTCCA
D00010756 Treponema_denticola_ATCC_35405 Thr CGT -GCCAACTTAGCTCACCC-GGC--AGAGCAGCACCCTCGTAACGTGCAG-------------------GTACTCGGTTCAAGTCCGAGAGTTGGCT---
D00002941 Treponema_pallidum Thr CGT -GCCAACTTAGCTCACCT-GGC--AGAGCAGCACCCTCGTAACGTGCAG-------------------GTACCCGGTTCGAGCCCGGGAGTTGGCT---
D00010366 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Thr CGT -GCCAACTTAGCTCACCT-GGC--AGAGCAGCACCCTCGTAACGTGCAG-------------------GTACCCGGTTCGAGCCCGGGAGTTGGCT---
D00010623 Tropheryma_whipplei_str._Twist Thr CGT -GCCGCCCTAGCTCAGTTAGGC--AGAGCGATTCACTCGTAATGAATAG-------------------GTCAGGGGTTCGACTCCCCTGGGCGGCT---
D00010626 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Thr CGT -GCCGCCCTAGCTCAGTTAGGC--AGAGCGATTCACTCGTAATGAATAG-------------------GTCAGGGGTTCGACTCCCCTGGGCGGCT---
D00010560 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Thr CGT -GCCGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGGCGCATTCGTAATGCGTAG-------------------GTCGTAGGTTCGATTCCTATTTCCGGCACCA
D00010557 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Thr CGT -GCCGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGGCGCATTCGTAATGCGTAG-------------------GTCGTAGGTTCGATTCCTATTTCCGGCACCA
D00010378 Xylella_fastidiosa_9a5c Thr CGT -GCCGGTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCGACTCCTATCTCCGGCACCA
D00010381 Xylella_fastidiosa_9a5c Thr CGT -GCTCAAGTAGTTAAAAA-TGCA-TTAACATCGCATTCGTAATGCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACC-
D00010382 Xylella_fastidiosa_9a5c Thr CGT -GCCGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCA
D00010628 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Thr CGT -GCCGGTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCGACTCCTATCTCCGGCACCA
D00010497 Arabidopsis_thaliana Thr CGT -GCCTCCGTAGCATAGT--GGT--ATTGCGTTCGCTTCGTAAGCGAAAG-------------------GTCGTGAGTTCGATCCTCACCGTAGGC----
D00010498 Arabidopsis_thaliana Thr CGT -GCCTCTGTAGCATAGT--GGT--ATTGCGTTCGCTTCGTAAGCGAAAG-------------------GCCGCGAGTTCGATCCTCGCCGGAGGC----
D00010499 Arabidopsis_thaliana Thr CGT -GCCTCCGTAGCATAGT--GGT--ATTGCGTTCGCTTCGTAAGCGAAAG-------------------GCCGCGAGTTCGATCCTCGCCGGGGGC----
D00010506 Caenorhabditis_elegans Thr CGT -GCCCGTATAGCTCAGT--GGC--AGAGCGTCTGTCTCGTAAACAGAAG-------------------GCCGGCGGTTCAATCCCGCCTGGGGGC----
D00010507 Caenorhabditis_elegans Thr CGT -GCCCGTATAGCTCAGA--GGC--AGAGCGTCTGTCTCGTAAACAGAAG-------------------GTCGGCGGTTCAATCCCGCCTGTGGGC----
D00010508 Caenorhabditis_elegans Thr CGT -GCCCGTATAGCTCAGT--GGC--AGAGCGTCTGTCTCGTAAACAGAAG-------------------GTCGACGGTTCAATCCCGTCTGGGGGC----
D00010509 Caenorhabditis_elegans Thr CGT -GCCCGTATAGCTCAGT--GGC--AGAGCGTCTGTCTCGTAAACAGAAG-------------------GTCGGCGGTTCAATCCCGCCTGGGGGC----
D00010510 Caenorhabditis_elegans Thr CGT -GCCCTTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCGTTGGTCTCGTAAACCAAAG-------------------GTCCGTAGTTCAATCCTGCGTGAGGGCA---
D00010734 Candida_glabrata_CBS_138 Thr CGT -GCCTCTTTGGCCAAGT--GGT--AAGGCATCGCACTCGTAATGCGGGG-------------------ATCGTGGGTTCAATTCCCACAGGAGGCA---
D00003078 Dictyostelium_discoideum Thr CGT -GCCATAGTAGTCTAGT--GGT--AAGACATTTCTCTCGTAAAGAAGGA-------------------T-CCCGTGTTCGATTCACGGCTTTGGCA---
D00010519 Drosophila_melanogaster Thr CGT -GCCTCTTTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGTTGGTCTCGTAAACCAAAG-------------------GCCGTGAGTTCAACCCTCACAGGAGGC----
D00010562 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Thr CGT -GGCTTGTTAGTTTAGT--GGC--AAAACGGTTGATTCGTAATCAACTG-------------------A-CGCGAGTTCGATTCTCGCACAAGCCT---
D00010781 Gallus_gallus Thr CGT -GGCGCGGTGGCCAAGT--GGT--AAGGCGTCGGTCTCGTAAACCGAAG-------------------ATCGCGGGTTCGAACCCCGTCCGTGCCT---
D00010782 Gallus_gallus Thr CGT -GGCGCGGTGGCCAAGT--GGT--AAGGCGTCGGTCTCGTAAACCGAAG-------------------ATCACGGGTTCGAACCCCGTCCGTGCCT---
D00010481 Homo_sapiens Thr CGT -GGCAGAGTGGTGCAGC--GGA--AGCGTGCTGGGCCCGTAACCCAGAG-------------------GTCAATGGATCGAAGCCATCCTTGGCT----
D00010482 Homo_sapiens Thr CGT -GGCCCTGTAGCTCAGC--GGTT-GGAGCGCTGGTCTCGTAAACCTAGG--------G----------GTCGTGAGTTCAAATCTCACCAGGGCC----
D00010483 Homo_sapiens Thr CGT -GGCGCGGTGGCCAAGT--GGT--AAGGCGTCGGTCTCGTAAACCGAAG-------------------ATCGCGGGTTCGAACCCCGTCCGTGCC----
D00010484 Homo_sapiens Thr CGT -GGCTCTGTGGCTTAGTT-GGCT-AAAGCGCCTGTCTCGTAAACAGGAG-------------------ATCCTGGGTTCGAATCCCAGCGGGGCC----
D00010485 Homo_sapiens Thr CGT -GGCGCGGTGGCCAAGT--GGT--AAGGCGTCGGTCTCGTAAACCGAAG-------------------ATCACGGGTTCGAACCCCGTCCGTGCC----
D00010486 Homo_sapiens Thr CGT -GGCTCTATGGCTTAGTT-GGTT-AAAGCGCCTGTCTCGTAAACAGGAG-------------------ATCCTGGGTTCGACTCCCAGTGGGGCC----
D00010817 Pan_troglodytes Thr CGT -GGCGCGGTGGCCAAGT--GGT--AAGGCGTCGGTCTCGTAAACCGAAG-------------------ATCGCGGGTTCGAACCCCGTCCGTGCCT---
D00010818 Pan_troglodytes Thr CGT -GGCTCTGTGGCTTAGTT-GGCT-AAAGCGCCTGTCTCGTAAACAGGAG-------------------ATCCTGGGTTCGAATCCCAGCGGGGCCT---
D00010819 Pan_troglodytes Thr CGT -GGCGCGGTGGCCAAGT--GGT--AAGGCGTCGGTCTCGTAAACCGAAG-------------------ATCACGGGTTCGAACCCCGTCCGTGCCT---
D00010820 Pan_troglodytes Thr CGT -GGCTCTATGGCTTAGTT-GGTT-AAAGCGCCTGTCTCGTAAACAGGAG-------------------ATCCTGGGTTCGACTCCCAGTGGGGCCT---
D00010768 Plasmodium_falciparum_3D7 Thr CGT -GCCATCTTAGCACAGTT-GGT--AATGCGTTTGATTCGTAATCAAAAG-------------------ATCGTGGGTTCGACTCCCACAGGTGGCT---
D00003080 Saccharomyces_cerevisiae Thr CGT -GCCCTTTTGGCCAAGT--GGT--AAGGCATCGCACTCGTAATGCGGGG-------------------ATCGTGGGTTCAATTCCCACAGAGGGCA---
D00010514 Saccharomyces_cerevisiae Thr CGT -GCCCTTTTGGCCAAGT--GGT--AAGGCATCGCACTCGTAATGCGGGG-------------------ATCGTGGGTTCAATTCCCACAGAGGGCA---
D00003082 Schizosaccharomyces_pombe Thr CGT -GCTCTTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCCTGTCTCGTAAACAGGAG-------------------GTCCAGTGTTCGAGTCACTGCCGGAGCA---
D00010524 Schizosaccharomyces_pombe Thr CGT -GCTCTTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCCTGTCTCGTAAACAGGAG-------------------GTCCAGTGTTCGAGTCACTGCCGGAGCA---
D00010795 Takifugu_rubripes Thr CGT -GGCGCTGTCGCTTAGCT-GGTC-AAAGCGCCTGTCTCGTAAACAGGCG-------------------AGCCTGGGTTCGAATCCCAGCAGTGTCT---
D00010796 Takifugu_rubripes Thr CGT -GGCGCTGTAGCTTAGCT-GGTC-AAAGTGCCTGTCTCGTAAACAGGAG-------------------AGCCTGGGTTCAAATCCCAGCAGTGCCT---
D00010797 Takifugu_rubripes Thr CGT -GGTGTGGTGGCCAAGT--GGT--AAGGCGTTGGTCTCGTAAACCAAAG-------------------ATCATGGGTTCAATCCCCATCCATACCT---
D00010798 Takifugu_rubripes Thr CGT -GGCTCCATAGCTCAGG--GGTT-AGAGCACTGGTCTCGTAATCCAGGG-------------------GTCATGAGTTCAAATCTCATTGGGGCCT---
D00010799 Takifugu_rubripes Thr CGT -GGCGCTGTGGCTTAGCT-GGTT-ATAGCACCTGTCTCGTAAACAGGAG-------------------ATCCTGGGTTCAAATCCCAGCAGTGCCT---
D00010800 Takifugu_rubripes Thr CGT -GGCGCGGTGGCCAAGT--GGT--AAGGCGTCGGTCTCGTAAACCGAAG-------------------ATCGCGGGTTCGAACCCCGTCCGTGCCT---
D00003075 Trypanosoma_brucei Thr CGT -GGCCGCTTAGCACAT---GGC--AGTGCACCACTCTCGTAAAGTGGGG-------------------GTCGCGAGTTCGATTCTCGCAGTGGCCT---
D00010443 Aeropyrum_pernix_K1 Thr TGT -GCCGCCGTAGCTCAGCA-GGC--AAAGCGCCGGCCTTGTAAGCCGGTG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGCCGGCGGCTCC-
D00002922 Archaeoglobus_fulgidus Thr TGT -GCCGCCGTGGCTCAGCT-GGC--AGAGCGGGTGACTTGTAATCACCAG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGCCGGCGGCT---
D00010446 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Thr TGT -GCCGCCGTGGCTCAGCT-GGC--AGAGCGGGTGACTTGTAATCACCAG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGCCGGCGGCT---
D00010449 Halobacterium_sp._NRC-1 Thr TGT -GCCAAGGGAGCTTGGGT-GGTC-CAAGCACTCGATTTGTAATCGAGAG-------------------TTCGTGGGTTCAAATCCCACCCTTGGCT---
D00002923 Methanocaldococcus_jannaschii Thr TGT -GCCTCGGTGGCTCAGCCTGGTAGAGAGCGCCTGACTTGTAATCAGGTG-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCCCCCGGGGCT---
D00010454 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Thr TGT -GCCTCGGTGGCTCAGCCTGGT--AGAGCGCCTGACTTGTAATCAGGTG-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCCCCCGGGGCTCC-
D00011862 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Thr TGT -GCCTCGGTGGCTCAGCCTGGT--AGAGCGCCTGACTTGTAATCAGGTG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCCCCCGGGGCT---
D00010456 Methanococcus_maripaludis Thr TGT -GCCTCGGTGGCTCAGCCTGGT--AGAGCGCCTGACTTGTAATCAGGTG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCCCCCGGGGCT---
D00002925 Methanococcus_vannielii Thr TGT -GCCTCGGTGGCTCAGCCTGGT--AGAGCGCCTGACTTGTAATCAGGTG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCCCCCGAGGCT---
D00002928 Methanococcus_voltae Thr TGT -GCCTCAGTGGCTCAGCCTGGT--AGAGCGCCTGACTTGTAATCAGGTG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCCCCTGGGGCT---
D00010568 Methanopyrus_kandleri_AV19 Thr TGT -GCCGCGGCAGCTTAGCCTGGTT-AGAGCGCGGGACTTGTAATCCCGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGCGGCTCCA
D00011924 Methanosarcina_acetivorans_C2A Thr TGT -GCCTCGTTGGCTCAGCCCGGT--AGAGCGAGTGACTTGTAATCACTAG-------------------GTCGCGTGTTCAAATCACGCACGGGGCT---
D00010533 Methanosarcina_mazei_Go1 Thr TGT -GCCTCGTTGGCTCAGCCCGGT--AGAGCGAGTGACTTGTAATCACTAG-------------------GTCGCGTGTTCGAATCACGCACGAGGCT---
D00011951 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Thr TGT -GCCTCAGTGGCTTAGCT-GGC--AGAGCGGTTGACTTGTAATCAACAG-------------------GTCCCGAGTTCAAATCTCGGCTGAGGCT---
D00010452 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Thr TGT -GCCTCGGTAGCTCAGTCTGGT--GGAGCGCGAGACTTGTAATCTCGTG-------------------GTCGCGGGTTCAATTCCCGTCCGGGGCT---
D00002927 Methanothermus_fervidus Thr TGT -GCCTCGGTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCGCGAGACTTGTAATCTCGTG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGCCCGAGGCT---
D00012007 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Thr TGT -GCCCCGGTAGCTCAGC--GGC--AGAGCGGCGGCCTTGTAAGCCGCAG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGCCCGGGGCT---
D00010459 Pyrococcus_abyssi_GE5 Thr TGT -GCCCCGGTAGCCTAGCCTGGT--GGGGCGGGGGACTTGTAATCCCCAG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGCCCGGGGCTCC-
D00010462 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Thr TGT -GCCCGGGTAGCCTAGCCTGGT--GGGGCGGGGGACTTGTAATCCCCAG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGCCCCGGGCTCC-
D00010465 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Thr TGT -GCCCCGGTAGCCTAGCCTGGT--GGGGCGGGGGACTTGTAATCCCCAG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGCCCGGGGCTCCA
D00012056 Staphylothermus_marinus_F1 Thr TGT -GCCGCCGTAGCTCAGCCCGGT--AGAGCGCCGGCCTTGTAAGCCGGTG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGCCGGCGGCT---
D00012078 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Thr TGT -GCCGCCGTAGCTCAGCACGGCC-AGAGCGCTGGCCTTGTAAGCCAGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCGGCT---
D00010468 Sulfolobus_solfataricus_P2 Thr TGT -GCCGCCGTAGCTCAGCCTGGTT-AGAGCGCCGGCCTTGTAAGCCGGCG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGCCGGCGGC----
D00010552 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Thr TGT -GCCGCTGTAGCTCAGCCTGGTT-AGAGCGCCGGCCTTGTAAGCCGGCG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCAGCGGCT---
D00010471 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Thr TGT -GCCACTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCTGACTTGTAATCAGCAG-------------------GTCGGGGGATCGATGCCCTCCAGTGGCT---
D00010474 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Thr TGT -GCCACTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCTGACTTGTAATCAGCAG-------------------GTCGGGGGATCGATGCCCTCCAGTGGCT---
D00002940 Acholeplasma_laidlawii Thr TGT -GCCGAAATAGCTCAATC-GGT--AGAGCAACTGATTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGCGGGTTCAATTCCTGTTTTCGGCACCA
D00010761 Acinetobacter_sp._ADP1 Thr TGT -GCCGGCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCCACAGTTCGAATCCGTGTGCCGGCACCA
D00010433 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Thr TGT --CCCTTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCTGATTTGTAATCAGGGG-------------------GTCACGAGTTCGAACCTTGTCGGGGGCACCA
D00010388 Aquifex_aeolicus_VF5 Thr TGT -GCTGGCGTAGCTCAGTC-GGC--AGAGCGCGGGATTTGTAATCCCGTG-------------------GGCGCGGGTTCGAGTCCCGCCGCCAGCT---
D00002963 Azospirillum_lipoferum Thr TGT -GCCGGTTTAGCTCAGCA-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCGTGGGTTCGATTCCTATAGCCGGCACCA
D00010762 Bacillus_anthracis_str._A2012 Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTAGCCGGCACCA
D00010671 Bacillus_anthracis_str._Ames Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTAGCCGGCACCA
D00010672 Bacillus_anthracis_str._Ames Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTAGCCGGCA---
D00010673 Bacillus_anthracis_str._Ames Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAATT-GGG--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTAGTCGGCACCA
D00010699 Bacillus_anthracis_str._Sterne Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTAGCCGGCACCA
D00010700 Bacillus_anthracis_str._Sterne Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTAGCCGGCA---
D00010701 Bacillus_anthracis_str._Sterne Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAATT-GGG--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTAGTCGGCACCA
D00010736 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTAGCCGGCACCA
D00010737 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTAGTCGGCA---
D00010738 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTAGCCGGCACCA
D00010739 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTAGTCGGCACCA
D00010640 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTAGTCGGCACCA
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D00010605 Bacillus_halodurans_C-125 Thr TGT -GCCGGTCTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTGGCCGGCTCCA
D00010606 Bacillus_halodurans_C-125 Thr TGT -GCCGGTCTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTGGCCGGCACCA
D00002951 Bacillus_subtilis Thr TGT -GCCGGTGTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTTGCCGGCACCA
D00010303 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Thr TGT -GCCGGTGTAGCTCAATT-GGT--AAAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTTGCCGGCA---
D00010304 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Thr TGT -GCCGGTGTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTTGCCGGC----
D00010305 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Thr TGT -GCCGGTGTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTTGCCGGCACCA
D00010764 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTAGCCGGCA---
D00010765 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTAGTCGGCACCA
D00010766 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTAGCCGGCACCA
D00010665 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Thr TGT -GCCTCTTTAGCTCAGTT-GGCC-AGAGCACGTGATTTGTAATCTCGGG-------------------GTCGTTGGTTCGAATCCGACAAGAGGCT---
D00010667 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Thr TGT -GCCTCTTTAGCTCAGTT-GGCC-AGAGCACGTGATTTGTAATCTCGGG-------------------GTCGTTGGTTCGAATCCGACAAGAGGCTCCA
D00010675 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Thr TGT -GCCCTTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCTGATTTGTAATCAGGGG-------------------GTCGGGAGTTCGAGTCTCTCTGGGGGCACCA
D00010772 Bartonella_quintana_str._Toulouse Thr TGT -GCCCTTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCTGATTTGTAATCAGGGG-------------------GTCGGGAGTTCGAGTCTCTCTGGGGGCACCA
D00010678 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Thr TGT -GCTGGTTTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAGCTGATTTGTAATCAGCAG-------------------GTTGCGGGTTCGAGTCCCATAACCAGCTCCA
D00010571 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Thr TGT -GCCTCTTTAGCTCAGAT-GGCC-AGAGCGGCCGCCTTGTAAGCGGCAG-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGACAAGAGGCT---
D00002944 Borrelia_burgdorferi Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGCT-GGCC-AGAGCAGCGGTCTTGTAAACCGCAG-------------------T-CGTCGGTTCGAATCCGACAGTCGGCT---
D00010349 Borrelia_burgdorferi_B31 Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGCT-GGCCAGAGCAGCGGGTCTTGTAAACCGCAG-------------------T-CGTCGGTTCGAATCCGACAGTCGGC----
D00010703 Borrelia_garinii_PBi Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGCT-GGCC-AGAGCAGCGGTCTTGTAAACCGCAG-------------------GTCGTCGGTTCGACTCCGACAGTCGGCT---
D00010609 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAGC--GGT--AGAGCAGCGGTTTTGTAAACCGAAG-------------------GTCGGGGGTTCAATCCCCTCAGCCGGCACCA
D00010411 Brucella_melitensis_16M Thr TGT -GCCCTTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCTGATTTGTAATCAGGGG-------------------GTCGGGAGTTCGAGTCTCTCTGGGGGCACCA
D00010575 Brucella_suis_1330 Thr TGT -GCCCTTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCTGATTTGTAATCAGGGG-------------------GTCGGGAGTTCGAGTCTCTCTGGGGGCACCA
D00010307 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAGCA-GGC--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCACCAGTTCAATTCCGGTAGCCGGCA---
D00010645 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAGCA-GGC--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCACCAGTTCGATTCCGGTAGCCGGCA---
D00010535 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAGCA-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCACCAGTTCGATTCCGGTAGCCGGCA---
D00002967 Campylobacter_jejuni Thr TGT -GCTGGTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCTGCCTTGTAAGCAGCAG-------------------GTCGGGGGTTCAAGTCCCTTAACCAGCTCCA
D00010351 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Thr TGT -GCTGGTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCTGCCTTGTAAGCAGCAG-------------------GTCGGGGGTTCAAGTCCCTTAACCAGCTCCA
D00010775 Candidatus_Blochmannia_floridanus Thr TGT -GCCGGTGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCAACTGATTTGTAATCAGTGG-------------------GTTAAGGGTTCAAATCCTTTTGCCGGCA---
D00010688 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Thr TGT -GCTGGCATAGCTCAATT-GGT--AGAGCACCCGACTTGTAATCGGACG-------------------GTTGTGGGTTCAATTCCTACTGCCAGCA---
D00010354 Caulobacter_crescentus_CB15 Thr TGT -GCCGGCTTAGCACAGC--GGT--AGTGCAGCGGTTTTGTAAACCGAAG-------------------GTCGGGGGTTCGATCCCCTCAGCCGGCACCA
D00010398 Chlamydia_muridarum_Nigg Thr TGT -GCTGGAGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCATTCGATTTGTAATCGAACG-------------------GTTGAGGGTTCAATTCCTTTCTCCAGCA---
D00010301 Chlamydia_trachomatis Thr TGT -GCTGGAGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCATTCGATTTGTAATCGAACG-------------------GTTGAGGGTTCAATTCCTTTCTCCAGC----
D00010298 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Thr TGT -GCTGGAGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCATTCGATTTGTAATCGAACG-------------------GTTGAGGGTTCAATTCCTTTCTCCAGCA---
D00010292 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Thr TGT -GCTGGAGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCATTCGATTTGTAATCGAACG-------------------GTTGAGGGTTCAATTCCTTTCTCCAGCA---
D00010295 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Thr TGT -GCTGGAGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCATTCGATTTGTAATCGAACG-------------------GTTGAGGGTTCAATTCCTTTCTCCAGCA---
D00010328 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Thr TGT -GCTGGAGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCATTCGATTTGTAATCGAACG-------------------GTTGAGGGTTCAATTCCTTTCTCCAGCA---
D00010527 Chlorobium_tepidum_TLS Thr TGT -GCTGGTGTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAGCTGACTTGTAATCAGCAG-------------------GTTGCGGGTTCGAGTCCCATCACCAGCT---
D00010404 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Thr TGT -GCTGGCATAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGTGGGTTCAATTCCTACTGCCAGCACCA
D00010406 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Thr TGT -GCTGGCATAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTATGGGTTCAATTCCTATTGCCAGCACCA
D00010395 Clostridium_perfringens_str._13 Thr TGT -GCTGGTGTGGCTCAATT-GGC--AGAGCAGCTGACTTGTAATCAGCAG-------------------GTTATCGGTTCAAGTCCGATCATCAGCTCCA
D00010610 Clostridium_tetani_E88 Thr TGT -GCTGGCATGGCTCAATT-GGC--AGAGCAGCTGACTTGTAATCAGCAG-------------------GTTGTAGGTTCAAGTCCTATTGCCAGCTCCA
D00010681 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Thr TGT -GCTGGAGTGGCGCAATT-GGT--AGCGCAACGCACTTGTAATGCGTAG-------------------GTTGTGGGTTCAAGTCCCATCTCCAGCT---
D00010578 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Thr TGT -GCTGGAGTGGCGCAATC-GGT--AGCGCAACGCACTTGTAATGCGTAG-------------------GTTGCGAGTTCAAGTCTCGTCTCCAGCT---
D00010541 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Thr TGT -GCTGGAGTGGCGCAATT-GGC--AGCGCAACGCACTTGTAATGCGTAG-------------------GTTGAGAGTTCAAGTCTCTTCTCCAGCT---
D00010638 Coxiella_burnetii_RSA_493 Thr TGT -GCTGGCGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGCTGATTTGTAATCAGCCG-------------------GTCGTAGGTTCGATTCCTATCGCCAGCT---
D00010357 Deinococcus_radiodurans_R1 Thr TGT -GCCACCCTAGCTCAACT-GGT--AGAGCACCCGACTTGTAATCGGAAG-------------------GTTGGGAGTTCGATTCTCCTGGGTGGCTCCA
D00010742 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Thr TGT -GCTGGCGTAGCTCAACT-GGC--AGAGCAGCTGATTTGTAATCAGCCG-------------------GTTGCGGGTTCGAGTCCCATCGCCAGCTCCA
D00010612 Enterococcus_faecalis_V583 Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGATTTGTAATCAGAGG-------------------GTCGAGGGTTCAAGTCCTTTAGCCGGCACCA
D00002958 Escherichia_coli Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGTA-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCACCAGTTCGATTCCGGTA.TCGGCACCA
D00010647 Escherichia_coli_CFT073 Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGTA-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCACCAGTTCGATTCCGGTAGTCGGCACCA
D00010333 Escherichia_coli_K12 Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGTA-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCACCAGTTCGATTCCGGTAGTCGGCACCA
D00010337 Escherichia_coli_O157:H7 Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGTA-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCACCAGTTCGATTCCGGTAGTCGGCACCA
D00010341 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGTA-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCACCAGTTCGATTCCGGTAGTCGGCACCA
D00010530 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Thr TGT -GCCGCTTTAGCTCATCT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTGATTGGTTCGACTCCGATAAGCGGCACCA
D00010706 Geobacter_sulfurreducens_PCA Thr TGT -GCTGGCGTAGCTCAACT-GGT--AGAGCAGCTGACTTGTAATCAGCAG-------------------GTTGCGGGTTCAAGTCCTGTCGCCAGCTCCA
D00002968 Haemophilus_influenzae Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGTA-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCATCAGTTCGATTCCGATAGTCGGCACCA
D00010347 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGTA-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCATCAGTTCGATTCCGATAGTCGGCACCA
D00002948 Helicobacter_pylori Thr TGT -GCTGGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCTGCCTTGTAAGCAGCAG-------------------GTCGGGGGTTCAAGTCCCTTAGCCAGCTCCA
D00010343 Helicobacter_pylori_26695 Thr TGT -GCTGGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCTGCCTTGTAAGCAGCAG-------------------GTCGGGGGTTCAAGTCCCTTAGCCAGCTCCA
D00010345 Helicobacter_pylori_J99 Thr TGT -GCTGGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCTGCCTTGTAAGCAGCAG-------------------GTCGGGGGTTCAAGTCCCTTAGCCAGCTCCA
D00010711 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Thr TGT -GCCGATTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGTCTTGTAAACAGGGG-------------------GTCGAAGGTTCGAGTCCTTTAATCGGCA---
D00010617 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGCT-GGC--AGAGCATCTGTCTTGTAAACAGGGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTAGTCGGCA---
D00010714 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCACTCGCCTTGTAAGCGAGCG-------------------GTCGCGGGTTCGAACCCCGCAGTCGGCT---
D00010579 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Thr TGT -GCTGCCTTAGCTCAATT-GGT--AGAGCATCTGATTTGTAATCAGACG-------------------GTTGTGGGTTCGATTCCTATAGGCAGCT---
D00010389 Listeria_innocua_Clip11262 Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACTGATTTGTAATCAGTAG-------------------GTCGCGAGTTCGACTCTTGCAGCCGGCACCA
D00010392 Listeria_monocytogenes_EGD-e Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACTGATTTGTAATCAGTAG-------------------GTCGCGAGTTCGACTCTTGCAGCCGGCACCA
D00010744 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACTGATTTGTAATCAGTAG-------------------GTCGCGAGTTCGACTCTTGCAGCCGGCACCA
D00010747 Mesoplasma_florum_L1 Thr TGT -GCTGACTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCTCTAGTCAGCACCA
D00010414 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Thr TGT -GCCCTTGTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCAGCGGTTTTGTAAACCGAAG-------------------GTCGGCGGTTCGATTCCGTCCGGGGGCACCA
D00010633 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Thr TGT -GCCTCCTTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACTCGCCTTGTAAGCGAGCG-------------------GTCGTCAGTTCAATCCTGACAGGGGGCT---
D00010324 Mycobacterium_leprae_TN Thr TGT -GCCTCCTTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACTCGCCTTGTAAGCGAGCG-------------------GTCGTCAGTTCAATCCTGACAGGGGGCTCCA
D00010310 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Thr TGT -GCCTCCTTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACTCGCCTTGTAAGCGAGCG-------------------GTCGTCAGTTCAATCCTGACAGGGGGCT---
D00010685 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Thr TGT -GCCTCCTTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACTCGCCTTGTAAGCGAGCG-------------------GTCGTCAGTTCAATCCTGACAGGGGGCT---
D00002932 Mycoplasma_capricolum Thr TGT -GCTGACTTAGCTCAGCA-GGC--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCGTAGGTTCGATTCCTATAGTCAGCACCA
D00010630 Mycoplasma_gallisepticum_R Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAATC-GGC--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGTAGGTTCAATTCCTATAGTCGGCACCA
D00002934 Mycoplasma_genitalium Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATTGACTTGTAATCAATAG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTATAGTCGGCACCA
D00010360 Mycoplasma_genitalium_G37 Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATTGACTTGTAATCAATAG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTATAGTCGGCACCA
D00002936 Mycoplasma_mycoides Thr TGT -GCTGACTTAGCTCAGCA-GGC--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCGTAGGTTCGATTCCTATAGTCAGCACCA
D00002939 Mycoplasma_pneumoniae Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTATAGTCGGCACCA
D00010363 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTATAGTCGGCACCA
D00010430 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGCA-GGC--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCGTAGGTTCGATTCCTATAGTCGGCACCA
D00010313 Neisseria_meningitidis_MC58 Thr TGT -GCCGGTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCTGACTTGTAATCAGGGG-------------------GTCCCGAGTTCGACTCTTGGTGCCGGCACCA
D00010316 Neisseria_meningitidis_Z2491 Thr TGT -GCCGGTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCTGACTTGTAATCAGGGG-------------------GTCCCGAGTTCGACTCTTGGTGCCGACACCA
D00010663 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Thr TGT -GCCGGCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCTGATTTGTAATCAGAAG-------------------GTCGCGAGTTCAATTCTTGCTGCCGGCACCA
D00010426 Nostoc_sp._PCC_7120 Thr TGT -GCTGGTGTGGCTCAAC--GGC--AGAGCAATCGCCTTGTAAGCGATCG-------------------GTTGCGGGTTCAACTCCTGTCACCAGCT---
D00010428 Nostoc_sp._PCC_7120 Thr TGT -GCCAGCATAGCACAGT--GGT--AGTGCATCCGACTTGTAATCGGAAG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGACTGCTGGCT---
D00010582 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Thr TGT -GCCGGCCTAGCTCAACT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTGGCCGGCACCA
D00010682 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M Thr TGT -GCCAAAATAGCTCAATA-GGT--AGAGCAACTGATTTGTAATCAGTAG-------------------GTTACGGGTTCGATTCCTGTTTTTGGCACCA
D00010365 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGTA-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCACCAGTTCGATTCCGGTAGTCGGCACCA
D00010689 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCACCAGTTCGACTCCGGTAGCCGGCACCA
D00010691 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Thr TGT -GCCGGCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCCCGAGTTCGATTCTTGGTGCCGGCACCA
D00010716 Porphyromonas_gingivalis_W83 Thr TGT -GCCTCTTTAGCTCAGTT-GGCC-AGAGCACGTGATTTGTAATCTCGGG-------------------GTCGTTGGTTCGAATCCGACAAGAGGCT---
D00010750 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Thr TGT -GCCTCTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCCGCTCTTGTAAAGCGATG-------------------GTCGCGGGTTCGATTCCTGTCAGAGGCTCCA
D00010371 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Thr TGT -GCCGGTATAGCTCAGCT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCCCGGGTTCGACTCCTGGTGCCGGCACCA
D00010669 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Thr TGT -GCCGGTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCCCGGGTTCGACTCCTGGTGCCGGCACCA
D00010424 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCATCA-GGT--AGAGCAGTTGATTTGTAATCATCAG-------------------GTGGCGGGTTCGAGTCCTGCAGCCGGCACCA
D00010658 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Thr TGT -GCCAACGTAGCTCAGTT-GGC--AGAGCAGCTGATTTGTAATCAGCCG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCTCCGTTGGCT---
D00010694 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Thr TGT -GCCGGCGTAGCACAGC--GGT--AGTGCAGCGGTTTTGTAAACCGAAG-------------------GTCGGGAGTTCGATCCTCTCCGCCGGCACCA
D00010410 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Thr TGT -GCCGGATTAGCTCAGT--GGT--AGAGCAACCGCCTTGTAAGCGGTAG-------------------GTCATCAGTTCAAATCCGATATCCGGCACCA
D00010538 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Thr TGT -GCCGGATTAGCTCAGT--GGT--AGAGCAACCGCCTTGTAAGCGGTAG-------------------GTCATCAGTTCAAATCCGATATCCGGCACCA
D00010720 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Thr TGT -GCCGGATTAGCTCAGT--GGT--AGAGCAACCGCCTTGTAAGCGGTAG-------------------GTCATCAGTTCAAATCCGATATCCGGCACCA
D00010437 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGTA-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCACCAGTTCGATTCCGGTAGTCGGCACCA
D00010656 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGTA-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCACCAGTTCGATTCCGGTAGTCGGCACCA
D00010421 Salmonella_typhimurium_LT2 Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGTA-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCACCAGTTCGATTCCGGTAGTCGGCACCA
D00010588 Shewanella_oneidensis_MR-1 Thr TGT -GCCGGCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCCCGAGTTCGACTCTTGGTGCCGGCACCA
D00010591 Shigella_flexneri_2a_str._301 Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGCA-GGC--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCACCAGTTCGATTCCGGTAGTCGCAC---
D00010592 Shigella_flexneri_2a_str._301 Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGCA-GGC--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCACCAGTTCGATTCCGGTAGTCGGCACCA
D00010594 Shigella_flexneri_2a_str._301 Thr TGT -GCCGACTTGGCTCAGTA-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCACCAGTTCGATTCCGGTAGTCGGCACCA
D00010595 Shigella_flexneri_2a_str._301 Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGTA-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCACCAGTTCGATTCCGGTAGTCGGCACCA
D00010597 Shigella_flexneri_2a_str._301 Thr TGT -TCCTCTGTAGTTCAGTC-GGT--AGAACGGCGGACTTGTTAATCCGTA--------T----------GTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCA
D00010440 Sinorhizobium_meliloti_1021 Thr TGT -GCCCTTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGGCTGATTTGTAATCAGTAG-------------------GTCGGGAGTTCGAGTCTCTCTGGGGGCACCA
D00002947 Staphylococcus_aureus Thr TGT -GCCGGCCTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTGGCCGGCACCA
D00010696 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Thr TGT -GCCGGCCTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGTGTTCAAGTCCTCTGGCCGGCACCA
D00010697 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Thr TGT -GCCGGCCTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTGGCCGGCACCA
D00010542 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Thr TGT -GCCGGCCTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTGGCCGGCACCA
D00010321 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Thr TGT -GCCGGCCTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTGGCCGGCACCA
D00010619 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Thr TGT -GCCGGCCTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTGGCCGGCACCA
D00010620 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Thr TGT -GCCGGCCTAGCTCAACT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCTCTGGCCGGCACCA
D00002954 Stigmatella_aurantiaca Thr TGT -GCCGGTGTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCAACTGATTTGTAATCAGTAG-------------------GTCGCGGGTTCAAGTCCCGCCGCCGGCC---
D00010599 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGATTTGTAATCAGAGG-------------------GTCGCGTGTTCAAGTCATGTAGCCGGCA---
D00010543 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGATTTGTAATCAGAGG-------------------GTCGCGTGTTCAAGTCATGTAGCCGGCA---
D00010602 Streptococcus_mutans_UA159 Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGATTTGTAATCAGAGG-------------------GTCGCGTGTTCAAGTCATGTAGCCGGCA---
D00010403 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGATTTGTAATCAGAGG-------------------GTCGCGTGTTCAAGTCATGTAGCCGGCA---
D00010400 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGATTTGTAATCAGAGG-------------------GTCGCGTGTTCAAGTCATGTAGCCGGCA---
D00010546 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGATTTGTAATCAGAGG-------------------GTCGCGTGTTCAAGTCATGTAGCCGGCA---
D00010635 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGATTTGTAATCAGAGG-------------------GTCGCGTGTTCAAGTCATGTAGCCGGCA---
D00010649 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Thr TGT -GCCTCCTTAGCTCAGCT-GGTC-AGAGCGCCGCTCTTGTAAAGCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCGAATCCGACAGGGGGCT---
D00010585 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Thr TGT -GCCTCCTTAGCTCAGCT-GGTC-AGAGCGCCGCTCTTGTAAAGCGAAG-------------------GTCGTCGGTTCGAATCCGACAGGGGGCT---
D00010724 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Thr TGT -GCTGGCGTAGCTCAACT-GGC--AGAGCACCTGATTTGTAATCAGGCG-------------------GTTGCAGGTTCGATTCCTGTCGCCAGCTCCA
D00002972 Synechocystis_sp. Thr TGT -GCTGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCAACTGATTTGTAATCAGTCG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCCGTCACCAGCT---
D00010374 Synechocystis_sp._PCC_6803 Thr TGT -GCTGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCAACTGATTTGTAATCAGTCG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCCGTCACCAGCT---
D00010555 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Thr TGT -GCTGGCGTAGCTCAATA-GGT--AGAGCAGCTGACTTGTAATCAGCAG-------------------GTTGAAGGTTCGAGTCCTTTCGCCAGCTCCA
D00010549 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Thr TGT -GCTGGTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCGTCGGTTCGAGTCCGACCATCAGCT---
D00002930 Thermotoga_maritima Thr TGT -GCCAGCGTAGCTCAACC-GGT--AGAGCGACTGATTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGTGGGTTCGAGTCCCACCGCTGGCACCA
D00010377 Thermotoga_maritima_MSB8 Thr TGT -GCCAGCGTAGCTCAACC-GGT--AGAGCGACTGATTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGTGGGTTCGAGTCCCACCGCTGGCTCCA
D00002952 Thermus_thermophilus Thr TGT -GCCACCCTAGCTCAACC-GGC--AGAGCACCCGACTTGTAATCGGGGG-------------------GTTGGGGGTTCAACTCCCCTGGGTGGCTCCA
D00010753 Thermus_thermophilus_HB27 Thr TGT --CCACCCTAGCTCAACC-GGC--AGAGCACCCGACTTGTAATCGGGGG-------------------GTTGGGGGTTCAACTCCCCTGGGTGGCTCCA
D00010755 Treponema_denticola_ATCC_35405 Thr TGT -GCCAACTTAGCTCAGCT-GGTCCAGAGCACGTGATTTGTAATCTCGGG-------------------GTCTAGGGTTCGAATCCCTAAGTTGGCT---
D00002943 Treponema_pallidum Thr TGT -GCCAACTTAGCTCAGTC-GGTCTAGAGCGCGTGATTTGTAATCTCGAG-------------------GTCTAGGGTTCGAATCCCTAAGTTGGCT---
D00010368 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Thr TGT -GCCAACTTAGCTCAGTC-GGTCTAGAGCGCGTGATTTGTAATCTCGAG-------------------GTCTAGGGTTCGAATCCCTAAGTTGGCT---
D00010622 Tropheryma_whipplei_str._Twist Thr TGT -GCCAGCTTGGCGCAATT-GGT--AGCGCACCCGACTTGTAATCGGGCG-------------------GTTATGGGTTCGAGTCCCATAGCTGGCT---
D00010625 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Thr TGT -GCCAGCTTGGCGCAATT-GGT--AGCGCACCCGACTTGTAATCGGGCG-------------------GTTATGGGTTCGAGTCCCATAGCTGGCT---
D00010325 Ureaplasma_parvum_serovar_3 Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAATA-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGTGGGTTCAATTCCTATAGTCGGCACCA
D00010319 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGTA-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCACCAGTTCGATTCCGGTAGTCGGCACCA
D00010320 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAGTA-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCGCCAGTTCGATTCCGGCAGCCGGCACCA
D00010758 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Thr TGT -GCCGGCTTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTTGTCAGTTCAAGTCCGACAGCCGGCA---
D00010561 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Thr TGT -GCCGGCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACCGCCTTGTAAGCGGTAG-------------------GTCCCCAGTTCGAATCCGGGTGTCGGCACCA
D00010558 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Thr TGT -GCCGGCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACCGCCTTGTAAGCGGTAG-------------------GTCCCCAGTTCGAATCCGGGTGCCGGCACCA
D00010380 Xylella_fastidiosa_9a5c Thr TGT -GCCGCTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACTGATTTGTAATCAGTAG-------------------GTCCACAGTTCGAATCTGTGAAGCGGCACCA
D00010385 Xylella_fastidiosa_9a5c Thr TGT -GCCGACTTAGCTCAGTA-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCACCAGTTCGATTCCGGTAGTCGGCACCA
D00010627 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Thr TGT -GCCGCTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACTGATTTGTAATCAGTAG-------------------GTCCACAGTTCGAATCTGTGAAGCGGCACCA
D00010726 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Thr TGT -GCCGGCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCCCGAGTTCGACTCTTGGTGCCGGCACCA
D00010417 Yersinia_pestis_CO92 Thr TGT -GCCGGCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCCCGAGTTCGACTCTTGGTGCCGGCACCA
D00010566 Yersinia_pestis_KIM Thr TGT -GCCGGCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCCCGAGTTCGACTCTTGGTGCCGGCACCA
D00010729 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Thr TGT -GCCGGCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAG-------------------GTCCCGAGTTCGACTCTTGGTGCCGGCACCA
D00010500 Arabidopsis_thaliana Thr TGT -GCCCGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCGTCAGTCTTGTAAACTGAAG-------------------GTCCGTAGTTCGATCCTGCGTGTGGC-----
D00010501 Arabidopsis_thaliana Thr TGT -GCCCGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCGTCAGTCTTGTAAACTGAAG-------------------GTCCGTAGTTCGATCCTGCGTGTGGGC----
D00010502 Arabidopsis_thaliana Thr TGT -GCCCTTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCGTCAGTCTTGTAAACTGAAG-------------------GTCCGTAGTTCGATCCTGCGTGAGGGCA---
D00003088 Caenorhabditis_elegans Thr TGT -GCCCTTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCGTTGGTCTTGTAAACCAAAG-------------------GTCCGTAGTTCAATCCTGCGTGGGGGCA---
D00010511 Caenorhabditis_elegans Thr TGT -GAGTTTTGGCTCGACT--GGT--AAGAGGTGTGACTTGTGATCAATAG-------------------GTCCGGGGTTCGACCCCTCGTAAGGGTC---
D00010512 Caenorhabditis_elegans Thr TGT -GCCCTTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCGTTGGTCTTGTAAACCAAAG-------------------GTCCGTAGTTCAATCCTGCGTGGGGGCA---
D00010732 Candida_glabrata_CBS_138 Thr TGT -GCCTCCTTAGCTTAGT--GGT--AGAGCGTTGCACTTGTAATGCAAAG-------------------GTCGCTAGTTCAATTCTGGCAGGTGGCA---
D00003087 Cyanidium_caldarium Thr TGT -GCTAGTATAGGTCAATT-GGT--AGAGCAGCTGATTTGTAATCAGCCG-------------------GTTGCAGGTTCAATTCCTGTTGCTAGCA---
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D00010564 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Thr TGT -GCCATTATAGCTCAGTA-GGT--AGAGCTTTAGCTTTGTAAGCTAAGG-------------------GTCCTGGGTTCGAGTCCCAGTGGTGGCT---
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D00010785 Gallus_gallus Thr TGT -GGCTCCATAGCTCAGT--GGTT-AGAGCACTGGTCTTGTAAACCAGGG-------------------GTCGCGAGTTCGATCCTCGCTGGGGCCT---
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D00003092 Homo_sapiens Thr TGT -GGCTCCATAGCTCAGG--GGTT-AGAGCACTGGTCTTGTAAACCAGGG-------------------GTCGCGAGTTCAAATCTCGCTGGGGCCT---
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D00003086 Phaseolus_vulgaris Thr TGT -GCCCTTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCGTCAGTCTTGTAAACTGAAG-------------------GTTCGTAGTTCGATCCTGCGTGAGGGCA---
D00003074 Plasmodium_falciparum Thr TGT -GCTAAAGTAGCTTAATT-GGT--AAAGCAACTGATTTGTAATCAGTAG-------------------ATTATGAGTTCAAATCTCACCATTAGCT---
D00010769 Plasmodium_falciparum_3D7 Thr TGT -GCCACCTTAGCACAGT--GGT--AGTGCGTTGGTCTTGTAAACCAAAG-------------------GTCGGGAGTTCGATCCTCCCAGGTGGCT---
D00003081 Saccharomyces_cerevisiae Thr TGT -GCCTCCTTAGCTTAGT--GGT--AGAGCGTTGCACTTGTAATGCAAAG-------------------GTCGCTAGTTCAATTCTGGCAGGTGGCA---
D00010515 Saccharomyces_cerevisiae Thr TGT -GCCTCCTTAGCTTAGT--GGT--AGAGCGTTGCACTTGTAATGCAAAG-------------------GTCGTTAGTTCAATTCTGACAGGTGGCA---
D00010516 Saccharomyces_cerevisiae Thr TGT -GCCTCCTTAGCTTAGT--GGT--AGAGCGTTGCACTTGTAATGCAAAG-------------------GTCGCTAGTTCAATTCTGGCAGGTGGCA---
D00010525 Schizosaccharomyces_pombe Thr TGT -GCCTCTATGGCTTAGT--GGT--ACAGCATCGCACTTGTAATGCGAAG-------------------ATCCTTGGTTCGATTCCGAGTGGAGGC----
D00010526 Schizosaccharomyces_pombe Thr TGT -GCCCCTATGGCTTAGT--GGT--ACAGCATCGCACTTGTAATGCGAAG-------------------ATCCTTGGTTCGATTCCGAGTGGGGGC----
D00010801 Takifugu_rubripes Thr TGT -GCATTAGTAGCTCAGA--TTC--AGAGCGTCGGTCTTGTAAACCGAAT-------------------GTCGGGGGTTAAAGTCCCCCCTTATGCT---
D00010802 Takifugu_rubripes Thr TGT -GGCACTGTAGCTTAGTT-GGTC-AAAGTACCTGTCTTGTAAACAGGAG-------------------AGCCTGGGTTCGAATCCCAGCAGTGCCT---
D00010803 Takifugu_rubripes Thr TGT -GGCTCTATAGCTCAGT--GGTT-AGAGCACTGGTCTTGTAAACCAGGG-------------------GTCATGAGTTCGATCCTCATTAGGGCCT---
D00010804 Takifugu_rubripes Thr TGT -GGCTCCATAGCTCAGG--GGTT-AGAGCACTGGTCTTGTAAACCAGGG-------------------GTCGCGAGTTCAAATCTCGCTGGGGCCT---
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D00010806 Takifugu_rubripes Thr TGT -GGCCTCATAGCTCAGT--GGTT-AGAGCACTGGTCTTGTAAACCAGGG-------------------GTCGCGAGTTCAATTCTCGCTGGGGCCT---
D00010807 Takifugu_rubripes Thr TGT -GGCTCCATAGCTCAGT--GGTT-AGAGCACTGGTCTTGTAAACCAGGG-------------------GTCGCGAGTTCGATCCTCGCTGGGGCCT---
D00003084 Toxoplasma_gondii Thr TGT -GCTGATGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCCGCTGATTTGTAATCAGGAG-------------------GTTATGGGTTCGAATCCCTTTATCAGTT---
D00010442 Aeropyrum_pernix_K1 Thr GGT -GCCGCCGTAGCTCAGCT-GGC--AGAGCGCCGCCCTGGTAAGGCGGAG-------------------GCCCCGGGTTCGAATCCCGGCGGCGGCTCC-
D00002920 Archaeoglobus_fulgidus Thr GGT -GCCACGGTAGCTCAGCA-GGA--AGAGCGCGTGCTTGGTAAGCACGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGTGGCT---
D00010445 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Thr GGT -GCCACGGTAGCTCAGCA-GGA--AGAGCGCGTGCTTGGTAAGCACGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGTGGCT---
D00010448 Halobacterium_sp._NRC-1 Thr GGT -GCCTGGGTAGCTTAGC--GGT--AAAGCGCGTCCTTGGTAAGGACGAG-------------------ACCCCGGATTCAAATTCCGGCCTAGGCT---
D00002924 Methanocaldococcus_jannaschii Thr GGT -GCCTCGGTAGCTCAGCCTGGCC-GGAGCGCCTGCTTGGTAAGCAGGAG-------------------GTCGCGGGTTCAAACCCCGCCCGAGGCT---
D00010453 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Thr GGT -GCCTCGGTAGCTCAGCCTGGC--GGAGCGCCTGCTTGGTAAGCAGGAG-------------------GTCGCGGGTTCAAACCCCGCCCGAGGCTCC-
D00011860 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Thr GGT -GCTTTGGTGGCTTAGCTCGGT--ATAGCGCTTGCTTGGTAAGCAAGAG-------------------GTCGCGGGTCCGAATCCCGCCCAAAGCT---
D00010455 Methanococcus_maripaludis Thr GGT -GCTTCAGTGGCTCAGCCTGGT--AGAGCGCCTGCTTGGTAAGCAGGAG-------------------GCCGCGGGTTCAAACCCCGCCTGAAGCT---
D00002926 Methanococcus_vannielii Thr GGT -GCCTCAGTGGCTCAGCCTGGT--AGAGCGCCTGCTTGGTAAGCAGGAG-------------------GCCGCGGGTTCAAACCCCGCCTGAGGCT---
D00010569 Methanopyrus_kandleri_AV19 Thr GGT -GCCGCGGTAGCTCAGCCTGGTT-AGAGCGCCGCCTTGGTAAGGCGGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGCGGCTCCA
D00011905 Methanosarcina_acetivorans_C2A Thr GGT -GCCTTGGTGGCTTAGG--GGT--ATAGCGCGTCCTTGGTAAGGACGAG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGCCCGAGGCT---
D00010532 Methanosarcina_mazei_Go1 Thr GGT -GCCTTGGTGGCTTAGG--GGT--ATAGCGCGTCCTTGGTAAGGACGAG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGCCCGAGGCT---
D00011941 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Thr GGT -GCCTCAGTGGCTCAGCC-GGC--AGAGCGCGTCCTTGGTAAGGACGAG-------------------GTCGCGAGTTCAAATCTCGCCTGAGGCT---
D00010451 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Thr GGT -GCCTTAGTGGCTCAGGT-GGT--AGAGCGATGCCTTGGTAAGGCATAG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCCCCTAAGGCT---
D00011995 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Thr GGT -GCCGCCGTAGCTCAGC--GGA--AGAGCGCCGCCCTGGTAAGGCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGCCGGCGGCT---
D00010458 Pyrococcus_abyssi_GE5 Thr GGT -GCCCCGGTGGCTCAGCCTGGT--AGAGCGGCCGCTTGGTAAGCGGCAG-------------------GTCCCGGGTTCAAAGCCCGGCCGGGGCTCC-
D00010461 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Thr GGT -GCCCCGGTGGCTCAGCCTGGT--AGAGCGGCCGCTTGGTAAGCGGCAG-------------------GTCCCGGGTTCAAAGCCCGGCCGGGGCTCC-
D00010464 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Thr GGT -GCCCCGGTGGCTCAGCCTGGT--AGAGCGGCCGCTTGGTAAGCGGCAG-------------------GTCCCGGGTTCAAAGCCCGGCCGGGGCTCCA
D00012041 Staphylothermus_marinus_F1 Thr GGT -GCCGCCGTAGCTCAGCCTGGTT-GGAGCGCCGCCCTGGTAAGGCGGAG-------------------GTCCCGGGTTCGAATCCCGGCGGCGGCT---
D00012081 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Thr GGT -GCCGCGGTAGCTCAGCCTGGCT-AGAGCGTTGCCCTGGTAAGGCAAAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGCGGCT---
D00010467 Sulfolobus_solfataricus_P2 Thr GGT -GCCGCGGTAGCTCAGCCTGGCC-AGAGCGCTGCCCTGGTAAGGCAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGCGGC----
D00010551 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Thr GGT -GCCGCGGTAGCTCAGCCTGGCT-AGAGCGTTGCCCTGGTAAGGCAAAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGCGGCT---
D00002929 Thermococcus_celer Thr GGT -GCCCCGGTGGCTCAGCC-TGGT-GGAGCGGCCGCTTGGTAAGCGGCAG-------------------GCCGCGGGTTCAAACCCCGCCCGGGGCTCCA
D00010470 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Thr GGT -GCCGTCGTAGCTCAGCCTGGT--AGAGCGCGTGCTTGGTAAGCACGAG-------------------T-CGCGGGTCCAAACCCCGTCGGCGGCT---
D00010473 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Thr GGT -GCCGTCGTAGCTCAGCCTGGT--AGAGCGCGTGCTTGGTAAGCACGAG-------------------GTCGCGGGTCCGAACCCCGTCGGCGGCT---
D00010760 Acinetobacter_sp._ADP1 Thr GGT -GCTCTTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCACTCCCTTGGTAAGGGAGAG-------------------GTCTCGAGTTCAAATCTCGATAAGAGCTCCA
D00010432 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Thr GGT -GCTGCTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCACTCCCTTGGTAAGGGAGAG-------------------GCCGAGAGTTCAAATCTCTCTAGCAGCACCA
D00010387 Aquifex_aeolicus_VF5 Thr GGT -GCCCAGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GGCGCCGGTTCGAGTCCGGTCCTGGGCTCCA
D00010670 Bacillus_anthracis_str._Ames Thr GGT -GCTTCCATAGCTCAGCT-GGT--AGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAG-------------------GTCACCGGTTCAAGCCCGGTTGGAAGCT---
D00010698 Bacillus_anthracis_str._Sterne Thr GGT -GCTTCCATAGCTCAGCT-GGT--AGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAG-------------------GTCACCGGTTCAAGCCCGGTTGGAAGCT---
D00010735 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Thr GGT -GCTTCCATAGCTCAGCT-GGT--AGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAG-------------------GTCACCGGTTCAAGCCCGGTTGGAAGCT---
D00010641 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Thr GGT -GCTTCCATAGCTCAGCT-GGT--AGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAG-------------------GTCACCGGTTCAAGCCCGGTTGGAAGCT---
D00010604 Bacillus_halodurans_C-125 Thr GGT -GCTTCCATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCACTACCATGGTAAGGTAGGG-------------------GTCAGCGGTTCAAGTCCGCTTGGAAGCT---
D00002950 Bacillus_subtilis Thr GGT -GCTTCCATAGCTCAGCA-GGT--AGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGAGCCCGCTTGGAAGCT---
D00010302 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Thr GGT -GCTTCCATAGCTCAGCA-GGT--AGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAG-------------------GTCAGCGGTTCGAGCCCGCTTGGAAGCT---
D00010763 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Thr GGT -GCTTCCATAGCTCAGCT-GGT--AGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAG-------------------GTCACCGGTTCAAGCCCGGTTGGAAGCT---
D00010666 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Thr GGT -GCTGTTATAGCTCAGC--GGT--AGAGCACTTCCTTGGTAAGGAAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAGTCCCGGTAACAGCT---
D00010676 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Thr GGT -GCTGCGGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACTCCCTTGGTAAGGGAGAG-------------------GTCGAGAGTTCAATCCTCTCTCGCAGCACCA
D00010771 Bartonella_quintana_str._Toulouse Thr GGT -GCTGCGGTAGCTCAGT--GGC--AGAGCACTCCCTTGGTAAGGGAGAG-------------------GTCGAGAGTTCAATCCTCTCTCGCAGCACCA
D00010677 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Thr GGT -GCCCATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCGTCGGTTCGGCTCCGATCATGGGCTCCA
D00010572 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Thr GGT -GCCCCGATAGCTCAGT--GGT--AGAGCACTTCCTTGGTAAGGAAGAG-------------------GTCGTGAGTCCAATTCTCACTCGGGGCT---
D00002945 Borrelia_burgdorferi Thr GGT -GCCCTTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCACCATGGTAAGGTGGGG-------------------GTCGTCGGTTCAAGTCCGATTGAGGGCT---
D00010348 Borrelia_burgdorferi_B31 Thr GGT -GCCCTTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCACCATGGTAAGGTGGGG-------------------GTCGTCGGTTCAAGTCCGATTGAGGGCT---
D00010702 Borrelia_garinii_PBi Thr GGT -GCCCTTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCACCATGGTAAGGTGGGG-------------------GTCGTCGGTTCAAGTCCGATTGAGGGCT---
D00010608 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Thr GGT -GCTGCCGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACTCCATTGGTAATGGAGAG-------------------GTCGACAGTTCAATCCTGTCTGGCAGCACCA
D00010412 Brucella_melitensis_16M Thr GGT -GCTGCGGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACTCCCTTGGTAAGGGAGAG-------------------GTCGAGAGTTCAATCCTCTCTCGCAGCACCA
D00010306 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Thr GGT -GCTGATATGGCTCAGTA-GGT--AGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCCCCAGTTCAATCCTGGGTATCAGCA---
D00010644 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Thr GGT -GCTGATATAGCTCAGTTTGGT--AGAGCACACCCTCGGTAAGGGTGAG-------------------GTTCCCAGTTCAAACCTGGGTATCAGCA---
D00010534 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Thr GGT -GCTGATATGGCTCAGTA-GGT--AGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCCCCAGTTCAAACCTGGGTATCAGCA---
D00002966 Campylobacter_jejuni Thr GGT -GCTCGTATAGCTCAGA--GGT--AGAGCACTCCCTTGGTAAGGGAGAG-------------------GTCGCGGGTTCAATTCCCGCTATGAGCTCCA
D00010350 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Thr GGT -GCTCGTATGGCTCAGA--GGT--AGAGCACTCCCTTGGTAAGGGAGAG-------------------GTCGCGGGTTCAATTCCCGCTATGAGCTCCA
D00010774 Candidatus_Blochmannia_floridanus Thr GGT -GCTGATATAGCTCAGG--GGC--AGAGCACTCCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCGGCAGTTCGATTCTGCTTATCAGCA---
D00010687 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Thr GGT -GCCCAGATAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTTGCATGGTAAGCAAAAG-------------------GTCGTAGGTTCAATTCCTATTCTGGGCA---
D00010353 Caulobacter_crescentus_CB15 Thr GGT -GCCGCCGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCATCCTTGGTAAGGCTGAG-------------------GTCGGCAGTTCAATCCTGCCCGGCGGCACCA
D00010399 Chlamydia_muridarum_Nigg Thr GGT -GCCCAGGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACTTGCATGGTAAGCAAGTG-------------------GCCGTAGGTTCAATTCCTATTCTGGGCA---
D00003085 Chlamydia_trachomatis Thr GGT -GCGCCCGTAGCTCAT---GGT--AGAGCACTTGCATGGTAAGCAAGTG-------------------GCCGTAGGTTCAATTCCTATTCTGGGCA---
D00010300 Chlamydia_trachomatis Thr GGT -GCCCAGATAGCTCAGT--GGT--AGAGCACTTGCATGGTAAGCAAGCG-------------------GTCGTAGGTTCAATTCCTATTCTGGGC----
D00010297 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Thr GGT -GCCCAGGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACTTGCATGGTAAGCAAGTG-------------------GCCGTAGGTTCAATTCCTATTCTGGGCA---
D00010291 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Thr GGT -GCCCAGATAGCTCAGT--GGT--AGAGCACTTGCATGGTAAGCAAGCG-------------------GTCGTAGGTTCAATTCCTATTCTGGGCA---
D00010294 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Thr GGT -GCCCAGATAGCTCAGT--GGT--AGAGCACTTGCATGGTAAGCAAGCG-------------------GTCGTAGGTTCAATTCCTATTCTGGGCA---
D00010327 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Thr GGT -GCCCAGATAGCTCAGT--GGT--AGAGCACTTGCATGGTAAGCAAGCG-------------------GTCGTAGGTTCAATTCCTATTCTGGGCA---
D00010528 Chlorobium_tepidum_TLS Thr GGT -GCTGATGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCACTTCCTTGGTAAGGAAGAG-------------------GTCATCGGTTCAAGTCCGATCATCAGCT---
D00010405 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Thr GGT -GCCCATGTGGCTCAGTA-GGT--AGAGCGTCACCTTGGTAAGGTGGAG-------------------GTCGCCAGTTCAAATCTGGTCGTGGGCTCCA
D00010396 Clostridium_perfringens_str._13 Thr GGT -GCTCACGTAGCTCAGTC-GGC--AGAGCGTCGCCTTGGTAAGGCGGAG-------------------GTCGTCGGTTCAATCCCGATCGTGAGCTCCA
D00010611 Clostridium_tetani_E88 Thr GGT -GCCCATGTAGCTCAGTA-GGT--AGAGTGCCACCTTGGTAAGGTGGAG-------------------GTCACCGGTTCAATCCCGGTCATGGGCTCCA
D00010680 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Thr GGT -GCCCCCTTAGCTCAGTC-GGC--AGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAG-------------------GTCGACAGTTCGATTCTGTCAGGGGGCT---
D00010577 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Thr GGT -GCCCCCTTAGCTCAGTC-GGC--AGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAG-------------------GTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCT---
D00010540 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Thr GGT -GCCCCCTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAG-------------------GTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCT---
D00010639 Coxiella_burnetii_RSA_493 Thr GGT -GCCCACATAGCTCAGGC-GGT--AGAGCACTTCCTTGGTAAGGAAGAG-------------------GTCACCGGTTCAAGTCCGGTTGTGGGCTCCA
D00010356 Deinococcus_radiodurans_R1 Thr GGT -GCTCCTGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCACTCCCTTGGTAAGGGAGAG-------------------GTCATCGGTTCAAGTCCGATCAGGAGCTCCA
D00010740 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Thr GGT -GCCCATGTGGCTCAGTC-GGT--AGAGCACATCCTTGGTAAGGATGAG-------------------GTCAGCAGTTCAATTCTGCTCATGGGCTCCA
D00010743 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Thr GGT -GCCCACATAGCTCAGGC-GGT--AGAGCACTTCCTTGGTAAGGAAGAG-------------------GTCATGAGTTCAAGTCTCATTGTGGGCTCCA
D00010613 Enterococcus_faecalis_V583 Thr GGT -GCCGCCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCACCATGGTAAGGTGGGG-------------------GTCGCCGGTTCAAGCCCGGCAGGTGGCT---
D00002956 Escherichia_coli Thr GGT -GCTGATATGGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAGGGGTGGG-------------------GTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCA
D00002957 Escherichia_coli Thr GGT -GCTGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCA
D00002960 Escherichia_coli Thr GGT -GCTGATATGGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCA
D00010331 Escherichia_coli_K12 Thr GGT -GCTGATATGGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCA
D00010332 Escherichia_coli_K12 Thr GGT -GCTGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCA
D00010335 Escherichia_coli_O157:H7 Thr GGT -GCTGATATGGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCA
D00010336 Escherichia_coli_O157:H7 Thr GGT -GCTGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCA
D00010339 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Thr GGT -GCTGATATGGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCA
D00010340 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Thr GGT -GCTGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCA
D00010705 Geobacter_sulfurreducens_PCA Thr GGT -GCCCACATAGCTCAGGA-GGT--AGAGCACTTCCTTGGTAAGGAAGAG-------------------GTCACCGGTTCGAGTCCGGTTGTGGGCTCCA
D00002969 Haemophilus_influenzae Thr GGT -GCTGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCGGCGGTTCAAATCCGCCTATCAGCACCA
D00010346 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Thr GGT -GCTGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCGGCGGTTCAAATCCGCCTATCAGCACCA
D00002949 Helicobacter_pylori Thr GGT -GCCTATATAGCTCAGA--GGC--AGAGCACTTCCTTGGTAAGGAAGAG-------------------GTCGGCGGTTCAATTCCGCTTATAGGCTCCA
D00010342 Helicobacter_pylori_26695 Thr GGT -GCCTATATAGCTCAGA--GGC--AGAGCACTTCCTTGGTAAGGAAGAG-------------------GTCGGCGGTTCAATTCCGCTTATAGGCTCCA
D00010344 Helicobacter_pylori_J99 Thr GGT -GCCTATATAGCTCAGA--GGC--AGAGCACTTCCTTGGTAAGGAAGAG-------------------GTCGGCGGTTCAATTCCGCTTATAGGCTCCA
D00010709 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Thr GGT -GCCGTTTTAGCTCAGGA-GGT--AGAGCACCGCCGTGGTAAGGAGGAG-------------------GTCCCCAGTTCAAATCTGGGAAACGGCT---
D00010618 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Thr GGT -GCCGTTTTAGCTCAGCA-GGT--AGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAG-------------------GTCGGCAGTTCAAATCTGCTAAACGGCT---
D00010712 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Thr GGT -GCCCCCTTAGCTCATT--GGT--AGAGCACTTCCTTGGTAAGGAAGAG-------------------GTAGTGGGTCCGATTCCCACAGGGGGCT---
D00010580 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Thr GGT -GCCCTCTTAGCTCAGC--GGT--AGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGGG-------------------GTCACCAGTTCAAGCCTGGTAGAGGGCT---
D00010391 Listeria_innocua_Clip11262 Thr GGT -GCCGCTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGGG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGACAAGTGGCT---
D00002961 Listeria_ivanovii Thr GGT -GCCGCTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGGG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGACAAGTGGCT---
D00002962 Listeria_monocytogenes Thr GGT -GCCGCTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACTTCCATGGTCCGGAAGGG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGACAAGTGGCT---
D00010394 Listeria_monocytogenes_EGD-e Thr GGT -GCCGCTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGGG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGACAAGTGGCT---
D00010746 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Thr GGT -GCCGCTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGGG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGACAAGTGGCT---
D00010416 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Thr GGT -GCTGCGGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACTCCCTTGGTAAGGGAGAG-------------------GTCGAGAGTTCAATCCTCTCTCGCAGCACCA
D00010632 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Thr GGT -GCCCCCTTAGCTCAGTC-GGC--AGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAG-------------------GTCAACGGTTCGATTCCGTTAGGGGGCT---
D00010323 Mycobacterium_leprae_TN Thr GGT -GCCCCCTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAG-------------------GTCAACGGTTCGATTCCGTTAGGGGGCT---
D00010309 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Thr GGT -GCCCCCTTAGCTCAGTC-GGC--AGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAG-------------------GTCAACGGTTCGATTCCGTTAGGGGGCT---
D00010684 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Thr GGT -GCCCCCTTAGCTCAGTC-GGC--AGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAG-------------------GTCAACGGTTCGATTCCGTTAGGGGGCT---
D00010631 Mycoplasma_gallisepticum_R Thr GGT -GCCGAATTAGTTTAGT--GGC--AAAACAGATGCATGGTAAGCATCAA-------------------A-GACAAGTTCGATTCTCGTATTCGGCACCA
D00002933 Mycoplasma_genitalium Thr GGT -GCCGAATTGGTTTAGG--GGC--AAAACAGATCCATGGTAAGGATCAG-------------------A-GAACAGTTCGACTCTGTTATTCGGCACCA
D00010359 Mycoplasma_genitalium_G37 Thr GGT -GCCGAATTGGTTTAGG--GGC--AAAACAGATCCATGGTAAGGATCAG-------------------A-GAACAGTTCGACTCTGTTATTCGGCACCA
D00002938 Mycoplasma_pneumoniae Thr GGT -GCCGAATTAGTTTAGG--GGC--AAAACAGATCCATGGTAAGGATCAG-------------------G-AAACAGTTCGACTCTGTTATTCGGCACCA
D00010362 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Thr GGT -GCCGAATTAGTTTAGG--GGC--AAAACAGATCCATGGTAAGGATCAG-------------------A-GAACAGTTCGACTCTGTTATTCGGCACCA
D00010429 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Thr GGT -GCCAATATAGCTCAGCA-GGC--AGAGCACATCCATGGTAAGGATGGG-------------------GTCGCTGGTTCAAGTCCAGTTATTGGCACCA
D00010312 Neisseria_meningitidis_MC58 Thr GGT -GCCCATGTAGCTCAGG--GGT--AGAGCACTCCCTTGGTAAGGGAGAG-------------------GTCGGCAGTTCAAATCTGCCCATGGGCACCA
D00010315 Neisseria_meningitidis_Z2491 Thr GGT -GCCCATGTAGCTCAGG--GGT--AGAGCACTCCCTTGGTAAGGGAGAG-------------------GCCGGCAGTTCAAATCTGCCCATGGGCACCA
D00010661 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Thr GGT -GCCCATGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACTCCCTTGGTAAGGGAGAG-------------------GTCGCCAGTTCAATCCTGGCCATGGGCACCA
D00010427 Nostoc_sp._PCC_7120 Thr GGT -GCCCGTGTGGCTCAGT--GGT--AGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCACGAGTTCAATCCTCGTCACGGGCT---
D00010583 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Thr GGT -GCTTCCATAGCTCAGTTCGGT--AGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGGG-------------------GTCAGCGGTTCAAGTCCGCTTGGAAGCT---
D00010683 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M Thr GGT -GCCCTTATAGTTTAAC--GGC--AGAACGTAGCAATGGTAATGCTGAA-------------------A-TACAAGTTCAATTCTTGTTAAGGGCACCA
D00010364 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Thr GGT -GCTGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCGGCGGTTCAAATCCGCCTATCAGCACCA
D00010690 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Thr GGT -GCTGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GCCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCA
D00010692 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Thr GGT -GCTGATATGGCTCAGTT-GGT--AGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCCCCAGTTCGAATCTGGGTATCAGCACCA
D00010715 Porphyromonas_gingivalis_W83 Thr GGT -GCCAATGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCACTTCCTTGGTAAGGAAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAGTCCCGGCATCGGCT---
D00010751 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Thr GGT -GCCCCTATAGCTCAGTA-GGC--AGAGCGTCTCCATGGTAAGGAGAAG-------------------GTCAGCAGTTCGATTCTGCTTGGGGGCT---
D00002965 Pseudomonas_aeruginosa Thr GGT -GCTCATGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCAGCGGTTCAAATCCGCTCATGAGCTCCA
D00010370 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Thr GGT -GCTCATGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCAGCGGTTCAAATCCGCTCATGAGCTCCA
D00010668 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Thr GGT -GCTCTTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCAGCGGTTCGAATCCGCTCAAGAGCTCCA
D00010425 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Thr GGT -GCCCATGTGGCTCAGT--GGT--AGAGCACTCCCTTGGTAAGGGAGAG-------------------GTCGGCAGTTCGATCCTGCCCATGGGCACCA
D00002970 Rhizobium_leguminosarum Thr GGT -GCTGCCGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCGGTGGTTCAATCCCACTCGGCAGCACCA
D00010659 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Thr GGT -GCTGCTGTAGCTCAGG--GGT--AGAGCGCCTCCTTGGTAAGGATGAG-------------------GTCATGGGTTCAAATCCCATCAGCAGCT---
D00010660 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Thr GGT -GGTCTGTAAGTGTTGC--GGC--AGCACGCGTCTGTGGTATGGACGAA-------------------G-ACCGGGTTCAATTCCCGGACGGACCT---
D00010695 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Thr GGT -GCTGCCGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACTCCCTTGGTAAGGGAGAG-------------------GTCGACAGTTCAATCCTGTCCGGCAGCACCA
D00010408 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Thr GGT -GCTACTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCACTTCATTGGTAATGAAGAG-------------------GTCGGGGGTTCGATTCCCCCTAGTAGCACCA
D00010537 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Thr GGT -GCTACTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCACTTCATTGGTAATGAAGAG-------------------GCCGTGGGTTCAATTCCCACTAGTAGCACCA
D00010718 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Thr GGT -GCTACTATAGCTCAGA--GGT--AGAGCACTTCATTGGTAATGAAGAG-------------------GTCGTGGGTTCAATTCCCACTAGTAGCACCA
D00010435 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Thr GGT -GCTGATATGGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCA
D00010436 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Thr GGT -GCTGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCA
D00010654 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Thr GGT -GCTGATATGGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCA
D00010655 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Thr GGT -GCTGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCA
D00010420 Salmonella_typhimurium_LT2 Thr GGT -GCTGATATGGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCA
D00010422 Salmonella_typhimurium_LT2 Thr GGT -GCTGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCA
D00010589 Shewanella_oneidensis_MR-1 Thr GGT -GCTGATATGGCTCAGTT-GGT--AGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCA
D00010590 Shewanella_oneidensis_MR-1 Thr GGT -GCTGATATGGCTCAGTC-GGT--AGAGCGCATCCTTGGTAAGGATGAG-------------------GTCCCCAGTTCGATTCTGGGTATCAGCACCA
D00010593 Shigella_flexneri_2a_str._301 Thr GGT -GCTGATATGGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCA
D00010596 Shigella_flexneri_2a_str._301 Thr GGT -GCTGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCA
D00010439 Sinorhizobium_meliloti_1021 Thr GGT -GCTGCTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCACTCCCTTGGTAAGGGAGAG-------------------GCCGAGAGTTCAAATCTCTCTAGCAGCACCA
D00002955 Stigmatella_aurantiaca Thr GGT -GCCCTGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCATCCTTGGTAAGGATGAG-------------------GTCACCAGTTCAATCCTGGTTCAGGGCTCCA
D00010600 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Thr GGT -GCCGCTATAGTTAAAT--GGT--ATAATAGAGCAATGGTAATGCTCAG-------------------T-TCCGAGTTCAATTCTCGGTGGTGGCA---
D00010544 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Thr GGT -GCCGCTATAGTTAAAT--GGT--ATAATAGAGCAATGGTAATGCTCAA-------------------T-TCCGAGTTCAATTCTCGGTGGTGGCA---
D00010603 Streptococcus_mutans_UA159 Thr GGT -GCCGCTATAGTTAAAT--GGT--ATAATAGAGCAATGGTAATGCTCCG-------------------T-TCCGAGTTCGATTCTCGGTGGTGGCA---
D00010402 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Thr GGT -GCTGATTTAGCTCAGTT-GGC--AGAGCGCATCCATGGTAAGGATGAG-------------------GTCGCCGGTTCAATCCCGGCAATTAGCA---
D00010401 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Thr GGT -GCCGCTGTAGTTAAAT--GGT--ATAATAAAGCAATGGTAATGCTTCG-------------------T-TCCGAGTTCGATTCTCGGTGGTGGCA---
D00010545 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Thr GGT -GCCGCTGTAGTTAAAT--GGT--ATAATAAAGCAATGGTAATGCTTCG-------------------T-TCCGAGTTCGATTCTCGGTGGTGGCA---
D00010636 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Thr GGT -GCCGCTGTAGTTAAAT--GGT--ATAATAAAGCAATGGTAATGCTTCG-------------------T-TCCGAGTTCGATTCTCGGTGGTGGCA---
D00010648 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Thr GGT -GCCCCCATAGCTCAGTC-GGC--AGAGCGTCTCCATGGTAAGGAGAAG-------------------GTCAACGGTTCGATTCCGTTTGGGGGCTCCA
D00010652 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Thr GGT -GCCCCAATAGCTCAGTC-GGC--AGAGCGTCTCCATGGTAAGGAGAAG-------------------GTCTACGGTTCGATTCCGTATTGGGGCT---
D00010586 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Thr GGT -GCCCCAATAGCTCAGTC-GGC--AGAGCGTCTCCATGGTAAGGAGAAG-------------------GTCAACGGTTCGATTCCGTTTTGGGGCT---
D00010587 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Thr GGT -GCCCCTATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGTCTCCATGGTAAGGAGAAG-------------------GTCAACGGTTCGATTCCGTTTGGGGGCTCCA
D00010722 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Thr GGT -GCTGATGTAGCTCAGGA-GGT--AGAGCACGTCCTTGGTAAGGACGAG-------------------GTCACCGGTTCGAGCCCGGTCATCAGCTCCA
D00010723 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Thr GGT -GCTGATGTAGCTCAGGT-GGT--AGAGCACGTCCTTGGTAAGGACGAG-------------------GTCACCGGTTCGAGCCCGGTCATCAGCTCCA
D00002973 Synechocystis_sp. Thr GGT -GCCCTTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCACGAGTTCAATCCTCGTCAAGGGCT---
D00010373 Synechocystis_sp._PCC_6803 Thr GGT -GCCCTTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCACGAGTTCAATCCTCGTCAAGGGCT---
D00010554 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Thr GGT -GCCCACGTAGCTCAGTA-GGC--AGAGCGTCGCCTTGGTAAGGCGGAG-------------------GTCACCGGTTCGATCCCGGTCGCGGGCTCCA
D00010548 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Thr GGT -GCCCGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCACGAGTTCAATCCTCGTCACGGGCT---
D00010376 Thermotoga_maritima_MSB8 Thr GGT -GCAGGCGTAGCTTCAAGCGGT--GGAGCGCCGCCTTGGTAAGGCGGAG-------------------GGTGTGGGTTCGAGTCCCACCGCCTGCTCCA
D00002953 Thermus_thermophilus Thr GGT -GCTCGCGTAGCTCAGCA-GGT--AGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCGCCGGTTCGAGCCCGGCCGCGAGCTCCA
D00010754 Thermus_thermophilus_HB27 Thr GGT --CTCGCGTAGCTCAGCA-GGT--AGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCGCCGGTTCGAGCCCGGCCGCGAGCTCCA
D00010757 Treponema_denticola_ATCC_35405 Thr GGT -GCTCCTGTAGCTCAGTC-GGC--AGAGCACAACCATGGTAAGGTTGGG-------------------GTCAGCAGTTCAATTCTGCTCGGGAGCT---
D00002942 Treponema_pallidum Thr GGT -GCTTCTGTAGCTCAGTT-GGC--AGAGCGCAACCATGGTAAGGTTGAG-------------------GTCAGCGGTTCAATCCCGCTCGGAAGCT---
D00010367 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Thr GGT -GCTTCTGTAGCTCAGTT-GGC--AGAGCGCAACCATGGTAAGGTTGAG-------------------GTCAGCGGTTCAATCCCGCTCGGAAGCT---
D00010621 Tropheryma_whipplei_str._Twist Thr GGT -GCCCCGGTAGCTCAGT--GGC--AGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGGG-------------------GTCGTCAGTTCAATCCTGACCCGGGGCT---
D00010624 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Thr GGT -GCCCCGGTAGCTCAGT--GGC--AGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGGG-------------------GTCGTCAGTTCAATCCTGACCCGGGGCT---
D00010317 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Thr GGT -GCTGATATGGCTCAGTC-GGT--AGAGCGCATCCTTGGTAAGGATGAG-------------------GTCCCCAGTTCGATTCTGGGTATCAGCACCA
D00010318 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Thr GGT -GCTGATATAGCTCAGAT-GGT--AGAGCGCATCCTTGGTAAGGATGAG-------------------GTCGGCAGTTCGATTCTGCCTATCAGCACCA
D00010759 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Thr GGT -GCCGTTGTAGCTCAGGT-GGT--AGAGTACGTCATTGGTAATGACGAG-------------------GTCCCAAGTTCGAGTCTTGGTAACGGCA---
D00010559 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Thr GGT -GCTCACGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCACCTCCTTGGTAAGGAGGAG-------------------GTCGAAGGTTCGATTCCTTTCGTGAGCACCA
D00010556 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Thr GGT -GCTCACGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCACCTCCTTGGTAAGGAGGAG-------------------GTCGAAGGTTCGATTCCTTTCGTGAGCACCA
D00010379 Xylella_fastidiosa_9a5c Thr GGT -GCTCACGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCACCTCCTTGGTAAGGAGGAG-------------------GTCGATGGTTCGATTCCATTCGTGAGCACCA
D00010383 Xylella_fastidiosa_9a5c Thr GGT -GCTGATATGGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCA
D00010384 Xylella_fastidiosa_9a5c Thr GGT -GCTGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCA
D00010629 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Thr GGT -GCTCACGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCACCTCCTTGGTAAGGAGGAG-------------------GTCGATGGTTCGATTCCATTCGTGAGCACCA
D00010727 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Thr GGT -GCTGATATGGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCA
D00010728 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Thr GGT -GCTGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCA
D00010418 Yersinia_pestis_CO92 Thr GGT -GCTGATATGGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCA
D00010419 Yersinia_pestis_CO92 Thr GGT -GCTGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCA
D00010565 Yersinia_pestis_KIM Thr GGT -GCTGATATGGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCA
D00010567 Yersinia_pestis_KIM Thr GGT -GCTGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCA
D00010730 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Thr GGT -GCTGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCA
D00010731 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Thr GGT -GCTGATATGGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCCCCAGTTCGACTCTGGGTATCAGCACCA
D00010707 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Thr AGT -GCTGACTTAGCTCAGTT-GGC--AGAGCACGTCACTAGTAATGATGAG-------------------GTCGAAGGTTCGAATCCTTTAGTCAGCA---
D00010708 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Thr AGT -GCTGACTTAGCTCAGTT-GGC--AGAGCACGTCACTAGTAATGATGAG-------------------GTCGAAGGTTCGAATCCTTTAGTCAGCA---
D00010616 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Thr AGT -GCCGACTTAGCTCAGTT-GGC--AGAGCATCTCACTAGTAATGAGGAG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTAGTCGGCA---
D00010748 Mesoplasma_florum_L1 Thr AGT -GCTGACTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATTGACTAGTAATCAATAG-------------------GTCGAAGGTTCAAGTCCTTTAGTCAGCACCA
D00002931 Mycoplasma_capricolum Thr AGT -GCTGACTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATTGACTAGTAATCAATAG-------------------GTCGAAGGTTCAAATCCTTTAGTCAGCACCA
D00010494 Arabidopsis_thaliana Thr AGT -GCTCTCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCCGTTTAGTAAGCGGGAG-------------------GTCTTGAGTTCAACTCTCAACGAAAGC----
D00010495 Arabidopsis_thaliana Thr AGT -GCTTTCATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCCGTTTAGTAAGCGGGAG-------------------GTCTTGAGTTCAACTCTCAATGAAAGC----
D00010496 Arabidopsis_thaliana Thr AGT -GCTCTCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCCGTTTAGTAAGCGGGAG-------------------GTCTTGAGTTCAACTCTCAACGAGAGC----
D00003089 Caenorhabditis_elegans Thr AGT -GCCTCATTGGCTCAGT--GGC--AGAGCGTCTGTCTAGTAAACAGAAG-------------------GTCGCTGGTTCGATTCCAGCATGAGGCA---
D00010503 Caenorhabditis_elegans Thr AGT -GGGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCTCCCTTAGTATGGGAGAG-------------------GGCTGGGGTTCAATTCCCCATACCTCCA---
D00010504 Caenorhabditis_elegans Thr AGT -GCCTCATTGGCTCAGT--GGC--AGAGCGTCTGTCTAGTAAACAGAAG-------------------GTCGCTGGTTCGATTCCAGCATGAGGCC---
D00010505 Caenorhabditis_elegans Thr AGT -GCCTCATTGGCTCAGT--GGC--AGAGCGTCTGTCTAGTAAACAGAAG-------------------GTCGCTGGTTCGATTCCAGCATGAGGCA---
D00010733 Candida_glabrata_CBS_138 Thr AGT -GCTTCTATGGCCAAGTT-GGT--AAGGCGCCACACTAGTAATGTGGAG-------------------ATCATCAGTTCAAATCTGGTTGGAAGCA---
D00003077 Dictyostelium_discoideum Thr AGT -GGCTCCTTAGCATAGT--GGT--ATTGCGTTTCCCTAGTAAGGAAGAG-------------------GTCATGAGTTCGATCCTCATAGGAGCCT---
D00003090 Drosophila_melanogaster Thr AGT -GGCGCCGTGGCTTAGTT-GGTT-AAAGCGCCTGTCTAGTAAACAGGAG-------------------ATCGTGAGTTCGAATCTCGCCGGGGCCT---
D00010517 Drosophila_melanogaster Thr AGT -GGCGCCGTGGCTTAGTT-GGTT-AAAGCGCCTGTCTAGTAAACAGGAG-------------------ATCGTGAGTTCGAATTTCGCCGGGGCCT---
D00010518 Drosophila_melanogaster Thr AGT -GGCGCCGTGGCTTAGTT-GGTT-AAAGCGCCTGTCTAGTAAACAGGAG-------------------ATCGTGAGTTCGAATCTCGCCGGGGCCT---
D00010563 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Thr AGT -GCCGCCATAGCTAAGT--GGTT-ATAGCGCCAGTTTAGTAAACTGGAG-------------------GCCCCGAGTTCGAGTCTCGGTGGTGGCT---
D00010776 Gallus_gallus Thr AGT -GGCACCATGGCTCAGCT-GGTT-GAAGTGCCTGTCTAGTAAAGAGGAG-------------------ATCCTGGGTTTGATCTCCAGTGCTGCCT---
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D00008269 Methanosarcina_mazei_Go1 Pro CGG -GGGACCGTAGGGTAGCTTGGTCCATCCTTCGGCGTTCGGGACGCCGGA-------------------A-CCTGAGTTCGAATCTCAGCGGTCCCA---
D00011956 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Pro CGG -GGGGTCGTAGGGTAGCCTGGACCATCCTAGGGCGTTCGGGACGCTCTG-------------------A-CCTGAGTTCGAATCTCAGCGACCCCA---
D00011985 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Pro CGG -GGGCCCGTAGTCTAGG--GGG--AAGACGCCGGGTTCGGGTCCCGGAG-------------------ATCGCGGGTTCGAATCCCGCCGGGCCCA---
D00008190 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Pro CGG -GGGGCCGTAGTCTAGCCTGGT--AGGATGCGCGGTTCGGGTCCGCGTG-------------------ATCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCCCA---
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D00008202 Sulfolobus_solfataricus_P2 Pro CGG -GGGTCCGTGGTCTAGCCTGGACTAGGATGCGACGTTCGGGTCGTCGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGACCC----
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D00008378 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Pro CGG -CGGAATGTAGCGCAGTT-GGT--AGCGCACTACGTTCGGGACGTAGGG-------------------GTCGGGCGTTCGAGTCGCCTCATTCCGA---
D00008302 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Pro CGG -CGGGCTGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCGCTTCGTTCGGGACGAAGAG-------------------GCCGCGGGTTCAAATCCCGCCAGCCCGA---
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D00008107 Caulobacter_crescentus_CB15 Pro CGG -CGGAGTGTGGCTCAGTCTGGT--AGAGCACTGCGTTCGGGACGCAGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGCCACTCCGACCA
D00008266 Chlorobium_tepidum_TLS Pro CGG -CGGGGTGTGGCTCAGCT-GGT--AGAGTGCTGCGTTCGGGACGCAGAG-------------------GTCGTGGGTTCGAGTCCCGCCACCCCGA---
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D00008388 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Pro CGG -CGGGATATGGCGCAGCTTGGT--AGCGCGCCTCGTTCGGGACGAGGAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTTATCCCGACCA
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D00008110 Deinococcus_radiodurans_R1 Pro CGG -CGGGGCGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACGTCGTTCGGGACGACGGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTCGCCCCGACCA
D00008430 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Pro CGG -CGGGATGTGGCTCAGTTTGGCT-AGAGCGCAGCGTTCGGGACGCTGAG-------------------GCCGGAGGTTCGAATCCTCTCATCCCGACCA
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D00008093 Escherichia_coli_O157:H7 Pro CGG -CGGTGATTGGCGCAGCCTGGT--AGCGCACTTCGTTCGGGACGAAGGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTATCACCGACCA
D00008097 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Pro CGG -CGGTGATTGGCGCAGCCTGGT--AGCGCACTTCGTTCGGGACGAAGGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTATCACCGACCA
D00008406 Geobacter_sulfurreducens_PCA Pro CGG -CGGGGCGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACCTGCTTCGGGAGCAGGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAATCCTCTCGCCCCGACCA
D00008409 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Pro CGG -CGGGATGTGGCTCAGCTTGGT--AGAGCGCTACGTTCGGGACGTAGAA-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTACTCTCCT---
D00008332 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Pro CGG -CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGCACTACGTTCGGGACGTAGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTTTTCCCGA---
D00008411 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Pro CGG -CGGGGTGTGGCGCAGCTTGGT--AGCGCGCTTCGTTCGGGACGAAGAG-------------------GCCGCAGGTTCAAATCCTGTCACCCCGACCA
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D00008349 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Pro CGG -CGGGGTGTGGCGCAGCTTGGT--AGCGCGCTTCGTTCGGGACGAAGAG-------------------GCCGTGGGTTCAAATCCCGCCACCCCGA---
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D00008074 Neisseria_meningitidis_MC58 Pro CGG -CGGAATGTAGCGCAGCCCGGT--AGCGCACTTCGTTCGGGACGAAGGG-------------------GGCGGAGGTTCGAATCCTCTCATTCCGACCA
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D00008416 Porphyromonas_gingivalis_W83 Pro CGG -CGGGATGTAGCACAGTT-GGT--AGCGCGCCACGTTCGGGACGTGGAG-------------------GTCGGAAGTTCGAGTCTTCTCATCCCGA---
D00008436 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Pro CGG -CGGGGTGTGGCGCAGTTTGGT--AGCGCGCTTCGTTCGGGACGAAGAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCACCCCGACCA
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D00008161 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Pro CGG -CGGGGTGTAGCTTAGCCTGGT--AGAGCGCTACGTTCGGGACGTAGAG-------------------GCCGGAGGTTCGAATCCTCTCACCCCGACCA
D00008369 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Pro CGG -CGGGGCATGGCTCAGCCTGGT--AGAACGCTGCGTTCGGGACGCAGAG-------------------GTCGCTGGTTCAAATCCTGTCGCCCCGA---
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D00008367 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Pro CGG -CGGTGATTGGCGCAGCCTGGT--AGCGCACTTCGTTCGGGACGAAGGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTATCACCGACCA
D00008157 Salmonella_typhimurium_LT2 Pro CGG -CGGTGATTGGCGCAGCCTGGT--AGCGCACTTCGTTCGGGACGAAGGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTATCACCGACCA
D00008321 Shigella_flexneri_2a_str._301 Pro CGG -CGGTGATTGGCGCAGCCTGGT--AGCGCACTTCGTTCGGGACGAAGGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTATCACCGACCA
D00008173 Sinorhizobium_meliloti_1021 Pro CGG -CGGAGTGTAGCGCAGTCTGGT--AGCGCACCACGTTCGGGACGTGGGG-------------------GTCGAGTGTTCGAATCACTCCACTCCGACCA
D00002105 Streptomyces_ambofaciens Pro CGG -CGGGGTGTGGCGCAGCTTGGT--AGCGCGCTTCGTTCGGGACGAAGAG-------------------GTCGTGGGTTCAAATCCCGCCACCCCGA---
D00008362 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Pro CGG -CGGGGTGTAGCGCAGCTTGGC--AGCGCGCTTCGTTCGGGACGAAGAG-------------------GTCGTGGGTTCAAATCCCGCCACCCCGA---
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D00008287 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Pro CGG -CGGGGCATGGCGCAGC--GGT--AGCGCGCGCGGTTCGGGACCGTGAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTTGCCCCGACCA
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D00002101 Treponema_pallidum Pro CGG -CGGGTGGTAGCGCAGT--GGT--AGCGCGCTCGGTTCGGGACTGAGAG-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCCCTCGCCCGACCA
D00008116 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Pro CGG -CGGGTGGTAGCGCAGT--GGT--AGCGCGCTCGGTTCGGGACTGAGAG-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCCCTCGCCCGACCA
D00008337 Tropheryma_whipplei_str._Twist Pro CGG -CGGGGTGTGGCGCAGCTTGGT--AGCGCGCCTCGTTCGGGACGAGGAG-------------------GTCGTGGGTTCAAATCCCGCCACCCCGA---
D00008340 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Pro CGG -CGGGGTGTGGCGCAGCTTGGT--AGCGCGCCTCGTTCGGGACGAGGAG-------------------GTCGTGGGTTCAAATCCCGCCACCCCGA---
D00008293 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Pro CGG -CGGGGTGTAGCTCAGTCTGGT--AGAGCGCTACGTTCGGGACGTAGAG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTCCCCGACCA
D00008290 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Pro CGG -CGGGGTGTAGCTCAGTCTGGT--AGAGCGCTACGTTCGGGACGTAGAG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTCCCCGACCA
D00008128 Xylella_fastidiosa_9a5c Pro CGG -CGGGGTGTAGCTCAGTCTGGT--AGAGCGCTACGTTCGGGACGTAGAG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTCCCCGACCA
D00008131 Xylella_fastidiosa_9a5c Pro CGG -CGGTGATTGGCGCAGCCTGGT--AGCGCACTTCGTTCGGGACGAAGGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTATCACCGACCA
D00008341 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Pro CGG -CGGGGTGTAGCTCAGTCTGGT--AGAGCGCTACGTTCGGGACGTAGAG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTCCCCGACCA
D00008224 Arabidopsis_thaliana Pro CGG -GGGCATTTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTCGGGTGCGAGGG-------------------GTCCCGAGTTCGATTCTCGGAATGCCCC---
D00008225 Arabidopsis_thaliana Pro CGG -GGGTGTTTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCGCGCTTCGGGTGCGCGAG-------------------GTCCCGAGTTCGATTCTCGGAACACCC----
D00008226 Arabidopsis_thaliana Pro CGG -GGGTGTTTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTCGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGAGTTCGATTCTCGGAACACCC----
D00008236 Caenorhabditis_elegans Pro CGG -GGCCGGATGGTCTAGA--GGT--ATGATTCTCGCTTCGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCGATTCCCGGTTCGGCC----
D00008256 Drosophila_melanogaster Pro CGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTTTCGCTTCGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAATTCCCGGACGAGCCC---
D00008257 Drosophila_melanogaster Pro CGG -GGCTCGTTGGTCTAGA--GGT--ATGATTCTCGCTTCGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAATTCCCGGACGAGCCC---
D00008258 Drosophila_melanogaster Pro CGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTCGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00008297 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Pro CGG -GGCGTCATGGTCCAAT--GGT--ACGATACGTGCTTCGGGTGCACGTG-------------------A-CCCGAGTTCGATTCTCGGTGACGCCC---
D00002249 Gallus_gallus Pro CGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTCGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00008454 Gallus_gallus Pro CGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTCGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAACTCCCGGACGAGCCC---
D00008455 Gallus_gallus Pro CGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTCGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00008214 Homo_sapiens Pro CGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTCGGGTGTGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00008215 Homo_sapiens Pro CGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTCGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00002250 Mus_musculus Pro CGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTCGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00008475 Pan_troglodytes Pro CGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTCGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
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D00002252 Rattus_norvegicus Pro CGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTCGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00008261 Schizosaccharomyces_pombe Pro CGG -GGCCTAATAGTGTAGT--GGTT-AACATACCTCTTTCGGGTAGAGGTG-------------------ATCCCTGGTTCGAATCCTGGTTAGGCC----
D00008461 Takifugu_rubripes Pro CGG -GGCTCATTGGTCGAGG--GGA--AGGATCCTCGCCTCGGGTGCGAGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
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D00008178 Aeropyrum_pernix_K1 Pro TGG -GGGGCCGTCGTCTAGCCTGGCT-AGGATGCGGGGCTTGGGACCCCGTG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCGGCCCCACC-
D00002088 Archaeoglobus_fulgidus Pro TGG -GGGGCCGTAGGGTAGCCTGGTG-ATCCTCTCGGCTTTGGGAGCCGGTG-------------------A-CCCGAGTTCAAATCTCGGCGGCCCCA---
D00008181 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Pro TGG -GGGGCCGTAGGGTAGCCTGGTG-ATCCTCTCGGCTTTGGGAGCCGGTG-------------------A-CCCGAGTTCAAATCTCGGCGGCCCCA---
D00008184 Halobacterium_sp._NRC-1 Pro TGG -GGGACTGTAGGGTAGCTTGGT--ATCCTTCGGGCCTTGGGTGCCCGTG-------------------A-CCCCGATTCAAATTCGGGCGGTCCCA---
D00002090 Methanocaldococcus_jannaschii Pro TGG -GGGCCTGTGGGGTAGCCTGGTCTATCCTTTGGGATTTGGGATCCTGAG-------------------A-CCCCAGTTCAAATCTGGGCAGGCCCA---
D00008187 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Pro TGG -GGGCCTGTGGGGTAGCCTGGTCTATCCTTTGGGATTTGGGATCCTGAG-------------------A-CCCCAGTTCAAATCTGGGCAGGCCCACCA
D00011863 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Pro TGG -GGGCTTGTAGGGTAGCCTGGTCCATCCTTTGGGATTTGGGATCCTGAG-------------------A-CCCCAGTTCGAATCTGGGCAAGCCCACCA
D00008189 Methanococcus_maripaludis Pro TGG -GGGCCTGTGGGGTAGCCTGGTC-ATCCTTTGGGATTTGGGATCCTGAA-------------------A-CCCCAGTTCGAATCTGGGCAGGCCCACCA
D00002092 Methanococcus_vannielii Pro TGG -GGGCCTGTGGGGTAGCCTGGTCCATCCTTTGGGATTTGGGATCCTGAG-------------------A-CCCCAGTTCAAATCTGGGCAGGCCCACCA
D00002094 Methanococcus_voltae Pro TGG -GGGCCTGTGGGGTAGCCTGGTC-ATCCTTTGGGATTTGGGATCCTGAA-------------------A-CCCCAGTTCGAATCTGGGCAGGCCCACCA
D00008301 Methanopyrus_kandleri_AV19 Pro TGG -GGGGCCGTGGGGTAGCCTGGTCTATCCTTCCGGCTTTGGGGGCCGGAG-------------------A-CCCCGGTTCAAATCCGGGCGGCCCCACCA
D00011919 Methanosarcina_acetivorans_C2A Pro TGG -GGGATAGTAGGGTAGCTTGGTCCATCCTCGAGCGTTTGGGACGCTTGG-------------------A-CCGCGGTTCAAATCCGCGCTATCCCA---
D00008271 Methanosarcina_mazei_Go1 Pro TGG -GGGATAGTAGGGTAGCTTGGTCCATCCTCGAGCGTTTGGGACGCTTGG-------------------A-CCGCGGTTCAAATCCGCGCTATCCCA---
D00011968 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Pro TGG -GGGGTAATAGGGTAGCCTGGTCCATCCTAGAGCGTTTGGGACGCTTTG-------------------A-CCGCAGTTCAAATCTGCGTTACCCCA---
D00008185 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Pro TGG -GGGACCATAGGGTAGCTTGGTCGATCCTTTGGGCTTTGGGAGCCTGAG-------------------A-CCCCGGTTCAAATCCGGGTGGTCCCA---
D00002093 Methanothermus_fervidus Pro TGG -GGGGCCATAGGGTAGCCTGGTCTATCCTTTGGGCTTTGGGAGCCTGAG-------------------A-CCCCGGTTCAAATCCGGGTGGCCCCA---
D00011994 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Pro TGG -GGGCCCGTAGTCTAGCCTGGCT-AGGACGCCGGGTTTGGGTCCCGGAG-------------------GTCCGGGGTTCGAATCCCCGCGGGCCCA---
D00008192 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Pro TGG -GGGGCCGTAGTCTAGCCTGGT--AGGATGCGTGGCTTGGGCCCACGTG-------------------ATCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCCCA---
D00008195 Pyrococcus_abyssi_GE5 Pro TGG -GGGGCCGTAGGGTAGCTTGGTCTATCCTGCGGGCTTTGGGAGCCCGTG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCCCACC-
D00008198 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Pro TGG -GGGGCCGTAGGGTAGCTTGGCCCATCCTGCGGGCTTTGGGAGCCCGTG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCCCACC-
D00008201 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Pro TGG -GGGGCCGTAGGGTAGCTTGGCCCATCCTGCGGGCTTTGGGAGCCCGTG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCCCACCA
D00012099 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Pro TGG -GGGGCCGTAGTCTAGCTTGGACTAGGATGCCAGGCTTGGGCCCTGGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCCCA---
D00008204 Sulfolobus_solfataricus_P2 Pro TGG -GGGGCCGTAGTCTAGCCTGGACTAGGACGCCAGGCTTGGGCCCTGGTG-------------------ATCGCGGGTTCAAATCCCGCCGGCCCC----
D00008285 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Pro TGG -GGGGCCGTAGTCTAGCCTGGACTAGGACGCAAGGCTTGGGCCCTTGTG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGCCGGCCCCA---
D00002095 Thermococcus_celer Pro TGG -GGGGCCGTGGGGTAGCTTGGTCCATCCTGCGGGCTTTGGGAGCCCGTG-------------------A-CCCGGGTTCGAATCCCGGCGGCCCCACCA
D00008207 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Pro TGG -GGGGCCGTGGGGTAGCTTGGT--ATCCTACGGGCTTTGGGAGCCTGAG-------------------A-CTCCGGTCCAAATCCGGACGGCCCCA---
D00008210 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Pro TGG -GGGGCCGTGGGGTAGCTTGGT--ATCCTACGGGCTTTGGGAGCCTGAG-------------------A-CTCCGGTCCAAATCCGGACGGCCCCA---
D00008444 Acinetobacter_sp._ADP1 Pro TGG -CGGAGCATAGCACAGCCTGGT--AGTGCACCTGGTTTGGGACCAGGGG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTACTGCTCCGACCA
D00002118 Aeromonas_hydrophila Pro TGG -CGGTGATTAGCGCAGCCCGGT--AGCGCATCTGGTTTGGGACCAGAGG-------------------GTCAAAGGTTCGAATCCTTTATCACCGACCA
D00008169 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Pro TGG --GGAGTGTAGCGCAGTCTGGT--AGCGCATCTGGTTTGGGACCAGAGG-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCTCCACTCCGACCA
D00008136 Aquifex_aeolicus_VF5 Pro TGG -CGGGGCGTAGCTCAGGT-GGT--AGAGCGTCGGCTTTGGGAGCCGAAG-------------------GTCGCCGGTTCAAGTCCGGCCGCCCCGA---
D00008382 Bacillus_anthracis_str._Ames Pro TGG -CGGGAAGTGGCTCAGCTTGGT--AGAGCACCTGGTTTGGGACCAGGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCTTCCCGACCA
D00008383 Bacillus_anthracis_str._Ames Pro TGG -CGGGAAGTGGCTCAGCTTGGT--AGAGCACCTGGTTTGGGACCAGGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCTTCCCGA---
D00008403 Bacillus_anthracis_str._Sterne Pro TGG -CGGGAAGTGGCTCAGCTTGGT--AGAGCACCTGGTTTGGGACCAGGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCTTCCCGACCA
D00008404 Bacillus_anthracis_str._Sterne Pro TGG -CGGGAAGTGGCTCAGCTTGGT--AGAGCACCTGGTTTGGGACCAGGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCTTCCCGA---
D00008427 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Pro TGG -CGGGAAGTGGCTCAGCTTGGT--AGAGCACCTGGTTTGGGACCAGGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCTTCCCGACCA
D00008428 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Pro TGG -CGGGAAGTGGCTCAGCTTGGT--AGAGCACCTGGTTTGGGACCAGGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCTTCCCGA---
D00008354 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Pro TGG -CGGGAAGTGGCTCAGCTTGGT--AGAGCACCTGGTTTGGGACCAGGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCTTCCCGA---
D00008355 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Pro TGG -CGGGAAGTGGCTCAGCTTGGT--AGAGCACCTGGTTTGGGACCAGGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCTTCCCGACCA
D00008324 Bacillus_halodurans_C-125 Pro TGG -CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCTTCCCGACCA
D00002111 Bacillus_subtilis Pro TGG -CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGCACATGGTTTGGGACCATGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGACCA
D00008069 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Pro TGG -CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGCACATGGTTTGGGACCATGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGACCA
D00008445 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Pro TGG -CGGGAAGTGGCTCAGCTTGGT--AGAGCACCTGGTTTGGGACCAGGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCTTCCCGA---
D00008446 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Pro TGG -CGGGAAGTGGCTCAGCTTGGT--AGAGCACCTGGTTTGGGACCAGGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCTTCCCGACCA
D00008376 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Pro TGG -CGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTT-AGCGCACCTGCTTTGGGAGCAGGGG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCGCTACCCCGA---
D00008377 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Pro TGG -CGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTT-AGCGCACCTGCTTTGGGAGCAGGGG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCGCTACCCCGA---
D00008385 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Pro TGG -CGGAGCGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACCTGATTTGGGATCAGGGG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTATCGCTCCGACCA
D00008451 Bartonella_quintana_str._Toulouse Pro TGG -CGGAGCGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACCTGATTTGGGATCAGGGG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTATCGCTCCGACCA
D00008386 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Pro TGG -CGGGGAGTAGCGCAGTCTGGT--AGCGCATCTGGTTTGGGACCAGAGG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTATCTCCCCGACCA
D00008303 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Pro TGG -CGGGCTATAGCGCAGTTTGGT--AGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGAT-------------------GTCGTGGGTTCAAATCCCGCTAGCCCGA---
D00002104 Borrelia_burgdorferi Pro TGG -CGGGATGTGGCCTAGT--GGCT-AAGGCACCTGCTTTGGGAGCAGGGG-------------------ATCGTGAGTTCGAATCCCACCATCCCGA---
D00008105 Borrelia_burgdorferi_B31 Pro TGG -CGGGATGTGGCCTAGT--GGCT-AAGGCACCTGCTTTGGGAGCAGGGG-------------------ATCGTGAGTTCGAATCCCACCATCCCGA---
D00008405 Borrelia_garinii_PBi Pro TGG -CGGGATGTGGCCTAGT--GGCT-AAGGCACCTGCTTTGGGAGCAGGGG-------------------ATCGTGAGTTCGAATCCCACCATCCCGA---
D00008326 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Pro TGG -CGGGGTATAGCGCAGCCTGGT--AGCGCGGCAGTTTTGGGTACTGCAG-------------------GTCGTTGGTTCGAATCCAGCTGCCCCGACCA
D00008149 Brucella_melitensis_16M Pro TGG -CGGAGCGTAGCGCAGTCTGGT--AGCGCACCTGATTTGGGATCAGGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCCGCTCCGACCA
D00008307 Brucella_suis_1330 Pro TGG -CGGAGCGTAGCGCAGTCTGGT--AGCGCACCTGATTTGGGATCAGGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCCGCTCCGACCA
D00008070 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Pro TGG -CGGCGAATAGCGCAGCTTGGT--AGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTAG-------------------GTCAGAGGTTCAAATCCTCTTTCGCCGACCA
D00008356 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Pro TGG -CGGCGAGTAGCGCAGTTTGGT--AGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTAG-------------------GTCAGAGGTTCAAATCCTCTCTCGCCGA---
D00008272 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Pro TGG -CGGCGAATAGCGCAGCTTGGT--AGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGG-------------------GTCAGGGGTTCAAATCCTCTTTCGCCGACCA
D00008106 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Pro TGG -CGGGGTGTAGCGCAGTCTGGTT-AGCGCACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GCCGAAGGTTCGAATCCTTTCACCCCGACCA
D00008452 Candidatus_Blochmannia_floridanus Pro TGG -CGGCGAGTGGCGCAGTTTGGT--AGCGTGGCTGGTTTGGGACCAGTAG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGA---
D00008395 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Pro TGG -CGGAGTATAGCGCAGCTTGGCT-AGCGCGGCTGCTTTGGGAGCAGTAG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTACTCCGA---
D00008109 Caulobacter_crescentus_CB15 Pro TGG -CGGAGCGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCATCTGTTTTGGGAGCAGAGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGCCGCTCCGACCA
D00008140 Chlamydia_muridarum_Nigg Pro TGG -CGGAGTATAGCGCAGCCTGGTT-AGCGCGGTTGCTTTGGGAGCAATAG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTACTCCGA---
D00008068 Chlamydia_trachomatis Pro TGG -CGGAGTATAGCGCAGCTTGGTT-AGCGCGGTTGCTTTGGGAGCAATAG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTACTCCG----
D00008066 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Pro TGG -CGGAGTATAGCGCAGCCTGGTT-AGCGCGGTTGCTTTGGGAGCAATAG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTACTCCGA---
D00008062 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Pro TGG -CGGAGTATAGCGCAGCTTGGTT-AGCGCGGTTGCTTTGGGAGCAATAG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTACTCCGA---
D00008064 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Pro TGG -CGGAGTATAGCGCAGCTTGGTT-AGCGCGGTTGCTTTGGGAGCAATAG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTACTCCGA---
D00008089 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Pro TGG -CGGAGTATAGCGCAGCTTGGTT-AGCGCGGTTGCTTTGGGAGCAATAG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTACTCCGA---
D00008265 Chlorobium_tepidum_TLS Pro TGG -CGGGGCATGGCGCAGCT-GGT--AGCGTGCCTGCTTTGGGAGCAGGAG-------------------GTCCCGAGTTCGAGTCTCGGTGCCCCGACCA
D00008145 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Pro TGG -CGGGGTGTGGCGCAGAT-GGG--AGCGCGCGTGGTTTGGGACCATGAG-------------------GTCGCAGGTTCAATCCCTGTCACCCCGACCA
D00008139 Clostridium_perfringens_str._13 Pro TGG -CGGGGTGTGGCGCAGAT-GGG--AGCGCGCGTGGTTTGGGACCATGAG-------------------GTCGCAGGTTCGATCCCTGTCACCCCGACCA
D00008329 Clostridium_tetani_E88 Pro TGG -CGGGGTGTGGCGCAGAT-GGG--AGCGCGCGTGGTTTGGGACCATGAG-------------------GTCGCAGGTTCAAGCCCTGTCACCCCGACCA
D00008390 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Pro TGG -CGGGACGTGGCGCAGTTTGGT--AGCGCACCTGCTTTGGGAGCAGGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCGTCCCGA---
D00008309 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Pro TGG -CGGGGCGTGGCGCAGTTTGGT--AGCGCACCTGCTTTGGGAGCAGGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCGCCCCGA---
D00008276 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Pro TGG -CGGGGCGTGGCGCAGCTTGGT--AGCGCACCTGCTTTGGGAGCAGGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCGCCCCGA---
D00008112 Deinococcus_radiodurans_R1 Pro TGG -CGGGAAGTAGCGCAGGCCGGT--AGCGCACCTGGTTTGGGACCAGGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGACCA
D00008429 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Pro TGG -CGGAACGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACCTGCCTTGGGAGCAGGGG-------------------GTCGCTGGTTCGAATCCAGTCGTTCCGACCA
D00008330 Enterococcus_faecalis_V583 Pro TGG -CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGA---
D00002113 Escherichia_coli Pro TGG -CGGCGAGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCA
D00008359 Escherichia_coli_CFT073 Pro TGG -CGGCGAGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCA
D00008092 Escherichia_coli_K12 Pro TGG -CGGCGAGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCA
D00008095 Escherichia_coli_O157:H7 Pro TGG -CGGCGAGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCA
D00008096 Escherichia_coli_O157:H7 Pro TGG -CGGCGAGTAGCGCACTT-GGT--AGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCA
D00008099 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Pro TGG -CGGCGAGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCA
D00008267 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Pro TGG -CGGAATATAGCGCAGCCCGGT--AGCGCACCTGCCTTGGGAGCAGGGG-------------------GTCGCAAGTTCAAATCTTGCTATTCCGACCA
D00008268 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Pro TGG -CGGAATATAGCGCAGCCCGGT--AGCGCACCTGCCTTGGGAGCAGGGG-------------------GCCGCAAGTTCAAATCTTGCTATTCCGACCA
D00008408 Geobacter_sulfurreducens_PCA Pro TGG -CGGGGTGTAGCGCAGCCTGGCT-AGCGCACCTGCCTTGGGAGCAGGGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTCACCCCGACCA
D00002120 Haemophilus_influenzae Pro TGG -CGGCGAGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTATCTCGCCGACCA
D00008104 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Pro TGG -CGGCGAGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTATCTCGCCGACCA
D00008345 Helicobacter_hepaticus_ATCC_51449 Pro TGG -CGGGGCGTAGCGCAGTCTGGTT-AGCGCACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GTCGAAGGTTCGAATCCTTTCGCCCCGACCA
D00002110 Helicobacter_pylori Pro TGG -CGGGGCGTAGCGCAGTCTGGTT-AGCGCACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GTCGAAGGTTCGAATCCTTTCGCCCCGACCA
D00008101 Helicobacter_pylori_26695 Pro TGG -CGGGGCGTAGCGCAGTCTGGTT-AGCGCACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GTCGAAGGTTCGAATCCTTTCGCCCCGACCA
D00008103 Helicobacter_pylori_J99 Pro TGG -CGGGGCGTAGCGCAGTCTGGTT-AGCGCACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GTCGAAGGTTCGAATCCTTTCGCCCCGACCA
D00002108 Lactobacillus_delbrueckii_subsp._bulgaricus Pro TGG -CGGGAAGTGGCTCAGTTTGGT--AGAGCACCTGGTTTGGGACCAGGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCTTCCCGA---
D00008410 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Pro TGG -CGGGAAGTGGCTCAGTTTGGT--AGAGCACCTGGTTTGGGACCAGGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGA---
D00008331 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Pro TGG -CGGGAAATAGCTCAGCTTGGT--AGAGCACCTGGTTTGGGACCAGGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTTTTCCCGA---
D00008413 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Pro TGG -CGGGGCGTAGCTCAGCTTGGCT-AGAGCGCCCGCTTTGGGAGCGGGAG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCGCCCCGA---
D00008311 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Pro TGG -CGGGATGTAGCGCAGG--GGT--AGCGCATCTGCCTTGGGAGCAGAGG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTATCATCCCGA---
D00008137 Listeria_innocua_Clip11262 Pro TGG -CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGA---
D00008138 Listeria_monocytogenes_EGD-e Pro TGG -CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGA---
D00008432 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Pro TGG -CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGA---
D00008433 Mesoplasma_florum_L1 Pro TGG -CGGGAAGTGGCTCAGCTTGGT--AGAGCATTCGGTTTGGGACCGAAGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGACCA
D00008152 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Pro TGG -CGGAGTGTAGCGCAGGCTGGT--AGCGCATCTGGTTTGGGACCAGAGG-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCTCCACTCCGACCA
D00008348 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Pro TGG -CGGGGTGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCATCCGCTTTGGGAGCGGAAG-------------------GCCGCAGGTTCAAATCCTGTCACCCCGACCA
D00008086 Mycobacterium_leprae_TN Pro TGG -CGGGGTGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCATCCGCTTTGGGAGCGGAAG-------------------GCCGCAGGTTCAAATCCTGTCACCCCGACCA
D00008073 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Pro TGG -CGGGGTGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCATCCGCTTTGGGAGCGGAAG-------------------GCCGCAGGTTCAAATCCTGTCACCCCGACCA
D00008393 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Pro TGG -CGGGGTGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCATCCGCTTTGGGAGCGGAAG-------------------GCCGCAGGTTCAAATCCTGTCACCCCGACCA
D00002096 Mycoplasma_capricolum Pro TGG -CGGGAAGTGGCTCAGTTTGGT--AGAGCATTCGGTTTGGGACCGAAGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCTTCCCGACCA
D00008344 Mycoplasma_gallisepticum_R Pro TGG -CGGGAAGTAGCTTAGCTTGGT--AGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCTTCCCGACCA
D00002097 Mycoplasma_genitalium Pro TGG -CGGGAAGTAGCTTAGTTTGGT--AGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCTTCCCGACCA
D00008113 Mycoplasma_genitalium_G37 Pro TGG -CGGGAAGTAGCTTAGTTTGGT--AGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCTTCCCGACCA
D00002098 Mycoplasma_mycoides Pro TGG -CGGGAAGTGGCTCAGTTTGGT--AGAGCATTCGGTTTGGGACCGAAGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCTTCCCGACCA
D00002099 Mycoplasma_pneumoniae Pro TGG -CGGGAAGTAGCTTAGTTTGGTA-GAAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCTTCCCGACCA
D00008114 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Pro TGG -CGGGAAGTAGCTTAGTTTGGT--AGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCTTCCCGACCA
D00008166 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Pro TGG -GGAGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGTG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCTTCTTCACCA
D00008076 Neisseria_meningitidis_MC58 Pro TGG -CGGGGCGTAGCGCAGCCCGGTT-AGCGCATCTGCTTTGGGAGCAGAGG-------------------GTCGTGAGTTCGAATCCCACCGCCCCGACCA
D00008079 Neisseria_meningitidis_Z2491 Pro TGG -CGGGGCGTAGCGCAGCCCGGTT-AGCGCATCTGCTTTGGGAGCAGAGG-------------------GTCGTGAGTTCGAATCCCACCGCCCCGACCA
D00008374 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Pro TGG -CGGGGTGTAGCGTAGCCTGGT--AGCGCGCCTGGTTTGGGACCAGGAT-------------------GTCGGGAGTTCAAATCTCTCCACCCCGACCA
D00008162 Nostoc_sp._PCC_7120 Pro TGG -CGGGATGTAATTCAGT--GGTCTAGAAGCCTTGTTTTGGGGACAAGGA-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTACCATCCCGACCA
D00008163 Nostoc_sp._PCC_7120 Pro TGG -CGGGATGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGAT-------------------GCCGCAGGTTCAAATCCTGTCATCCCGA---
D00008313 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Pro TGG -CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGACCA
D00008391 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M Pro TGG -CGGGAAGTAGCTTAGCTTGGT--ATAGCGCCTGGTTTGGGACCAGGAG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCTGCCTTCCCGACCA
D00008115 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Pro TGG -CGGCGAGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGG-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTATCTCGCCGACCA
D00002117 Photobacterium_phosphoreum Pro TGG -CGGTGAATAGCGCAGTTTGGT--AGCGCATCTGGTTTGGGACCAGAGG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTTCACCGACCA
D00008397 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Pro TGG -CGGCGAGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCA
D00008414 Porphyromonas_gingivalis_W83 Pro TGG -CGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTT-AGCGCACCTGCTTTGGGAGCAGGGG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCGCTACCCCGA---
D00008435 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Pro TGG -CGGGGCGTAGCGTAGT--GGCT-AGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGAG-------------------ATCGCAGGTTCGAGTCCTGTCGCCCCGACCA
D00008121 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Pro TGG -CGGGGTATAGCGCAGTCCGGT--AGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGAT-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCTCTACCCCGACCA
D00008380 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Pro TGG -CGGGGTATAGCGCAGTCCGGT--AGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGAT-------------------GTCAGGAGTTCGAATCCCCTTACCCCGACCA
D00008159 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Pro TGG -CGGGGCGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCATCTGATTTGGGATCAGAGG-------------------GTCGCATGTTCGAATCATGTCGCCCCGACCA
D00008368 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Pro TGG -CGGATACAGGTGCAGAT-GGA--AGCACGTCCGCTTTGGGAGCGGAAG-------------------GGTCTCGGTTCGACTCCGAGGTGTCCGA---
D00008370 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Pro TGG -CGGGGCGTAGCTCAGCCTGGC--AGAGCGTCTGGTTTGGGACCAGAAG-------------------GTCGCACGTTCGAATCGTGTCGCCCCGA---
D00008371 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Pro TGG -CGGATACAGGTGCAGAT-GGA--AGCACGCCTGGTTTGGGACCAGGAG-------------------GGTCTCGGTTCGACTCCGAGGTGTCCGA---
D00008400 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Pro TGG -CGGGGTATAGCGCAGCCTGGT--AGCGCGGCAGTTTTGGGTACTGCAG-------------------GTCGTTGGTTCGAATCCAGCTGCCCCGACCA
D00008147 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Pro TGG -CGGGGCGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCATCTGGTTTGGGACCAGAGG-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCTCCGCCCCGACCA
D00008273 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Pro TGG -CGGGGCGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCATCTGGTTTGGGACCAGAGG-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCTCCGCCCCGACCA
D00008417 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Pro TGG -CGGGGCGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCATCTGGTTTGGGACCAGAGG-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCTCCGCCCCGACCA
D00008171 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Pro TGG -CGGCGAGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCA
D00008366 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Pro TGG -CGGCGAGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCA
D00002116 Salmonella_typhimurium Pro TGG -CGGCGAGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCA
D00008158 Salmonella_typhimurium_LT2 Pro TGG -CGGCGAGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCA
D00008318 Shewanella_oneidensis_MR-1 Pro TGG -CGGTGATTAGCGCAGTCCGGT--AGCGCATCTGGTTTGGGACCAGAGG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTATCACCGACCA
D00008319 Shigella_flexneri_2a_str._301 Pro TGG -CGGCGAGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCA
D00008175 Sinorhizobium_meliloti_1021 Pro TGG -CGGAGTGTAGCGCAGTCTGGT--AGCGCATCTGGTTTGGGACCAGAGG-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCTCCACTCCGACCA
D00002100 Spiroplasma_melliferum Pro TGG -CGGAAAGTAGCTTAGCTTGGT--AGAGCACTCGGTTTGGGACCGAGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTTCCGACCA
D00002107 Staphylococcus_aureus Pro TGG -CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGA---
D00008402 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Pro TGG -CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGA---
D00008277 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Pro TGG -CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGA---
D00008083 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Pro TGG -CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGA---
D00008333 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Pro TGG -CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGA---
D00008334 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Pro TGG -CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GCCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGA---
D00008322 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Pro TGG -CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGTACTTGGTTTGGGACCAAGGT-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGA---
D00008278 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Pro TGG -CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGTACTTGGTTTGGGACCAAGGT-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGA---
D00002121 Streptococcus_mutans Pro TGG -CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGTACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGA---
D00008323 Streptococcus_mutans_UA159 Pro TGG -CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGTACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGA---
D00008143 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Pro TGG -CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGTACTTGGTTTGGGACCAAGGT-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGA---
D00008144 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Pro TGG -CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGTGCTTGGTTTGGGACCAAGGT-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGA---
D00008142 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Pro TGG -CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGTACTTGGTTTGGGACCAAGGT-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGA---
D00008279 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Pro TGG -CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGTACTTGGTTTGGGACCAAGGT-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGA---
D00008350 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Pro TGG -CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGTACTTGGTTTGGGACCAAGGT-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGA---
D00008363 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Pro TGG -CGGGGTGTGGCGCAGCTTGGT--AGCGCGTCCGCTTTGGGAGCGGAAG-------------------GCCGTGGGTTCAAATCCCGCCACCCCGACCA
D00008316 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Pro TGG -CGGGGTGTGGCGCAGCTTGGT--AGCGCGTCCGCTTTGGGAGCGGAAG-------------------GCCGTGGGTTCAAATCCCGCCACCCCGACCA
D00008418 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Pro TGG -CGGGGTGTGGCGCAGTCTGGT--AGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGAT-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCACCCCGACCA
D00002124 Synechocystis_sp. Pro TGG -CGGGATGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGAT-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCATCCCGA---
D00008124 Synechocystis_sp._PCC_6803 Pro TGG -CGGGATGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGAT-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCATCCCGA---
D00008286 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Pro TGG -CGGGATGTAGCGCAGCT-GGT--AGCGCACGTGCTTTGGGAGCATGGG-------------------GTCGGGGGTTCAAGTCCCCCCATCCCGACCA
D00008280 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Pro TGG -CGGGATGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCATCTGCTTTGGGAGCAGAGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCATCCCGA---
D00008127 Thermotoga_maritima_MSB8 Pro TGG -CGGGGCGTAGCGCAGGT-GGCT-AGCGCGCCTGCCTTGGGAGCAGGAG-------------------GTCGCTGGTTCAAGTCCAGTCGCCCCGACCA
D00008437 Thermus_thermophilus_HB27 Pro TGG -CGGGGCGTAGCGCAGGCCGGT--AGCGCACCTGCTTTGGGAGCAGGGG-------------------GTCGCCCGTTCAAATCGGGCCGCCCCGACCA
D00008441 Treponema_denticola_ATCC_35405 Pro TGG -CGGGATGTAGCCTAGG--GGCT-AAGGCGTCTGGTTTGGGACCAGAAG-------------------ATCGGGGGTTCAAATCCCTCCATCCCGA---
D00002102 Treponema_pallidum Pro TGG -CGGGACGTGGCCTAGG--GGCT-AGGGCACCCGGTTTGGGACCGGAAG-------------------ATCGAGGGTTCAAATCCCTCCGTCCCGA---
D00008118 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Pro TGG -CGGGACGTGGCCTAGG--GGCT-AGGGCACCCGGTTTGGGACCGGAAG-------------------ATCGAGGGTTCAAATCCCTCCGTCCCGA---
D00008336 Tropheryma_whipplei_str._Twist Pro TGG -CGGGGTGTAGCTCAGTTTGGT--AGAGCGCCCGCTTTGGGAGCGGGAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCGCCCCGA---
D00008339 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Pro TGG -CGGGGTGTAGCTCAGTTTGGT--AGAGCGCCCGCTTTGGGAGCGGGAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCGCCCCGA---
D00008087 Ureaplasma_parvum_serovar_3 Pro TGG -CGGGAAGTAGCACAGCTTGGT--AGTGCACTTGGTTTGGGACCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGACCA
D00008081 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Pro TGG -CGGTGAATAGCGCAGTTTGGT--AGCGCATCTGGTTTGGGACCAGAGG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTTCACCGACCA
D00008082 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Pro TGG -CGGTGAATAGCGCAGTTTGGT--ARCGCATCTGGTTTGGGACCAGAGG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTTCACCGACCA
D00008443 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Pro TGG -CGGGGCGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCATTTGGTTTGGGACCAAAGG-------------------GTCGGGAGTTCAAATCTCTCCGCCCCGA---
D00008292 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Pro TGG -CGGGGTATAGCGCAGTCTGGT--AGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGAT-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTACCCCGACCA
D00008289 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Pro TGG -CGGGGTATAGCGCAGTCTGGT--AGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGAT-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTACCCCGACCA
D00008130 Xylella_fastidiosa_9a5c Pro TGG -CGGGGTATAGCGCAGTCTGGC--AGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGAT-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTACCCCGACCA
D00008133 Xylella_fastidiosa_9a5c Pro TGG -CGGCGAGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCA
D00008343 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Pro TGG -CGGGGTATAGCGCAGTCTGGT--AGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGAT-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTACCCCGACCA
D00008422 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Pro TGG -CGGCGAGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCA
D00008155 Yersinia_pestis_CO92 Pro TGG -CGGCGAGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCA
D00008298 Yersinia_pestis_KIM Pro TGG -CGGCGAGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCA
D00008423 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Pro TGG -CGGCGAGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCA
D00008227 Arabidopsis_thaliana Pro TGG -CGAGGTGTAGCGCAGTCTGGTC-AGCGCATCTGTTTTGGGTACAGAGG-------------------GCCATAGGTTCGAATCCTGTCACCTTGA---
D00008228 Arabidopsis_thaliana Pro TGG -CAGCATTTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCAAGAG-------------------GTCCCGAGTTCGATTCTCGGAATGCCC----
D00008229 Arabidopsis_thaliana Pro TGG -GGGCATTTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGAGTTCGATTCTCGCAATGCCCC---
D00008230 Arabidopsis_thaliana Pro TGG -GGGCATTTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGAGTTCGATTCTCGGAATGCCCC---
D00008231 Arabidopsis_thaliana Pro TGG -GGGCGTTTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGAGTTCGATTCTCGGAACGCCCC---
D00002245 Caenorhabditis_elegans Pro TGG -GGCCGAATGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAATCCCCGGTTCGGCCC---
D00008237 Caenorhabditis_elegans Pro TGG -GGCCGAATGGTCTAGT--GGT--TTGATTCTCGCTTTGGGTGCGACAA-------------------G-TCCCGGTTCAATCCCCGGTTCGGCC----
D00008238 Caenorhabditis_elegans Pro TGG -GGCCGAATGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAATCCCCAGTTCGGCCC---
D00008239 Caenorhabditis_elegans Pro TGG -GGCCGAATGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCTGGTTCAATCCCCGGTTCGGCCC---
D00008240 Caenorhabditis_elegans Pro TGG -GGCCGAATGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTGAATCCCCGGTTCGGCCC---
D00008241 Caenorhabditis_elegans Pro TGG -GGCCGAATGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGCGTTCAATCCCCGGTTCGGCCC---
D00008242 Caenorhabditis_elegans Pro TGG -GGCCGAATGGTCTATT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAATCCCCGGTTCGGCCC---
D00008243 Caenorhabditis_elegans Pro TGG -GGCCCAATGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAATCCCCGGTTCGGCCC---
D00008244 Caenorhabditis_elegans Pro TGG -GGCCGAATGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAATCCCCGGCTCGGCCC---
D00008245 Caenorhabditis_elegans Pro TGG -GGCCGAATGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAATCCCCGGTTCGGCCC---
D00008246 Caenorhabditis_elegans Pro TGG -GGGCGTGTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GCCCTGGGTTCAATTCCCAGCTCGCCCC---
D00008425 Candida_glabrata_CBS_138 Pro TGG -GGGCGTGTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGATGCGAGAG-------------------GCCCTGGGTTCAATTCCCAGCTCGCCCC---
D00002247 Drosophila_melanogaster Pro TGG -GGCTCAATGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGTTGAGCCC---
D00008259 Drosophila_melanogaster Pro TGG -GGCTCAATGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGTTGAGCCC---
D00008296 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Pro TGG -GGCTCGGTGGTCTAAG--GGT--ATGATCTCCGCTTTGGGTGCGGAGG-------------------GCTCCAGGTTCAAATCCTGGCCGAGCCC---
D00008456 Gallus_gallus Pro TGG -CGAGGTGTAGCGCAGTCTGGTC-AGCGCATCTGTTTTGGGTACAGAGG-------------------GCCATAGGTTCGAATCCTGTCACCTTGA---
D00008457 Gallus_gallus Pro TGG -GGCTTGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACAAGCCC---
D00008458 Gallus_gallus Pro TGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00002255 Homo_sapiens Pro TGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00008216 Homo_sapiens Pro TGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00008217 Homo_sapiens Pro TGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGGTTTGGGTCCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00008218 Homo_sapiens Pro TGG -GGCTCGTTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00008477 Pan_troglodytes Pro TGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGAGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00008478 Pan_troglodytes Pro TGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00008479 Pan_troglodytes Pro TGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGGTTTGGGTCCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00008480 Pan_troglodytes Pro TGG -GGCTCGTTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00002243 Phaseolus_vulgaris Pro TGG -GGGCATTTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGAGTTCGATTCTCGGAATGCCCC---
D00002239 Plasmodium_falciparum Pro TGG -CAGAATATAGTGTAAT--GGT--AACATATCTATTTTGGGAATAGAAG-------------------AATATAGGTTCAAATCCTATTTTTCTGA---
D00008449 Plasmodium_falciparum_3D7 Pro TGG -GGCTACTTAGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAATTCCCGGAGTAGCCC---
D00002240 Saccharomyces_cerevisiae Pro TGG -GGGCGTGTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GCCCTGGGTTCAATTCCCAGCTCGCCCC---
D00002241 Saccharomyces_cerevisiae Pro TGG -GGGCGTGTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGCGCGAGAG-------------------GCCCTGGGTTCAATTCCCAGCTCGCCCC---
D00008248 Saccharomyces_cerevisiae Pro TGG -GGGCGTGTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GCCCTGGGTTCAATTCCCAGCTCGCCCC---
D00008249 Saccharomyces_cerevisiae Pro TGG -GGGCGTGTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GCCCTGGGTTCAATTCCCAGCTCGCCCC---
D00008250 Saccharomyces_cerevisiae Pro TGG -GGGCGTGTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GCCCTGGGTTCAATTCCCAGCTCGCCCC---
D00008251 Saccharomyces_cerevisiae Pro TGG -GGGCGTGTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GCCCTGGGTTCAATTCCCAGCTCGCCCC---
D00008252 Saccharomyces_cerevisiae Pro TGG -GGGCGTGTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GCCCTGGGTTCAATTCCCAGCTCGCCCC---
D00008253 Saccharomyces_cerevisiae Pro TGG -GGGCGTGTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GCCCTGGGTTCAATTCCCAGCTCGCCCC---
D00008254 Saccharomyces_cerevisiae Pro TGG -GGGCGTGTGGTCTAGT--GGA--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GCCCTGGGTTCAATTCCCAGCTCGCCCC---
D00008262 Schizosaccharomyces_pombe Pro TGG -GGTTTCGTGGTGTAGT--GGT--AGCATACTTCGTTTGGGTCGAAGTG-------------------GTCACGGGTTCAATCCCCGTCGAAACC----
D00008263 Schizosaccharomyces_pombe Pro TGG -GGCTTCGTGGTGTAGT--GGT--AGCATACTTCGTTTGGGTCGAAGTG-------------------GTCAGGGGTTCGATCCCCCTCGAAGCC----
D00008465 Takifugu_rubripes Pro TGG -GGCTTGTTGGTCTAGG--AGT--ATGATTCTCGCTTTGGTTGCAAGAG-------------------ATGCCGAGTTCAAATCCCGGATGAGCCC---
D00008466 Takifugu_rubripes Pro TGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--AGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00008467 Takifugu_rubripes Pro TGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTTGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00008177 Aeropyrum_pernix_K1 Pro GGG -GGGGCCGTCGTCTAGCCTGGCT-AGGATGCCAGCCTGGGGCGCTGGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCCCACC-
D00002089 Archaeoglobus_fulgidus Pro GGG -GGGGCCGTGGGGTAGCCTGGT--AGCCTCTCGGCCTGGGGCGCCGGTG-------------------A-CCCGAGTTCAAATCTCGGCGGCCCCA---
D00008180 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Pro GGG -GGGGCCGTGGGGTAGCCTGGT--AGCCTCTCGGCCTGGGGCGCCGGTG-------------------A-CCCGAGTTCAAATCTCGGCGGCCCCA---
D00008183 Halobacterium_sp._NRC-1 Pro GGG -GGGACCGTGGGGTAGC--GGT--ATCCTCGGCGCATGGGGTGCGTCGG-------------------A-CTCGAGTTCGAATCTCGACGGTCCCA---
D00002091 Methanocaldococcus_jannaschii Pro GGG -GGGGCCGTGGGGTAGCCTGGAT-ATCCTGTGCGCTTGGGGGGCGTGCG-------------------A-CCCGGGTTCAAGTCCCGGCGGCCCCA---
D00008186 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Pro GGG -GGGGCCGTGGGGTAGCCTGGAT-ATCCTGTGCGCTTGGGGGGCGTGCG-------------------A-CCCGGGTTCAAGTCCCGGCGGCCCCACC-
D00011872 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Pro GGG -GGGACTGTGGGGTAGCTTGGTCCATCCTGTGCGTCTGGGGGGCGTGCA-------------------A-CCTGAGTTCGAATCTCAGCAGTCCCACCA
D00008188 Methanococcus_maripaludis Pro GGG -GGGGCCGTGGGGTAGCCTGGCC-ATCCTGTGCGTCTGGGGGGCGTGCA-------------------A-CCCGAGTTCGAATCTCGGCGGCCCC----
D00008300 Methanopyrus_kandleri_AV19 Pro GGG -GGGGCCGTGGGGTAGCCTGGTCTATCCTCCGCGGCTGGGGACCGCGGG-------------------A-CCCCGGTTCAAATCCGGGCGGCCCCA---
D00011922 Methanosarcina_acetivorans_C2A Pro GGG -GGGGCCGTAGGGTAGCTTGGTCCATCCTGCAAGGCTGGGGGTCTTGCG-------------------A-CTTGAGTTCGAATCTCAGCGGCCCCACCA
D00008270 Methanosarcina_mazei_Go1 Pro GGG -GGGGCCGTAGGGTAGCTTGGTCCATCCTGCAAGACTGGGGGTCTTGCG-------------------A-CTTGAGTTCGAATCTCAACGGCCCCACCA
D00011967 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Pro GGG -GGGGCCATAGGGTAGCCTGGC--ATCCTAGGAGACTGGGGGTCTTCTG-------------------A-CTCGAGTTCGAATCTCGATGGCCCCA---
D00012005 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Pro GGG -GGGGCCGTGGCCCAGCTTGGT--AGGGCGCCGGCCTGGGGCGCCGGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCCCA---
D00008191 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Pro GGG -GGGGCCGTAGTCTAGCCTGGCT-AGGATGCCGGCCTGGGGCGCCGGTG-------------------ATCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCCCA---
D00008194 Pyrococcus_abyssi_GE5 Pro GGG -GGGGCCGTGGGGTAGCTTGGCT-ATCCTCCCGGCCTGGGGCGCCGGTG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCCCACC-
D00008197 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Pro GGG -GGGGCCGTGGGGTAGCTTGGCT-ATCCTCCCGGCCTGGGGCGCCGGAG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCCCACC-
D00008200 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Pro GGG -GGGGCCGTGGGGTAGCTTGGCT-ATCCTCCCGGCCTGGGGCGCCGGAG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCCCACCA
D00012044 Staphylothermus_marinus_F1 Pro GGG -GGGGCCGTAGTCTAGCCTGGCT-AGGATGCCGGCCTGGGGCGCCGGTG-------------------ATCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCCCA---
D00012067 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Pro GGG -GGGGCCGTAGTCTAGCTTGGACTAGGATGCCAGCCTGGGGCGCTGGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCCCA---
D00008203 Sulfolobus_solfataricus_P2 Pro GGG -GGGGCCGTAGTCTAGCTTGGACTAGGATGCCAGCCTGGGGCGCTGGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCCC----
D00008284 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Pro GGG -GGGACCGTCGTCTAGCCTGGACTAGGATGCAGGCCTGGGGCGCCTGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGTCCCA---
D00008206 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Pro GGG -GGGGCCGTGGGGTAGCTTGGT--ATCCTGCCAGCTTGGGGTGCTGGTG-------------------A-CTTGAGTTCAATTCTCAACGGCCCCA---
D00008209 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Pro GGG -GGGGCCGTGGGGTAGCTTGGT--ATCCTGCCAGCTTGGGGTGCTGGTG-------------------A-CTTGAGTTCAATTCTCAACGGCCCCA---
D00008168 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Pro GGG -CGGAGCGTAGCGCAGCCCGGT--AGCGCACTTGACTGGGGGTCAAGGG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCGCCGCTCCGACCA
D00008135 Aquifex_aeolicus_VF5 Pro GGG -CGGGGTGTAGCGCAGGT-GGT--AGCGCGCTGGCATGGGGGGCCAGAG-------------------GTCGCCGGTTCGAGTCCGGTCACCCCGACCA
D00002112 Bacillus_circulans Pro GGG -CGGGGTATGGCGCAGTCTGGT--AGCGCGCACCCTTGGGGTGGGTGAG-------------------GCCGTGGGTTCAAATCCCGCTACTCCGACCA
D00008379 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Pro GGG -CGGGATGTAGCTCAGCCCGGT--AGAGTACGCGTCTGGGGGGCGTGTG-------------------GTCGCAAGTTCGAATCTTGTCATCCCGA---
D00008384 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Pro GGG -CGGAGCGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACTTGACTGGGGGTCAAGGG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCGCCGCTCCGACCA
D00008450 Bartonella_quintana_str._Toulouse Pro GGG -CGGAGCGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACTTGACTGGGGGTCAAGGG-------------------GTCGTGGGTTCAAATCCCGCCGCTCCGACCA
D00008387 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Pro GGG -CTGCGCGTGGCTCAGCTTGGT--AGAGCACTTGCTTGGGGTGCAAGAG-------------------GTCGCTGGTTCAAATCCAGTCGCGCAGACCA
D00008304 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Pro GGG -CGGGCCGTAGCGCAGTTTGGT--AGCGCACTTGACTGGGGGTCAAGGG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGCCGGCCCGA---
D00008327 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Pro GGG -CGGAGCGTGGCGCAGCCCGGTT-AGCGCACTAGTCTGGGAGACTAGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAATCCTCTCGCTCCGACCA
D00008148 Brucella_melitensis_16M Pro GGG -CGGAGCGTAGCGCAGCCCGGT--AGCGCACTTGACTGGGGGTCAAGGG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCGCCGCTCCGACCA
D00008305 Brucella_suis_1330 Pro GGG -CGGAGCGTAGCGCAGCCCGGT--AGCGCACTTGACTGGGGGTCAAGGG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCGCCGCTCCGACCA
D00008396 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Pro GGG -CTGGGTGTAGCGCAGCTTGGCT-AGCGCACTTGCATGGGGTGCAAGGG-------------------GTCGGAAGTTCAAATCTTCTCACCCAGA---
D00008108 Caulobacter_crescentus_CB15 Pro GGG -CGGAGCGTGGCGCAGCCTGGT--AGCGCACTTGACTGGGGGTCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCGCTCCGACCA
D00008141 Chlamydia_muridarum_Nigg Pro GGG -CTGGATGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACTTGCATGGGGTGCAAGGG-------------------GGCGGAGGTTCAAATCCTCTCATCCAGA---
D00008067 Chlamydia_trachomatis Pro GGG -CTGGGTGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACTTGCATGGGGTGCAAGGG-------------------GGCGGAGGTTCAAATCCTCTCATCCAG----
D00008065 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Pro GGG -CTGGATGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACTTGCATGGGGTGCAAGGG-------------------GGCGGAGGTTCAAATCCTCTCATCCAGA---
D00008061 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Pro GGG -CTGGGTGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACTTGCATGGGGTGCAAGGG-------------------GGCGGAGGTTCAAATCCTCTCATCCAGA---
D00008063 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Pro GGG -CTGGGTGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACTTGCATGGGGTGCAAGGG-------------------GGCGGAGGTTCAAATCCTCTCATCCAGA---
D00008088 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Pro GGG -CTGGGTGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACTTGCATGGGGTGCAAGGG-------------------GGCGGAGGTTCAAATCCTCTCATCCAGA---
D00008264 Chlorobium_tepidum_TLS Pro GGG -CGGCGTATAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACTACCTTGGGGTGGTAGGG-------------------GTCGTGGGTTCAAATCCCGCTACGCCGA---
D00008328 Clostridium_tetani_E88 Pro GGG -CTGGGTATAGCGCAGAT-GGT--AGCGCGCATGCATGGGGTGCATGAG-------------------GTCGCAGGTTCAAGTCCTGTTACTCAGACCA
D00008389 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Pro GGG -CGGACTATGGCGCAGCTTGGT--AGCGCACTTGACTGGGGGTCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTTAGTCCGA---
D00008310 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Pro GGG -CGGACTGTGGCGCAGCTTGGT--AGCGCACTACACTGGGGGTGTAGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCAGTCCGA---
D00008275 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Pro GGG -CGGACTATGGCGCAGCTTGGT--AGCGCACTACACTGGGGGTGTAGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTTAGTCCGA---
D00008352 Coxiella_burnetii_RSA_493 Pro GGG -CGGGGTATAGCGCAGTCTGGT--AGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGAT-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCTCTACCCCGA---
D00008353 Coxiella_burnetii_RSA_493 Pro GGG -CGGGGCGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACTTGCATGGGGTGCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGCCGTCCCGA---
D00008111 Deinococcus_radiodurans_R1 Pro GGG -CGAGGCGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACTACCTTGGGGTGGTAGGG-------------------GTCGTGAGTTCAAATCTCGCCGCCTCGACCA
D00008431 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Pro GGG -CGGGATGTAGCGCAGCCTGGG--AGCGCACTTGAATGGGGTTCAAGGG-------------------GTCGAAGGTTCAAATCCTTTCATCCCGACCA
D00002115 Escherichia_coli Pro GGG -CGGCACGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAATCCTCTCGTGCCGACCA
D00008357 Escherichia_coli_CFT073 Pro GGG -CGGCACGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAATCCTCTCGTGCCGACCA
D00008091 Escherichia_coli_K12 Pro GGG -CGGCACGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAATCCTCTCGTGCCGACCA
D00008094 Escherichia_coli_O157:H7 Pro GGG -CGGCACGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAATCCTCTCGTGCCGACCA
D00008098 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Pro GGG -CGGCACGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAATCCTCTCGTGCCGACCA
D00008407 Geobacter_sulfurreducens_PCA Pro GGG -CGGGGCGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACCAGACTGGGGGTCTGGTG-------------------GTCGCTGGTTCGAATCCAGTCGCCCCGACCA
D00008346 Helicobacter_hepaticus_ATCC_51449 Pro GGG -CGGAGTATAGCGCAGCCTGATT-AGCGCGCACCCTTGGGGTGGGTGAG-------------------GTCGTGGGTTTGAATCCCGCTACTCCGACCA
D00002109 Helicobacter_pylori Pro GGG -CGGAGTATGGCGCAGCCTGATT-AGCGCGCACCCTTGGGGTGGGTGAG-------------------GTCGTGGGTTTGAATCCCGCTACTCCGACCA
D00008100 Helicobacter_pylori_26695 Pro GGG -CGGAGTATGGCGCAGCCTGATTAGCGCGCACCCTTGGGGTGGGTGAGG-------------------T-CGTGGGTTTGAATCCCGCTACTCCGACCA
D00008102 Helicobacter_pylori_J99 Pro GGG -CGGAGTATGGCGCAGCCTGATT-AGCGCGCACCCTTGGGGTGGGTGAG-------------------GTCGTGGGTTTGAATCCCGCTACTCCGACCA
D00008412 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Pro GGG -CGGGCTGTGGCGCAGCTTGGT--AGCGCACTTGACTGGGGGTCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCAGCCCGACCA
D00008312 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Pro GGG -CGGGGTGTAGCGCAGT--GGT--AGCGCACTTCTCTGGGGGGGAAGGG-------------------GTCGCTGGTTCGAATCCAGTCACTCCGA---
D00008153 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Pro GGG -CGGAGTGTAGCGCAGCCCGGT--AGCGCACTTGACTGGGGGTCAAGGG-------------------GTCGTCGGTTCGAATCCGGCCACTCCGACCA
D00008347 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Pro GGG -CGGGCTGTGGCGCAGTTTGGT--AGCGCACTTGACTGGGGGTCAAGTG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCAGCCCGA---
D00008085 Mycobacterium_leprae_TN Pro GGG -CGGGCTGTGGCGCAGTTTGGT--AGCGCACTTGACTGGGGGTCAAGTG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCAGCCCGA---
D00008072 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Pro GGG -CGGGCTGTGGCGCAGTTTGGT--AGCGCACTTGACTGGGGGTCAAGTG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCAGCCCGA---
D00008392 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Pro GGG -CGGGCTGTGGCGCAGTTTGGT--AGCGCACTTGACTGGGGGTCAAGTG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCAGCCCGA---
D00008075 Neisseria_meningitidis_MC58 Pro GGG -CGGAGTGTGGCGCAGTCTGGT--AGCGCACTTGCATGGGGTGCAAGGG-------------------GTCGAAGGTTCGAATCCTTTCACTCCGACCA
D00008078 Neisseria_meningitidis_Z2491 Pro GGG -CGGAGTGTGGCGCAGTCTGGT--AGCGCACTTGCATGGGGTGCAAGGG-------------------GTCGAAGGTTCGAATCCTTTCACTCCGACCA
D00008373 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Pro GGG -CGGGGCGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGTACTTGCATGGGGTGCAAGTG-------------------GTCGGAGGTTCAAATCCTCTCGCCCCGACCA
D00008165 Nostoc_sp._PCC_7120 Pro GGG -CGGGGCGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCGCCACTTTGGGGTAGTGGAG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCGCCGCTCCGA---
D00008398 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Pro GGG -CGGCATGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAATCCTCTCATGCCGACCA
D00008415 Porphyromonas_gingivalis_W83 Pro GGG -CGGGGTGTAGCTCAGCCCGGTT-AGAGTACGCGTCTGGGGGGCGTGTG-------------------GTCGCTGGTTCGAATCCAGTCACCCCGA---
D00008434 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Pro GGG -CGGGCTGTGGCGCAGTTTGGT--AGCGCACTTGACTGGGGGTCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCAGCCCGA---
D00008120 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Pro GGG -CGGGGCGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACTTGCATGGGGTGCAAGGG-------------------GTCGAGTGTTCGAATCACTCCGTCCCGACCA
D00008381 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Pro GGG -CGGGGCGTAGCGCAGTCCGGT--AGCGCACTAGCATGGGGTGCTAGGG-------------------GTCGAGTGTTCGAATCACTCCGTCCCGACCA
D00008160 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Pro GGG -CGGGGCGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGTACCTGCATGGGGTGCAGGTG-------------------GTCGGAGGTTCAAATCCTCTCGCCCCGACCA
D00008372 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Pro GGG -CGGGATGTGGCTCAGCCTGGTT-AGAGCGCTGCACTGGGGGTGCAGAG-------------------GTCGCAAGTTCGAATCTTGTCATCCCGA---
D00008401 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Pro GGG -CGGAGCGTGGCGCAGCCCGGTT-AGCGCACTAGTCTGGGAGACTAGGG-------------------GTCGAAGGTTCAAATCCTTTCGCTCCGACCA
D00008170 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Pro GGG -CGGCACGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAATCCTCTCGTGCCGACCA
D00008365 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Pro GGG -CGGCACGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAATCCTCTCGTGCCGACCA
D00008156 Salmonella_typhimurium_LT2 Pro GGG -CGGCACGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAATCCTCTCGTGCCGACCA
D00008317 Shewanella_oneidensis_MR-1 Pro GGG -CGGTATGTAGCGCAGCCCGGT--AGCGCACTGTCATGGGGTGTCAGGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTCATACCGACCA
D00008320 Shigella_flexneri_2a_str._301 Pro GGG -CGGCACGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGG--------G----------GTCGGAGGTTCAAATCCTCTCGTGCCGACCA
D00008174 Sinorhizobium_meliloti_1021 Pro GGG -CGGAGCGTAGCGCAGCCCGGT--AGCGCACTTGACTGGGGGTCAAGGG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCGCCGCTCCGACCA
D00008360 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Pro GGG -CGGGACGTGGCGCAGCTTGGT--AGCGCACTTGACTGGGGGTCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCGTCCCGA---
D00008361 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Pro GGG -CGGGACGTGGCGCAGCTTGGT--AGCGCACTTGACTGGGGGTCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCGTCCCGA---
D00008364 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Pro GGG -CGGGACGTGGCGCAGCTTGGT--AGCGCACTTGACTGGGGGTCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCGTCCCGA---
D00008315 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Pro GGG -CGGGACGTGGCGCAGCTTGGT--AGCGCACTTGACTGGGGGTCAAGGG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCGTCCCGA---
D00008419 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Pro GGG -CGGGCTGTGGCGCAGCTTGGT--AGCGCGCTTCCTTGGGGTGGAAGAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCAGCCCGACCA
D00002122 Synechocystis_sp. Pro GGG -CGGGGCGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCACCACTTTGGGGTAGTGGGG-------------------GTCGTGGGTTCAAATCCCGCCGCTCCGA---
D00008123 Synechocystis_sp._PCC_6803 Pro GGG -CGGGGCGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCACCACTTTGGGGTAGTGGGG-------------------GTCGTGGGTTCAAATCCCGCCGCTCCGA---
D00008288 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Pro GGG -CTGGGTGTGGCGCAGCT-GGT--AGCGCGCCAGAATGGGGTTCTGGAG-------------------GCCGGGGGTTCAAGTCCCCCCACTCAGACCA
D00008282 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Pro GGG -CGGGGCGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCACCACTTTGGGGTAGTGGGG-------------------GTCGTGGGTTCAAATCCCGCCGCTCCGA---
D00008126 Thermotoga_maritima_MSB8 Pro GGG -CGGGGCGTAGCGCAGGT-GGCT-AGCGCGCTTGCATGGGGCGCAAGAG-------------------GTCGCTGGTTCAAGTCCAGTCGCCCCGACCA
D00008439 Thermus_thermophilus_HB27 Pro GGG -CGGGGAGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACACGCTTGGGGTGCGTGGG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCCTCCCCGACCA
D00008440 Treponema_denticola_ATCC_35405 Pro GGG -CGGGCAATAGCGCAGTT-GGTT-AGCGTACAAGTCTGGGGGACTTGGG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGTTGCCCGA---
D00002103 Treponema_pallidum Pro GGG -CGGGCAATGGCGCAGTA-GGTT-AGCGTACAAGTCTGGGGGACTTGGG-------------------GTCCCCGGTTCGAGTCCGGGTTGCCCGA---
D00008117 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Pro GGG -CGGGCAATGGCGCAGTA-GGTT-AGCGTACAAGTCTGGGGGACTTGGG-------------------GTCCCCGGTTCGAGTCCGGGTTGCCCGA---
D00008335 Tropheryma_whipplei_str._Twist Pro GGG -CGGGCTGTGGCGCAGCTTGGT--AGCGCACTTGACTGGGGGTCAAGGG-------------------GTCGTGGGTTCAAATCCCGCCAGCCCGA---
D00008338 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Pro GGG -CGGGCTGTGGCGCAGCTTGGT--AGCGCACTTGACTGGGGGTCAAGGG-------------------GTCGTGGGTTCAAATCCCGCCAGCCCGA---
D00008080 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Pro GGG -CGGACTGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAATCCTCTCAGTCCGACCA
D00008294 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Pro GGG -CGGGGTATAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACTAGTCTGGGGGACTAGTG-------------------GTCGTCGGTTCGAATCCGGCTACCCCGACCA
D00008291 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Pro GGG -CGGGGTATAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACTAGTCTGGGGGACTAGTG-------------------GTCGTCGGTTCGAATCCGGCTACCCCGACCA
D00008129 Xylella_fastidiosa_9a5c Pro GGG -CGGGGTATAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACCAGTCTGGGGGACTGGTG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCTACCCCGACCA
D00008132 Xylella_fastidiosa_9a5c Pro GGG -CGGCACGTAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGG-------------------GTCGGAGGTTCAAATCCTCTCGTGCCGACCA
D00008342 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Pro GGG -CGGGGTATAGCGCAGCCTGGT--AGCGCACCAGTCTGGGGGACTGGTG-------------------GTCGTCGGTTCAAATCCGGCTACCCCGACCA
D00008421 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Pro GGG -CGGCATGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGG-------------------GTCGAAGGTTCAAATCCTTTCATGCCGACCA
D00008154 Yersinia_pestis_CO92 Pro GGG -CGGCATGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGG-------------------GTCGAAGGTTCAAATCCTTTCATGCCGACCA
D00008299 Yersinia_pestis_KIM Pro GGG -CGGCATGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGG-------------------GTCGAAGGTTCAAATCCTTTCATGCCGACCA
D00008424 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Pro GGG -CGGCATGTAGCGCAGCTTGGT--AGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGG-------------------GTCGAAGGTTCAAATCCTTTCATGCCGACCA
D00002119 Sinorhizobium_meliloti Pro AGG -CGGAGTGTAGCGCAGTCTGGT--AGCGCACCACGTTAGGGACGTGGGG-------------------GTCGAGTGTTCGAATCACTCCACTCCGACCA
D00008219 Arabidopsis_thaliana Pro AGG -GGGCATTTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTTGCTTAGGGTGCGAGAG-------------------GCCCGGAGCTCAATTCTCGGAAAACCC----
D00008220 Arabidopsis_thaliana Pro AGG -TGGCATTTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTAGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGAGTTCAATTCTCGGAATGCCCC---
D00008221 Arabidopsis_thaliana Pro AGG -GGGCATTTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTAGGGTGCGAGAG-------------------GTCCGGAGTTCAATTCTCCGAATGCCCC---
D00008222 Arabidopsis_thaliana Pro AGG -GGGCATTTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTAGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGAGTTCAATTCTCGGAATGCCCC---
D00008223 Arabidopsis_thaliana Pro AGG -GGGCGTTTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTAGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGAGTTCAATTCTCGGAACGCCCC---
D00002246 Caenorhabditis_elegans Pro AGG -GGCTGAGTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTAGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGATCGATCCCCGGCTCAGCCC---
D00008232 Caenorhabditis_elegans Pro AGG -GGTCGGATGGCCTAGA--GGT--AAGGCGCTTGCTTAGGGTGCAAGAG-------------------ATCCCGGGTTCGATCCCCGGTTCGACC----
D00008233 Caenorhabditis_elegans Pro AGG -GGCCGGATGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTAGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGATCGATCCCCGGTTCGGCC----
D00008234 Caenorhabditis_elegans Pro AGG -GGCTGAGTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTAGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGATCGATCCCCGGCTCAGCCC---
D00008235 Caenorhabditis_elegans Pro AGG -GGCCGGATGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTAGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGATCGATCCCCGGTCCGGCC----
D00008426 Candida_glabrata_CBS_138 Pro AGG -GGGCGTGTGGTCTAGA--GGT--ATGATTTCCGCTTAGGGTGCGGGAG-------------------GTCCCGGGTTCGAGTCCCGGCTCGCCCC---
D00008255 Drosophila_melanogaster Pro AGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTTCCGCTTAGGGTGCGGGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCC----
D00008295 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Pro AGG -GGTGGTATGGTCTAGC--GGT--ATGACGCTTGCTTAGGGTGCAAGAG-------------------GCCTTGGGTTCGAATCCCAATACCGCCC---
D00002248 Gallus_gallus Pro AGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTAGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00008453 Gallus_gallus Pro AGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTAGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00008459 Gallus_gallus Pro AGG -GGCTTGTTGTGCTGGG--GGT--ATGATCCTTGCTTAGGGTGTGAGAG-------------------GTCCTGGGTTCAAATCTCAGATGAGGCC---
D00002254 Homo_sapiens Pro AGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTAGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00008211 Homo_sapiens Pro AGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTAGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00008212 Homo_sapiens Pro AGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTAGGATGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00008213 Homo_sapiens Pro AGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--GTGGTTCTCGCTTAGGGCGGGAGACCC------AAGA-----GGT-CCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCC----
D00002251 Mus_musculus Pro AGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTAGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00008468 Pan_troglodytes Pro AGG -GGCTGGTTGGTCTAGG--GCT--ATGATTCTCACTTAGGGTGCAAGAG-------------------GTCCTGGGTTCAAATCCCAGAGGAGCCC---
D00008469 Pan_troglodytes Pro AGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTAGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCGCGGACGAGCCC---
D00008470 Pan_troglodytes Pro AGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTAGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCTGGACGAGCCC---
D00008471 Pan_troglodytes Pro AGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTAGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCACGGACGAGCCC---
D00008472 Pan_troglodytes Pro AGG -GGCTCGTTGGGCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTAGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00008473 Pan_troglodytes Pro AGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTAGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00008474 Pan_troglodytes Pro AGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GTT--GTGGTTCTCGCTTAGGGCGGGAGACCC------AAGA-----GGT-CCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00002244 Phaseolus_vulgaris Pro AGG -GGGCATTTGGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCGCTTAGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGAGTTCAATTCTCGGAATGCCCC---
D00008447 Plasmodium_falciparum_3D7 Pro AGG -GGCTACTTAGTCTAGT--GGT--ATGATTCTCTCTTAGGGTGGGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCGATTCCCGGAGTAGCCC---
D00002253 Rattus_norvegicus Pro AGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTAGGGTGCGAGAG-------------------GTCCTGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00008247 Saccharomyces_cerevisiae Pro AGG -GGGCGTGTGGTCTAGA--GGT--ATGATTCTCGCTTAGGGTGCGGGAG-------------------GTCCCGGGTTCGAGTCCCGGCTCGCCC----
D00002242 Schizosaccharomyces_pombe Pro AGG -GGCCGTTTGGTCTAGT--GGT--ATGATACCATCTTAGGGTGATGGTG-------------------GTCGTGGGTTCGATTCCCACAACAGCCC---
D00008260 Schizosaccharomyces_pombe Pro AGG -GGCCGTTTGGTCTAGT--GGT--ATGATACCATCTTAGGGTGATGGTG-------------------GTCGTGGGTTCGATTCCCACAACAGCCC---
D00008460 Takifugu_rubripes Pro AGG -GGCTCGTTGGTCTAGG--GGT--ATGATTCTCGCTTAGGGTGCGAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGACGAGCCC---
D00009775 Aeropyrum_pernix_K1 Ser CGA -GCCGGGGTGGCCGAGC--GGCCCAAGGCGGCGGGCTCGAGACCCGTTGCCCC----GCGA---GGGGCGCGCGGGTTCGAATCCCGCCCCCGGCGCC-
D00002606 Archaeoglobus_fulgidus Ser CGA -GCCGGGGTTGCAGAGCCAGGCC-ACTGCGGGAGACTCGAGATCTCCTGCCC-----GAAA----GGGCGCGTGGGTTCGAATCCCACCCCCGGCG---
D00009779 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Ser CGA -GCCGGGGTTGCAGAGCCAGGCC-ACTGCGGGAGACTCGAGATCTCCTGCCC-----GAAA----GGGCGCGTGGGTTCGAATCCCACCCCCGGCG---
D00009783 Halobacterium_sp._NRC-1 Ser CGA -GCCGAGGTAGCCTAGCCTGGCC-AAGGCGGTTGCTTCGAGAGCAACTGTCC-----ACAC----GGACTCAGGAGTTCAAATCTCCTCCTCGGCG---
D00011920 Methanosarcina_acetivorans_C2A Ser CGA -GCCCAGGTCGTCTAGT--GGT--ATGGCGACGGTCTCGAAAACCGTTCCC------TTTG-----GGATCGCAGGTTCAAATCCTGCCCTGGGCG---
D00009910 Methanosarcina_mazei_Go1 Ser CGA -GCCCAGGTCGTCTAGC--GGT--ATGGCGACGGTCTCGAAAACCGTTCCC------CTTG-----GGATCGCAGGTTCGAATCCTGCCCTGGGCA---
D00011969 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Ser CGA -GCCGAGGTAGTCTAGTCCGGG--AAGGCGGTGGTCTCGAAAACCACTGGTG-----GTAA----CACCTCGGGAGTTCAAATCTCCCCTTCGGCG---
D00011977 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Ser CGA -GGGGCCGTAGCTCAGCCAGGC--AGAGCGGCGGATTCGAAACCCGTAG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCCCCGGCCCCA---
D00011991 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Ser CGA -GCCGCCGTGCCCGAGC--GGCCCAAGGGGGAGGGCTCGAGACCCTCTCCCCG----CCA----AGGGGGCGGGGGTTCGAATCCCCCCGGCGGCG---
D00009796 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Ser CGA -GCCGGGGTGGCCGAGC--GGCCCAAGGCGCGGGACTCGAGATCCCGTCCCCG----TCC----AGGGGGCGTGGGTTCAAATCCCACCCCCGGCG---
D00009800 Pyrococcus_abyssi_GE5 Ser CGA -GCCGGGGTAGCCTAGCCAGGG--AAGGCGCGGGACTCGAGATCCCGTGGGC-----GTTC----GCCCACCGGGGTTCAAATCCCCGCCCCGGCGCC-
D00009804 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Ser CGA -GCCGGGGTAGCCTAGTCAGGG--AAGGCGCGGGACTCGAGATCCCGTGGGC-----GTTC----GCCCGCCGGGGTTCAAATCCCCGCCCCGGCGCC-
D00009808 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Ser CGA -GCCGGGGTAGCCTAGCCTGGG--AAGGCGCGGGACTCGAGATCCCGTGGGCG----TGG----TCCCA-CCGGGGTTCAAATCCCCGCCCCGGCGCCA
D00012015 Staphylothermus_marinus_F1 Ser CGA -GCCGGGGTGCCCGAGC--GGACTAAGGGGGTAGGCTCGAGACCTACTGCCCCG---CGG---AGGGGCGCGCGGGTTCGAATCCCGCCCCCGGCGCCA
D00012060 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Ser CGA -GCCGGGGTGCCCGAGC--GGACCAAGGGGGTAGGCTCGAGACCTACTGCCTC----TCC----GAGGCACGCGGGTTCAAATCCCGCCCCCGGCG---
D00002614 Sulfolobus_solfataricus Ser CGA -GCCGGGGTGCCCGAGC--GGACCAAGGGGGTAGGCTCGAGACCTACTGCCTC----TCC----GAGGCACGCGGGTTCAAATCCCGCCCCCGGCG---
D00009812 Sulfolobus_solfataricus_P2 Ser CGA -GCCGGGGTGCCCGAGC--GGTC-AAGGGGGTAGGCTCGAGACCTACTGCCTC----TCT----GAGGCACACGGGTTCGAATCCCGTCCCCGGC----
D00009939 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Ser CGA -GCCGGGGTGCCCGAGC--GGACTAAGGGGGTAGGCTCGAGACCTACTGCCCC----TAT----GGGGCACGCGGGTTCAAATCCCGCCCCCGGCG---
D00009816 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Ser CGA -GTCGGGGTAGCCTAGCCCGGT--AAGGCGGTAGACTCGAGATCTACTGCTC-----TCG-----TAGCTCGGGAGTTCAAATCTCCCCCCCGACG---
D00009820 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Ser CGA -GTCGGGGTAGCCTAGCCCGGT--AAGGCGGTAGACTCGAGATCTACTGCTC-----TCG-----TAGCTCGGGAGTTCAAATCTCCCCCCCGACG---
D00009766 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Ser CGA -GGAGAGGTGGCAGAGT--GGTCGAATGCACCGCACTCGAAATGCGGCATACCT---GCAA--GGGTAT-CGTGGGTTCGAATCCCACCCTCTCCGCCA
D00009699 Aquifex_aeolicus_VF5 Ser CGA -GACGGGGTGGCCGAGC--GGACGAAGGCGGGGGACTCGAAATCCCTTGGCGGGTT-ACC-AGCCCGCC-CGTGGGTTCGAATCCCACCCCCGTCG---
D00010095 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Ser CGA -GGAGAGATGGCTGAGT--GGTTGAAAGCACCGCACTCGAAATGCGGCATAGGG---GTAA--CTCTAT-CGGGGGTTCAAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00010222 Bartonella_quintana_str._Toulouse Ser CGA -GGAGAGATGGCTGAGT--GGTTGAAAGCACCGCACTCGAAATGCGGCATAGGG---GCAA--CTCTAT-CGGGGGTTCAAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00009970 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Ser CGA -GGATAAGTGTCCGAGC--GGTCTAAGGAGCACGCCTCGAAAGCGTGTGAGGT----GAAA---GCCTC-CGCGAGTTCGAATCTCGCCTTATCCG---
D00010007 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Ser CGA -GGAGAGGTGGCAGAGT--GGTTGAATGCACCGCACTCGAAATGCGGCATAGGT---GCAA--GCCTAT-CGGGGGTTCGAATCCCTCCCTCTCCGCCA
D00009735 Brucella_melitensis_16M Ser CGA -GGAGAGGTGGCTGAGT--GGTTGAAAGCACCGCACTCGAAATGCGGCATGGGG---GCAA--CTCCAT-CGGGGGTTCGAATCCCTCCCTCTCCGCCA
D00009973 Brucella_suis_1330 Ser CGA -GGAGAGGTGGCTGAGT--GGTTGAAAGCACCGCACTCGAAATGCGGCATGGGG---GCAA--CTCCAT-CGGGGGTTCGAATCCCTCCCTCTCCGCCA
D00010226 Candidatus_Blochmannia_floridanus Ser CGA -GGAGAGATGCCGGAGT--GGATGAACGGGACGGTTTCGAAAATCGTTAAAGAAT--GTA--ATTTTTT-CAAGGGTTCGAATCCCTTTCTCTCCT---
D00009655 Caulobacter_crescentus_CB15 Ser CGA -GGAGAGGTGGCAGAGT--GGTCGAATGCGCCGCACTCGAAATGCGGTTTACGT---GAAA--GCGTAA-CGTGGGTTCGAATCCCACCCTCTCCGCCA
D00009718 Chlamydia_muridarum_Nigg Ser CGA -GGAAGAGTGGCAGAGT--GGTCGAATGCATCTGATTCGAAATCAGAAGTCCCT---CAAC--GGGGAC-CGGGGGTTCAAATCCCTTCTCTTCCG---
D00009585 Chlamydia_trachomatis Ser CGA -GGAAGAGTGGCAGAGT--GGTCGAATGCGTCTGATTCGAAATCAGAAGTTCTC---TTA---CAGGAACCAGGGGTTCGAATCCCTTCTCTT------
D00009582 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Ser CGA -GGAAGAGTGGCAGAGT--GGTCGAATGCATCTGATTCGAAATCAGAAGTCCCT---CAAC--GGGGAC-CGGGGGTTCAAATCCCTTCTCTTCCG---
D00009573 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Ser CGA -GGAAGAGTGGCAGAGT--GGTCGAATGCGTCTGATTCGAAATCAGAAGTTCTC---TTA---CAGGAACCAGGGGTTCGAATCCCTTCTCTTCCG---
D00009577 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Ser CGA -GGAAGAGTGGCAGAGT--GGTCGAATGCGTCTGATTCGAAATCAGAAGTTCTC---TTA---CAGGAACCAGGGGTTCGAATCCCTTCTCTTCCG---
D00009624 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Ser CGA -GGAAGAGTGGCAGAGT--GGTCGAATGCGTCTGATTCGAAATCAGAAGTTCTC---TTA---CAGGAACCAGGGGTTCGAATCCCTTCTCTTCCG---
D00009904 Chlorobium_tepidum_TLS Ser CGA -GGAGAGGTGCGAGAGT--GGTTGAATCGGGCGGTCTCGAAAACCGTTGTGCGC---GCAA--GTGTAC-CGTGGGTTCGAATCCCACCCTCTCCG---
D00009730 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Ser CGA -GGAGAGATGTCGGAGT--GGTCTATCGTGCATGACTCGAAATCATGTGTACGGT--TTAA-CCCGTAC-CGAGGGTTCAAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00010011 Clostridium_tetani_E88 Ser CGA -GGAGAGATGTCCGAGA--GGTCGAAGGTGGTGGTCTCGAAAACCATTATACAGT--AACA-ACTGTAT-CGAGGGTTCAAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00010104 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Ser CGA -GGTAGCGTGTCCGAGC--GGCCGAAGGTGTTCGCCTCGAAAGCGAATGTTGGGT--AAC--CCCCAAC-CGCGGGTTCAAATCCCGCCGCTACCGCCA
D00009977 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Ser CGA -GGTGGCGTGTCCGAGC--GGCCGAAGGTGATCGCCTCGAAAGCGATTGTTGGGT--AAT--CCCCAAC-CGGGGGTTCAAATCCCCCCGCCACCGCCA
D00009922 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Ser CGA -GGTGGCGTGTCCGAGC--GGCCGAAGGTGTTCGCCTCGAAAGCGAATGTTGGGT--AAT--CCCCAAC-CGGGGGTTCAAATCCCCCCGCCACCG---
D00010050 Coxiella_burnetii_RSA_493 Ser CGA -GGAGAGGTACCGAAGCG-GTCACACCGGCACCGACTCGAAATCGGCTGAGGCC---TCAC--GGCCTA-CGCGGGTTCGAATCCCGCCCTCTCCGCCA
D00009659 Deinococcus_radiodurans_R1 Ser CGA -GGAGAGGTGGCAGAGT--GGTTGAATGCGTCGCTCTCGAAAAGCGGAGTACTC---GCAA--GGGTAC-CGTGGGTTCGAATCCCACCCTCTTCGCCA
D00010187 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Ser CGA -GGAGAGGTAGCGAAGCTGGCCGTAACGCGCTCGACTCGAAATCGAGTTACGGGTT-AAT-AGCCCGTA-CGTGGGTTCGAATCCCACCCTCTCCGCCA
D00010017 Enterococcus_faecalis_V583 Ser CGA -GGAGGATTACCCAAGTTTGGCTGAAGGGGACGGTCTCGAAAACCGTTAGGCGAG--TAA--CATCGTG-CAAGGGTTCGAATCCCTTATCCTCCG---
D00002652 Escherichia_coli Ser CGA -GGAGAGATGCCGGAGC--GGCTGAACGGACCGGTCTCGAAAACCGGAGTAGGG---GCAA--CTCTAC-CGGGGGTTCAAATCCCCCTCTCTCCGCCA
D00010062 Escherichia_coli_CFT073 Ser CGA -GGAGAGATGCCGGAGC--GGCTGAACGGACCGGTCTCGAAAACCGGAGTAGGG---GCAA--CTCTAC-CGGGGGTTCAAATCCCCCTCTCTCCGCCA
D00009628 Escherichia_coli_K12 Ser CGA -GGAGAGATGCCGGAGC--GGCTGAACGGACCGGTCTCGAAAACCGGAGTAGGG---GCAA--CTCTAC-CGGGGGTTCAAATCCCCCTCTCTCCGCCA
D00009632 Escherichia_coli_O157:H7 Ser CGA -GGAGAGATGCCGGAGC--GGCTGAACGGACCGGTCTCGAAAACCGGAGTGGGG---GCAA--CTCCAC-CGGGGGTTCAAATCCCCCTCTCTCCGCCA
D00009636 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Ser CGA -GGAGAGATGCCGGAGC--GGCTGAACGGACCGGTCTCGAAAACCGGAGTGGGG---GCAA--CTCCAC-CGGGGGTTCAAATCCCCCTCTCTCCGCCA
D00010140 Geobacter_sulfurreducens_PCA Ser CGA -GGAGAGATGGCCGAGT--GGTCGAAGGCGGCAGACTCGAAATCTGTTGTACCG---CTTG--CGGTAC-CTAGGGTTCGAATCCCTATCTCTCCGCCA
D00002646 Lactobacillus_delbrueckii Ser CGA -GGAGAGTTGGCAGAGC--GGT--AATGCAGCGGACTCGAAATCCGCCGAGCCAAT-GTTGAATTGGGT-CGCAGGTTCAAATCCTGTACTCTCCT---
D00002642 Lactobacillus_delbrueckii_subsp._bulgaricus Ser CGA -GGAGAGTTGGCAGAGC--GGT--AATGCAGCGGACTCGAAATCCGCCGAACCAAT-GTTGAATTGGTG-CGCAGGTTCAAATCCTGTACTCTCCT---
D00010144 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Ser CGA -GGAGAGTTGGCAGAGT--GGT--AATGCACCGGACTCGAAATCCGGCGAACCGGC-TTA-TACCGGCG-CGCAGGTTCAAATCCTGTACTCTCCT---
D00010019 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Ser CGA -GGAGAGTTGGCAGAGT--GGT--AATGCACCGGACTCGAAATCCGGCGAACCGGC-TAA-TACCGGCG-CGCAGGTTCAAATCCTGTACTCTCCT---
D00010150 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Ser CGA -GGTACCGTGTCCGAGC--GGCCGAAGGTGCAACTCTCGAAAAGTTGTGTGGGT---GAGA--GCCCAC-CGTGGGTTCAAATCCCACCGGTACCGCCA
D00009703 Listeria_innocua_Clip11262 Ser CGA -GGAGAAATACCCAAGTCCGGCTGAAGGGGACAGACTCGAAATCTGTTAGGCGG---TGTA--TGCCGCGCCGGGGTTCGAATCCCCGTTTCTCCG---
D00009708 Listeria_monocytogenes_EGD-e Ser CGA -GGAGAAATACCCAAGTCCGGCTGAAGGGGACAGACTCGAAATCTGTTAGGCGG---TGTA--TGCCGCGCCGGGGTTCGAATCCCCGTTTCTCCG---
D00010188 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Ser CGA -GGAGAAATACCCAAGTCCGGCTGAAGGGGACAGACTCGAAATCTGTTAGGCGG---TGTA--TGCCGCGCCGGGGTTCGAATCCCCGTTTCTCCG---
D00009741 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Ser CGA -GGAGAGGTGGCAGAGT--GGTCGAATGCACCGCACTCGAAATGCGGCATGGGT---GCAA--GCCCAT-CGGGGGTTCGAATCCCTCCCTCTCCGCCA
D00010041 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Ser CGA -GGTGGCGTGTCCGAGC--GGCCTAAGGAGCACGCCTCGAAAGCGTGTGACGGC---TAAC--ACCGTC-CGAGGGTTCAAATCCCTCCGCCACCGCCA
D00009618 Mycobacterium_leprae_TN Ser CGA -GGTGGTGTGTCCGAGC--GGCCTAAGGAGCACGCCTCGAAAGCGTGTGACGGCA--AAA--ACCCGTC-CGAGGGTTCAAATCCCTCCGCCACCGCCA
D00009597 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Ser CGA -GGTGGCGTGTCCGAGC--GGCCTAAGGAGCACGCCTCGAAAGCGTGTGACGGC---TAAC--ACCGTC-CGAGGGTTCAAATCCCTCCGCCACCGCCA
D00010110 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Ser CGA -GGTGGCGTGTCCGAGC--GGCCTAAGGAGCACGCCTCGAAAGCGTGTGACGGC---TAAC--ACCGTC-CGAGGGTTCAAATCCCTCCGCCACCGCCA
D00002620 Mycoplasma_genitalium Ser CGA -GGAGATTTACCCAAGT--GGCTGAAGGGGGCGCTCTCGAAAAGCGTTAGGGGT---GGTT--ATCCACGCGTGGGTTCAAATCCCACAATCTCCGCCA
D00009663 Mycoplasma_genitalium_G37 Ser CGA -GGAGATTTACCCAAGT--GGCTGAAGGGGGCGCTCTCGAAAAGCGTTAGGTGG---TTA---TCCACG-CGTGGGTTCAAATCCCACAATCTCCGCCA
D00002623 Mycoplasma_pneumoniae Ser CGA -GGAGACTTACCCAAGT--GGTTTAAGGGGGCGCTCTCGAAAAGCGTT_GTGT----TTTT---GCATG-CGTGGGTTCGAATCCCACAGTCTCCGCCA
D00009667 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Ser CGA -TAATACTTACCCAAAT--GGTTTAAGGGGGCGCTTTCGAAAAGCGTTAGGTT----TTTT---TGCATGCGTGGGTTCGAATCCCACATTCTTGGCCA
D00009668 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Ser CGA -GGAGACTTACCCAAGT--GGTTTAAGGGGGCGCTCTCGAAAAGCGTTAGGTG----TTTT---TGCATGCGTGGGTTCGAATCCCACAGTCTCCGCCA
D00009601 Neisseria_meningitidis_MC58 Ser CGA -GGAAACGTGGCAGAGA--GGCTGAATGCAGCGGACTCGAAATCCGCTGAGGGT---GCAA--ATCCTC-CGTGGGTTCGAATCCCACCGTTTCCGCCA
D00009605 Neisseria_meningitidis_Z2491 Ser CGA -GGAAACGTGGCAGAGA--GGCTGAATGCAGCGGACTCGAAATCCGCTGAGGGT---GCAA--ATCCTC-CGTGGGTTCGAATCCCACCGTTTCCGCCA
D00010077 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Ser CGA -GGAGAGGTACCGAAGTG-GCCATAACGGCGCTGACTCGAAATCAGATGGTCAGG--ATTT-CCTGGCA-CGTGGGTTCGAATCCCACCCTCTCCGCCA
D00009759 Nostoc_sp._PCC_7120 Ser CGA -GGAGAGGTGTCCGAGT--GGTTGATGGTGACGCACTCGAAATGCGTTAAGGAT---GCAA--GTCCTT-CGGGGGTTCAAATCCCCCCTTCTCCG---
D00010196 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Ser CGA -GGTGACGTGTCTGAGC--GGCCGAAAGTGCCCGCCTCGAAAGCGGGTGTAGC----GAGA---GCTAC-CGAGGGTTCAAATCCCTCCGTCACCGCCA
D00009679 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Ser CGA -GGAGAGATGCCGGAGT--GGTCGAACGGGACGGATTCGAAATCCGTTGAGTCA---GCAA--TGGCTC-CTAGGGTTCAAATCCCTATCTCTCCGCCA
D00010088 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Ser CGA -GGAGAGATGCCAGAGT--GGCCGAATGGGACGGATTCGAAATCCGTTGTACCT---TCAC--CGGTAC-CTAGGGTTCGAATCCCTATCTCTCCGCCA
D00009756 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Ser CGA -GGAGAGGTGGCAGAGT--GGTCGAATGTACCTGACTCGAAATCAGGCGTACCG---GCAA--CGGTAC-CGTGGGTTCGAATCCCACCCTCTCCGCCA
D00010072 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Ser CGA --GGAGGATAAGCGAAT--GGC--TAGCAGGCTGATTCGAAATCAGTTGCCCA----GCAA---TGGGT-TGCGGGTTCGAGTCCCGTGTCCTCCG---
D00010120 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Ser CGA -GGAGAGGTGGCAGAGT--GGTTGAATGCACCGCACTCGAAATGCGGCATAGGT---GCAA--GCCTAT-CGGGGGTTCGAATCCCTCCCTCTCCGCCA
D00009769 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Ser CGA -GGAGAGATGCCGGAGC--GGCTGAACGGACCGGTCTCGAAAACCGGAGTAGGG---GCAA--CTCTAC-CGGGGGTTCAAATCCCCCTCTCTCCGCCA
D00010068 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Ser CGA -GGAGAGATGCCGGAGC--GGCTGAACGGACCGGTCTCGAAAACCGGAGTAGGG---GCAA--CTCTAC-CGGGGGTTCAAATCCCCCTCTCTCCGCCA
D00009751 Salmonella_typhimurium_LT2 Ser CGA -GGAGAGATGCCGGAGC--GGCTGAACGGACCGGTCTCGAAAACCGGAGTAGGG---GCAA--CTCTAC-CGGGGGTTCAAATCCCCCTCTCTCCGCCA
D00009994 Shigella_flexneri_2a_str._301 Ser CGA -GGAGAGATGCCGGAGC--GGCTGAACGGACCGGTCTCGAAAACCGGAGTGGGG---GCAA--CTCCAC-CGGGGGTTCAAATCCCCCTCTCTCCGCCA
D00009774 Sinorhizobium_meliloti_1021 Ser CGA -GGAGAGGTGGCAGAGT--GGTTGAATGCACCGCACTCGAAATGCGGCATGGGT---GCAA--GCCCAT-CGGGGGTTCGAATCCCCCCCTCTCCGCCA
D00002628 Spiroplasma_citri Ser CGA -GGAAGTATACCCAAGTC_GGTTGAAGGGGGCGGTCTCGAAAACCGTT_ATGGA---GTAA--TCCATG-CAAGAGTTCGAATCTCTTTACTTCCGCCA
D00009999 Streptococcus_mutans_UA159 Ser CGA -GGAAAGGTGGCTCAGCTTGGT--ACAGCACCGGACTCGAAATCCGGCAAGTGGA--CAT--TGTTCATGCGCGGGTTCAAATCCCGTCCTTTCCT---
D00010065 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Ser CGA -GGTAGCGTGTCCGAGC--GGCCGAAGGAGCTCGCCTCGAAAGCGAGTGTGGC----GCAA---GTCAC-CGAGGGTTCAAATCCCTCCGCTACCG---
D00009987 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Ser CGA -GGTAGCGTGTCCGAGC--GGCCGAAGGAGCTCGCCTCGAAAGCGAGTGTGGC----GCAA---GTCAC-CGAGGGTTCAAATCCCTCCGCTACCG---
D00010157 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Ser CGA -GGAGGGGTGTCCGAGT--GGTTTAAGGTGCCGCTCTCGAAAAGCGGTGTGGCT---TAAC--GGCCAC-CGTGGGTTCGAATCCCACCCCCTCCGCCA
D00010159 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Ser CGA -GGAGAGGTGTCCGAGG--GGTTTAAGGTGCCGCTCTCGAAAAGCGGTGTGGTG---ATG---AGCCAC-CGTGGGTTCGAATCCCACCCTCTCCGCCA
D00002665 Synechocystis_sp. Ser CGA -GGAGAGGTGGCAGAGC--GGTTGAATGCGGCAGACTCGAAATCTGTTTTGGG----GCAA---CTCAA-CGGGGGTTCGAATCCCCCCCTCTCCG---
D00009683 Synechocystis_sp._PCC_6803 Ser CGA -GGAGAGGTGGCAGAGC--GGTTGAATGCGGCAGACTCGAAATCTGTTTTGGG----GCAA---CTCAA-CGGGGGTTCGAATCCCCCCCTCTCCG---
D00009945 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Ser CGA -GGAGAGATGGCTGAGT--GGTCGAAAGCGCTCGCCTCGAAAGCGAGTGGGCGAA--TTT--TTCGCCT-CGAGGGTTCAAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00009938 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Ser CGA -GGAGAGGTGGCAGAGT--GGTTGAATGCGCTTGACTCGAAATCAAGTTTAGGG---TAAC--ACCTAA-CGGGGGTTCGAATCCCCCCCTCTCCG---
D00009687 Thermotoga_maritima_MSB8 Ser CGA -GGAGGCGTGTCCGAACT-GGCT-AAGGAGCCGGTCTCGAAAACCGGTGGGCC----GTGA---GGCCCTTGTGGGTTCGAGTCCCACCGCCTCCGCCA
D00010200 Thermus_thermophilus_HB27 Ser CGA --GAGGGGTGCCGGAGC--GGTTGAACGGGCCGGTCTCGAAAACCGGTAGGCCCC--TCGC-GGGGCCT-CGCGGGTTCGAATCCCGCCCCCTCCGCCA
D00002631 Treponema_pallidum Ser CGA -GGAGAGATGCGAGAGC--GGTCGAATCGGACGGTCTCGAAAACCGTAGCGCTCT--TGCA-AGGGCGC-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCG---
D00009675 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Ser CGA -GGAGAGATGCGAGAGC--GGTCGAATCGGACGGTCTCGAAAACCGTAGCGCTCT--TGCA-AGGGCGC-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCG---
D00010026 Tropheryma_whipplei_str._Twist Ser CGA -GGTAGCGTGTCTGAGT--GGCCGAAAGAGCGCGCCTCGAAAGCGCGTGAGCGC---ACCT--GTGCTC-CGTGGGTTCAAATCCCACCGCTACCG---
D00010030 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Ser CGA -GGTAGCGTGTCTGAGT--GGCCGAAAGAGCGCGCCTCGAAAGCGCGTGAGCGC---ACCT--GTGCTC-CGTGGGTTCAAATCCCACCGCTACCG---
D00009951 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Ser CGA -GGAGAGGTGGCAGAGC--GGTTGAATGTACCTGACTCGAAATCAGGCAGGCGTT--TAT--AGCGCCT-CGGGGGTTCGAATCCCCCCCTCTCCGCCA
D00009947 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Ser CGA -GGAGAGGTGGCAGAGC--GGTTGAATGTACCTGACTCGAAATCAGGCAGGCGTT--TAT--AGCGCCT-CGGGGGTTCGAATCCCCCCCTCTCCGCCA
D00009691 Xylella_fastidiosa_9a5c Ser CGA -GGGAAGATGGCAGAGT--GGTTGAATGTACCTGACTCGAAATCAGGCAGGCGTT--TAT--AGCGCCT-CGGGGGTTCGAATCCCCCTCTTCCCGCCA
D00009695 Xylella_fastidiosa_9a5c Ser CGA -GGAGAGATGCCGGAGC--GGCTGAACGGACCGGTCTCGAAAACCGGAGTAGGG---GCAA--CTCTAC-CGGGGGTTCAAATCCCCCTCTCTCCGCC-
D00010036 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Ser CGA -GGGAAGATGGCAGAGT--GGTTGAATGTACCTGACTCGAAATCAGGCAGGCGTT--TAT--AGCGCCT-CGGGGGTTCGAATCCCCCTCTTCCCGCCA
D00009853 Arabidopsis_thaliana Ser CGA -GTCAATATGTCCGAGT--GGTT-AAGGAGACAGACTCGAAATCTGTTGGGC-----TTT-----GCCTGCGCAGGTTCGAATCCTGCTGTTGACG---
D00009854 Arabidopsis_thaliana Ser CGA -GTCGATATGTCCGAGT--GGTT-AAGGAGATTGACTCGAAATCAATTGGGC-----TTT-----GCCCGCGCAGGTTCGAATCCTGCTGTCGAC----
D00009855 Arabidopsis_thaliana Ser CGA -GTCAATATGTCCGAGT--GGTT-AAGGAGATTGACTCGAAATCAATTGGGC-----TTT-----GCCCGCGCAGGTTCGAATCCTGCTGTTGAC----
D00009874 Caenorhabditis_elegans Ser CGA -GTGGTTATGTCCGAGT--GGTT-AAGGAGTTTGACTCGAAATCAAATGGGC-----TCT-----GTCCGCGTAGGTTCGAATCCTGCTGACTGC----
D00009875 Caenorhabditis_elegans Ser CGA -GCAGTCATGTCCGAGT--GGTT-AAGGAGATTGACTCGAAATCAATTGGGC-----TCT-----GCCCGCGTAGGTTCGAATCCTGCTGACTGC----
D00009876 Caenorhabditis_elegans Ser CGA -GCAGTCATGTCCGAGT--GGTT-AAGGAGTTTGACTCGAAATCAAATGGGC-----TCT-----GCCCGCGTAGGTTCGAATCCTGCTGACTGC----
D00010176 Candida_glabrata_CBS_138 Ser CGA -GGCACTATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGAGAGACTCGAATTATCTCTTGGG----CTC----TGCCCGCGCTGGTTCAAATCCTGCTGGTGTCG---
D00002905 Drosophila_melanogaster Ser CGA -GCAGTCGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTCTGACTCGAAATCAGATTCCC-----TCT-----GGGAGCGTAGGTTCGAATCCTACCGGCTGCG---
D00009894 Drosophila_melanogaster Ser CGA -GCAGTCGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTCTGACTCGAAATCAGATTCCC-----TCT-----GGGAGCGTAGGTTCGAATCCTACCGGCTGCG---
D00002906 Drosophila_simulans Ser CGA -GCAGTCGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTCTGACTCGAAATCAGATTCCC-----TCT-----GGGAGCGTAGGTTCGAATCCTACCGGCTGCG---
D00009956 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Ser CGA -GGCGGTGTGGCCGAGT--GGTCAAAGGCAATCGATTCGAAATCGATGGAC------TCTG-----TCCCCACAGGTTCGAATCCTGTCGCCGTCG---
D00010237 Gallus_gallus Ser CGA -GCTGTGATGGCCGAGA--GGTG-AAGGCGTTGGACTCGAAATCCAATAGGG-----TTT-----CCCTGCGCAGGTTCGAATCCTGCTCACAGCG---
D00002914 Homo_sapiens Ser CGA -GGAGATATGGCACAATCTGGT--ACTGCAACGGACTCGAAATCCGTCGAGCCGC--GTT--TCGGGTG-TGCGGGTTCAAATCCCGCTATCTCCT---
D00009830 Homo_sapiens Ser CGA -GTCACGGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTTGGACTCGAAATCCAATGGGG-----TTT-----CCCCGCACAGGTTCGAATCCTGTTCGTGAC----
D00009831 Homo_sapiens Ser CGA -GCTGTGATGGCCGAGT--GGTT-AAGGTGTTGGACTCGAAATCCAATGGGG-----GTT-----CCCCGCGCAGGTTCAAATCCTGCTCACAGC----
D00009832 Homo_sapiens Ser CGA -GCTGTGATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTTGGACTCGAAATCCAATGGGG-----TCT-----CCCCGCGCAGGTTCAAATCCTGCTCACAGC----
D00002894 Nicotiana_rustica Ser CGA -GTCGATATGTCCGAGT--GGTT-AAGGAGACAGACTCGAAATCTGTTGGGC-----TTT-----GCCTGCGCAGGTTCGAATCCTGCTGTCGACG---
D00010276 Pan_troglodytes Ser CGA -GTCACGGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTTGGACTCGAAATCCAATGGGG-----TTT-----CCCCGCACAGGTTCGAATCCTGTTCGTGACG---
D00010277 Pan_troglodytes Ser CGA -GCTGTGATGGCCGAGT--GGTT-AAGGTGTTGGACTCGAAATCCAATGGGG-----GTT-----CCCCGCGCAGGTTCAAATCCTGCTCACAGCG---
D00010278 Pan_troglodytes Ser CGA -GCTGTGATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTTGGACTCGAAATCCAATGGGG-----TCT-----CCCCGCGCAGGTTCAAATCCTGCTCACAGCG---
D00010279 Pan_troglodytes Ser CGA -GCTGTGATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTTGGACTCGAAATCCAATGGGG-----TCT-----CCCCGCGCAGGTTCGAATCCTGCTCACAGCG---
D00010219 Plasmodium_falciparum_3D7 Ser CGA -GACAGTTTGTCCGAGT--GGTT-AAGGAGGTTGACTCGAAATCAACTGGGC-----TCT-----GCCCGCACAGGTTCAAATCCTGTAGCTGTCG---
D00002879 Saccharomyces_cerevisiae Ser CGA -GGCACTATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGAGAGACTCGAAATCTCTTGGGC-----TCT-----GCCCGCGCTGGTTCAAATCCTGCTGGTGTCG---
D00002881 Saccharomyces_cerevisiae Ser CGA -GGCTACATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGAGAGACTCGAAATCTCTGGGC------TCTG-----CCCGCGCTGGTTCAATCCCTGCTGTGGTCG---
D00009888 Saccharomyces_cerevisiae Ser CGA -GGCACTATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGAGAGACTCGAAATCTCTTGGGC-----TCT-----GCCCGCGCTGGTTCAAATCCTGCTGGTGTCG---
D00002884 Schizosaccharomyces_pombe Ser CGA -GTCACTATGTCCGAGT--GGTT-AAGGAGTTAGACTCGAAATCTAATGGGC-----TCT-----GCCCGCGCAGGTTCAAATCCTGCTGGTGACG---
D00009900 Schizosaccharomyces_pombe Ser CGA -GTCACTATGTCCGAGT--GGTT-AAGGAGTTAGACTCGAAATCTAATGGGC-----TCT-----GCCCGCGCAGGTTCAAATCCTGCTGGTGACG---
D00010253 Takifugu_rubripes Ser CGA -GCTGTGATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTTGGATTCGAAATCCAATGGGG-----TTT-----CCCTTCGTAGGTTCAAATCCTACTCACAGCG---
D00010254 Takifugu_rubripes Ser CGA -GTCACGGTGGCCGAGA--GGTT-AAGGCGTTGGACTCGAAATCCAATGGGG-----TTT-----CCCCGCACAGGTTCGAATCCTGTTCGTGACG---
D00010255 Takifugu_rubripes Ser CGA -GTCACGGTGGCCGAGA--GGTT-AAGGCGTTGGACTCGAAATCCAATGGGG-----TTT-----CCCCGCACAGGTTCGAATCCTGTCCGTGACG---
D00009778 Aeropyrum_pernix_K1 Ser TGA -GCCGGGGTGGCCGAGC--GGCCCAAGGCGGCGGGCTTGAGACCCGTTGCCCC----GCGA---GGGGCGCGCGGGTTCGAATCCCGCCCCCGGCGCC-
D00002605 Archaeoglobus_fulgidus Ser TGA -GCCGGGGTTGCAGAGA--GGT--ACTGCGCCAGCCTTGAGAGCTGGTGCCC-----GTAA----GGGCTCCTGGGTTCAAATCCCAGCCCCGGCG---
D00009782 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Ser TGA -GCCGGGGTTGCAGAGA--GGT--ACTGCGCCAGCCTTGAGAGCTGGTGCCC-----GTAA----GGGCTCCTGGGTTCAAATCCCAGCCCCGGCG---
D00009786 Halobacterium_sp._NRC-1 Ser TGA -GGTGAGGTGGCAGAGC--GGCCTATTGCGCCGGTCTTGAAAACCGGTGGCG-----TCA-----CGCCTCCTGGGTTCGAATCCCAGCCTCACCG---
D00002610 Methanocaldococcus_jannaschii Ser TGA -GCAGGGGTAGCCAAGCCAGGACTACGGCGCTGGACTTGAGATCCAGTGGGGC----TTT----GCCCCGCCTGGGTTCAAATCCCAGCCCCTGCG---
D00009792 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Ser TGA -GCAGGGGTAGCCAAGCCAGGACTACGGCGCTGGACTTGAGATCCAGTGGGGC----TTT----GCCCCGCCTGGGTTCAAATCCCAGCCCCTGCGCC-
D00011870 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Ser TGA -GCAGAGGTGGTCGAGCTTGGACTATGGCGCCGGACTTGAAATCCGGTGGAGC----TTT----GCTCCGCAAGGGTTCAAATCCCTTCCTCTGCG---
D00009795 Methanococcus_maripaludis Ser TGA -GCAGAGGTGGTTGAGCTTGGCCAAAGGCGCCGGACTTGAAATCCGGTTCTCC----ACT----GGGGAGCGGGGGTTCAAATCCCTCCCTCTGC----
D00002613 Methanopyrus_kandleri Ser TGA -GCCGGGGCGGCCGAGCCCGGTCCAAGGCGCGGGACTTGAGATCCCGTGGCCC----GTAT---GGGCCGCCCGGGTTCAAATCCCGGCCCCGGCGCCA
D00009964 Methanopyrus_kandleri_AV19 Ser TGA -GCCGGGGCGGCCGAGCCCGGTCCAAGGCGCGGGACTTGAGATCCCGTGGCCC----GTAT---GGGCCGCCCGGGTTCAAATCCCGGCCCCGGCGCCA
D00011912 Methanosarcina_acetivorans_C2A Ser TGA -GCTGAGGTAGCCAAGC--GGACCACGGCGCCGGTCTTGAAAACCGGTAGCGC----CAC----GCGCTACGGGAGTTCGAATCTCCCCCTCAGCG---
D00009913 Methanosarcina_mazei_Go1 Ser TGA -GCTGAGGTAGCCAAGC--GGACCACGGCGCCGGTCTTGAAAACCGGTAGCGC----TAC----GCGCTACGGGAGTTCGAATCTCTCCCTCAGCG---
D00011936 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Ser TGA -GCCGAGATAGTCTAGTCCGGG--AAGGCGGTGGTCTTGAAAACCACTGGTG-----GTAA----CACCTCGGGAGTTCAAATCTCCCTTTCGGCG---
D00009789 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Ser TGA -GCCGGGATAGCCTAGCCAGGT--AAGGCGCGGGACTTGAGATCCCGTGGAGA----TTC----TCTCCGCCTGGGTTCAAATCCCAGTCCCGGCG---
D00011984 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Ser TGA -GCCGCCGTGCCCGAGC--GGACCAAGGGGTTCGGCTTGAGACCGAATCCCCG----ATA----AGGGGGCGGGGGTTCGAATCCCCCCGGCGGCG---
D00009799 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Ser TGA -GCCGGGGTGGCCGAGC--GGCCCAAGGCGCGGGACTTGAGATCCCGTCCCCG----TCC----AGGGGGCGTGGGTTCAAATCCCACCCCCGGCGCCA
D00009803 Pyrococcus_abyssi_GE5 Ser TGA -GCCGGGATAGCCTAGCCTGGT--AGGGCGCGGGCCTTGAGAGCCCGTGGGC-----GTTT----GCCCGCCGGGGTTCAAATCCCCGTCCCGGCGCC-
D00009807 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Ser TGA -GCCGGGATAGCCTAGCCTGGT--AGGGCGCGGGCCTTGAGAGCCCGTGGGC-----GTTT----GCCCGCCGGGGTTCAAATCCCCGTCCCGGCGCC-
D00009811 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Ser TGA -GCCGGGATAGCCTAGCCTGGT--AGGGCGCGGGCCTTGAGAGCCCGTGGGC-----GTTT----GCCCGCCGGGGTTCAAATCCCCGTCCCGGCGCCA
D00012031 Staphylothermus_marinus_F1 Ser TGA -GCCGGGGTGCCCGAGC--GGTCTAAGGGGCTGGCCTTGAGAGCCAGTGGGCC----AAGG---GGCCCGCGCGGGTTCGAATCCCGCCCCCGGCGCCA
D00012083 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Ser TGA -GCCGGGGTGCCCGAGC--GGTCCAAGGGGCTGGCCTTGAGAGCCAGTAGGG-----TTAT----CCCTGCGTGGGTTCAAATCCCACCCCCGGCG---
D00009815 Sulfolobus_solfataricus_P2 Ser TGA -GCCGGGGTGCCCGAGT--GGTCCAAGGGGCTGGCCTTGAGAGCCAGTAGGTG----TCT----AGCCTGCGCGGGTTCAAATCCCGCCCCCGGC----
D00009942 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Ser TGA -GCCGGGGTGCCCGAGT--GGACTAAGGGGCTGGCCTTGAGAGCCAGTGGGG-----ATCT----CCCCGCGCGGGTTCAAATCCCGCCCCCGGCG---
D00009819 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Ser TGA -GCCGCGGTGGCCCAGC--GGT--ACGGCGCCAGCCTTGAGAGCTGGTTCCC-----TTG-----TGGATCGGGAGTTCGAATCTCCCCCGCGGCG---
D00009823 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Ser TGA -GCCGCGGTGGCCCAGC--GGT--ACGGCGCCAGACTTGAGATCTGGTTCCC-----TTG-----TGGATCGGGAGTTCGAATCTCCCCCGCGGCG---
D00002627 Acholeplasma_laidlawii Ser TGA -GGAGGAATACCCAAGA--GGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGGTG---TAA---AAGCCG-CGGGGGTTCAAATCCCTCTTCCTCCGCCA
D00010210 Acinetobacter_sp._ADP1 Ser TGA -GGAAGCGTGGCAGAGC--GGTTTAATGCACCGGTCTTGAAAACCGACGAGGGT---GTGA--GTCCTC-CGTGAGTTCGAATCTCACCGCTTCCGCCA
D00009765 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Ser TGA -GGATGGGTGTCCGAGT--GGTTTAAGGAACCGGTCTTGAAAACCGGCGTGCGT---GAGA--GCGTAC-CGTGGGTTCGAATCCCACCCCATCTGCCA
D00009702 Aquifex_aeolicus_VF5 Ser TGA -GGAGGGGTGGCCGAGC--GGACGAAGGCGGGGGATTTGAAATCCCTTGGCGGGTT-ACA-GGCCCGCC-CGTGGGTTCGAATCCCACCCCCTCCGCCA
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D00010092 Bacillus_anthracis_str._Ames Ser TGA -GGAGGTATACCCAAGTTCGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGCGGT--GAG--AATCGCG-CGGGGGTTCGAATCCCTCTACCTCCTCCA
D00010093 Bacillus_anthracis_str._Ames Ser TGA -GGAGGTATACCCAAGCTCGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGCGGC--GAG--AGTCGCG-CGAGGGTTCGAATCCCTCTACCTCCTCCA
D00010094 Bacillus_anthracis_str._Ames Ser TGA -GGAGGTATACCCAAGTTCGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGCGGC--GAG--AGTCGCG-CGGGGGTTCGAATCCCTCTACCTCCTCCA
D00010129 Bacillus_anthracis_str._Sterne Ser TGA -GGAGGTATACCCAAGTCTGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGCGGC--GAG--AGTCGCG-CGGGGGTTCGAATCCCTCTACCTCCTCCA
D00010132 Bacillus_anthracis_str._Sterne Ser TGA -GGAGGTATACCCAAGTTCGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGCGGT--GAG--AATCGCG-CGGGGGTTCGAATCCCTCTACCTCCTCCA
D00010133 Bacillus_anthracis_str._Sterne Ser TGA -GGAGGTATACCCAAGCTCGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGCGGC--GAG--AGTCGCG-CGAGGGTTCGAATCCCTCTACCTCCTCCA
D00010134 Bacillus_anthracis_str._Sterne Ser TGA -GGAGGTATACCCAAGTTCGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGCGGC--GAG--AGTCGCG-CGGGGGTTCGAATCCCTCTACCTCCTCCA
D00010177 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Ser TGA -GGAGGTATACCCAAGTCTGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGCGGC--GAG--AGTCGCG-CGGGGGTTCGAATCCCTCTACCTCCTCCA
D00010180 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Ser TGA -GGAGGTATACCCAAGTTCGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGCGGT--GAG--AATCGCG-CGGGGGTTCGAATCCCTCTACCTCCTCCA
D00010181 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Ser TGA -GGAGGTATACCCAAGTTCGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGCGGC--GAG--AGTCGCG-CGGGGGTTCGAATCCCTCTACCTCCTCCA
D00010183 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Ser TGA -GGAGGTATACCCAAGTTCGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGCGGC--GAG--AGTCGCG-CGGGGGTTCGAATCCCTCTACCTCCTCCA
D00010051 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Ser TGA ----GGTATACCCAAGTCTGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGCGGC--GAG--AGTCGCG-CGGGGGTTCGAATCCCTCTACCTCCTCCA
D00010054 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Ser TGA -GGAGGTATACCCAAGTTCGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGCGGT--GAG--AATCGCG-CGGGGGTTCGAATCCCTCTACCTCCTCCA
D00010055 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Ser TGA -GGAGGTATACCCAAGTTCGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGCGGC--GAG--AGTCGCG-CGGGGGTTCGAATCCCTCTACCTCCTCCA
D00010005 Bacillus_halodurans_C-125 Ser TGA -GGAGGAGTACCCAAGTCTGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGCGGG--TTA--AACCGCG-CGGGGGTTCGAATCCCTCCTCCTCCGCCA
D00002649 Bacillus_subtilis Ser TGA -GGAGGAATACCCAAGTCTGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGGTG---TCAA--AGCCCG-CGGGGGTTCGAATCCCTCTTCCTCCGCCA
D00009592 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Ser TGA -GGAGGAATACCCAAGTCCGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGGGTG--TCA--AAGCCCG-CGGGGGTTCGAATCCCTCTTCCTCCGCCA
D00009593 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Ser TGA -GGAGGAATACCCAAGTCTGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGGTG---TCAA--AGCCCG-CGGGGGTTCGAATCCCTCTTCCTCCGCCA
D00010215 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Ser TGA -GGAGGTATACCCAAGTTCGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGCGGT--GAG--AATCGCG-CGGGGGTTCGAATCCCTCTACCTCCTCCA
D00010216 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Ser TGA -GGAGGTATACCCAAGTTCGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGCGGC--GAG--AGTCGCG-CGGGGGTTCGAATCCCTCTACCTCCTCCA
D00010217 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Ser TGA -GGAGGTATACCCAAGTCTGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGCGGT--GAG--AGTCGCG-CGGGGGTTCGAATCCCTCTACCTCCTCCA
D00010083 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Ser TGA -GGAGAGGTGGCAGAGT--GGTCGATTGCGGCGGTCTTGAAAACCGTTGTACT----GCGA---GGTAC-CCGGGGTTCGAATCCCTGTCTCTCCG---
D00010084 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Ser TGA -GGAGAGGTGGCAGAGT--GGTCGATTGCGGCGGTCTTGAAAACCGTTGTACC----GCGA---GGTAC-CCGGGGTTCGAATCCCTGTCTCTCCG---
D00010097 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Ser TGA -GGAGGGGTGGCCGAGC--GGTTTAAGGCACCGGTCTTGAAAACCGGCGTGCAG---GAGA--CTGTAC-CGTGGGTTCGAATCCCACCCCCTCCGCCA
D00010225 Bartonella_quintana_str._Toulouse Ser TGA -GGATGGGTGGCCGAGC--GGTTTAAGGCACCGGTCTTGAAAACCGGCGTGCAG---GAGA--CTGTAC-CGTGGGTTCGAATCCCACCCCCTCCGCCA
D00010099 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Ser TGA -GGAGAGTTGGTAGAGC--GGTTGAATACACCAGTCTTGAAAACTGGCAGCCCT---TCGC--GGGGCT-CGAGGGTTCGAATCCCTCACTCTCCGCCA
D00009967 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Ser TGA -GGACAGGTGTCTGAGC--GGCCTAAAGAGACGGTCTTGAAAACCGTTGAGGG----GCAA---CCCTC-CGCGAGTTCGAATCTCGCCCTGTCCG---
D00002635 Borrelia_burgdorferi Ser TGA -GGAGAGGTGGCAGACT--GGTTTAATGCTACGGTCTTGAAAACCGTTGTAGGT---GTAA--GCCTAC-CGTGAGTTCGAATCTCACCCTCTCCG---
D00009651 Borrelia_burgdorferi_B31 Ser TGA -GGAGAGGTGGCAGAGT--GGTTTAATGCTACGGTCTTGAAAACCGTTGTAGGT---GTAA--GCCTAC-CGTGAGTTCGAATCTCACCCTCTCCG---
D00010136 Borrelia_garinii_PBi Ser TGA -GGAGAGGTGGCAGAGT--GGTTTAATGCTACGGTCTTGAAAACCGTTGTAGGT---GTAA--GCCTAC-CGTGAGTTCGAATCTCACCCTCTCCG---
D00010008 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Ser TGA -GGAAGGGTGGCCGAGT--GGTTTAAGGCACCGGTCTTGAAAACCGGCGTGCCT---GCAA--GGGTAC-CGTGGGTTCGAATCCCACCCCTTCCGCCA
D00009738 Brucella_melitensis_16M Ser TGA -GGAAGGGTGGCCGAGC--GGTTTAAGGCACCGGTCTTGAAAACCGGCGTGCGA---GAGA--TCGTAC-CGTGGGTTCGAATCCCACCCCCTCCGCCA
D00009974 Brucella_suis_1330 Ser TGA -GGAAGGGTGGCCGAGC--GGTTTAAGGCACCGGTCTTGAAAACCGGCGTGCGA---GAGA--TCGTAC-CGTGGGTTCGAATCCCACCCCCTCCGCCA
D00009596 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Ser TGA -GGAGAGGTGGCCGAGC--GGTTTAAGGCAGCGGTCTTGAAAACCGCCGACGA----GAAA---TCGTC-CGAGAGTTCGAATCTCTCTCTCTCCG---
D00010057 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Ser TGA -GGAGGAATGGCTGAGT--GGTTTAAAGCAGCGGTCTTGAAAACCGCCGATGA----GAAA---TCATC-CGAGAGTTCGAATCCCTCTTCCTCCA---
D00009914 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Ser TGA -GGAGAGGTGGCCGAGT--GGTTTAAGGCAGCGGTCTTGAAAACCGCCGATGA----GCAA---TCATC-CGAGAGTTCGAATCTCTCTCTCTCCG---
D00009654 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Ser TGA -CGGGAGATGGCTGAGT--GGTCGAAAGCGGCGGTCTTGAAAACCGTTGAGGG----TCAC---ACCTC-CAGGGGTTCGAATCCCTTTCTCCCGGCCA
D00010229 Candidatus_Blochmannia_floridanus Ser TGA -GGAGGAGTGGCCGAGA--GGATGAAGGCGCCGGTCTTGAAAATCGGTAATGT----AAA----AAATT-CTAGAGTTCGAATCTCTACTCCTCCG---
D00010113 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Ser TGA -GGAAGAGTGGCAGAGT--GGCCGAATGCGTCTGTCTTGAAAACAGAAGTCGGGC--AGC--CCCCGAC-CGTGGGTTCGAATCCTACCTCTTCCG---
D00009658 Caulobacter_crescentus_CB15 Ser TGA -GGACAGGTGGCCGAGT--GGTTTAAGGCAGCGGTCTTGAAAACCGCCGTAGGT---GGAA--GCCTAC-CGTGGGTTCGAATCCCACCCTGTCCGCCA
D00009717 Chlamydia_muridarum_Nigg Ser TGA -GGAAGAATGGCAGAGC--GGTTTAATGCACCTGTCTTGAAAACAGGAGACCT----GAAA---GGGTC-CGGGGGTTCGAATCCCTCTTCTTCCG---
D00009588 Chlamydia_trachomatis Ser TGA -GGAAGAATGGCAGAGC--GGTTTAATGCACCTGTCTTGAAAACAGGAGACCT----GAAA---GGGTC-CGGGGGTTCGAATCCCTCTTCTTCC----
D00009581 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Ser TGA -GGAAGAATGGCAGAGC--GGTTTAATGCACCTGTCTTGAAAACAGGAGACCT----GAAA---GGGTC-CGGGGGTTCGAATCCCTCTTCTTCCG---
D00009576 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Ser TGA -GGAAGAATGGCAGAGC--GGTTTAATGCACCTGTCTTGAAAACAGGAGACCT----GAAA---GGGTC-CGGGGGTTCGAATCCCTCTTCTTCCG---
D00009580 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Ser TGA -GGAAGAATGGCAGAGC--GGTTTAATGCACCTGTCTTGAAAACAGGAGACCT----GAAA---GGGTC-CGGGGGTTCGAATCCCTCTTCTTCCG---
D00009627 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Ser TGA -GGAAGAATGGCAGAGC--GGTTTAATGCACCTGTCTTGAAAACAGGAGACCT----GAAA---GGGTC-CGGGGGTTCGAATCCCTCTTCTTCCG---
D00009906 Chlorobium_tepidum_TLS Ser TGA -GGAGGATTAGCCTAATT-GGT--AAGGCAGCAGTCTTGAAAACTGCCGGGT-----TTGC----GCCCTTGGGGGTTCGAGTCCCTCATCCTCCG---
D00009728 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Ser TGA -GGAAAGATGGTCGAGTT-GGTTTAAGGCACCGGTCTTGAAAACCGGCGTGCGG---GTAA--CCGCAC-CTAGGGTTCGAATCCCTATCTTTCCGCCA
D00009713 Clostridium_perfringens_str._13 Ser TGA -GGAGAGATGGTCGAGTT-GGTTTAAGGCACCGGTCTTGAAAACCGGCGTGCGT---GTGA--GCGTAC-CATGGGTTCGAATCCCATTCTCTCCGCCA
D00010013 Clostridium_tetani_E88 Ser TGA -GGAAAGATGGTCGAGTT-GGTTTAAGGCACCGGTCTTGAAAACCGGCGTACGG---GTGA--CCGTAC-CGTGGGTTCGAATCCCACTCTTTCCGCCA
D00010102 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Ser TGA -GGAGATGTGGCAGAGC--GGCCGAATGCACTGGTCTTGAAAACCAGCGATGG----GAAA---CCATC-CCAGGGTTCAAATCCCTGCGTCTCCG---
D00009975 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Ser TGA -GGAGACGTGACAGAGC--GGCCGAATGTACTGGTCTTGAAAACCAGCGATGG----GAAA---CCATC-CGAGGGTTCAAATCCCTCCGTCTCCG---
D00009920 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Ser TGA -GGAGACGTGACAGAGC--GGCCGAATGTACTGGTCTTGAAAACCAGCGATGG----GAAA---CCATC-CGAGGGTTCAAATCCCTCCGTCTCCG---
D00010049 Coxiella_burnetii_RSA_493 Ser TGA -GGAGAGGTGGCAGAGC--GGTTGAATGCGACGGTCTTGAAAACCGTTGAGGGG---GCAA--CTCCTC-CGAGGGTTCGAATCCCTCCCTCTCCGCCA
D00009662 Deinococcus_radiodurans_R1 Ser TGA -GGGGGGTTGGCCGAGT--GGTTGAAGGCAACGGTCTTGAAAACCGTAGTGGG----GCAA---CCTAC-CGGGGGTTCGAATCCCTCACCCCTCGCCA
D00010184 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Ser TGA -GGAAGGGTGGCAGAGTCCGGTTTATTGCGGCGGTCTTGAAAACCGTTGTGGGG---GGAA--CCCCAC-CGGGGGTTCGAATCCCTCCCCTTCCGCCA
D00010014 Enterococcus_faecalis_V583 Ser TGA -GGAGGATTACCCAAGTCCGGCTGAAGGGAACGGTCTTGAAAACCGTCAGGCGGG--TAA--AACCGTG-CAAGGGTTCGAATCCCTTATCCTCCT---
D00002653 Escherichia_coli Ser TGA -GGAAGTGTGGCCGAGC--GGTTGAAGGCACCGGTCTTGAAAACCGGCGACCC----GAAA---GGGTT-CCAGAGTTCGAATCTCTGCGCTTCCGCCA
D00010061 Escherichia_coli_CFT073 Ser TGA -GGAAGTGTGGCCGAGC--GGTTGAAGGCACCGGTCTTGAAAACCGGCGACCC----GAAA---GGGTT-CCAGAGTTCGAATCTCTGCGCTTCCGCCA
D00009631 Escherichia_coli_K12 Ser TGA -GGAAGTGTGGCCGAGC--GGTTGAAGGCACCGGTCTTGAAAACCGGCGACCC----GAAA---GGGTT-CCAGAGTTCGAATCTCTGCGCTTCCGCCA
D00009635 Escherichia_coli_O157:H7 Ser TGA -GGAAGTGTGGCCGAGC--GGTTGAAGGCACCGGTCTTGAAAACCGGCGACCC----GAAA---GGGTT-CCAGAGTTCGAATCTCTGCGCTTCCGCCA
D00009639 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Ser TGA -GGAAGTGTGGCCGAGC--GGTTGAAGGCACCGGTCTTGAAAACCGGCGACCC----GAAA---GGGTT-CCAGAGTTCGAATCTCTGCGCTTCCGCCA
D00009908 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Ser TGA -GGAAGGCTATCCTAATT-GGT--AAGGAACCGGTCTTGAAAACCGGCGTC------GTAA-----GACTTTAGAGTTCGAGTCTCTAGCCTTCCGCCA
D00010138 Geobacter_sulfurreducens_PCA Ser TGA -GGAGGGATGGCCGAGT--GGTTTAAGGCGGCGGTCTTGAAAACCGTTGAAC-----GAAA----GTTC-CGTGGGTTCGAATCCTACTCCCTCCGCCA
D00002656 Haemophilus_influenzae Ser TGA -GGAGGAATGGTCGAGT--GGTTGAAGGCACCGGTCTTGAAAACCGGCCAGGGTT--TTA--CGCCCTC-CTAGGGTTCGAATCCCTATTCCTCCG---
D00002658 Haemophilus_influenzae Ser TGA -GGAGGAATGGTCGAGT--GGTTGAAGGCACCGGTCTTGAAAACCGGCGAGGGTT--TAC--GGCCCTC-CTAGGGTTCGAATCCCTATTCCTCCGCC-
D00009648 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Ser TGA -GGAGGAATGGTCGAGT--GGTTGAAGGCACCGGTCTTGAAAACCGGCGAGGGT---TTAC--GCCCTC-CTAGGGTTCGAATCCCTATTCCTCCGCCA
D00002643 Helicobacter_pylori Ser TGA -CGGGAGATGGCTGAGT--GGTTGAAAGCGGCGGTCTTGAAAACCGTTGAGGG----TCAT---ACCTC-CGGGGGTTCGAATCCCTCTCTCCCGGCCA
D00009642 Helicobacter_pylori_26695 Ser TGA -CGGGAGATGGCTGAGT--GGTTGAAAGCGGCGGTCTTGAAAACCGTTGAGGG----TCAT---ACCTC-CGGGGGTTCGAATCCCTCTCTCCCGGCCA
D00009645 Helicobacter_pylori_J99 Ser TGA -CGGGAGATGGCTGAGT--GGTTGAAAGCGGCGGTCTTGAAAACCGTTGAGGG----TCAT---ACCTC-CGGGGGTTCGAATCCCTCTCTCCCGGCCA
D00010142 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Ser TGA -AGGAGTGTAGCCAAAT--GGT--ACGGCATCGTGTTTGAGCCCGAGTT-------------------A-TGTTGGTTCGAGTCCAGCCACTCCTA---
D00010146 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Ser TGA -GGAGGATTACCCAAGTCCGGCTGAAGGGAACGGTCTTGAAAACCGTCAGGCGGG--TTC--TGCCCGCGCGTGGGTCCGAATCCCACATCCTCCT---
D00010021 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Ser TGA -GGAGGATTACCCAAGTCTGGCTGAAGGGAACGGTCTTGAAAACCGTCAGGTGGG--TCA--AACCACG-CGAGAGTTCGAATCTCTCATCCTCCT---
D00002647 Lactococcus_lactis Ser TGA -GGAGGATTACCCAAGTCCGGCTGAAGGGAACGGTCTTGAAAACCGTCAGGCGT---GTAA--AAGCGTGCGTGGGTTCGAATCCCACATCCTCCT---
D00010148 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Ser TGA -GGAGGGCTGTCCGAGC--GGCCGATGGAGCCAGTCTTGAAAACTGGTGGGCA----GAAA---TGTCT-CGTGGGTTCGAATCCCACGCCCTCCGCCA
D00009980 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Ser TGA -GGAGAAGTGGCTGAGT--GGTCTAAAGCAGCGGTCTTGAAAACCGTCGTGGT----AAT----CCCAC-CGTGGGTTCGAATCCTACCTTCTCCG---
D00009706 Listeria_innocua_Clip11262 Ser TGA -GGAGGAATACCCAAGTCTGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGCGGG--TAA--TACCGCG-CGGGGGTTCGAATCCCTCTTCCTCCG---
D00009711 Listeria_monocytogenes_EGD-e Ser TGA -GGAGGAATACCCAAGTCTGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGCGGG--TAA--TACCGCG-CGGGGGTTCGAATCCCTCTTCCTCCG---
D00010191 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Ser TGA -GGAGGAATACCCAAGTCTGGCTGAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGCGGG--TAA--TACCGCG-CGGGGGTTCGAATCCCTCTTCCTCCG---
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D00010286 Pan_troglodytes Ser TGA -GTAGTCGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTTGAAATCCATTGGGG-----TTT-----CCCCGCGCAGGTTCGAATCCTGTCGGCTACG---
D00010287 Pan_troglodytes Ser TGA -GTAGTCGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTTGAAATCCATTGGGG-----TCT-----CCCCGCGCAGGTTCGAATCCTGCCGACTACG---
D00010288 Pan_troglodytes Ser TGA -GTAGTCGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTTGAAATCCATTGGGG-----TTT-----CCCCGCGCAGGTTCGAATCCTGCCGACTACG---
D00010289 Pan_troglodytes Ser TGA -GCAGCGATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTTGGACTTGAAATCCAATGGGG-----TCT-----CCCCGCGCAGGTTCGAACCCTGCTCGCTGCG---
D00002869 Plasmodium_falciparum Ser TGA -AGAGAAATGACAGAGT--GGTTTATTGTGTTTGATTTGAGATCAAAAAAATAT---AAAT--ATATTT-CATGGGTTCAAATCCCATTTTCTCTT---
D00010221 Plasmodium_falciparum_3D7 Ser TGA -GACAGTTTGCCCGAGT--GGTT-AAGGGGTTGGACTTGAAATCCAATGAGC-----TTT-----GCTTGCGCAGGTTCGAATCCTGCAGCTGTCG---
D00002909 Podocoryne_carnea Ser TGA -GCTGCGATGGCCGACT--GGTT-AAGGCGTTAGACTTGAAATCTAATGGGA-----TCT-----TCCCGCGTAGGTTCGAACCCTACTCGCAGCG---
D00002875 Podospora_anserina Ser TGA -GTCAGCATGGCAGAGT--GGTCTAATGCGTTAGACTTGAAATCTAATTCC------TTCG-----GGAGCGTAGGTTCGAACCCTACTGCTGACG---
D00002876 Podospora_anserina Ser TGA -GGCGCGATGGCAGAGT--GGTCTAATGCGTGAGACTTGAAATCTCATTTC------TTCG-----GAAGCGTCGGTTCAAATCCGGCTCGCGTCG---
D00002880 Saccharomyces_cerevisiae Ser TGA -GGCACTATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGACAGACTTGAAATCTGTTGGGC-----TCT-----GCCCGCGCTGGTTCAAATCCTGCTGGTGTCG---
D00009890 Saccharomyces_cerevisiae Ser TGA -GGCACTATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGACAGACTTGAAATCTGTTGGGC-----TCT-----GCCCGCGCTGGTTCAAATCCTGCTGGTGTCG---
D00002882 Schizosaccharomyces_pombe Ser TGA -GTCACTATGTCCGAGT--GGTT-AAGGAGTTAGACTTGAAATCTAATGGGC-----TTT-----GCCCGCGCAGGTTCAAATCCTGCTGGTGACG---
D00002883 Schizosaccharomyces_pombe Ser TGA -GTCACTATGTCCGAGT--GGTT-AAGGAGTTAGACTTGAAATCTAATGGGC-----TCT-----GCCCGCGCAGGTTCAAATCCTGCTGGTGACG---
D00009902 Schizosaccharomyces_pombe Ser TGA -GTCACTATGTCCGAGT--GGTT-AAGGAGTTAGACTTGAAATCTAATGGGC-----TTT-----GCCCGCGCAGGTTCAAATCCTGCTGGTGACG---
D00009903 Schizosaccharomyces_pombe Ser TGA -GTCACTATGTCCGAGT--GGTT-AAGGAGTTAGACTTGAAATCTAATGGGC-----TCT-----GCCCGCGCAGGTTCAAATCCTGCTGGTGACG---
D00010264 Takifugu_rubripes Ser TGA -GTTGTGGTGGCCGAGC--GATT-AAGGTGATGGACTTGAACTTCAATGGAA-----TCC-----TCCCGTGCAGGTTGGAGTCTTGCCAGCAACG---
D00010265 Takifugu_rubripes Ser TGA -AAGAAAGTGACAGAGT--GGT--TTTGTAGCTGGCTTGAAACCAGTTT-------------------A-CGGGGGTTCGATTCCTCCCTTTCTCG---
D00010266 Takifugu_rubripes Ser TGA -GTTGTTGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTTGAAATCCATTGGGG-----TCT-----CCCTGCGTAGGTTCGAATCCTGCCAACAACG---
D00010267 Takifugu_rubripes Ser TGA -GCTGTGATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTTGGACTTGAAATCCAATGGGA-----TCT-----TCCCGCGCAGGTTCAAGTCCTGCTCACAGCG---
D00010268 Takifugu_rubripes Ser TGA -GCTGCGATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTTGGACTTGAAATCCAATGGGA-----TCT-----TCCCGCGCAGGTTCGAACCCTGCTCGCAGCG---
D00010269 Takifugu_rubripes Ser TGA -GCTGTGATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTTGGACTTGAAATCCAATGGGG-----TCT-----CCCCGCGCAGGTTCGAACCCTGCTCGCAGCG---
D00002900 Triticum_aestivum Ser TGA -GGATGGATGTCTGAGC--GGTTGAAAGAGTCGGTCTTGAAAACCGAAGTATTG---ATAG--GAATAC-CGGGGGTTCGAATCCCTCTCCATCCG---
D00009777 Aeropyrum_pernix_K1 Ser GGA -GCCGGGGTGCCCGAGC--GGTCCAAGGGGACGGGCTGGAGACCCGTTGCCCC----GCGA---GGGGCGCGCGGGTTCGAATCCCGCCCCCGGCGCC-
D00002607 Archaeoglobus_fulgidus Ser GGA -GCCGGGGTTGCCGAGC--GGT--AAGGCGCACGCCTGGAGAGCGTGTGGGC-----GTTC----GCCCGCGTGGGTTCGAATCCCACCCCCGGCG---
D00009781 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Ser GGA -GCCGGGGTTGCCGAGC--GGT--AAGGCGCACGCCTGGAGAGCGTGTGGGC-----GTTC----GCCCGCGTGGGTTCGAATCCCACCCCCGGCG---
D00009785 Halobacterium_sp._NRC-1 Ser GGA -GCCGGGATGGCCGAAT--GGC--AAAGCGCACGCCTGGAAAGCGTGTCCCCT----TAC----GGGGT-TCAGGGTTCAAATCCCTGTCCCGGCG---
D00002611 Methanocaldococcus_jannaschii Ser GGA -GCGGAGGTAGCCTAGCCCGGCC-AAGGCGTGGGACTGGAGATCCCATGGGC-----TTT-----GCCCGCGGGGGTTCAAATCCCCCCCTCCGCG---
D00009791 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Ser GGA -GCGGAGGTAGCCTAGCCCGGCC-AAGGCGTGGGACTGGAGATCCCATGGGGC----TTT----GCCCCGCGGGGGTTCAAATCCCCCCCTCCGCGCC-
D00011871 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Ser GGA -GCAGAGATAGTCTAGCTCGGT--AAGGCGTGGGACTGGAAATCCCATGGGGC----TTT----GCTCCGCGGGGGTTCAAATCCCCCTCTCTGCG---
D00009794 Methanococcus_maripaludis Ser GGA -GCAGAGATAGTCTAGCCTGGG--AAGGCGTACGGCTGGAAACCGTATGAGGC----TTT----GCCTCCCGGGGGTTCAAATCCCCCTCTCTGCGCC-
D00009965 Methanopyrus_kandleri_AV19 Ser GGA -GCCGGGGCGGCCGAGCCCGGTCCAAGGCGCGGGATTGGAGATCCCGTGGCCC----GTAT---GGGCCGCCCGGGTTCAAATCCCGGCCCCGGCGCCA
D00011882 Methanosarcina_acetivorans_C2A Ser GGA -GCCGAGGTAGTCTAGC--GGT--AGGGCGCAAGCCTGGAAAGCTTGTGGGGC----TTA----GCCCCTCGGGAGTTCAAATCTCCCCCTCGGCG---
D00009912 Methanosarcina_mazei_Go1 Ser GGA -GCCGAGGTAGTCTAGT--GGT--AGGGCGCAAGCCTGGAAAGCTTGTGGGGC----TTA----GCCCCTCGGGAGTTCGAATCTCCCCCTCGGCG---
D00011946 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Ser GGA -GCTGAGGTAGTCTAGTCTGGG--AAGGCGCAAGATTGGAAATCTTGTGGGA-----GCAA----TCCCTCGGGAGTTCAAATCTCCCCCTTAGCG---
D00009788 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Ser GGA -GCCGGGATAGCCTAGCCAGGT--AAGGCGCAAGACTGGAAATCTTGTGGAGC----TTT----GCTCCTCCTGGGTTCAAATCCCAGTCCCGGCG---
D00012000 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Ser GGA -GCCGCCGTGCCCGAGC--GGACCAAGGGGTTCGGCTGGAGACCGAATCCCCG----ATA----AGGGGGCGGGGGTTCGAATCCCCCCGGCGGCG---
D00009798 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Ser GGA -GCCGGGGTGGCCGAGC--GGCCCAAGGCGCGGGACTGGAGATCCCGTCCCCG----TCT----AGGGGGCCCGGGTTCAAATCCCGGCCCCGGCG---
D00009802 Pyrococcus_abyssi_GE5 Ser GGA -GCCGGGGTAGCCTAGCCAGGG--AAGGCGCGGGCCTGGAGAGCCCGTGGGC-----GTTC----GCCCACCGGGGTTCAAATCCCCGCCCCGGCGCC-
D00009806 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Ser GGA -GCCGGGGTAGCCTAGCCAGGG--AAGGCGCGGGCCTGGAGAGCCCGTGGGC-----GTTC----GCCCACCGGGGTTCAAATCCCCGCCCCGGCGCC-
D00009810 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Ser GGA -GCCGGGGTAGCCTAGCCTGGG--AAGGCGCGGGCCTGGAGAGCCCGTGGGC-----GTTT----GCCCACCGGGGTTCAAATCCCCGCCCCGGCGCCA
D00012025 Staphylothermus_marinus_F1 Ser GGA -GCCGGGGTGCCCGAGC--GGACTAAGGGGCTGGCCTGGAGAGCCAGTGCCCC----ATAC---GGGGCGCGCGGGTTCGAATCCCGCCCCCGGCGCCA
D00012088 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Ser GGA -GCCGGGGTGCCCGAGT--GGACTAAGGGGCTGGCCTGGAGAGCCAGTGTGGA----TCT----TCCACGCGCGGGTTCAAATCCCGCCCCCGGCG---
D00009814 Sulfolobus_solfataricus_P2 Ser GGA -GCCGGGGTGCCCGAGC--GGACTAAGGGGCTGGCCTGGAGAGCCAGTGGGGG----TTT----CCCCG-CGCGGGTTCAAATCCCGCCCCCGGC----
D00009941 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Ser GGA -GCCGGGGTGCCCGAGC--GGTCTAAGGGGGCGGCCTGGAGAGCCGTTGGGGG----TTT----CCCCG-CGCGGGTTCAAGTCCCGCCCCCGGCG---
D00009818 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Ser GGA -GCTGGGATAGCCTAGCCCGGT--AAGGCGCAGGTCTGGAAAACCTGTGCTCG----TAT----AGAGCTCGGGAGTTCAAATCTCCCTCCCAGCG---
D00009822 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Ser GGA -GCTGGGATAGCCTAGCCTGGT--AAGGCGCAGGTCTGGAAAACCTGTGCTC-----ATTA----GAGCTCGGGAGTTCAAATCTCCCTCCCAGCG---
D00010209 Acinetobacter_sp._ADP1 Ser GGA -GGTGAGGTGTCCGAGT--GGCTTAAGGAGCACGCCTGGAAAGTGTGTATACGT---TTTC--GCGTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCACCGCCA
D00009763 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Ser GGA -GGACAGGTGGCCGAGT--GGTTTAAGGCGCACGCCTGGAACGCGTGTGTGCGT---GAAA--GCGTAC-CGTGGGTTCGAATCCCACCCTGTCCGCCA
D00009701 Aquifex_aeolicus_VF5 Ser GGA -GGAAGGGTGGCCGAGC--GGTCGAAGGCGCGGCGCTGGAAACGCCGTGTACCCC--GTTT-GGGGTAC-CGAGGGTTCGAATCCCTCCCCTTCCGCCA
D00010091 Bacillus_anthracis_str._Ames Ser GGA -GGAGAGCTGTCCGAGTT-GGCCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTATACGTC--ACA--AGCGTAT-CAAGGGTTCGAATCCCTTGCTCTCCGCCA
D00010131 Bacillus_anthracis_str._Sterne Ser GGA -GGAGAGCTGTCCGAGTT-GGCCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTATACGTC--ACA--AGCGTAT-CAAGGGTTCGAATCCCTTGCTCTCCGCCA
D00010179 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Ser GGA -GGAGAGCTGTCCGAGTT-GGCCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTATACGTC--ACA--AGCGTAT-CAAGGGTTCGAATCCCTTGCTCTCCGCCA
D00010053 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Ser GGA ---AGAGCTGTCCGAGTT-GGCCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTATACGTC--ACA--AGCGTAT-CAAGGGTTCGAATCCCTTGCTCTCCGCCA
D00010004 Bacillus_halodurans_C-125 Ser GGA -GGAGAGCTGTCCGAGTT-GGCCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTAGGCGGTG-ACA-AACCGTCT-CGAGGGTTCGAATCCCTCGCTCTCCGCCA
D00002651 Bacillus_sp._PS3 Ser GGA -GGAGAGCTGTCCGAGT--GGTCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTAGGCGTG--AAT--AGCGCCT-CAAGGGTTCGAATCCCTTGCTCTCCGCCA
D00002648 Bacillus_subtilis Ser GGA -GGAGAGCTGTCCGAGT--GGTCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTAGGCGGT--CAAC-TCCGTCT-CAAGGGTTCGAATCCCTTGCTCTCCGCCA
D00009591 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Ser GGA -GGAGAGCTGTCCGAGT--GGTCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTAGGCGGT--CAAC-TCCGTCT-CAAGGGTTCGAATCCCTTGCTCTCCGCCA
D00010214 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Ser GGA -GGAGAGCTGTCCGAGTT-GGCCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTATACGTC--ACA--AGCGTAT-CAAGGGTTCGAATCCCTTGCTCTCCGCCA
D00010080 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Ser GGA -GGAGAGATGCTCGAGT--GGTTGAAGAGGCACGCCTGGAAAGCGTGTATACGCC--AAA--AGTGTAT-CGCGGGTTCGAATCCCGCTCTCTCCG---
D00010082 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Ser GGA -GGAGAGGTGCTCGAGT--GGTTGAAGAGGCACGCCTGGAAAGCGTGTATACGCC--AAA--AGTGTAT-CCGGGGTTCGAATCCCCGTCTCTCCG---
D00010096 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Ser GGA -GGAGAGGTGGCCGAGT--GGTTGAAGGCGCACGCCTGGAACGCGTGTATATGG---GAAA--CCATAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00010224 Bartonella_quintana_str._Toulouse Ser GGA -GGAGAGGTGGCCGAGT--GGTTGAAGGCGCACGCCTGGAACGCGTGTATATAG---GAAA--CTATAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00010101 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Ser GGA -GGAGAGGTGGCCGAGT--GGTTGAAGGCGCACGCCTGGAACGCGTGTGTAGGTC--ACA--AGCCTAC-CGAGAGTTCGAATCTCTCTCTCTCCGCCA
D00009969 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Ser GGA -GGAGGATTCGCCTAGT--GGTCTATGGCGCACGCTTGGAAAGCGTGTTGGTG----TAA----CAGCCTCACGAGTTCGAATCTCGTATCCTCCG---
D00002636 Borrelia_burgdorferi Ser GGA -GGAGAGATGGCCGAGT--GGCTTAAGGCGCACGCTTGGAAAGCGTGTATACAG---TAAA--ATGTAT-CATGGGTTCGAATCCCATTCTCTCCG---
D00009650 Borrelia_burgdorferi_B31 Ser GGA -GGAGAGATGGCCGAGT--GGCTTAAGGCGCACGCTTGGAAAGCGTGTATACAG---TAAA--ATGTAT-CATGGGTTCGAATCCCATTCTCTCCG---
D00010137 Borrelia_garinii_PBi Ser GGA -GGAGAGATGGCCGAGT--GGCTTAAGGCGCACGCTTGGAAAGCGTGTATACGG---TAAA--ATGTAT-CATGGGTTCGAATCCCATTCTCTCCG---
D00010006 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Ser GGA -GGAGAGATGGCCGAGT--GGCTTAAGGCGCACGCTTGGAAAGCGTGTGTGCGG---GAAA--CCGTAC-CGTGGGTTCGAATCCCACTCTCTCCGCCA
D00009737 Brucella_melitensis_16M Ser GGA -GGAGAGGTGGCCGAGT--GGTTGAAGGCGCACGCCTGGAACGCGTGTATACGG---GAAA--CCGTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00009972 Brucella_suis_1330 Ser GGA -GGAGAGGTGGCCGAGT--GGTTGAAGGCGCACGCCTGGAACGCGTGTATACGG---GAAA--CCGTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00009595 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Ser GGA -GGTGAGGTGTCCGAGA--GGCTTAAGGAGCACGCCTGGAAAGCGTGTATATG----GAAA---CGTAT-CAAGGGTTCGAATCCCTTTCTCACCA---
D00010059 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Ser GGA -GGTGAGATGTCCGAGA--GGATTAAGGAGCACGCCTGGAAAGCGTGTATACGATT-TTA-AAACGTAT-CAAGGGTTCGAATCCCTTTCTCACCG---
D00009916 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Ser GGA -GGTGAGATGTCCGAGA--GGCTTAAGGAACACGCCTGGAAAGCGTGTATATG----GAAA---CGTAT-CAAGGGTTCGAATCCCTTTCTCACCA---
D00009653 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Ser GGA -AGACAGGTGTCCGAGC--GGTTGAAGGAGCACGCCTGGAACGCGTGTAAAGT----GCAA---GCTTT-CGAGGGTTCGAATCCCTTCCTGTCTGCCA
D00010228 Candidatus_Blochmannia_floridanus Ser GGA -GGTGAGGTGTCCGAGA--GGCTCAAGGAGCATGCCTGGAAAGCATGTATACATA--TAA--TATGTAT-CAAGGGTTCGAATCCCTTCCTCACCG---
D00010115 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Ser GGA -GGAGGGGTGTCCGAGT--GGCTTAAGGAGCACGCTTGGAAAGCGTGTGTACGTT--AAA--CACGTAC-CGTGGGTTCGAATCCCACCTCCTCCG---
D00009657 Caulobacter_crescentus_CB15 Ser GGA -GGTGAGGTGGCCGAGT--GGTTGAAGGCGCACGCCTGGAACGCGTGTATAGGG---GAAA--CTCTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCACCGCCA
D00009719 Chlamydia_muridarum_Nigg Ser GGA -GGAGAGATGTCCGAGT--GGCTTAAGGAGCACGCTTGGAAAGCGTGTGTGCGT---TAAC--GCGTAC-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCG---
D00009587 Chlamydia_trachomatis Ser GGA -GGAGAGATGTCCGAGT--GGCTTAAGGAGCACGCTTGGAAAGCGTGTGTGCGT---TAAC--GCGTAC-CGTGGGTTCGAATCCCACTCTCTCC----
D00009584 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Ser GGA -GGAGAGATGTCCGAGT--GGCTTAAGGAGCACGCTTGGAAAGCGTGTGTGCGT---TAAC--GCGTAC-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCG---
D00009575 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Ser GGA -GGAGAGATGTCCGAGT--GGCTTAAGGAGCACGCTTGGAAAGCGTGTGTGCGT---TAAC--GCGTAC-CGTGGGTTCGAATCCCACTCTCTCCG---
D00009579 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Ser GGA -GGAGAGATGTCCGAGT--GGCTTAAGGAGCACGCTTGGAAAGCGTGTGTGCGT---TAAC--GCGTAC-CGTGGGTTCGAATCCCACTCTCTCCG---
D00009626 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Ser GGA -GGAGAGATGTCCGAGT--GGCTTAAGGAGCACGCTTGGAAAGCGTGTGTGCGT---TAAC--GCGTAC-CGTGGGTTCGAATCCCACTCTCTCCG---
D00009907 Chlorobium_tepidum_TLS Ser GGA -GGAGAGATCGCATAGTT-GGTCTAGTGCGCTCGCCTGGAAAGCGGGTAGGGTG---TAA---CAGCCCTCGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00009731 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Ser GGA -GGAGAGATGTCCGAGT--GGTTTAAGGAGCACGCCTGGAACGCGTGTGTAGGG---GAAA--CTCTAC-CGAGGGTTCGAATCCCTCTTTCTCCGCCA
D00002661 Clostridium_perfringens Ser GGA -GGAGAGATGTCCGAGT--GGTCGAAGGAGCACGCCTGGAACGCGTGTGTAGGG---GAAA--CTCTAC-CGAGGGTTCAAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00009715 Clostridium_perfringens_str._13 Ser GGA -GGAGAGATGTCCGAGT--GGTCGAAGGAGCACGCCTGGAACGCGTGTGTAGGG---GAAA--CTCTAC-CGAGGGTTCAAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00010010 Clostridium_tetani_E88 Ser GGA -GGAGAGATGTCCGAGA--GGTTGAAGGAGCACGCCTGGAAAGCGTGTGTAGGG---GCAA--CTCTAC-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00010105 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Ser GGA -GGAGGATTCGACTAGC--GGCCTATGTCACACGCCTGGAACGCGTGCGGGTT----TCAC---GACCCTCGTGGGTTCAAATCCCACATCCTCCG---
D00009978 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Ser GGA -GGAGGATTCGACTAGC--GGCCTATGTCGCTCGCCTGGAACGCGGGTTGGGA----GCAA---TCCCT-CAGGGGTTCAAATCCCCTATCCTCCG---
D00009923 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Ser GGA -GGAGGATTCGACTAGC--GGCCTATGTCGCTCGCCTGGAACGCGGGTTGGGA----GCAA---TCCCT-CAGGGGTTCAAATCCCCTATCCTCCG---
D00010047 Coxiella_burnetii_RSA_493 Ser GGA -GGAGAGGTGCTCGAGT--GGTTGAAGAGGCACGACTGGAAATCGTGTGTGCGTT--AAT--CACGTAC-CGAGGGTTCGAATCCCTCCCTCTCCGCCA
D00009661 Deinococcus_radiodurans_R1 Ser GGA -GGAACGGTGTCCGAGT--GGTTGAAGGAGCACGCCTGGAAAGCGTGTATAGGG---GCAA--CTCTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCGTTCCGCCA
D00010185 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Ser GGA -GGAGAGGTGTCCGAGAT-GGCCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTGTACCCT--AAC--CCGGTAC-CGAGAGTTCGAATCTCTCCCTCTCCGCCA
D00010016 Enterococcus_faecalis_V583 Ser GGA -GGAGAGTTGTCCGAGA--GGCCGAAGGAGCATGATTGGAAATCATGTAGGCGGT--AAAC-ACTGTCT-CAAGGGTTCGAATCCCTTACTCTCCG---
D00002655 Escherichia_coli Ser GGA -GGTGAGGTGTCCGAGT--GGCTGAAGGAGCACGCCTGGAAAGTGTGTATACG----GCAA---CGTAT-CGGGGGTTCGAATCCCCCCCTCACCGCCA
D00010060 Escherichia_coli_CFT073 Ser GGA -GGTGAGGTGTCCGAGT--GGCTGAAGGAGCACGCCTGGAAAGTGTGTATACG----GCAA---CGTAT-CGGGGGTTCGAATCCCCCCCTCACCGCCA
D00009630 Escherichia_coli_K12 Ser GGA -GGTGAGGTGTCCGAGT--GGCTGAAGGAGCACGCCTGGAAAGTGTGTATACG----GCAA---CGTAT-CGGGGGTTCGAATCCCCCCCTCACCGCCA
D00009634 Escherichia_coli_O157:H7 Ser GGA -GGTGAGGTGTCCGAGT--GGCTGAAGGAGCACGCCTGGAAAGTGTGTATACG----GCAA---CGTAT-CGGGGGTTCGAATCCCCCCCTCACCGCCA
D00009638 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Ser GGA -GGTGAGGTGTCCGAGT--GGCTGAAGGAGCACGCCTGGAAAGTGTGTATACG----GCAA---CGTAT-CGGGGGTTCGAATCCCCCCCTCACCGCCA
D00010141 Geobacter_sulfurreducens_PCA Ser GGA -GGAGAGATGTCCGAGT--GGCCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTGTACT----GCAA---GGTAC-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00002657 Haemophilus_influenzae Ser GGA CGGTGAGATGTCCGAGTG-GGTTGAAGGAGCACGCCTGGAAAGCGTGTATGTGGC--AAA--CCTGCAT-CAAGGGTTCAAATCCCTTTCTCACCGCC-
D00002660 Haemophilus_influenzae Ser GGA -GGTGAGATGTCCGAGT--GGTTGAAGGAGCACGCCTGGAAAGCGTGTATGTGG---GAAA--CTGCAT-CAAGGGTTCAAATCCCTTTCTCACCGCCA
D00009647 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Ser GGA -GGTGAGATGTCCGAGT--GGTTGAAGGAGCACGCCTGGAAAGCGTGTATGTGG---GAAA--CTGCAT-CAAGGGTTCAAATCCCTTTCTCACCGCCA
D00002644 Helicobacter_pylori Ser GGA -GGGGAGATGTCCGAGT--GGTTGAAGGAGCACGCCTGGAACGCGTGTAAGGT----GCAA---GCCTT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00009641 Helicobacter_pylori_26695 Ser GGA -GGGGAGATGTCCGAGT--GGTTGAAGGAGCACGCCTGGAACGCGTGTAAGGT----GCAA---GCCTT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00009644 Helicobacter_pylori_J99 Ser GGA -GGGGAGATGTCCGAGT--GGTTGAAGGAGCACGCCTGGAACGCGTGTAAGGT----GCAA---GCCTT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00010143 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Ser GGA -GGAGTGTTGTCCGAGT--GGCTGAAGGAGCATGATTGGAAATCATGTATACGGGC-TTT-ACCTGTAT-CGAGAGTTCGAATCTCTCACACTCCG---
D00010018 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Ser GGA -GGAGAGTTGTCCGAGT--GGCTGAAGGAGCAGCATTGGAAATGCTGTAAACGGGT-TAT-ACCTGTTT-CAAGGGTTCGAATCCCTTACTCTCCG---
D00010149 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Ser GGA -GGAGAATTCGCCTAGT--GGCCTATGGCGCACGCTTGGAAAGCGTGTTGGGT----GCAA---GCCCT-CGGGGGTTCGAATCCCCCATTCTCCG---
D00009981 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Ser GGA -GGAGAAGTGTCAGAGT--GGTCTATTGTGCATGCTTGGAAAGCATGTGTGCC----AAA----AGCAC-CCCGGGTTCGAATCCCGGCTTCTCCG---
D00009707 Listeria_innocua_Clip11262 Ser GGA -GGAGAGCTGTCCGAGT--GGCCGAAGGAGCACGGTTGGAAACCGTGTAGGCGGT--GTAA-GCTGTCT-CAAGGGTTCGAATCCCTTGCTCTCCG---
D00009712 Listeria_monocytogenes_EGD-e Ser GGA -GGAGAGCTGTCCGAGT--GGCCGAAGGAGCACGGTTGGAAACCGTGTAGGCGGT--GTAA-GCTGTCT-CAAGGGTTCGAATCCCTTGCTCTCCG---
D00010192 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Ser GGA -GGAGAGCTGTCCGAGT--GGCCGAAGGAGCACGGTTGGAAACCGTGTAGGCGGT--GTAA-GCTGTCT-CAAGGGTTCGAATCCCTTGCTCTCCG---
D00009740 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Ser GGA -GGAGAGGTGGCCGAGT--GGTTGAAGGCGCACGCCTGGAAAGTGTGTTTACGG---GAGA--CCGTAA-CGCGGGTTCGAATCCCGCTCTCTCCGCCA
D00010040 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Ser GGA -GGAGGATTCGCCTAGT--GGCCTATGGCGCTCGCCTGGAACGCGGGTTGGGTT---AAC---AGCCCT-CGCGGGTTCAAATCCCGCATCCTCCGCCA
D00009620 Mycobacterium_leprae_TN Ser GGA -GGAGGATTCGCCTAGT--GGCCTATGGCGCTCGCCTGGAACGCGGGTTGGGTT---AAC---AGCCCT-CGCGGGTTCAAATCCCGCATCCTCCG---
D00009599 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Ser GGA -GGAGGATTCGCCTAGT--GGCCTATGGCGCTCGCCTGGAACGCGGGTTGGGTT---AAC---AGCCCT-CGCGGGTTCAAATCCCGCATCCTCCGCCA
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D00010272 Pan_troglodytes Ser AGA -TGAGTTGTAGCTGAGT--GGTT-AAGGCAACGAGCTAGAAATTCGTTGGTT-----TCT-----CTCTGTGCAGGTTTGAATCCTGCTAATTATG---
D00010273 Pan_troglodytes Ser AGA -GTAGTCGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTAGAAATCCATTGGGG-----TCT-----CCCCGCGCAGGTTCGAATCCTGCCGACTACG---
D00010274 Pan_troglodytes Ser AGA -GTAGTCGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTAGAAATCCATTGGGG-----TTT-----CCCCGCGCAGGTTCGAATCCTGCCGACTACG---
D00010275 Pan_troglodytes Ser AGA -GTAGTCGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGGTGGACTAGAAATCCATTGGGG-----TCT-----CCCCGCGCAGGTTCGAATCCTGCCGACTACG---
D00010218 Plasmodium_falciparum_3D7 Ser AGA -GACAGTGTGTCCGAGT--GGTT-AAGGAGTCAGACTAGAAATCTGGTAGGC-----TTT-----GCCTGCGCAGGTTCGAATCCTGCCGCTGTCG---
D00002908 Podocoryne_carnea Ser AGA -GCTGCGATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTTTGACTAGAAATCAAATGGGA-----TCT-----TCCCGCGTAGGTTCGAATCCTACTCGCAGCG---
D00002877 Saccharomyces_cerevisiae Ser AGA -GGCAACTTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGAAAGATTAGAAATCTTTTGGGC-----TTT-----GCCCGCGCAGGTTCGAGTCCTGCAGTTGTCG---
D00009886 Saccharomyces_cerevisiae Ser AGA -GGCAACTTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGAAAGATTAGAAATCTTTTGGGC-----TTTG----GCCCGCGCAGGTTCGAGTCCTGCAGTTGTC----
D00009887 Saccharomyces_cerevisiae Ser AGA -GGCAACTTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGAAAGATTAGAAATCTTTTGGGC-----TTT-----GCCCGCGCAGGTTCGAGTCCTGCAGTTGTCG---
D00002885 Schizosaccharomyces_pombe Ser AGA -GACACTATGCCTGAGT--GGTT-AAAGGGACAGACTAGAAATCTGTTGCGG-----TCT-----CCGCGCGCAGGTTCAAATCCTGCTGGTGTCG---
D00009899 Schizosaccharomyces_pombe Ser AGA -GACACTATGCCTGAGT--GGTT-AAAGGGACAGACTAGAAATCTGTTGCGG-----TCT-----CCGCGCGCAGGTTCAAATCCTGCTGGTGTCG---
D00010246 Takifugu_rubripes Ser AGA -GTTGTTGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTAGAAATCCATTGGGG-----TCT-----CCCTGCGTAGGTTCGAATCCTGCCAACAAAG---
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D00010249 Takifugu_rubripes Ser AGA -GTTGTTGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTAGAAATCCATTGGGG-----TCT-----CCCTGCGTAGGTTCGAATCCTGCCAACAACG---
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D00010252 Takifugu_rubripes Ser AGA -GTTGTCGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTAGAAATCCATTGGGG-----TCT-----CCCCGCGCAGGTTCGAATCCTGCCGACAACG---
D00002870 Tetrahymena_pyriformis Ser AGA -GACAATTTGTCCGAGT--GGTT-AAGGAGGAAGACTAGAAATCTTTTGGG------TTTA-----CCCGCGCAGGTTCGAATCCTGCAGTTGTCG---
D00004668 Aeropyrum_pernix_K1 Glu CTC -GCCGCGGTAGTATAGCCCGGCCCAGTATGCGGGCCTCTCGAGCCCGTG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGCGGCACC-
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D00004670 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Glu CTC -GCTCCGGTGGTGTAGCCCGGCCAATCATACGGGACTCTCGATCCCGTG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGAGCA---
D00004672 Halobacterium_sp._NRC-1 Glu CTC -GCTCCGTTGGTGTAGTCCGGCCAATCATCTTGCCCTCTCACGGCAAGG-------------------A-CTAGGGTTCAAATCCCTGACGGAGCA---
D00011897 Methanosarcina_acetivorans_C2A Glu CTC -GCTCCGATAGTGTAGCTCGGCCAATCATTCAGGACTCTCACTCCTGCG-------------------A-CTGGGGTTCAAATCCCCATCGGAGCA---
D00004731 Methanosarcina_mazei_Go1 Glu CTC -GCTCCGATAGTGTAGCTCGGCCAATCATTCAGGACTCTCACTCCTGCG-------------------A-CTGGGGTTCAAATCCCCATCGGAGCA---
D00011934 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Glu CTC -GCTGATATAGTGTAGG--GGTCAATCATGCAGGACTCTCACTCCTGCG-------------------A-CTGGGGTTCAAATCCCCATATCAGCA---
D00004677 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Glu CTC -CAGCCGGTAGTCTAGCCCGGACAAGGATGCGGGCCTCTCGAGCCCGTG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGGGCA---
D00004678 Pyrococcus_abyssi_GE5 Glu CTC -GCCCCGGTGGTGTAGCCCGGTCAATCATGCGGGACTCTCGATCCCGCG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGGGCACC-
D00004680 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Glu CTC -GCCCCGGTGGTGTAGCCCGGTCAATCATGCGGGACTCTCGATCCCGCG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGGGCACC-
D00004682 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Glu CTC -GCCCCGGTGGTGTAGCCCGGTCAATCATGCGGGACTCTCGATCCCGCG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGGGCACCA
D00012033 Staphylothermus_marinus_F1 Glu CTC -GCCGCCGTAGTATAGCCCGGCCAAGTATGCGGGCCTCTCGGGCCCGTGCG------CGGG-----AGA-CCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCGGCA---
D00004684 Sulfolobus_solfataricus_P2 Glu CTC -GCCGCGGTGGTTTAGCCCGGTC-AGAATGCGGGCCTCTCGAGCCCGTG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGCGGC----
D00004743 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Glu CTC -GCCGCGGTAGTATAGCCCGGTC-AGTATGCGGGCCTCTCAAGCCCGTG-------------------G-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGCGGCA---
D00004686 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Glu CTC -GCTCCGGTGGTGTAGTCCGGCCAAGCATTAGGGACTCTCAATCCCCCG-------------------A-CTCGGGTCCAAATCCCGACCGGAGCA---
D00004688 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Glu CTC -GCTCCGGTGGTGTAGTCCGGCCAAGCATTAGGGACTCTCAATCCCCCG-------------------A-CTCGGGTCCAAATCCCGACCGGAGCA---
D00004810 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Glu CTC -GGTGGGTTCGTCTAAC--GGTT-AGGACACATGCCTCTCACGCATGTA-------------------A-TACGAGTTCGATTCTCGTACCCACTA---
D00004756 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Glu CTC -GCCCCCATCGTCTAGC--GGTCTAGGACTACGCCCTCTCACGGCGCCA-------------------A-CACCGGTTCAAATCCGGTTGGGGGTA---
D00004775 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Glu CTC -GCTCCCTTCGTCTAGC--GGTT-AGGACGCGGCCCTCTCAAGGCTGAA-------------------A-CAGGGGTTCGATTCCCCTAGGGAGCGCCA
D00004653 Brucella_melitensis_16M Glu CTC -GCGCCCATCGTCTAGC--GGTC-AGGACGGCGCCCTCTCACGGCGCAA-------------------A-CAGGGGTTCGATTCCCCTTGGGCGTACCA
D00004728 Chlorobium_tepidum_TLS Glu CTC -GGCGTGTTCGTCTAGT--GGCCCAGGACATCGCCCTCTCAAGGCGAAG-------------------ATCACGGGTTCGAATCCCGTACACGCTACCA
D00004650 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Glu CTC -GGCCCTATGGTCAAGC--GGTT-AAGACATCGCCCTCTCAAGGCGGAA-------------------T-CACGGGTTCGATTCCCGTTGGGGCTACCA
D00004777 Clostridium_tetani_E88 Glu CTC -GGTCTCTTGGTCAAGT--GGTT-AAGACGCCACCCTCTCAAGGTGGAA-------------------T-CGGGAGTTCGATCCTCCTAGAGACTGCCA
D00004818 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Glu CTC -GCCCCGTTCGTCTAGC--GGCCTAGGACGTCGGCCTCTCACGCCGGTA-------------------A-CACGGGTTCAAATCCCGTACGGGGTA---
D00004758 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Glu CTC -GCCCCGTTCGTCTAGA--GGCCTAGGACGCCGGCCTCTCACGCCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGGTA---
D00004759 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Glu CTC -GCCCCGTTCGTCTAGA--GGCCTAGGACGCCGGCCTCTCACGCCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGGTA---
D00004735 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Glu CTC -GCCCCGTTCGTCTAGC--GGCCTAGGACGCCGGCCTCTCACGCCGGTA-------------------A-CACGGGTTCAAATCCCGTACGGGGTA---
D00004736 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Glu CTC -GCCCCGTTCGTCTAGT--GGCCTAGGACGCCGGCCTCTCACGCCGGTA-------------------A-CACGGGTTCAAATCCCGTACGGGGTA---
D00004798 Coxiella_burnetii_RSA_493 Glu CTC -GCTCCCTTCGTCTAGA--GGCCTAGGACACCGCCCTCTCACAGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTAGGGAGCACCA
D00004840 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Glu CTC -TGCCCGTTGGTCAAAT--GGTT-AAGACGCCACCCTCTCAAGGTGGAG-------------------T-TACGAGTTCAATTCTCGTACGGGTGA---
D00004780 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Glu CTC -TGCCCGCTGGTCAAATT-GGTT-AAGACGTCGCCCTCTCAAGGCGGAG-------------------T-TACGGGTTCGATCCCCGTGCGGGTGA---
D00004843 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Glu CTC -GGCCCCATCGTCTAGC--GGCCTAGGACGTCGCCCTCTCACGGCGGTA-------------------A-CGCGGGTTCAAATCCCGCTGGGGTCA---
D00004656 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Glu CTC -GCGCCCATCGTCTAGC--GGTC-AGGACACCGCCCTCTCACGGCGGGA-------------------A-CAGGGGTTCGATTCCCCTTGGGCGTACCA
D00004795 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Glu CTC -GGCCCCGTCGTCTAGC--GGCCTAGGACGCCGCCCTCTCACGGCGGTA-------------------G-CGTGGGTTCGAATCCCATCGGGGCTA---
D00004613 Mycobacterium_leprae_TN Glu CTC -GGCCCCGTCGTCTAGC--GGCCTAGGACGCCGCCCTCTCACGGCGGTA-------------------G-CGTGGGTTCGAATCCCATCGGGGCTA---
D00004604 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Glu CTC -GGCCCCGTCGTCTAGC--GGCCTAGGACGCCGCCCTCTCACGGCGGTA-------------------G-CGTGGGTTCGAATCCCATCGGGGCTA---
D00004822 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Glu CTC -GGCCCCGTCGTCTAGC--GGCCTAGGACGCCGCCCTCTCACGGCGGTA-------------------G-CGTGGGTTCGAATCCCATCGGGGCTA---
D00004863 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Glu CTC -GGCCCCGTAGTGCAGC--GGCCTAGCACGCGGCCCTCTCAAGGCTGAA-------------------A-CGGCGGTTCGAATCCGCTCGGGGCTACCA
D00004825 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Glu CTC -GCTCCCTTCGTCTAGC--GGTT-AGGACGCGGCCCTCTCAAGGCTGAA-------------------A-CAGGGGTTCGATTCCCCTAGGGAGCGCCA
D00000519 Ruminobacter_amylophilus Glu CTC -GTCCCTTC-GTCTAGT--GGTCTAGGACATCGCCCTCTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAACCCCGTAGGGGACGCCA
D00004667 Sinorhizobium_meliloti_1021 Glu CTC -GCGCCCATCGTCTAGC--GGTT-AGGACGCCGCCCTCTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAGTCCCGTTGGGCGTACCA
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D00004765 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Glu CTC -GCCCCCGTTGTGTAGC--GGCCTAGCACGCCGCCCTCTCAAGGCGGTA-------------------G-CGCCGGTTCGAATCCGGTCGGGGGTA---
D00004766 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Glu CTC -GCCCCCGTTGTGTAGC--GGCCTAGCACGCCGCCCTCTCAAGGCGGTA-------------------G-CGCCGGTTCGAATCCGGTCGGGGGTA---
D00000530 Streptomyces_lividans Glu CTC -GCCCCCGTTGTGTAGC--GGCCTAGCACGCCGCCCTCTCAAGGCGGTA-------------------G-CGCCGGTTCGAATCCGGTCGGGGGTA---
D00000531 Streptomyces_lividans Glu CTC --CCCCCGTTGTGTAGC--GGCCTAGCACGCCGCCCTCTCAAGGCGGTA-------------------G-CGCCGGTTCGAATCCGGTCGGGGGTA---
D00000529 Streptomyces_rimosus Glu CTC -GCCCCCGTTGTGTAGC--GGCCTAGCACGCCGCCCTCTCAAGGCGGTA-------------------G-CGCCGGTTCGAATCCGGTCGGGGGTA---
D00004848 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Glu CTC -GGCCCCATCGTCTAGA--GGTCTAGGACGGCGCCCTCTCACGGCGCAA-------------------A-CAGGGGTTCGAATCCCCTTGGGGTCACCA
D00004849 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Glu CTC -GGCCCCATCGTCTAGA--GGCCTAGGACGGCGCCCTCTCACGGCGCAA-------------------A-CAGGGGTTCGAATCCCCTTGGGGTCACCA
D00004745 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Glu CTC -GGCCCCATCGTCTAGC--GGCCTAGGACACCGCCCTCTCACGGCGGAG-------------------A-CAGGGGTTCGAGTCCCCTTGGGGCTACCA
D00004637 Thermotoga_maritima_MSB8 Glu CTC -GGCCCCATAGGATAAC--GGCC-AGTCCGCCGGATTCTCAGTCCGGAG-------------------G-TCGGGGTTCGATTCCCCGTGGGGCTGCCA
D00004865 Thermus_thermophilus_HB27 Glu CTC TGGCCCCATCGTCTAGA--GGCCTAGGACACGGCCCTCTCAAGGCCGAG-------------------A-CGGGGGTTCGAATCCCCCTGGGGTCACCA
D00004867 Thermus_thermophilus_HB27 Glu CTC AGGCCCCATCGTCTAGC--GGTT-AGGACGCGGCCCTCTCAAGGCCGAA-------------------A-CGGGGGTTCGATTCCCCCTGGGGTCACCA
D00004869 Treponema_denticola_ATCC_35405 Glu CTC -GGTCCCTTCGTCTATC--GGTT-AGGACATGAGATTCTCAATCTTAAA-------------------A-GACGGGTTCGATTCCCGTAGGGACCG---
D00000526 Treponema_pallidum Glu CTC -GGTCCCTTCGTCTATC--GGTT-AGGACATGAGATTCTCAATCTCAAA-------------------A-GACGGGTTCAATTCCCGTAGGGACTA---
D00004633 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Glu CTC -GGTCCCTTCGTCTATC--GGTT-AGGACATGAGATTCTCAATCTCAAA-------------------A-GACGGGTTCAATTCCCGTAGGGACTA---
D00004785 Tropheryma_whipplei_str._Twist Glu CTC -GGCCCCATCGTCTAGA--GGTCTAGGACGTCGCCCTCTCACGGCGGTA-------------------G-CGCGGGTTCGAATCCCGCTGGGGTCA---
D00004788 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Glu CTC -GGCCCCATCGTCTAGA--GGTCTAGGACGTCGCCCTCTCACGGCGGTA-------------------G-CGCGGGTTCGAATCCCGCTGGGGTCA---
D00004750 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Glu CTC -GCTCCCTTCGTCTAAT--GGTT-AGGACGTGGCCCTCTCAAGGCTAAA-------------------A-CAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGGAGCACCA
D00004748 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Glu CTC -GCTCCCTTCGTCTAGC--GGTT-AGGACGTGGCCCTCTCAAGGCTAAA-------------------A-CAGGGGTTCGAGCCCCCTAGGGAGCGCCA
D00004639 Xylella_fastidiosa_9a5c Glu CTC -GCTCCCTTCGTCTAGC--GGTT-AGGACATGGCCCTCTCAAGGCTAAA-------------------A-CAGGGGTTCGAGCCCCCTAGGGAGCGCCA
D00004790 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Glu CTC -GCTCCCTTCGTCTAGC--GGTT-AGGACATGGCCCTCTCAAGGCTAAA-------------------A-CAGGGGTTCGAGCCCCCTAGGGAGCGCCA
D00000649 Arabidopsis_thaliana Glu CTC -TCCGTTGTAGTCTAGCT-GGTC-AGGATACTCGGCTCTCACCCGAGAG-------------------A-CCCGGGTTCGAGTCCCGGCAACGGAG---
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D00004704 Arabidopsis_thaliana Glu CTC -TCCGTTGTAGTCTAGCT-GGTC-AGGATACTCGGCTCTCACCCGAGAG-------------------A-CCCGGGTTCGAGTCCCGGCAACGGAG---
D00004705 Arabidopsis_thaliana Glu CTC -TCCGTTGTAGTCTAGCT-GGTT-AGGATACTCGGCTCTCACCCGAGAG-------------------A-CCCGGGTTCGAGTCCCGGCAACGGAG---
D00004706 Arabidopsis_thaliana Glu CTC -TCCGTCGTAGTCTAGCT-GGTT-AGGATACTCGGCTCTCACCCGAGAG-------------------A-CCCGGGTTCGAGTCCCGGCGACGGAG---
D00000650 Caenorhabditis_elegans Glu CTC -TCCGTTGTGGTCTAGT--GGTT-AGGATTTATGGCTCTCACCCATAAG-------------------G-CCGGGGTTCGATTCCCCGCAACGGAA---
D00004712 Caenorhabditis_elegans Glu CTC -TCCGTTGTTGTCTAGT--GGTT-AGGATTTATGGCTCTCACCCATAAG-------------------G-CCGGGGTTCGATTCCCCGCAACAAA----
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D00004714 Caenorhabditis_elegans Glu CTC -TCCGTTGTGGTCTAGT--GGTT-AGGATTTATGGCTCTCACCCATAAG-------------------G-CCGGGGTTCGATTCCCCGCAACGAAA---
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D00004716 Caenorhabditis_elegans Glu CTC -TCCGTTGTGGTCTAGT--GGTT-AGGATTTATGGCTCTCACCCATAAG-------------------G-CCGGGGTTCGATTCCCCGCAACGGAA---
D00004854 Candida_glabrata_CBS_138 Glu CTC -TCCGATGTAGTGTAAC--GGCT-ATCACATCACGCTCTCACCGTGGAG-------------------A-CCGGGGTTCGACTCCCCGCTTCGGAG---
D00000653 Drosophila_melanogaster Glu CTC -TCCTATATTGTCTAGT--GGTT-AGGATATCCGGCTCTCACCCGGAAG-------------------G-CCCGGGTTCAATTCCCGGTATGGGAA---
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D00004723 Drosophila_melanogaster Glu CTC -TCCCATATTGTCTAGT--GGTT-AGGATATCCGGCTCTCACCCGGAAG-------------------G-CCCGGGTTCAATTCCCGGTATGGGAA---
D00004724 Drosophila_melanogaster Glu CTC -TCCCATATTGTCTAGT--GGTT-AGGATACCCGGCTCTCACCCGGGAG-------------------G-CCCGGGTTCAATTCCCGGTATGGGAA---
D00004752 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Glu CTC -TCCTTGTTGGTCCAGT--GGTT-AGGATAGCTGCCTCTCACGCAGCAG-------------------G-CTCGGGTTCGATTCCCGGACGAGGAA---
D00004879 Gallus_gallus Glu CTC -TCCCTGGTGGTCTAGT--GGTT-AGGATTCGGCGCTCTCACCGCCGCG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGTCAGGGAA---
D00004690 Homo_sapiens Glu CTC -CCCCTGGTGGTCTATC--GGTT-AGGATTCAGACCTCTCACCACTGCT-------------------A-CCCATGCTCGATTCCTGGTCAGGGA----
D00004691 Homo_sapiens Glu CTC -CCCCGGGTGGTGTAGT--GGAT-GGGATTTGGCGCTCTCACCACCATG-------------------G-CCCGGATTTGATTCCCGGTCAGGGA----
D00004692 Homo_sapiens Glu CTC -TCCTTGATG-TCTAGT--GGTT-AGGATTTGGTGCTCTCACTGCAGCA-------------------G-CCTGGGTTCATTTCTCAGTCAGGGA----
D00004693 Homo_sapiens Glu CTC -CCCCTGGTGGTCTAGT--GCTT-AGGATTCGGTGCTCTCACCGCTGCT-------------------G-CCTGCGTTCGATTCCCGGTCAGGGA----
D00004694 Homo_sapiens Glu CTC -TCCCTGGTGGTCTAGT--GGTT-AGGATTCGGCGCTCTCACCGCCGCG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGTCAGGGAA---
D00000656 Mus_musculus Glu CTC -TCCCTGGTGGTCTAGT--GGTT-AGGATTCGGCGCTCTCACCGCCGCG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCTCGGTCAGGGAA---
D00004902 Pan_troglodytes Glu CTC -TCCCTGGTAGTCTAGT--GGCT-AAAGTTTGGCGCTCTCACCGCCGG----------------------GACTGGTTGATTCCAGATCAGGGGA----
D00004903 Pan_troglodytes Glu CTC -CCCCTGGTAGTCTAGT--GGTT-AGGCTTTGCCACTCTCAGTGCCGCT-------------------G-CCTGGGTTGGATTCCCAGTCACGTGA---
D00004904 Pan_troglodytes Glu CTC -TCCTTGAT-GTCTAGT--GGTT-AGGATTTGGTGCTCTCACTGCAGCA-------------------G-CCTGGGTTCATTTCCCAGTCAGGGAA---
D00004905 Pan_troglodytes Glu CTC -TTCCCCTTGGTCTAGT--GGTT-AGGATTCAGCACTCTCACCGCTGCA-------------------G-CCCGGGTTTGATTCCCGGCAGGGAAG---
D00004906 Pan_troglodytes Glu CTC -TCCCTGGTGGTCTAGT--GGTT-AGGATTCGGCGCTCTCACCGCCGCG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGTCAGGGAA---
D00004875 Plasmodium_falciparum_3D7 Glu CTC -TCCCACGTGGTCTAGT--GGCT-AGGATATTCGGCTCTCACCCGAAAG-------------------G-CCCGGGTTCAATTCCCGGCGTGGGAA---
D00000657 Rattus_norvegicus Glu CTC -TCCTTGGTGGTCTAGT--GGTT-AGGATTCGGCGCTCTCACCGCCGCG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGTCAGGGAA---
D00000658 Rattus_norvegicus Glu CTC -TCCCTGGTGGTCTAGT--GGTT-AGGATTCGGCGCTCTCACCGCCGCG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGTCAGGGAA---
D00000659 Rattus_norvegicus Glu CTC -TCGCTGGTGGTCTAGT--GGTT-AGGATTCGGCGCTCTCACCGCCGCG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGTCAGGGAA---
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D00000648 Schizosaccharomyces_pombe Glu CTC -TCCGTCATGGTCCAGT--GGCT-AGGATTCATCGCTCTCACCGATGCG-------------------G-CGGGGGTTCGATTCCCCCTGACGGAG---
D00004726 Schizosaccharomyces_pombe Glu CTC -TCCGTCATGGTCCAGT--GGCT-AGGATTCATCGCTCTCACCGATGCG-------------------G-CGGGGGTTCGATTCCCCCTGACGGAG---
D00004888 Takifugu_rubripes Glu CTC -TCCCTGGTGGTCTAGT--GGTC-AGGATTCGGCGCTCTCACTGCCGTG-------------------G-CCTGGGTTCGATTCCCAGTCAGGGAA---
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D00000513 Archaeoglobus_fulgidus Glu TTC -GCTCCGGTGGTGTAGCCCGGCCAATCATTCCGGCCTTTCGAGCCGGCG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGAGCA---
D00004671 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Glu TTC -GCTCCGGTGGTGTAGCCCGGCCAATCATTCCGGCCTTTCGAGCCGGCG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGAGCA---
D00004673 Halobacterium_sp._NRC-1 Glu TTC -GCTCGGTTGGTGTAGTCCGGCCAATCATGTTGGCCTTTCGAGCCGACG-------------------A-CCAGGGTTCAAATCCCTGACCGAGCA---
D00000516 Methanocaldococcus_jannaschii Glu TTC -GCTCCGGTGGTGTAGTCCGGCCAATCATGCGGGCCTTTCGAGCCCGCG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGAGCA---
D00004675 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Glu TTC -GCTCCGGTGGTGTAGTCCGGCCAATCATGCGGGCCTTTCGAGCCCGCG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGAGCA---
D00011853 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Glu TTC -GCTCCAGTGGTGTAGTCCGGCCAATCATGCAGGCCTTTCGAGCCTGCG-------------------A-CTCGGGTTCAAATCCCGGCTGGAGCA---
D00004676 Methanococcus_maripaludis Glu TTC -GCTCCAGTGGTGTAGTCCGGCCAATCATCCGGCCCTTTCGAGGCCGGG-------------------A-CTCGGGTTCAAATCCCGGCTGGAGC----
D00000517 Methanococcus_vannielii Glu TTC -GCTCCGGTGGTGTAGTCCGGCCAATCATGCTGGCCTTTCGAGCCAGCG-------------------A-CTCGGGTTCAAATCCCGGCCGGAGCA---
D00011885 Methanosarcina_acetivorans_C2A Glu TTC -GCTCCGGTAGTGTAGTCCGGCCAATCATTCCGGCCTTTCGAGCCGAAG-------------------A-CTCGGGTTCGAATCCCGGCCGGAGCACCA
D00004732 Methanosarcina_mazei_Go1 Glu TTC -GCTCCGGTAGTGTAGTCCGGCCAATCATTCCGGCCTTTCGAGCCGAAG-------------------A-CTCGGGTTCGAATCCCGGCCGGAGCACCA
D00011935 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Glu TTC -GCTGATATAGTGTAGTCCGGCCAATCATGTCGGCCTTTCACGCCGACG-------------------A-CTGGGGTTCGAATCCCCATATCAGCA---
D00004674 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Glu TTC -GCTCCGGTAGTGTAGTCCGGCCAATCATTTCGGCCTTTCGAGCCGAAG-------------------A-CTCGGGTTCAAATCCCGGCCGGAGCA---
D00000518 Methanothermus_fervidus Glu TTC -GCTCCGGTGGTGTAGCCCGGCCAATCATTTCGGCCTTTCGAGCCGAAG-------------------A-CTCGGGTTCAAATCCCGACCGGAGCA---
D00004679 Pyrococcus_abyssi_GE5 Glu TTC -GCCCCGGTGGTGTAGCCCGGTCAAACATGCGGGCCTTTCGAGCCCGCG-------------------C-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGGGCACC-
D00000515 Pyrococcus_furiosus Glu TTC -GCCCCGGTGGGTAGCCC-GGTCAAACATGCGGGCCTTTCGAGCCCGCG-------------------C-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGGGCACCA
D00004681 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Glu TTC -GCCCCGGTGGTGTAGCCCGGTCAAACATGCGGGCCTTTCGAGCCCGCG-------------------C-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGGGCACC-
D00004683 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Glu TTC -GCCCCGGTGGTGTAGCCCGGCCAAACATGCGGGCCTTTCGAGCCCGCG-------------------C-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGGGCACCA
D00012055 Staphylothermus_marinus_F1 Glu TTC -GCCGCCGTAGTATAGCCCGGCCAAGTATGCGGGCCTTTCGAGCCCGTG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCGGCA---
D00004685 Sulfolobus_solfataricus_P2 Glu TTC -GCCGCGGTGGTTTAGCCCGGTC-AGAATGCGGGCCTTTCGAGCCCGTG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGCGGC----
D00004744 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Glu TTC -GCCGCGGTAGTATAGCCCGGTCAAGCACGCGGGCCTTTCGAGCCCGTG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGCGGCA---
D00004687 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Glu TTC -GCTCCGGTGGTGTAGTCCGGACAAGCATATCGGCCTTTCGAGCCGACG-------------------A-CCTGGGTCCAAATCCCGGCCGGAGCA---
D00004689 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Glu TTC -GCTCCGGTGGTGTAGTCCGGACAAGCATATCGGCCTTTCGAGCCGACG-------------------A-CCTGGGTCCAAATCCCGGCCGGAGCA---
D00000525 Acholeplasma_laidlawii Glu TTC -GGCCCGTTGGAGAAAC--GGTT-AACTCACATGCCTTTCACGCATGCA-------------------TTCACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCACCA
D00004871 Acinetobacter_sp._ADP1 Glu TTC -GTCCCTATCGTCTAGA--GGCCTAGGACATCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CCGGGGTTCGAATCCCCGTAGGGACGCCA
D00000542 Aeromonas_hydrophila Glu TTC -GTCCCCTTCGCTAGA---GGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCA
D00004664 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Glu TTC -GCGCCCTTCGTCTATC--GGTT-AGGACGTCAGATTTTCATTCTGAAA-------------------A-GAGGGGTTCGACTCCCCTAGGGCGTGCCA
D00004641 Aquifex_aeolicus_VF5 Glu TTC -GCCCCCGTCGTCTAGCCTGGCCTAGGACGCCGGCCTTTCACGCCGGAA-------------------A-CGCGGGTTCAAATCCCGCCGGGGGTGCCA
D00004872 Bacillus_anthracis_str._A2012 Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGT--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCA---
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D00004814 Bacillus_anthracis_str._Ames Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGT--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-AACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCACCA
D00004815 Bacillus_anthracis_str._Ames Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGT--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCACCA
D00004829 Bacillus_anthracis_str._Sterne Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGT--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCA---
D00004830 Bacillus_anthracis_str._Sterne Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGT--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-AACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCACCA
D00004831 Bacillus_anthracis_str._Sterne Glu TTC -GGCCTGTTGGTCAAGT--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCACCA
D00004832 Bacillus_anthracis_str._Sterne Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGT--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCACCA
D00004833 Bacillus_anthracis_str._Sterne Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGT--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCA---
D00004834 Bacillus_anthracis_str._Sterne Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGT--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCA---
D00004835 Bacillus_anthracis_str._Sterne Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGT--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCA---
D00004856 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGT--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCA---
D00004857 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGT--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCACCA
D00004858 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGT--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCA---
D00004799 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGT--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCA---
D00004800 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGT--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCACCA
D00004772 Bacillus_halodurans_C-125 Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGT--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCA---
D00004773 Bacillus_halodurans_C-125 Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGT--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCACCA
D00000540 Bacillus_sp._PS3 Glu TTC -GGCCCTGTGGTCAAGT--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAA-TCCGTACGGGTCA---
D00000538 Bacillus_subtilis Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGC--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCA---
D00000539 Bacillus_subtilis Glu TTC -GGCCCGTTGGTAAAC---GGT--TAAGCACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCA---
D00004602 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGC--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCA---
D00004873 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGT--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCA---
D00004874 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGT--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCACCA
D00004811 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Glu TTC -GGCCCGTTCGTCTATC--GGTT-AGGACGCAAGATTTTCATTCTTGAA-------------------A-GGGGGGTTCGATTCCCCCACGGGCTA---
D00004816 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Glu TTC -GCGCCCATCGTCTAGC--GGTC-AGGACGCCGCCCTTTCACGGCGGAA-------------------A-CAGGGGTTCGATTCCCCTTGGGCGTACCA
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D00004817 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Glu TTC -GTTCCCATCGTCTAGG--GGCCTAGGACACCTCCCTTTCACGGAGGAT-------------------A-CAGGGGTTCAAATCCCCTTGGGAACGCCA
D00004755 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Glu TTC -GCCCCCATCGTCTAAC--GGTT-AGGACACCAGACTTTCAATCTGACA-------------------A-CGAGAGTTCGACTCTCTCTGGGGGTA---
D00000528 Borrelia_burgdorferi Glu TTC -GTCCTCTTCGTCTATC--GGTT-AGGACTCCAGGTTTTCATCCTGGCA-------------------A-GAGGGGTTCGATTCCCCTAGAGGATG---
D00004626 Borrelia_burgdorferi_B31 Glu TTC -GTCCTCTTCGTCTATC--GGTT-AGGACTCCAGGTTTTCATCCTGGCA-------------------A-GAGGGGTTCGATTCCCCTAGAGGATG---
D00004774 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Glu TTC -GCTCCCTTCGTCTATC--GGTT-AGGACGCCACCCTTTCACGGTGGAG-------------------A-GAGCGGTTCGATTCCGCTAGGGAGCGCCA
D00004654 Brucella_melitensis_16M Glu TTC -GCGCCCATCGTCTAGC--GGTT-AGGACGCCGCCCTTTCACGGCGGAA-------------------A-CAGGGGTTCGATTCCCCTTGGGCGTACCA
D00004757 Brucella_suis_1330 Glu TTC -GCGCCCATCGTCTAGC--GGTT-AGGACGCCGCCCTTTCACGGCGGAA-------------------A-CAGGGGTTCGATTCCCCTTGGGCGTACCA
D00004603 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Glu TTC -GTCCCCTTCGTCTAGA--GGTCTAGGACATCGCCCTTTCACGGCGGCA-------------------A-CAGGGGTTCAAATCCCCTAGGGGACG---
D00004801 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Glu TTC -GTCCCCTTCGTCTAGA--GGACTAGGACATCGCCCTTTCACGGCGATA-------------------A-CAGGGGTTCAAATCCCCTAGGGGACA---
D00004733 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Glu TTC -GTCCCCTTCGTCTAGA--GGTT-AGGACATCGCCCTTTCACGGCGGCA-------------------A-CAGGGGTTCAAATCCCCTAGGGGACG---
D00004627 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Glu TTC -GGCCCATTCGTCTAGC--GGTT-AGGACATCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGAGTTCGAGTCTCGTATGGGTCACCA
D00004878 Candidatus_Blochmannia_floridanus Glu TTC -GTCCCCTTCGTCTAGA--GGTT-AGGACACTGCCCTTTCACGGCGGCA-------------------A-CAGGGGTTCGAAACCCCTAGGGGACA---
D00004823 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Glu TTC -GGCCCCATCGTCTAGCCAGGTCTAGGACACCGGATTTTCATTCCGATA-------------------A-CAGGGGTTCGAATCCCCTTGGGGTCA---
D00004628 Caulobacter_crescentus_CB15 Glu TTC -GGTCCCTTCGTCTATC--GGTT-AGGACGCCAGATTTTCAATCTGGAG-------------------A-GAGGGGTTCGACTCCCCTAGGGACTGCCA
D00004647 Chlamydia_muridarum_Nigg Glu TTC -GGCCCCATCGTCTAGCCTGGCCCAGGACATCGGATTTTCATTCCGGTA-------------------A-CAGGGGTTCGAATCCCCTTGGGGTCA---
D00004601 Chlamydia_trachomatis Glu TTC -GGCCCCATCGTCTAGCCTGGCCCAGGACATCGGATTTTCATTCCGGTA-------------------A-CAGGGGTTCGAATCCCCTTGGGGTC----
D00004600 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Glu TTC -GGCCCCATCGTCTAGCCTGGCCCAGGACATCGGATTTTCATTCCGGTA-------------------A-CAGGGGTTCGAATCCCCTTGGGGTCA---
D00004598 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Glu TTC -GGCCCCATCGTCTAGCCTGGCCCAGGACATCGGATTTTCATTCCGGTA-------------------A-CAGGGGTTCGAATCCCCTTGGGGTCA---
D00004599 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Glu TTC -GGCCCCATCGTCTAGCCTGGCCCAGGACATCGGATTTTCATTCCGGTA-------------------A-CAGGGGTTCGAATCCCCTTGGGGTCA---
D00004616 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Glu TTC -GGCCCCATCGTCTAGCCTGGCCCAGGACATCGGATTTTCATTCCGGTA-------------------A-CAGGGGTTCGAATCCCCTTGGGGTCA---
D00004729 Chlorobium_tepidum_TLS Glu TTC -GGCCCCATCGACTAGT--GGTT-AGGTCATCACCCTTTCAAGGTGGTA-------------------G-CACGGGTTCGAATCCCGTTGGGGTCA---
D00004651 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGC--GGTT-AAGACACCACCCTTTCACGGTGGTA-------------------A-CATGGGTTCGATTCCCGTACGGGTCA---
D00004646 Clostridium_perfringens_str._13 Glu TTC -GGCCCCTTGGTCAAGC--GGTT-AAGACACCACCCTTTCACGGTGGTA-------------------A-CAGGGGTTCGATTCCCCTAGGGGTCACCA
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D00004819 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Glu TTC -GCTCCCATCGTCTAGG--GGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGCG-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTTGGGAGTACCA
D00004760 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Glu TTC -GCTCCCATCGTCTAGG--GGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGCG-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTTGGGAGTA---
D00004737 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Glu TTC -GCTCCCATCGTCTAGG--GGCCTAGGACACTGCCCTTTCACGGCAGCG-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTTGGGAGTA---
D00004797 Coxiella_burnetii_RSA_493 Glu TTC -GTCCCCATCGTCTAGA--GGCCTAGGACATCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CAGGGGTTCGAATCCCCTTGGGGACGCCA
D00004629 Deinococcus_radiodurans_R1 Glu TTC -GGCCCCATCGTCTAAC--GGTT-AGGACACTACCCTTTCAAGGTAGCG-------------------A-TACGGGTTCGAATCCCGTTGGGGTCACCA
D00004859 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Glu TTC -GTTCCCATCGTCTAGCC-GGCCTAGGACAACGGCCTTTCACGCCGTCG-------------------A-CAGGGGTTCGAATCCCCTTGGGAACGCCA
D00004860 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Glu TTC -GTCCCTATCGTCTAGCCCGGCCCAGGACAACGGCCTTTCACGCCGTCG-------------------A-CAGGGGTTCAAATCCCCTTGGGGACGCCA
D00004778 Enterococcus_faecalis_V583 Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGC--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAGTCCCGTACGGGTCA---
D00000541 Escherichia_coli Glu TTC -GTCCCCTTCGTCTAGA--GGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCA
D00004802 Escherichia_coli_CFT073 Glu TTC -GTCCCCTTCGTCTAGA--GGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCA
D00004617 Escherichia_coli_K12 Glu TTC -GTCCCCTTCGTCTAGA--GGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCA
D00004618 Escherichia_coli_O157:H7 Glu TTC -GTCCCCTTCGTCTAGA--GGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCA
D00004619 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Glu TTC -GTCCCCTTCGTCTAGA--GGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCA
D00004620 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Glu TTC -GTCCCCTTCGTYTAGA--GGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCA
D00004730 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Glu TTC -GCCCCGTTCGTTCAGT--GGTT-AGGACATCAGATTTTCACTCTGGAA-------------------A-CAGGGGTTCAATTCCCCTACGGGGTACCA
D00004836 Geobacter_sulfurreducens_PCA Glu TTC -GGTCCCATCGTCTAGT--GGTT-AGGACACCGGCCTTTCACGTCGGTA-------------------A-CAGGGGTTCAAGTCCCCTTGGGATCACCA
D00004837 Geobacter_sulfurreducens_PCA Glu TTC -GTCCCCTTCGTCTAGCCCGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGCG-------------------A-CGGGGGTTCAAATCCCCCAGGGGACGCCA
D00000533 Haemophilus_ducreyi Glu TTC -GTCCCCATCGTCTAGA--GGCCTAGGACATCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CCGGGGTTCGAATCCCCGTGGGGACGCCA
D00000543 Haemophilus_influenzae Glu TTC -GTCCCCATCGTCTAGA--GGCCTAGGACATCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CCGGGGTTCGAATCCCCGTGGGGACGCCA
D00004625 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Glu TTC -GTCCCCATCGTCTAGA--GGCCTAGGACATCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CCGGGGTTCGAATCCCCGTGGGGACGCCA
D00004793 Helicobacter_hepaticus_ATCC_51449 Glu TTC -GACCCTTTCATCTAGCT-GGCCAAGGATATCACCCTTTCTCGGTGAAA-------------------A-CGGAAGTTCAAATCTTTCAAGGGTCGCCA
D00000535 Helicobacter_pylori Glu TTC -GACCCTTTCATCTAGT--GGCCAAGGATACCACCCTTTCACGGTGGAA-------------------A-CGGAAGTTCAAATCTTTCAAGGGTCGCCA
D00000536 Helicobacter_pylori Glu TTC -GGCTCCTTCATCTAGT--GGTT-AGGATACCACCCTTTCACGGTGGTT-------------------A-CAGGGGTTCAAATCCCCTAGGAGTCACCA
D00004621 Helicobacter_pylori_26695 Glu TTC -GACCCTTTCATCTAGT--GGCCAAGGATACCACCCTTTCACGGTGGAA-------------------A-CGGAAGTTCAAATCTTTCAAGGGTCGCCA
D00004622 Helicobacter_pylori_26695 Glu TTC -GGCTCCTTCATCTAGT--GGTT-AGGATACCACCCTTTCACGGTGGTT-------------------A-CAGGGGTTCAAATCCCCTAGGAGTCACCA
D00004623 Helicobacter_pylori_J99 Glu TTC -GACCCTTTCATCTAGT--GGCCAAGGATACCACCCTTTCACGGTGGAA-------------------A-CGGAAGTTCAAATCTTTCAAGGGTCGCCA
D00004624 Helicobacter_pylori_J99 Glu TTC -GGCTCCTTCATCTAGT--GGTT-AGGATACCACCCTTTCACGGTGGTT-------------------A-CAGGGGTTCAAATCCCCTAGGAGTCACCA
D00000534 Lactobacillus_delbrueckii_subsp._bulgaricus Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGT--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CATGGGTTCAAATCCCGTACGGGTCA---
D00004838 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Glu TTC -GGCTCGTTGGTCAAAT--GGTC-AAGACGCCACCCTTTCACGGTGGAG-------------------T-TACAAGTTCAATTCTTGTACGAGCTA---
D00004839 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGC--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CATGAGTTCAAATCTCGTACGGGTCA---
D00004841 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Glu TTC -GGCTCGTTGGTCAAGT--GGTTTAAGACACTGGTTTTTCATACCAGTA-------------------A-CACAAGTTCGATTCTTGTACGAGCTA---
D00004842 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Glu TTC -GACCCGTTGGTCAAGT--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CATGAGTTCAAATCTCGTACGGGTCA---
D00004779 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Glu TTC -GACCCCTTGGTCAAGT--GGTTTAAGACACTGCCCTTTCACGGCAGTA-------------------A-CATGGGTTCGAATCCCGTAGGGGTCA---
D00000537 Lactococcus_lactis Glu TTC -GGTCCGTTGGTCAAGG--GGTT-AAGACACCGCCTTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGACTA---
D00004844 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Glu TTC -GGCCCCATCGTTTAGT--GGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGCA-------------------G-CACGGGTTCGAATCCCGTTGGGGTCA---
D00004761 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Glu TTC -GCCGCCATCGTCTAGT--GGTT-AGGACACAAGATTTTCATTCTTGGA-------------------A-CAGGGGTTCAATTCCCCTTGGCGGTACCA
D00004642 Listeria_innocua_Clip11262 Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGC--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCA---
D00004643 Listeria_innocua_Clip11262 Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGC--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGATTCCCGTACGGGTCA---
D00004644 Listeria_innocua_Clip11262 Glu TTC -GGTCCGTTGGTCAAGC--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGATTCCCGTACGGGTCA---
D00004645 Listeria_monocytogenes_EGD-e Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGC--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCA---
D00004861 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGC--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCA---
D00004862 Mesoplasma_florum_L1 Glu TTC -GGCCTGTTGGTGAAGC--GGTT-AACACACACGGTTTTCATCCGTGGA-------------------CACACGGGTTCGAACCCCGTACAGGCTACCA
D00004655 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Glu TTC -GCGCCCATCGTCTAGC--GGTT-AGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CAGGGGTTCGATTCCCCTTGGGCGTACCA
D00004794 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Glu TTC -GCCCCCTTCGTCTAGAC-GGCCTAGGACGCCGCCCTTTCAAGGCGGTA-------------------A-CGCGGGTTCGAATCCCGTAGGGGGTA---
D00004614 Mycobacterium_leprae_TN Glu TTC -GCCCCCTTCGTCTAGT--GGCCTAGGACGCCGCCCTTTCAAGGCGGTA-------------------G-CGCGGGTTCGAATCCCGTAGGGGGTA---
D00004605 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Glu TTC -GCCCCCTTCGTCTAGAC-GGCCTAGGACGCCGCCCTTTCAAGGCGGTA-------------------A-CGCGGGTTCGAATCCCGTAGGGGGTA---
D00004821 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Glu TTC -GCCCCCTTCGTCTAGAC-GGCCTAGGACGCCGCCCTTTCAAGGCGGTA-------------------A-CGCGGGTTCGAATCCCGTAGGGGGTA---
D00000520 Mycoplasma_capricolum Glu TTC -GGCCTGTTGGTGAAGC--GGTT-AACACACACGGTTTTCATCCGTGGA-------------------CACACGGGTTCGAACCCCGTACAGGCTACCA
D00004792 Mycoplasma_gallisepticum_R Glu TTC -GGCGCGTTGGTGAAGT--GACTTAACACACACGCCTTTCACGCGTGCA-------------------TTCACGGGTTTGAATCCCGTACGCGTCACCA
D00000521 Mycoplasma_genitalium Glu TTC -GGCGCGTTGGTGAAGA--GACTTAACACACACGCCTTTCACGCGTGCA-------------------TTCACGGGTTTGAATCCCGTACGCGTCACCA
D00004630 Mycoplasma_genitalium_G37 Glu TTC -GGCGCGTTGGTGAAGA--GACTTAACACACACGCCTTTCACGCGTGCA-------------------TTCACGGGTTTGAATCCCGTACGCGTCACCA
D00000522 Mycoplasma_mycoides Glu TTC -GGCCTGTTGGTGAAGC--GGTT-AACACACACGGTTTTCATCCGTGGA-------------------CACACGGGTTCGAACCCCGTACAGGCTACCA
D00000523 Mycoplasma_pneumoniae Glu TTC -GGCGCGTTGGTGAAGA--GACTTAACACACACGCCTTTCACGCGTGCA-------------------TTCACGGGTTTGAATCCCGTACGCGTCACCA
D00004631 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Glu TTC -GGCGCGTTGGTGAAGA--GACTTAACACACACGCCTTTCACGCGTGCA-------------------TTCACGGGTTTGAATCCCGTACGCGTCACCA
D00004663 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Glu TTC -GGCCTATTGGTGAAGA--GGTT-AACACACATGGTTTTCATCCATGCA-------------------TGCGCGGGTTCGAATCCCGCATAGGTCACCA
D00004606 Neisseria_meningitidis_MC58 Glu TTC -GCGCCCATCGTCTAGC--GGTT-AGGACATCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CCGGGGTTCGATTCCCCGTGGGCGTGCCA
D00004607 Neisseria_meningitidis_MC58 Glu TTC -GCGCCCATCGTCTAGC--GGTT-AGGACATCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CCGGGGTTCGATTCCCCGTGGGCGTGCCA
D00004608 Neisseria_meningitidis_MC58 Glu TTC -GCGCCCATCGTCTAGA--GGCCTAGGACACTGCCCTTTCACGGCGGCA-------------------A-CCGGGGTTCGAATCCCCGTGGGCGTGCCA
D00004609 Neisseria_meningitidis_Z2491 Glu TTC -GCGCCCATCGTCTAGC--GGTT-AGGACATCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CCGGGGTTCGATTCCCCGTGGGCGTGCCA
D00004809 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Glu TTC -GTCCCCATCGTCTAGA--GGCCTAGGACACCACCCTTTCACGGTGGGT-------------------A-CAGGGGTTCGAATCCCCTTGGGGACGCCA
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D00004763 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Glu TTC -GGCCCGTTGGTCAAGC--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCA---
D00004820 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M Glu TTC -GGCCCGTTGGAGAAAC--GGTT-AACTCACATGCCTTTCACGCATGCA-------------------TTCACGGGTTCAAATCCCGTACGGGTCACCA
D00004632 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Glu TTC -GTCCCCATCGTCTAGA--GGCCTAGGACATCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CCGGGGTTCGAATCCCCGTGGGGACGCCA
D00004824 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Glu TTC -GTCCCCTTCGTCTAGA--GGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCA
D00000532 Plesiomonas_shigelloides Glu TTC -GTCCCCTTCGTCTAGA--GGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACA---
D00004845 Porphyromonas_gingivalis_W83 Glu TTC -GGCCCATTCGTCTATC--GGTT-AGGACGCAAGATTTTCATTCTTGAA-------------------A-GAGGGGTTCGACTCCCCTATGGGCTA---
D00004846 Porphyromonas_gingivalis_W83 Glu TTC -GGCCCATTCGTCTATC--GGTT-AGGACGCAAGATTTTCATTCTTGAA-------------------A-GAGGGGTTCGATTCCCCTATGGGCTA---
D00004864 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Glu TTC -GTCCCGGTCGTCCAGA--GGCCTAGGACACCGCCCTTTCAAGGCGGCA-------------------A-CGCGGGTTCGAATCCCGTCCGGGATA---
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D00004807 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Glu TTC -GGCCCCTTCGTCTAGC--GGTCTAGGACATCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAGTCCCGTAGGGGTCA---
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D00004826 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Glu TTC -GCTCCCTTCGTCTATC--GGTT-AGGACGCCACCCTTTCACGGTGGAG-------------------A-GAGCGGTTCGATTCCGCTAGGGAGCGCCA
D00004652 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Glu TTC -GGCCCCTTCGTCTAGT--GGTT-AGGACACCACCCTTTCACGGTGGGA-------------------A-CACGGGTTCGAGTCCCGTAGGGGTCACCA
D00004734 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Glu TTC -GGCCCCTTCGTCTAGC--GGTT-AGGACACCACCCTTTCACGGTGGGA-------------------A-CACGGGTTCAAGTCCCGTAGGGGTCACCA
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D00004767 Shewanella_oneidensis_MR-1 Glu TTC -GTCCCCTTCGTCTAGA--GGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGATACCA
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D00004738 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Glu TTC -GGCTCCTTGGTCAAGC--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAGTCCCGTAGGAGTCACCA
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D00004770 Streptococcus_mutans_UA159 Glu TTC -GGTCCGTTGGTCAAGG--GGTT-AAGACACCGCCTTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGACTA---
D00004771 Streptococcus_mutans_UA159 Glu TTC -GGTCCGTTGGTCAAGG--GGTT-AAGACACCGCCTTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGACTA---
D00004649 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Glu TTC -GGTCCGTTGGTCAAGG--GGTT-AAGACACCGCCTTTTCACGGCGGTA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTACGGACTA---
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D00000545 Synechocystis_sp. Glu TTC -GCCCCCATCGTCTAGA--GGCCTAGGACACCTCCCTTTCACGGAGGCG-------------------A-CAGGGATTCGAATTCCCTTGGGGGTA---
D00004636 Synechocystis_sp._PCC_6803 Glu TTC -GCCCCCATCGTCTAGA--GGCCTAGGACACCTCCCTTTCACGGAGGCG-------------------A-CAGGGATTCGAATTCCCTTGGGGGTA---
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D00004747 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Glu TTC -GGCCCCGTGGTCAAGT--GGTT-AAGACACCGCCCTTTCACGGCGGCA-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTCGGGGTCACCA
D00004742 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Glu TTC -GCCCCCATCGTCTAGT--GGCCTAGGACACCTCCCTTTCACGGAGGCG-------------------A-CGGGGATTCGAATTCCCCTGGGGGTA---
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D00000642 Plasmodium_falciparum Glu TTC -ACTTTTATCGTTTAAA--GGT--AAGACATCTTTTTTTCAAGAAGAAA-------------------A-TAGGAATTCGATTTTCCTTAAAAGTA---
D00004876 Plasmodium_falciparum_3D7 Glu TTC -TCCCATGTAGTCTAGGC-GGTT-AGGATATTCGGCTTTCACCCGAACG-------------------A-CCCGGGTTCGAGTCCCGGCGTGGGAA---
D00000644 Saccharomyces_cerevisiae Glu TTC -TCCGATATAGTGTAAC--GGCT-ATCACATCACGCTTTCACCGTGGAG-------------------A-CCGGGGTTCGACTCCCCGTATCGGAG---
D00000646 Saccharomyces_cerevisiae Glu TTC -TCCGATATAGTGTAAC--GGCT-ATCACATCACGCTTTCACCGTGGAG-------------------A-CCGGGGTTCGACTCCCCGTAGCGGAG---
D00004721 Saccharomyces_cerevisiae Glu TTC -TCCGATATAGTGTAAC--GGCT-ATCACATCACGCTTTCACCGTGGAG-------------------A-CCGGGGTTCGACTCCCCGTAGCGGAG---
D00004722 Saccharomyces_cerevisiae Glu TTC -TCCGATATAGTGTAAC--GGCT-ATCACATCACGCTTTCACCGTGGAG-------------------A-CCGGGGTTCGACTCCCCGTATCGGAG---
D00000647 Schizosaccharomyces_pombe Glu TTC -TCCGTTGTGGTCCAAC--GGCT-AGGATTCGTCGCTTTCACCGACGCG-------------------G-TCGGGGTTCGACTCCCCGCAACGGAG---
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D00004893 Takifugu_rubripes Glu TTC -TCCCATATGGTCTAGT--GGTC-AGGATTACTGGTTTTCGCCCAATCG-------------------C-TTTTGGTTTGATTCCCAGTGTGGGAA---
D00004894 Takifugu_rubripes Glu TTC -TCCCATATGCTCTAGT--GGTC-AGGATTCCTGGCTTTCACCCAGGTG-------------------G-CATAGGTTCAATTCCCAATATGGGAG---
D00004895 Takifugu_rubripes Glu TTC -TTCCATATGGTCTAAC--GGTG-AGGATTCCTGGTTTTCACCCAGGTG-------------------G-CCCGGGTTCAACTCCCGGTATGGGAA---
D00004896 Takifugu_rubripes Glu TTC -TCCCATATGGTCTAGC--GGTG-AGGATCCCTGGTTTTCACCCAGGTG-------------------G-CCCGGGTTCAACTCCCGGTATGGGAA---
D00004897 Takifugu_rubripes Glu TTC -TCCCATATGGTCTAGC--GGTC-AGGATTCCTGGTTTTCACCCAGGCG-------------------G-CCCGGGTTCAACTCCCGGTATGGGAA---
D00004898 Takifugu_rubripes Glu TTC -TCCCATATGGTCTAGA--GGTC-AGGATTCCTGGTTTTCACCCAGGCG-------------------G-CCCGGGTTCAATTCCCGGTATGGGAA---
D00004899 Takifugu_rubripes Glu TTC -TCCCATATGGTCTAGC--GGTC-AGGATTCCTGGTTTTCACCCAGGCG-------------------G-CCCGGGTTCGACTCCCGGTATGGGAA---
D00004900 Takifugu_rubripes Glu TTC -TCCCTGGTGGTCTAGT--GGTC-AGGATTCAGCGCTTTCACCGCTGCG-------------------G-CCTGGGTTCGATTCCCAGTCAGGGAA---
D00004901 Takifugu_rubripes Glu TTC -TCCCATATGGTCTAGC--GGTT-AGGATTCCTGGTTTTCACCCAGGCG-------------------G-CCCGGGTTCGACTCCCGGTATGGGAA---
D00000524 Mycoplasma_pneumoniae Glu GAA -GGTCTTGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAACGGTTTGAAGAACCGTGT-------------------GTCGGCAGTTCGATTCTGCCCGAGACCACCA
D00000660 Rattus_norvegicus Glu CTG -GGTTCCATGGTGTAAT--GGTG-AGCACTCTGGACTCTGAATCCAGCG-------------------A-TCCGAGTTCAAATCTCGGTGGGACCT---
D00000661 Rattus_norvegicus Glu CTG -GGTTCCATGGTGTAAT--GGTT-AGCACTCTGGACTCTGAATCCAGCG-------------------A-TCCGAGTTCAAATCTCGGTGGAACCT---
D00000662 Rattus_norvegicus Glu CTG -GGTTCCATGGTGTAAT--GGTT-AGCACTCTGGACTCTGAATCCAGCG-------------------A-TCTGAGTTCAAATCTCAGTGGGACCT---
D00000663 Rattus_norvegicus Glu TTG -GGTCCCATGGTGTAAT--GGTT-AGCACTCTGGACTTTGAATCCAGCG-------------------A-TCCGAGTTCAAATCTCGGTGGGACCT---
D00000664 Rattus_norvegicus Glu TTG -GGTCCCATGGTGTAAT--GGTT-AGCACTCTGGACTTTGAATCCAGCA-------------------A-TCTGAGTTCAAATCTCGGTGGGACCT---
D00000665 Rattus_norvegicus Glu TTG -GGTCTCATGGTGTAAT--GGTT-AGCACTCTGGACTTTGAATCCAGCG-------------------A-TCCGAGTTCGAGTCTCGGTGAGGCCT---
D00004439 Aeropyrum_pernix_K1 Asp GTC -GCCGCGGTAGTATAGCCTGGACTAGTATGCGGGCCTGTCAAGCCCGTG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGCGGCGCC-
D00000383 Archaeoglobus_fulgidus Asp GTC -GCCCGGGTGGTGTAGTCCGGCCTATCATGCGGGCCTGTCGTGGCCGCG-------------------A-CTCGGGTTCAAATCCCGGCCCGGGCG---
D00004440 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Asp GTC -GCCCGGGTGGTGTAGTCCGGCCTATCATGCGGGCCTGTCGAGCCCGCG-------------------A-CTCGGGTTCAAATCCCGGCCCGGGCG---
D00004441 Halobacterium_sp._NRC-1 Asp GTC -GCCCGGATGGTGTAGT--GGCCCATCATACAACCCTGTCACGGTTGTG-------------------A-CGCGGGTTCAAATCCCGCTCCGGGCG---
D00000384 Methanocaldococcus_jannaschii Asp GTC -GCCCTGGTGGTGTAGCCCGGCCTATCATACGGGACTGTCACTCCCGTG-------------------A-CTCGGGTTCAAATCCCGGCCAGGGCG---
D00004443 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Asp GTC -GCCCTGGTGGTGTAGCCCGGCCTATCATACGGGACTGTCACTCCCGTG-------------------A-CTCGGGTTCAAATCCCGGCCAGGGCGCC-
D00011866 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Asp GTC -GCTCTGGTGGTGTAGCTCGGCCTATCATACAGGACTGTCACTCCTGTG-------------------A-CTCGGGTTCAAATCCCGGCCAGAGCG---
D00004444 Methanococcus_maripaludis Asp GTC -GCTCTGGTGGTGTAGCTCGGCCTATCATACAGGACTGTCACTCCTGTG-------------------A-CTCGGGTTCAAATCCCGGCCAGAGCG---
D00000385 Methanococcus_vannielii Asp GTC -GCCCTGGTGGTGTAGCTCGGCCTATCATACAGGACTGTCACTCCTGTG-------------------A-CTCGGGTTCAAATCCCGGCCAGGGCG---
D00000387 Methanococcus_voltae Asp GTC -GCCCTGGTGGTGTAGCTCGGCCTATCATACAGGACTGTCACTCCTGTG-------------------A-CTCGGGTTCAAATCCCGGCCAGGGCG---
D00004493 Methanopyrus_kandleri_AV19 Asp GTC -GCCCCGGCGGTGTAGCCCGGTCTATCATCCGGGCCTGTCGAGCCCGGG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGGGCGCCA
D00011926 Methanosarcina_acetivorans_C2A Asp GTC -GTCCGGATAGTGTAGA--GGCCTATCATGGAGCCCTGTCGAGGCTCCG-------------------A-CTCGGGTTCGAATCCCGGTCCGGGCG---
D00004475 Methanosarcina_mazei_Go1 Asp GTC -GTCCGGATAGTGTAGA--GGCCTATCATGGAGCCCTGTCGAGGCTCCG-------------------A-CCCGGGTTCGAATCCCGGTCCGGGCG---
D00011939 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Asp GTC -GCCCAGATAGTGTAGT--GGCCTATCATGTCGGCCTGTCACGCCGACG-------------------A-CTCGGATTCGAATTCCGATCTGGGCG---
D00004442 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Asp GTC -GCCCTGGTGGTGTAGG--GGCT-ATCATGCGGGCCTGTCGAGCCCGCG-------------------A-CTCGGGTTCAATTCCCGGCCAGGGCG---
D00000386 Methanothermus_fervidus Asp GTC -GCCCTGGTGGTGTAGT--GGCT-ATCATGCGGGCCTGTCGAGCCCGCG-------------------A-CTCGGGTTCAATTCCCGGCCAGGGCG---
D00011982 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Asp GTC -GCCCCGGTGGTGTAGC--GGCCTAGCATGCGGGCCTGTCGAGCCCGCG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGGGCG---
D00004445 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Asp GTC -TAGCCGGTAGTATAGCCCGGACTAGTATGCGGGCCTGTCGAGCCCGTG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGGGCGCCA
D00004446 Pyrococcus_abyssi_GE5 Asp GTC -GCCCGGGTGGTGTAGCCCGGCCTATCATGCGGGACTGTCACTCCCGCG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCCGGGCGCC-
D00004447 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Asp GTC -GCCCGGGTGGTGTAGCCCGGCCTATCATGCGGGACTGTCACTCCCGCG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCCGGGCGCC-
D00004448 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Asp GTC -GCCCGGGTGGTGTAGCCCGGCCTATCATGCGGGACTGTCACTCCCGCG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCCGGGCGCCA
D00012019 Staphylothermus_marinus_F1 Asp GTC -GCCCCCGTAGTATAGCCCGGCCTAGTATGCGGGCCTGTCGAGCCCGTG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGGGCG---
D00012057 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Asp GTC -GCCGCGGTAGTCTAGC--GGTCTAGGATGGGGGCCTGTCGAGCCCTTG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGCGGCG---
D00004449 Sulfolobus_solfataricus_P2 Asp GTC -GCCGCGGTAGTCTAGT--GGTCTAGGATGGGGGCCTGTCGAGCCCCTG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGCGGC----
D00004484 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Asp GTC -GCCGCGGTAGTCTAGCCCGGT--AGGATGGGGGCCTGTCGAGCCCTTG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGCGGCG---
D00000388 Thermococcus_celer Asp GTC -GCCCGGGTGGTGTAGCCAGGCCCATCATACGGGACTGTCACTCCCGTG-------------------A-CTCGGGTTCAAATCCCGACCCGGGCG---
D00004450 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Asp GTC -GCCCCGGTAGTGTAGT--GGCCTATCATACAGGCCTGTCGAGCCTGTG-------------------A-CATGGGTTCAAATCCCGTCCGGGGCG---
D00004451 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Asp GTC -GCCCCGGTAGTGTAGT--GGCCTATCATACAGGCCTGTCGAGCCTGTG-------------------A-CATGGGTTCAAATCCCGTCCGGGGCG---
D00000393 Acholeplasma_laidlawii Asp GTC -GGTCCGGTGGTGTAGG--GGTT-AACATGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCGGGTTCAAATCCCGTCCGGACCGCCA
D00004572 Acinetobacter_sp._ADP1 Asp GTC -GCAGCGGTAGTTCAGTT-GGTT-AGAATACCGGCCTGTCACGCCGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCCGCTGCGCCA
D00004435 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Asp GTC -GCGGGTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGTGCCGGCCTGTCACGCCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCACTCGCGCCA
D00004436 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Asp GTC -GCGGGTGTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGTGCCGGCCTGTCACGCCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCACTCGCGCCA
D00004415 Aquifex_aeolicus_VF5 Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGCCCGGTC-AGAACGCCGGCCTGTCAAGCCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGTCCGCTCCGCCA
D00004573 Bacillus_anthracis_str._A2012 Asp GTC -GGTCCCGTGGTGTAGT--GGTT-AACATGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCCGGTTCGACCCCGGTCGGGACCGCCA
D00004534 Bacillus_anthracis_str._Ames Asp GTC -GGTCCCGTGGTGTAGT--GGTT-AACATGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCCGGTTCGACCCCGGTCGGGACCGCCA
D00004546 Bacillus_anthracis_str._Sterne Asp GTC -GGTCCCGTGGTGTAGT--GGTT-AACATGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCCGGTTCGACCCCGGTCGGGACCGCCA
D00004561 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Asp GTC -GGTCCCGTGGTGTAGT--GGTT-AACATGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCCGGTTCGACCCCGGTCGGGACCGCCA
D00004562 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Asp GTC -GGTCCCGTGGTGTAGT--GGTT-AACATGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCCGGTTCGACCCCGGTCGGGACCGCCA
D00004524 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Asp GTC -GGTCCCGTGGTGTAGT--GGTT-AACATGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCCGGTTCGACCCCGGTCGGGACCGCCA
D00004506 Bacillus_halodurans_C-125 Asp GTC -GGTCCGGTAGTTCAGTT-GGTT-AGAATGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGGACCGCCA
D00000403 Bacillus_sp._PS3 Asp GTC -GGTCCCGTAGTGTAGT--GGTT-AACATGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCGGGTTCGAT-GCCGTCGGGACCGCCA
D00000402 Bacillus_subtilis Asp GTC -GGTCCGGTAGTTCAGTT-GGTT-AGAATGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGGACCGCCA
D00004382 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Asp GTC -GGTCCGGTAGTTCAGTT-GGTT-AGAATGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGGACCGCCA
D00004574 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Asp GTC -GGTCCCGTGGTGTAGT--GGTT-AACATGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCCGGTTCGACCCCGGTCGGGACCGCCA
D00004531 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Asp GTC -GGTGCGTTAGTTCAGTT-GGTT-AGAATACATGCCTGTCACGCATGGG-------------------GTCACGGGTTCGAGTCCCGTACGCACCG---
D00004532 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Asp GTC -GGTTCGGTAGTTCAGTT-GGTT-AGAATACATGCCTGTCACGCATGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGGACCG---
D00004535 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Asp GTC -GCGGGTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGTGCTGGCCTGTCACGCCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCACTCGCGCCA
D00004576 Bartonella_quintana_str._Toulouse Asp GTC -GCGGGTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGTGCTGGCCTGTCACGCCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCACTCGCGCCA
D00004536 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Asp GTC -GGGGTGGTAGTTAAGTT-GGTT-ATAACGTCCGCCTGTCACGCGGAAG-------------------GCCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCACCCCGCCA
D00004494 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Asp GTC -GGCCCCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCCGCCCTGTCACGGCGGAG-------------------GTCACCGGTTCAAGTCCGGCCGGGGTCG---
D00004495 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Asp GTC -GGCCCCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCCGCCCTGTCACGGCGGAG-------------------GTCACCGGTTCAAGTCCGGCCGGGGTCGCCA
D00000396 Borrelia_burgdorferi Asp GTC -GGGGGCGTAGTTCAGGT-GGTT-AGAACGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGACCCGTCGCTCCCG---
D00004400 Borrelia_burgdorferi_B31 Asp GTC -GGGGGCGTAGTTCAGGT-GGTT-AGAACGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGACCCGTCGCTCCCG---
D00004547 Borrelia_garinii_PBi Asp GTC -GGGGGCGTAGTTCAGAT-GGTT-AGAACGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGACCCGTCGCTCCCG---
D00004507 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Asp GTC -GCGGGAGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCCGGCCTGTCACGCCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCTCTCGCGCCA
D00004426 Brucella_melitensis_16M Asp GTC -GCGGGTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGTGCCGGCCTGTCACGCCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCACTCGCGCCA
D00004496 Brucella_suis_1330 Asp GTC -GCGGGTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGTGCCGGCCTGTCACGCCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCACTCGCGCCA
D00004383 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Asp GTC -GGTGTGGTAGTTCAGTT-GGTT-AGAATACCGGCCTGTCACGCCGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGCACCG---
D00004525 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Asp GTC -GGTGCGGTAGTTCAGAT-GGTT-AGAATACTGGCCTGTCACGCCGGGG-------------------GTCGCGGGTTCAAGTCCCGTCCGCACCG---
D00004476 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Asp GTC -GGTGCGGTAGTTCAGTC-GGTT-AGAATACCGGCCTGTCACGCCGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCCGCACCG---
D00004401 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Asp GTC -GCAGCGGTAGTTCAGCT-GGTT-AGAATGCCGCCCTGTCACGGCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCCGCTGCGCCA
D00004577 Candidatus_Blochmannia_floridanus Asp GTC -GGTGCGGTAGTTCAGAT-GGTT-AGAATATCGGCTTGTCACGCCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCCGCACCGCCA
D00004540 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Asp GTC -GCGGGAGTAGTTCAATT-GGTT-AGAGCACCGGCTTGTCACGCCGGAA-------------------GTTGCGGGTTCGAGTCCCGTCTCCCGCG---
D00004402 Caulobacter_crescentus_CB15 Asp GTC -GCGGATGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCCGGCCTGTCACGCCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCATTCGCGCCA
D00004421 Chlamydia_muridarum_Nigg Asp GTC -GCGGGAGTAGTTCAATT-GGTT-AGAGCACCGCCCTGTCAAGGCGGAA-------------------GTTGCGGGTTCGAGCCCCGTCTCTCGCG---
D00004381 Chlamydia_trachomatis Asp GTC -GCGGGAGTAGTTCAATT-GGTT-AGAGCACCGCCCTGTCAAGGCGGAA-------------------GTTGCGGGTTCGACCCCCGTCTCTCGC----
D00004380 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Asp GTC -GCGGGAGTAGTTCAACT-GGTT-AGAGCACCGCCCTGTCAAGGCGGAA-------------------GTTGCGGGTTCGAGCCCCGTCTCTCGCG---
D00004378 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Asp GTC -GCGGGAGTAGTTCAATT-GGTT-AGAGCACCGCCCTGTCAAGGCGGAA-------------------GTTGCGGGTTCGACCCCCGTCTCTCGCG---
D00004379 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Asp GTC -GCGGGAGTAGTTCAATT-GGTT-AGAGCACCGCCCTGTCAAGGCGGAA-------------------GTTGCGGGTTCGACCCCCGTCTCTCGCG---
D00004392 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Asp GTC -GCGGGAGTAGTTCAATT-GGTT-AGAGCACCGCCCTGTCAAGGCGGAA-------------------GTTGCGGGTTCGACCCCCGTCTCTCGCG---
D00004472 Chlorobium_tepidum_TLS Asp GTC -GGAGCTGTAGCTCAGTCTGGTT-AGAGCGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCAGCTCCG---
D00004424 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Asp GTC -GGCTTGGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGTGCTGGCCTGTCACGCCAGAG-------------------GTCGAGGGTTCGATCCCCTTCCAAGTCGCCA
D00004420 Clostridium_perfringens_str._13 Asp GTC -GGCTCAGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGTGCCGGCCTGTCACGCCGGAG-------------------GTCGAGGGTTCGAGCCCCTTCTGAGTCGCCA
D00004508 Clostridium_tetani_E88 Asp GTC -GGCCCAGTGGCTCAGTT-GGTTTAGAGTGCCGGCCTGTCACGCCGGAG-------------------GTCGAGGGTTCGAGTCCCTTCTGGGTCGCCA
D00004537 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Asp GTC -GGCCCTGTGGCGCAGTT-GGTT-AGCGCGCCGCCCTGTCACGGCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCAAGTCCCGTCAGGGTCG---
D00004497 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Asp GTC -GGCCCTGTGGCGCAGTT-GGTT-AGCGCGCCGCCCTGTCACGGCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCAAGTCCCGTCAGGGTCG---
D00004498 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Asp GTC -GGCCCTGTGGCGCAGTT-GGTT-AGCGCGCCGCCCTGTCACGGCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCAAGTCCCGTCAGGGTCG---
D00004478 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Asp GTC -GGCCCTGTGGCGCAGTT-GGTT-AGCGCGCCGCCCTGTCACGGCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCAAGTCCCGTCAGGGTCG---
D00004523 Coxiella_burnetii_RSA_493 Asp GTC -GGAGTGGTAGTTCAGTT-GGTT-AGAATACCGGCCTGTCACGCCGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCACTCCGCCA
D00004403 Deinococcus_radiodurans_R1 Asp GTC -GGTTTCATCGTCCAGC--GGCC-AGGATGCCCCGTTGTCTGCGGGAGG-------------------A-CGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGGACCGCCA
D00004404 Deinococcus_radiodurans_R1 Asp GTC -GGTCCGGTAGTGTAGC--GGTT-AGCATATCTGCCTGTCACGCAGAAG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGTCCGGACCGCCA
D00004563 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Asp GTC -GGAGCCGTAGTTAAGAC-GGTT-ATAACGCCGGCCTGTCACGCCGGAG-------------------GCCGAGGGTTCGAGTCCCTTCGGCTCCGCCA
D00004564 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Asp GTC -GGAGCGGTAGTTAAGAC-GGTT-ATAACGCCGGCCTGTCACGCCGGAG-------------------GCCGAGGGTTCGAGTCCCTTCCGCTCCGCCA
D00004509 Enterococcus_faecalis_V583 Asp GTC -GGTTTGGTAGTTCAGCT-GGTT-AGAATGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCAGACCGCCA
D00004510 Enterococcus_faecalis_V583 Asp GTC -GGTTTGGTAGTTCAGCT-GGTT-AGAATGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCAGACCG---
D00004511 Enterococcus_faecalis_V583 Asp GTC -GGTTCCGTGGTGTAGG--GGTT-AACATGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCGGGTTCAAATCCCGTCGGAACCGCCA
D00000404 Escherichia_coli Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGTC-GGTT-AGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCA
D00004526 Escherichia_coli_CFT073 Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGTC-GGTT-AGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCA
D00004393 Escherichia_coli_K12 Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGTC-GGTT-AGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCA
D00004394 Escherichia_coli_O157:H7 Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGTC-GGTT-AGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------T-CGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCA
D00004395 Escherichia_coli_O157:H7 Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGTC-GGTT-AGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCA
D00004396 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGTC-GGTT-AGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCA
D00004473 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Asp GTC -GGGGGTGTAGCTCAGTTTGGTT-AGAGCGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTCACTCCCGCCA
D00004474 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Asp GTC -GGGGGTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------GTCGCGAGTTCGAGCCTCGTCACTCCCGCCA
D00004548 Geobacter_sulfurreducens_PCA Asp GTC -GGGGTCGTAGTTAAGTT-GGTT-ATAACGCCGGCCTGTCACGCCGGAG-------------------GCCGCGGGTTCGAGCCCCGTCGACCCCGCCA
D00000405 Haemophilus_influenzae Asp GTC -GGAGTGGTAGTTCAGCT-GGTT-AGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------T-CGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCA
D00000406 Haemophilus_influenzae Asp GTC -GGAGTGGTAGTTCAGCT-GGTT-AGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCA
D00000407 Haemophilus_influenzae Asp GTC -GGAGTGGTAGTTCAGCT-GGCT-AGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCA
D00004399 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Asp GTC -GGAGTGGTAGTTCAGCT-GGTT-AGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCA
D00000401 Helicobacter_pylori Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGCT-GGTT-AGAATATCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGCTCCGCCA
D00004397 Helicobacter_pylori_26695 Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGCT-GGTT-AGAATATCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGCTCCGCCA
D00004398 Helicobacter_pylori_J99 Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGCT-GGTT-AGAATATCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGCTCCGCCA
D00000400 Lactobacillus_delbrueckii_subsp._bulgaricus Asp GTC -GGTCCATTGGAGCAGT--GGTCTATCTCGCCTCCCTGTCACGGAGGAG-------------------ATCGCGGGTTCAAATCCCGCATGGACCG---
D00004549 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Asp GTC -GGTCCCTTGGTGTAGG--GGTT-ATCACGCCTCCCTGTCACGGAGGAG-------------------ATCACCGGTCCGAATCCGGTAGGGACCG---
D00004550 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Asp GTC -GGTCCCTTAGTGTAGT--GGTT-ATCACGCCTCCCTGTCACGGAGGAG-------------------ATCACCGGTTCGAGTCCGGTAGGGACCG---
D00004512 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Asp GTC -GGTCCGTTGGTCTAGTT-GGTTTAGGACGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCACGAGTTCGAGTCTCGTACGGACCG---
D00004513 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Asp GTC -GGTCCGTTGGTCTAGTT-GGTTTAGGACGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCACGAGTTCGAGTCTCGTACGGACCG---
D00004551 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Asp GTC -GGCCCTGTAGCGCAGTT-GGTT-AGCGTGCCGCCCTGTCACGGCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCAAGTCCCGTCAGGGTCGCCA
D00004499 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Asp GTC -GGAGCTGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGTGCCTGCCTGTCACGCAGGAT-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCAGCTCCG---
D00004416 Listeria_innocua_Clip11262 Asp GTC -GGTTCCGTGGTGTAGG--GGTT-AACATGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCGGGTTCAAATCCCGTCGGGACCG---
D00004417 Listeria_innocua_Clip11262 Asp GTC -GGTTCCGTGGTGTAGG--GGTT-AACATGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCGGGTTCAAATCCCGTCGGGACCGCCA
D00004418 Listeria_monocytogenes_EGD-e Asp GTC -GGTTCCGTGGTGTAGG--GGTT-AACATGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCGGGTTCAAATCCCGTCGGGACCG---
D00004419 Listeria_monocytogenes_EGD-e Asp GTC -GGTTCCGTGGTGTAGG--GGTT-AACATGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCGGGTTCAAATCCCGTCGGGACCGCCA
D00004565 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Asp GTC -GGTTCCGTGGTGTAGG--GGTT-AACATGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCGGGTTCAAATCCCGTCGGGACCG---
D00004566 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Asp GTC -GGTTCCGTGGTGTAGG--GGTT-AACATGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCGGGTTCAAATCCCGTCGGGACCGCCA
D00004567 Mesoplasma_florum_L1 Asp GTC -GGCCCCATAGCGAAGTT-GGTT-ATCGCGCCTCCCTGTCACGGAGGAG-------------------ATCACGGGTTCGAGTCCCGTTGGGGTCGCCA
D00004427 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Asp GTC -GCGGGTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGTGCCGGCCTGTCACGCCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCACTCGCGCCA
D00004521 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Asp GTC -GGCCCTGTGGCGCAGTT-GGTT-AGCGCGCCGCCCTGTCACGGCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCAGGGTCGCCA
D00004390 Mycobacterium_leprae_TN Asp GTC -GGCCCTGTGGCGCAGTT-GGTT-AGCGCGCCGCCCTGTCACGGCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCAGGGTCG---
D00004384 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Asp GTC -GGCCCTGTGGCGCAGTT-GGTT-AGCGCGCCGCCCTGTCACGGCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCAGGGTCGCCA
D00004539 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Asp GTC -GGCCCTGTGGCGCAGTT-GGTT-AGCGCGCCGCCCTGTCACGGCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCAGGGTCGCCA
D00000389 Mycoplasma_capricolum Asp GTC -GGCCCCATAGCGAAGTT-GGTT-ATCGCGCCTCCCTGTCACGGAGGAG-------------------ATCACGGGTTCGAGTCCCGTTGGGGTCGCCA
D00004520 Mycoplasma_gallisepticum_R Asp GTC -GGTTCCTTGGTGTAGT--GAT--AACATACCTCCCTGTCACGGAGGGG-------------------T-TGCGGGTTTGATTCCCGTAGGAACCGCCA
D00000390 Mycoplasma_genitalium Asp GTC -TGGTTCCATGGTGTAGT-GAT--AAGATATCTCCCTGTCACGGAGGGG-------------------T-TGCGGGTTGATTCCCGTTGGAACCGCCA-
D00004405 Mycoplasma_genitalium_G37 Asp GTC -GGTTCCATGGTGTAGT--GAT--AACATATCTCCCTGTCACGGAGGGG-------------------T-TGCGGGTTTGATTCCCGTTGGAACCGCCA
D00000391 Mycoplasma_mycoides Asp GTC -GGCCCCATAGCGAACGTTGGTT-ATCGCGCCTCCCTGTCACGGAGGAG-------------------ATCACGGGTTCGAGTCCCGTTGGGGTCGCCA
D00000392 Mycoplasma_pneumoniae Asp GTC -GGTTCCATGGTGTAGT--GGTT-AACATATCTCCCTGTCACGGAGGGG-------------------T-TGCGGGTTCGATTCCCGTTGGAACCGCCA
D00004406 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Asp GTC -GGTTCCATGGTGTAGT--GAT--AACATATCTCCCTGTCACGGAGGGG-------------------T-TGCGGGTTTGATTCCCGTTGGAACCGCCA
D00004434 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Asp GTC -GGTCCAGTGGTAAAGT--GGTTGACTACGCCTCCCTGTCACGGAGGAG-------------------ATCGCGGGTTCGATTCCCGTCTGGACCGCCA
D00004385 Neisseria_meningitidis_MC58 Asp GTC -GCGGTGGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGTACCGGCCTGTCACGCCGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCCGCCGCGCCA
D00004386 Neisseria_meningitidis_Z2491 Asp GTC -GCGGTGGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGTACCGGCCTGTCACGCCGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCCGCCGCGCCA
D00004530 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Asp GTC -GGAGTGGTAGTTCAGTT-GGTT-AGAATACCGGCCTGTCACGCCGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCACTCCGCCA
D00004433 Nostoc_sp._PCC_7120 Asp GTC -GGGACTGTAGTTCAATT-GGTT-AGAGCACCGCCCTGTCACGGCGGAA-------------------GTTGCGGGTTCGAGCCCCGTCAGTCCCG---
D00004500 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Asp GTC -GGTCCGGTAGTTCAGTT-GGTT-AGAATGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGGACCGCCA
D00004538 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M Asp GTC -GGTCCGGTGGTGTAGT--GGTT-AACATGCTTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCGGGTTCAAGTCCCGTCCGGACCGCCA
D00004407 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Asp GTC -GGAGTGGTAGTTCAGCT-GGTT-AGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATTCCGCCA
D00004408 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGCT-GGTT-AGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCA
D00004541 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Asp GTC -GGTGCGGTAGTTCAGTT-GGTT-AGAATACCGGCCTGTCACGCCGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCCGCACCGCCA
D00004542 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Asp GTC -GGTGCGGTAGTTCAGTC-GGTT-AGAATACCGGCCTGTCACGCCGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGCACCGCCA
D00004552 Porphyromonas_gingivalis_W83 Asp GTC -GGTGTGGTAGTTCAGCT-GGTT-AGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCATACCG---
D00004568 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Asp GTC -GGCCCCGTAGCGCAGTT-GGTT-AGCGCGCCGCCCTGTCACGGCGGAG-------------------GTCGTGGGTTCAAGTCCCATCGGGGTCG---
D00004410 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Asp GTC -GCAGCGGTAGTTCAGTC-GGTT-AGAATACCGGCCTGTCACGCCGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGCTGCGCCA
D00004411 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGTC-GGTT-AGAATACCGGCCTGTCACGCCGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGCTCCGCCA
D00004533 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Asp GTC -GCAGCGGTAGTTCAGTC-GGTT-AGAATACCGGCCTGTCACGCCGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGCTGCGCCA
D00004431 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Asp GTC -GGAGTGGTAGTTCAGTC-GGTT-AGAATACCGGCCTGTCACGCCGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCACTCCGCCA
D00004432 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGTC-GGTT-AGAATACCGGCCTGTCACGCCGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGCTCCGCCA
D00004529 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Asp GTC -GGCGCGGTAGCTCAATT-GGTT-AGAGCCCCGGACTGTCGATCCGGAG-------------------GTTGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGCGTCG---
D00004543 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Asp GTC -GCGGGAGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCCGGCCTGTCACGCCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCTCTCGCGCCA
D00004425 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Asp GTC -GGGGGTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCATCTGCCTGTCACGCAGAAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCACTCTCGCCA
D00004477 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Asp GTC -GGGGATGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTCTGCCTGTCACGCAGAAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCATTCTCGCCA
D00004553 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Asp GTC -GGGGATGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTCTGCCTGTCACGCAGAAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCATTCTCGCCA
D00004437 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGTT-GGTT-AGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCA
D00004528 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGTT-GGTT-AGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCA
D00004430 Salmonella_typhimurium_LT2 Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGTT-GGTT-AGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCA
D00004502 Shewanella_oneidensis_MR-1 Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGTT-GGTT-AGAATACCGGCCTGTCACGCCGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGCTCCGCCA
D00004503 Shigella_flexneri_2a_str._301 Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGTC-GGTT-AGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCA
D00004438 Sinorhizobium_meliloti_1021 Asp GTC -GCGGGTGTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGTGCCGGCCTGTCACGCCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCACTCGCGCCA
D00000394 Spiroplasma_melliferum Asp GTC -GGTCTTGTAGTGAAGTT-GGTT-ATCATGCCTCTCTGTCACAGAGGAG-------------------ATCGCGGGTTCAAGTCCCGTCAAGACCGCCA
D00000398 Staphylococcus_aureus Asp GTC -GGTCTCGTAGTGTAGC--GGTT-AACACGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCGGGTTCGGTTCCCGTCGAGACCGCCA
D00000399 Staphylococcus_aureus Asp GTC -GGTCTCGTAGTGTAGC--GGTT-AACACGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCGGGTTCGATTCCCGTCGAGACCGCCA
D00004544 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Asp GTC -GGTCTCGTAGTGTAGC--GGTT-AACACGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCGGGTTCGATTCCCGTCGAGACCG---
D00004545 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Asp GTC -GGTCTCGTAGTGTAGC--GGTT-AACACGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCGGGTTCGATTCCCGTCGAGACCGCCA
D00004479 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Asp GTC -GGTCTCGTAGTGTAGC--GGTT-AACACGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCGGGTTCGATTCCCGTCGAGACCG---
D00004480 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Asp GTC -GGTCTCGTAGTGTAGC--GGTT-AACACGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCGGGTTCGATTCCCGTCGAGACCGCCA
D00004388 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Asp GTC -GGTCTCGTAGTGTAGC--GGTT-AACACGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCGGGTTCGATTCCCGTCGAGACCG---
D00004389 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Asp GTC -GGTCTCGTAGTGTAGC--GGTT-AACACGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCGGGTTCGATTCCCGTCGAGACCGCCA
D00004514 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Asp GTC -GGTCCCGTAGTGTAGC--GGTT-AACACGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCGGGTTCGATTCCCGTCGGGACCG---
D00004515 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Asp GTC -GGTCTCGTAGTGTAGC--GGTT-AACACGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCGGGTTCGATTCCCGTCGAGACCGCCA
D00004516 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Asp GTC -GGTCCCGTAGTGTAGC--GGTT-AACACGCCTGCCTGTCACGCAGGAG-------------------ATCGCGGGTTCGATTCCCGTCGGGACCGCCA
D00004504 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Asp GTC -GGTCCCGTAGTGTAGC--GGTT-ATCACGTCGCCCTGTCACGGCGAAG-------------------ATCGCGGGTTCGATTCCCGTCGGGACCG---
D00004481 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Asp GTC -GGTCCCGTAGTGTAGC--GGTT-ATCACGTCGCCCTGTCACGGCGAAG-------------------ATCGCGGGTTCGATTCCCGTCGGGACCG---
D00004505 Streptococcus_mutans_UA159 Asp GTC -GGTCCCGTGGTGTAGC--GGTT-ATCACGTCGCCCTGTCACGGCGAAG-------------------ATCGCGGGTTCGATTCCCGTCGGGACCG---
D00004423 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Asp GTC -GGTCCCGTAGTGTAGC--GGTT-ATCACGTCGCCCTGTCACGGCGAAG-------------------ATCGCGGGTTCGATTCCCGTCGGGACCG---
D00004422 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Asp GTC -GGTCCCGTAGTGTAGC--GGTT-ATCACGTCGCCCTGTCACGGCGAAG-------------------ATCGCGGGTTCGATTCCCGTCGGGACCG---
D00004482 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Asp GTC -GGTCCCGTAGTGTAGC--GGTT-ATCACGTCGCCCTGTCACGGCGAAG-------------------ATCGCGGGTTCGATTCCCGTCGGGACCG---
D00004522 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Asp GTC -GGTCCCGTAGTGTAGC--GGTT-ATCACGTCGCCCTGTCACGGCGAAG-------------------ATCGCGGGTTCGATTCCCGTCGGGACCG---
D00004527 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Asp GTC -GGTCCTGTGGAGCAGTTTGGAG-TGCTCGCCACCCTGTCAAGGTGGAG-------------------GCCGCGGGTTCAAATCCCGTCAGGACCG---
D00004501 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Asp GTC -GGTCCTGTGGAGCAGTTTGGAG-TGCTCGCCACCCTGTCAAGGTGGAG-------------------GCCGCGGGTTCAAATCCCGTCAGGACCG---
D00000397 Streptomyces_lividans Asp GTC -GGTCCTGTGGAGCAGTTTGGAG-TGCTCGCCACCCTGTCAAGGTGGAG-------------------GCCGCGGGTTCAAATCCCGTCAGGACCG---
D00004554 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Asp GTC -GGAGGCGTGGTGTAGA--GGCCTAACATGCGGCCCTGTCACGGCCGAG-------------------ATCGCGGGTTCGAATCCCGTCGCCTCCGCCA
D00004555 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Asp GTC -GGAGGCGTAGTGTAGA--GGCCTAACATGCGGCCCTGTCACGGCCGAG-------------------ATCGCGGGTTCGAATCCCGTCGCCTCCGCCA
D00000408 Synechocystis_sp. Asp GTC -GGGTCTGTAGTTCAATT-GGTT-AGAGCACCGCCCTGTCACGGCGGAA-------------------GTTGCGGGTTCGAGCCCCGTCAGACCCG---
D00004412 Synechocystis_sp._PCC_6803 Asp GTC -GGGTCTGTAGTTCAATT-GGTT-AGAGCACCGCCCTGTCACGGCGGAA-------------------GTTGCGGGTTCGAGCCCCGTCAGACCCG---
D00004485 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Asp GTC -GGCCCAGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCCAGCCTGTCACGCTGGAG-------------------GCCGAGGGTTCAAGTCCCTTCTGGGTCGCCA
D00004486 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Asp GTC -GGCCCAGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCTAGCCTGTCACGCTAGAG-------------------GTCGAGGGTTCAAGTCCCTTCTGGGTCGCCA
D00004483 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Asp GTC -GGGACTGTAGTTCAATC-GGTT-AGAGCACCGCCCTGTCACGGCGGAA-------------------GTTGCGGGTTCGAGCCCCGTCAGTCCCG---
D00004413 Thermotoga_maritima_MSB8 Asp GTC -GGGGACGTGGTGCAGCCTGGTT-AGCATGCCGGTCTGTCACACCGGTG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGTCGTCCCCGCCA
D00004569 Thermus_thermophilus_HB27 Asp GTC ---CCCCGTGGTGTAGTT-GGTT-AACACACCCGCCTGTCACGTGGGAG-------------------ATCGCGGGTTCGAGTCCCGTCGGGGCCGCCA
D00004570 Treponema_denticola_ATCC_35405 Asp GTC -GGGGGCGTAGCGAAGCT-GGTTTATCGCGCTGGCCTGTCACGCCGGAG-------------------ATCGCGGGTTCGAGCCCCGTCGCTCCCG---
D00000395 Treponema_pallidum Asp GTC -GGGGGCGTAGCGAAGTT-GGTT-ATCGCGCCAGCCTGTCACGCCGGAG-------------------ATCGCGGGTTCGAGCCCCGTCGCTCCCG---
D00004409 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Asp GTC -GGGGGCGTAGCGAAGTT-GGTT-ATCGCGCCAGCCTGTCACGCCGGAG-------------------ATCGCGGGTTCGAGCCCCGTCGCTCCCG---
D00004517 Tropheryma_whipplei_str._Twist Asp GTC -GGCCCTGTGGCGCAGTT-GGTT-AGCGCGCCGCCCTGTCACGGCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCAGGGTCG---
D00004518 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Asp GTC -GGCCCTGTGGCGCAGTT-GGTT-AGCGCGCCGCCCTGTCACGGCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCAGGGTCG---
D00004391 Ureaplasma_parvum_serovar_3 Asp GTC -GGTTCTGTGGTGTAGT--GATT-AACATGCCTCTCTGTCACAGAGGAG-------------------ATCGCGGGTTTGACTCCCGTCAGGACCGCCA
D00004387 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGTC-GGTT-AGAATACCGGCCTGTCACGCCGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGCTCCGCCA
D00004571 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Asp GTC -GGGGGTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCATGCCTGTCACGCATGAG-------------------GTCGTGAGTTCAAGTCTCATCACTCCCGCCA
D00004488 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGCT-GGTT-AGAATGCTGGCCTGTCACGCCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGCTCCGCCA
D00004487 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGCT-GGTT-AGAATGCTGGCCTGTCACGCCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGCTCCGCCA
D00004414 Xylella_fastidiosa_9a5c Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGCT-GGTT-AGAATGCTGGCCTGTCACGCCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGCTCCGCCA
D00004519 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGCT-GGTT-AGAATGCTGGCCTGTCACGCCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGCTCCGCCA
D00004556 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Asp GTC -GGTGCGGTAGTTCAGTC-GGTT-AGAATACCGGCCTGTCACGCCGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGCACCGCCA
D00004557 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGTT-GGTT-AGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCCGTTCCGCCA
D00004428 Yersinia_pestis_CO92 Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGTT-GGTT-AGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCCGTTCCGCCA
D00004429 Yersinia_pestis_CO92 Asp GTC -GGTGCGGTAGTTCAGTC-GGTT-AGAATACCGGCCTGTCACGCCGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGCACCGCCA
D00004490 Yersinia_pestis_KIM Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGTT-GGTT-AGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCCGTTCCGCCA
D00004491 Yersinia_pestis_KIM Asp GTC -GGTGCGGTAGTTCAGTC-GGTT-AGAATACCGGCCTGTCACGCCGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGCACCGCCA
D00004492 Yersinia_pestis_KIM Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGTT-GGTT-AGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCCGTTCCGCCA
D00004558 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Asp GTC -GGAGCGGTAGTTCAGTT-GGTT-AGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCCGTTCCGCCA
D00004559 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Asp GTC -GGTGCGGTAGTTCAGTC-GGTT-AGAATACCGGCCTGTCACGCCGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGCACCGCCA
D00000504 Arabidopsis_thaliana Asp GTC -GTCGTTGTAGTATAGT--GGTA-AGTATTCCCGCCTGTCACCCGGGTG-------------------A-CCCGGGTTCGATCCCCGGCAACGGCG---
D00000505 Arabidopsis_thaliana Asp GTC -GTCGTTGTAGTATAGT--GGTA-AGTATTCCCGCCTGTCACGCGGGTG-------------------A-CCCGGGTTCGATCCCCGGCAACGGCG---
D00004459 Arabidopsis_thaliana Asp GTC -GGGATTGTAGTTCAATC-GGTC-AGAGCACCGCCCTGTCAAGGCGGAA-------------------GCTGCGGGTTCGAGCCCCGTCAGTCCCG---
D00004460 Arabidopsis_thaliana Asp GTC -GTCGTTGTAGTATAGT--GGTA-AGGATTCCCGCCTGTCACGCGGGTG-------------------A-CCCGGGTTCGATCCTCGGCAACGAC----
D00004461 Arabidopsis_thaliana Asp GTC -GTCGTTGTAGTATAGT--GGTA-AGTATTCCCGCCTGTCACGCGGGTG-------------------A-CCCGGGTTCGATCCCCGGCAAAGGCG---
D00004462 Arabidopsis_thaliana Asp GTC -GTCGTTGTAGTATAGT--GGTA-AGTATTCCCGCCTGTCACGCGGGTG-------------------A-CCCGGGTTCGATCCCCGGCAACGGCG---
D00000507 Caenorhabditis_elegans Asp GTC -TCCTCGGTAGTATAGT--GGTG-AGTATCCGCGTCTGTCACATGCGAG-------------------A-CCCGGGTTCAATTCCCGGCCGGGGAG---
D00004463 Caenorhabditis_elegans Asp GTC -TCCTCGGTAGTATAGT--GGTG-AGTATCCGCGTCTGTCACATGCGAG-------------------A-CCCGGGTTCAATTCCCGGCCGGGAG----
D00004464 Caenorhabditis_elegans Asp GTC -TCCTCGGTAGTATAGT--GGTG-AGTATCCGCGTCTGTCACATGCGAG-------------------A-CCCTGGTTCAATTCCCGGCCGGGGAG---
D00004465 Caenorhabditis_elegans Asp GTC -TCCTCGGTAGTATAGT--GGTG-AGTATCCGCGTCTGTCACATGCGAG-------------------A-CCCGGGTTCAATTCCCGGCCGGGGAG---
D00000499 Candida_albicans Asp GTC -TCTCTTGTAGTTTAAC--GGTC-AGAATACGCGCTTGTCACGCGCGTG-------------------A-TCGGGGTTCGATTCCCCGCAAGAGAG---
D00004560 Candida_glabrata_CBS_138 Asp GTC -TCCGCGATAGTTTAAT--GGTC-AGAATGGGCGCTTGTCGCGTGCCAG-------------------A-TCGGGGTTCAATTCCCCGTCGCGGAG---
D00000508 Drosophila_melanogaster Asp GTC -TCCTCGATAGTATAGT--GGTT-AGTATCCCCGCCTGTCACGCGGGAG-------------------A-CCGGGGTTCAATTCCCCGTCGGGGAG---
D00004468 Drosophila_melanogaster Asp GTC -CCTCCGATAGTATAGT--GGTTAAGTATCCCCGCCTGTCACGCGGGAG-------------------A-CCGGGGTTCAATTCCCCGTCGGGGA----
D00004469 Drosophila_melanogaster Asp GTC -TCCTCGATAGTATAGT--GGTT-AGTATCCCCGCCTGTCACGCGGGAG-------------------A-CCGGGGTTCAATTCCCCGTCTGGGAG---
D00004470 Drosophila_melanogaster Asp GTC -TCCTCGATAGTATAGT--GGTT-AGTATCCCCGCCTGTCACGCGGGAG-------------------A-CCGGGGTTCAATTCCCCGTCGGGGAG---
D00004489 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Asp GTC -TCTTCCATAGTGTAGT--GGTATATCATATCCGCCTGTCACGCGGGTG-------------------A-CCCGGGTTCGAATCCCGGTGGGAGAG---
D00000509 Gallus_gallus Asp GTC -TCCTCGTTAGTATAGT--GGTG-AGTATCCCCGCCTGTCACGCGGGAG-------------------A-CCGGGGTTCGATTCCCCGACGGGGAG---
D00004578 Gallus_gallus Asp GTC -TTCTCATTAGTATAGT--GGTG-AGTATTCCCACCTGTCACGTGGGAG-------------------A-CCAGGGTTCGATTCCCTGATAAAATT---
D00004579 Gallus_gallus Asp GTC -TCCTCGTTAGTATAGT--GGTA-AGTATCCCCGCCTGTCACGCGGGAG-------------------A-CCGGGGTTCGATTCCCCGACGGGGAG---
D00004580 Gallus_gallus Asp GTC -TCCTCGTTAGTATAGT--GGTG-AGTATCCCCGCCTGTCACGCGGGAG-------------------A-CCGGGGTTCGATTCCCCGACGGGGAG---
D00004581 Gallus_gallus Asp GTC -TCCTCGTTAGTATAGA--GGTA-AGTATTTCTGCCTGTCACATGGGAG-------------------G-CCGGAGTTTGATTCCCTGATGGGGTG---
D00000506 Glycine_max Asp GTC -GTCGTTGTAGTATAGT--GGTA-AGTATTCCCGCCTGTCACGCGGGTG-------------------A-CCCGGGTTCGATCCCCGGCAACGGCG---
D00004452 Homo_sapiens Asp GTC -TCCTTGTTAGTATAGT--GGTG-AGTGTTTCTGCCTGTCATGTGGAGA---------------------CTGGAGTTTGAGTCCCCAACAGGGA----
D00004453 Homo_sapiens Asp GTC -TACTCGTTAGTATAGT--GGTG-CGTATCCCCGTCTGTCACGCGGGAG-------------------A-GCGGGGTTCGCTCTCCCGACGGGGA----
D00004454 Homo_sapiens Asp GTC -TCCTCATCAGTATAGT--GGTG-AGTATCCCCGCCTGTCACGCGGGAG-------------------A-CTGGGGTTCGATTCCCTGAGGAGGA----
D00004455 Homo_sapiens Asp GTC -TCCTCGTTAGTATGGT--GGTG-AGTATCCCTGCCTGTCACGCGGGAG-------------------A-CCGGGGTTCGATTCCCCAACGGGGA----
D00004456 Homo_sapiens Asp GTC -TCCTCGTTAGTATAGT--GGTG-AGTGTCCCCGTCTGTCACGCGGGAG-------------------A-CCGGGGTTCGATTCCCCGACGGGGAG---
D00004457 Homo_sapiens Asp GTC -TCCTCGTTAGTATAGT--GGTG-AGTATCCCCGCCTGTCACGCGGGAG-------------------A-CCGGGGTTCGATTCCCCGACGGGGAG---
D00004458 Homo_sapiens Asp GTC -TCCTCGTTAGTATAGT--GGTT-AGTATCCCCGCCTGTCACGCGGGAG-------------------A-CCGGGGTTCAATTCCCCGACGGGGAG---
D00000510 Mus_musculus Asp GTC -TCCTCGTTAGTATAGT--GGTG-AGTATCCCCGCCTGTCACGCGGGAG-------------------A-CCGGGGTTCGATTCCCCGACGGGGAG---
D00004590 Pan_troglodytes Asp GTC -TTCTCGTTAGTATAGT--GGTG-AGTATCCCCGCCTGTCACGGGGGGA-------------------GACCGGGGTTTGATCTCCCGACGGGGAG---
D00004591 Pan_troglodytes Asp GTC -TTCTCGTTAGTATAGT--GGTG-AGTATCCCCGCCTGTCACGGGGGAG-------------------A-CCGGGGTTTGATCTCCCGACGGGGAG---
D00004592 Pan_troglodytes Asp GTC -TTCTTGTTAATACAGT--GGTG-AGTATTCCCACCTGTCATGCGGGAG---------------------ACGGGGTTCAATTCCCTGATGGGGAG---
D00004593 Pan_troglodytes Asp GTC --TCCTCTTAGTATAGT--GGTG-AGTATCCCCGCCTGTCACGCGGGAG-------------------A-CTGGGGTTCGATTCCCTGACAAGGAG---
D00004594 Pan_troglodytes Asp GTC -TCCTCGTTAGTATGGT--GGTG-AGTATCCCTGCCTGTCACGCGGGAG-------------------A-CCGGGGTTCGATTCCCCAACGGGGAG---
D00004595 Pan_troglodytes Asp GTC -TCCTCGTTAGTATAGT--GGTG-AGTATCCCCGCCTGTCACGCGGGAG-------------------A-CCGGGGTTCGATTCCCCGACGGGGAG---
D00004596 Pan_troglodytes Asp GTC -TCCTCGTTAGTATAGT--GGTT-AGTATCCCCGCCTGTCACGCGGGAG-------------------A-CCGGGGTTCAATTCCCCGACGGGGAG---
D00004597 Pan_troglodytes Asp GTC -TCCTCGTTAGTATAGT--GGTG-AGTATCCCCGCCTGTCACGCGGGAG-------------------G-CCGGGGTTCGATTCCCCGACGGGGAG---
D00000500 Phytophthora_parasitica Asp GTC -TTCTCGTTAGTATAGT--GGTT-AGTATACCCGCCTGTCACGCGGGTG-------------------A-CCCGGGTTCAATTCCCGGACGGGAAG---
D00000498 Plasmodium_falciparum Asp GTC -GAATTTGTAGTTTAATTAGGTA-AAAATATTATTTTGTCATAATAAAG-------------------AATACGAGTTCAATTCTCGTCAAATTCG---
D00004575 Plasmodium_falciparum_3D7 Asp GTC -TCCGAGATAGTATAGT--GGCA-AGTATTTCCGCCTGTCACGCGGAAG-------------------A-CCCGGGTTCAATTCCCGGTCTCGGAG---
D00000511 Rattus_norvegicus Asp GTC -TCCTCGTTAGTATAGT--GGTG-AGTATCCCCGCCTGTCACGCGGGAG-------------------A-CCGGGGTTCGATTCCCCGACGGGGAG---
D00000501 Saccharomyces_cerevisiae Asp GTC -TCCGTGATAGTTTAAT--GGT--CAGAATGGGGCTTGTCGCGTGCCAG-------------------A-TCGGGGTTCAATTCCCCGTCGCGGAG---
D00000502 Saccharomyces_cerevisiae Asp GTC -TCCGTGATAGTTTAAT--GGTC-AGAATGGGCGCTTGTCGCGTGCCAG-------------------A-TCGGGGTTCAATTCCCCGTCGCGGAG---
D00004466 Saccharomyces_cerevisiae Asp GTC -TCCAACAAGTTTAATG--GTC--AGAATGGGCGCTTGTCGCGTGCCAG-------------------A-TCGGGGTTCAATTCCCCGTCGCGGA----
D00004467 Saccharomyces_cerevisiae Asp GTC -TCCGTGATAGTTTAAT--GGTC-AGAATGGGCGCTTGTCGCGTGCCAG-------------------A-TCGGGGTTCAATTCCCCGTCGCGGAG---
D00000503 Schizosaccharomyces_pombe Asp GTC -TCTCCTTTAGTATAGG--GGT--AGTACACAAGCCTGTCACGCTTGCA-------------------G-CCCGGGTTCGAATCCCGGAGGGAGAG---
D00004471 Schizosaccharomyces_pombe Asp GTC -TCTCCTTTAGTATAGG--GGT--AGTACACAAGCCTGTCACGCTTGCA-------------------G-CCCGGGTTCGAATCCCGGAGGGAGAG---
D00004582 Takifugu_rubripes Asp GTC -TCCTAGTCAGTATAAT--GGAC-AGTATCTCTGCCTGTCACGCGGAAG-------------------A-GCGGGGTTCGATTCCCCGAGGAGGAG---
D00004583 Takifugu_rubripes Asp GTC -TCCTAGTCAGTATAAT--GGAC-AGTATCTCCGCCTGTCACGCGGAAG-------------------A-GCGGGGTTCGATTCCCTGAGGAGGAG---
D00004584 Takifugu_rubripes Asp GTC -TCCTCGTTAGTATAGT--GGAC-AGTATCTTCGCCTGTCACGCGGAAG-------------------A-CCGGGGTTCGATTCCCCGACGGGGAG---
D00004585 Takifugu_rubripes Asp GTC -TCCTCGTTAGTATAGT--GGAC-AGTATCTCCGCCTGTCACGCGGAAG-------------------A-CCGGGGTTCGATTACCCGACGGGGAG---
D00004586 Takifugu_rubripes Asp GTC -TCCTCGTTAGTATAGT--GGAC-AGTGTCTCCGCCTGTCACGCGGAAG-------------------A-CCGGGGTTCGATTCCCCGACGGGGAG---
D00004587 Takifugu_rubripes Asp GTC -TCCTCGTTAGTATAGT--GGAC-AGTATCTCCGCCTGTCACGCGGAAG-------------------A-CCGGGGTTCGATTCCCCGACGGGGAG---
D00004588 Takifugu_rubripes Asp GTC -TCCTCGTTAGTATAGT--GGTG-AGTATCCCCGCCTGTCACGCGGGAG-------------------A-CCGGGGTTCGATTCCCCGACGGGGAG---
D00004589 Pan_troglodytes Asp ATC -GGGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGTGTGTACTTATCATGCACGAG-------------------GTCTTGGGCTGATTTCCCAGTACCTCCA---
D00006151 Aeropyrum_pernix_K1 Lys CTT -GGGCCCGTAGCTCAGCCTGGT--AGAGCGGCGGGCTCTTACCCCGCGG--------AA---------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGCCCGCC-
D00001335 Archaeoglobus_fulgidus Lys CTT -GGGCCGGTAGCTTAGCCAGGC--AGAGCGCGGGACTCTTAATCCCGCA-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCTCCCGGCCCG---
D00006153 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Lys CTT -GGGCCGGTAGCTTAGCCAGGC--AGAGCGCGGGACTCTTAATCCCGCA-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCTCCCGGCCCG---
D00006155 Halobacterium_sp._NRC-1 Lys CTT -GGGCCGGTAGCTCAGTCTGGC--AGAGCGACGGACTCTTAATCCGTCG-------------------GTCGCGTGTTCAAATCGCGCCCGGCCCG---
D00011927 Methanosarcina_acetivorans_C2A Lys CTT -GGGCCCGTAGCTTAGTCAGGC--AGAGCGATGGACTCTTAATCCATAG-------------------GCCGGGGGTTCAAATCCCTTCGGGCCCG---
D00006230 Methanosarcina_mazei_Go1 Lys CTT -GGGCCCGTAGCTTAGTCAGGC--AGAGCGATGGACTCTTAATCCATAG-------------------GCCGGGGGTTCAAATCCCTTCGGGCCCG---
D00011933 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Lys CTT -GGGTCTGTAGCTTAGTC-GGT--AGAGCGGCGGACTCTTAATCCGCAG-------------------GCCAGGGGTTCGAGTCCCTTCAGGCCCG---
D00006160 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Lys CTT -GGGCCCGTAGCTCAGCCTGGT--AGAGCGGCGGGCTCTTAACCCGTAG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCACCGGGCCCG---
D00006162 Pyrococcus_abyssi_GE5 Lys CTT -GGGCCGGTAGCTTAGCCTGGTT-AGAGCGGCGGACTCTTAATCCGCAG-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCCCCCGGCCCGCC-
D00006164 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Lys CTT -GGGCCGGTAGCTTAGCCTGGTT-AGAGCGGCGGACTCTTAATCCGCAG-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCCCCCGGCCCGCC-
D00006166 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Lys CTT -GGGCCGGTAGCTTAGCCTGGTT-AGAGCGGCGGACTCTTAATCCGCAG-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCCCCCGGCCCGCCA
D00012085 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Lys CTT -GGGCCCGTAGCTCAGCCAGGT--AGAGCGGCGGGCTCTTAACCCGTAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGCCCG---
D00006168 Sulfolobus_solfataricus_P2 Lys CTT -GGGCCCGTAGCTTAGCCAGGT--AGAGCGACGGGCTCTTAACCCGTAG-------------------T-CCCGGGTTCGAATCCCGGCGGGCCC----
D00006245 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Lys CTT -GGGCCCGTAGCTCAGCCAGGT--AGAGCGGCGGGCTCTTAACCCGTAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGCCCG---
D00006170 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Lys CTT -GGGTCCGTAGCTTAGCTAGGT--AGAGCGATGGACTCTTAATCCATAG-------------------GTCAGGGGTCCAAATCCCCTCGGACCCG---
D00006172 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Lys CTT -GGGTCCGTAGCTTAGCTAGGT--AGAGCGATGGACTCTTAATCCATAG-------------------GTCAGGGGTCCAAATCCCCTCGGACCCG---
D00001348 Acholeplasma_laidlawii Lys CTT -GCATCCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACAGACTCTTAATCTGTGG-------------------GTCCACGGTTCGAGCCCGTGTGGGTGTACCA
D00006145 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Lys CTT -GGGTGATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTCGTAGGTTCGAGCCCTACATCACCCACCA
D00006114 Aquifex_aeolicus_VF5 Lys CTT -GGGCTGCTAGCTCAATA-GGC--AGAGCGGCGGACTCTTAATCCGCAG-------------------GTTCCGGGTTCGAGTCCCGGGCAGCCCACCA
D00006321 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Lys CTT -GCACTCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACTGACTCTTAATCAGTGG-------------------GTCCAGGGTTCGAATCCCTGAGGGTGTA---
D00006327 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Lys CTT -GGGTGATTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTCGTGGGTTCGATTCCCTCATCACCCACCA
D00006384 Bartonella_quintana_str._Toulouse Lys CTT -GGGTGATTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTCGTGGGTTCGATTCCCTCATCACCCACCA
D00006259 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Lys CTT -GCCCCTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGT-------------------GTCCAGGGTTCGAATCCCTGCGGGGGCA---
D00001353 Borrelia_burgdorferi Lys CTT -GGGCTGCTAGCTCAAT--GGT--AGAGCATCGGACTCTTAATCCGCTG-------------------GTTACAGGTTCAAGTCCTGTGCAGCTCA---
D00006092 Borrelia_burgdorferi_B31 Lys CTT -GGGCTGCTAGCTCAAGT-GGT--AGAGCATCGGACTCTTAATCCGCTG-------------------GTTACAGGTTCAAGTCCTGTGCAGCTCA---
D00006345 Borrelia_garinii_PBi Lys CTT -GGGCTGCTAGCTCAAGT-GGT--AGAGCATCGGACTCTTAATCCGTTG-------------------GTTACAGGTTCAAGTCCTGTGCAGCTCA---
D00006281 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Lys CTT -GGGCGCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTCCCAGGTTCGAGCCCTGGTGCGCCCACCA
D00006130 Brucella_melitensis_16M Lys CTT -GGGTGATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTCGTAGGTTCGATCCCTACATCACCCACCA
D00006262 Brucella_suis_1330 Lys CTT -GGGTGATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTCGTAGGTTCGATCCCTACATCACCCACCA
D00006386 Candidatus_Blochmannia_floridanus Lys CTT -GGGTCGTTAGCTCAAT--GGT--AGAGCAGTTGACTCTTAATCAATTG-------------------ATTGTAGGTTCGAGTCCTACACGACCCA---
D00006095 Caulobacter_crescentus_CB15 Lys CTT -GGGTGTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTCCAAGGTTCGAATCCTTGTACACCCACCA
D00006227 Chlorobium_tepidum_TLS Lys CTT -GCACTCGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACTGACTCTTAATCAGTGG-------------------GTCCAAGGTTCGAGTCCTTGCGAGTGCACCA
D00006128 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Lys CTT -GCGTTATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCTGACTCTTAATCAGGGT-------------------GCCCAGGGTTCGAATCCCTGATGACGCACCA
D00006121 Clostridium_perfringens_str._13 Lys CTT -GCACCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCTGACTCTTAATCAGGGA-------------------GTCCAGGGTTCGAATCCCTGATGGTGCACCA
D00006283 Clostridium_tetani_E88 Lys CTT -GTGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCTGACTCTTAATCAGGGT-------------------GTCCAGGGTTCGACTCCCTGATGGCGCACCA
D00006329 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Lys CTT -GCGCCATTAGCTCAATT-GGC--AGAGCAACTGACTCTTAATCAGTGG-------------------GTTCGGGGTTCAAGTCCCTGATGGCGCA---
D00006263 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Lys CTT -GCGTCATTAGCTCAATT-GGT--AGAGCATCTGACTCTTAATCAGAGG-------------------GTTCGGGGTTCGATTCCCTGATGACGCA---
D00006264 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Lys CTT -GCGTCATTAGCTCAATT-GGT--AGAGCATCTGACTCTTAATCAGAGG-------------------GTTCGGGGTTCGATTCCCTGATGACGCACCA
D00006234 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Lys CTT TGCGTCATTAGCTCAATT-GGT--AGAGCATCTGACTCTTAATCAGAGG-------------------GTTCGGGGTTCGATTCCCTGATGACGCA---
D00006235 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Lys CTT TGCGTCATTAGCTCAATT-GGC--AGAGCATCTGACTCTTAATCAGAGG-------------------GTTCGGGGTTCGATTCCCTGATGACGCA---
D00006305 Coxiella_burnetii_RSA_493 Lys CTT -GGGCCGTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTCCACGGTTCGAGCCCGTGACGGCCCA---
D00006097 Deinococcus_radiodurans_R1 Lys CTT -GGGTCGTTAGCTCAATT-GGC--AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTTGTAGGTTCGATTCCTACACGACCCACCA
D00006366 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Lys CTT -GGGTCATTAGCTCAATT-GGT--AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGTTG-------------------GTTCGGGGTTCGAGTCCCTGATGGCCCACCA
D00006285 Enterococcus_faecalis_V583 Lys CTT -GGGCTGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGATGACTCTTAATCATCGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCTCACAGCCCA---
D00006229 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Lys CTT -GCGTCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTCTTAATCAGGAG-------------------GTCACAGGTTCGACCCCTGTATGACGCACCA
D00001363 Haemophilus_influenzae Lys CTT -GGGTTGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGTAGCGGACTCTTAATCCGTCA-------------------GTCGAGAGTTCTAGTCTCTCACAACCCACCA
D00006090 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Lys CTT -GGGTTGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGTAGCGGACTCTTAATCCGTCA-------------------GTCGAGAGTTCTAGTCTCTCACAACCCACCA
D00006298 Helicobacter_hepaticus_ATCC_51449 Lys CTT -GGACGTGTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCAACTGACTCTTAATCAGTGG-------------------GTCCAGAGTTCGATCCTCTGCGCGTCCACCA
D00006347 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Lys CTT -GGGTGGTTAGCTCAGCT-GGC--AGAGCAACGGACTCTTAATCCGTGG-------------------GTCCAGGGTTCGATCCCCTGACCACCCA---
D00006349 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Lys CTT -GCGCCTCTAGCTCAATC-GGC--AGAGCAATTGACTCTTAATCAATGG-------------------GTTCAGGGTTCAAGTCCCTGGGGGCGCA---
D00006116 Listeria_innocua_Clip11262 Lys CTT -GGGTTGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTCGGGGGTTCGAAACCCTCACAACCCA---
D00006118 Listeria_monocytogenes_EGD-e Lys CTT -GGGTTGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTCGTGGGTTCGAAACCCTCACAACCCA---
D00006367 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Lys CTT -GGGTTGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTCGGGGGTTCGAAACCCTCACAACCCA---
D00006133 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Lys CTT -GGGTGCGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTCCACAGTTCAATCCTGTGCGCACCCACCA
D00006300 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Lys CTT -GCGCCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTCCGGGGTTCGAAACCCTGACGGCGCA---
D00006080 Mycobacterium_leprae_TN Lys CTT -GCGCCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTCCGGGGTTCGAAACCCTGACGGCGCA---
D00006071 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Lys CTT -GCGCCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTCCGGGGTTCGAAACCCTGACGGCGCA---
D00006333 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Lys CTT -GCGCCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTCCGGGGTTCGAAACCCTGACGGCGCA---
D00001342 Mycoplasma_capricolum Lys CTT -GTCTGATTAGCGCAACT-GGC--AGAGCAACTGACTCTTAATCAGTGG-------------------GTTGTGGGTTCGATTCCCACATCAGGCACCA
D00006296 Mycoplasma_gallisepticum_R Lys CTT -GCTTCTTTAGCTCAGAC-GGT--AGAGCAAGTGACTCTTAATCACTGG-------------------GTCGTGGGTTCGATCCCCTCAAGGAGCACCA
D00001344 Mycoplasma_genitalium Lys CTT -GCATCTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAAATGACTCTTAATCATTGG-------------------GTCGTGGGTTCGATCCCCTCAAGATGCACCA
D00006099 Mycoplasma_genitalium_G37 Lys CTT -GCATCTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAAATGACTCTTAATCATTGG-------------------GTCGTGGGTTCGATCCCCTCAAGATGCACCA
D00001346 Mycoplasma_pneumoniae Lys CTT -GCATCTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAAATGACTCTTAATCATTGG-------------------GTCGGGGGTTCGAGCCCCTCAAGATGCACCA
D00006101 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Lys CTT -GCATCTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAAATGACTCTTAATCATTGG-------------------GTCGGGGGTTCGAGCCCCTCAAGATGCACCA
D00006143 Nostoc_sp._PCC_7120 Lys CTT -GGGTGACTAGCTCAAC--GGT--AGAGCAGTAGACTCTTAATCTATTG-------------------GTTGCGGGTTCAAATCCCTCGTCACCCA---
D00006336 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Lys CTT -GGGTTGTTAGCTCAGTC-GGC--AGAGCAGTTGACTCTTAATCAATTG-------------------GCCCGGGGTTCGAGCCCCCGACAACCCACCA
D00006352 Porphyromonas_gingivalis_W83 Lys CTT -GACTCCGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAAATGACTCTTAATCATTGG-------------------GTCGTGAGTTCGAGCCTCACCGGGGTCA---
D00006371 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Lys CTT -GCGCTGCTAGCTCAATT-GGC--AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTTCAGGGTTCGAGTCCCTGGCGGCGCA---
D00006140 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Lys CTT -GGGGCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCGGACTCTTAATCCGTAG-------------------GTCGAGTGTTCGAGTCACTCACGCCCCACCA
D00006316 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Lys CTT -GGGATTGTGGCAGACAA-GGT--AATGCATCGGACTCTTAATCCGAGC-------------------GATGTGAGTTCGATTCTCACCGATCCCA---
D00006319 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Lys CTT -GCCCTTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACGGACTCTTAATCCGTGG-------------------GTCCTAGGTTCGAGCCCTAGCGGGGGCA---
D00006337 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Lys CTT -GGGCGCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTCCTAGGTTCGAGCCCTAGTGCGCCCACCA
D00006150 Sinorhizobium_meliloti_1021 Lys CTT -GGGTGATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTCCACGGTTCGAGCCCGTGATCACCCACCA
D00006276 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Lys CTT -GCCTCCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTAGACTCTTAATCTATGG-------------------GTCACAGGTTCGAGCCCTGTAGGGGGCA---
D00006241 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Lys CTT -GCCTCCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTAGACTCTTAATCTATGG-------------------GTCACAGGTTCGAGCCCTGTAGGGGGCA---
D00006278 Streptococcus_mutans_UA159 Lys CTT -CCTTCCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTGGACTCTTAATCCATGG-------------------GTCGTAGGTTCGAGCCCTACAGGGAGGA---
D00006125 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Lys CTT -GCCTCCTTAGCTCAGCT-GGC--AGAGCAGCGGACTCTTAATCCGTGG-------------------GTCACAGGTTCGATCCCTGTAGGGGGCA---
D00006124 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Lys CTT -GCCTCCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTAGACTCTTAATCTATGG-------------------GTCACAGGTTCGAGCCCTGTAGGGGGTA---
D00006242 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Lys CTT -GCCTCCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTAGACTCTTAATCTATGG-------------------GTCACAGGTTCGAGCCCTGTAGGGGGTA---
D00006303 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Lys CTT -GCCTCCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTAGACTCTTAATCTATGG-------------------GTCACAGGTTCGAGCCCTGTAGGGGGTA---
D00006312 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Lys CTT -GCGCCGCTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTCCGGGGTTCGAGTCCCTGGCGGCGCA---
D00006313 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Lys CTT -GCGCCGCTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTCCGGGGTTCGAGTCCCTGGCGGCGCA---
D00006270 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Lys CTT -GCGCCGCTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTCCGGGGTTCGAGTCCCTGGCGGCGCA---
D00006271 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Lys CTT -GCGCCGCTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTCCGGGGTTCGAGTCCCTGGCGGCGCA---
D00001354 Streptomyces_lividans Lys CTT -GCGCCGCTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTCCGGGGTTCGAGTCCCTGGCGGCGCA---
D00006354 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Lys CTT -GGACCGCTAGCTCAATT-GGT--AGAGCATCCGACTCTTAATCGGCAG-------------------GTTGTAGGTTCGAGTCCTACGCGGTCCACCA
D00006247 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Lys CTT -GCGCCATTAGCTCAGTT-GGC--AGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGG-------------------GTCCGGGGTTCGAATCCCTGATGGCGCACCA
D00006108 Thermotoga_maritima_MSB8 Lys CTT -GGGCCGTTAGCTCAACA-GGT--AGAGCACCTGATTCTTAATCAGGGG-------------------GTTGCAGGTTCGAGTCCTGCACGGCCCACCA
D00006373 Thermus_thermophilus_HB27 Lys CTT TGGGCCGCTAGCTCAACT-GGT--AGAGCAACCGACTCTTAATCGGTGG-------------------GTTACAGGTTCGAGTCCTGTGCGGCCCACCA
D00006376 Treponema_denticola_ATCC_35405 Lys CTT -GGGCCATTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCAACAGACTCTTAATCTGTGG-------------------GTCGCAGGTTCGAAGCCTGCATGGCTCA---
D00001350 Treponema_pallidum Lys CTT -GGGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACAGACTCTTAATCTGTGG-------------------GTCGCAGGTTCGAAGCCTGCATGGCTCA---
D00006104 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Lys CTT -GGGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACAGACTCTTAATCTGTGG-------------------GTCGCAGGTTCGAAGCCTGCATGGCTCA---
D00006290 Tropheryma_whipplei_str._Twist Lys CTT -GCGCCTCTAGCTCAATC-GGC--AGAGCAACTGACTCTTAATCAGCAG-------------------GTTCTGGGTTCGAGTCCCAGGGGGCGCA---
D00006292 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Lys CTT -GCGCCTCTAGCTCAATC-GGC--AGAGCAACTGACTCTTAATCAGCAG-------------------GTTCTGGGTTCGAGTCCCAGGGGGCGCA---
D00006082 Ureaplasma_parvum_serovar_3 Lys CTT -GCTCTGTTAGCTCAGTA-GGT--AGAGCAACTGACTCTTAATCAGTGG-------------------GTCGCGGGTTCGAAACCCTCACAGAGCACCA
D00006252 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Lys CTT -GGGCCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTCTTAATCAATAG-------------------GTCCAAGGTTCGAATCCTTGACGGCCCACCA
D00006250 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Lys CTT -GGGCCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTCTTAATCAATAG-------------------GTCCAAGGTTCGAATCCTTGACGGCCCACCA
D00006110 Xylella_fastidiosa_9a5c Lys CTT -GGGCCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTCTTAATCAATAG-------------------GTCCAAGGTTCGAATCCTTGACGGCCCACCA
D00006295 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Lys CTT -GGGCCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTCTTAATCAATAG-------------------GTCCAAGGTTCGAATCCTTGACGGCCCACCA
D00006357 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Lys CTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTCTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCGAACCCTGCACGACCCACCA
D00006135 Yersinia_pestis_CO92 Lys CTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTCTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCGAACCCTGCACGACCCACCA
D00006257 Yersinia_pestis_KIM Lys CTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTCTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCGAACCCTGCACGACCCACCA
D00006359 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Lys CTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTCTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCGAACCCTGCACGACCCACCA
D00006196 Arabidopsis_thaliana Lys CTT -CATCGTCTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAAGGCTCTTAACTTTGTGGA------CTTG-----TGGTCATTGGTTCGAGTTACATGGTGGGC----
D00006197 Arabidopsis_thaliana Lys CTT -GCCCGTCTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAAGGCTCTTAACCTTCTG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACGGTGGGC----
D00006198 Arabidopsis_thaliana Lys CTT -GCCCGTCTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAAGGCTCTTAACCTTGTG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACGGTGGGC----
D00006199 Arabidopsis_thaliana Lys CTT -GCCCGTCTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAAGGCTCTTAACCTTGTG-------------------GTCGTGGGTTCGAACCCCACGGTGGGC----
D00001469 Bombyx_mori Lys CTT -GCCCGGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATGAGACTCTTAATCTCAGG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACGTTGGGCG---
D00001467 Caenorhabditis_elegans Lys CTT -GCCCGGTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCACCAGACTCTTAATCTGGTT-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGCATTGGGCT---
D00001468 Caenorhabditis_elegans Lys CTT -GCCCGGTTAGCTCAGTCTACCG-ACTGCACCAGACTCTTAATCTGGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAGTCCCGCATTGGGCT---
D00006204 Caenorhabditis_elegans Lys CTT -GCCCGGTTAGCTCAGTCTACCG-ACTGCACCAGACTCTTAATCTGGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAGTCCCGCATTGGGCT---
D00006205 Caenorhabditis_elegans Lys CTT -GTAAAAATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCACCAGACTCTTAATCTGGTT-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGCATTGGGC----
D00006206 Caenorhabditis_elegans Lys CTT -GACACGGTGGCCGAGT--GGTTTAAGGCATGAGACACTTGATCTCAAACGGT----TCTA---ACCGAACGCAGGTTCGAATCCTGCCCGTGTC----
D00006207 Caenorhabditis_elegans Lys CTT -GCCTGGTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCACCAGACTCTTAATCTGGTT-------------------GTCGCGGTTTCGAGCCCCGCATTGGGCT---
D00006208 Caenorhabditis_elegans Lys CTT -GCCCGGTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCACCAGACTCTTAATCTGGTT-------------------CTCGCGGGTTCGAGCCCCGCATTGGGCT---
D00006209 Caenorhabditis_elegans Lys CTT -GCCCGGTTAGCTCAGCC-GGT--AGAGCACCAGACTCTTAATCTGGTT-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGCATTGGGCT---
D00006210 Caenorhabditis_elegans Lys CTT -GCCCGGTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCACCAGACTCTTAATCTGGTT-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGCATTGGGCT---
D00006361 Candida_glabrata_CBS_138 Lys CTT -GCCTTGTTGGCGCAATC-GGT--AGCGCGTATGACTCTTAATCATAAG-------------------GTTAGGGGTTCGAGCCCCCTACAGGGCT---
D00001462 Dictyostelium_discoideum Lys CTT -GCCCGGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGCCAGACTCTTAATCTGGTG-------------------GTCGGGGGTTCGAGCCCCCCGTTGGGCG---
D00001470 Drosophila_melanogaster Lys CTT -GCCCGGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATGAGACTCTTAATCTCAGG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACGTTGGGCG---
D00006217 Drosophila_melanogaster Lys CTT -GCCCGGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATGAGACTCTTAATCTCAGG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACGTTGGGCG---
D00006254 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Lys CTT -GCCTGGCTAGCTCAACA-GGAT-AGAGCGACAGACTCTTAATCTGTAG-------------------GCTGCGGGTTCGAGTCCCGCGCTGGGTA---
D00001474 Gallus_gallus Lys CTT -GCCCGGCTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATGAGACTCTTAATCTCAGG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACGTTGGGCG---
D00006388 Gallus_gallus Lys CTT -GCCCGGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATGAGACTCTTAATCTCAGG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACGTTGGGCG---
D00006389 Gallus_gallus Lys CTT -GCCCGGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATGGGACTCTTAATCCCAGG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACGTTGGGCG---
D00001479 Homo_sapiens Lys CTT -GCCCGGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATGAGACTCTTAATCTCAGG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACGTTGGGCG---
D00006174 Homo_sapiens Lys CTT -AACCGAATAGCTTAGTT-GAT--GAAGCGTGAGACTCTTAATCTCAGG-------------------GTAGTGGGTTCAAGCCCCACATTGGAC----
D00006175 Homo_sapiens Lys CTT -GCAGGTGTAGCAAAAT--GGT--TATGCGGCTGACTCTTAATCAGTAA--------G----------ACGATGGGTTCAATTCCCTCCACCTGT----
D00006176 Homo_sapiens Lys CTT -CTGCAGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATGAGACTCTTAATCTCAGG-------------------GTCATGGGTTCGTGCCCCATGTTGGGT----
D00006177 Homo_sapiens Lys CTT -GCCCAGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATAAGACTCTTAATCTCAGG-------------------GTTGTGGATTCGTGCCCCATGCTGGGT----
D00006178 Homo_sapiens Lys CTT -GCCCGACTACCTCAGTC-GGT--GGAGCATGGGACTCTTCATCCCAGG-------------------GTTGTGGGTTCGAGCCCCACATTGGGC----
D00006179 Homo_sapiens Lys CTT -GCCTGGCTAGCTCAGTC-GGC--AAAGCATGAGACTCTTAATCTCAGG-------------------GTCGTGGGCTCGAGCTCCATGTTGGGC----
D00006180 Homo_sapiens Lys CTT -GCCCAGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATGAGACTCTTAATCTCAGG-------------------GTCATGGGTTTGAGCCCCACGTTTGGT----
D00006181 Homo_sapiens Lys CTT -GCCCGGCTAGCTCAGTC-GAT--AGAGCATGAGACTCTTAATCTCAGG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCGCACGTTGGGCG---
D00006182 Homo_sapiens Lys CTT -GCCCGGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATGGGACTCTTAATCTCAGG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACGTTGGGCG---
D00006183 Homo_sapiens Lys CTT -GCCCGGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATGAGACTCTTAATCTCAGG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACGTTGGGCG---
D00006184 Homo_sapiens Lys CTT -GCCCGGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATGGGACTCTTAATCCCAGG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACGTTGGGCG---
D00001472 Loligo_bleekeri Lys CTT -GCCCGGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCACGAGACTCTTAATCTCGGG-------------------T-CGTGGGTTCAAGCCCCACGTTGGGCGCCA
D00001476 Mus_musculus Lys CTT -GCCCGGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATGAGACTCTTAATCTCAGG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACGTTGGGCG---
D00006407 Pan_troglodytes Lys CTT -AACCGAATAGCTTAGTT-GAT--GAAGCATGAGACTCTTAATCTCAGG-------------------GTAGTGGGTTCAAGCCCCACATTGGACA---
D00006408 Pan_troglodytes Lys CTT -CTGCAGCTAGTTCAGTC-GGT--AGAGCATGAGACTCTTAATCTCAGG-------------------GTCATGGGTTCGTGCCCCATGTTGGGTG---
D00006409 Pan_troglodytes Lys CTT -GTCTAGCTAGATCAGTT-GGT--AGAGCATGAGACTCTTAATCTCAGG-------------------GTCATGGGTTCGAGCCCTACGTTGGGCG---
D00006410 Pan_troglodytes Lys CTT -GCCCAGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATGAGACTCTTAATCTCAGG-------------------GTCATGGGTTTGAGCCCCACGTTTGGTG---
D00006411 Pan_troglodytes Lys CTT -GACGAGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATGGGACTCTTAATCCCAGG-------------------GTCGTGGGTTTGAGCCCCATGTTGGGCA---
D00006412 Pan_troglodytes Lys CTT -GCCTGACTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATGGGACTCTTAATCCCAGG-------------------GTTGTGGGTTCGAGCCCCACATTGGGCA---
D00006413 Pan_troglodytes Lys CTT -GCCTGGCTAGCTCAGTC-GGC--AGAGCATGAGACTCTTAATCTCAGG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACGTTGGGCG---
D00006414 Pan_troglodytes Lys CTT -GCCCGGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATGAGACCCTTAATCTCAGG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACGTTGGGCG---
D00006415 Pan_troglodytes Lys CTT -GCCCGGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATGAGACTCTTAATCTCAGG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACGTTGGGCG---
D00006416 Pan_troglodytes Lys CTT -GCCCGGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATGGGACTCTTAATCCCAGG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACGTTGGGCG---
D00006382 Plasmodium_falciparum_3D7 Lys CTT -GCTGCCTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGCCAGACTCTTAATCTGGTG-------------------GTCAGGGGTTCGAGCCCCCTAGGCAGCT---
D00001477 Rattus_norvegicus Lys CTT -GCCCGGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATGAGACTCTTAATCTCAGG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACGTTGGGCG---
D00001464 Saccharomyces_cerevisiae Lys CTT -GCCTTGTTGGCGCAATC-GGT--AGCGCGTATGACTCTTAATCATAAG-------------------GTTAGGGGTTCGAGCCCCCTACAGGGCT---
D00001465 Saccharomyces_cerevisiae Lys CTT -GCCTTGTTGGCGCAATC-GGT--AGCGCGTATGACTCTTAATCATAAG-------------------G-TTAGGGGTCGAGGCCCCTACAGGGCT---
D00006213 Saccharomyces_cerevisiae Lys CTT -GCCTTGTTGGCGCAATC-GGT--AGCGCGTATGACTCTTAATCATAAG-------------------GTTAGGGGTTCGAGCCCC-TACAGGGC----
D00006214 Saccharomyces_cerevisiae Lys CTT -GCCTTGTTGGCGCAATC-GGT--AGCGCGTATGACTCTTAATCATAAG-------------------GTTAGGGGTTCGAGCCCCCTACAGGGCT---
D00001466 Schizosaccharomyces_pombe Lys CTT -TCCCGAGTGGCTCAATC-GGTTTAGAGCGTCTGACTCTTAATCAGAAG-------------------GTTGCGAGTTCGAGTCTCGCCTTGGGAG---
D00006221 Schizosaccharomyces_pombe Lys CTT -TCCCGAGTGGCTCAATC-GGTTTAGAGCGTCTGACTCTTAATCAGAAG-------------------GTTGCGAGTTCGAGTCTCGCCTTGGGAG---
D00006222 Schizosaccharomyces_pombe Lys CTT -TCCCGAGTGGCTCAATC-GGTTTAGAGCGTCTGACTCTTAATCAGAAG-------------------GTTGCGAGTTCGAGTCTCGCCTTGGGAG---
D00006223 Schizosaccharomyces_pombe Lys CTT -TCCCGAGTGGCTCAATC-GGTTTAGAGCGTCTGACTCTTAATCAGAAG-------------------GTTGCGAGTTCGAGTCTCGCCTTGGGAG---
D00006393 Takifugu_rubripes Lys CTT -GCCCGGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCTTGAGGCTCTTAACCTCAGG-------------------GTCCTTGGTTCGAGCCCCACGTTAGGCG---
D00006394 Takifugu_rubripes Lys CTT -GCCGGGCTAGCTCTGTC-GGT--AGAGCATGAGACTCTTAATCTCAGA-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACGTTGGGCG---
D00006395 Takifugu_rubripes Lys CTT -GCCTGGCTAGCTCAGTTTGGT--AGAGCATGAGACTCTTAATCTCAGG-------------------GTCGTGGGTTCAAGCCCCACGTCAGGTG---
D00006396 Takifugu_rubripes Lys CTT -GCCCGGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATGAGACTCTTAATCTCAGG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACGTTGGGCG---
D00001457 Trypanosoma_brucei Lys CTT -GCCCTTCTAGCTCAGTC-GGT--AGGGCGCACGGCTCTTAACCGTGTG-------------------GTCGTGGGTTCGAG-CCCACGGGGGGTG---
D00001459 Trypanosoma_brucei Lys CTT -GCCCTTCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGCACGGCTCTTAACCGTGTG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACGGGGGGTG---
D00006152 Aeropyrum_pernix_K1 Lys TTT -GGGCCCGTAGCTCAGCCCGGC--AGAGCGGCGGGCTTTTACCCCGCGG--------AA---------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGCCCGCC-
D00001334 Archaeoglobus_fulgidus Lys TTT -GGGCTCGTAGCTCAGCCAGGC--AGAGCGACGGGCTTTTAACCCGTCG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGTCGAGCCCG---
D00006154 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Lys TTT -GGGCTCGTAGCTCAGCCAGGC--AGAGCGACGGGCTTTTAACCCGTCG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGTCGAGCCCG---
D00006156 Halobacterium_sp._NRC-1 Lys TTT -GGGCCGATAGCTCAGCCCGGC--AGAGCGTCTGGCTTTTAACCAGACG-------------------GTCGAGGGTTCAAATCCCTCTCGGCCCG---
D00001336 Methanocaldococcus_jannaschii Lys TTT -GGGCCCGTAGCTCAGTCTGGC--AGAGCGCCTGGCTTTTAACCAGGTG-------------------GTCGAGGGTTCAAATCCCTTCGGGCCCG---
D00006158 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Lys TTT -GGGCCCGTAGCTCAGTCTGGC--AGAGCGCCTGGCTTTTAACCAGGTG-------------------GTCGAGGGTTCAAATCCCTTCGGGCCCG---
D00011865 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Lys TTT -GGGCCCGTAGCTTAGTCTGGT--AGAGCGCCTGACTTTTAATCAGGCG-------------------GTCGAGGGTTCGAATCCCTTCGGGCCCG---
D00006159 Methanococcus_maripaludis Lys TTT -GGGCCCGTAGCTTAGTCTGGT--AGAGCGCCTGACTTTTAATCAGGCG-------------------GTCGAGGGTTCGAATCCCTTCGGGCCCG---
D00001337 Methanococcus_vannielii Lys TTT -GGGCCCGTAGCTTAGTCTGGT--AGAGCGCCTGACTTTTAATCAGGCG-------------------GTCGAGGGTTCGAATCCCTTCGGGCCCG---
D00001339 Methanococcus_voltae Lys TTT -GGGCCCGTAGCTTAGTCTGGT--AGAGCGCCTGGCTTTTAATCAGGCG-------------------GTCGAGGGTTCGAATCCCTTCGGGCCCG---
D00001340 Methanopyrus_kandleri Lys TTT -GGGCCGGCAGCTCAGTCTGGCT-AGAGCGCGGGACTTTTAATCCCGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGCCCACCA
D00006258 Methanopyrus_kandleri_AV19 Lys TTT -GGGCCGGCAGCTCAGTCTGGCT-AGAGCGCGGGACTTTTAATCCCGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGCCCACCA
D00011918 Methanosarcina_acetivorans_C2A Lys TTT -GGGCCCGTAGCTCAGTCAGGC--AGAGCGACTGGCTTTTAACCAGTCG-------------------GCCTAGGGTTCAAATCCCTACGGGCCCGCCA
D00006231 Methanosarcina_mazei_Go1 Lys TTT -GGGCCCGTAGCTCAGTCAGGC--AGAGCGACTGGCTTTTAACCAGTCG-------------------GCCTAGGGTTCAAATCCCTACGGGCCCGCCA
D00011929 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Lys TTT -GGGTTCGTAGCTCAGTTAGGC--AGAGCGCCTGGCTTTTAACCAGGTG-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCCTCGAGCCCG---
D00006157 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Lys TTT -GGGCCCGTAGCTCAGTCTGGC--AGAGCGCTTGGCTTTTAACCAAGTG-------------------GTCGCGGGTTCAATTCCCGTCGGGCCCG---
D00001338 Methanothermus_fervidus Lys TTT -GGGCCCGTAGCTCAGTCTGGT--AGAGCGCTTGGCTTTTAACCAAGTA-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGTCGGGCCCG---
D00012004 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Lys TTT -GGGCCCGTAGCTCAGCCTGGA--AGAGCGCCGGGCTTTTAACCCGGAA-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGCCGGGCCCG---
D00006161 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Lys TTT -GGGCCCGTAGCTCAGCCCGGTT-AGAGCGGCGGGCTTTTAACCCGTAG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCACCGGGCCCGCCA
D00006163 Pyrococcus_abyssi_GE5 Lys TTT -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGTC-AGAGCACCGGGCTTTTAACCCGGTG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGCCCGGCCCGCC-
D00006165 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Lys TTT -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGTT-AGAGCACCGGGCTTTTAACCCGGTG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGCCCGGCCCGCC-
D00006167 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Lys TTT -GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGTC-AGAGCACCGGGCTTTTAACCCGGTG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGCCCGGCCCGCCA
D00012023 Staphylothermus_marinus_F1 Lys TTT -GGGCCCGTAGCTCAGCCTGGT--AGAGCGGCGGGCTTTTAACCCGTAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGCCCG---
D00012065 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Lys TTT -GGGCCCGTAGCTCAGCCAGGT--AGAGCGGCGGGCTTTTAACCCGTAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGCCCG---
D00006169 Sulfolobus_solfataricus_P2 Lys TTT -GGGCCCGTAGCTCAGCCAGGT--AGAGCGGCGGGCTTTTAACCCGTAG-------------------GTCCCGGGTTCGAATCCCGGCGGGCCC----
D00006246 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Lys TTT -GGGCCCGTAGCTCAGCCAGGT--AGAGCGGCGGGCTTTTAACCCGTAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGCCCG---
D00006171 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Lys TTT -GGGCCCGTAGCTCAGCCAGGT--AGAGCATCTGGCTTTTAACCAGGTG-------------------GTCAGGGGTTCGAACCCCCTCGGGCCCG---
D00006173 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Lys TTT -GGGCCCGTAGCTCAGCCAGGT--AGAGCATCTGGCTTTTAACCAGGTG-------------------GTCAGGGGTTCGAACCCCCTCGGGCCCG---
D00001349 Acholeplasma_laidlawii Lys TTT -GTCCCGTTAGCTCAGGT-GGT--AGAGCACTTGACTTTTAATCAAGGT-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATCACGGGACACCA
D00006378 Acinetobacter_sp._ADP1 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCGGACTTTTAATCCGTTG-------------------GTCCCGCGTTCGAGTCGCGGACGACCCACCA
D00006146 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Lys TTT -GAGAGCGTAGCTCAGCC-GGT--AGAGCAACTGACTTTTAATCAGTAG-------------------GTCCAGGGTTCGAATCCCTGCGCTCTCACCA
D00006115 Aquifex_aeolicus_VF5 Lys TTT -GAGCCGGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACGGCCTTTTAAGCCGTGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGCCCGGCTCACCA
D00001360 Azospirillum_lipoferum Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCGAAGGTTCGAGTCCTTCATGGCTCACCA
D00006324 Bacillus_anthracis_str._Ames Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCGAAGGTTCGAGTCCTTCATGGCTCACCA
D00006325 Bacillus_anthracis_str._Ames Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCGAAGGTTCGAGTCCTTCATGGCTCA---
D00006342 Bacillus_anthracis_str._Sterne Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCGAAGGTTCGAGTCCTTCATGGCTCACCA
D00006343 Bacillus_anthracis_str._Sterne Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCGAAGGTTCGAGTCCTTCATGGCTCA---
D00006362 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCGAAGGTTCGAGTCCTTCATGGCTCACCA
D00006363 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCGAAGGTTCGAGTCCTTCATGGCTCA---
D00006364 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCGAAGGTTCGAGTCCTTCATGGCTCACCA
D00006306 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCGAAGGTTCGAGTCCTTCATGGCTCACCA
D00006307 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCGAAGGTTCGAGTCCTTCATGGCTCA---
D00006308 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCGAAGGTTCGAGTCCTTCATGGCTCA---
D00006279 Bacillus_halodurans_C-125 Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCGAAGGTTCGAGTCCTTCATGGCTCACCA
D00001357 Bacillus_subtilis Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCGAAGGTTCGAGTCCTTCATGGCTCACCA
D00006069 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCGAAGGTTCGAGTCCTTCATGGCTCACCA
D00006380 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCGAAGGTTCGAGTCCTTCATGGCTCA---
D00006381 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCGAAGGTTCGAGTCCTTCATGGCTCACCA
D00006322 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Lys TTT -GATTCAGTAGCTCAGCA-GGT--AGAGCACAACACTTTTAATGTTGGG-------------------GTCCTGGGTTCGAGCCCCAGCTGGATCA---
D00006326 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Lys TTT -GAGCGCGTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCAACTGACTTTTAATCAGTAG-------------------GTCCAGGGTTCGAATCCCTGCGCGCTCACCA
D00006385 Bartonella_quintana_str._Toulouse Lys TTT -GAGCGCGTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCAACTGACTTTTAATCAGTAG-------------------GTCCAGGGTTCAAATCCCTGCGCGCTCACCA
D00006328 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Lys TTT -GGTTCGCTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCACTTCACTTTTAATGAAGGG-------------------GTCGATGGTTCGAATCCATCGCGAGCCACCA
D00006260 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Lys TTT -GCCCCTTTAGCTCAAC--GGTT-AGAGCAGCGTCCTTTTAAGTCGTGG-------------------GTTGTGGGTTCGAATCCCACAGGGGGCA---
D00001352 Borrelia_burgdorferi Lys TTT -GGGCTCATAGCTCAGGT-GGT--AGAGCAGCGCCCTTTTAAGGCGTTTAAG-----GCG-----TTTGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGAGCTCA---
D00006093 Borrelia_burgdorferi_B31 Lys TTT -GGGCTCATAGCTCAGGT-GGT--AGAGCAGCGCCCTTTTAAGGCGTTT-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGAGCTCA---
D00006344 Borrelia_garinii_PBi Lys TTT -GGGCTCATAGCTCAGGT-GGT--AGAGCAGCGCCCTTTTAAGGCGTTT-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGAGCTCA---
D00006280 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Lys TTT -GAGCGCGTAGCTCAGCC-GGT--AGAGCACGTGACTTTTAATCACGGG-------------------GTCCTGGGTTCGAGCCCCAGCGCGCTCACCA
D00006131 Brucella_melitensis_16M Lys TTT -GAGCGCGTAGCTCAGCC-GGT--AGAGCAACTGACTTTTAATCAGTAG-------------------GTCCAGGGTTCGAATCCCTGCGCGCTCACCA
D00006261 Brucella_suis_1330 Lys TTT -GAGCGCGTAGCTCAGCC-GGT--AGAGCAACTGACTTTTAATCAGTAG-------------------GTCCAGGGTTCGAATCCCTGCGCGCTCACCA
D00006070 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGCACGACCCA---
D00006309 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGCACGACCCA---
D00006232 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGCACGACCCA---
D00006094 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Lys TTT -GTCTCGTTAGCTCAGCC-GGT--AGAGCATCTCCCTTTTAAGGAGGGG-------------------GCCGTTGGTTCGAATCCAACACGGGACACCA
D00006387 Candidatus_Blochmannia_floridanus Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCAAGTCCTGCACGACCCA---
D00006334 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Lys TTT -GAGTCTTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCTCACTTTTAATGAGGGG-------------------GTCGATGGTTCGAGTCCATCAAGACTCA---
D00006096 Caulobacter_crescentus_CB15 Lys TTT -GGGCCGGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTCGACTTTTAATCGAATG-------------------GTCCTGGGTTCGAGTCCCAGCCGGCCTACCA
D00006122 Chlamydia_muridarum_Nigg Lys TTT -GGGTCTTTAGCTCAGC--GGTT-AGAGCATCTCACTTTTAATGAGAGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTTCAAGACCCA---
D00006068 Chlamydia_trachomatis Lys TTT -GGGTCTTTAGCTCAGC--GGTT-AGAGCACCTCACTTTTAATGAGGGG-------------------GTCGAAGGTTCAAATCCTTCAAGACCC----
D00006067 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Lys TTT -GGGTCTTTAGCTCAGC--GGTT-AGAGCATCTCACTTTTAATGAGAGG-------------------GTCGAAGGTTCGAATCCTTCAAGACCCA---
D00006065 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Lys TTT -GGGTCTTTAGCTCAGC--GGTT-AGAGCACCTCACTTTTAATGAGGGG-------------------GTCGAAGGTTCAAATCCTTCAAGACCCA---
D00006066 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Lys TTT -GGGTCTTTAGCTCAGC--GGTT-AGAGCACCTCACTTTTAATGAGGGG-------------------GTCGAAGGTTCAAATCCTTCAAGACCCA---
D00006084 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Lys TTT -GGGTCTTTAGCTCAGC--GGTT-AGAGCACCTCACTTTTAATGAGGGG-------------------GTCGAAGGTTCAAATCCTTCAAGACCCA---
D00006226 Chlorobium_tepidum_TLS Lys TTT -GAGAATATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAACTGCCTTTTAAGCAGTGG-------------------GTCGAAGGTTCGAGTCCTTCTATTCTCA---
D00006127 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Lys TTT -GGTTTATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACATGACTTTTAATCATGGT-------------------GTCCGGGGTTCGACTCCCCGATAAGCCA---
D00006120 Clostridium_perfringens_str._13 Lys TTT -GATTTGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCACGTGACTTTTAATCACGGT-------------------GTCCAGGGTTCGATTCCCTGGCAGATCACCA
D00006282 Clostridium_tetani_E88 Lys TTT -GATCCACTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCACATGACTTTTAATCATGGT-------------------GTCCGGGGTTCGATTCCCCGGTGGATCACCA
D00006330 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Lys TTT -GGGCCTTTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCTACGGACTTTTAATCCGCAG-------------------GTCCCGGGTTCGAGCCCCGGAGGGCCCA---
D00006265 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Lys TTT -GGGCCTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCTACGGACTTTTAATCCGCAG-------------------GTCCCGGGTTCGAGCCCCGGAGGGCCCACCA
D00006236 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Lys TTT -GGGCCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCTACGGACTTTTAATCCGCAG-------------------GTCTTGGGTTCGAGTCCCAATGGGCCCA---
D00006304 Coxiella_burnetii_RSA_493 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCAGCGGACTTTTAATCCGTTG-------------------GTCATAGGTTCAAATCCTATACGACCCACCA
D00006098 Deinococcus_radiodurans_R1 Lys TTT -GGGTTGTTAGCTCAAT--GGT--AGAGCAGCTGACTTTTAATCAGCGG-------------------GTTCTCGGTTCGAGTCCGAGGCGACCCACCA
D00006365 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Lys TTT -GGGTCGTTAACTCAGTC-GGT--AGAGTACCTGCCTTTTAAGCAGAGA-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA
D00006284 Enterococcus_faecalis_V583 Lys TTT -GAGCCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCACAGGTTCGAGCCCTGTACGGCTCA---
D00006286 Enterococcus_faecalis_V583 Lys TTT -AGACGTGTAGCTCAATA-GGT--AGAGCAATTGATTTTTAATCAATGGTGCG----TGAT---TGCTTGTGCAGGTTCGACTCCTGTCACGTCAA---
D00001359 Escherichia_coli Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA
D00006310 Escherichia_coli_CFT073 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA
D00006085 Escherichia_coli_K12 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA
D00006086 Escherichia_coli_O157:H7 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA
D00006087 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA
D00006228 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Lys TTT -GCGTCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACACGACTTTTAATCGTGTT-------------------GTCACAAGTTCAAATCTTGTATGACGCACCA
D00006346 Geobacter_sulfurreducens_PCA Lys TTT -GAGCCGCTAGCTCAGAT-GGT--AGAGCACCTGACTTTTAATCAGGTG-------------------GTCGTTGGTTCGATCCCAACGCGGCTCACCA
D00001361 Haemophilus_influenzae Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGAC-GGT--AGAGCAGCGGACTTTTAATCCGTTG-------------------GTCGAAGGTTCGAATCCTTCACGACCCACCA
D00001362 Haemophilus_influenzae Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGCGGACTTTTAATCCGTTG-------------------GTCGAAGGTTCGAATCCTTCACGACCCACCA
D00006091 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGCGGACTTTTAATCCGTTG-------------------GTCGAAGGTTCGAATCCTTCACGACCCACCA
D00001356 Helicobacter_pylori Lys TTT -GACCCGTTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCAATTCCCTTTTAAGGAATGG-------------------GCCGTTGGTTCAAATCCAACACGGGTCACCA
D00006088 Helicobacter_pylori_26695 Lys TTT -GACCCGTTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCAATTCCCTTTTAAGGAATGG-------------------GCCGTTGGTTCAAATCCAACACGGGTCACCA
D00006089 Helicobacter_pylori_J99 Lys TTT -GACCCGTTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCAATTCCCTTTTAAGGAATGG-------------------GCCGTTGGTTCAAATCCAACACGGGTCACCA
D00006348 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Lys TTT -GAGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCGGCAGTTCGAGCCTGCCACGACTCA---
D00006287 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Lys TTT -GAGCCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCGACAGTTCGAGACTGTCACGGCTCA---
D00006350 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Lys TTT -GGGCCTCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATCGGACTTTTAATCCGCGG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACGGGGCCCA---
D00006266 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Lys TTT -GAGTCGTTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCAATTCCCTTTTAAGGAATGG-------------------GTCCGGGGTTCGAATCCCCGACGACTCA---
D00006117 Listeria_innocua_Clip11262 Lys TTT -GAGCCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCGCTGGTTCGAACCCAGCACGGCTCA---
D00006119 Listeria_monocytogenes_EGD-e Lys TTT -GAGCCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCGCTGGTTCGAACCCAGCACGGCTCA---
D00006368 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Lys TTT -GAGCCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCGCTGGTTCGAACCCAGCACGGCTCA---
D00006369 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Lys TTT -GAGCCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCGCTGGTTCGAACCCAGCACGGCTCA---
D00006370 Mesoplasma_florum_L1 Lys TTT -GACTCGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAACTGGCTTTTAACCAGTGG-------------------GTCCGGAGTTCGAGCCTCCGGCGAGTCACCA
D00006132 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Lys TTT -GAGCGCGTAGCTCAGCC-GGT--AGAGCAACTGACTTTTAATCAGTAG-------------------GTCATGGGTTCGAATCCCATCGCGCTCACCA
D00006299 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Lys TTT -GCCCCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCTACGGACTTTTAATCCGCAG-------------------GTCCCAGGTTCGAGTCCTGGTGGGGGCA---
D00006081 Mycobacterium_leprae_TN Lys TTT -GCCCCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCTACGGACTTTTAATCCGCAG-------------------GTCCTAGGTTCGAGTCCTAGTGGGGGCA---
D00006072 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Lys TTT -GCCCCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCTACGGACTTTTAATCCGCAG-------------------GTCCCAGGTTCGAGTCCTGGTGGGGGCA---
D00006332 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Lys TTT -GCCCCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCTACGGACTTTTAATCCGCAG-------------------GTCCCAGGTTCGAGTCCTGGTGGGGGCA---
D00001341 Mycoplasma_capricolum Lys TTT -GACTCGTTAGCTCAGCC-GGT--AGAGCAACTGGCTTTTAACCAGTGG-------------------GTCCGGGGTTCGAATCCCCGACGAGTCACCA
D00006297 Mycoplasma_gallisepticum_R Lys TTT -GACTCACTAGCTCAGC--GGT--AGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGG-------------------GTCCCGGGTTCGATCCCCGGGTGGGTCACCA
D00001343 Mycoplasma_genitalium Lys TTT -GACTCACTAGCTCAGG--GGT--AGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGG-------------------GTCCCGAGTTCGATCCTCGGGTGGGTCACCA
D00006100 Mycoplasma_genitalium_G37 Lys TTT -GACTCACTAGCTCAGC--GGT--AGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGG-------------------GTCCCGAGTTCGATCCTCGGGTGGGTCACCA
D00001345 Mycoplasma_pneumoniae Lys TTT -GACTCACTAGCTCAGC--GGT--AGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGG-------------------GTCCCGAGTTCGATCCTCGGGTGAGTCACCA
D00006102 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Lys TTT -GACTCACTAGCTCAGC--GGT--AGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGG-------------------GTCCCGAGTTCGATCCTCGGGTGAGTCACCA
D00006144 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Lys TTT -GCGCCTTTAGCTCAGCA-GGT--AGAGCAAATGGCTTTTAACCATTGG-------------------GTCAGAGGTTCAAATCCTCTAAGGCGTACCA
D00001347 Mycoplasma_sp._PG50 Lys TTT -GACTCGTTAGCTCAGCC-GGT--AGAGCAACTGGCTTTTAACCAGTGG-------------------GTCCGGGGTTCGAATCCCCGACGAGTCACCA
D00006073 Neisseria_meningitidis_MC58 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGCGGACTTTTAATCCGTTG-------------------GTCGAGCGTTCGAATCGCTCACGACCCACCA
D00006074 Neisseria_meningitidis_MC58 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGCC-GGT--AGAGCAGCGGACTTTTAATCCGTTG-------------------GTCGAGCGTTCGAATCGCTCACGACCCACCA
D00006075 Neisseria_meningitidis_Z2491 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGCGGACTTTTAATCCGTTG-------------------GTCGAGCGTTCGAATCGCTCACGACCCACCA
D00006320 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGCC-GGT--AGAGCAGCGGACTTTTAATCCGTTG-------------------GTCGCGCGTTCGAATCGCGCACGGCCTACCA
D00006141 Nostoc_sp._PCC_7120 Lys TTT -GGGGTATTGGCATAGC--GGCA-AGTGCATCGGACTTTTAATCCGACT-------------------TAGACAGGTTCGACTCCTGTATACCCCACCA
D00006142 Nostoc_sp._PCC_7120 Lys TTT -GGGTCGCTAACTCAAC--GGT--AGAGTACTCGGCTTTTAACCGATTA-------------------GTTCCGGGTTCGAATCCCGGGCGACCCA---
D00006267 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCGAAGGTTCGAATCCTTCATGGCTCACCA
D00006268 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCGAAGGTTCGAATCCTTCATGGCTCA---
D00006331 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M Lys TTT -GTCCCGTTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCACTTGACTTTTAATCAAGGT-------------------GTCGAAGGTTCGACTCCTTCACGGGATACCA
D00006103 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGCGGACTTTTAATCCGTTG-------------------GTCGAAGGTTCGAATCCTTCACGACCCACCA
D00006335 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA
D00006351 Porphyromonas_gingivalis_W83 Lys TTT -GAATCGCTAGCTCAGCA-GGT--AGAGCACATCCCTTTTAAGGATGGG-------------------GTCCTGGGTTCGAACCCCAGGCGATTCA---
D00006372 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Lys TTT -GCCCCCGTAGCTCAGAT-GGTT-AGAGCAGCGGACTTTTAATCCGCGG-------------------GTCCTGGGTTCGAGTCCCAGTGGGGGCA---
D00006106 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGTTGGCTTTTAACCAATTG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTACACGACCCACCA
D00006323 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGGCTTTTAACCAATTG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCCACACGACCCACCA
D00006139 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGCGGACTTTTAATCCGTTG-------------------GTCGCGTGTTCGAGTCACGCACGACCCACCA
D00006317 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Lys TTT -GAGAGTGTAGCTCAGTT-GGC--AGAGCATTCGACTTTTAATCGAATG-------------------GTCCTGGGTTCGAGTCCCAGCACTCTCA---
D00006318 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Lys TTT -GGGGCTGTGGTGTAACT-GGC--AGCATGACGGACTTTTAATCCGTTC-------------------GGTGAGGGTTCAACTCCCTTCGGCCCCA---
D00006338 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Lys TTT -GAGCGCGTAGCTCAGCC-GGT--AGAGCACGTGACTTTTAATCATGGG-------------------GTCGAGGGTTCGAGTCCCTCCGCGCTCACCA
D00006129 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Lys TTT -GAGCTCGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGAGCTCACCA
D00006233 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Lys TTT -GAGCTCGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGG-------------------GTCCCGGGTTCGAATCCCGGCGAGCTCACCA
D00006353 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Lys TTT -GAGCTCGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGAGCTCACCA
D00006147 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCA---
D00006148 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA
D00006314 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA
D00006315 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACTA
D00006136 Salmonella_typhimurium_LT2 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA
D00006137 Salmonella_typhimurium_LT2 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA
D00006138 Salmonella_typhimurium_LT2 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA
D00006272 Shewanella_oneidensis_MR-1 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGTTGGCTTTTAACCAATTG-------------------GTCGAAGGTTCGAATCCTTCACGACCCACCA
D00006273 Shigella_flexneri_2a_str._301 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA
D00006274 Shigella_flexneri_2a_str._301 Lys TTT -CCGCCACTAGCTCATCA-GGAA-AGAGCGTCAACCCTTTAAGTTGAGT-------------------GTGCGAGGTTCGAGTCCCCGGTGGCGGTCCA
D00006149 Sinorhizobium_meliloti_1021 Lys TTT -GAGCGCGTAGCTCAGCC-GGT--AGAGCAACTGACTTTTAATCAGTAG-------------------GTCCAGGGTTCGAATCCCTGCGCGCTCACCA
D00001355 Staphylococcus_aureus Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCACCA
D00006339 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCA---
D00006340 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCACCA
D00006341 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCAC--
D00006237 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCA---
D00006238 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCACCA
D00006239 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCACTA
D00006077 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCA---
D00006078 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCA---
D00006079 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCACCA
D00006288 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCACCA
D00006289 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Lys TTT -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTATGGCTCA---
D00006275 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Lys TTT -GACTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATTGACTTTTAATCAATGG-------------------GTCACTGGTTCGAGCCCAGTACGGGTCA---
D00006240 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Lys TTT -GACTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATTGACTTTTAATCAATGG-------------------GTCACTGGTTCGAGCCCAGTACGGGTCA---
D00006277 Streptococcus_mutans_UA159 Lys TTT -GACTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATTTGACTTTTAATCAAAGG-------------------GTCACTGGTTCGAGCCCAGTACGGGTCA---
D00006126 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Lys TTT -GACTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATTGACTTTTAATCAATGG-------------------GTCACTGGTTCGAGCCCAGTACGGGTCA---
D00006123 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Lys TTT -GACTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATTGACTTTTAATCAATGG-------------------GTCACTGGTTCGAGCCCAGTACGGGTCA---
D00006243 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Lys TTT -GACTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATTGACTTTTAATCAATGG-------------------GTCACTGGTTCGAGCCCAGTACGGGTCA---
D00006301 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Lys TTT -GACTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATTGACTTTTAATCAATGG-------------------GTCACTGGTTCGAGCCCAGTACGGGTCA---
D00006302 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Lys TTT -GGCTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATTGACTTTTAATCAATGG-------------------GTCACTGGTTCGAGCCCAGTACGGGTCA---
D00006311 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Lys TTT -GGACCCTTAGCTCAATT-GGC--AGAGCAGTGGACTTTTAATCCATTG-------------------GTTGTGGGTTCGAGTCCCACAGGGTCTA---
D00006269 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Lys TTT -GGGCCCTTAGCTCAATT-GGC--AGAGCAGTGGACTTTTAATCCATTG-------------------GTTGTGGGTTCGAGTCCCACAGGGCCTA---
D00006355 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Lys TTT -GGGCCATTAGCTCAGT--GGC--AGAGCATCCGCCTTTTAAGCGGGGT-------------------GTCGTTGGTTCGAATCCAACATGGCCCACCA
D00001364 Synechocystis_sp. Lys TTT -GGGTCGCTAGCTCAGC--GGT--AGAGCACTCGGCTTTTAACCGATTG-------------------GTCTTGGGTTCGAATCCCAGGCGACCCA---
D00006107 Synechocystis_sp._PCC_6803 Lys TTT -GGGTCGCTAGCTCAGC--GGT--AGAGCACTCGGCTTTTAACCGATTG-------------------GTCTTGGGTTCGAATCCCAGGCGACCCA---
D00006248 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Lys TTT -GACCCATTAGCTCAGGA-GGT--AGAGCACCTGCCTTTTAAGCAGGGT-------------------GTCCCGCGTTCGAGTCGCGGATGGGTCACCA
D00006249 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Lys TTT -GACCCATTAGCTCAGGA-GGT--AGAGCACCTGCCTTTTAAGCAGGGT-------------------GTCCCGCGTTCGAATCGCGGATGGGTCACCA
D00006244 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Lys TTT -GGGTCGCTAGCTCAGC--GGT--AGAGCACTCGGCTTTTAACCGATTG-------------------GTCTTGGGTTCGAATCCCAGGCGACCCA---
D00006109 Thermotoga_maritima_MSB8 Lys TTT -GACCCGGTAGCTCAGCA-GGC--AGAGCACCTGACTTTTAATCAGGGG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCACCCGGGTCACCA
D00006374 Thermus_thermophilus_HB27 Lys TTT TGGGCCGTTAGCTCAGCT-GGC--AGAGCAACCGACTTTTAATCGGTAG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGGCCCACCA
D00006375 Treponema_denticola_ATCC_35405 Lys TTT -GGGCTATTAGCTCAGTA-GGT--AGAGCAACGCCCTTTTAAGGCGTGG-------------------GTCTCAGGTTCGAATCCTGAATAGCTCA---
D00001351 Treponema_pallidum Lys TTT -GGGCTATTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCAACGCCCTTTTAAGGCGTGG-------------------GTCGATGGTTCGAATCCATCATGGCTCA---
D00006105 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Lys TTT -GGGCTATTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCAACGCCCTTTTAAGGCGTGG-------------------GTCGATGGTTCGAATCCATCATGGCTCA---
D00006291 Tropheryma_whipplei_str._Twist Lys TTT -GGGCCTGTAGCTCAGCT-GGA--AGAGCATCGGACTTTTAATCCGCTG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACCGGGCCCA---
D00006293 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Lys TTT -GGGCCTGTAGCTCAGCT-GGA--AGAGCATCGGACTTTTAATCCGCTG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACCGGGCCCA---
D00006083 Ureaplasma_parvum_serovar_3 Lys TTT -GCCTCATTAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTTCACTTTTAATGAAGGG-------------------GTCAAAGGTTCGAAACCTTTATGGGGCACCA
D00006076 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGT--GGT--AGAGCAGTTGGCTTTTAACCAATTG-------------------GTCATAGGTTCAAATCCTATACGACCCACCA
D00006377 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Lys TTT -GATCCCGTAGCTCAGCC-GGT--AGAGCAACTGACTTTTAATCAGTGG-------------------GTCACGCGTTCGAATCGCGTCGGGATCA---
D00006253 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Lys TTT -GGGCCGTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAAGACTTTTAATCTTTTG-------------------GTCGATGGTTCGAATCCATCACGGCCCACCA
D00006251 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Lys TTT -GGGCCGTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGAAGACTTTTAATCTTTTG-------------------GTCGATGGTTCGAATCCATCACGGCCCACCA
D00006111 Xylella_fastidiosa_9a5c Lys TTT -GGGCCGTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATCGGACTTTTAATCCGCTG-------------------GTCGCTGGTTCGATTCCAGCACGGCCCACCA
D00006112 Xylella_fastidiosa_9a5c Lys TTT -ATAGCGTTTTTAGTCCTCGGT--AGAGCATCGGACTTTTAATCCGCTG-------------------GTCGCTGGTTCGATTCCAGCACGGCCCACCA
D00006113 Xylella_fastidiosa_9a5c Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA
D00006294 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Lys TTT -GGGCCGTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATCGGACTTTTAATCCGCTG-------------------GTCGCTGGTTCGATTCCAGCACGGCCCACCA
D00006356 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCCGCACGACCCACCA
D00006134 Yersinia_pestis_CO92 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCCGCACGACCCACCA
D00006256 Yersinia_pestis_KIM Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCCGCACGACCCACCA
D00006358 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Lys TTT -GGGTCGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCCGCACGACCCACCA
D00006200 Arabidopsis_thaliana Lys TTT -GCCGTCTTAGCTCAGC--GGT--AGAGCGCGTGGCTTTTAACCACGTG-------------------GCCGTGGGTTCGATCCCCACAGACGGC----
D00006201 Arabidopsis_thaliana Lys TTT -GCCTTCTTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCGTGGCTTTTAACCACGTG-------------------GTCGTGGGTTCGATCCCCACAGACGGC----
D00006202 Arabidopsis_thaliana Lys TTT -GCCGTCTTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCGTGGCTTTTACCCACGAG-------------------GCCGTGGGTTCGATCCCCACAGACGGC----
D00006203 Arabidopsis_thaliana Lys TTT -GCCGTCTTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCGTGGCTTTTAACCACGTG-------------------GCCGTGGGTTCGATCCCCACAGACGGC----
D00006211 Caenorhabditis_elegans Lys TTT -GTGTCCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGTGAGACTTTTAATCTTAAG-------------------GTCAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGTGGC----
D00006212 Caenorhabditis_elegans Lys TTT -GCCTCCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGTGAGACTTTTAATCTTAAG-------------------GTCAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGTGGC----
D00006360 Candida_glabrata_CBS_138 Lys TTT -TCCTTGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGTTCGGCTTTTAACCGAAAT-------------------GTCAGGGGTTCGAGCCCCCTATGAGGAG---
D00001461 Dictyostelium_discoideum Lys TTT -GCCCAGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGCAAGGCTTTTAACCTTGTG-------------------GTCGGGGGTTCGAGCCCCCCTTTGGGCG---
D00001471 Drosophila_melanogaster Lys TTT -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATTGGACTTTTAATCCAAGG-------------------GTCCAGGGTTCAAGTCCCTGTTCGGGCG---
D00006218 Drosophila_melanogaster Lys TTT -CCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATTGGACTTTTAATCCAAGG-------------------GTCCAGGGTTCAAGTCCCTGTTCGGGCG---
D00006219 Drosophila_melanogaster Lys TTT -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATTGGACTTTTAATCCAAGG-------------------GTCCAGGGTTCAAGTCCCTGTTCGGGCG---
D00006220 Drosophila_melanogaster Lys TTT -GCCCGGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATTGGACTTTTAATCCAAGG-------------------GTCCAGGGTTCAAGTCCCTGCTCGGGCG---
D00006255 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Lys TTT -ACCCTGTTAGCTCAGTT-GGA--AGAGTGCTGGACTTTTAATCCAAGG-------------------GCCGTGGGTTCGAGTCCCGCACAGGGTG---
D00006390 Gallus_gallus Lys TTT -GCCTGGATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCCAGGGTTCAAGCCCCTGTTCAGGCG---
D00006391 Gallus_gallus Lys TTT -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGC--AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCCAGGGTTCAAGTCCCTGTTCGGGCG---
D00006392 Gallus_gallus Lys TTT -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCCAGGGTTCAAGTCCCTGTTCGGGCG---
D00001478 Homo_sapiens Lys TTT -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCCAGGGTTCAAGTCCCTGTTCGGGCG---
D00006185 Homo_sapiens Lys TTT -ACCCAGATAGCTCAGTC-AGT--AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCCAAGGTTCATGTCCCTTTTTGGGT----
D00006186 Homo_sapiens Lys TTT -ACCTGGGTAGCTCAGTA-GGT--AGAACATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCTAGGGTTCAAGTCCCTGTCCAGGC----
D00006187 Homo_sapiens Lys TTT -GCCCGGAGAGCTCAGT--GGGT-AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCCAGGGTTCAAGTCCTCGTTCGGGC----
D00006188 Homo_sapiens Lys TTT -GCCTGGATAGCTCAGTT-GGT--AGAACATCAGACTTTTAATCTGACG-------------------ATGCAGGGTTCAAGTCCCTGTTCAGGC----
D00006189 Homo_sapiens Lys TTT -GCCTGGATAGCTCAGTT-GGT--AGAACATCAGACTTTTAATCTGACG-------------------GTGCAGGGTTCAAGTCCCTGTTCAGGC----
D00006190 Homo_sapiens Lys TTT -GCCTGGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCCAGGGTTCAAGTCCCTGTCCAGGC----
D00006191 Homo_sapiens Lys TTT -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCCGGGGTTCAAGTCCCTGTTCGGGCG---
D00006192 Homo_sapiens Lys TTT -GCCTGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCCAGGGTTCAAGTCCCTGTTCAGGCG---
D00006193 Homo_sapiens Lys TTT -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCCAGGGTTCAAGTCCCTGTTCGGGCG---
D00006194 Homo_sapiens Lys TTT -GCCTGGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCCAGGGTTCAAGTCCCTGTTCAGGCG---
D00006195 Homo_sapiens Lys TTT -GCCTGGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCCAGGGTTCAAGTCCCTGTTCAGGCA---
D00001460 Leishmania_tarentolae Lys TTT -GCACTTCTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCGTGGCTTTTAACCTCGTG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCACGGAGTGCG---
D00001475 Mus_musculus Lys TTT -GCCTGGATAGCTCAATT-GGT--AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTTCAGGGTTCAAGTCCCTGTTCAGGCG---
D00006417 Pan_troglodytes Lys TTT -ACCCTGGTGGTACAGG--GGCT-AATATGTTGGGCCTTTACCACTTCA-------------------G-CCCAGGTTCGATTCCTGGTCAGGGAA---
D00006418 Pan_troglodytes Lys TTT -TCCCACATGGGCTAGC--GGTT-AGGATTCCTGGTTTTTCACCCAGGC-------------------GGCCCGGGTTCGACTCCCGGTGTAAGAA---
D00006419 Pan_troglodytes Lys TTT -ACCCAGATAGCTCAGTC-AGT--AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCCAAGGTTCATGTCCCTTTTTGGGTG---
D00006420 Pan_troglodytes Lys TTT -ACCTGGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCTAGGGTTCAAGTTCTTGTCCAGGCG---
D00006421 Pan_troglodytes Lys TTT -CCCCGGAGAGCTCAGT--GGGT-AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCCAGGGTTCAAGTCCTTGTTCGGGCG---
D00006422 Pan_troglodytes Lys TTT -GCCTGGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCCAGGGTTCAAGTCCCTGTCCAGGCG---
D00006423 Pan_troglodytes Lys TTT -GCCTGGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCCAGGGTTCAAGTCCCTGTTTGGGCG---
D00006424 Pan_troglodytes Lys TTT -GCCTGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCCAGGGTTCAAGTCCCTGTTCAGGCG---
D00006425 Pan_troglodytes Lys TTT -GCCCGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCCAGGGTTCAAGTCCCTGTTCGGGCG---
D00006426 Pan_troglodytes Lys TTT -GCCTGGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCCAGGGTTCAAGTCCCTGTTCAGGCA---
D00001456 Plasmodium_falciparum Lys TTT -GAATTACTAGCTTAATT-GGT--AGAGTACTCGACTTTTAATCGAATG-------------------GTTCTGAGTTCAAATCTCAGGTAGTTCA---
D00006383 Plasmodium_falciparum_3D7 Lys TTT -GCCTCTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCCAGACTTTTAATCTGGTG-------------------GTCAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGAGGCT---
D00001463 Saccharomyces_cerevisiae Lys TTT -TCCTTGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGTTCGGCTTTTAACCGAAAT-------------------GTCAGGGGTTCGAGCCCCCTATGAGGAG---
D00006215 Saccharomyces_cerevisiae Lys TTT -TCCTTGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGTTCGGCTTTTAACCGAAAT-------------------GTCAGGGGTTCGAGCCCCCTATGAGGAG---
D00006216 Saccharomyces_cerevisiae Lys TTT -TCCTTGTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGTTCGGCTTTTAACCGAAAT-------------------GTCAGGGGTTCGAGCCCCCTATGAGGAG---
D00006224 Schizosaccharomyces_pombe Lys TTT -TCCCGTTTAGCTCAATC-GGCTTAGAGCGTCCGGCTTTTAACCGGAAG-------------------GTTGCGAGTTCGAGTCTCGCAGTGGGA----
D00006225 Schizosaccharomyces_pombe Lys TTT -TCCCGTTTAGCTCAATC-GGCTTAGAGCGTCCGGCTTTTAACCGGAAG-------------------GTTGCGAGTTCGAATCTCGCAGTGGGA----
D00006397 Takifugu_rubripes Lys TTT -ACCTGGATATCTCAGAT-CGT--AGACAATCACAATTTTAATCTGAGG-------------------ATCCAGGGTTCAAGTCCCTGTTCAGGTG---
D00006398 Takifugu_rubripes Lys TTT -GTCTTGATAGCTCAGAT-GGT--AGAGCATCAGACATTTAATCTGAGG-------------------GCTCAGGGTTCAATTCCCGTTCTAGGCA---
D00006399 Takifugu_rubripes Lys TTT -GCTTGAATAGCTTGGTT-GGC--AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCCAGGGTTCAAGTCCCTGTTCAGGTG---
D00006400 Takifugu_rubripes Lys TTT -GCCTGGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCCAGGGTTCAAGTCCTTGTTCAGGCG---
D00006401 Takifugu_rubripes Lys TTT -GCCTGGCTAGCTCAGAT-GGT--AGAGTATGAGACTTTTAATCTCAGG-------------------GTCATGGGTTCAAGTCCCATGTTGGGCA---
D00006402 Takifugu_rubripes Lys TTT -GCCTGGCTAGCTCAGAT-GGT--AGAGCATGAGACTTTTAATCTCAGG-------------------GTCATGGGTTCAAGTCCCATGTTGGGCG---
D00006403 Takifugu_rubripes Lys TTT -GCCTGGCTAGCTCAGAT-GGT--AGAGCATGAGACTTTTAATCTCAGG-------------------GTCATGGGTTCAAGTCCCATGTTGGGCA---
D00006404 Takifugu_rubripes Lys TTT -GCCTGGGTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCCAGGGTTCGAGTCCCTGTTCAGGTG---
D00006405 Takifugu_rubripes Lys TTT -GCCTGGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATGAGACTTTTAATCTCAGG-------------------GTCATGGGTTCAAGTCCCATGTTGGGCG---
D00006406 Takifugu_rubripes Lys TTT -GCCCGGCTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATGAGACTTTTAATCTCAGG-------------------GTCATGGGTTCAAGTCCCATGTTGGGCG---
D00001458 Trypanosoma_brucei Lys TTT -GCCTTCCTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCACGGCTTTTAACCGTGTG-------------------GTCGTGGGTTCGATCCCCACGGAAGGCG---
D00001473 Xenopus_laevis Lys TTT -GCCCGCATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATCAGACTTTTAATCTGAGG-------------------GTCCAGGGTTCAAGTCCCTGTTCGGGCG---
D00001358 Bacillus_subtilis Lys TTA -GAGCCATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGACTTTAAATCAGAGG-------------------GTCGAAGGTTCGAGTCCTTCATGGCTCACCA
D00007862 Aeropyrum_pernix_K1 Asn GTT -GCCGGGGTAGCTCAGCTAGGT--AGAGCGCCGGGCTGTTAACCCGGTG-------------------GTCGGGGGTTCAAGTCCCCTCCCCGGCGCC-
D00001931 Archaeoglobus_fulgidus Asn GTT -GCCGCCGTAGCTTAGCT-GGT--AGAGCGTCCGGCTGTTAACCGGACG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCCGGCGGCG---
D00007863 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Asn GTT -GCCGCCGTAGCTTAGCT-GGT--AGAGCGTCCGGCTGTTAACCGGACG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCCGGCGGCG---
D00007864 Halobacterium_sp._NRC-1 Asn GTT -GCCGCCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGTGGTTGTTACCCACGTT-------------------GTCCCAGGTTCGAGCCCTGGTGGCGGCG---
D00001932 Methanocaldococcus_jannaschii Asn GTT -GCCCCCATAGCTCAGAT-GGT--AGAGCGACGGACTGTTAATCCGTAG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCTGGGGGCG---
D00007866 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Asn GTT -GCCCCCATAGCTCAGAT-GGT--AGAGCGACGGACTGTTAATCCGTAG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCTGGGGGCGCC-
D00011855 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Asn GTT -GCCCCCATAGCTTAGTA-GGT--AGAGCGACGGACTGTTAATCCGTAG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCTGGGGGCG---
D00007867 Methanococcus_maripaludis Asn GTT -GCCTCCTTAGCTCAGTA-GGTA-GCAGCGACGGACTGTTAATCCGTAG-------------------GTCGCAGGTTCGAGCCCTGCAGGAGGCGCCA
D00001933 Methanococcus_vannielii Asn GTT -GCCTCCTTAGCTCAGTA-GGTA-GCAGCGATGGACTGTTAATCCATAG-------------------GTCGCAGGTTCGAGCCCTGCAGGAGGCGCCA
D00007935 Methanopyrus_kandleri_AV19 Asn GTT -GCCGCGGCAGCTCAGTA-GGT--AGAGCGCGGGACTGTTAATCCCGTG-------------------GTCCCCGGTTCAAGTCCGGGCCGCGGCGCCA
D00011894 Methanosarcina_acetivorans_C2A Asn GTT -GCCGCTTTAACTCAGTT-GGT--AGAGTGTCTGGCTGTTAACCAGAAT-------------------GTCGTAGGTTCGAGCCCTGCAAGCGGCG---
D00007917 Methanosarcina_mazei_Go1 Asn GTT -GCCGCTTTAACTCAGTT-GGT--AGAGTGTCTGGCTGTTAACCAGAAT-------------------GTCGTAGGTTCGAGCCCTGCAAGCGGCG---
D00011948 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Asn GTT -GCCGCCATAACTCAGTT-GGT--AGAGTGACTGGCTGTTAACCAGTTT-------------------GTCACAGGTTCGAGTCCTGTTGGCGGCG---
D00007865 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Asn GTT -GCCGCCGTAGCTCAGTA-GGT--AGAGCGTTCGGCTGTTAACCGATTG-------------------GTCACAGGTTCGAGCCCTGTCGGCGGCG---
D00001934 Methanothermus_fervidus Asn GTT -GCCGCCGTAGCTCAGTA-GGTA-GGAGCGCTCGGCTGTTAACCGAGTG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCCGGCGGCG---
D00011993 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Asn GTT -GCCCGGGTAGCTCAGCCCGGT--AGAGCGGCCGGCTGTTAACCGGCAG-------------------GTCCCCGGTTCGAATCCGGGCCCGGGCG---
D00007868 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Asn GTT -GCCGCCGTAGCTCAGCCCGGTT-AGAGCGGCGGGCTGTTAACCCGTAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCGGCG---
D00007869 Pyrococcus_abyssi_GE5 Asn GTT -GCCGCCGTAGCTTAGCT-GGT--GGAGCGCCGGACTGTTAATCCGGCG-------------------GTCCCCGGTTCGAATCCGGGCGGCGGCGCC-
D00007870 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Asn GTT -GCCGCCGTAGCTTAGCT-GGT--GGAGCGCCGGACTGTTAATCCGGCG-------------------GTCCCCGGTTCGAATCCGGGCGGCGGCGCC-
D00007871 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Asn GTT -GCCGCCGTAGCTTAGCT-GGT--GGAGCGCCGGACTGTTAATCCGGCG-------------------GTCCCCGGTTCGAATCCGGGCGGCGGCGCCA
D00012027 Staphylothermus_marinus_F1 Asn GTT -GCCGGGGTAGCTCAGCCTGGT--AGAGCGCCGGGCTGTTAACCCGGTG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCCCCGGCG---
D00012074 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Asn GTT -GCCGCGGTAGCTCAGTT-GGC--AGAGCGCCGGGCTGTTAACCCGGTG-------------------GTCGGTGGTCCGAGTCCACCCCGCGGCG---
D00007872 Sulfolobus_solfataricus_P2 Asn GTT -GCCGGAGTAGCTCAGTT-GGC--AGAGCGCCCGGCTGTTAACCGGGTG-------------------GTCGGAGGTTCGAGTCCTCCCTCCGGC----
D00007927 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Asn GTT -GCCGCGGTAGCTCAGCT-GGC--AGAGCGCCGGGCTGTTAACCCGGTG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCCCGCGGCGCCA
D00007873 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Asn GTT -GCCGCTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACTCGGCTGTTAACCGAGCG-------------------GTCATCGGTTCGAGACCGATCAGCGGCG---
D00007874 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Asn GTT -GCCGCTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACTCGGCTGTTAACCGAGCG-------------------GTCATCGGTTCGAGACCGATCAGCGGCG---
D00001939 Acholeplasma_laidlawii Asn GTT -GCCTACTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCACCTGACTGTTAATCAGGGG-------------------GTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAGTGGGCGCCA
D00008021 Acinetobacter_sp._ADP1 Asn GTT -TCTCCAATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGACGGACTGTTAATCCGCAG-------------------GTCCCTGGTTCGAGCCCAGGTTGGAGAGCCA
D00008022 Acinetobacter_sp._ADP1 Asn GTT -TCTCCCATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGACGGACTGTTAATCCGCAG-------------------GTCCCTGGTTCGAGCCCAGGTGGGAGAGCCA
D00007859 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Asn GTT -TCCCTGGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCATTCGACTGTTAATCGACAG-------------------GTCGCCGGTTCGAATCCGGCCCGGGGAGCCA
D00007833 Aquifex_aeolicus_VF5 Asn GTT -TCCGGGGTAGCTCAATC-GGC--AGAGCGGGTGGCTGTTAACCACCTG-------------------GTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCCCCGGAGCCA
D00008024 Bacillus_anthracis_str._A2012 Asn GTT -TCCGCAGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGTAGGTTCAAGTCCTACCTGCGGAGCCA
D00008025 Bacillus_anthracis_str._A2012 Asn GTT -TCCGCAGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGCKGAGCCA
D00007983 Bacillus_anthracis_str._Ames Asn GTT -TCCGCAGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGCGGAGCCA
D00007984 Bacillus_anthracis_str._Ames Asn GTT -TCCGCAGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGTAGGTTCGATTCCTACCTGCGGAGCCA
D00007995 Bacillus_anthracis_str._Sterne Asn GTT -TCCGCAGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGCGGAGCCA
D00007996 Bacillus_anthracis_str._Sterne Asn GTT -TCCGCAGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGTAGGTTCGATTCCTACCTGCGGAGCCA
D00008011 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Asn GTT -TCCGCAGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGCGGAGCCA
D00008012 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Asn GTT -TCCGCAGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGTAGGTTCGATTCCTACCTGCGGAGCCA
D00007971 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Asn GTT -TCCGCAGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGCGGAGCCA
D00007972 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Asn GTT -TCCGCAGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGTAGGTTCGATTCCTACCTGCGGAGCCA
D00007951 Bacillus_halodurans_C-125 Asn GTT -TCCACAGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCAATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCA
D00007952 Bacillus_halodurans_C-125 Asn GTT -TCCGCAGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCAATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGCGGAGCCA
D00001949 Bacillus_sp._PS3 Asn GTT -TCCGCAGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCAATCGGCTGTTAACCGATTG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCCTGCGGAGCCA
D00001947 Bacillus_subtilis Asn GTT -TCCACAGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCCTGTGGAGCCA
D00001948 Bacillus_subtilis Asn GTT -TCCGCAGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGAG---
D00007799 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Asn GTT -TCCGCAGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGAG---
D00007800 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Asn GTT -TCCACAGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCCTGTGGAGCCA
D00007801 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Asn GTT -TCCGCAGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGAGCCA
D00008026 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Asn GTT -TCCGCAGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGTAGGTTCGATTCCTACCTGCGGAGCCA
D00008027 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Asn GTT -TCCGCAGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGCGGAGCCA
D00007981 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Asn GTT -TCTTCCTTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCATCTGACTGTTAATCAGAGG-------------------GTCCTTGGTTCAAGTCCAAGAGGAAGAG---
D00007985 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Asn GTT -TCCCCGGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCAACCGGCTGTTAACCGGTTG-------------------GTCGCTGGTTCGAATCCGGCCCGGGGAGCCA
D00008029 Bartonella_quintana_str._Toulouse Asn GTT -TCCCCGGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCAACCGGCTGTTAACCGGTTG-------------------GTCGCTGGTTCGAATCCGGCCCGGGGAGCCA
D00007986 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Asn GTT -TCAGAAGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAAGCGGCTGTTAACCGCTGG-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCCTCCTTCTGAGCCA
D00007936 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Asn GTT -TCCTGCGTAGCTCAGTT-GGC--AGAGCATCCGACTGTTAATCGGACG-------------------GTCGCTGGTTCAAGCCCAGCCGCAGGAG---
D00007937 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Asn GTT -TCCTGCGTAGCTCAGTT-GGC--AGAGCATCCGACTGTTAATCGGACG-------------------GTCACTGGTTCAAGCCCAGTCGCAGGAGCCA
D00007938 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Asn GTT -TCCTGCGTAGCTCAGTT-GGC--AGAGCATCCGACTGTTAATCGGACG-------------------GTCACTGGTTCAAGCCCAGTCGCAGGAG---
D00001941 Borrelia_burgdorferi Asn GTT -TCCCCTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCGGGTGGCTGTTAACCACTAG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTTCTGGGGGAG---
D00007821 Borrelia_burgdorferi_B31 Asn GTT -TCCCCTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCGGGTGGCTGTTAACCACTAG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTTCTGGGGGAG---
D00007997 Borrelia_garinii_PBi Asn GTT -TCCCCTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCGGGTGGCTGTTAACCACTAG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTTCTGGGGGAG---
D00007953 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Asn GTT -TCCTCGGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCATCCGACTGTTAATCGGATG-------------------GTCGCTGGTTCGAATCCAGCCCGGGGAGCCA
D00007954 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Asn GTT -CAAGGGATAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCAGATGACTGTTAATCATCTT-------------------GTCGCGGGTTCGATTCCCGCTCCATCGC---
D00007849 Brucella_melitensis_16M Asn GTT -TCCCCGGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCAACCGGCTGTTAACCGGTTG-------------------GTCGCTGGTTCGAATCCGGCCCGGGGAGCCA
D00007939 Brucella_suis_1330 Asn GTT -TCCCCGGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCAACCGGCTGTTAACCGGTTG-------------------GTCGCTGGTTCGAATCCGGCCCGGGGAGCCA
D00007802 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Asn GTT -TCCTCTGTAGTTCAGTT-GGT--AGAACGGCGGACTGTTAATCCGTAT-------------------GTCACTGGTTCGAATCCAGTCGGAGGAG---
D00007973 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Asn GTT -TCCTCTGTAGTTCAGTT-GGT--AGAACGGCGGACTGTTAATCCGTAT-------------------GTCACTGGTTCGAATCCAGTCAGGGGAG---
D00007918 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Asn GTT -TCCTCTGTAGTTCAGTT-GGT--AGAACGGCGGACTGTTAATCCGTAT-------------------GTCACTGGTTCGAGCCCAGTCAGGGGAG---
D00007822 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Asn GTT -TCCGGATTAGCTCAGC--GGT--AGAGTAGTCGGCTGTTAACCGATTG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTACATCCGGAGCCA
D00008030 Candidatus_Blochmannia_floridanus Asn GTT -TCCTCTGTAGTTCAGTT-GGT--AGAACGGCGGACTGTTAATCCGTAT-------------------GTCACTGGTTCAAATCCAGTCAGGGGAGCCA
D00007990 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Asn GTT -TCCGGATTAGCTCAGC--GGT--AGAGCAGTGGACTGTTAATCCATTG-------------------GTCGCTAGTTCGAATCTAGCATCCGGAG---
D00007823 Caulobacter_crescentus_CB15 Asn GTT -TCCGCGGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCAGCCGGCTGTTAACCGGCTG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTACCCGCGGAGCCA
D00007842 Chlamydia_muridarum_Nigg Asn GTT -TCCGGAGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCAGTGGACTGTTAATCCATTG-------------------GTCGTTGGTTCGAACCCATCCTCCGGAG---
D00007798 Chlamydia_trachomatis Asn GTT -TCCGGAGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCAGTGGACTGTTAATCCATTG-------------------GTCGTTGGTTCGAACCCATCCTCCGGA----
D00007797 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Asn GTT -TCCGGAGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCAGTGGACTGTTAATCCATTG-------------------GTCGTTGGTTCGAACCCATCCTCCGGAG---
D00007795 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Asn GTT -TCCGGAGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCAGTGGACTGTTAATCCATTG-------------------GTCGTTGGTTCGAACCCATCCTCCGGAG---
D00007796 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Asn GTT -TCCGGAGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCAGTGGACTGTTAATCCATTG-------------------GTCGTTGGTTCGAACCCATCCTCCGGAG---
D00007812 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Asn GTT -TCCGGAGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCAGTGGACTGTTAATCCATTG-------------------GTCGTTGGTTCGAACCCATCCTCCGGAG---
D00007915 Chlorobium_tepidum_TLS Asn GTT -TCCGCGATAGCTCAAT--GGT--AGAGCATTCGGCTGTTAACCGAAGG-------------------GTTGTAGGTTCGAATCCTACTCGCGGAG---
D00007846 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Asn GTT -TCCGCGATAGCTCAAC--GGT--GGAGCACTCGGCTGTTAACCGATAG-------------------GTTGAAGGTTCGAATCCTTTTCGCGGAGCCA
D00007847 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Asn GTT -TCCGTGATAGCTCAAC--GGT--GGAGCACTCGGCTGTTAACCGATAG-------------------GTTGAAGGTTCGAATCCTTTTCACGGAGCCA
D00007839 Clostridium_perfringens_str._13 Asn GTT -TCCTCGGTAGCTCAAT--GGT--GGAGCACTCGGCTGTTAACCGATAG-------------------GTTGGAGGTTCGAGTCCTCTCCGAGGAGCCA
D00007840 Clostridium_perfringens_str._13 Asn GTT -TCCTCGATAGCTCAAT--GGT--GGAGCACTCGGCTGTTAACCGATAG-------------------GCTGGAGGTTCGAGTCCTCTTCGAGGAGCCA
D00007841 Clostridium_perfringens_str._13 Asn GTT -TCCTCGGTAGCTCAAT--GGT--GGAGCACTCGGCTGTTAACCGATAG-------------------GTTGGAGGTTCGAGTCCTCTCCGAGGAGCCA
D00007955 Clostridium_tetani_E88 Asn GTT -TCCGTGGTAGCTCAAT--GGT--GGAGCATTCGGCTGTTAACCGAAGG-------------------GTTGAAGGTTCGAATCCTTTCCACGGAGCCA
D00007987 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Asn GTT -TCCCCCATAGCTCAATT-GGC--AGAGCATTCGACTGTTAATCGAAGG-------------------GTTACTGGTTCGAGTCCAGTTGGGGGAG---
D00007940 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Asn GTT -TCCTCCATAGCTCAGTT-GGC--AGAGCATTCGACTGTTAATCGAAGG-------------------GTCACTGGTTCGAGCCCAGTTGGAGGAG---
D00007920 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Asn GTT TTCCTCCATAGCTCAGTT-GGC--AGAGCATTCGACTGTTAATCGAAGG-------------------GTCACTGGTTCGAGCCCAGTTGGAGGAG---
D00007970 Coxiella_burnetii_RSA_493 Asn GTT -TCCTCGGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAGGTGACTGTTAATCACTTG-------------------GTCGGGGGTTCAAGTCCCTCCCGAGGAGCCA
D00007824 Deinococcus_radiodurans_R1 Asn GTT -TCGGCAGTAGCTCAGT--GGC--AGAGCATCCGACTGTTAATCGGACG-------------------GTCGTTGGTTCGACCCCAACCTGCCGAGCCA
D00008013 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Asn GTT -TCCCCGGTGGCTCAATC-GGC--AGAGCGGGTGACTGTTAATCACTAG-------------------GTTGGCGGTTCAAGTCCGTCCCGGGGAGCCA
D00007956 Enterococcus_faecalis_V583 Asn GTT -TCCGGCATAGCTCAGTT-GGTA-GTAGCGCATGACTGTTAATCATGAT-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAG---
D00001950 Escherichia_coli Asn GTT -TCCTCTGTAGTTCAGTC-GGT--AGAACGGCGGACTGTTAATCCGTAT-------------------GTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCA
D00007974 Escherichia_coli_CFT073 Asn GTT -TCCTCTGTAGTTCAGTC-GGT--AGAACGGCGGACTGTTAATCCGTAT-------------------GTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCA
D00007813 Escherichia_coli_K12 Asn GTT -TCCTCTGTAGTTCAGTC-GGT--AGAACGGCGGACTGTTAATCCGTAT-------------------GTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCA
D00007814 Escherichia_coli_O157:H7 Asn GTT -TCCTCTGTAGTTCAGTC-GGT--AGAACGGCGGACTGTTAATCCGTAT-------------------GTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCA
D00007815 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Asn GTT -TCCTCTGTAGTTCAGTC-GGT--AGAASGGCGGACTGTTAATCCGTAT-------------------GTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCA
D00007816 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Asn GTT -TCCTCTGTAGTTCAGTC-GGT--AGAACGGCGGACTGTTAATCCGTAT-------------------GTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCA
D00007916 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Asn GTT -GCTTCCTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCATGCGGCTGTTAACCGCAGC-------------------GTCAATGGTTCGAGTCCATTAGGAAGCGCCA
D00007998 Geobacter_sulfurreducens_PCA Asn GTT -TCCCCAATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGGGTGGCTGTTAACCACCAT-------------------GTCCCTGGTTCGAGTCCGGGTTGGGGAGCCA
D00001953 Haemophilus_influenzae Asn GTT -TCCTCCTTAGTTCAGTC-GGT--AGAACGGTGGACTGTTAATCCATAT-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCCGCAGGAGGAGCCA
D00001954 Haemophilus_influenzae Asn GTT -TCCTCCTTAGTTCAGTC-GGT--AGAACGGTGGACTGTTAATCCATAT-------------------GTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAGGAGGAGCCA
D00007819 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Asn GTT -TCCTCCTTAGTTCAGTC-GGT--AGAACGGTGGACTGTTAATCCATAT-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCCGCAGGAGGAGCCA
D00007820 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Asn GTT -TCCTCCTTAGTTCAGTC-GGT--AGAACGGTGGACTGTTAATCCATAT-------------------GTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAGGAGGAGCCA
D00007966 Helicobacter_hepaticus_ATCC_51449 Asn GTT -TCCGGATTAGCTCAGC--GGT--AGAGTAGGTGGCTGTTAACCACTTG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCATCCGGAGCCA
D00007817 Helicobacter_pylori_26695 Asn GTT -TCCAGATTAGCTCAGC--GGT--AGAGTAGGCGGCTGTTAACCGCTTG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTACATCTGGAGCCA
D00007818 Helicobacter_pylori_J99 Asn GTT -TCCAGATTAGCTCAGC--GGT--AGAGTAGGCGGCTGTTAACCGCTTG-------------------GTCGTAGGTTCCAATCCTACATCTGGAACCA
D00001944 Klebsiella_aerogenes Asn GTT -TCCTCTGTAGTTCAGTC-GGT--AGAACGGCGGACTGTTAATCCGTAT-------------------GTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCA
D00001945 Lactobacillus_delbrueckii_subsp._bulgaricus Asn GTT -TCCGCCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCTTGACTGTTAATCAGGAT-------------------GTCGTCAGTTCGAGTCTGACAGGCGGAG---
D00007999 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Asn GTT -TCCGGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCTGACTGTTAATCAGGTT-------------------GTCGTCAGTTCGAGTCTGACAGCCGGAG---
D00008000 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Asn GTT -TCCGGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCTGACTGTTAATCAGGTT-------------------GTCGTCAGTTCGAGTCTGACAGCCGGAGCCA
D00007957 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Asn GTT -TCCGACATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCTTGACTGTTAATCAAGAT-------------------GTCGACGGTTCGAGCCCGCCTGTCGGAG---
D00007958 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Asn GTT -GTGGCCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCTGACTGTTAATCAGGTT-------------------GTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAGGCTACG---
D00007959 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Asn GTT -TGCCCGGTAGTTCAGC--GGT--AGAATAATTGACTGTTAATCAAGAG-------------------GTCGCTGGTTCGATCCCAGCCCGGGCAG---
D00001946 Lactococcus_lactis Asn GTT -TGCGGATTAGCTCAGTT-GGTA-GTAGCGCATGACTGTTAATCATGAT-------------------GTCGTCAGTTCGAGTCTGACATCCGCAG---
D00008001 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Asn GTT -TCCTCGATAGCTCAATT-GGC--AGAGCAGCCGGCTGTTAACCGGCAG-------------------GTTCTTGGTTCGAGTCCAAGTCGGGGAC---
D00007941 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Asn GTT -TCCCCTTTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAAGTGACTGTTAATCACTGG-------------------GTCGCTGGTTCGAGCCCAGCAGGGGGAGCCA
D00007834 Listeria_innocua_Clip11262 Asn GTT -TCCACAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCCTGTGGAG---
D00007835 Listeria_innocua_Clip11262 Asn GTT -TCCACAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCCTGTGGAGCCA
D00007836 Listeria_innocua_Clip11262 Asn GTT -TCCACAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCCTGTGGAGCC-
D00001951 Listeria_ivanovii Asn GTT -TCCACAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCCTGTGGAGCCA
D00001952 Listeria_monocytogenes Asn GTT -TCCACAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCCTGTGGAGCCA
D00007837 Listeria_monocytogenes_EGD-e Asn GTT -TCCACAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCCTGTGGAG---
D00007838 Listeria_monocytogenes_EGD-e Asn GTT -TCCACAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCCTGTGGAGCCA
D00008014 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Asn GTT -TCCACAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCCTGTGGAG---
D00008015 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Asn GTT -TCCACAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCCTGTGGAGCCA
D00008016 Mesoplasma_florum_L1 Asn GTT -GGCTTTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACCGGCTGTTAACCGGTTT-------------------GTCACAGGTTCAAGTCCTGTAAAAGCCGCCA
D00007850 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Asn GTT -TCCCCGGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCAACCGGCTGTTAACCGGTTG-------------------GTCGCTGGTTCGAATCCGGCCCGGGGAGCCA
D00007967 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Asn GTT -TCCCCTGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCGTTCGGCTGTTAACCGAAGG-------------------GTTGGAGGTTCGAGTCCTCCCGGGGGAG---
D00007810 Mycobacterium_leprae_TN Asn GTT -TCCCCTGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCATTCGGCTGTTAACCGAACG-------------------GTTGGAGGTTCGAGTCCTCCCGGGGGAG---
D00007803 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Asn GTT -TCCCCTGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCGTTCGGCTGTTAACCGAAGG-------------------GTTGGAGGTTCGAGTCCTCCCGGGGGAG---
D00007989 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Asn GTT -TCCCCTGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCGTTCGGCTGTTAACCGAAGG-------------------GTTGGAGGTTCGAGTCCTCCCGGGGGAG---
D00001935 Mycoplasma_capricolum Asn GTT -GGCTTTTTAGCTCAGCA-GGT--AGAGCAACCGGCTGTTAACCGGTTT-------------------GTCACAGGTTCGAGCCCTGTAAAAGCCGCCA
D00007965 Mycoplasma_gallisepticum_R Asn GTT -GGCCACATAGCTCAGC--GGT--AGAGCAACCGGCTGTTAACCGGTTG-------------------GTCACAGGTTCAAATCCTGTTGTGGCCGCCA
D00001936 Mycoplasma_genitalium Asn GTT -CTCAGCGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCAACCGGCTGTTAACCGGTTG-------------------GTCACAGGTTCGATCCCTGTTGTGGCCGCCA
D00007825 Mycoplasma_genitalium_G37 Asn GTT -GGCCACATAGCTCAGC--GGT--AGAGCAACCGGCTGTTAACCGGTTG-------------------GTCACAGGTTCGATCCCTGTTGTGGCCGCCA
D00001937 Mycoplasma_mycoides Asn GTT -GGCTTTTTAGCTCAGCA-GGT--AGAGCAACCGGCTGTTAACCGGTTT-------------------GTCACAGGTTCGAGCCCTGTAAAAGCCGCCA
D00001938 Mycoplasma_pneumoniae Asn GTT -GGCCACATAGCTCAGC--GGT--AGAGCAACCGGCTGTTAACCGGTTG-------------------GTCACAGGTTCGATCCCTGTTGTGGCCGCCA
D00007826 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Asn GTT -GGCCACATAGCTCAGC--GGT--AGAGCAACCGGCTGTTAACCGGTTG-------------------GTCACAGGTTCGATCCCTGTTGTGGCCGCCA
D00007858 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Asn GTT -GCCGATTTAGCTCAGT--GGT--AGAGCAGCTGGCTGTTAACCAGTTG-------------------GTCACAAGTTCAAATCTTGTAATCGGCGCCA
D00007804 Neisseria_meningitidis_MC58 Asn GTT -TCCCCGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGACGGACTGTTAATCCGCAG-------------------GTCCCTGGTTCGAGCCCAGGTCGGGGAGCCA
D00007805 Neisseria_meningitidis_MC58 Asn GTT -TCCCCGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGACGGACTGTTAATCCGCAG-------------------GTCCCTGGTTCGAGCCCAGGTCGGGGAGCCA
D00007980 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Asn GTT -TCCCCGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGACGGACTGTTAATCCGCAG-------------------GTCCCAGGTTCGAGCCCTGGTCGGGGAGCCA
D00007855 Nostoc_sp._PCC_7120 Asn GTT -TGCCCCATAGCTCAAT--GGC--AGAGCAAGCGGCTGTTAACCGCGAG-------------------GTTGTAAGTTCGACTCTTACTGGGGCAGCCA
D00007856 Nostoc_sp._PCC_7120 Asn GTT -CGAAAGTTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGATCGACTGTTAATCGATAT-------------------GTTGTAGGTTCAACTCCTATACTTTCTCCCA
D00007857 Nostoc_sp._PCC_7120 Asn GTT -TCCTCAGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGATCGACTGTTAATCGATTG-------------------GTCACTGGTTCGAATCCAGTCTGGGGAG---
D00007942 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Asn GTT -TCCACAGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCAATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGTGGAGCCA
D00007988 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M Asn GTT -GCCTACGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCATCTGACTGTTAATCAGAGG-------------------GTCCTAGGTTCGAGTCCTAGCGTGGGCGCCA
D00007827 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Asn GTT -TCCTCCTTAGTTCAGTC-GGT--AGAACGGCGGACTGTTAATCCGTAT-------------------GTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAGGAGGAGCCA
D00007991 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Asn GTT -TCCTCCATAGTTCAGTC-GGT--AGAACAGCGGACTGTTAATCCGTAT-------------------GTCACTGGTTCAAGTCCAGTTGGGGGAGCCA
D00007992 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Asn GTT -TCCTCCATAGTTCAGTC-GGT--AGAACGGCGGACTGTTAATCCGTAT-------------------GTCACTGGTTCAAGTCCAGTTGGAGGAGCCA
D00008002 Porphyromonas_gingivalis_W83 Asn GTT -TCTTCCTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCATCTGACTGTTAATCAGAGG-------------------GTCCTTGGTTCAAGTCCAAGAGGAAGAG---
D00008003 Porphyromonas_gingivalis_W83 Asn GTT -GCTTTCTTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCATCTGACTGTTAATCAGAGG-------------------GTCCTTGGTTCGAGCCCAAGAGAAAGCG---
D00008017 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Asn GTT -TCCCCTGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCATCTGACTGTTAATCAGAGG-------------------GTTACTGGTTCGAGTCCAGTCGGGGGAG---
D00007829 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Asn GTT -TCCGCGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCAAATGACTGTTAATCATTGG-------------------GTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCA
D00007982 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Asn GTT -TCCGCGATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAAGTGACTGTTAATCACTGG-------------------GTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGTGGAGCCA
D00007854 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Asn GTT -TCCCCGATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGCCGGACTGTTAATCCGTAG-------------------GTCCCTGGTTCGAGCCCAGGTCGGGGAGCCA
D00007977 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Asn GTT -TCCGGTGTGGCCCAAT--GGT--AAGGCGGCTCCCTGTTAAGGAGACG-------------------AGTGATGGTTCGAGTCCATCCGCCGGAG---
D00007978 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Asn GTT -TCCCCTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGGCGGCTGTTAACCGCCTT-------------------GTCACAGGTTCGAGTCCTGTCGGGGGAG---
D00007979 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Asn GTT -TCCATGGGGGAGCCGTT-GGT--GGCTCGACTGACTGTTAATCAGTTT-------------------GCCGCTGGTTCGATTCCAGCCTATGGAG---
D00007993 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Asn GTT -TCCCTGGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCAACCGGCTGTTAACCGGTTG-------------------GTCGCTGGTTCGAATCCGGCCCGGGGAGCCA
D00007848 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Asn GTT -TCCTCGGTAGCTTAGT--GGT--AGAGCAAACGGCTGTTAACCGTTCG-------------------GTCGCTGGTTCGAGTCCGGCCCGGGGAGCCA
D00007919 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Asn GTT -TCCTCGGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCAAACGGCTGTTAACCGTTCG-------------------GTCGCTGGTTCGAGTCCGGCCCGGGGAGCCA
D00008004 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Asn GTT -TCCTCGGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCAAACGGCTGTTAACCGTTCG-------------------GTCGCTGGTTCGAGTCCGGCCCGGGGAGCCA
D00007860 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Asn GTT -TCCTCTGTAGTTCAGTC-GGT--AGAACGGCGGACTGTTAATCCGTAT-------------------GTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCA
D00007976 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Asn GTT -TCCTCTGTAGTTCAGTC-GGT--AGAACGGCGGACTGTTAATCCGTAT-------------------GTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCA
D00007852 Salmonella_typhimurium_LT2 Asn GTT -TCCTCTGTAGTTCAGTC-GGT--AGAACGGCGGACTGTTAATCCGTAT-------------------GTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCA
D00007853 Salmonella_typhimurium_LT2 Asn GTT -TCCTCTGTAGTTCAGTC-GGT--AGAACGGCGGACTGTTAATCCGTAT-------------------GTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCA
D00007945 Shewanella_oneidensis_MR-1 Asn GTT -TCCCCTGTAGTTCAGTC-GGT--AGAACGGCGGACTGTTAATCCGTAT-------------------GTCACTGGTTCAAGTCCAGTCAGGGGAGCCA
D00007946 Shigella_flexneri_2a_str._301 Asn GTT -TCCTCTGTAGTTCAGTC-GGT--AGAACGGGGGACTGTTAATCCGTAT-------------------GTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCA
D00007947 Shigella_flexneri_2a_str._301 Asn GTT -TCCTCTGTAGTTCAGTC-GGT--AGAACGGCGGACTGTTAATCCGTAT-------------------GTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCA
D00007861 Sinorhizobium_meliloti_1021 Asn GTT -TCCCTGGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCACTCGACTGTTAATCGATAG-------------------GTCGCCGGTTCGAATCCGGCCCGGGGAGCCA
D00007994 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Asn GTT -TCCACAGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCA
D00007921 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Asn GTT -TCCACAGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCA
D00007809 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Asn GTT -TCCACAGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACCTGTGGAGCCA
D00007960 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Asn GTT -TCCGCAGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGAGCCA
D00007961 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Asn GTT -TCCACAGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGTGGAGCCA
D00007948 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Asn GTT -TCCGGCATAGCTCAGTT-GGTA-GTAGCGCATGACTGTTAATCATGAT-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCTGCCGGAG---
D00007949 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Asn GTT -TCCGCCATAGCTCAGTT-GGTA-GTAGCGCATGACTGTTAATCATGAT-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGGCGGAG---
D00007922 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Asn GTT -TCCGCCATAGCTCAGTT-GGTA-GTAGCGCATGACTGTTAATCATGAT-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGGCGGAG---
D00007923 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Asn GTT -TCCGGCATAGCTCAGTT-GGTA-GTAGCGCATGACTGTTAATCATGAT-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCTGCCGGAG---
D00007950 Streptococcus_mutans_UA159 Asn GTT -TCCGGCATAGCTCAGTT-GGTA-GTAGCGCATGACTGTTAATCATGAT-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAG---
D00007845 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Asn GTT -TCCGCCATAGCTCAGTT-GGTA-GTAGCGCATGACTGTTAATCATGAT-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGGCGGAG---
D00007843 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Asn GTT -TCCGCCATAGCTCAGTT-GGTA-GTAGCGCATGACTGTTAATCATGAT-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGGCGGAG---
D00007844 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Asn GTT -TCCGGCATAGCTCAGTT-GGTA-GTAGCGCATGACTGTTAATCATGAT-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAG---
D00007924 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Asn GTT -TCCGCCATAGCTCAGTT-GGTA-GTAGCGCATGACTGTTAATCATGAT-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGGCGGAG---
D00007925 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Asn GTT -TCCGGCATAGCTCAGTT-GGTA-GTAGCGCATGACTGTTAATCATGAT-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAG---
D00007968 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Asn GTT -TCCGCCATAGCTCAGTT-GGTA-GTAGCGCATGACTGTTAATCATGAT-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGGCGGAG---
D00007969 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Asn GTT -TCCGGCATAGCTCAGTT-GGTA-GTAGCGCATGACTGTTAATCATGAT-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAG---
D00007975 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Asn GTT -TCCTCCGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCAGCCGGCTGTTAACCGGCAG-------------------GTTACTGGTTCGAGTCCAGTCGGGGGAG---
D00007943 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Asn GTT -TCCTCCGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCAGCCGGCTGTTAACCGGCAG-------------------GTTACTGGTTCGAGTCCAGTCGGGGGAG---
D00007944 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Asn GTT -TCCTCGGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCAGCCGGCTGTTAACCGGCAG-------------------GTTACTGGTTCGAGTCCAGTCCGGGGAG---
D00001942 Streptomyces_lividans Asn GTT -TCCTCGGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCAGCCGGCTGTTAACCGGCAG-------------------GTTACTGGTTCGAGTCCAGTCCGGGGAG---
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D00008005 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Asn GTT -TCCGGCGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCGTCCGGCTGTTAACCGGAGG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTACCGCCGGAGCCA
D00001955 Synechocystis_sp. Asn GTT -TCCTCGGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGGTCGGCTGTTAACCGATTG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTACCCGGGGAG---
D00007830 Synechocystis_sp._PCC_6803 Asn GTT -TCCTCGGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGGTCGGCTGTTAACCGATTG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTACCCGGGGAG---
D00007928 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Asn GTT -TCCTCAGTAGCTCAAG--GGT--AGAGCAACCGGCTGTTAACCGGTAG-------------------GTTGTAGGTTCGAATCCTACCTGAGGAGCCA
D00007929 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Asn GTT -TCCTCAGTAGCTCAAG--GGT--AGAGCAGCCGGCTGTTAACCGGCAG-------------------GTTGTAGGTTCGAATCCTACCTGAGGAGCCA
D00007926 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Asn GTT -TCCTCAGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCGGTCGGCTGTTAACCGATTG-------------------GTCGCTGGTTCGAATCCAGCCTGGGGAG---
D00007831 Thermotoga_maritima_MSB8 Asn GTT -TCCGGCGTAGCTCAACC-GGT--AGAGCGCCTGGCTGTTAACCAGGTG-------------------GTTGCAGGTTCGAGTCCTGCCGCCGGAGCCA
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D00002383 Tetrahymena_thermophila Gln TTA -GGTTCCATAGTATAGT--GGTT-AGTACTGGGGACTTTAAATCCCTTG-------------------A-CCTGGGTTCGAATCCCAGTGGGACCT---
D00005702 Aeropyrum_pernix_K1 His GTG -GCCCGGGTAGCTCAGCCTGGAT-AGAGCGCCGGACTGTGGATCCGGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCCGGGCCCC-
D00000974 Archaeoglobus_fulgidus His GTG -GCCCGGATGGGGTAGT--GGTT-ATCCTCTGGGACTGTGGATCCCAGG-------------------A-CCCGGGTTCGAATCCCGGTCCGGGCC---
D00005703 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 His GTG GGCCCGGATGGGGTAGT--GGTT-ATCCTCTGGGACTGTGGATCCCAGG-------------------A-GCCGGGTTCGAATCCCGGTCCGGGCC---
D00005704 Halobacterium_sp._NRC-1 His GTG GTCCGGGGTAGGGTAGT--GGACTATCCTTCAGCCTTGTGGAGGCTGAG-------------------A-CGCGGGTTCGATTCTCGCCCCTGGAC---
D00000975 Methanocaldococcus_jannaschii His GTG -GCCGGGGTGGGGTAGT--GGCC-ATCCTGGGGGACTGTGGATCCCCTG-------------------A-CCCGGGTTCAATTCCCGGTCCCGGCCC--
D00005706 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 His GTG -GCCGGGGTGGGGTAGT--GGCC-ATCCTGGGGGACTGTGGATCCCCTG-------------------A-CCCGGGTTCAATTCCCGGTCCCGGC----
D00011858 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 His GTG GGCCGGTGTAGGGTAGT--GGTT-ATCCTGAAGGACTGTGGATCCTTCG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCTCGGCACCGGCCCCA
D00005707 Methanococcus_maripaludis His GTG -GCCGTGGTAGGGTAGT--GGCT-ATCCTGAGGGACTGTGGATCCCTCG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGTCTCGGCCCC-
D00000976 Methanococcus_vannielii His GTG GGCCGAGGTAGGGTAGT--GGCT-ATCCTGAAGGACTGTGGATCCTTCG-------------------A-CCCGGGTTCAATTCCCGGTCTCGGCCCCA
D00005747 Methanopyrus_kandleri_AV19 His GTG -GCCGCGGCAGCTCAGCCTGGTT-AGAGCGCCGGCCTGTGGAGCCGGTG-------------------GCCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGCGGCCCCA
D00011911 Methanosarcina_acetivorans_C2A His GTG GGCCGGGGTAGGGTAGA--GGTCCATCCTGTGGCCCTGTGGAGGCTACG-------------------A-CCCGAGTTCGATTCTCGGTCCCGGCC---
D00005732 Methanosarcina_mazei_Go1 His GTG -GCCGGGGTAGGGTAGA--GGTCCATCCTGTGGCCCTGTGGAGGCTACG-------------------A-CCCGAGTTCGATTCTCGGTCCCGGCC---
D00011950 Methanospirillum_hungatei_JF-1 His GTG TGCCTGGGTGGGGTAAT--GGCT-ATCCTAAGGGATTGTGGTTCCCTCG-------------------A-TCTGGGTTCAATTCCCGGTCCAGGCC---
D00005705 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H His GTG -GCCGGGGTGGGGTAGGC-GGTT-ATCCTTCGGGACTGTGGATCCCGCG-------------------A-CTCGGGTTCAAATCTCGGCCCCGGCCCCA
D00000977 Methanothermus_fervidus His GTG GGCCGGGGTGGGGTAGTT-GGCC-ATCCTTCGGGACTGTGGATCCCGCG-------------------A-CTCGGGTTCAAATCCCGGCCCTGGCCT--
D00005708 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 His GTG -GCCGCCGTAGTCTAGC--GGTT-AGGATGGCGGGTTGTGGTCCCGTTGCGGCGAG-CCG-CGGGAGGA-CCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCGGCCCCA
D00005709 Pyrococcus_abyssi_GE5 His GTG -GCCGGGGTGGTGTAGCCTGGTT-AGCACAGGGGACTGTGGATCCCCTA-------------------G-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCCCGGCCCC-
D00005710 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 His GTG -GCCGGGGTGGTGTAGCCTGGTT-AGCACAGGGGACTGTGGATCCCCTG-------------------G-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCCCGGCCCC-
D00005711 Pyrococcus_horikoshii_OT3 His GTG GGCCGGGGTGGTGTAGCCTGGTT-AGCACAGGGGACTGTGGATCCCCTG-------------------G-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCCCGGCCCCA
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D00005741 Sulfolobus_tokodaii_str._7 His GTG -GCTCGGGTAGCTCAGCCTGGTT-AGAGCGACGGGCTGTGGACCCGTAG-------------------GTCCCGGGTTCAAGTCCCGGCCCGAGCC---
D00005713 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 His GTG GGCCGGGGTGGGGTAGT--GGAT-ATCCTTGGGGACTGTGGATCCCCGG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGTCCCGGCC---
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D00000981 Acholeplasma_laidlawii His GTG GGCGGTTGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCATCGGCTTGTGGCGCCGACA-------------------CTCGGGGGTTCAATTCCCCTCGGCCGCCCCA
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D00000991 Aeromonas_hydrophila His GTG GGTGGCTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGTCCCGGATTGTGATTCCGGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCATCAGCCACCCCA
D00005699 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 His GTG TGCGGTTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCAGGTTTGTGGCACCTGAG-------------------GTCGGTGGTTCGACCCCACTCAACCGTACCA
D00005681 Aquifex_aeolicus_VF5 His GTG GGAGGGTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGGGGGACTGTGGATCCCCGT-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCACCCTCCCCA
D00005819 Bacillus_anthracis_str._A2012 His GTG -GCGGTTGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCGGATTGTGGCTCCGGCA-------------------TTCGTGGGTTCGATTCCCATCAGTCGCCCCA
D00005784 Bacillus_anthracis_str._Ames His GTG GGCGGTTGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCGGATTGTGGCTCCGGCA-------------------TTCGTGGGTTCGATTCCCATCAGTCGCCCCA
D00005795 Bacillus_anthracis_str._Sterne His GTG GGCGGTTGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCGGATTGTGGCTCCGGCA-------------------TTCGTGGGTTCGATTCCCATCAGTCGCCCCA
D00005808 Bacillus_cereus_ATCC_10987 His GTG GGCGGTTGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCGGATTGTGGCTCCGGCA-------------------TTCGTGGGTTCGATTCCCATCAGTCGCCCCA
D00005809 Bacillus_cereus_ATCC_10987 His GTG GGCGGTTGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCGGATTGTGGCTCCGGCA-------------------TTCGTGGGTTCGATTCCCATCAGTCGCCCCA
D00005774 Bacillus_cereus_ATCC_14579 His GTG GGCGGTTGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCGGATTGTGGCTCCGGCA-------------------TTCGTGGGTTCGATTCCCATCAGTCGCCCCA
D00005759 Bacillus_halodurans_C-125 His GTG GGCGACTGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCGGATTGTGGCTCCGGCA-------------------CTCGTGGGTTCGATTCCCATCAGTCGCCCCA
D00000986 Bacillus_subtilis His GTG GGCGGTTGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCAGATTGTGGCTCTGGCA-------------------CTCGTGGGTTCGATTCCCATCAATCGCCCCA
D00000987 Bacillus_subtilis His GTG GGCGGTTGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCAGATTGTGGCTCTGGCA-------------------TTCGTGGGTTCGATTCCCATCAATCGCCCCA
D00005651 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 His GTG GGCGGTTGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCAGATTGTGGCTCTGGCA-------------------CTCGTGGGTTCGATTCCCATCAATCGCCCCA
D00005652 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 His GTG GGCGGTTGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCAGATTGTGGCTCTGGCA-------------------TTCGTGGGTTCGATTCCCATCAATCGCCCCA
D00005820 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 His GTG GGCGGTTGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCGGATTGTGGCTCCGGCA-------------------TTCGTGGGTTCGATTCCCATCAGTCGCCCCA
D00005782 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 His GTG GGTGGATGTAGTTCAGTT-GGTT-AGAGCGTCAGATTGTGGTTCTGAAT-------------------GTCGCCGGTTCGAGTCCGGTCTTCCACC---
D00005785 Bartonella_henselae_str._Houston-1 His GTG TGCGGTTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCTGGTTTGTGGCACCAGAG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCCACCAACCGTACCA
D00005822 Bartonella_quintana_str._Toulouse His GTG TGCGGTTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCTGGTTTGTGGCACCAGAG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCCACCAACCGTACCA
D00005786 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 His GTG GGTGGGTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCGGATTGTGATTCCGAGT-------------------GTCGCGGGTTCAAGCCCCGTTACTCACCCCA
D00005748 Bifidobacterium_longum_NCC2705 His GTG GGTGGCCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCTGATTGTGGTTCAGAAG-------------------GTCGCGCGTTCGAGCCGCGTTGGCCACCCCA
D00000983 Borrelia_burgdorferi His GTG GGTGGTTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGTCGGGTTGTGGTTCCGAAT-------------------GTCGCGGGTTCAAGCCCCGTCAATCACC---
D00005669 Borrelia_burgdorferi_B31 His GTG GGTGGTTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGTCGGGTTGTGGTTCCGAAT-------------------GTCGCGGGTTCAAGCCCCGTCAATCACC---
D00005796 Borrelia_garinii_PBi His GTG GGTGGTTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGTCGGGTTGTGGTTCCGAAT-------------------GTCGCGGGTTCAAGCCCCGTCAATCACC---
D00005760 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 His GTG TGCAGTTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCCTGTCTGTGGAACAGGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGCCCACCCAACTGTACCA
D00005692 Brucella_melitensis_16M His GTG CGCGGTCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCAGGATTGTGGCTCCTGAG-------------------GTCGTTGGTTCAACTCCAACCGACCGTACCA
D00005749 Brucella_suis_1330 His GTG CGCGGTCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCAGGATTGTGGCTCCTGAG-------------------GTCGTTGGTTCAACTCCAACCGACCGTACCA
D00005653 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) His GTG GGTGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGTGCTGGATTGTGATTCCAGTG-------------------GTCATGGGTTCAAGTCCCATTAGCCACCCCA
D00005775 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) His GTG GGTGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGTCCTGGATTGTGATTCCAGTT-------------------GTCATGGGTTCAAGTCCCATTAGCCACC---
D00005733 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) His GTG GGTGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGTTCTGGATTGTGATTCCAGTG-------------------GTCATGGGTTCAAATCCCATTAGCCACC---
D00005670 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 His GTG GGTGAGTGTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCATCAGATTGTGGTCCTGAGG-------------------GTCGTGGGTTCAATTCCCATCACTCACCCCA
D00005823 Candidatus_Blochmannia_floridanus His GTG GGTGATTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCTCTGGATTGTGGTTCCAGTG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCATCAGTCACC---
D00005790 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 His GTG GGCGGTCGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTTGGATTGTGGTTCCAAAT-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCGATCGCC---
D00005671 Caulobacter_crescentus_CB15 His GTG AGCCGGCTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCTAGATTGTGGATCTAGAG-------------------GTCCTCGGTTCGAGCCCGAGAGCTGGTACCA
D00005687 Chlamydia_muridarum_Nigg His GTG GGCGAACGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTCGGATTGTGGTTCCGAAG-------------------GTCGCGGGTTCGAACCCCGTCGTTCGCC---
D00005650 Chlamydia_trachomatis His GTG -GCGAACGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGTCGGATTGTGGTTCCGAAG-------------------GTCGCGGGTTCAAGCCCCGTCGTTCGC----
D00005649 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX His GTG GGCGAACGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTCGGATTGTGGTTCCGAAG-------------------GTCGCGGGTTCGAACCCCGTCGTTCGCC---
D00005647 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 His GTG GGCGAACGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGTCGGATTGTGGTTCCGAAG-------------------GTCGCGGGTTCAAGCCCCGTCGTTCGCC---
D00005648 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 His GTG GGCGAACGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGTCGGATTGTGGTTCCGAAG-------------------GTCGCGGGTTCAAGCCCCGTCGTTCGCC---
D00005662 Chlamydophila_pneumoniae_J138 His GTG GGCGAACGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGTCGGATTGTGGTTCCGAAG-------------------GTCGCGGGTTCAAGCCCCGTCGTTCGCC---
D00005730 Chlorobium_tepidum_TLS His GTG GGTGATTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCCAGGTTGTGGCCCTGGAG-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCCCTCATTCACCCCG
D00005690 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 His GTG GGTGGGTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCCAGATTGTGGTTCTGGAT-------------------GTCTAGGGTTCGAGACCCTATATTCACC---
D00005686 Clostridium_perfringens_str._13 His GTG GGTGGGCGTAGTTCAGTT-GGT--AGAGCACCAGATTGTGGCTCTGGGT-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTCGCTCACCCCA
D00005761 Clostridium_tetani_E88 His GTG GGTGGGTATAGCTCAGGT-GGT--AGAGCGCCAGATTGTGGTTCTGGAT-------------------GCCAAGGGTTCGAGTCCCTTTATCCACCCCA
D00005787 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 His GTG GGTGGCTGTAGTTCAGCT-GGT--AGAGCACCAGGTTGTGATCCTGGGT-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCAGCCACC---
D00005750 Corynebacterium_efficiens_YS-314 His GTG GGTGGCTGTAGTTCAGCT-GGT--AGAGCACCAGGTTGTGATCCTGGGT-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCAGCCACC---
D00005735 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 His GTG GGTGGCTGTAGTTCAGCT-GGT--AGAGCACCAGGTTGTGATCCTGGGT-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCAGCCACC---
D00005773 Coxiella_burnetii_RSA_493 His GTG GGTGGGCGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCCCCGGATTGTGATTCCGGTT-------------------GTCGTGGGTTCAAGTCCCATCGTCCACCCCA
D00005672 Deinococcus_radiodurans_R1 His GTG GGTGGAATTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCGCCGCTCTGTGGAAGCGGAG-------------------GCCGTGGGTTCAAGTCCCATATTCCACCCCA
D00005810 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough His GTG GGCGGATGTAGCTCAGCA-GGT--AGAGCACCTGGTTGTGGCCCAGGTG-------------------GCCGTGGGTTCAAGTCCCATCATTCGCCCCA
D00005762 Enterococcus_faecalis_V583 His GTG GGCGATCGTGGTGAAGT--GGTT-AACACACCAGATTGTGGCTCTGGCA-------------------TTCGTGGGTTCGATTCCCATCGGTCGCC---
D00000988 Escherichia_coli His GTG GGTGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCA
D00005776 Escherichia_coli_CFT073 His GTG GGTGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCA
D00005663 Escherichia_coli_K12 His GTG GGTGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCA
D00005664 Escherichia_coli_O157:H7 His GTG GGTGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCA
D00005665 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 His GTG GGTGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCA
D00005731 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 His GTG GGTGACCGTAGTTCAGTT-GGT--AGAGCGCCAGTTTGTGGCACTGGTT-------------------GTCGCGAGTTCGAGCCTCGTCGGTCACCCCA
D00005797 Geobacter_sulfurreducens_PCA His GTG GGTGGCTATGGTGAAGG--GGTCTAACACACATGACTGTGACTCATGCA-------------------TTCGTGGGTTCAAATCCCACTAGCCACCCCA
D00000992 Haemophilus_influenzae His GTG GGTGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCA
D00005668 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 His GTG GGTGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCA
D00005770 Helicobacter_hepaticus_ATCC_51449 His GTG GGTGGGTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCATCAGGTTGTGGCTCTGAGG-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCATCTCCCACCCCA
D00000985 Helicobacter_pylori His GTG GGTGGGAGTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCATCAGATTGTGGTCCTGAGG-------------------GTCGTGGGTTCGATTCCCATCTTCCACCCCA
D00005666 Helicobacter_pylori_26695 His GTG GGTGGGAGTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCATCAGATTGTGGTCCTGAGG-------------------GTCGTGGGTTCGATTCCCATCTTCCACCCCA
D00005667 Helicobacter_pylori_J99 His GTG GGTGGGAGTAGCTCAGTC-GGTT-AGAGCATCAGATTGTGGTCCTGAGG-------------------GTCGTGGGTTCGATTCCCATCTTCCACCCCA
D00005798 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 His GTG GGCGGAATTGGTGAAGT--GGTT-AACACACCGGTTTGTGGATCCGGCA-------------------TGCGTGGGTTCGATCCCCACATTCCGCC---
D00005763 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 His GTG GGCGGTAGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCGGATTGTGGCTCCGGCA-------------------CGCGTGGGTTCGATTCCCACCTACCGCC---
D00005799 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 His GTG GGTGGGTATAGCTCAGCT-GGT--AGAGCGCCTGGTTGTGGTCCAGGAG-------------------GTCGCGGGTTCAAGCCCCGTTACTCACCCCA
D00005751 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 His GTG GGAGAACGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCTCCAGTTTGTGGTACTGGCC-------------------GTCGCGGGTTCGATTCCCGTCGTTCTCCCCA
D00005682 Listeria_innocua_Clip11262 His GTG GGCGGATATGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCTGATTGTGGTTCAGGCA-------------------TTCGTGGGTTCGATTCCCATTATCCGCC---
D00005683 Listeria_innocua_Clip11262 His GTG GGCGGATGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCTGATTGTGGTTCAGGCA-------------------TTCGTGGGTTCGATTCCCATCATCCGCC---
D00005684 Listeria_monocytogenes_EGD-e His GTG GGCGGATATGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCTGATTGTGGTTCAGGCA-------------------TTCGTGGGTTCGATTCCCATTATCCGCC---
D00005685 Listeria_monocytogenes_EGD-e His GTG GGCGGATGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCTGATTGTGGTTCAGGCA-------------------TTCGTGGGTTCGATTCCCATCATCCGCC---
D00005811 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 His GTG GGCGGATATGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCTGATTGTGGTTCAGGCA-------------------TTCGTGGGTTCGATTCCCATTATCCGCC---
D00005812 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 His GTG GGCGGATGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCTGATTGTGGTTCAGGCA-------------------TTCGTGGGTTCGATTCCCATCATCCGCC---
D00005813 Mesoplasma_florum_L1 His GTG GGCGCCGGTGGTGAAGT--GGTT-AACACATCAGGTTGTGGCTCTGACA-------------------TTCGCGGGTTCGATTCCCGTTCGGCGCCCCA
D00005693 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 His GTG TGCCGTTGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCCGGATTGTGGATCCGGAG-------------------GTCGCTGGTTCGATCCCAGCCAACGGTACCA
D00005771 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 His GTG GGTGAGTGTAGTTCAGTT-GGT--AGAGCACCAGGTTGTGATCCTGGGT-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCACTCACCCCA
D00005660 Mycobacterium_leprae_TN His GTG GGTGAGTGTAGTTCAGTT-GGT--AGAGCACCAGGTTGTGATCCTGGGT-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCACTCACCCCA
D00005654 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 His GTG GGTGAGTGTAGTTCAGTT-GGT--AGAGCACCAGGTTGTGATCCTGGGT-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCACTCACCCCA
D00005789 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv His GTG GGTGAGTGTAGTTCAGTT-GGT--AGAGCACCAGGTTGTGATCCTGGGT-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCACTCACCCCA
D00000978 Mycoplasma_capricolum His GTG GGCGTAGGTGGTGAAGT--GGTT-AACACATCAGGTTGTGGCTCTGACA-------------------TACGCGGGTTCGATCCCCGTTCTACGCCCCA
D00005769 Mycoplasma_gallisepticum_R His GTG GGCGGTTGTGGCGAAGC--GGTTTAACGCACCTGACTGTGAATCAGGCA-------------------TGCACGGGTTCAAATCCCGTCAATCGCCCCA
D00000979 Mycoplasma_genitalium His GTG GGCGATTGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCTGATTGTGGATCAGGCA-------------------TTCGTGGGTTCAATTCCCATCAGTCGCCCA-
D00005673 Mycoplasma_genitalium_G37 His GTG GGCGATTGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCTGATTGTGGATCAGGCA-------------------TTCGTGGGTTCAATTCCCATCAGTCGCCCCA
D00000980 Mycoplasma_pneumoniae His GTG GGCGATTGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCTGATTGTGGATCAGGCA--------T----------GTCGTGGGTTCAATTCCCATCAGTCGCCCCA
D00005674 Mycoplasma_pneumoniae_M129 His GTG GGCGATTGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCTGATTGTGGATCAGGCA-------------------TTCGTGGGTTCAATTCCCATCAGTCGCCCCA
D00005698 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP His GTG GGTGAATATGGCGAAGG--GGTC-AACGCATCGGGTTGTGGTTCCGACA-------------------TTCGCGGGTTCGAATCCCGTTATTCACCCCA
D00005655 Neisseria_meningitidis_MC58 His GTG GGTGGCTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCCCCGGATTGTGATTCCGGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCATCAGCCACCCCA
D00005656 Neisseria_meningitidis_Z2491 His GTG GGTGGCTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCCCCGGATTGTGATTCCGGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCATCAGCCACCCCA
D00005781 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 His GTG GGTGGCTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGTCCCGGATTGTGATTCCGGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAGTCCCATCAGCCACCCCA
D00005697 Nostoc_sp._PCC_7120 His GTG GGCGGGCGTAGCCAAGT--GGTT-AAGGCAGTGGATTGTGGTTCCACCA-------------------TTCGGGGGTTCAAGTCCCCTCGTTCGCC---
D00005752 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 His GTG GGCGGTCGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCGGATTGTGGCTCCGGCA-------------------TTCGTGGGTTCAATCCCCACCGGTCGCCCCA
D00005753 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 His GTG GGCGGTCGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCACCGGATTGTGGCTCCGGCA-------------------CACGTGGGTTCGATCCCCATCGATCGCC---
D00005788 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M His GTG GGCGGTTATGGCGAAGT--GGTT-AACGCGGCGGCTTGTGGCGCCGATA-------------------TGCGTGGGTTCGATTCCCACTAGCCGCCCCA
D00005675 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 His GTG GGTGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCCCCGGATTGTGATTCCGGTT-------------------GTCGTGGGTTCAAGTCCCATTAGCCACCCCA
D00000990 Photobacterium_phosphoreum His GTG GGTGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGTCCCGGATTGTGATTCCGGTT-------------------GTCGCGAGTTCAAGCCTCGTTAGCCACCCCA
D00005791 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 His GTG GGTGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAGTCCCATTAGCCACCCCA
D00005800 Porphyromonas_gingivalis_W83 His GTG GGTGGGCGTAGTTCAGT--GGT--AGAGCAACGGATTGTGGTTCCGTCT-------------------GTCGTGGGTTCGAGTCCCATCGTCCACCCCA
D00005814 Propionibacterium_acnes_KPA171202 His GTG GGTGGCTATAGCTCAGTC-GGT--AGAGCACCTGGTTGTGGTCCAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCAAGTCCCGTTAGCCACCCCA
D00005677 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 His GTG GGTGGGCGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACAGGATTGTGGCTCCTGGT-------------------GTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCA
D00005783 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 His GTG GGTGGGCGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACAGGATTGTGACTCCTGCG-------------------GTCGTGGGTTCGAACCCCATCGTCCACCCCA
D00005696 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 His GTG GGTGGCTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGTCCCAGATTGTGATTCTGGTC-------------------GTCGTGGGTTCGAGTCCCATCAGCCACCCCA
D00005779 Rhodopirellula_baltica_SH_1 His GTG TGTGGCCGTCCTGCATT--GGTTTCAGGAACTTCGCTGTGAACGAAGTC-------------------CATGTCGGTTCAATTCCGATCGGTCACACTG
D00005780 Rhodopirellula_baltica_SH_1 His GTG GGTGGTTGTAGTTCAGTT-GGTT-AGAACGTCGGATTGTGATTCCGAAG-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCCCTCAGCCACC---
D00005792 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 His GTG TGCAGTTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCCTGTCTGTGGAACAGGAG-------------------GTCGGTGGTTCGAGCCCACCCAACTGTACCA
D00005691 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 His GTG GGCGGGTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCATCAGGTTGTGGTTCTGAGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCACTCGCCCCA
D00005734 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E His GTG GGCGAGTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCATCAGGTTGTGGTTCTGAGG-------------------GCCACGGGTTCGAATCCCGTCACTCGCCCCA
D00005801 Rickettsia_typhi_str._Wilmington His GTG GGCGAGTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCATCAGGTTGTGGTTCTGAGG-------------------GCCACGGGTTCGAATCCCGTCACTCGCCCCA
D00005700 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 His GTG GGTGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCA
D00005778 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 His GTG GGTGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCA
D00000989 Salmonella_typhimurium His GTG GGTGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCA
D00005695 Salmonella_typhimurium_LT2 His GTG GGTGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCA
D00005755 Shewanella_oneidensis_MR-1 His GTG GGTGATTGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGTCCCGGATTGTGATTCCGGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCATCAGTCACCCCA
D00005756 Shigella_flexneri_2a_str._301 His GTG GGTGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCA
D00005701 Sinorhizobium_meliloti_1021 His GTG TGCGGTTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGCAGGTTTGTGGCACCTGAG-------------------GTCGGAGGTTCGATCCCCCCCAACCGTACCA
D00000984 Staphylococcus_aureus His GTG GGCGGCTGTGGTGAAGT--GGTT-AACACATCGGATTGTGGTTCCGACA-------------------TTCGAGGGTTCGATCCCCTTCAGCCGCC---
D00005793 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 His GTG GGCGGTTGTGGTGAAGT--GGTT-AACACATCGGATTGTGGTTCCGACA-------------------TTCGAGGGTTCGATCCCCTTCAGCCGCCCCA
D00005794 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 His GTG GGCGGCTGTGGTGAAGT--GGTT-AACACATCGGATTGTGGTTCCGACA-------------------TTCGAGGGTTCGATCCCCTTCAGCCGCC---
D00005736 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 His GTG GGCGGTTGTGGTGAAGT--GGTT-AACACATCGGATTGTGGTTCCGACA-------------------TTCGAGGGTTCGATCCCCTTCAGCCGCCCCA
D00005737 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 His GTG GGCGGCTGTGGTGAAGT--GGTT-AACACATCGGATTGTGGTTCCGACA-------------------TTCGAGGGTTCGATCCCCTTCAGCCGCC---
D00005658 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 His GTG GGCGGCTGTGGTGAAGT--GGTT-AACACATCGGATTGTGGTTCCGACA-------------------TTCGAGGGTTCGATCCCCTTCAGCCGCC---
D00005659 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 His GTG GGCGGTTGTGGTGAAGT--GGTT-AACACATCGGATTGTGGTTCCGACA-------------------TTCGAGGGTTCGATCCCCTTCAGCCGCCCCA
D00005764 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 His GTG GGCGGTTGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCATCGGATTGTGGTTCCGACA-------------------CTCGAGGGTTCGATTCCCTTCAACCGCCCCA
D00005765 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 His GTG GGCGGTTGTGGCGAAGT--GGTT-AACGCATCGGATTGTGGTTCCGACA-------------------CTCGAGGGTTCGATTCCCTTCAACCGCC---
D00005757 Streptococcus_agalactiae_2603V/R His GTG GGCGGGTGTGGTGAAGT--GGTT-AACACATCAGATTGTGGCTCTGACA-------------------TTCGTGGGTTCGATTCCCATCACTCGCC---
D00005738 Streptococcus_agalactiae_NEM316 His GTG GGCGGGTGTGGTGAAGT--GGTT-AACACATCAGATTGTGGCTCTGACA-------------------TTCGTGGGTTCGATTCCCATCACTCGCC---
D00005758 Streptococcus_mutans_UA159 His GTG GGCGGGTGTGGTGAAGT--GGTT-AACACACCAGATTGTGGCTCTGGCA-------------------TGCGTGGGTTCGATCCCCATCACTCGCC---
D00005689 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 His GTG GGCGGGTGTGGTGAAGT--GGTT-AACACACCAGATTGTGGCTCTGGCA-------------------TGCGTGGGTTCGATCCCCATCACTCGCC---
D00005688 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS His GTG GGCGGGTGTGGTGAAGT--GGTT-AACACATCAGATTGTGGCTCTGACA-------------------TTCGTGGGTTCGATTCCCATCACTCGCC---
D00005739 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 His GTG GGCGGGTGTGGTGAAGT--GGTT-AACACATCAGATTGTGGCTCTGACA-------------------TTCGTGGGTTCGATTCCCATCACTCGCC---
D00005772 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 His GTG GGCGGGTGTGGTGAAGT--GGTT-AACACATCAGATTGTGGCTCTGACA-------------------TTCGTGGGTTCGATTCCCATCACTCGCC---
D00005777 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 His GTG GGTGGGTGTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCACCTGGTTGTGGTCCAGGAT-------------------GCCGCGGGTTCAAGTCCCGTCACTCACC---
D00005754 Streptomyces_coelicolor_A3(2) His GTG GGTGGGTGTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCACCTGGTTGTGGTCCAGGAT-------------------GCCGCGGGTTCAAGTCCCGTCACTCACC---
D00005802 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 His GTG GCTGACCGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCGCCAGATTGTGGCTCTGGAG-------------------GTCGCCGGTTCGATTCCGGTCGGTCAGCCCA
D00005803 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 His GTG GCAGACCGTAGCTCAGTT-GGCT-AGAGCGCCAGATTGTGGCTCTGGAG-------------------GTCGCCGGTTCGACCCCGGTCGGTCTGCCCA
D00000993 Synechocystis_sp. His GTG GGCGAGCGTAGCCAAGG--GGTT-AAGGCAGAGGATTGTGGTTCCTCCA-------------------CTCGTGGGTTCGAATCCCATCGTTCGCC---
D00005678 Synechocystis_sp._PCC_6803 His GTG GGCGAGCGTAGCCAAGG--GGTT-AAGGCAGAGGATTGTGGTTCCTCCA-------------------CTCGTGGGTTCGAATCCCATCGTTCGCC---
D00005742 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 His GTG GGTGGATATAGTTCAGGT-GGCA-AGAACGCCAGATTGTGGCTCTGGAG-------------------GTCGTGGGTTCAAGTCCCACTATCCACCCCA
D00005740 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 His GTG GGCGAGCGTAGCCAAGT--GGTT-AAGGCAGTGGATTGTGGTTCCACCA-------------------TTCGTGGGTTCGAGTCCCATCGCTCGCC---
D00005679 Thermotoga_maritima_MSB8 His GTG GGTGACCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCA
D00005815 Thermus_thermophilus_HB27 His GTG GGTGAGCGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGCACCGGACTGTGGATCCGGGG-------------------GTCGTGGGTTCAAGTCCCATCGCTCACCCCA
D00005816 Treponema_denticola_ATCC_35405 His GTG GGTGGGTATAGTTCAGG--GGT--AGAGCGCCAGATTGTGGTTCTGGTT-------------------GTCGTGGGTTCAAATCCCACTACCCACC---
D00000982 Treponema_pallidum His GTG GGTGGGTGTAGTTCAGT--GGT--AGAGCGCCAGATTGTGGATCTGGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCATCACTCACC---
D00005676 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols His GTG GGTGGGTGTAGTTCAGT--GGT--AGAGCGCCAGATTGTGGATCTGGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCATCACTCACC---
D00005766 Tropheryma_whipplei_str._Twist His GTG GGTGGATATAGCTCAGCT-GGT--AGAGCACCTGGTTGTGGTCCAGGAT-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTTATCCACC---
D00005767 Tropheryma_whipplei_TW08/27 His GTG GGTGGATATAGCTCAGCT-GGT--AGAGCACCTGGTTGTGGTCCAGGAT-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTTATCCACC---
D00005661 Ureaplasma_parvum_serovar_3 His GTG GGCGGTTATGGTGAAGTT-GGTT-AACACGCCTGATTGTGGCTCAGGTA--------TT---------TTCGCGGGTTCGAGTCCCGTTAATCGCCCCA
D00005657 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 His GTG GGTGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCCCCGGATTGTGATTCCGGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAGCCCCATTAGCCACCCCA
D00005817 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster His GTG GGCGGGCGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGTCAGTTTGTGGTACTGAAT-------------------GTTGCCAGTTCGATCCTGGTCGCTCGCCCCA
D00005744 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 His GTG GGTGGCTGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGTACTGGATTGTGATTCCAGAT-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCCCTCAGCCACCCCA
D00005743 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 His GTG GGTGGCTGTAGCTCAGCT-GGTT-AGAGTACTGGATTGTGATTCCAGAT-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCCCTCAGCCACCCCA
D00005680 Xylella_fastidiosa_9a5c His GTG GGTGGCTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGTACTGGATTGTGATTCCAGTT-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCCCTCAGCCACCCCA
D00005768 Xylella_fastidiosa_Temecula1 His GTG GGTGGCTGTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGTACTGGATTGTGATTCCAGTT-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCCCTCAGCCACCCCA
D00005804 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 His GTG GGTGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAGTCCCATTAGCCACCCCA
D00005694 Yersinia_pestis_CO92 His GTG GGTGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAGTCCCATTAGCCACCCCA
D00005746 Yersinia_pestis_KIM His GTG GGTGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAGTCCCATTAGCCACCCCA
D00005805 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 His GTG GGTGGCTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAGTCCCATTAGCCACCCCA
D00005718 Arabidopsis_thaliana His GTG -GTGGTTGTAGTATAGC--GGTT-AGTATCCCACGTTGTGGCCGTGGGG-------------------A-CCCGGGCTCGAATCCCGGCAGCCAC----
D00005719 Arabidopsis_thaliana His GTG -GTGGCTGTAGTTTAGT--GGTA-AGAATTCCACGTTGTGGCCGTGGAG-------------------A-CCTGGGCTCGAATCCCAGCAGCCAC----
D00005720 Arabidopsis_thaliana His GTG -GTGGCTGTAGTTTAGT--GGTT-AGAATCCCACGTTGTGGCCGTGGGG-------------------A-CCTGGGCTCGAATCCCAGCAGCCAC----
D00005721 Arabidopsis_thaliana His GTG -GTGGCTGTAGTTTAGT--GGTT-AGAATTCCACGTTGTGGCCGTGGAG-------------------A-CCTGGGCTCGAATCCCAGCAGCCAC----
D00001114 Caenorhabditis_elegans His GTG -GCCACGGTGGCCGAGT--GGTC-AAGGCGTGAGCTTGTGG_GGTTAAA--------CCC--------ATCGCAGGTTCGAATCCTGCCCGTGGCA---
D00005722 Caenorhabditis_elegans His GTG -GCCCTCTTAGTATAGT--GGCT-AGTACTCCACGTTGTGGTCGTGGCA-------------------A-CGCGGGTTCGATTCCAGCAGCAGGC----
D00005723 Caenorhabditis_elegans His GTG -GCCTGCTTAGTATAGT--GGTT-AGTACTCCACGTTGTGGCCGTGGCG-------------------A-CGCTGGTTAGATTCCAGCAGCAGGC----
D00005724 Caenorhabditis_elegans His GTG -GCCTGCTTAGTATAGT--GGTT-AGTACTCCACGTTGTGGCCGTGGCG-------------------A-CGCTGGTTCGATTCCAGCAGCAGGC----
D00005725 Caenorhabditis_elegans His GTG -GCCTGCGTAGTATAGT--GGTT-AGTACTCCACGTTGTGGCCGTGGCG-------------------A-CGCTGGTTCGATTCCAGCCGCAGGC----
D00005726 Caenorhabditis_elegans His GTG -GCCACGGTGGCCGAGT--GGTC-AAGGCGTGAGCTTGTGGGATGCGCTCATGGG--GTTA-AACCCAT-CGCAGGTTCGAATCCTGCCCGTGGC----
D00005806 Candida_glabrata_CBS_138 His GTG -GCCATTTTAGTATAGT--GGTT-AGTACACATCGTTGTGGCCGATGAA-------------------A-CCCTGGTTCGATTCTAGGAAATGGCA---
D00005807 Candida_glabrata_CBS_138 His GTG -GCCATCTTAGTATAGT--GGTT-AGTACACATCGTTGTGGCCGATGAA-------------------A-CCCTGGTTCGATTCTAGGAGATGGCA---
D00000994 Cyanophora_paradoxa His GTG GGCGATCGTAGCCAAGT--GGTT-AAGGCAGTGGATTGTGGTTCCACCA-------------------CTCGCGGGTTCAATTCCCGTCGTTCGCCC--
D00001111 Dictyostelium_discoideum His GTG -GCCGTGATAGTATAGT--GGT--AGTACATCAGATTGTGGCTCTGATG-------------------A-CCCTGGTTCGATTCCAGGTCGCGGCA---
D00001115 Drosophila_melanogaster His GTG -GCCGTGATCGTCTAGT--GGTT-AGGACCCCACGTTGTGGCCGTGGTA-------------------A-CCCAGGTTCGAATCCTGGTCACGGCA---
D00005728 Drosophila_melanogaster His GTG -GCCGTGATCGTCTAGT--GGTT-AGGACCCCACGTTGTGGCCGTGGTA-------------------A-CCCAGGTTCGAATCCTGGTCACGGCA---
D00005745 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 His GTG -GCTGAATTAGCTTAGT--GGT--AGAGCATGGCGTTGTGGCCGCCAAG-------------------A-TGCGAGTTCGATTCTCGCATTCAGCA---
D00005825 Gallus_gallus His GTG -GCGGATGTAGCCAAGT--GGATCAAGGCAGTGGATTGTGAATCCACCA-------------------TGCGCGGGTTCAATTCCCGTCGTTCGCC---
D00005826 Gallus_gallus His GTG -GCTGTGATTGTATAGT--GGTC-AGTACTCTGCGTTGTGGCCGCAGCA-------------------A-CCTCGGTTCGAATCCGAGTCACAGCA---
D00005827 Gallus_gallus His GTG -GCCGTGATCGTATAGT--GGTC-AGTACTCTGCGTTGTGGCCGCAGCA-------------------A-CCTCGGTTCGAATCCGAGTCACGGCA---
D00005828 Gallus_gallus His GTG -GCCGTGATCGTATAGT--GGTT-AGTACTCTGCGTTGTGGCCGCAGCA-------------------A-CCTCGGTTCAAATCCGAGTCACGGCA---
D00005829 Gallus_gallus His GTG -GCCGTGATCGTATAGT--GGTT-AGTACTCTGCGTTGTGGCCGCAGCA-------------------A-CCTCGGTTCGAATCCGAGTCACGGCA---
D00005715 Homo_sapiens His GTG -GCAGTGACTGTATAGT--GGTT-AGCACTCTGTGTTGTGGCCACAGCA-------------------A-CCATGGTTCAAATCTGAGTCATGAC----
D00005716 Homo_sapiens His GTG -GCCATGATCGTATAGT--GGTT-AGTACTCTGCGCTGTGGCCGCAGCA-------------------A-CCTCGGTTCGAATCCGAGTCACGGC----
D00005717 Homo_sapiens His GTG -GCCGTGATCGTATAGT--GGTT-AGTACTCTGCGTTGTGGCCGCAGCA-------------------A-CCTCGGTTCGAATCCGAGTCACGGCA---
D00001116 Mus_musculus His GTG -GCCGTGATCGTATAGG--GGTT-AGTACTCTGCGTTGTGGCCGCAGCA-------------------A-CCTCGGTTCGAATCCGAGTCACGGCA---
D00005838 Pan_troglodytes His GTG -GCTATGATCGTACAGT--GGTT-ACTACTCTGCGTTGTGGCCACAGCA-------------------A-CCTCGGCTCGAATCCGAGTCATGGCA---
D00005839 Pan_troglodytes His GTG -GCCGTGATCGTATAGT--GGTT-AGTACTCTGCGTTGTGGCCGCAGCA-------------------A-CCTCGGTTCGAATCCGAGTCACGGCA---
D00005840 Pan_troglodytes His GTG -GCCATGATGGTATAGT--GGTT-AGTACTCTGCGCTGTGGCCGCAGCA-------------------A-CCTCGGTTCGAATCCGAGTCACGGCA---
D00001110 Plasmodium_falciparum His GTG -ATAAATATAATCTAAT--GGTT-AAGATGAAGAATTGTGGTTTCTTTT-------------------A-TATGAGTTCAAATCTCTTTATTTATC---
D00005821 Plasmodium_falciparum_3D7 His GTG -GTCCAAATCGTCTAGT--GGTT-AGGACTCCACGCTGTGGACGTGGCA-------------------A-CGTAGGTTCGAATCCTGCTTTGGACA---
D00001112 Saccharomyces_cerevisiae His GTG -GCCATCTTAGTATAGT--GGTT-AGTACACATCGTTGTGGCCGATGAA-------------------A-CCCTGGTTCGATTCTAGGAGATGGCA---
D00005727 Saccharomyces_cerevisiae His GTG -GCCATCTTAGTATAGT--GGTT-AGTACACATCGTTGTGGCCGATGAA-------------------A-CCCTGGTTCGATTCTAGGAGATGGCA---
D00001113 Schizosaccharomyces_pombe His GTG -GCTCACATGGTCCAGT--GGTT-AAGACTCATCGTTGTGGCCGATGCG-------------------A-CCCAGGTTCGATTCCTGGTGTGGGCA---
D00005729 Schizosaccharomyces_pombe His GTG -GCTCACATGGTCCAGT--GGTT-AAGACTCATCGTTGTGGCCGATGCG-------------------A-CCCAGGTTCGATTCCTGGTGTGGGCA---
D00005830 Takifugu_rubripes His GTG -GCCGTGATCGTATAGT--GGTC-AGTACTCTGCGTTGTGGCCGCAGCA-------------------A-CCCCAGTTCGAATCCGGGTCACGGCA---
D00005831 Takifugu_rubripes His GTG -GCCGTGATCGTATAGT--GGTC-AGTACTTTGCGTTGTGGCCGCAAAC-------------------AACCCCGGTTCGAATCCGGGTCACGGCA---
D00005832 Takifugu_rubripes His GTG -GCCGTGATCGTATAGT--GGTT-AGTACTCTGCGTTGTGGCCGCAGCA-------------------A-CCCAGGTTCGAATCCGGGTCACGGCA---
D00005833 Takifugu_rubripes His GTG -GCCGTGATCGTATAGT--GGTC-AGTACTCTGCGTTGTGGCCGCAGCA-------------------A-CCCCGGTTCAAATCCGGGTCACGGCA---
D00005834 Takifugu_rubripes His GTG -GCCGTGATCGTATAGT--GGTT-AGTACTCTGTGTTGTGGCCGCAGCA-------------------A-CCCCGGTTCGAATCCGGGTCACGGCA---
D00005835 Takifugu_rubripes His GTG -GCCGTGATCGTATAGT--GGTC-AGTACTCTGCGTTGTGGCCGCAGCA-------------------A-CCCCGGTTCGAATCCGGGTCACGGCA---
D00005836 Takifugu_rubripes His GTG -GCCGTGATCGTATAGT--GGTT-AGTACTTTGCGTTGTGGCCGCAACA-------------------A-CCCCGGTTCGAATCCGGGTCACGGCA---
D00005837 Takifugu_rubripes His GTG -GCCGTGATCGTATAGT--GGTT-AGTACTCTGCGTTGTGGCCGCAGCA-------------------A-CCCCGGTTCGAATCCGGGTCACGGCA---
D00005824 Gallus_gallus His ATG -GAGCCAGTGGTGCAAT--GGAT-AACACATCTGGCTATGGATAAGAAG-------------------ACTGTAGGTTCGACTCCTGCCTAGCTTG---
D00011623 Aeropyrum_pernix_K1 Tyr GTA -CCCGCCGTAGCTCAGC--GGC--AGAGCGCCCGGCTGTAGACCGGGTG-------------------GTCCGGGGTTCGAATCCCCGCGGCGGGACC-
D00003509 Archaeoglobus_fulgidus Tyr GTA -CCCGCCTTAGCTCAGA--GGT--AGAGCGTGGGACTGTAGATCCCATG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGAGGCGGGA---
D00011624 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Tyr GTA -CCCGCCTTAGCTCAGA--GGT--AGAGCGTGGGACTGTAGATCCCATG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGAGGCGGGA---
D00011625 Halobacterium_sp._NRC-1 Tyr GTA -CCGCCCTTAGCTCAGACTGGT--AGAGCAGTCGACTGTAGATCGACTT-------------------GCCCCCCGTTCAAATCGGGGAGGGCGGA---
D00003510 Methanocaldococcus_jannaschii Tyr GTA -CCGGCGGTAGTTCAGCCTGGT--AGAACGGCGGACTGTAGATCCGCAT-------------------GTCGCTGGTTCAAATCCGGCCCGCCGGA---
D00011627 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Tyr GTA -CCGGCGGTAGTTCAGCCTGGT--AGAACGGCGGACTGTAGATCCGCAT-------------------GTCGCTGGTTCAAATCCGGCCCGCCGGACC-
D00011864 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Tyr GTA -CCGGTGGTAGTTCAGTT-GGT--AGAGCGGCGGACTGTAGATCCGCAT-------------------GTCGCTGGTTCAAATCCGGCCCACCGGACCA
D00011628 Methanococcus_maripaludis Tyr GTA -CCCGCGATAGTTCAGACTGGT--AGAACGGCGGACTGTAGATCCGCAT-------------------GTCGCTGGTTCAAATCCGGCTCGCGGGA---
D00003511 Methanococcus_vannielii Tyr GTA -CCCGCGATAGTTCAGATTGGT--AGAACGGCGGACTGTAGATCCGCAT-------------------GTCGCTGGTTCAAATCCGGCTCGCGGGA---
D00003512 Methanococcus_voltae Tyr GTA -CCCGCGATAGTTCAGACTGGT--AGAACGGCGGACTGTAGATCCGCAT-------------------GTCGCTGGTTCAAATCCGGCTCGCGGGA---
D00011709 Methanopyrus_kandleri_AV19 Tyr GTA -CCGGCCGCAGCTCAGTCTGGCT-AGAGCGCGGGACTGTAGATCCCGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCGGACCA
D00011925 Methanosarcina_acetivorans_C2A Tyr GTA -CCCGCCTTAACTCAGT--GGT--AGAGTGCGCGGCTGTAGACCGCGAT-------------------GTCCCCGGTTCGAGTCTGGGAGGCGGGA---
D00011693 Methanosarcina_mazei_Go1 Tyr GTA -CCCGCCTTAACTCAGT--GGT--AGAGTGCGCGGCTGTAGACCGCGAT-------------------GTCCCCGGTTCGAGTCTGGGAGGCGGGA---
D00011961 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Tyr GTA -CCCGCCTTAACTCAGACTGGT--AGAGTGCGCGGCTGTAGACCGCGAT-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGAGGCGGGA---
D00011626 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Tyr GTA -CCCGCCTTAGCTCAATT-GGC--AGAGCATCGGACTGTAGATCCGAGG-------------------GTTGCTGGTTCAAGTCCGGCAGGCGGGA---
D00011979 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Tyr GTA -CCGGGCGTAGCTCAGC--GGC--AGAGCGGCCGGCTGTAGACCGGCAG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCCCCGCCCGGA---
D00011629 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Tyr GTA -CGGGCCGTAGCTCAGC--GGTCGAGAGCGCCCGGCTGTAGAACGGGCG-------------------GTCCCGGGTTCGAATCCCGGCGGCCCGA---
D00011630 Pyrococcus_abyssi_GE5 Tyr GTA -CCCGCGGTAGCCTAGCCTGGTA-GTGGCGGCGGACTGTAGATCCGCAG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGCCGCGGGACC-
D00011631 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Tyr GTA -CCCGCGGTAGCCTAGCCTGGTA-GTGGCGGCGGACTGTAGATCCGCAG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGCCGCGGGACC-
D00011632 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Tyr GTA -CCCGCGGTAGCCTAGCCTGGGA-GTGGCGGCGGACTGTAGATCCGCAG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGCCGCGGGACCA
D00012018 Staphylothermus_marinus_F1 Tyr GTA -CCCGCGGTAGCTCAGC--GGC--AGAGCGCCCGGCTGTAGACCGGGTG-------------------GTCGGGGGTTCAAGTCCCCCCCGCGGGACCA
D00011633 Sulfolobus_solfataricus_P2 Tyr GTA -CCCGCCGTAGCTCAGCCCGGTTTAGAGCGCCCGGCTGTAGACCGGGTG-------------------GTCCGGGGTTCAAGTCCCCGCGGCGGG----
D00011703 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Tyr GTA -CCCGCCGTAGCTCAGCCCGGT--GGAGCGCCCGGCTGTAGACCGGGTG-------------------GTCCGGGGTTCAAGTCCCCGCGGCGGGA---
D00011634 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Tyr GTA -CCCGGCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGGCGGACTGTAGATCCGCAG-------------------GTCTCTGGTTCGAATCCGGAAGCCGGGA---
D00011635 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Tyr GTA -CCCGGCTTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCGGCGGACTGTAGATCCGCAG-------------------GTCTCTGGTTCGAATCCGGAAGCCGGGA---
D00011780 Acinetobacter_sp._ADP1 Tyr GTA -GGTGAGATTCCCGAGC--GGTCAAAGGGGGCGGACTGTAACTCCGCTACG------AAAG-----TTT-CGAAGGTTCGAATCCTTCTCTCACCACCA
D00011620 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Tyr GTA -GGAGGGATGCCCGAGT--GGTTAAAGGGGACGGACTGTAAATCCGTTGGC------TACG-----CCTACGTTGGTTCAAATCCAACTCCCTCCACCA
D00011600 Aquifex_aeolicus_VF5 Tyr GTA -GGAGGGGTGGCCGAGC--GGCCAAAGGCAGGGGACTGTAAATCCCCCGGGCG----TCCG---CCCTG-CGCAGGTTCGAATCCTGCCCCCTCCA---
D00011781 Bacillus_anthracis_str._A2012 Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGCAGTTCGAATCTGCCCCCCTCCACCA
D00011748 Bacillus_anthracis_str._Ames Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGCAGTTCGAATCTGCCCCCCTCCACCA
D00011759 Bacillus_anthracis_str._Sterne Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGCAGTTCGAATCTGCCCCCCTCCACCA
D00011772 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGCAGTTCGAATCTGCCCCCCTCCACCA
D00011736 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGCAGTTCGAATCTGCCCCCCTCCACCA
D00011723 Bacillus_halodurans_C-125 Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCC------TCAG-----GGTTCGGCGGTTCGAATCCGTCCCCCTCCACCA
D00003522 Bacillus_subtilis Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCC------TCAG-----GGTTCGGCAGTTCGAATCTGCCCCCCTCCACCA
D00003523 Bacillus_subtilis Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GCTA-AACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCC------TCAG-----GGTTCGGCAGTTCGAATCTGCCCCCCTCCACCA
D00011564 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GCTA-AACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCC------TCAG-----GGTTCGGCAGTTCGAATCTGCCCCCCTCCACCA
D00011565 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCC------TCAG-----GGTTCGGCAGTTCGAATCTGCCCCCCTCCACCA
D00011782 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGCAGTTCGAATCTGCCCCCCTCCACCA
D00011745 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Tyr GTA -GGGCAAATACCAGAGT--GGCCAAATGGGGCAGACTGTAAATCTGCTGTCT-----TTC-----GACTTCGGTGGTTCGAATCCATCTTTGCCCA---
D00011746 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Tyr GTA -GGGCAAATACCAGAGT--GGCCAAATGGGGCAGACTGTAAATCTGCTGGCT-----TAC-----GCCTTCGGTGGTTCGAATCCATCTTTGCCCA---
D00011749 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Tyr GTA -GGAGGGGTGCCCGAGT--GGTTAAAGGGGGCGGACTGTAAATCCGTTGCG------TATG-----CTA-CGTTGGTTCGAATCCAACCCCCTCCACCA
D00011784 Bartonella_quintana_str._Toulouse Tyr GTA -GGAGGGGTGCCCGAGT--GGTTAAAGGGGGCGGACTGTAAATCCGTTGCG------TATG-----CTA-CGTTGGTTCGAATCCAACCCCCTCCACCA
D00011750 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Tyr GTA -GGGTAGGTGCCCGAGT--GGCTAAAGGGGACGGACTGTAAATCCGTTGGCT-----TAT-----GTCTACGAAGGTTCGAATCCTTCCCTGCCCACCA
D00011710 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Tyr GTA -GGCGGATTTCCCAAGC--GGTCAAAGGGAGCTGACTGTAAATCAGCCGCT------TCGT-----GCTTCAGTGGTTCGAATCCACTATCCGCCA---
D00003518 Borrelia_burgdorferi Tyr GTA -GGGGCGGTACCGAAGT--GGTTAACCGGGGCAGACTGTAAATCTGTTGGC------TTTG-----CCTACGTGGGTTCGAATCCCACCCTCCCCA---
D00011585 Borrelia_burgdorferi_B31 Tyr GTA -GGGGCGGTACCGAAGT--GGTTAACCGGGGCAGACTGTAAATCTGTTGGC------TTTG-----CCTACGTGGGTTCGAATCCCACCCTCCCCA---
D00011724 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Tyr GTA -GGGGGAGTGTCCCGAGT-GGCA-AAGGGAGCTGACTGTAAATCAGCCGCCT-----CAT-----GGCTTCGCAGGTTCGAGTCCTGCCTCCCCCACCA
D00011611 Brucella_melitensis_16M Tyr GTA -GGAGGGATGCCCGAGT--GGTTAAAGGGGACGGACTGTAAATCCGTTGGC------TATG-----CCTACGTTGGTTCAAATCCAACTCCCTCCACCA
D00011711 Brucella_suis_1330 Tyr GTA -GGAGGGATGCCCGAGT--GGTTAAAGGGGACGGACTGTAAATCCGTTGGC------TATG-----CCTACGTTGGTTCAAATCCAACTCCCTCCACCA
D00011566 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Tyr GTA -GGTGGGGTTCCCGAGC--GGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTC------ATAG-----ACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCTCCCACCACCA
D00011737 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Tyr GTA -GGTGGGATTCCCGAGT--GGCTAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTC------AAAG-----ACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCTCCCACCA---
D00011694 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Tyr GTA -GGTGGGATTCCCGAGC--GGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTCT-----AAG-----ACTT-CGAAGGTTCGAATCCTTCTCCCACCA---
D00003529 Campylobacter_jejuni Tyr GTA -GGTGAGTTACTCAAGT--GGCCAACGAGGGCAGACTGTAAATCTGCTGGCT-----TTC-----GCCTTCCGTGGTTCGAATCCACGACTCACCACCA
D00011586 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Tyr GTA -GGTGAGTTACTCAAGT--GGCCAACGAGGGCAGACTGTAAATCTGCTGGCT-----TTC-----GCCTTCCGTGGTTCGAATCCACGACTCACCACCA
D00011785 Candidatus_Blochmannia_floridanus Tyr GTA -GATGGGGTGCCCGAGT--GGTTAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTC------GTAG-----ACTTCGAAGGTTCAAATCCTTCCCCCATCA---
D00011754 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Tyr GTA -GGGGGTGTCGCATAGT--GGCA-ATTGCAAGGGACTGTAAATCCCTCGACT-----TCG-----GTCTCCGTTGGTTCGAGTCCAACCGCCCCCA---
D00011587 Caulobacter_crescentus_CB15 Tyr GTA --GGGAATGTCCCGAGT--GGCA-AAGGGGGGGGACTGTAAATCCCCTGGCG-----TAAG----CCTT-CGTAGGTTCGAGTCCTACTTCCCCCACCA
D00011604 Chlamydia_muridarum_Nigg Tyr GTA -GGGGGTGTCGCATAGC--GGTCAATTGCATCGGACTGTAAATCCGACTCCT-----TAC-----GGATACGTTGGTTCAAATCCAGCCACCCCCA---
D00011563 Chlamydia_trachomatis Tyr GTA -GGGGGTGTCGCATAGT--GGTCAATTGCATCGGACTGTAAATCCGGCTCCT-----TAC-----GGATACGTTGGTTCAAATCCAGCCACCCCC----
D00011562 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Tyr GTA -GGGGGTGTCGCATAGC--GGTCAATTGCATCGGACTGTAAATCCGACTCCT-----TAC-----GGATACGTTGGTTCAAATCCAGCCACCCCCA---
D00011560 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Tyr GTA -GGGGGTGTCGCATAGT--GGTCAATTGCATCGGACTGTAAATCCGGCTCCT-----TAC-----GGATACGTTGGTTCAAATCCAGCCACCCCCA---
D00011561 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Tyr GTA -GGGGGTGTCGCATAGT--GGTCAATTGCATCGGACTGTAAATCCGGCTCCT-----TAC-----GGATACGTTGGTTCAAATCCAGCCACCCCCA---
D00011575 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Tyr GTA -GGGGGTGTCGCATAGT--GGTCAATTGCATCGGACTGTAAATCCGGCTCCT-----TAC-----GGATACGTTGGTTCAAATCCAGCCACCCCCA---
D00011691 Chlorobium_tepidum_TLS Tyr GTA -GGGTAGGTAGCGAAGC--GGTCAAACGCAACAGACTGTAAATCTGTCGACA-----TATG----TCTT-CGGAGGTTCGAATCCTCCCCTACCCA---
D00011608 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Tyr GTA -GGAGGAATTCCCGAGT--GGCCAAAGGGGGCAGACTGTAAATCTGTTAGC------TCAG-----CTTTCCATGGTTCGAATCCATGTTCCTCCACCA
D00011609 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Tyr GTA -GGAGGAATTCCCGAGT--GGCTAAAGGGGGCAGACTGTAAATCTGTTAGC------TCAG-----CTTTCCATGGTTCGAATCCATGTTCCTCCACCA
D00011603 Clostridium_perfringens_str._13 Tyr GTA -GGTGGAATTCCCGAGT--GGCCAAAGGGGGCAGACTGTAAATCTGTTGTCG-----GAC-----GACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCTTCCACCACCA
D00011725 Clostridium_tetani_E88 Tyr GTA -GGAGGAGTTCCCGAGT--GGCCAAAGGGGGCAGACTGTAAATCTGTTGGCT-----TTC-----GCCTTCGATGGTTCGAATCCGTCCTCCTCCACCA
D00011751 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Tyr GTA -GCCAGGTTGCCCGAGC--GGCCAAAGGGAGCGGACTGTAAATCCGTCGGC------ATTG-----CCTACAGAAGTTCGAATCTTCTACCTGGCA---
D00011712 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Tyr GTA -GCCAGATTGCCCGAGC--GGCCAATGGGAGCGGACTGTAAATCCGTCGGCT-----TGC-----GCCTACGTAGGTTCGAATCCTACATCTGGCA---
D00011696 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Tyr GTA -GCCAGATTGCCCGAGC--GGCCAATGGGAGCGGACTGTAAATCCGTCGGCT-----TGC-----GCCTACGTAGGTTCGAATCCTACATCTGGCA---
D00011735 Coxiella_burnetii_RSA_493 Tyr GTA -GGAGGGGTTCCCGAGT--GGCCAAAGGGATCAGACTGTAAATCTGACGGC------TCAG-----CCTTCGTAGGTTCGAATCCTACCCCCTCCA---
D00011588 Deinococcus_radiodurans_R1 Tyr GTA -GGATGGGCGGCGACGCG-GGAGAGTCGCACCCGGCTGTAAACCGGACGCT------CAA------GCTGAGTCAGTTCGAATCTGACCCCATCCACCA
D00011589 Deinococcus_radiodurans_R1 Tyr GTA -GGGTAGGTGGCCGAGT--GGTTAAAGGCGACAGACTGTAAATCTGTTCACG-----TAAG----TGTA-CGGCGGTTCGAATCCGCCCCTGCCCACCA
D00011773 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Tyr GTA -GGTGGGGTTCCCGAGT--GGCCAAAGGGAACAGACTGTAAATCTGTCGTCG-----TAA-----GACTTCGGTGGTTCAAATCCACCCCCCACCACCA
D00011726 Enterococcus_faecalis_V583 Tyr GTA -GGAGGAATAGCGAAGT--GGCTAAACGCGACGGACTGTAAATCCGTTCCT------TAG------GGTTCAGTGGTTCGAATCCACTTTCCTCCA---
D00003526 Escherichia_coli Tyr GTA -GGTGGGGTTCCCGAGC--GGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTC------ACAG-----ACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCA
D00003527 Escherichia_coli Tyr GTA -GGTGGGGTTCCCGAGC--GGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTC------ATCG-----ACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCA
D00011738 Escherichia_coli_CFT073 Tyr GTA -GGTGGGGTTCCCGAGC--GGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTC------ATCG-----ACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCA
D00011739 Escherichia_coli_CFT073 Tyr GTA -GGTGGGGTTCCCGAGC--GGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTC------ACAG-----ACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCA
D00011740 Escherichia_coli_CFT073 Tyr GTA -GCTGATATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAG-------------------GTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCA
D00011576 Escherichia_coli_K12 Tyr GTA -GGTGGGGTTCCCGAGC--GGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTC------ATCG-----ACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCA
D00011577 Escherichia_coli_K12 Tyr GTA -GGTGGGGTTCCCGAGC--GGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTC------ACAG-----ACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCA
D00011578 Escherichia_coli_O157:H7 Tyr GTA -GGTGGGGTTCCCGAGC--GGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTC------ATCG-----ACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCA
D00011579 Escherichia_coli_O157:H7 Tyr GTA -GGTGGGGTTCCCGAGC--GGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTC------ACAG-----ACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCA
D00011580 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Tyr GTA -GGTGGGGTTCCCGAGC--GGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTC------ATCG-----ACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCA
D00011581 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Tyr GTA -GGTGGGGTTCCCGAGC--GGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTC------ACAG-----ACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCA
D00011692 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Tyr GTA -GGTTGGGTTCCCGAGC--GGTCAAAGGGATCAGACTGTAAATCTGACGGC------TCAG-----CCTTCGAAGGTTCGAATCCTTCCCCAACCACCA
D00011760 Geobacter_sulfurreducens_PCA Tyr GTA -GGAGGGATTCCCGAGC--GGCCAAAGGGAACAGACTGTAAATCTGTCGTCG-----AAC-----GACTTCGGAGGTTCGAATCCTCCTCCCTCCACCA
D00003531 Haemophilus_influenzae Tyr GTA -TGAGGGGTTCCCGAGC--GGCCAAAGGGGGCAGACTGTAAATCTGTTGGC------TCAG-----CCTTCGAAGGTTCGAATCCTTCTCCCTCCACCA
D00011584 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Tyr GTA -GGAGGGGTTCCCGAGC--GGCCAAAGGGGGCAGACTGTAAATCTGTTGGC------TCAG-----CCTTCGAAGGTTCGAATCCTTCTCCCTCCACCA
D00003521 Helicobacter_pylori Tyr GTA -GGTGAGATACTCAAGT--GGCCAACGAGGGCAGACTGTAAATCTGCTG--------TC---------TTCCGTGGTTCGAATCCACGTCTCACCA---
D00011582 Helicobacter_pylori_26695 Tyr GTA -GGGTAGGTACTCAAGT--GGCCAACGAGGGCAGACTGTAAATCTGCTGACT-----ATG-----TCTT-CGAAGGTTCGAATCCTTCCCTGCCCACC-
D00011583 Helicobacter_pylori_J99 Tyr GTA -GGTGAGATACTCAAGT--GGCCAACGAGGGCAGACTGTAAATCTGCTGACT-----ATG-----TCTT-CCGTGGTTCGAATCCACGTCTCACCACCA
D00011761 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Tyr GTA -GGCAAAGTGGTCCAGT--AGCA-ACGACAGCGGACTGTAAATCCGCCACCG-----AAA-----GGTTACGTAGGTGCGAGTCCTACCTTTGCCA---
D00011762 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Tyr GTA -GGAGGCCTAGCGAAGT--GGCTAAACGCGGCGGTCTGTAAAACCGCTCTCT-----CTG-----AGTT-CGGTGGTTCGAATCCACTGGCCTCCA---
D00011727 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGTCTGGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGTGGTTCGAATCCACTCCCCTCCA---
D00011763 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Tyr GTA -GGCGAGTTACCCAAGC--GGCCAAAGGGATCTGACTGTAAATCAGCTGTCT-----ACG-----ACTT-CGGGGGTTCGAATCCCTCACTCGCCA---
D00011713 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Tyr GTA -GGGTAGGTACTCAAGT--GGCCAACGAGGGCAGACTGTAAATCTGCTGACT-----ATG-----TCTT-CGAAGGTTCGAATCCTTCCCTGCCCACCA
D00011601 Listeria_innocua_Clip11262 Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGTGGTTCGAATCCACTCCCCTCCACCA
D00011602 Listeria_monocytogenes_EGD-e Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGTGGTTCGAATCCACTCCCCTCCACCA
D00011774 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGTGGTTCGAATCCACTCCCCTCCACCA
D00011775 Mesoplasma_florum_L1 Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGC--GGTCAAACGCGGGTGGCTGTAACCCACTTCCT------TTC------GGTTCGGGGGTTCGAATCCCTCCCCCTCCACCA
D00011612 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Tyr GTA -GGAGAGGTGCCCGAGT--GGTTAAAGGGGACGGACTGTAAATCCGTTGGC------TTAG-----CCTACGTTGGTTCGAATCCAACCCTCTCCACCA
D00011733 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Tyr GTA -GGCAGGTTGCCCGAGC--GGCCAATGGGAGCGGACTGTAAATCCGTCGCG------AAAG-----CTA-CGCAGGTTCGAATCCTGCACCTGCCACCA
D00011573 Mycobacterium_leprae_TN Tyr GTA -GGCAGGTTGCCCGAGC--GGCCAATGGGAGCGGACTGTAAATCCGTCGCG------AAAG-----CTA-CACAGGTTCGAATCCTGTACCTGCCACCA
D00011567 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Tyr GTA -GGCAGGTTGCCCGAGC--GGCCAATGGGAGCGGACTGTAAATCCGTCGCG------AAAG-----CTA-CGCAGGTTCGAATCCTGCACCTGCCACCA
D00011753 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Tyr GTA -GGCAGGTTGCCCGAGC--GGCCAATGGGAGCGGACTGTAAATCCGTCGCG------AAAG-----CTA-CGCAGGTTCGAATCCTGCACCTGCCACCA
D00003514 Mycoplasma_capricolum Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCGGGTGGCTGTAACCCACTTCCT------TAC------GGTTCGGGGGTTCGAATCCCTCCCCCTCCACCA
D00011732 Mycoplasma_gallisepticum_R Tyr GTA -GGGTAGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCTTCTGACTGTAAATCAGACACCT-----TTT-----GGTTTCGGCGGTTCGAATCCGTCCCTGCCCACCA
D00003515 Mycoplasma_genitalium Tyr GTA -GGACAGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCTTCTGACTGTAGATCAGACACCT-----TAT-----GGTTTCGGGAGTTCGAATCTCTCCCTGTCCACCA
D00011590 Mycoplasma_genitalium_G37 Tyr GTA -GGACAGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCTTCTGACTGTAGATCAGACACCT-----TTAT----GGTTTCGGGAGTTCGAATCTCTCCCTGTCCACCA
D00003516 Mycoplasma_pneumoniae Tyr GTA -GGACAGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCTTCTGACTGTAGATCAGACACCT-----TCAT----GGTTTCGGGAGTTCGAATCTCTCCCTGTCCACCA
D00011591 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Tyr GTA -GGACAGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCTTCTGACTGTAGATCAGACACCT-----TCAT----GGTTTCGGGAGTTCGAATCTCTCCCTGTCCACCA
D00011619 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Tyr GTA -GGGGGGGTAGCGAAGC--GGCCAAACGCGGGTGGCTGTAACCCACTTTCT------TCG------GATTCGGGGGTTCGAATCCCTCCCCCCCCACCA
D00011568 Neisseria_meningitidis_MC58 Tyr GTA -GGAGGGATTCCCGAGC--GGTCAAAGGGGGCAGACTGTAAATCTGTTGCG------AAAG-----CTT-CGAAGGTTCGAATCCTTCTCCCTCCACCA
D00011569 Neisseria_meningitidis_Z2491 Tyr GTA -GGAGGGGTTCCCGAGC--GGTCAAAGGGGGCAGACTGTAAATCTGTTGCG------AAAG-----CTT-CGAAGGTTCGAATCCTTCTCCCTCCACCA
D00011744 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Tyr GTA -GGAGGGGTTCCCGAGC--GGTCAAAGGGATCAGACTGTAAATCTGACGGC------TCTG-----CCTTCGAAGGTTCGAATCCTTCCCCCTCCACCA
D00011617 Nostoc_sp._PCC_7120 Tyr GTA -GGGTCGGTATCCAAGTCCGGTTGAAGGAAGCCGTCTGTAAAACGGATGCCT-----CTG-----TGCTTCGTAGGTTCAAATCCTACTCGGCCCA---
D00011618 Nostoc_sp._PCC_7120 Tyr GTA -GGGTCGGTGTCCGAGT--GGTTAATGGAGACGGACTGTAAATCCGTTGGTT-----TAC-----ACCTACGCTGGTTCAAATCCAGCCCGGCCCA---
D00011714 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCC------TCG------GGTTCGGCAGTTCGAATCTGCCCCCCTCCACCA
D00011715 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGCAGTTCGAATCTGCCCCCCTCCACCA
D00011752 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M Tyr GTA -GGAGGGATAGCGAAGT--GGCTAAACGCAGCAGTCTGTAAAACTGTTCCG------TAA------GGTACGGTGGTTCGAATCCACCTCCCTTCACCA
D00011592 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Tyr GTA -GGAGGGATTCCCGAGC--GGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGGC------TCAG-----CCTTCGAAGGTTCGAATCCTTCTCCCTCCACCA
D00011755 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Tyr GTA -GGTGGGGTTCCCGAGC--GGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTC------ACAG-----ACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCA
D00011764 Porphyromonas_gingivalis_W83 Tyr GTA -GGGCAGTTACCAGAGT--GGCCAAATGGGGCTGACTGTAACTCAGCTGGCT-----TAC-----GCCTTCGGTGGTTCGAATCCATCACTGCCCA---
D00011765 Porphyromonas_gingivalis_W83 Tyr GTA -GGGCAGTTACCAGAGT--GGCCAAATGGGGCTGACTGTAACTCAGCTGGCT-----TAC-----GCCTTCGGTGGTTCGAATCCATCACTGCCCA---
D00011776 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Tyr GTA -GGCAGGTTGCCCGAGT--GGCCAAAGGGAGCGGTCTGTAAAACCGTCGGT------TTCG-----CCTACGTTGGTTCGAATCCAACACCTGCCA---
D00003528 Pseudomonas_aeruginosa Tyr GTA -GGAGGGATCCCTTAGT--GGCC-AAAGGATCAGACTGTAAATCTGACGTC------ATAG-----ACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCTCCCTCCACCA
D00011594 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Tyr GTA -GGAGGGATTCCCGAGT--GGCCAAAGGGATCAGACTGTAAATCTGACGTC------ATAG-----ACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCTCCCTCCACCA
D00011747 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Tyr GTA -GGAGGGGTTCCCGAGC--GGCCAAAGGGATCAGACTGTAAATCTGACGTCT-----ACG-----ACTT-CGAAGGTTCGAATCCTTCCCCCTCCACCA
D00011616 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Tyr GTA -GGAGAGGTGCCCGAGT--GGCTAAAGGGGGCAGACTGTAAATCTGTTGGCT-----TAC-----GCCTACGTTGGTTCGAATCCAACCCTCTCCACCA
D00011743 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Tyr GTA -GGGGGTTTGCCCGAGT--GGTTAAAGGGGGCGGACTGTAAATCCGCTGGC------TATG-----CCTACACAGGTTCGAATCCTGTAGCCCCCA---
D00011756 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Tyr GTA -GGGGGAGTGTCCCGAGT-GGCA-AAGGGAGCTGACTGTAAATCAGCCGCCT-----CAT-----GGCTTCGCAGGTTCGAGTCCTGCCTCCCCCACCA
D00011610 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Tyr GTA -GGAGGGGTGGCCGAGT--GGTCAATGGCAGCAGACTGTAAATCTGCCCGCG-----TAAG----CGTT-CGAAGGTTCAAATCCTTCTCCCTCCACCA
D00003530 Rickettsia_prowazekii Tyr GTA -GGAGGGGTGGCCGAGT--GGTCAATGGCAGCAGACTGTAAATCTGCCCGGC-----GTAA----GTTT-CGAAGGTTCGAATCCTTCTCCCTCCACCA
D00011695 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Tyr GTA -GGAGGGGTGGCCGAGT--GGTCAATGGCAGCAGACTGTAAATCTGCCCGCG-----TAAG----CGTT-CGAAGGTTCGAATCCTTCTCCCTCCACCA
D00011766 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Tyr GTA -GGAGGGGTGGCCGAGT--GGTCAATGGCAGCAGACTGTAAATCTGCCCGCG-----TAAG----CGTT-CGAAGGTTCGAATCCTTCTCCCTCCACCA
D00011621 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Tyr GTA -GGTGGGGTTCCCGAGC--GGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTC------ACAG-----ACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCA
D00011742 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Tyr GTA -GGTGGGGTTCCCGAGC--GGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTC------ACAG-----ACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCA
D00011614 Salmonella_typhimurium_LT2 Tyr GTA -GGTGGGGTTCCCGAGC--GGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTC------ATCG-----ACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCA
D00011615 Salmonella_typhimurium_LT2 Tyr GTA -GGTGGGGTTCCCGAGC--GGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTC------ACAG-----ACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCA
D00011717 Shewanella_oneidensis_MR-1 Tyr GTA -GGAGGGGTTCCCGAGT--GGCCAAAGGGATCAGACTGTAAATCTGACGGC------TCCG-----CCTTCGAAGGTTCGAATCCTTCTCCCTCCACCA
D00011718 Shigella_flexneri_2a_str._301 Tyr GTA -GGTGGGGTTCCCGAGC--GGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTC------ATCG-----ACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCA
D00011719 Shigella_flexneri_2a_str._301 Tyr GTA -GGTGGGGTTCCCGAGC--GGCCAAAGGGAGCTTACTGTAAATCTGTCGTC------ACAG-----ACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCA
D00011622 Sinorhizobium_meliloti_1021 Tyr GTA -GGAGGGATGCCCGAGT--GGTTAAAGGGGACGGACTGTAAATCCGTTGGC------TCAG-----CCTACGTTGGTTCAAATCCAACTCCCTCCACCA
D00003520 Staphylococcus_aureus Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCGG-----GGTTCGGCAGTTCGAATCTGCCCCCCTCCA---
D00011757 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGCAGTTCGAATCTGCCCCCCTCCA---
D00011758 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGCAGTTCGAATCTGCCCCCCTCCACCA
D00011697 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGCAGTTCGAATCTGCCCCCCTCCA---
D00011698 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGCAGTTCGAATCTGCCCCCCTCCACCA
D00011571 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGCAGTTCGAATCTGCCCCCCTCCA---
D00011572 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGCAGTTCGAATCTGCCCCCCTCCACCA
D00011728 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Tyr GTA -GGAGGGGTAGCGAAGT--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGCAGTTCGAATCTGCCCCCCTCCACCA
D00003525 Stigmatella_aurantiaca Tyr GTA -GGAGGGATACCCAAGC--GGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGGCT-----CTAC----GCCTTCGATGGTTCGAATCCATCTCCCTCCA---
D00011720 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Tyr GTA -GGAGAGATAGCGAAGA--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCA---
D00011721 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Tyr GTA -GGAAAGATAGCGAAGA--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGGGGTTCGAATCCCTCTCTTTCCA---
D00011699 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Tyr GTA -GGAGAGATAGCGAAGA--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCA---
D00011700 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Tyr GTA -GGAAAGATAGCGAAGA--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGGGGTTCGAATCCCTCTCTTTCCA---
D00011722 Streptococcus_mutans_UA159 Tyr GTA -GGAAGGGTAGCGAAGA--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGGGGTTCGAATCCCTCCCCTTCCA---
D00011606 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Tyr GTA -GGAGAGATAGCGAAGA--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCA---
D00011607 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Tyr GTA -GGAAGGGTAGCGAAGA--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGGGGTTCGAATCCCTCCCCTTCCA---
D00011605 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Tyr GTA -GGAAAGATAGCGAAGA--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGGGGTTCGAATCCCTCTCTTTCCA---
D00011701 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Tyr GTA -GGAAAGATAGCGAAGA--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGGGGTTCGAATCCCTCTCTTTCCA---
D00011734 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Tyr GTA -GGAAAGATAGCGAAGA--GGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCT------TCG------GGTTCGGGGGTTCGAATCCCTCTCTTTCCA---
D00011741 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Tyr GTA -GGCGGTGTGCCCGAGC--GGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGGC------TCAG-----CCTTCCCAGGTTCGAATCCTGGCGCCGCCA---
D00011716 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Tyr GTA -GGCGGTGTGCCCGAGC--GGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGGC------TCAG-----CCTTCCCAGGTTCGAATCCTGGCGCCGCCA---
D00003519 Streptomyces_lividans Tyr GTA -GGCGGTGTGCCCGAGC--GGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGGC------TCAG-----CCTTCCCAGGTTCGAATCCTGGCGCCGCCA---
D00011767 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Tyr GTA -GGGGAGATACCCAAGT--GGTCAAAGGGGGCTGACTGTAAATCAGTTGCGT-----AAC-----GCTT-CGGAGGTTCGAATCCTCCTCTCCCCACCA
D00011768 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Tyr GTA -GGGGAGATACCCAAGT--GGCCAAAGGGGGCTGACTGTAAATCAGTTGCGC-----AAC-----GCTT-CGGTGGTTCGAATCCACCTCTCCCCACCA
D00003532 Synechocystis_sp. Tyr GTA -GGGTCGATGCCCGAGT--GGTTAATGGGGGCGGACTGTAAATCCGCTGGC------TATG-----CCTACGCTGGTTCAAATCCAGCTCGGCCCA---
D00011595 Synechocystis_sp._PCC_6803 Tyr GTA -GGGTCGATGCCCGAGT--GGTTAATGGGGGCGGACTGTAAATCCGCTGGC------TATG-----CCTACGCTGGTTCAAATCCAGCTCGGCCCA---
D00011704 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Tyr GTA -GGAGGGATACCCAAGC--GGCCAAAGGGGGCAGACTGTAAATCTGCTGGCG-----TATG----CCTT-CGATGGTTCAAATCCATCTCCCTCCACCA
D00011702 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Tyr GTA -GGGTCGGTGCCCGAGT--GGTTAATGGGGGCGGACTGTAAATCCGTTGGC------TACG-----CCTACGCTGGTTCGAATCCAGCCCGGCCCA---
D00003513 Thermotoga_maritima Tyr GTA -GGTGGGGTGCCCGAGT--GGCCAAAGGGGGCGGATTGTAAATCCGCAGA-------ATC-------TT-CGGAGGTTCAAATCCTCCCCCCACCACCA
D00011596 Thermotoga_maritima_MSB8 Tyr GTA -GGTGGGGTGCCCGAGT--GGCCAAAGGGGGCGGACTGTAAATCCGCTGGCA-----GAAT----GCCTTCGGAGGTTCAAATCCTCCCCCCACCACCA
D00003524 Thermus_thermophilus Tyr GTA -GGGCAGGTGCCCGAGC--GGCCAAAGGGGACGGTCTGTAAAACCGTTGGCG-----TATG----CCTT-CGCTGGTTCGAATCCAGCCCTGCCCACCA
D00011777 Thermus_thermophilus_HB27 Tyr GTA --GGCAGGTGCCCGAGC--GGCCAAAGGGGACGGTCTGTAAAACCGTTGGCG-----TATG----CCTT-CGCTGGTTCGAATCCAGCCCTGCCCACCA
D00011778 Treponema_denticola_ATCC_35405 Tyr GTA -GGGGAGTTTCCCGAGC--GGTCAAAGGGGGCAGACTGTAAATCTGTTGGC------TATG-----CCTTCCAAGGTCCGAATCCTTGACTCCCCA---
D00003517 Treponema_pallidum Tyr GTA -GGGGAGTTTCCCGAGT--GGTCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGTTGGCG-----TTG-----TCTT-CCAAGGTTCGAATCCTTGACTCCCCA---
D00011593 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Tyr GTA -GGGGAGTTTCCCGAGT--GGTCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGTTGGCG-----TTG-----TCTT-CCAAGGTTCGAATCCTTGACTCCCCA---
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D00011771 Candida_glabrata_CBS_138 Tyr GTA -CTCTCGGTAGCCAAGTT-GGTTTAAGGCGCAAGACTGTAAATCTTGAG-------------------ATCGGGCGTTCGAATCGCCCCCGGGAGA---
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D00011688 Schizosaccharomyces_pombe Tyr GTA -CTCCTGATGGTGTAGTT-GGTT-ATCACACCCGGCTGTAAACCGGTTG-------------------GTCGCTAGTTCGATTCTGGCTCAGGAG----
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D00003652 Tetrahymena_thermophila Tyr GTA -CCGAACTTAGCTCAGTT-GGA--AGAGCATCGGACTGTAAATCCGGTG-------------------GTCCCCGGTTCGAACCCGGGAGTTCGGACCA
D00003663 Triticum_aestivum Tyr GTA -CCGACCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGGAGGACTGTAGATCCTTAG-------------------GTCACTGGTTCGAATCCGGTAGGTCGGA---
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D00011799 Pan_troglodytes Tyr ATA -CCTTCAATAGTTCAGCT-GGT--AGAGCAGAGGACTATAGGTCCTTAG-------------------GTCGCTGGTTCGATTCCAGCTTGAAGGA---
D00005271 Aeropyrum_pernix_K1 Gly CCC -GCGGCCGTCGTCTAGCCTGGACTAGGACGCCGGCCTCCCAAGCCGGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCGCACC-
D00000804 Archaeoglobus_fulgidus Gly CCC -GCGGTCGTAGTCTAGC--GGC--AGGACACGGGCCTCCCGAGCCCGTT-------------------G-CCCGGGTTCGAATCCCGGCGGCCGCA---
D00005274 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Gly CCC -GCGGTCGTAGTCTAGC--GGC--AGGACACGGGCCTCCCGAGCCCGTT-------------------G-CCCGGGTTCGAATCCCGGCGGCCGCA---
D00005277 Halobacterium_sp._NRC-1 Gly CCC -GCGCTGGTGGTCTAGT--GGT--AGGACATGAGCTTCCCAAGCTCATA-------------------G-CCCGGGTTCAATTCCCGGCCAGCGCA---
D00011880 Methanosarcina_acetivorans_C2A Gly CCC -GCGACTGTGGTTTAGT--GGCT-ATGACCTGAGCTTCCCAAGCTTAGA-------------------A-CCCGGGTTCGAATCCCGGCAGTCGCA---
D00005363 Methanosarcina_mazei_Go1 Gly CCC -GCGACTGTGGTTTAGT--GGCT-ATGACCTGAGCTTCCCAAGCTTAGA-------------------A-CCCGGGTTCGAATCCCGGCAGTCGCA---
D00011970 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Gly CCC -GCGGTAATAGTCTAGC--GGC--AGGACAGGGGCTTCCCAAGCCCTTA-------------------G-CCCGGGTTCGATCCCCGGTTACCGCA---
D00011996 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Gly CCC -GCGCCCGTAGTCTAGG--GGT--AGGATGCGGGCCCCCCAAGCCCGTG-------------------A-CCCGGGTTCGAATCCCGGCGGGCGCA---
D00005286 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Gly CCC -GCGGCGGTAGTCTAGCCTGGTTTAGGATGGCGGCCTCCCAAGCCGTTG-------------------ATCCCGGGTTCGAATCCCGGCCGCCGCA---
D00005289 Pyrococcus_abyssi_GE5 Gly CCC -GCGGTGGTAGTCTAGCCTGGTCTAGGACGCCGGCCTCCCAAGCCGGCG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCACCGCACC-
D00005292 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Gly CCC -GCGGTGGTAGTCTAGCCTGGTCTAGGACGCCGGCCTCCCAAGCCGGCG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCACCGCACC-
D00005295 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Gly CCC -GCGGTGGTAGTCTAGCCTGGTCTAGGACGCCGGCCTCCCAAGCCGGCG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCACCGCACCA
D00012035 Staphylothermus_marinus_F1 Gly CCC -GGGCCCGTAGCTCAGCCAGGT--AGAGCGGCGGACACCCCACCCGTAG-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCCCCGGGCCCACCA
D00012045 Staphylothermus_marinus_F1 Gly CCC -GCGGCGGTCGTCTAGCCTGGACTAGGACGCCGGCCCCCCAAGCCGGAG-------------------ATCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGCCGCACCA
D00012092 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Gly CCC -GCGGCCGTCGTCTAGTCTGGATTAGGACGCTGGCCTCCCAAGCCAGCA-------------------ATCCCGGGTTCGAATCCCGGCGGCCGCA---
D00000807 Sulfolobus_solfataricus Gly CCC -GCGGCCGTCGTCTAGTCTGGATTAGGACGCTGGCCTCCCAAGCCAGCA-------------------ATCCCGGGTTCGAATCCCGGCGGCCGCA---
D00005298 Sulfolobus_solfataricus_P2 Gly CCC -GCGGCCGTAGTCTAGGCTGGATTAGGACGCCGGCCTCCCAAGCCGGTG-------------------ATCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCGC----
D00005386 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Gly CCC -GCGGCCGTCGTCTAGTCTGGATTAGGACGCCGGCCTCCCAAGCCGGTA-------------------ATCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCGCA---
D00000808 Thermofilum_pendens Gly CCC -GCGGCCGTAGTCTAGCCTGGT--AGGATGGCGGCCTCCCAAGCCGCAG-------------------AACCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCGCACCA
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D00005304 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Gly CCC -GCGGAAGTAGTGTAGTCTGGC--ATCACAGGAGCTTCCCAAGCTCCTA-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCTTCCGCA---
D00005261 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Gly CCC -GCGGGTGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCAGCAGCTTCCCAAGCTGAAT-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCACCCGCTCCA
D00005216 Aquifex_aeolicus_VF5 Gly CCC -GCGGGCGTAGCTCAGA--GGT--AGAGCACCTGCTTCCCAAGCAGGAG-------------------GTCGCCGGTTCGAGTCCCGTCGCCCGCTCCA
D00005499 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Gly CCC -GCGGTAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATTAGCTTCCCAAGCTGGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTACCGCT---
D00005410 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Gly CCC -GCGGACATAGTTCATC--GGT--AGAATGAAAGCTTCCCAAGCTTTAG-------------------A-GGCGGGTTCGACTCCCGTTGTCCGCTCCA
D00005441 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Gly CCC -GCGGGCGTAGTTCAAT--GGT--AGAACGGCAGCTTCCCAAGCTGCAT-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCGCCCGCTCCA
D00005242 Brucella_melitensis_16M Gly CCC -GCGGGTATGATGTAAT--GGT--AGCCTGTCAGCTTCCCAAGCTGAAC-------------------G-CGCGGGTTCGATTCCCGCTACCCGCTCCA
D00005189 Caulobacter_crescentus_CB15 Gly CCC -GCGGGCGTAGTTCAGA--GGT--AGAACGTCAGCTTCCCAAGCTGAAT-------------------GTCGGGGGTTCGATTCCCCCCGCCCGCTCCA
D00005359 Chlorobium_tepidum_TLS Gly CCC -GCGGGTGTAACTCAGTT-GGT--AGAGTGTTTGCTTCCCAAGCAAAAT-------------------GTCGCGAGTTCGAATCTCGTCACCCGCT---
D00005238 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Gly CCC -GCGGGAATAGCTCAGT--GGT--AGAGCACTAGCTTCCCAAGCTGGGT-------------------GCCGCGGGTTCGATACCCGTTTCCCGCTCCA
D00005514 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Gly CCC -GCCGATGTAGTTCAAT--GGT--AGAACATCAGCTTCCCAAGCTGAAT-------------------A-CGCGGGTTCGATTCCCGTCATCGGCTCCA
D00005415 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Gly CCC -GCCGGTGTAGTTCAAT--GGT--AGAACCCCTGCTTCCCAAGCAGGCG-------------------G-CGCGGGTTCGATTCCCGTCACCGGCTCCA
D00005374 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Gly CCC TGCCGGTGTAGTTCAAT--GGT--AGAACTCCTGCTTCCCAAGCAGGCG-------------------G-CGCGGGTTCGATTCCCGTCACCGGCTCCA
D00005472 Coxiella_burnetii_RSA_493 Gly CCC -GCGGGTGTAGTTCAAT--GGT--AGAACATAAGCTTCCCAAGCTTAGA-------------------A-CGTGGGTTCGATTCCCATCACCCGCT---
D00005192 Deinococcus_radiodurans_R1 Gly CCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGTCAGCTTCCCAAGCTGAAT-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCT---
D00005573 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Gly CCC -GCGGGAATAACTCAGC--GGT--AGAGTGTCAGCTTCCCAAGCTGAAG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGTTTCCCGCTCCA
D00000839 Escherichia_coli Gly CCC -GCGGGCGTAGTTCAAT--GGT--AGAACGAGAGCTTCCCAAGCTCTAT-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCGCCCGCTCCA
D00005481 Escherichia_coli_CFT073 Gly CCC -GCGGGCGTAGTTCAAT--GGT--AGAACGAGAGCTTCCCAAGCTCTAT-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCGCCCGCTCCA
D00005169 Escherichia_coli_K12 Gly CCC -GCGGGCGTAGTTCAAT--GGT--AGAACGAGAGCTTCCCAAGCTCTAT-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCGCCCGCTCCA
D00005172 Escherichia_coli_O157:H7 Gly CCC -GCGGGCGTAGTTCAAT--GGT--AGAACGAGAGCTTCCCAAGCTCTAT-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCGCCCGCTCCA
D00005175 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Gly CCC -GCGGGCGTAGTTCAAT--GGT--AGAACGAGAGCTTCCCAAGCTCTAT-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCGCCCGCTCCA
D00005540 Geobacter_sulfurreducens_PCA Gly CCC -GCGGGAATAACTCAGT--GGT--AGAGTGTCAGCTTCCCAAGCTGAAG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTTTCCCGCTCCA
D00005542 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Gly CCC -GCGGGTATAGTTTAAT--GGT--AAAATGTCAGCTTCCCAAGCTGAAG-------------------A-TGCGGGTTCGATTCACGCTATCCGCT---
D00005449 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Gly CCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAATTCAAGCTTCCCAAGCTTGCG-------------------T-CGCGGGTCCGATTCCCGTCACCCGCT---
D00005548 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Gly CCC -GCGAGTGTAGTTCAAT--GGT--AGAACTTCAGCTTCCCAAGCTGATA-------------------G-CGCGGGTTCGATTCCCGTCACTCGCTCCA
D00005246 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Gly CCC -GCGGGTATGATGTAAT--GGT--AGCCTGTCAGCTTCCCAAGCTGAAC-------------------G-CGCGGGTTCGATTCCCGCTACCCGCTCCA
D00005466 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Gly CCC -GCCGATGTAGTTCAAT--GGC--AGAACATCAGCTTCCCAAGCTGAAT-------------------A-CGCGGGTTCGATTCCCGTCATCGGCT---
D00005162 Mycobacterium_leprae_TN Gly CCC -GCCGATGTAGTTCAAT--GGC--AGAACATCAGCTTCCCAAGCTGAAT-------------------A-CGCGGGTTCGATTCCCGTCATCGGCTCCA
D00005149 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Gly CCC -GCCGATGTAGTTCAAT--GGC--AGAACATCAGCTTCCCAAGCTGAAT-------------------A-CGCGGGTTCGATTCCCGTCATCGGCT---
D00005517 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Gly CCC -GCCGATGTAGTTCAAT--GGC--AGAACATCAGCTTCCCAAGCTGAAT-------------------A-CGCGGGTTCGATTCCCGTCATCGGCT---
D00005495 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Gly CCC -GCGGGTGTAGTTCAAT--GGC--AGAACGGTAGCTTCCCAAGCTGCAT-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCACCCGCTCCA
D00005257 Nostoc_sp._PCC_7120 Gly CCC -GCGGGCGTAATTCAGT--GGT--AGAATGTCACCTTCCCAAGGTGAAC-------------------GTCGTGGGTTCGAGTCCCATCGCCCGCT---
D00005523 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Gly CCC -GCGAGCGTAGTTCAAT--GGC--AGAACGAGAGCTTCCCAAGCTCTAT-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCGCTCGCTCCA
D00005551 Porphyromonas_gingivalis_W83 Gly CCC -GCGGTAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCAGCTTCCCAAGCTGAGG-------------------GTCACGAGTTCGAGCCTCGCCTACCGCT---
D00005581 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Gly CCC -GCGGGCGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCGTCAGCTTCCCAAGCTGGAT-------------------A-CGCGGGTTCGATTCCCGTCGCCCGCTCCA
D00005203 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Gly CCC -GCGGGCGTCGTATAAT--GGC--ATTACCTGAGCTTCCCAAGCTCATG-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCGCCCGCTCCA
D00005503 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Gly CCC -GCGGGTATAGTTGAAT--GGT--ACAACTATTGCTTCCCAAGCAATCG-------------------G-TGAGGGTTCGATTCCCTCTACCCGCTCCA
D00005253 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Gly CCC -GCGGGCGTCGTATAAT--GGT--AATACCCTAGCTTCCCAAGCTAGAG-------------------C-CGTGGGTTCGATTCCCATCGCCCGCTCCA
D00005528 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Gly CCC -GCGGGCGTAGTTCAAT--GGT--AGAACGGCAGCTTCCCAAGCTGCAT-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCGCCCGCTCCA
D00005266 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Gly CCC -GCGGGCGTAGTTCAAT--GGT--AGAACGAGAGCTTCCCAAGCTCTAT-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCGCCCGCTCCA
D00005488 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Gly CCC -GCGGGCGTAGTTCAAT--GGT--AGAACGAGAGCTTCCCAAGCTCTAT-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCGCCCGCTCCA
D00005251 Salmonella_typhimurium_LT2 Gly CCC -GCGGGCGTAGTTCAAT--GGT--AGAACGAGAGCTTCCCAAGCTCTAT-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCGCCCGCTCCA
D00005427 Shigella_flexneri_2a_str._301 Gly CCC -GCGGGCGTAGTTCAAT--GGT--AGAACGAGAGCTTCCCAAGCTCTAT-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCGCCCGCTCCA
D00005268 Sinorhizobium_meliloti_1021 Gly CCC -GCGGGTGTAGTTCAGT--GGT--AGAACGCCAGCTTCCCAAGCTTGAT-------------------GTCGTCGGTTCGATCCCGATCACCCGCTCCA
D00005484 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Gly CCC -GCGGGTGTAGTTTAAT--GGT--AGAACATGAGCTTCCCAAGCTCAGA-------------------G-CGCGAGTTCGATTCTCGTCACCCGCTCCA
D00005420 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Gly CCC -GCGGGTGTAGTTTAAT--GGT--AGAACATCAGCTTCCCAAGCTGAGA-------------------G-CGCGAGTTCGATTCTCGTCACCCGCTCCA
D00005557 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Gly CCC -GCGGGTGTAGTTCAAT--GGT--AGAACGTCAGCTTCCCAAGCTGAAG-------------------A-CGTGGGTTCGATTCCCATCACCCGCTCCA
D00005558 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Gly CCC -GCGGGTGTAGTTCAAT--GGT--AGAACATCAGCTTCCCAAGCTGAGA-------------------A-CGTGGGTTCGATTCCCATCACCCGCTCCA
D00000849 Synechocystis_sp. Gly CCC -GCGGGTATAGTTTAGT--GGT--AAAACGAAAGCCTCCCATGCTTTAG-------------------T-TGGGGGTTCGATTCCCCCTACCCGCT---
D00005206 Synechocystis_sp._PCC_6803 Gly CCC -GCGGGTATAGTTTAGT--GGT--AAAACGAAAGCCTCCCATGCTTTAG-------------------T-TGGGGGTTCGATTCCCCCTACCCGCT---
D00005389 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Gly CCC -GCGGATGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCATCAGCTTCCCAAGCTGAGG-------------------GCCGCGGGTTCAAATCCCGTCATCCGCTCCA
D00005384 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Gly CCC -GCGGACGTAATTCAGT--GGT--AGAATGTCAGCTTCCCAAGCTGAAC-------------------GTCGTGGGTTCGAGTCCCATCGTCCGCT---
D00005209 Thermotoga_maritima_MSB8 Gly CCC -GCGGGTGTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCACCAGCTTCCCAAGCTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCGCCCGCTCCA
D00000835 Thermus_thermophilus Gly CCC -GCGGGAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCGGCTTCCCAAGCCGAGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCTCCCGCTCCA
D00005584 Thermus_thermophilus_HB27 Gly CCC --CGGGAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCGGCTTCCCAAGCCGAGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCTCCCGCTCCA
D00005457 Tropheryma_whipplei_str._Twist Gly CCC -GCGAGTGTAGTTCAAT--GGC--AGAACTTCAGCTTCCCAAGCTGACG-------------------G-CGCGGGTTCGATTCCCGTCACTCGCT---
D00005460 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Gly CCC -GCGAGTGTAGTTCAAT--GGC--AGAACTTCAGCTTCCCAAGCTGACG-------------------G-CGCGGGTTCGATTCCCGTCACTCGCT---
D00005397 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Gly CCC -GCGGGCGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCTGTAGCTTCCCAAGCTACTG-------------------A-CGTGGGTTCGATTCCCATCGCCCGCTCCA
D00005394 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Gly CCC -GCGGGCGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCTGTAGCTTCCCAAGCTACTG-------------------A-CGTGGGTTCGATTCCCATCGCCCGCTCCA
D00005212 Xylella_fastidiosa_9a5c Gly CCC -GCGGGCGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCTGTAGCTTCCCAAGCTACCG-------------------A-CGTGGGTTCGATTCCCATCGCCCGCTCCA
D00005462 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Gly CCC -GCGGGCGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCTGTAGCTTCCCAAGCTACCG-------------------A-CGTGGGTTCGATTCCCATCGCCCGCTCCA
D00005561 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Gly CCC -GCGGGTGTAGTTCAAT--GGT--AGAACGAGAGCTTCCCAAGCTCTAT-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCACCCGCTCCA
D00005248 Yersinia_pestis_CO92 Gly CCC -GCGGGTGTAGTTCAAT--GGT--AGAACGAGAGCTTCCCAAGCTCTAT-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCACCCGCTCCA
D00005403 Yersinia_pestis_KIM Gly CCC -GCGGGTGTAGTTCAAT--GGT--AGAACGAGAGCTTCCCAAGCTCTAT-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCACCCGCTCCA
D00005564 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Gly CCC -GCGGGTGTAGTTCAAT--GGT--AGAACGAGAGCTTCCCAAGCTCTAT-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCACCCGCTCCA
D00005323 Arabidopsis_thaliana Gly CCC -GCGCATCTGGTGTAGT--GGT--ATCATAGTACCCTCCCACGGTACTG-------------------A-CCAGGGTTCGATTCCCTGGATGCGC----
D00005332 Caenorhabditis_elegans Gly CCC -GCGGTGGTGGCCGAGC--GGTC-AAGGCGTAGGACTCCCGATCCTATTCTG-----GTAA----CAGAGCGCGGGTTCGAATCCCGTCCACCGC----
D00005567 Candida_glabrata_CBS_138 Gly CCC -GCGTAAGTAGTATAGT--GGTT-AGAATCTATCCTTCCCAAGGATGGG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGCTTTCGCA---
D00005400 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Gly CCC -GCATTGGTAGTATAGT--GGTT-ATTATGTGAGCTTCCCAAGCTCATG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGTCAATGCA---
D00005605 Gallus_gallus Gly CCC -GCGCCGCTGGTGTAGT--GGT--ATCATGCAAGATTCCCATTCTTGCG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGGCGGCGCA---
D00000971 Homo_sapiens Gly CCC -GCATTGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATTCTCGCCTCCCACGCGGGAG-------------------A-CCCGGGTTCAATTCCCGGCCAATGCA---
D00005307 Homo_sapiens Gly CCC -GCATTGGTGGTTCGGT--GGT--AGCATTCTCGCCTCCCAGGCCGGAG-------------------T-CCCGGGTTCAATTCCCGGCCAATGC----
D00005308 Homo_sapiens Gly CCC -GTGTTGGTGGTGCAGT--GGT--AGAATTCTCGCCTCCCACGTGGGAG-------------------A-CTCGGGTTCAATTCCCGGCCAATGC----
D00005309 Homo_sapiens Gly CCC -GCCTTGGTGGTGCAGT--GGT--AGAATTCTCGCCTCCCACGTGGGAG-------------------A-CCCGGGTTCAATTCCCGGCCAATGC----
D00005310 Homo_sapiens Gly CCC -GCGTTGGTGGTTTAGT--GGT--AGAATTCTCGCCTCCCATGCGGGAG-------------------A-CCCGGGTTCAATTCCCGGCCACTGC----
D00005311 Homo_sapiens Gly CCC -GCATTGGTGGTTCAAT--GGT--AGAATTCTCGCCTCCCACGCAGGAG-------------------A-CCCAGGTTCGATTCCTGGCCAATGC----
D00005312 Homo_sapiens Gly CCC -GCGCCGCTGGTGTAGT--GGT--ATCATGCAAGATTCCCATTCTTGCG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGGCGGCGC----
D00005313 Homo_sapiens Gly CCC -GCATTGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATTCTCGCCTCCCACGCGGGAG-------------------A-CCCGGGTTCAATTCCCGGCCAATGCA---
D00005629 Pan_troglodytes Gly CCC -GCAGTGGTGGTTCAGG--GGT--AGAATTATCGCCTCCCACGTGGGAG-------------------A-CCCGGGTTCAATTCCCGGCCAATGCA---
D00005630 Pan_troglodytes Gly CCC -GCATTGGTGGTTCAAT--GGT--AGAATTCTCGCCTCCCACGCAGGAG-------------------A-CCCAGGTTCGATTCCTGGCCAATGCA---
D00005631 Pan_troglodytes Gly CCC -GGATTGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATTCTCGCCTCCCACGCGGGAG-------------------A-CCCGGGTTCAATTCCCGGCCAATGCA---
D00005632 Pan_troglodytes Gly CCC -GCATTGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATTCTCGCCTCCCACGCGGGAG-------------------A-CCTGGGTTCAATTCCCGGCCAATGCA---
D00005633 Pan_troglodytes Gly CCC -GCGCCGCTGGTGTAGT--GGT--ATCATGCAAGATTCCCATTCTTGCG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGGCGGCGCA---
D00005634 Pan_troglodytes Gly CCC -GCATTGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATTTCCGCCTCCCACGCGGGAG-------------------A-CCCGGGTTCAATTCCCGGCCAATGCA---
D00005345 Saccharomyces_cerevisiae Gly CCC -GCGAAAGTGGTTCAGT--GGTT-AGAATTCATGCTTCCCAAGCATGGG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGCTTCCGC----
D00005346 Saccharomyces_cerevisiae Gly CCC -GCGCAAGTGGTTCAGT--GGTT-AGAATTTATGCTTCCCAAGCATGAG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGCTTGCGC----
D00000953 Schizosaccharomyces_pombe Gly CCC -GCATTAGTGGTGTAGC--GGT--AACATTGGAGCTTCCCATGCTCTAG-------------------C-TCCGGGTTCGACTCCCGGCTGATGCA---
D00005353 Schizosaccharomyces_pombe Gly CCC -GCATTAGTGGTGTAGC--GGT--AACATTGGAGCTTCCCATGCTCTAG-------------------C-TCCGGGTTCGACTCCCGGCTGATGCA---
D00005617 Takifugu_rubripes Gly CCC -GCTTTGGTGGTGTAGCT-GTG--ATCATAGCAGCTTCCCAGGCAGCTG-------------------A-TCTGGGTTCAAATCCTGGCCAATGCA---
D00005618 Takifugu_rubripes Gly CCC -GCGCCGCTGGTGTAGT--GGT--ATCATGCAAGATTCCCATTCTTGCG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGGCGGCGCA---
D00005619 Takifugu_rubripes Gly CCC -GCGCCGCTGGTGTAGT--GGT--ATCATGCAAGATTCCCATTCTTGTG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGGCGGCGCA---
D00005273 Aeropyrum_pernix_K1 Gly TCC -GCGGCCGTCGTCTAGCCTGGACTAGGACGCCGGCCTTCCAAGCCGGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCGCACC-
D00000803 Archaeoglobus_fulgidus Gly TCC -GCGCGGGTAGTCTAGC--GGT--AGGACAACGCCCTTCCGAGGCGTTA-------------------G-CCCGGGTTCGAATCCCGGCCCGCGCA---
D00005276 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Gly TCC -GCGCGGGTAGTCTAGC--GGT--AGGACAACGCCCTTCCGAGGCGTTA-------------------G-CCCGGGTTCGAATCCCGGCCCGCGCA---
D00005279 Halobacterium_sp._NRC-1 Gly TCC -GCGCCGGTAGTCTAGT--GGT--AGGACCTGAGCCTTCCAAGCTCATG-------------------G-CCCGGGTTCAAATCCCGGTCGGCGCA---
D00000805 Methanocaldococcus_jannaschii Gly TCC -GCGCCGGTGGTGTAGCCTGGT--ATCACTCTGGCCTTCCAAGCCAGCG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGCGCA---
D00005283 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Gly TCC -GCGCCGGTGGTGTAGCCTGGT--ATCACTCTGGCCTTCCAAGCCAGCG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGCGCACC-
D00011874 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Gly TCC -GCGCCAGTGGTGTAGTCTGGT--ATCACTTTGGCCTTCCAAGCCAATA-------------------A-GCTGGGTTCGAATCCCAGCTGGCGCA---
D00005285 Methanococcus_maripaludis Gly TCC -GCGCCAGTGGTGTAGCCTGGT--ATCACTTTGGCCTTCCAAGCCAGTA-------------------A-CTCGGGTTCAAATCCCGACTGGCGC----
D00005404 Methanopyrus_kandleri_AV19 Gly TCC -GCGGCCGCAGTCTAGTCTGGT--AGGACGCGGGCCTTCCGAGCCCGTG-------------------G-CCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCGCACCA
D00011906 Methanosarcina_acetivorans_C2A Gly TCC -GCGTTGATGGTCTAGC--GGCT-ATGACTTGGGCCTTCCAAGCCCAAA-------------------A-CCCGGGTTCGAATCCCGGTCGGCGCA---
D00005366 Methanosarcina_mazei_Go1 Gly TCC -GCGTTGATGGTCTAGC--GGCT-ATGACTTGGGCCTTCCAAGCCCAAA-------------------A-CCCGGGTTCGAATCCCGGTCGGCGCA---
D00011957 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Gly TCC -GCATCGATGGTCTAGA--GGT--ATGACTTTGGCCTTCCAAGCCAATA-------------------G-CTCGGGTTCGAATCCCGATCGGTGCA---
D00005281 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Gly TCC -GCGGTTGTAGTCTAGTCTGGTT-AGGACTCGGGCCTTCCAAGCCCGCG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCAACCGCA---
D00012009 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Gly TCC -GCGCCCGTAGTCTAGT--GGT--AGGATGCGGGCCTTCCAAGCCCGTG-------------------A-CCCGGGTTCGAATCCCGGCGGGCGCA---
D00005288 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Gly TCC -GCGGCGGTAGTCTAGCCTGGTTTAGGATGGCGGCCTTCCAAGCCGTTG-------------------ATCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGCCGCA---
D00005291 Pyrococcus_abyssi_GE5 Gly TCC -GCGGTGGTAGTCTAGCCTGGTCTAGGACGCCGGCCTTCCGAGCCGGCG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCACCGCACC-
D00005294 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Gly TCC -GCGGTGGTAGTCTAGCCTGGTCTAGGACGCCGGCCTTCCGAGCCGGCG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCACCGCACC-
D00005297 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Gly TCC -GCGGTGGTAGTCTAGCCTGGTCTAGGACGCCGGCCTTCCGAGCCGGCG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCACCGCACCA
D00012032 Staphylothermus_marinus_F1 Gly TCC -GCGGCGGTCGTCTAGCCTGGACTAGGACGCCGGCCCTCCAAGCCGGAG-------------------ATCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGCCGCA---
D00012075 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Gly TCC -GCGGCCGTCGTCTAGTCTGGATTAGGACGCTGGCCTTCCAAGCCAGCA-------------------ATCCCGGGTTCGAATCCCGGCGGCCGCA---
D00005300 Sulfolobus_solfataricus_P2 Gly TCC -GCGGCCGTAGTCTAGGCTGGATTAGGACGCCGGCCTTCCAAGCCGGTG-------------------ATCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCGC----
D00005388 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Gly TCC -GCGGCCGTCGTCTAGTCTGGATTAGGACGCTGGCCTTCCAAGCCAGTA-------------------ATCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCGCA---
D00005303 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Gly TCC -GCAGGTGTGGTGTAGCCTGGT--AGCACGAGAGCCTTCCAAGCTTTCG-------------------A-CTCGGGTCCAAATCCCGACACCTGCA---
D00005306 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Gly TCC -GCAGGTGTGGTGTAGCCTGGT--AGCACGAGAGCCTTCCAAGCTTTCG-------------------A-CTCGGGTCCAAATCCCGACACCTGCA---
D00005591 Acinetobacter_sp._ADP1 Gly TCC -GCGGGAGTAACTCAGTT-GGT--AGAGTGGCAGCCTTCCAAGCTGCAT-------------------GTCGCGAGTTCGATCCTCGTCTCCCGCTCCA
D00005262 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Gly TCC --CGGGTATAGCTCAAT--GGT--AGAGCAGCAGCCTTCCAAGCTGAAT-------------------A-CGCGGGTTCGATTCCCGCTACCCGCTCCA
D00005218 Aquifex_aeolicus_VF5 Gly TCC -GCGGGCGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAGCGGCCTTCCAAGCCGCAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCGCCCGCTCCA
D00005593 Bacillus_anthracis_str._A2012 Gly TCC -TCCGGAGTAGTTTAGT--GGT--AAAACAAGAGCCTTCCAAGCTCTGG-------------------T-CGAGAGTTCGATTCTCTTCACCCGCTCCA
D00005505 Bacillus_anthracis_str._Ames Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACAAGAGCCTTCCAAGCTCTGG-------------------T-CGAGAGTTCGATTCTCTTCACCCGCT---
D00005507 Bacillus_anthracis_str._Ames Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACAAGAGCCTTCCAAGCTCTGG-------------------T-CGAGAGTTCGATTCTCTTCACCCGCTCCA
D00005534 Bacillus_anthracis_str._Sterne Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACAAGAGCCTTCCAAGCTCTGG-------------------T-CGAGAGTTCGATTCTCTTCACCCGCT---
D00005536 Bacillus_anthracis_str._Sterne Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACAAGAGCCTTCCAAGCTCTGG-------------------T-CGAGAGTTCGATTCTCTTCACCCGCTCCA
D00005569 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACAAGAGCCTTCCAAGCTCTGG-------------------T-CGAGAGTTCGATTCTCTTCACCCGCT---
D00005571 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACAAGAGCCTTCCAAGCTCTGG-------------------T-CGAGAGTTCGATTCTCTTCACCCGCTCCA
D00005476 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACAAGAGCCTTCCAAGCTCTGG-------------------T-CGAGAGTTCGATTCTCTTCACCCGCT---
D00005477 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACAAGAGCCTTCCAAGCTCTGG-------------------T-CGAGAGTTCGATTCTCTTCACCCGCTCCA
D00005437 Bacillus_halodurans_C-125 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------T-CGTGGGTTCGATTCCCATCACCCGCT---
D00005438 Bacillus_halodurans_C-125 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------T-CGTGAGTTCGATTCTCATCACCCGCTCCA
D00005439 Bacillus_halodurans_C-125 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------T-CGTGGGTTCGATTCCCATCACCCGCTCCA
D00000830 Bacillus_subtilis Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------T-CGTGGGTTCGATTCCCATCACCCGCTCCA
D00000832 Bacillus_subtilis Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------T-CGTGAGTTCGATTCTCATCACCCGCTCCA
D00005145 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------T-CGTGAGTTCGATTCTCATCACCCGCTCCA
D00005146 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------T-CGTGGGTTCGATTCCCATCACCCGCTCCA
D00005596 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACAAGAGCCTTCCAAGCTCTGG-------------------T-CGAGAGTTCGATTCTCTTCACCCGCT---
D00005597 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACAAGAGCCTTCCAAGCTCTGG-------------------T-CGAGAGTTCGATTCTCTTCACCCGCTCCA
D00005500 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Gly TCC -GCGGAAGTAGCTCAGTT-GAT--AGAGCATTAGCCTTCCAAGCTGAGG-------------------GTCGCGGGTTTGAGCCCCGTCTTCCGCT---
D00005508 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Gly TCC -GCGGGTATAGCTCAAT--GGT--AGAGCAGCAGCCTTCCAAGCTGAAT-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGCTACCCGCTCCA
D00005602 Bartonella_quintana_str._Toulouse Gly TCC -GCGGGTATAGCTCAAT--GGT--AGAGCAGCAGCCTTCCAAGCTGAAT-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGCTACCCGCTCCA
D00005511 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Gly TCC -GCGGGAATAGCTCAATT-GGCT-AGAGTATCTGCCTTCCAAGCAGAGG-------------------GTTGCGGGTTCGAGACCCGTTTCCCGCTCCA
D00005406 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Gly TCC -GCGGATGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCCTCAGTCTTCCAAACTGATT-------------------A-CGCGGGTTCGATTCCCGTCATCCGCTCCA
D00000818 Borrelia_burgdorferi Gly TCC -GCGTCCTTCGTATAAT--GGCT-ATTACCTTAGCCTTCCAAGCTAATG-------------------A-TGTCGGTTCGATTCCGATAGGACGCT---
D00005186 Borrelia_burgdorferi_B31 Gly TCC -GCGTCCTTCGTATAAT--GGCT-ATTACCTTAGCCTTCCAAGCTAATG-------------------A-TGTCGGTTCGATTCCGATAGGACGCT---
D00005537 Borrelia_garinii_PBi Gly TCC -GCGTCCTTCGTATAAT--GGCT-ATTACCTTAGCCTTCCAAGCTAATG-------------------A-TGTCGGTTCGATTCCGATAGGACGCT---
D00005442 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Gly TCC -GCGGGTGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCAGCAGCCTTCCAAGCTGAAT-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCACCCGCTCCA
D00005241 Brucella_melitensis_16M Gly TCC -GCGGGTATAGCTCAAT--GGT--AGAGCAGCAGCCTTCCAAGCTGAAT-------------------A-CGCGGGTTCGATTCCCGCTACCCGCTCCA
D00005412 Brucella_suis_1330 Gly TCC -GCGGGTATAGCTCAAT--GGT--AGAGCAGCAGCCTTCCAAGCTGAAT-------------------A-CGCGGGTTCGATTCCCGCTACCCGCTCCA
D00005148 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Gly TCC -GCGGACATCGTATAAT--GGCT-ATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-CGCGGGTTCAATTCCCGCTGTCCGCT---
D00005478 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Gly TCC -GCGAACATCGTATAAT--GGAT-ATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-TGCGGGTTCAATTCCCGCTGTTCGCTCCA
D00005367 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Gly TCC -GCGGACATCGTATAAT--GGCT-ATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-TGCGGGTTCAATTCCCGCTGCCCGCT---
D00000841 Campylobacter_jejuni Gly TCC -GCGGGAGTAGCTCAGTT-GGCT-AGAGCATCAGCCTTCCAAGCTGAGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTTTCCCGCTCCA
D00005188 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Gly TCC -GCGGGAGTAGCTCAGTT-GGCT-AGAGCATCAGCCTTCCAAGCTGAGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTTTCCCGCTCCA
D00005604 Candidatus_Blochmannia_floridanus Gly TCC -GTGGGCATCGTATAAT--GGTT-ATTACCTCAACCTTCCAAGTTGATG-------------------A-TGTGGGTTCGATTCCCACTGTCCGCT---
D00005520 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Gly TCC -GCGCCTGTAGTTCAAT--GGT--AGAACAGTAGCCTTCCAAGCTACGA-------------------G-TGTCAGTTCGATTCTGATCAGGCGCT---
D00005191 Caulobacter_crescentus_CB15 Gly TCC -GCGGGTATAGCACAAT--GGT--AGTGCAGCAGCCTTCCAAGCTGAGG-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGCTACCCGCTCCA
D00005230 Chlamydia_muridarum_Nigg Gly TCC -GCGCCCGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCTGTAGCCTTCCAAGCTACCG-------------------G-TGTCAGTTCGATTCTGATCGGGCGCT---
D00005143 Chlamydia_trachomatis Gly TCC -GCGCCCGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCTGTAGCCTTCCAAGCTACCG-------------------G-TGTCAGTTCGATTCTGATCGGGCGC----
D00005141 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Gly TCC -GCGCCCGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCTGTAGCCTTCCAAGCTACCG-------------------G-TGTCAGTTCGATTCTGATCGGGCGCT---
D00005137 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Gly TCC -GCGCCCGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCTGTAGCCTTCCAAGCTACCG-------------------G-TGTCAGTTCGATTCTGATCGGGCGCT---
D00005139 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Gly TCC -GCGCCCGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCTGTAGCCTTCCAAGCTACCG-------------------G-TGTCAGTTCGATTCTGATCGGGCGCT---
D00005168 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Gly TCC -GCGCCCGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCTGTAGCCTTCCAAGCTACCG-------------------G-TGTCAGTTCGATTCTGATCGGGCGCT---
D00005360 Chlorobium_tepidum_TLS Gly TCC -GCGGGAGTAACTCAGCT-GGT--AGAGTCACAGCCTTCCAAGCTGTTG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCTCCCGCT---
D00005237 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Gly TCC -GCGGGTGTAACTCAAT--GGT--AGAGTGCTAGCCTTCCAAGCTAGTT-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTCTACCCGCTCCA
D00005227 Clostridium_perfringens_str._13 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTCAAT--GGT--AGAACACCAGCCTTCCAAGCTGGAT-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGTACCCGCTCCA
D00005444 Clostridium_tetani_E88 Gly TCC -GCGGGTGTAGCTCAAT--GGT--AGAGTTCCAGCCTTCCAAGCTGGCT-------------------G-TGAGAGTTCGATTCTCTTCACCCGCTCCA
D00005513 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Gly TCC -GGGAATGTCGTATAGT--GGCT-AATACCTCAGCCTTCCAAGCTGAAG-------------------A-CGCGGGTTCGATTCCCGTCATTCCCTCCA
D00005414 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Gly TCC -GGGAATGTCGTATAAT--GGCT-ATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-CGCGGGTTCGATTCCCGTCATTCCCT---
D00005373 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Gly TCC -GGGAATGTCGTATAAT--GGCT-ATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-CGCGGGTTCGATTCCCGTCATTCCCT---
D00005471 Coxiella_burnetii_RSA_493 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTCAAC--GGT--AGAACTTCAGCCTTCCAAGCTGATA-------------------G-CGTGGGTTCGACTCCCATCACCCGCT---
D00005194 Deinococcus_radiodurans_R1 Gly TCC -GCGGGATTGGTGTAGT--GGT--AGCACAGCAGCCTTCCAAGCTTCTG-------------------G-CCTCGGTTCGAATCCGTGATCCCGCTCCA
D00005574 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Gly TCC -GCGGGAATAGCTCAAGT-GGCT-AGAGCATCAGCCTTCCAAGCTGAGG-------------------GTTGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005446 Enterococcus_faecalis_V583 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACCACAGCCTTCCAAGCTGTTG-------------------T-CGCGAGTTCGATTCTCGTCACCCGCT---
D00000837 Escherichia_coli Gly TCC -GCGGGCATCGTATAAT--GGCT-ATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCA
D00005482 Escherichia_coli_CFT073 Gly TCC -GCGGGCATCGTATAAT--GGCT-ATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCA
D00005171 Escherichia_coli_K12 Gly TCC -GCGGGCATCGTATAAT--GGCT-ATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCA
D00005174 Escherichia_coli_O157:H7 Gly TCC -GCGGGCATCGTATAAT--GGCT-ATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCA
D00005177 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Gly TCC -GCGGGCATCGTATAAT--GGCT-ATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCA
D00005361 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Gly TCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGTCAGCCTTCCAAGCTGAAT-------------------GTCGCGAGTTCGAACCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005541 Geobacter_sulfurreducens_PCA Gly TCC -GCGGGAGTAGCTCAGTT-GGCT-AGAGCATCAGCCTTCCAAGCTGAGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTTTCCCGCTCCA
D00000846 Haemophilus_influenzae Gly TCC -GCGGGCATCGTATAAT--GGCT-ATTACCTTAGCCTTCCAAGCTAATG-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCA
D00005184 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Gly TCC -GCGGGCATCGTATAAT--GGCT-ATTACCTTAGCCTTCCAAGCTAATG-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCA
D00000828 Helicobacter_pylori Gly TCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGCT-AGAGCATCAGCCTTCCAAGCTGAGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTTTCCCGCTCCA
D00005179 Helicobacter_pylori_26695 Gly TCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGCT-AGAGCATCAGCCTTCCAAGCTGAGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTTTCCCGCTCCA
D00005181 Helicobacter_pylori_J99 Gly TCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGCT-AGAGCATCAGCCTTCCAAGCTGAGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTTTCCCGCTCCA
D00005544 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Gly TCC -GCGGGTATAGTTTAGT--GGT--AAAACGAAAGCCTTCCAAGCTTTAG-------------------T-CGCGAGTCCGATTCTCGTTACCCGCT---
D00005447 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Gly TCC -GCGAGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACGACAGCCTTCCAAGCTGTAG-------------------T-CGCGGGTCCGATTCCCGTCACTCGCT---
D00005450 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Gly TCC -GCGGGTATAGTTTAGT--GGT--AAAACCACAGCCTTCCAAGCTGTTG-------------------T-CGCGAGTCCGATTCTCGTTACCCGCT---
D00000829 Lactococcus_lactis Gly TCC -GCGGATGTAGTTTAAT--GGT--AGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCT-------------------A-CGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCT---
D00005546 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Gly TCC -GGGGATGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCCTCAGTCTTCCAAACTGATT-------------------A-CGCGGGTTCGATTCCCGTCATCCCCT---
D00005417 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Gly TCC -GCGGGCATGGTGTAAT--GGCT-AGCACTGTAGCCTTCCAAGCTTCCA-------------------G-TGAGGGTTCGAGTCCCTCTGCCCGCA---
D00005220 Listeria_innocua_Clip11262 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACTACAGCCTTCCAAGCTGTTG-------------------T-CGTGGGTTCGATTCCCATCACCCGCT---
D00005224 Listeria_monocytogenes_EGD-e Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACTACAGCCTTCCAAGCTGTTG-------------------T-CGTGGGTTCGATTCCCATCACCCGCT---
D00005576 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACTACAGCCTTCCAAGCTGTTG-------------------T-CGTGGGTTCGATTCCCATCACCCGCT---
D00005578 Mesoplasma_florum_L1 Gly TCC -GCAGGTGTAGTTTAAT--GGT--AGAACTTCAGCCTTCCAAGCTGACT-------------------G-TGAGGGTTCGATTCCCTTCACCTGCTCCA
D00005244 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Gly TCC -GCGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCAGCAGCCTTCCAAGCTGAAT-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGCTACCCGCTCCA
D00005467 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Gly TCC -GCGGGCGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCCCTAGTCTTCCAAACTAGCG-------------------A-CGCGGGTTCGATTCCCGTCGCCCGCT---
D00005164 Mycobacterium_leprae_TN Gly TCC -GCGGGCGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCCCTAGTCCTCCAAACTAGCT-------------------A-CACGGGTTCGATTCCCGTCGCCCGCT---
D00005151 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Gly TCC -GCGGGCGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCCCTAGTCTTCCAAACTAGCG-------------------A-CGCGGGTTCGATTCCCGTCGCCCGCT---
D00005518 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Gly TCC -GCGGGCGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCCCTAGTCTTCCAAACTAGCG-------------------A-CGCGGGTTCGATTCCCGTCGCCCGCT---
D00000809 Mycoplasma_capricolum Gly TCC -GCAGGTGTAGTTGAAT--GGT--AGAACTTCAGCCTTCCAAGCTGATT-------------------G-TGAGGGTTCGATTCCCTTCACCTGCTCCA
D00005464 Mycoplasma_gallisepticum_R Gly TCC -GCGGGTGTAGTTCAAT--GGT--AGAACTGCAGCCTTCCAAGCTGTTA-------------------A-TGTGGGTTCGATTCCCATCACCCGCTCCA
D00000811 Mycoplasma_genitalium Gly TCC -GCGAGTATAGTTTAAT--GGT--AGAACATCAGCCTTCCAAGCTGATC-------------------G-TGTCGGTTCGATTCCGATTACTCGCTCCA
D00005196 Mycoplasma_genitalium_G37 Gly TCC -GCGAGTATAGTTTAAT--GGT--AGAACATCAGCCTTCCAAGCTGATC-------------------G-TGTCGGTTCGATTCCGATTACTCGCTCCA
D00000812 Mycoplasma_mycoides Gly TCC -GCAGGTGTAGTTTAAT--GGC--AGAACTTCAGCCTTCCAAGCTGATT-------------------G-TGAGGGTTCGATTCCCTTCACCTGCTCCA
D00000813 Mycoplasma_pneumoniae Gly TCC -GCGAGTATAGTTTAGT--GGT--AGAACATCAGTCTTCCAAGCTGATC-------------------G-TGTCGGTTCGATTCCGATTACTCGCTCCA
D00005198 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Gly TCC -GCGAGTATAGTTTAGT--GGT--AGAACATCAGTCTTCCAAGCTGATC-------------------G-TGTCGGTTCGATTCCGATTACTCGCTCCA
D00005260 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Gly TCC -GCAAGTGTAGTTTAAT--GGT--AGAACTTCAGCCTTCCAAGCTGATT-------------------G-TGAGGGTTCGATTCCCTTCACTTGCTCCA
D00005153 Neisseria_meningitidis_MC58 Gly TCC -GCGGGTGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCAGAAGCCTTCCAAGCTTACG-------------------G-TGAGGGTTCGATTCCCTTCACCCGCTCCA
D00005155 Neisseria_meningitidis_Z2491 Gly TCC -GCGGGTGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCAGAAGCCTTCCAAGCTTACG-------------------G-TGAGGGTTCGATTCCCTTCACCCGCTCCA
D00005496 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Gly TCC -GCGGGTGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCAGAAGCCTTCCAAGCTTACG-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCACCCGCTCCA
D00005256 Nostoc_sp._PCC_7120 Gly TCC -GCGATCGTGGTGTAAC--GGC--AGCATCAGAGTCTTCCAAACTCACG-------------------G-TACGAGTTCGAGTCTCGTCGATCGCT---
D00005258 Nostoc_sp._PCC_7120 Gly TCC -GCGGGCGTAGTTTAGT--GGT--AAAACTATAGCCTTCCAAGCTATTA-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGCCGCCCGCT---
D00005418 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAAT--GGT--AAAACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCACCCGCTCCA
D00005515 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M Gly TCC -GCGGGCGTCGTATAAT--GGCC-ATTACCTTAGCCTTCCAAGCTAAAG-------------------A-CGTGGGTTCGATTCCCATCGCCCGCTCCA
D00005200 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Gly TCC -GCGGGCATCGTATAAT--GGCT-ATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCA
D00005525 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Gly TCC -GCGGGCATCGTATAAT--GGCT-ATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCA
D00005549 Porphyromonas_gingivalis_W83 Gly TCC -GCGGAAGTAGCTCAGTC-GAT--AGAGCATCAGCCTTCCAAGCTGAGG-------------------GTCGCGGGTTTGAGCCCCGTCTTCCGCT---
D00005580 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Gly TCC -GCGGATGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCCCCAGTCTTCCAAACTGGCT-------------------A-CGCGGGTTCGATTCCCGTCATCCGCTCCA
D00000840 Pseudomonas_aeruginosa Gly TCC -GCGGGTATAGTTCAGT--GGT--AGAACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGCTACCCGCTCCA
D00005205 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Gly TCC -GCGGGTATAGTTCAGT--GGT--AGAACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGCTACCCGCTCCA
D00005501 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Gly TCC -GCGGGTATAGTTTAGT--GGT--AGAACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGCTACCCGCTCCA
D00005255 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Gly TCC -GCGGGTGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCAGAAGCCTTCCAAGCTTACG-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCACCCGCTCCA
D00005492 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Gly TCC -GCGGGTGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCAGCAGCCTTCCAAGCTGAAT-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCACCCGCT---
D00005493 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Gly TCC -GTGTCCTTGCCCGAGC--GGCA-AAGGTTCCGGACTTCCAATCCGGCT-------------------A-GGTGGGTTCGACTCCCACAGGACACT---
D00005527 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Gly TCC -GCGGGTGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCAGCAGCCTTCCAAGCTGAAT-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCACCCGCTCCA
D00005240 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Gly TCC -GCGGGTGTAGCTCAAT--GGT--AGAGTTCCAGCCTTCCAAGCTGGCT-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCCATCACCCGCTCCA
D00000842 Rickettsia_prowazekii Gly TCC -GCGGGTGTAGCTCAAT--GGT--AGAGTTCCAGCCTTCCAAGCTGGCT-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCCATCACCCGCTCCA
D00005370 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Gly TCC -GCGGGTGTAGCTCAAT--GGT--AGAGTTCCAGCCTTCCAAGCTGGCT-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCCATCACCCGCTCCA
D00005554 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Gly TCC -GCGGGTGTAACTCAAT--GGT--AGAGTTCCAGCCTTCCAAGCTGGCT-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCCATCATCCGCTCCA
D00005267 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Gly TCC -GCGGGCATCGTATAAT--GGCT-ATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCA
D00005489 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Gly TCC -GCGGGCATCGTATAAT--GGCT-ATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCA
D00005252 Salmonella_typhimurium_LT2 Gly TCC -GCGGGCATCGTATAAT--GGCT-ATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCA
D00005425 Shewanella_oneidensis_MR-1 Gly TCC -GCGGGCATCGTATAAT--GGT--ATTACTCCAGCCTTCCAAGCTGATA-------------------A-CGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCA
D00005426 Shigella_flexneri_2a_str._301 Gly TCC -GCGGGCATCGTATAAT--GGCT-ATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCA
D00005269 Sinorhizobium_meliloti_1021 Gly TCC -GCGGGTATAGCTCAAT--GGT--AGAGCAGCAGCCTTCCAAGCTGAAT-------------------A-CGCGGGTTCGATTCCCGCTACCCGCTCCA
D00000823 Staphylococcus_aureus Gly TCC -GCGGGAGTAGTTCAACT-TTT--AGAACACGTTCCTTCCCGGAACGAG-------------------G-TATAGGTGCAAATCCTATCTTCCGCTCCA
D00000824 Staphylococcus_aureus Gly TCC -GCGGGAGTATTTCAACT-CTT--AGAATACATTCCTTCCTGGAATGAG-------------------G-TATAGGTGTAAATCCTATCTTCCGCTCCA
D00000825 Staphylococcus_aureus Gly TCC -GCGGGAGTAGTTCAACT-TTT--AGAACACGTTCCTTCCCGGAACGAG-------------------G-TATAGGTGTAAATCCTATCTTCCGCTCCA
D00005530 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAAT--GGC--AAAACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------T-TGTGGGTTCGATTCCCATCACCCGCTCCA
D00005531 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Gly TCC -GCGGGAGTAGTTCAACT-CTT--AGAATACATTCCTTCCTGGAATGAG-------------------G-TATAGGTGTAAATCCTATCTTCCGCTCCA
D00005532 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Gly TCC -GCGGGAGTAGTTCAACT-TTT--AGAACACGTTCCTTCCCGGAACGAG-------------------G-TATAGGTGCAAATCCTATCTTCCGCTCCA
D00005376 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAAT--GGC--AAAACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------T-TGTGGGTTCGATTCCCATCACCCGCTCCA
D00005377 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Gly TCC -GCGGGAGTAGTTCAACT-TTT--AGAACACGTTCCTTCCCGGAACGAG-------------------G-TATAGGTGTAAATCCTATCTTCCGCTCCA
D00005378 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Gly TCC -GCGGGAGTAGTTCAACT-TTT--AGAACACGTTCCTTCCCGGAACGAG-------------------G-TATAGGTGCAAATCCTATCTTCCGCTCCA
D00005159 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Gly TCC -GCGGGAGTAGTTCAACT-TTT--AGAACACGTTCCTTCCCGGAACGAG-------------------G-TATAGGTGCAAATCCTATCTTCCGCTCCA
D00005160 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAAT--GGC--AAAACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------T-TGTGGGTTCGATTCCCATCACCCGCTCCA
D00005161 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Gly TCC -GCGGGAGTAGTTCAACT-TTT--AGAACACGTTCCTTCCCGGAACGAG-------------------G-TATAGGTGTAAATCCTATCTTCCGCTCCA
D00005451 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAAT--GGC--AAAACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------T-TGTGGGTTCGATTCCCATCACCCGCTCCA
D00005452 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Gly TCC -GCGGGAGTAGTTCAACT-CTC--AGAACACATTCCTTCCCGGAATGAG-------------------A-TATAGGTGTAAATCCTATCTTCCGCTCCA
D00005453 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Gly TCC -GCGGGAGTAGTTCAACT-CTC--AGAACACATTCCTTCCCGGAATGAG-------------------A-TATAGGTGCAAATCCTATCTTCCGCTCCA
D00005454 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Gly TCC -GCGGGAGTAGTTCAACT-CTT--AGAACACATTCCTTCCCGGAATGAG-------------------A-TATAGGTGTAAATCCTATCTTCCGCTCCA
D00000836 Stigmatella_aurantiaca Gly TCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGTCAGCCTTCCAAGCTGAAT-------------------GTCGTGGGTTCGAGTCCCATTTCCCGCTCCA
D00005431 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACTACAGCCTTCCAAGCTGTTG-------------------T-CGCGAGTTCGATTCTCGTCACCCGCT---
D00005380 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACTACAGCCTTCCAAGCTGTTG-------------------T-CGCGAGTTCGATTCTCGTCACCCGCT---
D00005433 Streptococcus_mutans_UA159 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACCACAGCCTTCCAAGCTGTTG-------------------T-CGCGAGTTCGATTCTCGTCACCCGCT---
D00005435 Streptococcus_mutans_UA159 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACTACAGCCTTCCAAGCTGTTG-------------------T-CGCGAGTTCGATTCTCGTCACCCGCT---
D00005234 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACTACAGCCTTCCAAGCTGTTG-------------------T-CGCGAGTTCGATTCTCGTCACCCGCT---
D00005233 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACTACAGCCTTCCAAGCTGTTG-------------------T-CGCGAGTTCGATTCTCGTCACCCGCT---
D00005382 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACTACAGCCTTCCAAGCTGTTG-------------------T-CGCGAGTTCGATTCTCGTCACCCGCT---
D00005470 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACTACAGCCTTCCAAGCTGTTG-------------------T-CGCGAGTTCGATTCTCGTCACCCGCT---
D00005485 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Gly TCC -GCGGGCGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCCCTAGTCTTCCAAACTAGCT-------------------A-CGCGGGTTCGATTCCCGTCGCCCGCTCCA
D00005423 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Gly TCC -GCGGGCGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCACCAGTCTTCCAAACTGGCT-------------------A-CGCGGGTTCGATTCCCGTCGCCCGCT---
D00000821 Streptomyces_lividans Gly TCC -GCGTTGGTGGTCCAA---GGA--AAGACGCCCCACTTCCCGTGGGGAA-------------------A-TGCAGGTGCAAGGCCTGCCCAGCGCT---
D00005556 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Gly TCC -GCGGGTGTAGCTTAGT--GGT--AAAGCTCCAGCCTTCCAAGCTGGCG-------------------A-CGAGGGTTCGATTCCCTTCACCCGCTCCA
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D00005208 Synechocystis_sp._PCC_6803 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AAAACCTTAGCCTTCCAAGCTAATG-------------------A-TAGGGGTTCGATTCCCCTCACCCGCT---
D00005391 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Gly TCC -GCGGGTGTAGCTCAAT--GGT--AGAGCCCCAGCCTTCCAAGCTGGTT-------------------G-CGTGGGTTCGATTCCCATCACCCGCTCCA
D00005383 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Gly TCC -GCGGGCATGGTTTAAT--GGT--AAAACCCTAGCCTTCCAAGCTAGAG-------------------A-CGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCT---
D00005211 Thermotoga_maritima_MSB8 Gly TCC -GCGGGTGTAGCTCAACT-GGT--AGAGCATCGGCCTTCCAAGCCGAGG-------------------GTTGCGGGTTCGAGTCCCGTCGCCCGCTCCA
D00005582 Thermus_thermophilus_HB27 Gly TCC -GCGGGAGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGCATCGGCCTTCCAAGCCGAGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTCCCGCTCCA
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D00000816 Treponema_pallidum Gly TCC -GCGGATGTTGTATAAC--GGCT-ATTACCCCAGCCTTCCAAGCTGGAG-------------------A-CGTGGGTTCGACTCCCATCATCCGCT---
D00005202 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Gly TCC -GCGGATGTTGTATAAC--GGCT-ATTACCCCAGCCTTCCAAGCTGGAG-------------------A-CGTGGGTTCGACTCCCATCATCCGCT---
D00005458 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Gly TCC -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGTTCCAGTCTTCCAAACTGGTG-------------------G-CGCGGGTTCGATTCCCGTCACCCCCT---
D00005166 Ureaplasma_parvum_serovar_3 Gly TCC -GCGGGTGTAGTTCAAT--GGT--AGAACTATAGCCTTCCAAGCTATTA-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCCATCACCCGCTCCA
D00005157 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Gly TCC -GCGGGCATCGTATAAT--GGCT-ATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCA
D00005588 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Gly TCC -GCGGGTATAGCTCAAT--GGT--AGAGCTCTAGCCTTCCAAGCTAGTG-------------------A-CGTGGGTTCAATTCCCACTATCCGCT---
D00005395 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Gly TCC -GCGGGAGTAGTTCAAC--GGT--AGAACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------G-TGCGGGTTCGATTCCCGTCTCCCGCTCCA
D00005392 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Gly TCC -GCGGGAGTAGTTCAAC--GGT--AGAACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------G-TGCGGGTTCGATTCCCGTCTCCCGCTCCA
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D00005463 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Gly TCC -GCGGGAGTAGTTCAAA--GGT--AGAACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------G-TGCGGGTTCGATTCCCGTCTCCCGCTCCA
D00005560 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Gly TCC -GCGGGCATCGTATAAT--GGCT-ATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-TGTGGGTTCGATTCCCACTGCCCGCTCCA
D00005249 Yersinia_pestis_CO92 Gly TCC -GCGGGCATCGTATAAT--GGCT-ATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-TGTGGGTTCGATTCCCACTGCCCGCTCCA
D00005401 Yersinia_pestis_KIM Gly TCC -GCGGGCATCGTATAAT--GGCT-ATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-TGTGGGTTCGATTCCCACTGCCCGCTCCA
D00005562 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Gly TCC -GCGGGCATCGTATAAT--GGCT-ATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATG-------------------A-TGTGGGTTCGATTCCCACTGCCCGCTCCA
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D00000962 Caenorhabditis_elegans Gly TCC -GCGTTCGTGGTGTAAT--GGTC-AGCATGGATGCCTTCCAAGCATTCG-------------------A-CGGGGGTTCGATTCCCCCCGAACGCA---
D00005338 Caenorhabditis_elegans Gly TCC -GCGGTTTACCTGTGAT--GGTC-AGCATGGATGCCTTCCAAGCATTCG-------------------A-CGGGGGTTCGATTCCCCCCGAACGC----
D00005339 Caenorhabditis_elegans Gly TCC -GCGTTCGGGGTGTAAT--GGTC-AGCATGGATGCCTTCCAAGCATTCG-------------------A-CGGGGGTTCGATTCCCCCCGAACGCA---
D00005340 Caenorhabditis_elegans Gly TCC -GAGTTCGTGGTGTAAT--GGTC-AGCATGGATGCCTTCCAAGCATTCG-------------------A-CGGGGGTTCGATTCCCCCCGAACGCA---
D00005341 Caenorhabditis_elegans Gly TCC -GCGTTCGTGGTGTAAT--GGTC-AGCATGGATGCCTTCCAAGCATTCG-------------------A-CGGGGGTTCGATTCCCCCCGAACGC----
D00005342 Caenorhabditis_elegans Gly TCC -GCGTTCGTGGTGTAAT--GGTC-AGCATGGATGCCTTCCAAGCATTCG-------------------A-CGGGGGTTCGATTCCCCTCGAACGCA---
D00005343 Caenorhabditis_elegans Gly TCC -GCGTTCGTGGTGTAAT--GGTC-AGCATGGATGCCTTCCAAGCATTCG-------------------A-CGGGGGTTCGATTCCCCCCGAACGCA---
D00005344 Caenorhabditis_elegans Gly TCC -GCGTTCGTGGTGTAAT--GGTC-GGCATGGATGCCTTCCAAGCATTCG-------------------A-CGGGGGTTCGATTCCCCCCGAACGCA---
D00005566 Candida_glabrata_CBS_138 Gly TCC -GGGCGGTTAGTGTAGT--GGTT-ATCATTCCACCCTTCCAAGGTGGAG-------------------A-CACGGGTTCGATTCTCGTACCGCTCA---
D00005351 Drosophila_melanogaster Gly TCC -GCGTCGGTGGTGTAAT--GGTC-AGCATAGTTGCCTTCCAAGCAGTTG-------------------A-TCCGGGTTCGATTCCCGGCCGACGC----
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D00005398 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Gly TCC -GCGTTGTTGGTCTAGT--GGAT-AGGATAACAGCCTTCCAAGCTGTTG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGACATCGCA---
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D00005322 Homo_sapiens Gly TCC -GCGTTGGTGGTATAGT--GGTT-AGCATAGCTGCCTTCCAAGCAGTTG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCAACGCA---
D00000950 Leishmania_tarentolae Gly TCC -GCAATTGTGGTCCAAC--GGTT-AAGATCCCCGCCTTCCAAGCGGGTG-------------------A-CCCGGGTTCGACTCCCGGCAATTGCA---
D00000967 Mus_musculus Gly TCC -GCGTTGGTGGTATAGT--GGTG-AGCATAGCTGCCTTCCAAGCAGTTG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCAACGCA---
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D00005643 Pan_troglodytes Gly TCC -GCGTTGGTGGTATAGT--GGTG-AGCATAGCTGCCTTCCAACCAGTTG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCAACGCA---
D00005644 Pan_troglodytes Gly TCC -GCGTTGGTGGTATAGT--GGTG-AGCATAGCTGCCTTCCAAGCGGTTG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCAACGCA---
D00005645 Pan_troglodytes Gly TCC -GCGTTGGTGGTATAGT--GGTG-AGCATAGCTGCCTTCCAAGCAGTTG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCAACGCA---
D00005646 Pan_troglodytes Gly TCC -GCGTTGGTGGTATAGT--GGTT-AGCATAGCTGCCTTCCAAGCAGTTG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCAACGCA---
D00000958 Phaseolus_vulgaris Gly TCC -GCGTCTGTAGTCCAAC--GGTT-AGGATAATTGCCTTCCAAGCAATAG-------------------A-CCCGGGTTCGACTCCCGGCAGACGCA---
D00000949 Plasmodium_falciparum Gly TCC -ACAAATATAGTTTAATC-GGT--AAAATATTAATTTTCCAAATTAATG-------------------A-TATGGATTCAATTTCCATTATTTGTA---
D00005599 Plasmodium_falciparum_3D7 Gly TCC -GCGTCAATAGTCTAAC--GGCC-ATGATACCTGCCTTCCAAGCAGGTG-------------------A-CCCGGGTTCGACTCCCGGTTGACGCA---
D00005600 Plasmodium_falciparum_3D7 Gly TCC -GGGCCTATGGCGCAAC--GGT--AGCGCGTCTGAACTCCACTCAGAAG-------------------GCTGGGGGTTCGAATCCCTCTGGGCTCA---
D00000968 Rattus_norvegicus Gly TCC -GCGTTGGTGGTATAGT--GGTG-AGCATAGCTGCCTTCCAAGCAGTTG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCAACGCA---
D00000969 Rattus_norvegicus Gly TCC -GCGTTGGTGGTATAGT--GGTG-AACATAGCTGCCTTCCAAGCAGTTG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCAACGCA---
D00005348 Saccharomyces_cerevisiae Gly TCC -GGGCGGTTAGTGTAGT--GGTT-ATCATCCCACCCTTCCAAGGTGGGG-------------------A-CACGGGTTCGATTCTCGTACCGCTC----
D00000954 Schizosaccharomyces_pombe Gly TCC -GCATCGATGGTGTAGC--GGT--AACATCAATGCCTTCCAAGCATTAG-------------------C-TCCGGGTTCGACTCCCGGTCGATGCA---
D00005355 Schizosaccharomyces_pombe Gly TCC -GCATCAGTGGTGTAGC--GGT--AACATCAATGCCTTCCAAGCATTAG-------------------C-TCCGGGTTCGACTCCCGGTTGATGC----
D00005356 Schizosaccharomyces_pombe Gly TCC -GCATCAGTGGTGTAGC--GGT--AACATCAATGCCTTCCAAGCATTAG-------------------C-TCCGGGTTCGACTCCCGGCTGATGC----
D00005357 Schizosaccharomyces_pombe Gly TCC -GCATCGATGGTGTAGC--GGT--AACATCAATGCCTTCCAAGCATTAG-------------------C-TCCGGGTTCGACTCCCGGTCGATGCA---
D00005626 Takifugu_rubripes Gly TCC -GCGTTGGTGGTATAGT--GGTT-AGCATAGCTGCCTTCCAAGCAGTTG---------------------ACCCGGTTCGATTCCCGGCCAACGCA---
D00005627 Takifugu_rubripes Gly TCC -GCGATGGTGGTATAGT--GGTG-AGCATAGCTGCCTTCCAAGCAGTTG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCATCGCA---
D00005628 Takifugu_rubripes Gly TCC -GCGTTGGTGGTATAGT--GGTT-AGCATAGCTGCCTTCCAAGCAGTTG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCAACGCA---
D00005272 Aeropyrum_pernix_K1 Gly GCC -GCGGCGGTCGTCTAGCCTGGACTAGGACGCCGGCCTGCCAAGCCGGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGCCGCACC-
D00005275 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Gly GCC -GCGCCGATGGTGTAGCCTGGT--AACACAGGGGCTTGCCGAGCCCCTG-------------------C-CCCGGGTTCAAATCCCGGTCGGCGCA---
D00005278 Halobacterium_sp._NRC-1 Gly GCC -GCGCTGGTAGTGTAGT--GGT--ATCACGTGACCTTGCCATGGTCACA-------------------A-CCTGGGTTCAAATCCCAGCCAGCGCA---
D00000806 Methanocaldococcus_jannaschii Gly GCC -GCGGCCTTGGTGTAGCCTGGT--AACACACGGGCCTGCCACGCCCGGA-------------------C-CCCGGGTTCAAATCCCGGAGGCCGCA---
D00005282 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Gly GCC -GCGGCCTTGGTGTAGCCTGGT--AACACACGGGCCTGCCACGCCCGGA-------------------C-CCCGGGTTCAAATCCCGGAGGCCGCACC-
D00011873 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Gly GCC -GCGGTTTTGATGTAGCCTGGT--ATCATACGGCCCTGCCACGGCCGAC-------------------A-CCCGGGTTCGAATCCCGGAGACCGCA---
D00005284 Methanococcus_maripaludis Gly GCC -GCGGCTTTGATGTAGACTGGT--ATCATACGGCCCTGCCACGGCCGAC-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGAGGCCGC----
D00005405 Methanopyrus_kandleri_AV19 Gly GCC -GCGGCCGCAGTCTAGTCTGGT--AGGACGCGGGCCTGCCGAGCCCGTG-------------------G-CCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCGCACCA
D00011892 Methanosarcina_acetivorans_C2A Gly GCC -ACATCAGTAGTGTAGC--GGTC-ATCACCGGGCGTTGCCAACGCTCGA-------------------A-CCCGGGTTCGAATCCCGGCTGGTGTA---
D00005364 Methanosarcina_mazei_Go1 Gly GCC -ACATCAGTAGTGTAGC--GGTC-ATCACCGGGCGTTGCCAACGCTCGA-------------------A-CCCGGGTTCGAATCCCGGCTGGTGTA---
D00005365 Methanosarcina_mazei_Go1 Gly GCC -ACATCAGTAGTGTAGC--GGTC-ATCACCGGGCGTTGCCAACGCTCGA-------------------A-CCCGGGTTCGAATCCCGGCTGATGTA---
D00011952 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Gly GCC -GCGTTGATAGTGTAGT--GGTT-ATCACTAGGCGTTGCCAACGCCTAA-------------------A-CCCGGGTTCGAATCCCGGTCAGCGCA---
D00005280 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Gly GCC -GCGGCGTTAGTCCAGCCTGGTT-AAGACACTGGCCTGCCACGCCAGCG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGACGCCGCA---
D00011976 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Gly GCC -GCGCCCGTAGTCTAGG--GGA--AGGACGCCGGCCTGCCAAGCCGGAG-------------------GTCCCGGGTTCGAATCCCGGCGGGCGCA---
D00005287 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Gly GCC -GCGGCGGTAGTCTAGCCTGGTTTAGGATGGCGGCCTGCCAAGCCGTTG-------------------ATCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGCCGCACCA
D00005290 Pyrococcus_abyssi_GE5 Gly GCC -GCGGTGGTAGTCTAGCCTGGCCTAGGACGCCACCCTGCCAAGGTGGAG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCACCGCACC-
D00005293 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Gly GCC -GCGGTGGTAGTCTAGCCTGGTCTAGGACGCCACCCTGCCAAGGTGGAG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCACCGCACC-
D00005296 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Gly GCC -GCGGTGGTAGTCTAGCCTGGCCTAGGACGCCACCCTGCCAAGGTGGAG-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCACCGCACCA
D00012017 Staphylothermus_marinus_F1 Gly GCC -GCGGCGGTCGTCTAGCCTGGACTAGGACGCCGGCCTGCCACGCCGGAG-------------------ATCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGCCGCACCA
D00012093 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Gly GCC -GCGGCCGTAGTCTAGCCTGGATTAGGACGCCTGCCTGCCACGCAGGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGTCGCA---
D00005299 Sulfolobus_solfataricus_P2 Gly GCC -GCGGCCGTAGTCTAGCCTGGATTAGGACGCCTGCCTGCCACGCAGGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCGC----
D00005387 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Gly GCC -GCGGCCGTAGTCTAGCCTGGATTAGGACGCCGGCCTGCCACGCCGGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGTCGCA---
D00005302 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Gly GCC -GCGGGTGTGGTGTAGCCTGGT--AACACGCGAGCTTGCCAAGCTCGTG-------------------C-CTCGGGTTCAAATCCCGACATCCGCA---
D00005305 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Gly GCC -GCGGGTGTGGTGTAGCCTGGC--AACACGCGAGCTTGCCAAGCTCGTG-------------------C-CTCGGGTTCAAATCCCGACATCCGCA---
D00000815 Acholeplasma_laidlawii Gly GCC -GTCGGTGTCGTATAT---GGTT-ATTAC-AGGCCTTGCCAAGGCTTAG-------------------A-CGGCAGTTCGATCCTGCTCACCGGCTCCA
D00005590 Acinetobacter_sp._ADP1 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005263 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Gly GCC -GCGGGTGTAGCTCAGG--GGT--AGAGCACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGAGGGTTCAAATCCCTTCGCCCGCTCCA
D00005264 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Gly GCC -GCGGGTGTAGCTCAGG--GGT--AGAGCACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGAGGGTTCAAATCCCTTCGCCCGCTCCA
D00005217 Aquifex_aeolicus_VF5 Gly GCC -GCGGGCGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGGCTGCTTGCCATGCAGCAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCGCCCGCTCCA
D00000843 Azorhizobium_caulinodans Gly GCC -GCGGGTGTAGCTCAGG--GGT--AGAGCACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGAGGGTTCGAATCCCTTCGCCCGCTCCA
D00005592 Bacillus_anthracis_str._A2012 Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--AGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCCGCTCCA
D00005504 Bacillus_anthracis_str._Ames Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--AGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCCGCT---
D00005506 Bacillus_anthracis_str._Ames Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--AGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCCGCTCCA
D00005533 Bacillus_anthracis_str._Sterne Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--AGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCCGCT---
D00005535 Bacillus_anthracis_str._Sterne Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--AGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCCGCTCCA
D00005568 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--AGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCCGCT---
D00005570 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--AGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCCGCTCCA
D00005474 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--AGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCCGCTCCA
D00005475 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--AGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCCGCT---
D00005436 Bacillus_halodurans_C-125 Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--AGAACACCACCTTGCCAAGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCCGCTCCA
D00000831 Bacillus_subtilis Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GG.--AGAACACCACCTTGCCAAGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCCGCTCCA
D00000833 Bacillus_subtilis Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--TGAACACCACCTTGCCAAGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCCGCTCCA
D00005144 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--AGAACACCACCTTGCCAAGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCCGCTCCA
D00005594 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--AGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCCGCT---
D00005595 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--AGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCCGCTCCA
D00005497 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Gly GCC -GCGGAAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATAACCTTGCCAAGGTTAGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTTCCGCT---
D00005498 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Gly GCC -GCGGAAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATAACCTTGCCAAGGTTAGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTTCCGCT---
D00005509 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Gly GCC -GCGGGTGTAGCTCAGG--GGT--AGAGCACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCATCGCCCGCTCCA
D00005601 Bartonella_quintana_str._Toulouse Gly GCC -GCGGGTGTAGCTCAGG--GGT--AGAGCACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCATCGCCCGCTCCA
D00005510 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Gly GCC -GCGGGAGTAGCTCAGTT-GAT--AGAGCGATGCCTTGCCAAGGCATAG-------------------GTCGCGGGTTTGAGCCCCGTCTCCCGCTCCA
D00005407 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Gly GCC -GCGGACATAGCTTAGTT-GGT--AAAGCGCAACCTTGCCAAGGTTGAG-------------------ACCGCGGGTTCGAGTCCCGTTGTCCGCT---
D00005408 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Gly GCC -GCGGACATAGCTTAGTT-GGT--AAAGCGCAACCTTGCCAAGGTTGAG-------------------ACCGCGGGTTCGAGTCCCGTTGTCCGCT---
D00005409 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Gly GCC -GCGGACATAGCTTAGTT-GGT--AAAGCGCAACCTTGCCAAGGTTGAG-------------------ACCGCGGGTTCGAGTCCCGTTGTCCGCTCCA
D00000819 Borrelia_burgdorferi Gly GCC -GCGAAAGTAACTCAGG--GGT--AGAGTGTCACCTCGCCAAGGTGGAA-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGTCTTTCGCT---
D00005185 Borrelia_burgdorferi_B31 Gly GCC -GCGAAAGTAACTCAGG--GGT--AGAGTGTCACCTTGCCAAGGTGGAA-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGTCTTTCGCT---
D00005538 Borrelia_garinii_PBi Gly GCC -GCGAAAGTAACTCAGG--GGT--AGAGTGTCACCTTGCCAAGGTGGAA-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGTCTTTCGCT---
D00005440 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Gly GCC -GCGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGAGGGTTCGAGCCCCTTCGCCCGCTCCA
D00005243 Brucella_melitensis_16M Gly GCC -GCGGGTGTAGCTCAGG--GGT--AGAGCACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGAGGGTTCGAATCCCTTCGCCCGCTCCA
D00005411 Brucella_suis_1330 Gly GCC -GCGGGTGTAGCTCAGG--GGT--AGAGCACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGAGGGTTCGAATCCCTTCGCCCGCTCCA
D00005147 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGCGAGTTCAAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005479 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGTACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGCGAGTTCAAATCTCGTTTCCCGCT---
D00005368 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAATCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005187 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGG--GGT--AGAGCACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAATCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005603 Candidatus_Blochmannia_floridanus Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGAT-GGTT-AGAGTGCAACCTTGCCAAGGTTGAG-------------------GTCGCGAGTTCGAATCTCGTTTCCCGCT---
D00005521 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Gly GCC -GCGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCATCACGTTGCCAACGTGAGA-------------------GTCGTGAGTTCGAATCTCATCACCCGCT---
D00005190 Caulobacter_crescentus_CB15 Gly GCC -GCGGGCGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCCACCTTGCCAAGGTGGAT-------------------GTCGAGAGTTCGAATCTCTTCGCCCGCTCCA
D00005231 Chlamydia_muridarum_Nigg Gly GCC -GCGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCCACGTTGCCAACGTGAAG-------------------GTCGTGAGTTCAAGCCTCATCACCCGCT---
D00005142 Chlamydia_trachomatis Gly GCC -GCGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGTCACGTTGCCAACGTGAAG-------------------GTCGTGAGTTCAAGCCTCATCACCCGC----
D00005140 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Gly GCC -GCGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCCACGTTGCCAACGTGAAG-------------------GTCGTGAGTTCAAGCCTCATCACCCGCT---
D00005136 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Gly GCC -GCGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGTCACGTTGCCAACGTGAAG-------------------GTCGTGAGTTCAAGCCTCATCACCCGCT---
D00005138 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Gly GCC -GCGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGTCACGTTGCCAACGTGAAG-------------------GTCGTGAGTTCAAGCCTCATCACCCGCT---
D00005167 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Gly GCC -GCGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCGTCACGTTGCCAACGTGAAG-------------------GTCGTGAGTTCAAGCCTCATCACCCGCT---
D00005358 Chlorobium_tepidum_TLS Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGCT-GGT--AGAGCACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCT---
D00005236 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Gly GCC -GCGGGAGTGGCTCAGT--GGT--AGAGCGTCACCTTGCCAAGGTGAAC-------------------GTCGCGAGTTCGAATCTCGTCTTCCGCTCCA
D00005228 Clostridium_perfringens_str._13 Gly GCC -GCGGGAGTGACTCAAT--GGT--AGAGTGTCACCTTGCCAAGGTGAAA-------------------GTTGCGAGTTCGAGTCTCGTCTTCCGCTCCA
D00005229 Clostridium_perfringens_str._13 Gly GCC -GCGGGAGTGACTCAAT--GGT--AGAGTGTCACCTTGCCAAGGTGAAA-------------------GTTGCGGGTTCGAGTCCCGTCTTCCGCTCCA
D00005443 Clostridium_tetani_E88 Gly GCC -GCGGGAGTGGCTCAGT--GGT--AGAGCGTCACCTTGCCAAGGTGAAC-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCATCTTCCGCTCCA
D00005512 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Gly GCC -GCGGATGTAGCGCAGTT-GGT--AGCGCATCACCTTGCCAAGGTGAGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTCATCCGCT---
D00005413 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Gly GCC -GCGGATGTAGCGCAGTT-GGT--AGCGCATCACCTTGCCAAGGTGAGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTCATCCGCT---
D00005371 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Gly GCC -GCGGATGTAGCGCAGTT-GGT--AGCGCATCACCTTGCCAAGGTGAGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTCATCCGCT---
D00005372 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Gly GCC -GCGGATGTAGCGCAGTT-GGT--AGCGCATCACCTTGCCAAGGTGAGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTCATCCGCT---
D00005473 Coxiella_burnetii_RSA_493 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGCT-GGT--AGAGCACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAATCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005193 Deinococcus_radiodurans_R1 Gly GCC -GCGGGAGTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCACTACCTTGCCAAGGTAGAT-------------------GTCGCGAGTTCGAATCTCGTCTCCCGCTCCA
D00005572 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Gly GCC -GCGGGAGTAACTCAGT--GGT--AGAGTGCAACCTTGCCAAGGTTGAA-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGTCTCCCGCTCCA
D00005445 Enterococcus_faecalis_V583 Gly GCC -GCGGAAATAGCTCAGT--GGT--AGAGCACCACCTTGCCAAGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAACCCCGTTTTCCGCT---
D00000838 Escherichia_coli Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005480 Escherichia_coli_CFT073 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005170 Escherichia_coli_K12 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005173 Escherichia_coli_O157:H7 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005176 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005362 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATAACCTTGCCAAGGTTAGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005539 Geobacter_sulfurreducens_PCA Gly GCC -GCGGGAATAACTCAGT--GGT--AGAGTGCAACCTTGCCAAGGTTGAA-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTTTCCCGCTCCA
D00000844 Haemophilus_influenzae Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCA
D00000845 Haemophilus_influenzae Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005182 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005183 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCA
D00000827 Helicobacter_pylori Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGT--GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GCCGCGGGTTCGATCCCCGTTTCCCGCTCCA
D00005178 Helicobacter_pylori_26695 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGT--GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GCCGCGGGTTCGATCCCCGTTTCCCGCTCCA
D00005180 Helicobacter_pylori_J99 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGT--GGTA-GAAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GCCGCGGGTTCGATCCCCGTTTCCCGCTCCA
D00000826 Lactobacillus_delbrueckii_subsp._bulgaricus Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--AGAACATCACCTTGCCATGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCCGCT---
D00005543 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--AGAACATCACCTTGCCATGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCCGCTCCA
D00005545 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--AGAACACCACCTTGCCATGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCCGCT---
D00005448 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--AGAACATCACCTTGCCATGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCCGCT---
D00005547 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Gly GCC -GCGGATGTAGCGCAGTT-GGT--AGCGCATCACCTTGCCAAGGTGAGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTCATCCGCT---
D00005416 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGT--GGT--AGAGCACCTCCTTGCCAAGGAGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTTTCCCGCT---
D00005219 Listeria_innocua_Clip11262 Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--AGAACATCACCTTGCCAAGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAACCCCGTCTTCCGCT---
D00005221 Listeria_innocua_Clip11262 Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--AGAACATCACCTTGCCAAGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAACCCCGTCTTCCGCTCCA
D00005222 Listeria_innocua_Clip11262 Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGC--GGT--AGAACATCACCTTGCCAAGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAACCCCGTCTTCCGCT---
D00005223 Listeria_monocytogenes_EGD-e Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--AGAACATCACCTTGCCAAGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAACCCCGTCTTCCGCT---
D00005225 Listeria_monocytogenes_EGD-e Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--AGAACATCACCTTGCCAAGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAACCCCGTCTTCCGCTCCA
D00005226 Listeria_monocytogenes_EGD-e Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGC--GGT--AGAACATCACCTTGCCAAGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAACCCCGTCTTCCGCT---
D00005575 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--AGAACATCACCTTGCCAAGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAACCCCGTCTTCCGCT---
D00005577 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGC--GGT--AGAACATCACCTTGCCAAGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAACCCCGTCTTCCGCT---
D00005245 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Gly GCC -GCGGGTGTAGCTCAGG--GGT--AGAGCACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGAGCGTTCGAATCGCTTCACCCGCTCCA
D00005468 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Gly GCC -GCGGATGTAGCGCAGTT-GGT--AGCGCATCACCTTGCCAAGGTGAGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCATCCGCT---
D00005163 Mycobacterium_leprae_TN Gly GCC -GCGGATGTAGCGCAGTT-GGT--AGCGCATCACCTTGCCAAGGTGAGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCATCCGCT---
D00005150 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Gly GCC -GCGGATGTAGCGCAGTT-GGT--AGCGCATCACCTTGCCAAGGTGAGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCATCCGCT---
D00005519 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Gly GCC -GCGGATGTAGCGCAGTT-GGT--AGCGCATCACCTTGCCAAGGTGAGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCATCCGCT---
D00005465 Mycoplasma_gallisepticum_R Gly GCC -GCAGATGTAGTTCAAT--GGT--AGAACGAGACCTTGCCGAGGTTTAG-------------------A-CGCGAGTTCGATTCTCGTCATCTGCTCCA
D00000810 Mycoplasma_genitalium Gly GCC -GCAGATATAGTTCAAT--GGT--AGAACATAACCTTGCCAAGGTTAAG-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGTTATCTGCTCCA
D00005195 Mycoplasma_genitalium_G37 Gly GCC -GCAGATATAGTTCAAT--GGT--AGAACATAACCTTGCCAAGGTTAAG-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGTTATCTGCTCCA
D00000814 Mycoplasma_pneumoniae Gly GCC -GCAGATATAGTTCAAT--GGC--AGAACATAACCTTGCCAAGGTTAAG-------------------A-TGCGGGTTTGATTCCCGTTATCTGCTCCA
D00005197 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Gly GCC -GCAGATATAGTTCAAT--GGC--AGAACATAACCTTGCCAAGGTTAAG-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCCGTTATCTGCTCCA
D00005152 Neisseria_meningitidis_MC58 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAACCTTGCCAAGGTTGAG-------------------GTCGCGAGTTCGAGACTCGTTTCCCGCTCCA
D00005154 Neisseria_meningitidis_Z2491 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAACCTTGCCAAGGTTGAG-------------------GTCGCGAGTTCGAGACTCGTTTCCCGCTCCA
D00005494 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAACCTTGCCAAGGTTGAG-------------------GTCGCGAGTTCGAGACTCGTTTCCCGCTCCA
D00005259 Nostoc_sp._PCC_7120 Gly GCC -GCGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCGTCACCTTGCCAAGGTGAAT-------------------GTCGCGCGTTCGAATCGCGTTACCCGCT---
D00005419 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--AGAACACCACCTTGCCAAGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCCGCTCCA
D00005516 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M Gly GCC -GTGGGCGTCGTATAGT--GGTT-ATTATACGTGCTTGCCAAGCATGAG-------------------A-CGGGGGTTCGATTCCCCTCGCCCGCTCCA
D00005199 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005522 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005524 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005550 Porphyromonas_gingivalis_W83 Gly GCC -GCGGAAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATAACCTTGCCAAGGTTAGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCTTCCGCT---
D00005552 Porphyromonas_gingivalis_W83 Gly GCC -GCGGAAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATAACCTTGCCAAGGTTAGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCTTCCGCTCCA
D00005579 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Gly GCC -GCGGACGTGGCTCAGTT-GGT--AGAGCATCACCTTGCCAAGGTGAGG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCGTCCGCT---
D00005204 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00000847 Pseudomonas_putida Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005502 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005254 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAACCTTGCCAAGGTTGAG-------------------GTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005490 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Gly GCC -GCGCCCATGATGTAGC--GGT--AGCCTGCTGCCTTGCCATGGCGGAA-------------------G-TGTGGGTTCGACTCCCACTGGGCGCT---
D00005491 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Gly GCC -GCGGCTGTAGCTCAGTT-GGC--AGAGCATCACGTTGCCAACGTGATT-------------------GTCGTCGGTTCGAATCCGATCAGCCGCT---
D00005526 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Gly GCC -GCGGGTGTAGCTCAGG--GGT--AGAGCACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGAGGGTTCGAATCCCTTCGCCCGCTCCA
D00005239 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Gly GCC -GCGGGTGTAGCTCAGG--GGT--AGAGCGCCACCTTGCCAAGGTTGAA-------------------GTCGAGGGTTCGAATCCCTTCACCCGCTCCA
D00005369 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Gly GCC -GCGGGTGTAGCTCAGG--GGT--AGAGCGCTACCTTGCCAAGGTCGAA-------------------GTCGAGGGTTCGAATCCCTTCACCCGCTCCA
D00005553 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Gly GCC -GCGGGTGTAGCTCAGG--GGT--AGAGCGCTACCTTGCCAAGGTCGAA-------------------GTCGAGGGTTCGAATCCCTTCACCCGCTCCA
D00005265 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005487 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005250 Salmonella_typhimurium_LT2 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005424 Shewanella_oneidensis_MR-1 Gly GCC -GCGACATTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGATACCTTGCCAAGGTATAG-------------------GTCATCGGTTCGAACCCGATATGTCGCTCCA
D00005428 Shigella_flexneri_2a_str._301 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005429 Shigella_flexneri_2a_str._301 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGAG-------------------GTCTCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005270 Sinorhizobium_meliloti_1021 Gly GCC -GCGGGTGTAGCTCAGG--GGT--AGAGCACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGGGCGTTCGAATCGCCTCACCCGCTCCA
D00000822 Staphylococcus_aureus Gly GCC -GCAGAAGTAGTTCAGC--GGT--AGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCA
D00005529 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Gly GCC -GCAGAAGTAGTTCAGC--GGT--AGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCA
D00005375 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Gly GCC -GCAGAAGTAGTTCAGC--GGT--AGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCA
D00005158 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Gly GCC -GCAGAAGTAGTTCAGC--GGT--AGAATACAACCTTGCCAAGGTTGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCTGCTCCA
D00005455 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Gly GCC -GCGGAAGTAGTTCAGT--GGT--AGAACACCACCTTGCCAAGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCCGCTCCA
D00005430 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Gly GCC -GCGAACGTAGTTCAGT--GGT--AGAACATCACCTTGCCAAGGTGAGG-------------------GTCGCGGGTTCGAACCCCGTCGTTCGCT---
D00005379 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Gly GCC -GCGAACGTAGTTCAGT--GGT--AGAACATCACCTTGCCAAGGTGAGG-------------------GTCGCGGGTTCGAACCCCGTCGTTCGCT---
D00005432 Streptococcus_mutans_UA159 Gly GCC -GCGAACGTAGTTCAGT--GGT--AGAACATCACCTTGCCAAGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCGTTCGCT---
D00005434 Streptococcus_mutans_UA159 Gly GCC -GCGAACGTAGTTCAGT--GGT--AGAACATCACCTTGCCAAGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAACCTATACGTAGGTT---
D00005235 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Gly GCC -GCGAACGTAGTTCAGT--GGT--AGAACACCACCTTGCCAAGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCGTTCGCT---
D00005232 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Gly GCC -GCGAACGTAGTTCAGT--GGT--AGAACATCACCTTGCCAAGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCGTTCGCT---
D00005381 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Gly GCC -GCGAACGTAGTTCAGT--GGT--AGAACATCACCTTGCCAAGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCGTTCGCT---
D00005469 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Gly GCC -GCGAACGTAGTTCAGT--GGT--AGAACATCACCTTGCCAAGGTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCGTTCGCT---
D00005483 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Gly GCC -GCGGACGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAACCTTGCCAAGGTTGAG-------------------GTCGCGAGTTCGAGCCTCGTCGTCCGCTCCA
D00005486 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Gly GCC -GCGGACGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAACCTTGCCAAGGTTGAG-------------------GTCGCGAGTTCGAGCCTCGTCGTCCGCT---
D00005421 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Gly GCC -GCGAACGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAACCTTGCCAAGGTTGAG-------------------GTCGCGAGTTCGAACCTCGTCGTTCGCTCCA
D00005422 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Gly GCC -GCGGACGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAACCTTGCCAAGGTTGAG-------------------GTCGCGAGTTCGAGCCTCGTCGTCCGCT---
D00000820 Streptomyces_lividans Gly GCC -GCGGACGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAACCTTGCCAAGGTTGAG-------------------GTCGCGAGTTCGAGCCTCGTCGTCCGCT---
D00005555 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Gly GCC -GCGGGTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCCACCTTGCCAAGGTGGAG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTAACCCGCTCCA
D00000850 Synechocystis_sp. Gly GCC -GCGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCAACCTTGCCAAGGTTGAT-------------------GTCGCGCGTTCGAATCGCGTTACCCGCT---
D00005207 Synechocystis_sp._PCC_6803 Gly GCC -GCGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCAACCTTGCCAAGGTTGAT-------------------GTCGCGCGTTCGAATCGCGTTACCCGCT---
D00005390 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Gly GCC -GCGGGCATAGCTCAGTT-GGC--AGAGCATCACCTTGCCAAGGTGAGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTGCCCGCTCCA
D00005385 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Gly GCC -GCGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCAACCTTGCCAAGGTTGAT-------------------GTCGCGCGTTCGAATCGCGTTACCCGCT---
D00005210 Thermotoga_maritima_MSB8 Gly GCC -GCGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCACCAGCTTGCCAAGCTGGGG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCGCCCGCTCCA
D00000834 Thermus_thermophilus Gly GCC -GCGGGAGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGCGGGTTCAAGTCCCGTCTCCCGCTCCA
D00005583 Thermus_thermophilus_HB27 Gly GCC --CGGGAGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGCGGGTTCAAGTCCCGTCTCCCGCTCCA
D00005585 Thermus_thermophilus_HB27 Gly GCC -GCGGGAGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGCGGGTTCAAGTCCCGTCTCCCGCTCCA
D00005586 Treponema_denticola_ATCC_35405 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCCACCTTGCCAAGGTGGAT-------------------GTCGCGAGTTCAATCCTCGTTTCCCGCT---
D00000817 Treponema_pallidum Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCCACCTTGCCAAGGTGGAA-------------------GTCGCGGGTTCGATCCCCGTTTCCCGCT---
D00005201 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGT--GGT--AGAGCGCCACCTTGCCAAGGTGGAA-------------------GTCGCGGGTTCGATCCCCGTTTCCCGCT---
D00005456 Tropheryma_whipplei_str._Twist Gly GCC -GCGGATGTGGCGCAGT--GGT--AGCGCATCACCTTGCCAAGGTGAGG-------------------GTCGCGAGTTCGAATCTCGTCATCCGCT---
D00005459 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Gly GCC -GCGGATGTGGCGCAGT--GGT--AGCGCATCACCTTGCCAAGGTGAGG-------------------GTCGCGAGTTCGAATCTCGTCATCCGCT---
D00005165 Ureaplasma_parvum_serovar_3 Gly GCC -GCAGATGTAGTTCAAT--GGT--AGAACGCAACCTTGCCAAGGTCGAG-------------------A-CGCGAGTTCGATTCTCGTCATCTGCTCCA
D00005156 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Gly GCC -GCGACACTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAACCTTGCCAAGGTTGAG-------------------GTCACGAGTTCGAACCTCGTGTGTCGCTCCA
D00005589 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Gly GCC -GCGGGAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAACCTTGCCAAGGTTGAG-------------------GTCGAGGGTTCGAACCCCTTCTCCCGCT---
D00005396 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAACCTTGCCAAGGTTGAG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005393 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAACCTTGCCAAGGTTGAG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005213 Xylella_fastidiosa_9a5c Gly GCC -ACAAAAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAACCTTGCCAAGGTTGAG-------------------GTCGCGAGTTCGAGCCTTGTTTCCCGCTCCA
D00005214 Xylella_fastidiosa_9a5c Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAACCTTGCCAAGGTTGAG-------------------GTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005461 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGCAACCTTGCCAAGGTTGAG-------------------GTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005559 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005247 Yersinia_pestis_CO92 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005402 Yersinia_pestis_KIM Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00005563 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Gly GCC -GCGGGAATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGG-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCA
D00000955 Arabidopsis_thaliana Gly GCC -GCACCAGTGGTCTAGT--GGT--AGAATAGTACCCTGCCACGGTACAG-------------------A-CCCGGGTTCAATTCCCGGCTGGTGCA---
D00005324 Arabidopsis_thaliana Gly GCC -TAACCAGTGGTCTAGT--GGT--AGAATAGTACCCTGCCACGGTACAG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGCTGGTGCA---
D00005325 Arabidopsis_thaliana Gly GCC -GCGGAAATAGCTTAAT--GGT--AGAGCATAGCCTTGCCAAGGCTAAG-------------------GTTGAGGGTTCAAGTCCCTCCTTCCGCT---
D00005326 Arabidopsis_thaliana Gly GCC -GCACCAGTGGTCTAGT--GGC--ATGATAGTACCCTGCCACGGTACAT-------------------A-CCCGGGTTCAATTCCCGGCTGGTGC----
D00005327 Arabidopsis_thaliana Gly GCC -GCACCAGTGGTCTAGT--GGT--AGAATAGTACTCTGCCACGGTACAG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGCTGGTGCA---
D00005328 Arabidopsis_thaliana Gly GCC -GCACCAGTGGTCTAGT--GGT--AGAATAGTACCCTGCCACGGTACAG-------------------A-CCCGGGTTCAATTCCCGGCTGGTGCA---
D00005329 Arabidopsis_thaliana Gly GCC -GCACCAGTGGTCTAGT--GGC--ATGATAGTACCCTGCCACGGTACAG-------------------A-CCCGGGTTCAATTCCCGGCTGGTGC----
D00005330 Arabidopsis_thaliana Gly GCC -GCACCAGTGGTCTAGT--GGT--AGAATAGTACCCTGCCACGGTACAG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGCTGGTGCA---
D00000963 Bombyx_mori Gly GCC -GCATCGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATGCTCGCCTGCCACGCGGGCG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCGATGCA---
D00000961 Caenorhabditis_elegans Gly GCC -GCATCGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATGCTCGCCTGCCACGCGGGCG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGTCGATGCA---
D00005333 Caenorhabditis_elegans Gly GCC -GCATTGGTGGCTCAGT--GGT--AGAATGCTCGCCTGCCACGCGGGCA-------------------G-CCCGGGTCCAATTCCCGGTCGATGC----
D00005334 Caenorhabditis_elegans Gly GCC -GCATCGGTGGTTCAGT--GGT--AGAAAGCTCGCCTGCCACGCGGGCG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGTCGATACA---
D00005335 Caenorhabditis_elegans Gly GCC -GCATCGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATGCTCGCCTGCCACGCGGCGG---------------------CCCGGGTTCGATTCCCGGTCGATGC----
D00005336 Caenorhabditis_elegans Gly GCC -GCATCGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATGCTCGCCTGCCACGCGTGCG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGTCGATGCA---
D00005337 Caenorhabditis_elegans Gly GCC -GCATCGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATGCTCGCCTGCCACGCGGGCG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGTCGATGCA---
D00005565 Candida_glabrata_CBS_138 Gly GCC -GCGCAAGTGGTTTAGT--GGT--AAAATCCAACGTTGCCATCGTTGGG-------------------C-CCCCGGTTCGATTCCGGGCTTGCGCA---
D00000851 Cyanophora_paradoxa Gly GCC -GCGGGTGTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCGCAACCTTGCCAAGGTTGAT-------------------GTCGCGCGTTCGAATCGCGTCACCCGCT---
D00000964 Drosophila_melanogaster Gly GCC -GCATCGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATGCTCGCCTGCCACGCGGGCG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCGATGCA---
D00000965 Drosophila_melanogaster Gly GCC -GCATCGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATGCTCGCCTGCCACGCGGGCG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGACCGATGCA---
D00005349 Drosophila_melanogaster Gly GCC -GCATCGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATGCTCGCCTGCCACGCGGGCG-------------------G-CCTGGGTTCGATTCCCGGCCGATGCA---
D00005350 Drosophila_melanogaster Gly GCC -GCATCGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATGCTCGCCTGCCACGCGGGCG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCGATGCA---
D00005399 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Gly GCC -GCATCATTGGTTTAGT--GGT--ATAATGGCCGGTTGCCATCTGGCCG-------------------A-CCCGAGTTCGATTCTCGGATGATGCA---
D00005607 Gallus_gallus Gly GCC -GCATTGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATTCTTGCCTGCCACGCGGGAG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCAATGCA---
D00005608 Gallus_gallus Gly GCC -GCATTGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATTCTCGCCTGCCACGCGGGAG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCAATGCA---
D00000970 Homo_sapiens Gly GCC -GCATTGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATTCTCGCCTGCCACGCGGGAG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCAATGCA---
D00005314 Homo_sapiens Gly GCC -GCATGGGTGATTCAGT--GGT--AGAATTTTCACCTGCCATGCAGGAG-------------------G-TCCAGGTTCATTTCCTGGCCTATGC----
D00005315 Homo_sapiens Gly GCC -GCATTGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATTCTCGCCTGCCATGCGGGCG-------------------G-CCGGGCTTCGATTCCTGGCCAATGC----
D00005316 Homo_sapiens Gly GCC -GCATAGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATTCTTGCCTGCCACGCAGGAG-------------------G-CCCAGGTTTGATTCCTGGCCCATGC----
D00005317 Homo_sapiens Gly GCC -GCATTGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATTCTCGCCTGCCACGCGGGAG-------------------G-CCCGGGTTTGATTCCCGGCCAGTGCA---
D00005318 Homo_sapiens Gly GCC -GCATTGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATTCTCGCCTGCCACGCGGGAG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCAATGCA---
D00005319 Homo_sapiens Gly GCC -GCATGGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATTCTCGCCTGCCACGCGGGAG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCCATGCA---
D00000957 Lupinus_luteus Gly GCC -GCACCAGTGGTCTAGT--GGT--AGAATAGTACCCTGCCACGGTAGAG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGCTGGTGCA---
D00000960 Oryza_sativa Gly GCC -GCACCAGTGGTCTAGT--GGT--AGAATAGTACCCTGCCACGGTACAG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGCTGGTGCA---
D00005635 Pan_troglodytes Gly GCC -GCATGGGTGATTCAGT--GGT--AGAATTTTCACCTGCCATGCAGGAG-------------------G-TCCAGGTTCATTTCCTGGCCTATGCA---
D00005636 Pan_troglodytes Gly GCC -GCATTGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATTCTCGCCTGCCATGCGGGCG-------------------G-CCGGGGTTGGATTCCTGGCCAATGCA---
D00005637 Pan_troglodytes Gly GCC -GCATAGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATTCTTGCCTGCCACGCAGGAG-------------------G-CCCAGGTTTGATTCCTGGCCCATGCA---
D00005638 Pan_troglodytes Gly GCC -GCATTGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATTCTCGCCTGCCACGCGGGAG-------------------G-CCCGGGTTTGATTCCCGGCCAGTGCA---
D00005639 Pan_troglodytes Gly GCC -GCATTGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATTCTCGCCTGCCACGCGGGAG-------------------G-CCCGGGTTTGATTCCCGGCCAATGCA---
D00005640 Pan_troglodytes Gly GCC -GCATTGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATTCTCGCCTGCCACGCGGGAG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCAATGCA---
D00005641 Pan_troglodytes Gly GCC -GCATGGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATTCTCGCCTGCCACGCGGGAG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCCATGCA---
D00005598 Plasmodium_falciparum_3D7 Gly GCC -GCATCTGTGGTCTAGT--GGT--AGAATACTTCGTTGCCATCGAAGTG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGCAGATGCA---
D00000966 Podocoryne_carnea Gly GCC -GCATTGATGGTTCAGT--GGT--AGAATTCTCGCCTGCCACGCGGGAG-------------------A-CCGGGGTTCGATTCCCCG--AATGCA---
D00000951 Saccharomyces_cerevisiae Gly GCC -GCGCAAGTGGTTTAGT--GGT--AAAATCCAACGTTGCCATCGTTGGG-------------------C-CCCCGGTTCGATTCCGGGCTTGCGCA---
D00000952 Saccharomyces_cerevisiae Gly GCC -GCGCAAGTGGTTTAGT--GGT--AAAATCCAACGTTGCCATCGTTGGG-------------------C-CCCCGGTTCGATTCCGGCGTTGCGCA---
D00005347 Saccharomyces_cerevisiae Gly GCC -GCGCAAGTGGTTTAGT--GGT--AAAATCCAACGTTGCCATCGTTGGG-------------------C-CCCCGGTTCGATTCCGGGCTTGCGCA---
D00005354 Schizosaccharomyces_pombe Gly GCC -GCTTTGGTGGTTTAGT--GGT--ATAATGAATCGTTGCCATCGATTCG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCAAAGC----
D00000959 Sorghum_bicolor Gly GCC -GCACCAGTGGTCTAGT--GGT--AGAATAGTACCCTGCCACGGTACAG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGCTGGTGCA---
D00005620 Takifugu_rubripes Gly GCC -GCATTGGTGATTCAGT--GGT--AGAATTCTCGCCTGCCACGCGGGGG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCAATGCA---
D00005621 Takifugu_rubripes Gly GCC --GCTTGGTGGTTCAAT--GGA--AGAATTCTCGCCTGCCACGCGGGAG-------------------A-CCCGGGTCCGATTCCCGGCCAATGCA---
D00005622 Takifugu_rubripes Gly GCC -GCATTGGTGGTTCAAT--GGA--AGAATTCTCGCCTGCCACGCGGGAG-------------------A-CCCGGGTCCGATTCCCGGCCAATGCA---
D00005623 Takifugu_rubripes Gly GCC -GCATTGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATTCTCTCCTGCCACGCGGGAG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCAATGCA---
D00005624 Takifugu_rubripes Gly GCC -GCATTGGTGATTCAGT--GGT--AGAATTCTCGCCTGCCACGCGGGAG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCAATGCA---
D00005625 Takifugu_rubripes Gly GCC -GCATTGGTGGTTCAGT--GGT--AGAATTCTCGCCTGCCACGCGGGAG-------------------G-CCCGGGTTCGATTCCCGGCCAATGCA---
D00005616 Gallus_gallus Gly ACC -GGAGAATTAGCTCAAAC-AGT--AGAGTACTCACTTACCATGTGAGTG-------------------GTAGCAGGATTGATGCCTACATTCTTTA---
D00000948 Plasmodium_falciparum Gly ACC -ATGAATATAATTTAAT--GAT--AAAATACAATTTTACCATAATTGTT-------------------A-TAAGAGTTTGAATCTCTTTATTCATA---
D00009028 Aeropyrum_pernix_K1 Arg CCT -GGGCCCGTAGCTCAGCCAGGAT-AGAGCGCCGGCCTCCTAAGCCGGTG-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCCCCGGGCCCGCC-
D00002410 Archaeoglobus_fulgidus Arg CCT -GGACCCGTAGCCTAGCA-GGAC-AGGGCGTGGGCCTCCTAAGCCCAAG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGCCGGGTCCG---
D00009033 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Arg CCT -GGACCCGTAGCCTAGCA-GGAC-AGGGCGTGGGCCTCCTAAGCCCAAG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGCCGGGTCCG---
D00009038 Halobacterium_sp._NRC-1 Arg CCT -GGGCGTGTGGCCAAGC--GGAC-ACGGCGAGAGGTTCCTAACCTCTAG-------------------ATCGCGGGTTCGAGTCCCGCCACGCCCG---
D00011904 Methanosarcina_acetivorans_C2A Arg CCT -GGGCGCGTGGCCTAGCCCGGAT-ATGGCGGCAGCCTCCTAAGCTGTAA-------------------ATCGGGGGTTCAAATCCCTTCGCGCCCG---
D00009168 Methanosarcina_mazei_Go1 Arg CCT -GGGCGCGTGGCCTAGCCCGGAT-ATGGCGGCAGCCTCCTAAGCTGTAA-------------------ATCGGGGGTTCAAATCCCTTCGCGCCCG---
D00011971 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Arg CCT -GGACGTGTGGCCTAGTCAGGAT-ATGGCGTCAGCCTCCTAAGCTGAAT-------------------GCCGGGGGTTCAAATCCCTCCACGTCCG---
D00009042 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Arg CCT -GGGCCCGTAGCCTAGCCAGGAT-AGGGCATCAGACTCCTAATCTGAAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGTCCG---
D00011987 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Arg CCT -GGGCCCGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGCGGCGGCCTCCTAAGCCGTAG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGCCGGGCCCG---
D00009055 Pyrococcus_abyssi_GE5 Arg CCT -GGACCGGTAGCCTAGCCAGGAC-AGGGCGGCGGCCTCCTAAGCCGCAG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCCGGTCCGCC-
D00009060 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Arg CCT -GGACCGGTAGCCTAGCCAGGAT-AGGGCGGCGGCCTCCTAAGCCGCAG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCCGGTCCGCC-
D00009065 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Arg CCT -GGACCGGTAGCCTAGCCAGGAC-AGGGCGGCGGCCTCCTAAGCCGCAG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCCGGTCCGCCA
D00012046 Staphylothermus_marinus_F1 Arg CCT -GGGCCCGTAGCCTAGCCAGGAT-AGGGCGCCGGCCTCCTAAGCCGGAG-------------------ACCCGGGGTTCGAATCCCCGCGGGCCCG---
D00012076 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Arg CCT -GGACCCGTAGCTCAGCCAGGAC-AGAGCGCCGGCCTCCTAAGCCGGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGTCCG---
D00009070 Sulfolobus_solfataricus_P2 Arg CCT -GGACCCGTAGCTCAGCCAGGAT-GGAGCGCCGGCCTCCTAAGCCGGTG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGCCGGGTCC----
D00009200 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Arg CCT -GGACCCGTAGCTCAGCCAGGAC-AGAGCGCCGGCCTCCTAAGCCGGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGTCCG---
D00009075 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Arg CCT -GGGCGCATGGCCTAGCCTGGAT-AGGGCAACAGCCTCCTAAGCTGTAG-------------------ATCAGGGGTCCAAATCCCCTTGCGCCCG---
D00009079 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Arg CCT -GGGCGCATGGCCTAGCCTGGAT-AGGGCAACAGCCTCCTAAGCTGTAG-------------------ATCAGGGGTCCAAATCCCCTTGCGCCCG---
D00009494 Acinetobacter_sp._ADP1 Arg CCT -GCGCTCTTAGCTTAACT-GGAT-AGAGCAGTTGCCTCCTAAGCGACCG-------------------A-CGTGGGTTCGAGTCCCGCAGAGCGCA---
D00002441 Agrobacterium_tumefaciens Arg CCT -GTCCACGTAGCTCAGCA-GGAT-AGAGCACAGGATTCCTAATCCTGGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTCGTGGACACCA
D00008949 Aquifex_aeolicus_VF5 Arg CCT -GTGCCCGTAGCTCAGGC-GGAT-AGAGCGCGAGATTCCTAATCTCGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGCCGGGCACACCA
D00008819 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Arg CCT -GCTCTAGTAGCACAGC--GGAT-AGTGCAGCAGTTTCCTAAACTGCAG-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCTCCTAGAGCG---
D00009373 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Arg CCT -GGCCTTGTAGTTCAAC--GGAT-AGAATAGAAGTTTCCTAAACTTTAG-------------------A-TAGGGGTTCGATTCCCCTCGGGGCTA---
D00009385 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Arg CCT -GTCTGCGTAGCTCAGTA-GGAT-AGAGCACAGGATTCCTAATCCTGGG-------------------GCCGCAGGTTCGAATCCTGCCGTAGACACCA
D00009229 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Arg CCT -GCCCGAGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGCACCGCTCTCCTAAAGCGGGT-------------------GTCGTCGGTTCGAATCCGATCTCGGGCA---
D00009277 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Arg CCT -GGTCCCGTAGCTCAGCC-GGAT-AGAGCGGCGGTTTCCTAAACCGTAG-------------------GTCGGATGTTCGAGTCATCCCGGGATCGCCA
D00008982 Brucella_melitensis_16M Arg CCT -GGTCCCGTAGCTCAGTA-GGAT-AGAGCGACAGATTCCTAATCTGTAG-------------------GTCACAGGTTCGATTCCTGTCGGGATCACCA
D00009232 Brucella_suis_1330 Arg CCT -GGTCCCGTAGCTCAGTA-GGAT-AGAGCGACAGATTCCTAATCTGTAG-------------------GTCACAGGTTCGATTCCTGTCGGGATCACCA
D00008901 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Arg CCT -GTCCTCGTAGCTCAGCA-GGAT-AGAGCGCAAAATTCCTAATTTTGAG-------------------GCCGTGAGTTCGAATCTCGCCGTGGACACCA
D00009507 Candidatus_Blochmannia_floridanus Arg CCT -GTCTTCGTAGTTAAAC--GGAT-ATAACAAGCCTCTCCTAAAGGCTAA-------------------T-TACAGGTTCGATCCCTGTCGAAGACA---
D00009400 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Arg CCT -GTTCTCGTAGCTCAGGT-GGAT-AGAGCGGTTGCCTCCTAAGCAACAG-------------------GCCGCGCGTTCGAGTCGCGCCGAGGACA---
D00008907 Caulobacter_crescentus_CB15 Arg CCT -GGCCCGGTAGCTCAGCA-GGAT-AGAGCAGCGCTTTCCTAAAGCGAAG-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCCTCCCGGGCCGCCA
D00008814 Chlamydia_trachomatis Arg CCT -GTCCTCGTAGCTCAGCA-GGAT-AGAGCGGTTGCCTCCTAAGCAGCAG-------------------GCCATGCGTTCGAATCGCATCGAGGAC----
D00008803 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Arg CCT -GTCCTCGTAGCTCAGCA-GGAT-AGAGCGGTTGCCTCCTAAGCAGCAG-------------------GCCATGCGTTCGAATCGCATCGAGGACG---
D00008807 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Arg CCT -GTCCTCGTAGCTCAGCA-GGAT-AGAGCGGTTGCCTCCTAAGCAGCAG-------------------GCCATGCGTTCGAATCGCATCGAGGACG---
D00008853 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Arg CCT -GTCCTCGTAGCTCAGCA-GGAT-AGAGCGGTTGCCTCCTAAGCAGCAG-------------------GCCATGCGTTCGAATCGCATCGAGGACG---
D00009162 Chlorobium_tepidum_TLS Arg CCT -ACCCTTGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGCAGCAGTTTCCTAAACTGTTG-------------------GTCGGCAGTTCGAGTCTGCCCAAGGGTA---
D00008976 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Arg CCT -GTGCTCGTAGCTCAGTA-GGAT-AGAGCAGCGGTTTCCTAAACCGCGT-------------------GCCGTAGGTTCGATTCCTATCGGGCACACCA
D00008960 Clostridium_perfringens_str._13 Arg CCT -GTCTCCATAGTTCAAT--GGAT-AGAACAATCCCCTCCTAAGGGATAA-------------------A-TGTAGGTTCGATTCCTACTGGGGATACCA
D00009282 Clostridium_tetani_E88 Arg CCT -GCGCTCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCAGTGGTTTCCTAAACCACGT-------------------GCCAGGGGTTCAATTCCTCTCGGGCGCACCA
D00009390 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Arg CCT -GCCCTAGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGCACGGCTCTCCTAAAGCCGGT-------------------GTCGGAGGTTCGATTCCTCTCTGGGGCA---
D00009236 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Arg CCT -GCCTTGGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGCACCGCTCTCCTAAAGCGGGT-------------------GTCGGAGGTTCGATTCCTCTCCAGGGCACCA
D00009180 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Arg CCT -GCCTTGGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGCACCGCTCTCCTAAAGCGGGT-------------------GTCGGAGGTTCGATTCCTCTCCAGGGCA---
D00009330 Coxiella_burnetii_RSA_493 Arg CCT -GCCCCGGTGGCACAGTT-GGAT-AGCGCAGTCCCCTCCTAAGGGACAG-------------------GTCACAGGTTCAAATCCTGTCCGGGGCACCA
D00008911 Deinococcus_radiodurans_R1 Arg CCT -GCACTCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCGGCCCCCTCCTAAGGGGCAG-------------------GCCACTGGTTCGACTCCAGTCGAGTGCACCA
D00009467 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Arg CCT -GCGCCTGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCGAGCGCCTCCTAAGCGCTAG-------------------GCCACAAGTTCGATTCTTGTCAGGCGCACCA
D00009289 Enterococcus_faecalis_V583 Arg CCT -GTTCTCGTAGCTCAGTA-GGAT-AGAGCAACCGCCTCCTAAGCGGTAG-------------------GTCGCTGGTTCAATTCCAGTCGGGAACG---
D00002453 Escherichia_coli Arg CCT -GTCCTCTTAGTTAAAT--GGAT-ATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAA-------------------T-TGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCA
D00009343 Escherichia_coli_CFT073 Arg CCT -GTCCTCTTAGTTAAAT--GGAT-ATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAA-------------------T-TGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCA
D00008858 Escherichia_coli_K12 Arg CCT -GTCCTCTTAGTTAAAT--GGAT-ATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAA-------------------T-TGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCA
D00008862 Escherichia_coli_O157:H7 Arg CCT -GTCCTCTTAGTTAAAT--GGAT-ATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAA-------------------T-TGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCA
D00008875 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Arg CCT -GTCCTCTTAGTTAAAT--GGAT-ATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAA-------------------T-TGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCA
D00009164 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Arg CCT -GACCCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGTGACTCCCTCCTAAGGAGTAG-------------------GTTGTGTGTTCAAGCCACATCGGGGTCGCCA
D00009424 Geobacter_sulfurreducens_PCA Arg CCT -GTCCCCGTAGCTCAGCA-GGAT-AGAGCACTTCCCTCCTAAGGAAGGG-------------------GTCGGACGTTCGAATCGTCTCGGGGACGCCA
D00009317 Helicobacter_hepaticus_ATCC_51449 Arg CCT -GTCCTCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCACACGATTCCTAATCGTGAG-------------------GTCATGCGTTCGAATCGCATCGGGGACACCA
D00002447 Helicobacter_pylori Arg CCT -GTCCTTGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGTATGATTCCTAATCGTAAG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCGCCAAGGACACCA
D00008886 Helicobacter_pylori_26695 Arg CCT -GTCCTTGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGTATGATTCCTAATCGTAAG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCGCCAAGGACACCA
D00008890 Helicobacter_pylori_J99 Arg CCT -GTCCTTGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGTATGATTCCTAATCGTAAG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCGCCAAGGACACCA
D00009427 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Arg CCT -GACCCCGTAGTTCATCT-GGAT-AGAACAATGGTCTCCTAAACCGTAG-------------------A-GGTGAGTTCGAATCTCACCGGGGTCA---
D00009290 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Arg CCT -GGGCAGTTAGCTCAGCT-GGC--AGAGCAACGGACTCTTAATCCGTGG-------------------GTCCAGGGTTCGATCCCCTGACTGCCCA---
D00009293 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Arg CCT -GGCCTCATAGCACAACT-GGAT-AGGGCACCCGCCTCCTAAGCGGTTG-------------------A-TCCCGGTTCGAGTCCGGGTGAGGTCA---
D00009433 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Arg CCT -GCCTCTGTAGCTCAGT--GGA--AGAGCGAGTGCGTCCTAAGCACCAG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCAGGGGCA---
D00009239 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Arg CCT -GCTCCCGTAGCTCAGGT-GGAC-AGAGCAGAAGTTTCCTAAACTTTTG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCTCGGGGGCA---
D00008953 Listeria_innocua_Clip11262 Arg CCT -GCCCATATAGTTAAAC--GGAT-ATAACAAGCCCCTCCTAAGGGCTAG-------------------T-TCGTGGTTCGATTCCGCGTATGGGCG---
D00008957 Listeria_monocytogenes_EGD-e Arg CCT -GCCCATATAGTTAAAC--GGAT-ATAACAAGCCCCTCCTAAGGGCTAG-------------------T-TCGTGGTTCGATTCCGCGTATGGGCG---
D00009472 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Arg CCT -GCCCATATAGTTAAAC--GGAT-ATAACAAGCCCCTCCTAAGGGCTAG-------------------T-TCGTGGTTCGATTCCGCGTATGGGCG---
D00008986 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Arg CCT -GGTCCCGTAGCTCAGTA-GGAT-AGAGCGGCAGATTCCTAATCTGTAG-------------------GTCACAGGTTCGATTCCTGTCGGGATCACCA
D00009319 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Arg CCT -GCCCTCGTAGCTCAGG--GGAT-AGAGCACGGCTCTCCTAAAGCCGGT-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCCGGGGGCA---
D00008847 Mycobacterium_leprae_TN Arg CCT -GCCCTCGTAGCTCAGG--GGAT-AGAGCACGGCTCTCCTAAAGCCGGT-------------------GTCACAGGTTCGAATCCTGTCGGGGGCA---
D00008826 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Arg CCT -GCCCTCGTAGCTCAGG--GGAT-AGAGCACGGCTCTCCTAAAGCCGGT-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCCGGGGGCA---
D00009395 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Arg CCT -GCCCTCGTAGCTCAGG--GGAT-AGAGCACGGCTCTCCTAAAGCCGGT-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCCGGGGGCA---
D00002423 Mycoplasma_genitalium Arg CCT -CTTCCCTTGGTGCAAT--GGAC-AGCACAACTGAGTCCTAATCAGTAA-------------------A-TAGAGGTTCAACTCCTCTAGGGAAGGCCA
D00008913 Mycoplasma_genitalium_G37 Arg CCT -CTTCCCTTGGTGCAAT--GGAC-AGCACAACTGAGTCCTAATCAGTAA-------------------A-TAGAGGTTCAACTCCTCTAGGGAAGGCCA
D00008917 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Arg CCT -CTTCCCTTGGTGTAAT--GGAT-AACACGACTGAGTCCTAATCAGTAA-------------------A-TGGAGGTTCGATTCCTCTAGGGAAGGCCA
D00008831 Neisseria_meningitidis_MC58 Arg CCT -CTCGCCATAGTTCAAC--GGAT-AGAACGTATGCCTCCTAAGCGTAAA-------------------A-TACAGGTTCGATTCCTGTTGGCGAGG---
D00008834 Neisseria_meningitidis_Z2491 Arg CCT -CTCGCCATAGTTCAAC--GGAT-AGAACGTATGCCTCCTAAGCGTAAA-------------------A-TACAGGTTCGATTCCTGTTGGCGAGG---
D00009364 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Arg CCT -GCCCTGGTAGCTCAGG--GGAT-AGAGCGACCCCCTCCTAAGGGGTAG-------------------GTCGGACGTTCGATTCGTCTCCAGGGCGCCA
D00009007 Nostoc_sp._PCC_7120 Arg CCT -GGGGCTGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCGAGCGCCTCCTAAGCGCTAG-------------------GTCGTGCGTTCAAGTCGCACCAGTCCCG---
D00009245 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Arg CCT -GCCCTCGTAGCTCAGG--GGAT-AGAGCATCGGTTTCCTAAACCGTGT-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCCGGGGGCG---
D00009404 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Arg CCT -GTCCCCTTAGTTAAAT--GGAT-ATAACAAGCCCCTCCTAAGGGCTAA-------------------T-TGCTGGTTCGATTCCAGCAGGGGACGCCA
D00009436 Porphyromonas_gingivalis_W83 Arg CCT -GGCTCTGTAGTTCAAT--GGAT-AGAATAGTGGTTTCCTAAACCATAG-------------------A-TTCGGGTTCGATTCCCGACGGAGCTACCA
D00002457 Prochlorococcus_marinus Arg CCT -GGGGCTGTAGCTCAGTA-GGAT-AGAGCGACGGTTTCCTAAACCGTAG-------------------GTCGTCCCTTCGCCTCCCGCCAGCCCCG---
D00009476 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Arg CCT -GGCCCCGTAGCTCAGG--GGAT-AGAGCAGTGGTTTCCTAAACCATGT-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTATCGGGGCCG---
D00008932 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Arg CCT -GTCCCGGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCATCCCCCTCCTAAGGGGAAG-------------------GTTGGAGGTTCGACCCCTCTCCGGGACGCCA
D00009376 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Arg CCT -GTCTCAGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCATCCCCCTCCTAAGGGGAAG-------------------GTTGCAGGTTCGAACCCCGCCTGGGACACCA
D00009001 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Arg CCT -CTCGCCGTAGCACAAT--GGAT-AGTGCACGCGCCTCCTAAGCGTGAG-------------------A-TACAGGTTCGATTCCTGTCGGCGGGACCA
D00009360 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Arg CCT -GCCCTCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAGCGCATTCCTAACGCGCAG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCTGTCGGGGGTA---
D00009407 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Arg CCT -GGTCCCGTAGCTCAGCC-GGAT-AGAGCGGCGGTTTCCTAAACCGTAG-------------------GTCGGATGTTCGAGTCATCCCGGGATCGCCA
D00009019 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Arg CCT -CCGCCACTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCATCAACCTCCTAAGTTGATG-------------------GTGCGAGGTTCGAGGCCTCGGTGGCGGTCCA
D00009020 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Arg CCT -GTCCCCTTAGTTAAAT--GGAT-ATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAG-------------------T-TGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCA
D00009350 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Arg CCT -GTCCCCTTAGTTAAAT--GGAT-ATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAG-------------------T-TGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCA
D00009351 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Arg CCT -CCGCCACTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCATCAACCTCCTAAGTTGATG-------------------GTGCGAGGTTCGAGGCCTCGGTGGCGGTCCA
D00008995 Salmonella_typhimurium_LT2 Arg CCT -CCGCCACTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCATCAACCTCCTAAGTTGATG-------------------GTGCGAGGTTCGAGGCCTCGGTGGCGGTCCA
D00008997 Salmonella_typhimurium_LT2 Arg CCT -GTCCCCTTAGTTAAAT--GGAT-ATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAG-------------------T-TGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCA
D00009257 Shewanella_oneidensis_MR-1 Arg CCT -CTCTTCATAGCTCAACA-GGAT-AGAGCAGCCGCCTCCTAAGCGGCCG-------------------A-TCGGGGTTCGAGTCCCTGTGGAGAGACCA
D00009259 Shigella_flexneri_2a_str._301 Arg CCT -GTCCTCTTAGTTAAAT--GGAT-ATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAA-------------------T-TGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGACACCA
D00009026 Sinorhizobium_meliloti_1021 Arg CCT -GGTCCCGTAGCTCAGCA-GGAT-AGAGCACCAGATTCCTAATCTGGGG-------------------GTCGCGCGTTCGAATCGCGCCGGGATCACCA
D00009267 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Arg CCT -GTCCCCTTAGTTCAAT--GGAT-ATAACAACTCCCTCCTAAGGAGTAA-------------------T-TGCTGGTTCGATTCCGGCAGGGGACA---
D00009188 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Arg CCT -GTCCCCTTAGTTCAAT--GGAT-ATAACAACTCCCTCCTAAGGAGTAA-------------------T-TGCTGGTTCGATTCCGGCAGGGGACA---
D00009270 Streptococcus_mutans_UA159 Arg CCT -GTCCCCTTAGTTAAAT--GGAT-ATAACATCTCCCTCCTAAGGAGCAG-------------------T-TGCTGGTTCGATTCCGGCAGGGGATA---
D00008972 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Arg CCT -GCTCCCTTAGTTCAAT--GGAT-ATAACAACTCCCTCCTAAGGAGTAG-------------------T-TGCAGGTTCGATTCCTGCAGGGGGCA---
D00008968 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Arg CCT -GACCCCTTAGTTCAAT--GGAT-ATAACAACTCCCTCCTAAGGAGTAG-------------------T-TGCTGGTTCGATTCCGGCAGGGGTCA---
D00009192 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Arg CCT -GACCCCTTAGTTCAAT--GGAT-ATAACAACTCCCTCCTAAGGAGTAG-------------------T-TGCTGGTTCGATTCCGGCAGGGGTCA---
D00009326 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Arg CCT -GACCCCTTAGTTCAAT--GGAT-ATAACAACTCCCTCCTAAGGAGTAG-------------------T-TGCTGGTTCGATTCCGGCAGGGGTCA---
D00009347 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Arg CCT -GCCTTCGTAGCTCAGG--GGAT-AGAGCACCGCTCTCCTAAAGCGGGT-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCCGGGGGCACCA
D00009247 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Arg CCT -GCCTCCGTAGCTCAGG--GGAT-AGAGCACCGCTCTCCTAAAGCGGGT-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCCGGGGGCA---
D00002463 Streptomyces_venezuelae Arg CCT -GCCTTCGTAGCTCAGG--GGAT-AGAGCACCGCTCTCCTAAAGCGGGT-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCCGGGGGCACCA
D00009442 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Arg CCT -GCGCCCGTAGCTCAGCA-GGAT-AGAGCAGCAGTTTCCTAAACTGTTG-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCCTCCGGGCGCGCCA
D00002465 Synechocystis_sp. Arg CCT -GAGGTTGTAGCTCAGAC-GGAT-AGAGCAAGCGCCTCCTAAGCGCTGG-------------------GCCGCCGGTTCGACTCCGGCCAACCTCG---
D00008936 Synechocystis_sp._PCC_6803 Arg CCT -GAGGTTGTAGCTCAGAC-GGAT-AGAGCAAGCGCCTCCTAAGCGCTGG-------------------GCCGCCGGTTCGACTCCGGCCAACCTCG---
D00009205 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Arg CCT -GCGCCCGTAGCTCAGAA-GGAT-AGAGCAGCAGTTTCCTAAACTGCGT-------------------GCCGGAGGTTCGAGTCCTCTCGGGCGCACCA
D00009197 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Arg CCT -GGGGCTGTAGCTCAGTC-GGAT-AGAGCGAGCGCCTCCTAAGCGCTAG-------------------GCCGTGCGTTCAAATCGCACCAGTCCCG---
D00008939 Thermotoga_maritima_MSB8 Arg CCT -GCCCCCGTAGTTCAAC--GGAT-AGAACGGCGGATTCCTAATCCGCAG-------------------A-TGGAGGTTCGATTCCTCCCGGGGGCACCA
D00009483 Thermus_thermophilus_HB27 Arg CCT -GCGCCCGTAGCTCAGCA-GGAT-AGAGCGGGGGCTTCCTAAGCCCTAG-------------------GCCGGGGGTTCGAATCCCTCCGGGCGCACCA
D00009485 Treponema_denticola_ATCC_35405 Arg CCT -GATCCGTTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCGGCTGCCTCCTAAGCAGCAG-------------------GTCGGACGTTCGAATCGTCTACGGGTCA---
D00002433 Treponema_pallidum Arg CCT -GATCCATTAGCTCAGC--GGAG-AGAGCGGCCGCCTCCTAAGCGGCAG-------------------GTCGGACGTTCAAGTCGTCCATGGATCA---
D00008925 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Arg CCT -GATCCATTAGCTCAGC--GGAG-AGAGCGGCCGCCTCCTAAGCGGCAG-------------------GTCGGACGTTCAAGTCGTCCATGGATCA---
D00009299 Tropheryma_whipplei_str._Twist Arg CCT -GCCTCTGTAGCTCAAT--GGA--AGAGCGGTTCCGTCCTAAGGAAATG-------------------GTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCAGGGGCG---
D00009305 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Arg CCT -GCCTCTGTAGCTCAAT--GGA--AGAGCGGTTCCGTCCTAAGGAAATG-------------------GTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCAGGGGCG---
D00009489 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Arg CCT -GGGACTATAGCTCAGCA-GGAT-AGAGCGTTGGACTCCTAATCTGAAG-------------------GTCGTGCGTTCGAATCGCACTAGTCCCACCA
D00009215 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Arg CCT -GGCCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGTCCCCCTCCTAAGGGGAAG-------------------GTCGCCCGTTCGAATCGGGCCGGGGTCACCA
D00009211 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Arg CCT -GGCCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGTCCCCCTCCTAAGGGGAAG-------------------GTCGCCCGTTCGAATCGGGCCGGGGTCACCA
D00008945 Xylella_fastidiosa_9a5c Arg CCT -GGCCTCGTGGCGCAATT-GGAT-AGCGCGACGACCTCCTAAGTCGTAG-------------------GTTGTGGGTTCGAATCCCGCCGGGGCCACCA
D00009308 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Arg CCT -GGCCTCGTGGCGCAATT-GGAT-AGCGCGACGACCTCCTAAGTCGTAG-------------------GTTGTGGGTTCAAATCCCGCCGGGGCCACCA
D00009450 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Arg CCT -GTCCCCGTAGTTAAAC--GGAT-ATAACAAGCCCCTCCTAAGGGCTAG-------------------T-TACTGGTTCGATTCCAGTCGGGGACACCA
D00008990 Yersinia_pestis_CO92 Arg CCT -GTCCCCGTAGTTAAAC--GGAT-ATAACAAGCCCCTCCTAAGGGCTAG-------------------T-TACTGGTTCGATTCCAGTCGGGGACACCA
D00009224 Yersinia_pestis_KIM Arg CCT -GTCCCCGTAGTTAAAC--GGAT-ATAACAAGCCCCTCCTAAGGGCTAG-------------------T-TACTGGTTCGATTCCAGTCGGGGACACCA
D00009455 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Arg CCT -GTCCCCGTAGTTAAAC--GGAT-ATAACAAGCCCCTCCTAAGGGCTAG-------------------T-TACTGGTTCGATTCCAGTCGGGGACACCA
D00009109 Arabidopsis_thaliana Arg CCT -GCGCATGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGCGTCTGTTTCCTAAGCAGAAG-------------------GTCGTAGGTTTGACCCCTACCTGGCAC----
D00009110 Arabidopsis_thaliana Arg CCT -GCGCCTGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGCGTCTGTTTCCTAAGCAGAAA-------------------GTCGAAGGTTCGACCCCTTCCTGGCGC----
D00009111 Arabidopsis_thaliana Arg CCT -GCGTCTGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGCGTCTGTTTCCTAAGCAGAAG-------------------GTCGTAGGTTCGACCCCTACCTGACGC----
D00009112 Arabidopsis_thaliana Arg CCT -GCGCCTGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGCGTCTGTTTCCTAAGCAGAAG-------------------GTCGTAGGTTCGACCCCTACCTGGCGC----
D00009128 Caenorhabditis_elegans Arg CCT -GCCACGGTGGCCGAGTGTGGTCAAAGGCGTGAGACTCCTGATCTCTTTCGG-----GCAA----CCGATCGCAGGTTCGAATCCTGCCCGTGGC----
D00009129 Caenorhabditis_elegans Arg CCT -GGCCGTGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCGGTCTCCTAAACCGAAG-------------------ACTGCAGGTTCGAGTCCTGCCTCGGTC----
D00009458 Candida_glabrata_CBS_138 Arg CCT -GGTCCGTTGGCGTAAT--GGT--AACGCGTCTCCCTCCTAAGGAGAAG-------------------ACTGCGGGTTCGAGTCCCGTACGGATCG---
D00009145 Drosophila_melanogaster Arg CCT -GCCCCAGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCATCGGCCTCCTAAGCCGGGG-------------------ATTGTGGGTTCGAGTCCCATCTGGGGT----
D00009219 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Arg CCT -GTTCCTGTAGCTCAGTC-GGT--AGAGCGCGGCTCTCCTAAAGCTGAG-------------------GTCGTGGGTTCAAGTCCCACCTGGAACG---
D00009515 Gallus_gallus Arg CCT -GCCCCAGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCACTGGCCTCCTAAGCCAGGG-------------------ACTGTCGGTTCGAGTCCCATCTGGGGTG---
D00009516 Gallus_gallus Arg CCT -CCCCCAGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCATTGGCCTCCTAAGCCAGGG-------------------ATTGTGGGTTCGAGTCCCATCTGGGGTG---
D00009517 Gallus_gallus Arg CCT -GCCCCAGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCACTGGCCTCCTAAGCCAGGG-------------------ATTGTGGGTTCGAGTCCCATCTGGGGTG---
D00009085 Homo_sapiens Arg CCT -GCCCCAGTGGCCTGAT--GGAT-AAGGTACTGGCCTCCTAAGCCAGGG-------------------ATTGTGGGTTCGAGTTCCACCTGGGGT----
D00009086 Homo_sapiens Arg CCT -GCCCCAGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCACTGGCCTCCTAAGCCAGGG-------------------ATTGTGGGTTCGAGTCCCACCTGGGGT----
D00009087 Homo_sapiens Arg CCT -GCCCCGGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCATTGGCCTCCTAAGCCAGGG-------------------ATTGTGGGTTCGAGTCCCACCCGGGGT----
D00009088 Homo_sapiens Arg CCT -GCCCCAGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCACTGGCCTCCTAAGCCAGGG-------------------ATTGTGGGTTCGAGTCCCACCTGGGGT----
D00009557 Pan_troglodytes Arg CCT -GCCCCGGTGGCCTAAT--GGAT-AAGACATTGGCCTCCTAAGCCAGGG-------------------ATTGTGGGTTCGAGTCCCACCCGGGGTA---
D00009558 Pan_troglodytes Arg CCT -GCCCCAGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCATTGGCCTCCTAAGCCAGGG-------------------ATTGTGGGTTCGAGTCCCATCTGGGGTG---
D00009559 Pan_troglodytes Arg CCT -GCCCCAGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCACTGGCCTCCTAAGCCAGGG-------------------ATTGTGGGTTCGAGTCCCACCTGGGGTG---
D00009560 Pan_troglodytes Arg CCT -GCCCCAGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCACTGGCCTCCTAAGCCAGGG-------------------ATTGTGGGTTCGAGTCCCACCTGGGGTA---
D00009499 Plasmodium_falciparum_3D7 Arg CCT -GCACCAGTGGCGTAATT-GGAT-AGCGCAATGCCTTCCTAAGGCAAAG-------------------GTTATGGGTTCGAGTCCCATCTGGTGTA---
D00002587 Saccharomyces_cerevisiae Arg CCT -GTTCCGTTGGCGTAAT--GGT--AACGCGTCTCCCTCCTAAGGAGAAG-------------------ACTGCGGGTTCGAGTCCCGTACGGAACG---
D00009142 Saccharomyces_cerevisiae Arg CCT -GTTCCGTTGGCGTAAT--GGT--AACGCGTCTCCCTCCTAAGGAGAAG-------------------ACTGCGGGTTCGAGTCCCGTACGGAACG---
D00009155 Schizosaccharomyces_pombe Arg CCT -TTACGCGTGGCGCAAT--GGT--AGCGCATCTCATTCCTAACGAGAAG-------------------GTTGCGGGTTCGAGTCCCGTCGTGTAA----
D00009531 Takifugu_rubripes Arg CCT -GCCCTAGTGGCCTAAT--GGAC-AAGGCACTGGCCTCCTAAGCCAGGG-------------------ATTGTGGGTTCAAATCCCATCTGGGGTG---
D00009532 Takifugu_rubripes Arg CCT -GCCCCAGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCACTGGCCTCCTAAGCCAGGG-------------------ATTGTGGGTTCAAGTCCCATCTGGGGTG---
D00009533 Takifugu_rubripes Arg CCT -GCCCCAGTGGCCTAAT--GGAC-AAGGCACTGGCCTCCTAAGCCAGGG-------------------ATTGTGGGTTCGAATCCCATCTGGGGTG---
D00009534 Takifugu_rubripes Arg CCT -GCCCCAGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCACTGGCCTCCTAAGCCAGGG-------------------ATTGTGGGTTCGAGTCCCATCTGGGGTG---
D00009535 Takifugu_rubripes Arg CCT -GCCCCAGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCACTGGCCTCCTAAGCCAGAG-------------------ATTGTGGGTTCAAGTCCCATCTGGGGTG---
D00002577 Trypanosoma_brucei Arg CCT -GCCCCCGTAGCCCAAT--GGAT-AAGGCGTTCGCTTCCTAAGCGAAAG-------------------ATTGCGGGTTCGAGTCCCGCCGGAGGTA---
D00009031 Aeropyrum_pernix_K1 Arg TCT -GGGCCCGTAGCTCAGCCAGGAC-AGAGCGCCGGCCTTCTAAGCCGGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGCCCGCC-
D00002414 Archaeoglobus_fulgidus Arg TCT -GGGCCCGTGGCTCAGCATGGAT-AGAGCGACGGCCTTCTAAGCCGTAG-------------------ATCGCGGGTTCAAATCCCGCCGGGTCCG---
D00009036 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Arg TCT -GGGCCCGTGGCTCAGCATGGAT-AGAGCGACGGCCTTCTAAGCCGTAG-------------------ATCGCGGGTTCAAATCCCGCCGGGTCCG---
D00009041 Halobacterium_sp._NRC-1 Arg TCT -GGGCGCGTAGCTCAGTCCGGAC-AGAGCGTTCGGCTTCTAACCGAAAT-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCCTCGTGCCCG---
D00002415 Methanocaldococcus_jannaschii Arg TCT -GGACCCGTAGCCTAGCCTGGAT-AGGGCACCGGCCTTCTAAGCCGGGG-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCCTCGGGTCCG---
D00009048 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Arg TCT -GGACCCGTAGCCTAGCCTGGAT-AGGGCACCGGCCTTCTAAGCCGGGG-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCCTCGGGTCCGCC-
D00011852 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Arg TCT -GGGCCCGTGGCCTAGTCTGGAT-ACGGCACCGGCCTTCTAAGCCGGGG-------------------ATCGGGGGTTCAAATCCCTCTGGGTCCG---
D00009051 Methanococcus_maripaludis Arg TCT -GGGCCCGTGGCCTAGTCTGGAT-ACGGCACCGGCCTTCTAAGCCGGGG-------------------ATCGGGGGTTCGAATCCCTCCGGGTCCGCC-
D00002418 Methanococcus_vannielii Arg TCT -GGGCCCGTGGCCTAGTCTGGAT-ACGGCACCGGCCTTCTAAGCCGGGG-------------------ATCGGGGGTTCAAATCCCTCCGGGTCCG---
D00009226 Methanopyrus_kandleri_AV19 Arg TCT -GGGCCCGCAGCTCAGCCTGGAC-AGAGCGCGGGGCTTCTAACCCCGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGTCCGCCA
D00011903 Methanosarcina_acetivorans_C2A Arg TCT -GGGCTCGTGGCTTAGCCAGGAT-ATAGCGCTGGGCTTCTAACCCAGAC-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCTTCGAGCCCG---
D00009171 Methanosarcina_mazei_Go1 Arg TCT -GGGCTCGTGGCTTAGCCAGGAT-ATAGCGCTGGGCTTCTAACCCAGAC-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCTTCGAGCCCG---
D00011974 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Arg TCT -GGGCCTGTGGCTTAGCCAGGAT-ATAGCGTCGGGCTTCTAACCCGAAT-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCAGGTCCG---
D00009045 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Arg TCT -GGGCCCGTAGCCTAGCCAGGAT-AGGGCGTCGGACTTCTAATCCGAAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGTCCG---
D00012002 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Arg TCT -GGGCCCGTAGCTCAGCTTGGT--AGAGCGGCGGCCTTCTAAGCCGTAG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGCCGGGCCCG---
D00009053 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Arg TCT -GGGCCCGTAGCTCAGCCTGGAT-AGAGCGGCGGCCTTCTAAGCCGTAG-------------------GTCGTGGGTTCAAATCCCATCGGGCCCGCCA
D00009058 Pyrococcus_abyssi_GE5 Arg TCT -GGGCCCGTAGCCTAGCA-GGAT-AGGGCGCCGGCCTTCTAAGCCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGCCGGGCCCGCC-
D00009063 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Arg TCT -GGGCCCGTAGCCTAGCA-GGAT-AGGGCGCCGGCCTTCTAAGCCGGAG-------------------GTCCCGGGTTCGAATCCCGGCGGGCCCGCC-
D00009068 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Arg TCT -GGGCCCGTAGCCTAGCA-GGAT-AGGGCGCCGGCCTTCTAAGCCGGAG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCCGCCGGGCCCGCCA
D00012034 Staphylothermus_marinus_F1 Arg TCT -GGGCCCGTGGCCTAGCCTGGAT-AGGGCGCCGGCCTTCTAAGCCGGAG-------------------ACCCGGGGTTCGAATCCCCGCGGGCCCG---
D00012096 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Arg TCT -GGACCCGTAGCTCAGCCAGGAC-AGAGCGCCGGCCTTCTAAGCCGGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGTCCG---
D00009073 Sulfolobus_solfataricus_P2 Arg TCT -GGACCCGTAGCTCAGCCAGGAC-GGAGCGCCGGCCTTCTAAGCCGGCG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGTCC----
D00009203 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Arg TCT -GGACCCGTAGCTCAGCCAGGAT-AGAGCGCCGGCCTTCTGAGCCGGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGTCCG---
D00009077 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Arg TCT -GGGCCCGTGGCCTAGCTAGGAT-AAGGCACCGTCCTTCTAAGTCGGGA-------------------ATCGTGGGTCCAAATCCCACCGGGCCCG---
D00009081 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Arg TCT -GGGCCCGTGGCCTAGCTAGGAT-AAGGCACCGTCCTTCTAAGTCGGGA-------------------ATCGTGGGTCCAAATCCCACCGGGCCCG---
D00002430 Acholeplasma_laidlawii Arg TCT -GTCCGAATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAATAGCCTTCTAAGCTATCG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTTCGGACGCCA
D00009495 Acinetobacter_sp._ADP1 Arg TCT -GCGCCTGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCATCCGCCTTCTAAGCGGATG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCTGTCAGGCGCGCCA
D00009015 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Arg TCT -GGCCCCTTAGCTCAACT-GGAT-AGAGCAACTGCCTTCTAAGCAGTAG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCAGGGGTCGCCA
D00008950 Aquifex_aeolicus_VF5 Arg TCT -GGGCCCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCAGGGGATTTCTAATCCCCAG-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCCTCCGGGCCCACCA
D00009380 Bacillus_anthracis_str._Ames Arg TCT -GTCCCAGTAGCTCAGCC-GGAT-AGAGCATACGCCTTCTAAGCGTACG-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCTCCTGGGACG---
D00009418 Bacillus_anthracis_str._Sterne Arg TCT -GTCCCAGTAGCTCAGCC-GGAT-AGAGCATACGCCTTCTAAGCGTACG-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCTCCTGGGACG---
D00009334 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Arg TCT -GTCCCAGTAGCTCAGCC-GGAT-AGAGCATACGCCTTCTAAGCGTACG-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCTCCTGGGACG---
D00009276 Bacillus_halodurans_C-125 Arg TCT -GTCCCAGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTCG-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCTCCTGGGACGCCA
D00008820 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Arg TCT -GTCCCAGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTCG-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCTCCTGGGACG---
D00009368 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Arg TCT -GGTTCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACGCCCTTCTAAGGCGTGG-------------------GTCAAGCGTTCGAATCGCTTCGGAATCA---
D00009384 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Arg TCT -GGTCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTGG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCTGTCGGGATCGCCA
D00009504 Bartonella_quintana_str._Toulouse Arg TCT -GGTCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTGG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCTGTCGGGATCGCCA
D00009388 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Arg TCT -GGTTCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCATCTCCCTTCTAAGGAGAGG-------------------GTCGTACGTTCGAGTCGTACCGGAATCACCA
D00009228 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Arg TCT -GGCCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCATGTGACTTCTAATCTCAAG-------------------GTCGACGGTTCGAGCCCGTCCGGGGTCA---
D00002439 Borrelia_burgdorferi Arg TCT -GCACCAATAGCTCAATT-GGAT-AGAGCAACAGACTTCTAATCTGTAG-------------------GTTTTAGGTTCGAGTCCTAATTGGTGCG---
D00008900 Borrelia_burgdorferi_B31 Arg TCT -GCACCAATAGCTCAATT-GGAT-AGAGCAACAGACTTCTAATCTGTAG-------------------GTTTTAGGTTCGAGTCCTAATTGGTGCG---
D00009422 Borrelia_garinii_PBi Arg TCT -GCATCAATAGCTCAATT-GGAT-AGAGCAACAGACTTCTAATCTGTAG-------------------GTTTTAGGTTCGAGTCCTAATTGGTGCG---
D00009279 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Arg TCT -GGTCCCATAGCTCAACT-GGAT-AGAGTAGCGGATTTCTACTCCGCGG-------------------GTTGCAGGTTCGAGTCCTGCTGGGATCGCCA
D00008984 Brucella_melitensis_16M Arg TCT -GGTCCCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCACCGGCCTTCTAAGCCGATG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCCGGGATCGCCA
D00009233 Brucella_suis_1330 Arg TCT -GGTCCCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCACCGGCCTTCTAAGCCGATG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCCGGGATCGCCA
D00008823 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Arg TCT -GCGTTCTTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTAG-------------------GTCACAGGTTCAAATCCTGTAGAACGCA---
D00009337 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Arg TCT -GCGCTCTTAGCTCAGAT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTAG-------------------GTCATAGGTTCGAATCCTATAGAGCGCA---
D00009173 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Arg TCT -GCGTTCTTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTAG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCTGTAGAACGCA---
D00008904 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Arg TCT -GCGTTCATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTAG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTTGGGCGTACCA
D00009508 Candidatus_Blochmannia_floridanus Arg TCT -GCGCTCTTAACTCAATA-GGAT-AGAGTAACGGCCTTCTAAGCCGTAA-------------------GTTATAGGTTCGAATCCTATAGAGCGCA---
D00009402 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Arg TCT -GGACTGATAGCTCAGT--GGAT-AGAGCACCCGCCTTCTAAGCGGGTG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTACTCGGTCCG---
D00008908 Caulobacter_crescentus_CB15 Arg TCT -GCGCCCTTAGCTCAGAC-GGAT-AGAGCATTCGCCTTCTAAGCGAACG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCA
D00008963 Chlamydia_muridarum_Nigg Arg TCT -GGACCGATAGCTCAGT--GGAT-AGAGCATCCGCCTTCTAAGCGGATG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCTCGGTCCG---
D00008816 Chlamydia_trachomatis Arg TCT -GGACCGATAGCTCAGT--GGAT-AGAGCATTCGCCTTCTAAGCGAATG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCTCGGTCC----
D00008812 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Arg TCT -GGACCGATAGCTCAGT--GGAT-AGAGCATCCGCCTTCTAAGCGGATG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCTCGGTCCG---
D00008805 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Arg TCT -GGACCGATAGCTCAGT--GGAT-AGAGCATTCGCCTTCTAAGCGAATG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCTCGGTCCG---
D00008809 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Arg TCT -GGACCGATAGCTCAGT--GGAT-AGAGCATTCGCCTTCTAAGCGAATG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCTCGGTCCG---
D00008855 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Arg TCT -GGACCGATAGCTCAGT--GGAT-AGAGCATTCGCCTTCTAAGCGAATG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCTCGGTCCG---
D00009160 Chlorobium_tepidum_TLS Arg TCT -GTGCCCGTAGCTCAACC-GGAT-AGAGCATCAGCCTTCTAAGCTGAGG-------------------GTTACAGGTTCGAGTCCTGTCGGGCATA---
D00008978 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Arg TCT -GCGTTTTTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTGG-------------------GCCAGGGGTTCGAATCCCTTAAAACGCACCA
D00008962 Clostridium_perfringens_str._13 Arg TCT -GTATCTTTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTGG-------------------GTCAGGGGTTCGAATCCCTTAAGGTACACCA
D00009285 Clostridium_tetani_E88 Arg TCT -GCGTCTTTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTGT-------------------GCCAGGGGTTCGACTCCCTTAAGACGCACCA
D00009392 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Arg TCT -GCCTCCATAGCTCAGT--GGATTAGAGCAGTCGGCTTCTACCCGATTG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCTGCTGGGGGCA---
D00009238 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Arg TCT -GCCTCCATAGCTCAGT--GGATTAGAGCAACCGGCTTCTACCCGGTTG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCTGCTGGGGGCGCAA
D00009182 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Arg TCT CGCCTCCATAGCTCAGT--GGATTAGAGCAACCGGCTTCTACCCGGTTG-------------------GTCGCGGGTTCGAATCCTGCTGGGGGCA---
D00009328 Coxiella_burnetii_RSA_493 Arg TCT -GCGCCCGTAGCTCACTC-GGAT-AGAGCATCGGCCTTCTAAGCCGAGG-------------------GTAGCAGGTTCGAATCCTGCCGGGCGCG---
D00008912 Deinococcus_radiodurans_R1 Arg TCT -GCACCCTTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACCGCCTTCTAAGCGGTCG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTACAGGGTGCACCA
D00009468 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Arg TCT -GCGCCCGTAGCTCAGTT-GGAA-AGAGCAGGAGCCTTCTAAGCTCTTG-------------------GCCGGGGGTTCGAATCCTCCCGGGCGCGCCA
D00009288 Enterococcus_faecalis_V583 Arg TCT -GTCATAGTAGCTCAGCA-GGAT-AGAGCATCCGCCTTCTAAGCGGACG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCTGTGACG---
D00002451 Escherichia_coli Arg TCT -GCGCCCTTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCAACGACCTTCTAAGTCGTGG-------------------GCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCA
D00009339 Escherichia_coli_CFT073 Arg TCT -GCGCCCTTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCAACGACCTTCTAAGTCGTGG-------------------GCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCA
D00009340 Escherichia_coli_CFT073 Arg TCT -CCGCCACTGGCTCATC--GGGAAAGAGCATCAGCCTTCTAAGTTGACT-------------------GTGCGAGGTTCGAGTCCTCGGTGGCGGTCCA
D00009342 Escherichia_coli_CFT073 Arg TCT -GCGTTGTTAGCTCAGCA-GGAC-AGAGCAATTGCCTTCTAAGCAATCG-------------------GTCAGTGGTTCGAATCCAGTACAACGCGCCA
D00008859 Escherichia_coli_K12 Arg TCT -GCGCCCTTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCAACGACCTTCTAAGTCGTGG-------------------GCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCA
D00008865 Escherichia_coli_O157:H7 Arg TCT -GCGTTTTTAGCTCAGCA-GGAC-AGAGCAATTGCCTTCTAAGCAATCG-------------------GTCACTGGTTCGACTCCAGTACAACGCGCCA
D00008866 Escherichia_coli_O157:H7 Arg TCT -GCGTTTTTAGCTCAGCC-GGAC-AGAGCAATTGCCTTCTAAGCAATCG-------------------GTCACTGGTTCGAACCCAGTACAACGCACCA
D00008867 Escherichia_coli_O157:H7 Arg TCT -GCGTTGTTAGCTCAGCC-GGAC-AGAGCAATTGCCTTCTAAGCAATCG-------------------GTCAGTGGTTCGACTCCACTACAACGCGCCA
D00008868 Escherichia_coli_O157:H7 Arg TCT -GCGTTGTTAGCTCAGCC-GGAC-AGAGCAATTGCCTTCTGAGCAATCG-------------------GTCACTGGTTCGAATCCAGTACAACGCGCCA
D00008869 Escherichia_coli_O157:H7 Arg TCT -GCGTTGTTAGCTCAGCC-GGAC-AGAGCAATTGCCTTCTAAGCAATCG-------------------GTCACTGGTTCGAATCCAGTACAACGCGCCA
D00008870 Escherichia_coli_O157:H7 Arg TCT -GCGTTGTTAGCTCAGCC-GGAC-AGAGCAATTGCCTTCTAAGCAATCG-------------------GTCACTGGTTCGAATCCAGTACAACGCACCA
D00008871 Escherichia_coli_O157:H7 Arg TCT -GCGCCCTTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCAACGACCTTCTAAGTCGTGG-------------------GCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCA
D00008878 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Arg TCT -GCGTTTTTAGCTCAGCA-GGAC-AGAGCAATTGCCTTCTAAGCAATCG-------------------GTCACTGGTTCGACTCCAGTACAACGCGCCA
D00008879 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Arg TCT -GCGTTTTTAGCTCAGCC-GGAC-AGAGCAATTGCCTTCTAAGCAATCG-------------------GTCACTGGTTCGAACCCAGTACAACGCACCA
D00008880 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Arg TCT -GCGTTGTTAGCTCAGCC-GGAC-AGAGCAATTGCCTTCTAAGCAATCG-------------------GTCAGTGGTTSGACTCCACTACAACGCGCCA
D00008881 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Arg TCT -GCGTTGTTAGCTCAGCC-GGAC-AGAGCAATTGCCTTCTAAGCAATCG-------------------GTCAGTGGTTCGACTCCACTACAACGCGCCA
D00008882 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Arg TCT -GCGTTGTTAGCTCAGCC-GGAC-AGAGCAATTGCCTTCTGAGCAATCG-------------------GTCACTGGTTCGAATCCAGTACAACGCGCCA
D00008883 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Arg TCT -GCGTTGTTAGCTCAGCC-GGAC-AGAGCAATTGCCTTCTAAGCAATCG-------------------GTCACTGGTTCGAATCCAGTACAACGCGCCA
D00008884 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Arg TCT -GCGTTGTTAGCTCAGCC-GGAC-AGAGCAATTGCCTTCTAAGCAATCG-------------------GTCACTGGTTCGAATCCAGTACAACGCACCA
D00008885 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Arg TCT -GCGCCCTTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCAACGACCTTCTAAGTCGTGG-------------------GCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCA
D00009163 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Arg TCT -GTATCTGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACGCCCTTCTAAGGCGTGG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCAGATACGCCA
D00009425 Geobacter_sulfurreducens_PCA Arg TCT -GCGCCTGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACGGACTTCTAATCCGTAG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTCAGGCGTGCCA
D00002459 Haemophilus_influenzae Arg TCT -GCGCCCTTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACGCCCTTCTAAGGCGTGG-------------------GTCAAAGGTTCGAATCCTTTAGGGCGTGCCA
D00008897 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Arg TCT -GCGCCCTTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACGCCCTTCTAAGGCGTGG-------------------GTCAAAGGTTCGAATCCTTTAGGGCGTGCCA
D00009316 Helicobacter_hepaticus_ATCC_51449 Arg TCT -GCGCTCATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTAG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTTGGGCGTACCA
D00002446 Helicobacter_pylori Arg TCT -GCGCTTGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACAGCCTTCTAAGCCGTAG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCCAAGCGCACCA
D00008889 Helicobacter_pylori_26695 Arg TCT -GCGCTTGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACAGCCTTCTAAGCCGTAG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCCAAGCGCACCA
D00008893 Helicobacter_pylori_J99 Arg TCT -GCGCTTGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACAGCCTTCTAAGCCGTAG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCCAAGCGCACCA
D00009428 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Arg TCT -GGTTTGGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACGGTCTTCTAAACCGTGG-------------------GTCGTGAGTTCGAATCTCACCCAAATCA---
D00009294 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Arg TCT -GTCACGGTAGCTCAACT-GGAT-AGAGCATCCGCCTTCTAAGCGGAGG-------------------GTTGTGAGTTCAAGTCTCACTCGTGACA---
D00009432 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Arg TCT -GCCCCTATAGCTCAAT--GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAATCCGTAG-------------------GTTGCAGGTTCGAGTCCTGCTGGGGGCA---
D00009241 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Arg TCT -GACTCGGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCAACTGCCTTCTAAGCAGTGG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTCGGGTCACCA
D00008952 Listeria_innocua_Clip11262 Arg TCT -GTCCTGATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTCG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTCAGGACG---
D00008956 Listeria_monocytogenes_EGD-e Arg TCT -GTCCTGATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTCG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTCAGGACG---
D00009471 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Arg TCT -GTCCTGATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTCG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTCAGGACG---
D00009475 Mesoplasma_florum_L1 Arg TCT -GCCCATGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCACGCGCCTTCTAAGCGTGAG-------------------GTCGGAAGTTCGAGCCTTCTCGTGGGCACCA
D00008989 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Arg TCT -GGTCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCACCGGCCTTCTAAGCCGATG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCTGTCGGGATCGCCA
D00009321 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Arg TCT -GCCTCCGTAGCTCAGGT-GGAT-AGAGCAAGGGCCTTCTAATCCCTAG-------------------GTCGCACGTTCGAGTCGTGCCGGGGGCA---
D00008848 Mycobacterium_leprae_TN Arg TCT -GCCTCCGTAGCTCAGGT-GGAT-AGAGCAAGGGCCTTCTAATCCCTAG-------------------GTCGCACGTTCGAGTCGTGCCGGGGGCA---
D00008827 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Arg TCT -GCCTCCGTAGCTCAGGT-GGAT-AGAGCAAGGGCCTTCTAATCCCTAG-------------------GTCGCACGTTCGAGTCGTGCCGGGGGCA---
D00009397 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Arg TCT -GCCTCCGTAGCTCAGGT-GGAT-AGAGCAAGGGCCTTCTAATCCCTAG-------------------GTCGCACGTTCGAGTCGTGCCGGGGGCA---
D00002420 Mycoplasma_capricolum Arg TCT -GCCCATGTAGCTCAGTA-GGAT-AGAGCACGCGCCTTCTAAGCGTGAG-------------------GTCGGAAGTTCGAGCCTTCTCGTGGGCACCA
D00009313 Mycoplasma_gallisepticum_R Arg TCT -GCGCCGGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCACATGCCTTCTAAGCCTGTT-------------------GTCAGGGGTTCGAATCCCTTTCGGCGCGCCA
D00002421 Mycoplasma_genitalium Arg TCT -TCAGTGGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGTACACGCCTTCTAAGCGTGTT-------------------GTCGTGGGTTCAAATCCCTCCCGATGCGCCA
D00008916 Mycoplasma_genitalium_G37 Arg TCT -GCGTCGGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGTACACGCCTTCTAAGCGTGTT-------------------GTCGTGGGTTCAAATCCCTCCCGATGCGCCA
D00002426 Mycoplasma_mycoides Arg TCT -GCCCATGTAGCTCAGTA-GGAT-AGAGCACGCGCCTTCTAAGCGTGAG-------------------GTCGGAAGTTCGAGCCTTCTCGTGGGCACCA
D00002429 Mycoplasma_pneumoniae Arg TCT -GCGTCGGTAGCTCAGCG-GATAGAGAGTACACGCCTTCTAAGTGTGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAGTCCCACCCGATGCGCCA
D00008920 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Arg TCT -GCGTCGGTAGCTCAGC--GGAT-AGAGTACACGCCTTCTAAGTGTGTT-------------------GTCGTGGGTTCGAGTCCCACCCGATGCGCCA
D00009013 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Arg TCT -GGTCGCGTAGCTCAGAT-GGAC-AGAGCACGAGCCTTCTAAGCTTGTG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGTGATCGCCA
D00008832 Neisseria_meningitidis_MC58 Arg TCT -GCGCCCGTAGCTCAACC-GGAT-AGAGCACCGACCTTCTAAGTCGGGG-------------------GTTACAGGTTCGATTCCTGTCGGGCGTGCCA
D00008835 Neisseria_meningitidis_Z2491 Arg TCT -GCGCCCGTAGCTCAACC-GGAT-AGAGCACCGACCTTCTAAGTCGGGG-------------------GTTACAGGTTCGATTCCTGTCGGGCGTGCCA
D00009366 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Arg TCT -GTGCCCGTAGCTCAACC-GGAT-AGAGCACCAGCCTTCTAAGCTGGGG-------------------GTTACAGGTTCGATTCCTGTCGGGCACGCCA
D00009005 Nostoc_sp._PCC_7120 Arg TCT -GGGAGTGTCGCCTAAT--GGA--TGGGCATCGATCTTCTAAATCGATT-------------------TGTAGGGGTTCAAGTCCCTTCACTCCTG---
D00009008 Nostoc_sp._PCC_7120 Arg TCT -GGGCGCGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGCCACGGATTTCTAATCCGTTG-------------------GTCGCAGGTTCGAACCCTGCCGCGCTCG---
D00009243 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Arg TCT -GTCCCAGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACAGCCTTCTAAGCTGTGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCCTGGGACG---
D00009393 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M Arg TCT -GTTTGAGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTCG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTTCTCAAACGCCA
D00008923 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Arg TCT -GCGCCCTTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTAG-------------------GTCATTGGTTCGAATCCAATAGGGCGTGCCA
D00009405 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Arg TCT -GCGCCCTTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTAG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCTGTAGGGCGCA---
D00009437 Porphyromonas_gingivalis_W83 Arg TCT -GGTCAGGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAATAGCCTTCTAAGCTATCG-------------------GTCCTGGGTTCGAATCCCAGCCTGATCA---
D00009478 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Arg TCT -GGCCCGGTAGCTCAGC--GGAT-AGAGCAGCAGCCTTCTAATCTGTCG-------------------CGCGTGGGTTCGATTCCCACCCGGGCCGCCA
D00008933 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Arg TCT -GCGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCATCCGCCTTCTAAGCGGATG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCCGGGTGCGCCA
D00009377 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Arg TCT -GTGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCATCCGCCTTCTAAGCGGATG-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCCGGGTGCGCCA
D00009002 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Arg TCT -CTGCCCATAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCATCGGCCTTCTAAGCCGACG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTGGGCAGGCCA
D00009357 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Arg TCT -GCGCCCATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACGGACTTCTAATCCGTAG-------------------GTCGGTGGTTCGAATCCACCTGGGCGTG---
D00009363 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Arg TCT -GGCTCGATGGTGAAAC--GGAC-ATCATCTCTGGCTTCTAACCAGAAG-------------------T-TCCGGGTTCGATTCCTGGTCGGGCTA---
D00009410 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Arg TCT -GGTCCCATAGCTCAACT-GGAT-AGAGTAGCGGATTTCTACTCCGCGG-------------------GTTGCAGGTTCGAATCCTGCTGGGATCGCCA
D00008981 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Arg TCT -GCACCCTTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACAGATTTCTAATCTGTGG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTTTAGGGTGCGCCA
D00009177 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Arg TCT -GCACCCTTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACAGATTTCTAATCTGTGG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTTTAGGGTGCGCCA
D00009440 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Arg TCT -GCACCCTTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACAGATTTCTAATCTGTGG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTTTAGGGTGCGCCA
D00009017 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Arg TCT -GCGCCCTTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCA
D00009018 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Arg TCT -CCGCCATTAGCTCAACC-GGAT-AGAGCATAGAGCTTCTACCTCTAAG-------------------GTTCGGGGTTCAATTCCTCGATGGCGGACCA
D00009352 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Arg TCT -CCGCCATTAGCTCAACC-GGAT-AGAGCATAGAGCTTCTACCTCTAAG-------------------GTTCGGGGTTCAATTCCTCGATGGCGGACCA
D00009353 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Arg TCT -GCGCCCTTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTGG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCA
D00008996 Salmonella_typhimurium_LT2 Arg TCT -CCGCCATTAGCTCAACC-GGAT-AGAGCATAGAGCTTCTACCTCTAAG-------------------GTTCGGGGTTCAATTCCTCGATGGCGGACCA
D00008998 Salmonella_typhimurium_LT2 Arg TCT -CCGCCATTAGCTCAACT-GGAA-AGAGCACGGAGCTTCTACCTCTGTG-------------------GTTCGGGGTTCGAATCCTCGATGGCGGACCA
D00009256 Shewanella_oneidensis_MR-1 Arg TCT -GCGCCCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCACCCGCCTTCTAAGCGGGTG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCCGGGCGTACCA
D00009258 Shigella_flexneri_2a_str._301 Arg TCT -GCGTTGTTAGCTCAGCC-GGAC-AGAGCAATTGCCTTCTAAGCAATCG-------------------GTCACTGGTTCGAATCCAGTACAGCGCGCCA
D00009260 Shigella_flexneri_2a_str._301 Arg TCT -GCGCCCTTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCAACGACCTTCTAAGTCGTGG-------------------GCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCA
D00009261 Shigella_flexneri_2a_str._301 Arg TCT -CCACCACTAGCTCATCC-GGAT-AGAGCATCAACCTTCTAAGTTGACG-------------------GTGCGAGGTTCGAGTCCTCGGTGGTGGGCCA
D00009262 Shigella_flexneri_2a_str._301 Arg TCT -CCACCACTAGCTCATCC-GGAT-AGAGCATCAACCTTCTAAGTTGACG-------------------GTCCGAGGTTCGAGTCCTCGGTGGTGGGCCA
D00009025 Sinorhizobium_meliloti_1021 Arg TCT -GGCCCCTTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCACCTGCCTTCTAAGCAGGTT-------------------GTCGCAGGTTCGAGTCCTGCAGGGGTCGCCA
D00009414 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Arg TCT -GTCCTGGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAATGGCCTTCTAAGCCATCG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCCAGGACG---
D00009185 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Arg TCT -GTCCTGGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAATGGCCTTCTAAGCCATCG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCCAGGACG---
D00008844 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Arg TCT -GTCCTGGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAATGGCCTTCTAAGCCATCG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCCAGGACG---
D00009296 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Arg TCT -GTCCTGGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAATGGCCTTCTAAGCCATCG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCCAGGACG---
D00009268 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Arg TCT -GGTTCCATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCATTCGCCTTCTAAGCGAACG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCTGGAATCA---
D00009190 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Arg TCT -GGTTCCATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCATTCGCCTTCTAAGCGAACG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCTGGAATCA---
D00009273 Streptococcus_mutans_UA159 Arg TCT -GGTCTCATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCATTCGCCTTCTAAGCGAACG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCTGGGATCA---
D00008974 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Arg TCT -GGTCTCATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCATTCGCCTTCTAAGCGAACG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCTGGGATCA---
D00008970 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Arg TCT -GGTCTCATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCATTCGCCTTCTAAGCGAACG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCTGGGATCA---
D00009194 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Arg TCT -GGTCTCATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCATTCGCCTTCTAAGCGAACG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCTGGGATCC---
D00009327 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Arg TCT -GGTCTCATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCATTCGCCTTCTAAGCGAACG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCTGGGATCA---
D00009349 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Arg TCT -GCCCCCGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGCAGGCGCCTTCTAAGCGCTTG-------------------GCCGCAGGTTCGAGTCCTGCCGGGGGCG---
D00009249 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Arg TCT -GCCCCCGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGCAGGCGCCTTCTAAGCGCTTG-------------------GCCGCAGGTTCGAGTCCTGCCGGGGGCG---
D00009441 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Arg TCT -GCGCCTGTAGCTCAGT--GGAC-AGAGCAACCGCCTTCTAAGCGGTTG-------------------GCCGCAGGTTCGAATCCTGCCAGGCGCACCA
D00002466 Synechocystis_sp. Arg TCT -GGGTGCGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGCATCCGCCTTCTAAGCGGACG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCCGCACCCG---
D00008937 Synechocystis_sp._PCC_6803 Arg TCT -GGGTGCGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGCATCCGCCTTCTAAGCGGACG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCCGCACCCG---
D00009206 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Arg TCT -GCGCCTGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTGT-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCTCCAGGCGCACCA
D00009195 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Arg TCT -GCGCCCGTAGCTCAGC--GGAATAGAGCACTCGCCTTCTAAGCGATTG-------------------GTCGTTGGTTCGAGTCCAACCGGGCGCG---
D00008942 Thermotoga_maritima_MSB8 Arg TCT -GCGCCCGTAGCTCAACA-GGAT-AGAGCATCGGATTTCTAATCCGAGG-------------------GTTGCAGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCA
D00009480 Thermus_thermophilus_HB27 Arg TCT -GGGCCCGTAGCTCAGT--GGAC-AGAGCAGCCGCCTTCTAAGCGGTAG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCGGGCCCGCCA
D00009487 Treponema_denticola_ATCC_35405 Arg TCT -GGGATCGTAGCTCATCA-GGAT-AGAGCAACTGCCTTCTAAGCAGTAG-------------------GTAGGGGGTTCGAGTCCCTCCGGTCCCG---
D00002436 Treponema_pallidum Arg TCT -GGGATCATAGCTCACCC-GGAT-AGAGCGACTGCCTTCTAAGCAGTAG-------------------GGAGGGGGTTCGAGTCCCTCTGGTCCCA---
D00008928 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Arg TCT -GGGATCATAGCTCACCC-GGAT-AGAGCGACTGCCTTCTAAGCAGTAG-------------------GGAGGGGGTTCGAGTCCCTCTGGTCCCA---
D00009301 Tropheryma_whipplei_str._Twist Arg TCT -GCCCTCGTAGCTCAGC--GGAT-AGAGCAGAAGACTTCTAATCTTTGT-------------------GTCGCAGGTTCGATTCCTGTCGGGGGCG---
D00009303 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Arg TCT -GCCCTCGTAGCTCAGC--GGAT-AGAGCAGAAGACTTCTAATCTTTGT-------------------GTCGCAGGTTCGATTCCTGTCGGGGGCG---
D00008851 Ureaplasma_parvum_serovar_3 Arg TCT -GCACCTGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCATACGCCTTCTAAGCGTACG-------------------GTCTGGGGTTCGAATCCCTTCAGGTGCGCCA
D00008840 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Arg TCT -GCGCCCTTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCACGTGCCTTCTAAGCATGTG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCTGTAGGGCGTGCCA
D00009491 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Arg TCT -GTGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCAACAGCCTTCTAAGCTGTGG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCCACCGGGCACA---
D00009213 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Arg TCT -GCGCCCGTAGCTCAACC-GGAT-AGAGCACCGGCCTTCTAAGCCGGCG-------------------GTTACAGGTTCGAGTCCTGTCGGGCGCGCCA
D00009209 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Arg TCT -GCGCCCGTAGCTCAACC-GGAT-AGAGCACCGGCCTTCTAAGCCGGCG-------------------GTTACAGGTTCGAGTCCTGTCGGGCGCGCCA
D00008946 Xylella_fastidiosa_9a5c Arg TCT -GCGCCCGTAGCTCAATCGGAATAAGAGCACCGGCCTTCTAAGCCGGGG-------------------GTTGCAGGTTCGAGTCCTGTCGGGTGCGCCA
D00009310 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Arg TCT -GCGCCCGTAGCTCAATCGGAATAAGAGCACCGGCCTTCTAAGCCGGGG-------------------GTTGCAGGTTCGAGTCCTGTCGGGTGCGCCA
D00009449 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Arg TCT -GCGCCCTTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTAG-------------------GTCACAGGTTCGAGCCCTGTAGGGCGTACCA
D00008991 Yersinia_pestis_CO92 Arg TCT -GCGCCCTTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTAG-------------------GTCACAGGTTCGAGCCCTGTAGGGCGTACCA
D00009223 Yersinia_pestis_KIM Arg TCT -GCGCCCTTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTAG-------------------GTCACAGGTTCGAGCCCTGTAGGGCGTACCA
D00009454 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Arg TCT -GCGCCCTTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTAG-------------------GTCACAGGTTCGAGCCCTGTAGGGCGTACCA
D00009115 Arabidopsis_thaliana Arg TCT -GCACCCGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTTTGACTTCTAATCAAGCG-------------------ATTGTGGGTTCGAGTCCCACCGGGTGT----
D00009116 Arabidopsis_thaliana Arg TCT -GCGCTCGTGGCCCAAT--GGAT-AAGGCGTCTGACTTCTAATCAGACG-------------------ATTGTGGGTTCGATCCCCACCGAGCGT----
D00009117 Arabidopsis_thaliana Arg TCT -GCACCCATGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGCTTGACTTCTAATCAAGCG-------------------ATTGTGGGTTCGAGTCCCACTGGGTGT----
D00009118 Arabidopsis_thaliana Arg TCT -GCACCCGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTTTGACTTCTAATCAAACG-------------------ATTGTGGGTTCGAGTCCCACCGGGTGT----
D00009119 Arabidopsis_thaliana Arg TCT -GCGCCCGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTTTGACTTCTAATCAAACG-------------------ATTGTGGGTTCGAGTCCCACCGGGCGT----
D00009120 Arabidopsis_thaliana Arg TCT -GCACCCATGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGCTTGACTTCTAATCAAGCG-------------------ATTGTGGGTTCGAATCCCACTGGGTGT----
D00002593 Caenorhabditis_elegans Arg TCT -GGCCTTGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCTGACTTCTAATCAGAAG-------------------ATTGCAGGTTCGACCCCTGCCTGGGTCA---
D00009136 Caenorhabditis_elegans Arg TCT -GGCCTTGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCTGACTTCTAATCAGAAG-------------------ATTGCAGGTTCGACCCCTGCCTGGGTCA---
D00009137 Caenorhabditis_elegans Arg TCT -GGCCTTGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCTGACTTCTAATCAGAAG-------------------ATTGCAGGTTCGAGCCCTGCCTGGGTCA---
D00009138 Caenorhabditis_elegans Arg TCT -GGCCTTGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCTGACTTCTAATCAGAAG-------------------ATTGCAGGTTCGATCCCTGCCTGGGTCA---
D00009457 Candida_glabrata_CBS_138 Arg TCT -GCTCGCGTGGCGTAAT--GGC--AACGCGTCTGACTTCTAATCAGAAG-------------------ATTATGGGTTCGACCCCCATCGTGAGTG---
D00002583 Dictyostelium_discoideum Arg TCT -GCCCGTTTAGCAAAGTT-GGA--ATTGCGGCAGCCTTCTAAGCTGCAG-------------------GTCGTGGGATCGAGACCCACAATGGGTG---
D00009150 Drosophila_melanogaster Arg TCT -GGCCGTGTAGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCGGATTTCTGATCCGAAA-------------------ATTGCGGGTTCAAGTCCCGTCATGGTC----
D00009151 Drosophila_melanogaster Arg TCT -GACCCTTTAGCGCATT--GGAT-AGCGCGTTGGACTTCTAATCCAAAG-------------------GTGGCGGGTTCGATTCCCGCAAGGGTT----
D00009152 Drosophila_melanogaster Arg TCT -GTCCCTTTGGCGCAGA--GGAT-AGCGCGTTGGACTTCTAATCCAAAG-------------------GTCGCGGGTTCGATCCCCGCAAGGGAT----
D00009218 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Arg TCT -GCCCTGATAGCGTAAT--GGCT-AACGCGTCTGCCTTCTAAGCAGAAG-------------------ACTGCGGGTTCGAGTCCCGCTCAGGGTG---
D00009520 Gallus_gallus Arg TCT -GCCCCAGTGGAACAACC-GGAT-AAGGCACTGGCCTTCTAAGTCAGGG-------------------ACTGTGGGTTCCATTCCCACCTGGGGTG---
D00009521 Gallus_gallus Arg TCT -GCCCCAGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCACTGGCCTTCTAAGTCAGGG-------------------ACTGTGGGTTCGAGTCCCACCTGGGGTG---
D00009522 Gallus_gallus Arg TCT -GGCTCCGTGGCGCAAT--GGAT-AGCGCATTGGACTTCTAATTCAAAG-------------------GTTCCGGGTTCGAGTCCCGGCGGAGTCG---
D00009523 Gallus_gallus Arg TCT -GGCTCTGTGGCGCAAT--GGAT-AGCGCATTGGACTTCTAATTCAAAG-------------------GTTGTGGGTTCGAGTCCCACCAGAGTCG---
D00009095 Homo_sapiens Arg TCT -GTCTCTGTGGCGCAAT--GGACGAGCGCGCTGGACTTCTAATCCAGAG-------------------GTTCCGGGTTCGAGTCCCGGCAGAGAT----
D00009096 Homo_sapiens Arg TCT -GGCTCCGTGGCGCAAT--GGAT-AGCGCATTGGACTTCTAATTCAAAG-------------------GTTCCGGGTTCGAGTCCCGGCGGAGTC----
D00009097 Homo_sapiens Arg TCT -GGCTCTGTGGCGCAAT--GGAT-AGCGCATTGGACTTCTAATTCAAAG-------------------GTTGTGGGTTCGAGTCCCACCAGAGTC----
D00009098 Homo_sapiens Arg TCT -GGCTCTGTGGCGCAAT--GGAT-AGCGCATTGGACTTCTAATTCAAAG-------------------GTTGCGGGTTCGAGTCCCTCCAGAGTC----
D00009099 Homo_sapiens Arg TCT -GGCTCTGTGGCGCAAT--GGAT-AGCGCATTGGACTTCTAATTCAAAG-------------------GTTGTGGGTTCGAGTCCCACCAGAGTC----
D00009568 Pan_troglodytes Arg TCT -GTCTCTGTGGCGCAAT--GGACGAGCGCGCTGGACTTCTAATCCAGAG-------------------GTTCCGGGTTCGAGTCCCGGCAGAGATG---
D00009569 Pan_troglodytes Arg TCT -GGCTCTGTGGCGCAAT--GGAT-AGCGCATTGGACTTCTAATTCAAAG-------------------GTTGTGGGTTCGAGTCCCACCAGAGTCG---
D00009570 Pan_troglodytes Arg TCT -GGCTCTGTGGCGCAAT--GGAT-AGCGCATTGGACTTCTAATTCAAAG-------------------GTTGCGGGTTCGAGTCCCGCCAGAGTCG---
D00009571 Pan_troglodytes Arg TCT -GGCTCTGTGGCGCAAT--GGAT-AGCGCATTGGACTTCTAATTCAAAG-------------------GTTGTGGGTTCGAATCCCACCAGAGTCG---
D00009572 Pan_troglodytes Arg TCT -GGCTCCGTGGCGCAAT--GGAT-AGCGCATTGGACTTCTAATTCAAAG-------------------GTTCCGGGTTCGAGTCCCGGCGGAGTCG---
D00002576 Plasmodium_falciparum Arg TCT -AAATCTATAATTTAAT--GGAT-AAAATAAAAACCTTCTAAGTTTTAT-------------------A-TGTAAGTTCAAATCTTACTAGATTTA---
D00009501 Plasmodium_falciparum_3D7 Arg TCT -GCCTCTGTGGCGCAATT-GGAT-AGCGCGTTGGACTTCTAATCCAAAG-------------------GCTGCGGGTTCGAATCCCGCCAGGGGTA---
D00002586 Saccharomyces_cerevisiae Arg TCT -GCTCGCGTGGCGTAAT--GGC--AACGCGTCTGACTTCTAATCAGAAG-------------------ATTATGGGTTCGACCCCCATCGTGAGTG---
D00009143 Saccharomyces_cerevisiae Arg TCT -GCTCGCGTGGCGTAAT--GGC--AACGCGTCTGACTTCTAATCAGAAG-------------------ATTATGGGTTCGACCCCCATCGTGAGTG---
D00009157 Schizosaccharomyces_pombe Arg TCT -GCTCCCGTGGCCTAAT--GGCT-AGGGCATTTGACTTCTAATCAAGGG-------------------ATTGTGGGTTCGAGTCCCGCCGGGAGC----
D00009158 Schizosaccharomyces_pombe Arg TCT -GCTCCCGTGGCCTAAT--GGCT-AGGGCATTTGACTTCTAATCAAGGG-------------------ATTGCGGGTTCGAGTCCCGCCGGGAGC----
D00009544 Takifugu_rubripes Arg TCT -GTCTCTGTGGCGCAAT--GGAATAGCGCGCTGGACTTCTAATCCAGAG-------------------GCTCCGGGTTCGAGTCCCGGCAGAGAT----
D00009545 Takifugu_rubripes Arg TCT -GGCTCCGTGGCGCAAT--GGAT-AGCGCATTGGACTTCTAATTCAAAG-------------------GTTGTGGGTTCGAGTCCCACCGGAGTCG---
D00009546 Takifugu_rubripes Arg TCT -GGCTCTGTGGTATAAT--GGAT-AGTACATTGGACTTCTAATTCAAAG-------------------GTTGTGGGTTCGAGTCCCACCAGAGTCT---
D00009547 Takifugu_rubripes Arg TCT -GGCTCTGTGGCGCAAT--GGAT-AGCGCATTGGACTTCTAATTCAAAG-------------------GTTGTGGGTTCGAGTCCCACCAGAGTCG---
D00009548 Takifugu_rubripes Arg TCT -GGCTCTGTGGTGTAAT--GGAT-AGCACATTGGACTTCTAATCCAAAG-------------------GTTGTGGGTTCAACCCCCACCAGAGTCA---
D00009549 Takifugu_rubripes Arg TCT -GGCTCTGTGGCGCAAT--GGAG-AGCGCATTGGACTTCTAATTCAAAG-------------------GTTGTGGGTTCGAGTCCCACCAGAGTCT---
D00009550 Takifugu_rubripes Arg TCT -GGCTCTGTGGCGCAAT--GGAG-AGCGCATTGGACTTCTAATTCAAAG-------------------GTTGTGGGTTCGAGTCCCACCAGAGTCG---
D00009551 Takifugu_rubripes Arg TCT -GGCTCTGTGGCGCAAT--GGAG-AGCGCATTGGACTTCTAATTCAAAG-------------------TTTGTGGGTTCGAGTCCCACCAGAGTCG---
D00002578 Trypanosoma_brucei Arg TCT -GCTCCAGTGGCCTAAT--GGAT-ATGGCTTTGGACTTCTAATCCAAAG-------------------GTTGCGGGTTCGAGTCCCGTCTGGAGTA---
D00009776 Aeropyrum_pernix_K1 Ser GCT -GCCGCGGTCGCCTAGCCTGGCC-AGGGCGCCGGCCTGCTAAGCCGGTGGGGG----AGA----CCCCG-CGCGGGTTCAAATCCCGCCCGCGGCGCC-
D00002604 Archaeoglobus_fulgidus Ser GCT -GCCGGGGTTGCCGAGC--GGT--AAGGCGACGGCCTGCTAAGCCGTTGGGC-----GTT-----GCCCGCGTGGGTTCGAATCCCACCCCCGGCG---
D00009780 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Ser GCT -GCCGGGGTTGCCGAGC--GGT--AAGGCGACGGCCTGCTAAGCCGTTGGGC-----GTT-----GCCCGCGTGGGTTCGAATCCCACCCCCGGCG---
D00002608 Haloarcula_marismortui Ser GCT -GTCGTGGTAGCCAAGCCTGGCCCAAGGCGCAGGGTTGCTAACTCTGTGGCG-----TAC-----AGCCTCCGGGGTTCGAATCCCCGCCACGACG---
D00009784 Halobacterium_sp._NRC-1 Ser GCT -GTCGTGGTAGCCTAGCCTGGTC-AAGGCGCAGGGTTGCTAACTCTGTGGC------GTAA-----GCCTCCGGGGTTCAAATCCCCGCCACGACG---
D00002609 Methanocaldococcus_jannaschii Ser GCT -GCGGGGGTGGCCCAGCCTGGT--ACGGCGTGGGACTGCTAATCCCATTGGGC----AAC----GCCCAGCCCGGGTTCAAGTCCCGGCCCCCGCG---
D00009790 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Ser GCT -GCGGGGGTGGCCCAGCCTGGT--ACGGCGTGGGACTGCTAATCCCATTGGGC----AAC----GCCCAGCCCGGGTTCAAGTCCCGGCCCCCGCG---
D00011846 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Ser GCT -GCGGAGATGGCCCAGTCTGGT--ACGGCGCGGGACTGCTAATCCCGTTGGGC----TTT----GCCCAACCCGAGTTCAAATCTCGGTCTCCGCG---
D00009793 Methanococcus_maripaludis Ser GCT -GCGGAGATGGCCCAGTCTGGT--ACGGCGCGGGACTGCTAATCCCGTTACGC----TCT----GCGTAACCCGAGTTCAAATCTCGGTCTCCGC----
D00009966 Methanopyrus_kandleri_AV19 Ser GCT -GCCGGGGCGGCCGAGCCCGGTCCAAGGCGCGGGACTGCTAATCCCGTGGCCC----GTAT---GGGCCGCCCGGGTTCAAATCCCGGCCCCGGCGCCA
D00011896 Methanosarcina_acetivorans_C2A Ser GCT -GACGAGATAGCCAAGCCCGGT--ATGGCGTGGGATTGCTAATCCCATGATGC----CCT----GCATCGCGGGGGTTCGAGTCCCCCTCTCGTCG---
D00009911 Methanosarcina_mazei_Go1 Ser GCT -GACGAGATAGCCAAGCCCGGT--ATGGCGCGGGATTGCTAATCCCGTGATGC----TCC----GCATCCCGGGGGTTCGAGTCCCCCTCTCGTCG---
D00011955 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Ser GCT -GTTGAGGTAGCCAAGCCAGGT--ATGGCGCAGGGTTGCTAACCCTGTGTCC-----CTTG----GGACTCGGGGGTTCAAATCCCTCCCTCAACG---
D00009787 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Ser GCT -GCCGGGGTGGCCCAGTCTGGT--ACGGCGTTGGCCTGCTAAGCCAATGATCC----TTT----GGATCTCGCGGGTTCAAATCCCGTCCCCGGCG---
D00002612 Methanothermus_fervidus Ser GCT -GCCGGGGTGGCCCAGCCTGGT--AGGGCGTCGGCCTGCTAAGCCGATGATCCG---TTA---AGGATCGCGCGGGTTCAAATCCCGTCCCCGGCG---
D00011988 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Ser GCT -GCCGCCGTGCCCGAGC--GGTC-AAGGGGCCTGCCTGCTAAGCAGGTCCCC-----GTAT----GGGGGCGGGGGTTCGAATCCCCCCGGCGGCG---
D00009797 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Ser GCT -GCCGGGGTGGCCGAGTT-GGTCCAAGGCGCGGGCCTGCTAAGCCCGTCCCC-----ATAC----GGGGGCGTGGGTTCAAATCCCACCCCCGGCG---
D00009801 Pyrococcus_abyssi_GE5 Ser GCT -GCCGCGGTAGCCTAGCCTGGT--AGGGCGCCGGCCTGCTAAGCCGGTGGGCG----TGG----TCCCG-CCGGGGTTCAAATCCCCGCCGCGGCGCC-
D00009805 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Ser GCT -GCCGCGGTAGCCTAGCCTGGT--AGGGCGCCGGCCTGCTAAGCCGGTGGGCG----TGG----TCCCG-CCGGGGTTCAAATCCCCGCCGCGGCGCC-
D00009809 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Ser GCT -GCCGCGGTAGCCTAGCCTGGT--AGGGCGCCGGCCTGCTAAGCCGGTGGGCG----TGG----TCCCG-CCGGGGTTCAAATCCCCGCCGCGGCGCCA
D00012028 Staphylothermus_marinus_F1 Ser GCT -GCCGGGGTCGCCTAGCCTGGT--AGGGCGCCGGCCTGCTAAGCCGGTGGGGT----GGT----TCCCCGCGCGGGTTCAAATCCCGCCCCCGGCG---
D00012097 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Ser GCT -GCCGGGGTCGCCTAGCTCGGT--AGGGCGGAGGCCTGCTAAGCCTCTGGGGT----CCC----ACCCCGCGCGGGTTCAAATCCCGCCCCCGGCGCCA
D00009813 Sulfolobus_solfataricus_P2 Ser GCT -GCCGAGGTCGCCTAGCCAGGT--AGGGCGGCGGCCTGCTAAGCCGCTGGGGA----TCC----TCCCCACGCGGGTTCAAATCCCGCCCTCGGC----
D00009940 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Ser GCT -GCCGGGGTCGCCTAGCCCGGTT-AGGGCGGCGGCCTGCTAAGCCGCTGGGGT----CCG----TCCCCGCGCGGGTTCAAATCCCGCCCCCGGCGCCA
D00009817 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Ser GCT -GCGGGGATGGCCCAGA--GGT--AAGGCGGCAGCCTGCTAAGCTGTTTCTC-----TTAT----GAGAGCGTGGGTTCGAATCCCACTCCCCGCG---
D00009821 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Ser GCT -GCGGGGATGGCCCAGT--GGT--AAGGCGGCAGCCTGCTAAGCTGTTTCTC-----GTAT----GAGAGCGTGGGTTCGAATCCCACTCCCCGCG---
D00002626 Acholeplasma_laidlawii Ser GCT -GGAGCGATACTCAAGA--GGCCGAAGAGGGCGCACTGCTAACGCGTT_ACGGT---TAAC--CCCGTG-CGAGGGTTCAAATCCCTCTCGCTCCGCCA
D00010208 Acinetobacter_sp._ADP1 Ser GCT -GGTGAGATGGGTGAGT--GGCTTAAACCACATCCCTGCTAAGGATGCGTACGG---GTAA--CTGTAC-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCACCGCCA
D00009764 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Ser GCT -GGAGAGGTGGCCGAGT--GGTCGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATACGTC--AAA--AGCGTAT-CGTGGGTTCGAATCCCATCCTCTCCGCCA
D00009700 Aquifex_aeolicus_VF5 Ser GCT -GGAGGGGTGGCCGAGA--GGCCGAAGGCGGCCGCTTGCTAAGCGGCAGAGGGGC--TAAA-ACCCCTC-CGAGGGTTCGAATCCCTCCCCCTCCGCCA
D00010211 Bacillus_anthracis_str._A2012 Ser GCT -AGAGAAGTACCCAAGT--GGCTCAAGGGGCTCCCCTGCTAAGGGAGTAGATCG---CGAA--CGCGGTGCGAGGGTTCGAATCCCTTCTTCTCTGCCA
D00010090 Bacillus_anthracis_str._Ames Ser GCT -AGAGAAGTACCCAAGT--GGCTCAAGGGGCTCCCCTGCTAAGGGAGTAGATCG---CGAA--CGCGGTGCGAGGGTTCGAATCCCTTCTTCTCTGCCA
D00010130 Bacillus_anthracis_str._Sterne Ser GCT -AGAGAAGTACCCAAGT--GGCTCAAGGGGCTCCCCTGCTAAGGGAGTAGATCG---CGAA--CGCGGTGCGAGGGTTCGAATCCCTTCTTCTCTGCCA
D00010178 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Ser GCT -AGAGAAGTACCCAAGT--GGCTCAAGGGGCTCCCCTGCTAAGGGAGTAGATCG---CGAA--CGCGGTGCGAGGGTTCGAATCCCTTCTTCTCTGCCA
D00010182 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Ser GCT -AGAGAAGTACCCAAGT--GGCTCAAGGGGCTCCCCTGCTAAGGGAGTAGATCG---CGAA--CGCGGTGCGAGGGTTCGAATCCCTTCTTCTCTGCCA
D00010052 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Ser GCT --GAGAAGTACCCAAGT--GGCTCAAGGGGCTCCCCTGCTAAGGGAGTAGATCG---CTAA--CGCGGTGCGAGGGTTCGAATCCCTTCTTCTCTGCCA
D00010056 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Ser GCT --GAGAAGTACCCAAGT--GGCTCAAGGGGCTCCCCTGCTAAGGGAGTAGATCG---CGAA--CGCGGTGCGAGGGTTCGAATCCCTTCTTCTCTGCCA
D00010003 Bacillus_halodurans_C-125 Ser GCT -GGAGAAGTACCCAAGT--GGCTGAAGGGGCTCCCCTGCTAAGGGAGTAGGTCGT--GTG--AGCGGCG-CGAGGGTTCAAATCCCTCCTTCTCCGCCA
D00002650 Bacillus_subtilis Ser GCT -GGAGAAGTACTCAAGT--GGCTGAAGAGGCGCCCCTGCTAAGGGTGTAGGTCGT--GTA--AGCGGCG-CGAGGGTTCAAATCCCTCCTTCTCCGCCA
D00009589 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Ser GCT -GGAGAAGTACTCAAGT--GGCTGAAGAGGCGCCCCTGCTAAGGGTGTAGGTCGC--GTA--AGCGGCG-CGAGGGTTCAAATCCCTCCTTCTCCGCCA
D00009590 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Ser GCT -GGAGAAGTACTCAAGT--GGCTGAAGAGGCGCCCCTGCTAAGGGTGTAGGTCGT--GTA--AGCGGCG-CGAGGGTTCAAATCCCTCCTTCTCCGCCA
D00010213 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Ser GCT -AGAGAAGTACCCAAGT--GGCTCAAGGGGCTCCCCTGCTAAGGGAGTAGATCG---CGAA--CGCGGTGCGAGGGTTCGAATCCCTTCTTCTCTGCCA
D00010081 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Ser GCT -GGAAGTTTGGGTGAGT--GGCTGAAACCACCAGTTTGCTAAACTGACGTACGG---GTAA--CCGTAC-CGGGGGTTCGAATCCCCCAGCTTCCG---
D00010098 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Ser GCT -GGAGAGGTGGCCGAGT--GGTCGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTAGGGCTC--AAA--AGGCTCT-CGAGAGTTCGAATCTCTTCCTCTCCGCCA
D00010223 Bartonella_quintana_str._Toulouse Ser GCT -GGAGAGGTGGCCGAGT--GGTCGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTAGGGCTC--AAA--AGGCTCT-CGAGAGTTCGAATCTCTTCCTCTCCGCCA
D00010100 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Ser GCT -GGAGAGGTGGGTGAGT--GGCTGAAACCAAGCGTTTGCTAAATGCTCGTACACC--AAA--AGTGTAC-CGAGGGTTCGAATCCCTCCCTCTCCGCCA
D00009968 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Ser GCT -GGAGTCATGCCTGAGT--GGCCGATAGGGGCACCCTGCTAAGGTGTTAGTCGT---GTAA--ACGGCT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTGACTCCG---
D00002637 Borrelia_burgdorferi Ser GCT -GGAGAGATGCCAGAGT--GGCCGAATGGGGCTTCCTGCTAAGAAGTTGTCCTTT--TAA--AAGGGGACCATGGGTTCGAATCCCATTCTCTCCG---
D00009649 Borrelia_burgdorferi_B31 Ser GCT -GGAGAGATGCCAGAGT--GGCCGAATGGGGCTTCCTGCTAAGAAGTTGTCCTTT--TAA--AAGGGGACCATGGGTTCGAATCCCATTCTCTCCG---
D00010135 Borrelia_garinii_PBi Ser GCT -GGAGAGATGCCAGAGT--GGCCGAATGGGGCTTCCTGCTAAGAAGTTGTCCTTT--TGA--AAGGGGACCATGGGTTCGAATCCCATTCTCTCCG---
D00010009 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Ser GCT -GGAGAGGTGGCCGAGT--GGCTGAAGGCAACGCTTTGCTAAAGCGTCATACGGTC-TCA-AGCTGTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCCCTCTCCGCCA
D00009736 Brucella_melitensis_16M Ser GCT -GGAGAGGTGGCCGAGT--GGTCGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTAGACCTC--AAA--AGGGTCT-CGTGGGTTCGAATCCCATCCTCTCCGCCA
D00009971 Brucella_suis_1330 Ser GCT -GGAGAGGTGGCCGAGT--GGTCGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTAGACCTC--AAA--AGGGTCT-CGTGGGTTCGAATCCCATCCTCTCCGCCA
D00009594 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Ser GCT -GGTGAGATGGCCGAGA--GGATTAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCAGA--AATA-CCTGCAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCACCGCCA
D00010058 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Ser GCT -GGTGAGATGGCCGAGA--GGCTGAAGGCACTCCCCTGCTAAGGGAGTATGTAAA--ATAA-ATTGCAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCACCA---
D00009915 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Ser GCT -GGTGAGATGGCCGAGA--GGATTAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTGTGCAGAA-ATA-ATCTGCAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCACCGCCA
D00009652 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Ser GCT -GGACAGATGGGTGAGT--GGCTGAAACCACACCCCTGCTAAGGGTGCAGATCT---TAAC--GGGTCT-CGAGGGTTCAAATCCCTCTCTGTCCGCCA
D00010227 Candidatus_Blochmannia_floridanus Ser GCT -AGTGAGGTGGCCGAGA--GGCTAAAGGCACTCCCCTGCTAAGGGAGTATATAGT--CTAA-ATACTGTTCGAGGGTTCGAATCCCTCCCTCACTG---
D00010114 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Ser GCT -GGAAAGATGGCTGAGC--GGCCGAAAGCACGTCCCTGCTAAGGACGCATACCCC--TAA--AGGGTAT-CGAGGGTTCAAATCCCTCTCTTTCCG---
D00009656 Caulobacter_crescentus_CB15 Ser GCT -GGAGACGTGGCCGAGA--GGCTGAAGGCACCGCTTTGCTAAAGCGGCATACCTC--AAA--AGGGTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCCGTCTCCGCCA
D00009720 Chlamydia_muridarum_Nigg Ser GCT -GGAAAGATGACTGAGT--GGTCGAAAGTACGTCCCTGCTAAGGACGCGTACCCC--TTAA-AGGGTAC-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTTTCCG---
D00009586 Chlamydia_trachomatis Ser GCT -GGAAAGATGACTGAGT--GGTCGAAAGTACGTCCCTGCTAAGGACGCGTACCCC--TAA--AGGGTAC-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTTTCC----
D00009583 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Ser GCT -GGAAAGATGACTGAGT--GGTCGAAAGTACGTCCCTGCTAAGGACGCGTACCCC--TTAA-AGGGTAC-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTTTCCG---
D00009574 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Ser GCT -GGAAAGATGACTGAGT--GGTCGAAAGTACGTCCCTGCTAAGGACGCGTACCCC--TAA--AGGGTAC-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTTTCCG---
D00009578 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Ser GCT -GGAAAGATGACTGAGT--GGTCGAAAGTACGTCCCTGCTAAGGACGCGTACCCC--TAA--AGGGTAC-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTTTCCG---
D00009625 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Ser GCT -GGAAAGATGACTGAGT--GGTCGAAAGTACGTCCCTGCTAAGGACGCGTACCCC--TAA--AGGGTAC-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTTTCCG---
D00009905 Chlorobium_tepidum_TLS Ser GCT -GGAGAGGTGGCCGAGT--GGCTGAAGGCACCGGTTTGCTAAACCGACGTAGTTCG-ATT-AGAGCTAC-CGAGGGTTCGAATCCCTCCCTCTCCG---
D00009729 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Ser GCT -GGAGAAGTACTCAAGT--GGTTGAAGAGGTGCCCTTGCTAAGGGTATAGGTCGG--GTA--ACCGGCG-CGAGAGTTCGAAACTCTCCTTCTCCGCCA
D00009714 Clostridium_perfringens_str._13 Ser GCT -GGAGAATTACTCAAGT--GGCTGAAGAGGCTCCCCTGCTAAGGGAGTAGGTCGG--GCA--ACCGGCG-CCCGGGTTCAAATCCCGGATTCTCCGCCA
D00009716 Clostridium_perfringens_str._13 Ser GCT -GGAAAGTTACTCAAGTT-GGTT-AAGAGGGCAGATTGCTAATCTGTTATTAGGC--TTAA-AGTCTAG-CAAAAGTTCGAATCTCTTACTTTCCTCCA
D00010012 Clostridium_tetani_E88 Ser GCT -GGAGAAATACTCAAGA--GGTCGAAGAGGCGCCCCTGCTAAGGGCGTAGGTCGG--GTA--ACCGGCA-CGAGGGTTCAAATCCCTCTTTCTCCGCCA
D00010103 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Ser GCT -GGAGACGTGCCAGAGC--GGCCGAATGGGGCTCCCTGCTAAGGAGTTGACTTGT--TTGC-GCAGGTC-CGGAGGTTCAAATCCTCTCGTCTCCG---
D00009976 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Ser GCT -GGAGACGTGCCAGAGC--GGCCGAATGGGGCTCACTGCTAATGAGTTGTCCTCT--TAAC-GGAGGAC-CGGAGGTTCAAATCCTCTCGTCTCCG---
D00009921 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Ser GCT -GGAGACGTGCCAGAGC--GGCCGAATGGGACTCACTGCTAATGAGTTGTCCTCT--TAAC-GGGGGAC-CGGAGGTTCAAATCCTCTCGTCTCCG---
D00010048 Coxiella_burnetii_RSA_493 Ser GCT -GGAGAGATGGCCGAGA--GGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGGGGC--GAAA-GCTCCAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00009660 Deinococcus_radiodurans_R1 Ser GCT -GGAGAGGTGGGTGAGC--GGCTTAAACCAAGCGTTTGCTAAACGCTCGTACGCCT-TAA-AAGTGTAC-CGCGGGTTCGAATCCCGCCCTCTCCGCCA
D00010186 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Ser GCT -GGAGAGGTGTCCGAGTC-GGCCGAAGGAGCTCGCCTGCTAAGCGGGTATAGGGGC-ATAAACCTCTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCCCTCTCCGCCA
D00010015 Enterococcus_faecalis_V583 Ser GCT -GGGGAAGTACTCAAGT--GGCTGAAGAGGCGCCCCTGCTAAGGGTGTAGGTCGG--GAA--ACCGGCG-CGAGGGTTCAAATCCCTCCTTCTCCG---
D00002654 Escherichia_coli Ser GCT -GGTGAGGTGGCCGAGA--GGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTC-AAA-AGCTGCAT-CCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA
D00010063 Escherichia_coli_CFT073 Ser GCT -GGTGAGGTGGCCGAGA--GGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTC-AAA-AGCTGCAT-CCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA
D00009629 Escherichia_coli_K12 Ser GCT -GGTGAGGTGGCCGAGA--GGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTC-AAA-AGCTGCAT-CCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA
D00009633 Escherichia_coli_O157:H7 Ser GCT -GGTGAGGTGGCCGAGA--GGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTC-AAA-AGCTGCAT-CCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA
D00009637 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Ser GCT -GGTGAGGTGGCCGAGA--GGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTC-AAA-AGCTGCATCCAGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA
D00009909 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Ser GCT -GGTGAGATGGCAGAGT--GGCCTAATGCACTGACCTGCTAAGTCAGAGTACCG---TCT---CGGTAC-CGAGGGTTCAAATCCCTCTCTCACCGCCA
D00010139 Geobacter_sulfurreducens_PCA Ser GCT -GGAGAGATGGCCGAGTA-GGTCGAAGGCGCTCGCCTGCTAAGCGAGTATACGGGC-AAA-ACCTGTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00002659 Haemophilus_influenzae Ser GCT -GGTGAGATGGCCGAGCA-GGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGGGGTT-AAA-AGCTCCAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCACCGCCA
D00009646 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Ser GCT -GGTGAGATGGCCGAGCA-GGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGGGGTT-AAAAAGCTCCAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCACCGCCA
D00002645 Helicobacter_pylori Ser GCT -GGACAGGTGGGTGAGTT-GGCTGAAACCACATCCCTGCTAAGGATGCGTAGCCG--TCA--AGGTTAC-CGAGGGTTCGAATCCCTCCCTGTCCGCCA
D00009640 Helicobacter_pylori_26695 Ser GCT -GGACAGGTGGGTGAGTT-GGCTGAAACCACATCCCTGCTAAGGATGCGTAGCCG--TCA--AGGTTAC-CGAGGGTTCGAATCCCTCCCTGTCCGCCA
D00009643 Helicobacter_pylori_J99 Ser GCT -GGACAGGTGGGTGAGTT-GGCTGAAACCACATCCCTGCTAAGGATGCGTAGCCG--TCA--AGGTTAC-CGAGGGTTCGAATCCCTCCCTGTCCGCCA
D00010145 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Ser GCT -GGAGATTTACTCAAGT--GGCTGAAGAGGCGCCCCTGCTAAGGGTGTAGGTCGGT-TTA-TACCGGCG-CGAGGGTTCGAATCTCTCAATCTCCG---
D00010020 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Ser GCT -GGAGAAGTACTCAAGT--GGCTGAAGAGGTGCCCCTGCTAAGGGTATAGATCGC--GCA--AGCGGTG-CGAGGGTTCGAATCCCTCCTTCTCCG---
D00010147 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Ser GCT -GGAGACGTCGCATAGTCAGGCCTAGTGCACCACCCTGCTAAGGTGGAGTCCCC---GTAA--GGGGAC-CGAGGGTTCAAATCCCTCCGTCTCCG---
D00009979 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Ser GCT -GGAGACGTGCCTGAGT--GGCCGAAAGGAGCAGTTTGCTAAACTGTCGTACGG---GTAA--CTGTAC-CCAGGGTTCGAATCCCTGCGTCTCCG---
D00009704 Listeria_innocua_Clip11262 Ser GCT -GGGGAAGTACTCAAGT--GGCTGAAGAGGTGCCCCTGCTAAGGGTATAGGTCG---CTCA--CGCGGCGCGAGGGTTCAAATCCCTCCTTCTCCG---
D00009705 Listeria_innocua_Clip11262 Ser GCT -GGGGAAGTACTCAAGT--GGCTGAAGAGGCGCCCCTGCTAAGGGTGTAGGTCG---CTCG--CGCGGCGCGAGGGTTCAAATCCCTCCTTCTCCGCCA
D00009709 Listeria_monocytogenes_EGD-e Ser GCT -GGGGAAGTACTCAAGT--GGCTGAAGAGGTGCCCCTGCTAAGGGTATAGGTCG---CTCG--CGCGGCGCGAGGGTTCAAATCCCTCCTTCTCCG---
D00009710 Listeria_monocytogenes_EGD-e Ser GCT -GGGGAAGTACTCAAGT--GGCTGAAGAGGCGCCCCTGCTAAGGGTGTAGGTCG---CTCG--CGCGGCGCGAGGGTTCAAATCCCTCCTTCTCCGCCA
D00010189 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Ser GCT -GGGGAAGTACTCAAGT--GGCTGAAGAGGTGCCCCTGCTAAGGGTATAGGTCG---CTCG--CGCGGCGCGAGGGTTCAAATCCCTCCTTCTCCG---
D00010190 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Ser GCT -GGGGAAGTACTCAAGT--GGCTGAAGAGGCGCCCCTGCTAAGGGTGTAGGTCG---CTCG--CGCGGCGCGAGGGTTCAAATCCCTCCTTCTCCGCCA
D00010193 Mesoplasma_florum_L1 Ser GCT -GGGTTAATACTCAAGTT-GGTG-AAGAGGACACCCTGCTAAGGTGTTAGGTCG---GTTT--CCGGCG-CAAGAGTTCGAGTCTCTTTTAACCCGCCA
D00009742 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Ser GCT -GGAGAGGTGGCCGAGT--GGTCGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTAGAGGTC--AAA--AGCTTCT-CGTGGGTTCGAATCCCATCCTCTCCGCCA
D00010042 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Ser GCT -GGAGGCGTGCCAGAGC--GGCCGAATGGGGCTCACTGCTAATGAGTTGTCCCCC--TTCA-AGGGGAC-CGGAGGTTCAAATCCTCTCGCCTCCG---
D00009619 Mycobacterium_leprae_TN Ser GCT -GGAGGCGTGCCAGAGC--GGCCGAATGGGGCTCACTGCTAATGAGTTGTCCCCCT-TGG-AAGGGGAC-CGGAGGTTCAAATCCTCTCGCCTCCG---
D00009598 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Ser GCT -GGAGGCGTGCCAGAGC--GGCCGAATGGGGCTCACTGCTAATGAGTTGTCCCCC--TTCA-AGGGGAC-CGGAGGTTCAAATCCTCTCGCCTCCG---
D00010111 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Ser GCT -GGAGGCGTGCCAGAGC--GGCCGAATGGGGCTCACTGCTAATGAGTTGTCCCCC--TTCA-AGGGGAC-CGGAGGTTCAAATCCTCTCGCCTCCG---
D00002616 Mycoplasma_capricolum Ser GCT -GGGTTAATACTCAAGTT-GGTG-AAGAGGACACCCTGCTAAGGTGTTAGGTCG---GTCT--CCGGCG-CGAGGGTTCGAGTCCCTCTTAACCCGCCA
D00010039 Mycoplasma_gallisepticum_R Ser GCT -GGGAGCATACTCAAGT--GGTT-AAGAGGACACCCTGCTAAGGTGTTAGATCA---GCA---ATGGTG-CGTGGGTTCGAATCCCACTGCTTCCGCCA
D00002617 Mycoplasma_genitalium Ser GCT -GGGAGCGTACTCAAGT--GGTT-AAGAGGACACCCTGCTAAGGTGTTAGATCGT--TCT--ACGGGTG-CGTGGGTTCGAATCCCACCGCTTCCGCCA
D00009664 Mycoplasma_genitalium_G37 Ser GCT -GGGAGCGTACTCAAGT--GGTT-AAGAGGACACCCTGCTAAGGTGTTATCGT----TCT----ACGGTGCGTGGGTTCGAATCCCACCGCTTCCGCC-
D00002622 Mycoplasma_pneumoniae Ser GCT -GGGAGCGTACTCAAGT--GGTT-AAGAGGACACCCTGCTAAGGTGTT_ATCGT---TCT---ACGGTG-CGTGGGTTCGAATCCCACCGCTTCCGCCA
D00009669 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Ser GCT -GGGAGCGTACTCAAGT--GGTT-AAGAGGACACCCTGCTAAGGTGTTATCGT----TCT----ACGGTGCGTGGGTTCGAATCCCACCGCTTCCGCC-
D00009762 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Ser GCT -GGGTCAGTACTCAAGT--GGCTGAAGAGGCGTCCCTGCTAAGGATGTAGGGGA---GGCA--ACTCCCGCGGAGGTTCAAATCCTCTCTGACCCGCCA
D00009602 Neisseria_meningitidis_MC58 Ser GCT -GGAGTAATGGCTGAGA--GGCTGAAGGCACTTCCCTGCTAAGGAAGCATGTGGGG-TCA-ACCTGCAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTTACTCCGCCA
D00009606 Neisseria_meningitidis_Z2491 Ser GCT -GGAGTAATGGCTGAGA--GGCTGAAGGCACTTCCCTGCTAAGGAAGCATGTGGGG-TCA-ACCTGCAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTTACTCCGCCA
D00010079 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Ser GCT -GGAGAGATGGCCGAGT--GGTCGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATAGGCTC-AAA-AAGCTTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00009757 Nostoc_sp._PCC_7120 Ser GCT -GGAGAGGTGGCTGAGT--GGTCGAAAGCGGCAGATTGCTAATCTGTTGTACGGCAGGCAACTCCGTAC-CGAGGGTTCGAATCCCTCCCTCTCCG---
D00009983 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Ser GCT -GGAGAAGTACTCAAGT--GGCTGAAGAGGCGCCCCTGCTAAGGGTGTAGGCCG---TTTA--CGCGGCGCGAGGGTTCAAATCCCTCCTTCTCCGCCA
D00010107 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M Ser GCT -GGAGTAGTACTCAAGT--GGCATAAGAGGCGTCCCTGCTAAGGACGTAGTCCGA--GAA--ATCGGTG-CAAGGGTTCGAATCCCTTCTGCTCCG---
D00009672 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Ser GCT -GGTGAGATGGCCGAGA--GGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGGGGTC-AAA-AACTCCAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCACCGCCA
D00010116 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Ser GCT -GGTGAGATGGCCGAGA--GGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTC-AAA-AGCTGCAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCACCGCCA
D00010151 Porphyromonas_gingivalis_W83 Ser GCT -GGAAGTGTGGGTGAGT--GGCTGAAACCAACAGTTTGCTAAACTGTCGTACGG---GTAA--CTGTAC-CACGAGTTCGAATCTCGTCGCTTCCG---
D00010197 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Ser GCT -GGAGGTGTCGCCTAGTCAGGTCTATGGCGCCCGCCTGCTAAGCGGGTTTGGGAG--GTA--ATCCCAT-CGCGGGTTCAAATCCCGCCACCTCCG---
D00009680 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Ser GCT -GGAGAGGTGGCCGAGT--GGCCGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTACACCTC--AAA--AGGGTGT-CGGGGGTTCGAATCCCCCCCTCTCCGCCA
D00010085 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Ser GCT -GGAGAGCTGGCCGAGT--GGCCGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTACACCTC--AAA--AGGGTGT-CGGGGGTTCGAATCCCCCGTTCTCCGCCA
D00009753 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Ser GCT -GGAGACGTGGCCGAGA--GGTCGAAGGCACTCCCCTGCTAAGGGAGCATCCGGGC-CAAAACCTGGAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCCGTCTCCGCCA
D00010073 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Ser GCT -GGAGCGGTGGCTGAGT--GGTCGAAAGCGCCGGTTTGCTAAATCGGTGAACCGG--GAAA-CTGGTTC-CGCAGGTTCGAATCCTGTCCGCTCCG---
D00010122 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Ser GCT -GGAGACGTGGCCGAGT--GGCTGAAGGCGGCGGTTTGCTAAACCGTTATAGGGTT-GTAAAGCCCTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCCGTCTCCGCCA
D00009734 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Ser GCT -GGAGAGATGGCCGAGT--GGCCGAAGGCGGCGGTTTGCTAAACCGTTATACGGG--TCAT-ACCGTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00009917 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Ser GCT -GGAGAGATGGCCGAGT--GGCCGAAGGCGGCGGTTTGCTAAACCGTTATACGGG--TCAT-ACCGTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00010156 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Ser GCT -GGAGAGATGGCCGAGT--GGCCGAAGGCGACGGTTTGCTAAACCGTTATACGGG--TTAT-ACCGTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00009770 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Ser GCT -GGTGAGGTGGCCGAGA--GGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTC-AAA-AGCTGCAT-CCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA
D00010071 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Ser GCT -GGTGAGGTGGCCGAGA--GGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTC-AAA-AGCTGCAT-CCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA
D00009752 Salmonella_typhimurium_LT2 Ser GCT -GGTGAGGTGGCCGAGA--GGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTC-AAA-AGCTGCAT-CCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA
D00009991 Shewanella_oneidensis_MR-1 Ser GCT -GGAGAGGTGGCCGAGT--GGCCGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGGGCT--TTAT-CTCCCAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCCTTCTCCGCCA
D00009995 Shigella_flexneri_2a_str._301 Ser GCT -GGTGAGGTGGCCGAGA--GGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTC-AAA-AGCTGCAT-CCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA
D00009772 Sinorhizobium_meliloti_1021 Ser GCT -GGAGAGGTGGCCGAGT--GGTCGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATACCG---GAAA--CGGTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTTCTTCTCCGCCA
D00010125 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Ser GCT -GGAAACGTACTCAAGTT-GGCTGAAGAGGCGCCCCTGCTAAGGGTGTAGGTCGC--GAA--AGCGGCG-CGAGGGTTCGAATCCCTCCGTTTCCG---
D00009925 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Ser GCT -GGAAACGTACTCAAGTT-GGCTGAAGAGGCGCCCCTGCTAAGGGTGTAGGTCGC--GAA--AGCGGCG-CGAGGGTTCGAATCCCTCCGTTTCCG---
D00009613 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Ser GCT -GGAAACGTACTCAAGTT-GGCTGAAGAGGCGCCCCTGCTAAGGGTGTAGTCGC---GAAA--GCGGCG-CGAGGGTTCGAATCCCTCCGTTTCC----
D00010022 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Ser GCT -GGAAACGTACTCAAGTT-GGCTGAAGAGGCGCCCCTGCTAAGGGTGTAGGTCGC--GAG--AGCGGCG-CGAGGGTTCGAATCCCTCCGTTTCCG---
D00009998 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Ser GCT -GGAGAATTACTCAAGA--GGCTGAAGAGGACGGTTTGCTAAATCGTTAGGTCGG--GTA--ACTGGCG-CAAGGGTTCGAATCCCTTATTCTCCG---
D00009930 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Ser GCT -GGAGAATTACTCAAGA--GGCTGAAGAGGACGGTTTGCTAAATCGTTAGGTCGG--GTA--ACTGGCG-CAAGGGTTCGAATCCCTTATTCTCCG---
D00010001 Streptococcus_mutans_UA159 Ser GCT -GGAGAATTACTCAAGA--GGCTGAAGAGGACGGTTTGCTAAATCGTTAGGTCGG--GAA--ACCGGCG-CGGGGGTTCGAATCCCCCATTCTCCG---
D00009726 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Ser GCT -GGAGAATTACTCAAGA--GGCTGAAGAGGACGGTTTGCTAAATCGTTAGGTCGG--GTA--ACTGGCG-CAAGGGTTCGAATCCCTTATTCTCCG---
D00009722 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Ser GCT -GGAGAATTACTCAAGA--GGCTGAAGAGGACGGTTTGCTAAATCGTTAGGTCGG--GTA--ACTGGCG-CAAGGGTTCGAATCCCTTATTCTCCG---
D00009933 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Ser GCT -GGAGAATTACTCAAGA--GGCTGAAGAGGACGGTTTGCTAAATCGTTAGGTCGG--GTA--ACTGGCG-CAAGGGTTCGAATCCCTTATTCTCCG---
D00010045 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Ser GCT -GGAGAATTACTCAAGA--GGCTGAAGAGGACGGTTTGCTAAATCGTTAGGTCGG--GTA--ACTGGCG-CAAGGGTTCGAATCCCTTATTCTCCG---
D00010066 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Ser GCT -GGAGGCGTCGCCTAGTCCGGTCTATGGCGCCGCACTGCTAATGCGGTTTGGGAC--TTCA-ATCCCAT-CGAGGGTTCAAATCCCTCCGCCTCCG---
D00009986 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Ser GCT -GGAGGCGTCGCCTAGTCCGGTCTATGGCGCCGCACTGCTAATGCGGTTTGGGTC--TTAA-AGCCCAT-CGAGGGTTCAAATCCCTCCGCCTCCG---
D00002639 Streptomyces_lividans Ser GCT -GGAGGCGTCGCCTAGTCCGGTCTATGGCGCCGCACTGCTAATGCGGTTTGGGTC--TTAA-AGCCCAT-CGAGGGTTCAAATCCCTCCGCCTCCG---
D00010161 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Ser GCT -GGAGAGATACCCAAGT--GGTTGAAGGGGCGGCTTTGCTAAAGCTGTAGGGGGC--GCA--AGCCCCG-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00010162 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Ser GCT -GGAGAGATACCCAAGT--GGCTGAAGGGGCGGCTTTGCTAAAGCTGTAGGGGGC--GCA--AGCCCCG-CGAGGGTTCAAATCCCTCTCTCTCCGCCA
D00002664 Synechocystis_sp. Ser GCT -GGAGAGATGGCTGAGC--GGTTGAAAGCGGCTCCCTGCTAAGGAGTTATGGGGTT-TAT-AGCTCCAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCG---
D00009684 Synechocystis_sp._PCC_6803 Ser GCT -GGAGAGATGGCTGAGC--GGTTGAAAGCGGCTCCCTGCTAAGGAGTTATGGGGTT-TAT-AGCTCCAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCTCCG---
D00009944 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Ser GCT -GGAGAAGTACCCAAGT--GGTG-AAGGGGCGGTCCTGCTAAGACTGTAGGTCGGGGAAAAACCCCGGCGCGTGGGTTCGAATCCCACCTTCTCCGCCA
D00009936 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Ser GCT -GGAGAGGTGGCTGAGT--GGTCGAAAGCGGCAGATTGCTAATCTGTTGATAGGCAGGTAACTCCTATC-CGAGGGTTCGAATCCCTCCCTCTCCG---
D00009688 Thermotoga_maritima_MSB8 Ser GCT -GGAGAGGTGGCCGAGC--GGCCTAAGGCGCTTGCCTGCTAAGCAAGTGTGGGG---GTTT--CCCCAC-CGTGGGTTCGAATCCCACCCTCTCCGCCA
D00010201 Thermus_thermophilus_HB27 Ser GCT TGGAGAGGTGGCCGAGT--GGTCGAAGGCGGCACCCTGCTAAGGTGTTGCACCGGG-AAA-ACCGGTGC-CGCGGGTTCGAATCCCGCCCTCTCCGCCA
D00002632 Treponema_pallidum Ser GCT -GGAGCGGTGCGAGAGT--GGTCGAATCGGGCTCCCTGCTAAGGAGTTGCATTC---ATCC--GAGTGC-CGGGGGTTCGAATCCCCCCTGCTCCG---
D00009676 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Ser GCT -GGAGCGGTGCGAGAGT--GGTCGAATCGGGCTCCCTGCTAAGGAGTTGCATTC---ATCC--GAGTGC-CGGGGGTTCGAATCCCCCCTGCTCCG---
D00010028 Tropheryma_whipplei_str._Twist Ser GCT -GGAGACGTCGCATAGCCAGGTCTAGTGCGCCACCCTGCTAAGGTGGAGTGCCC---GAAA--GGGTAC-CGTGGGTTCAAATCCCACCGTCTCCG---
D00010032 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Ser GCT -GGAGACGTCGCATAGCCAGGTCTAGTGCGCCACCCTGCTAAGGTGGAGTGCCC---GAAA--GGGTAC-CGTGGGTTCAAATCCCACCGTCTCCG---
D00009622 Ureaplasma_parvum_serovar_3 Ser GCT -GGAAACATACTCAAGT--GGTT-AAGAGGGCACCCTGCTAAGGTGTTAGGTCG---TTC---TGCGGCGCGTGGGTTCGAATCCCACTGTTTCCGCCA
D00009609 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Ser GCT -GGTGAGGTGGCCGAGA--GGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATACGGTT-TAT-AGCCGTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCCTTCACCGCCA
D00009610 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Ser GCT -GGTGAGGTGGCCGAGA--GGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATACGGTT-TAT-AGCCGTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCCCTCACCGCCA
D00010207 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Ser GCT -GGAAGGGTGGCCGAGC--GGCTGAAGGCGGCGGTTTGCTAAACCGTTATACGACC-CAAAAGTCGTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCCTTCCG---
D00009954 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Ser GCT -GGAGCGATGCCCGAGC--GGCTGAAGGGGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATAGGGTC-AAA-AGCTCTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCGCTCCGCCA
D00009950 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Ser GCT -GGAGCGATGCCCGAGC--GGCTGAAGGGGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATAGGGTC-AAA-AGCTCTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCGCTCCGCCA
D00009692 Xylella_fastidiosa_9a5c Ser GCT -GGAGTGATGCCCGAGA--GGCCGAAGGGGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATAGGGTC-AAA-AACTCTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCACTCCGCCA
D00009696 Xylella_fastidiosa_9a5c Ser GCT -GGTGAGGTGGCCGAGA--GGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTC-AAA-AGCTGCAT-CCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCC-
D00010034 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Ser GCT -GGAGTGATGCCCGAGA--GGCCGAAGGGGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATAGGGTC-AAA-AACTCTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCTCACTCCGCCA
D00010163 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Ser GCT -GGTGAGGTGGCCGAGA--GGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATACGGTC-AAA-AGCTGTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCCCTCACCGCCA
D00009747 Yersinia_pestis_CO92 Ser GCT -GGTGAGGTGGCCGAGA--GGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATACGGTC-AAA-AGCTGTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCCCTCACCGCCA
D00009959 Yersinia_pestis_KIM Ser GCT -GGTGAGGTGGCCGAGA--GGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATACGGTC-AAA-AGCTGTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCCCTCACCGCCA
D00010168 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Ser GCT -GGTGAGGTGGCCGAGA--GGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATACGGTC-AAA-AGCTGTAT-CGAGGGTTCGAATCCCTCCCTCACCGCCA
D00009856 Arabidopsis_thaliana Ser GCT -GTCGCTTTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTGTTCCTGCTAAGTACATGGGG-----TTT-----CCCCGCGAGAGTTCGAATCTGTCAGGCGACG---
D00009857 Arabidopsis_thaliana Ser GCT -GTCGCTTTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTGTGCCTGCTAAGTACATGGGA-----TTT-----TCCCGCGAGAGTTCGAATCTCTCAGGCGACG---
D00009858 Arabidopsis_thaliana Ser GCT -GTCGCTTTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGCTCGCCTGCTAAGTGAGTGGGA-----TTT-----TCCCGCGAGAGTTCGAATCTCTCAGGCGAC----
D00009859 Arabidopsis_thaliana Ser GCT -GACACTTTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTTTGCCTGCTAAGTAAATGGGG-----TTT-----CCCCGCGAGAGTTCGAATCTCTCAGGTGTC----
D00009860 Arabidopsis_thaliana Ser GCT -GTCGCTTTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTGTGCCTGCTAAGTACATGGGG-----TTT-----CCCCGCGAGAGTTCGAATCTCTCAGGCGACG---
D00009861 Arabidopsis_thaliana Ser GCT -GTCGCTTTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTGTGCCTGCTAAGTACATGGGC-----TCT-----GCCCGCGAGAGTTCGAATCTCTCAGGCGAC----
D00009862 Arabidopsis_thaliana Ser GCT -GTCGCTTTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTTTGCCTGCTAAGTAAATGGGG-----TTT-----CCCCGCGAGAGTTCGAATCTCTCAGGCGACG---
D00009863 Arabidopsis_thaliana Ser GCT -GGAGGGATGGCTGAGT--GGCTTAAGGCATTGGTTTGCTAAATCGACATACAAG--AAG--ATTGTAT-CATGGGTTCGAATCCCATTTCCTCCG---
D00002901 Caenorhabditis_elegans Ser GCT -GATCAGGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTGCTAATCCATTGGGG-----TTT-----CCCCGCGTGAGTTCGAATCTCATCCTGATCG---
D00009877 Caenorhabditis_elegans Ser GCT -GATCAGGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTGCTAATCCATTGG-------GGT-------TT-CCCCGCGTCAAATCTCATCCTGATC----
D00009878 Caenorhabditis_elegans Ser GCT -GATCAGGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTGCTAATCCATTGGGG-----TTT-----CCCCGCGTGAGTTCGAATCTCATCTTGATCG---
D00009879 Caenorhabditis_elegans Ser GCT -GATCAGGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTGCTAATCCATTGGGG-----TTT-----CCCCGCGTGAGTTCGAATCTCATCCTGATCG---
D00010174 Candida_glabrata_CBS_138 Ser GCT -GTCCCAGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGCCCTGCTATGGCATTGGGT-----TTT-----ACCTGCGCAGGTTCGAATCCTGTCTGTGACG---
D00002872 Dictyostelium_discoideum Ser GCT -GACACCTTAGCAAAGT--GGTT-AATGCGGCGCCCTGCTAAGGCGTTCTC------TTCG-----GAGGCGCAGGTTCGAACCCTGCAGGTGTCG---
D00009895 Drosophila_melanogaster Ser GCT -GACGAGGTGGCCGAGA--GGTT-AAGGCGTTGGACTGCTAATCCAATGTGC-----TCT-----GCACGCGTGGGTTCGAATCCCATCCTCGTC----
D00009896 Drosophila_melanogaster Ser GCT -GACGAGGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTTGGACTGCTAATCCAATGTGC-----TCT-----GCACGCGTGGGTTCGAATCCCATCCTCGTC----
D00009958 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Ser GCT -GACCTCGTAGCAAAGT--GGTT-AACGCGGTAGATTGCTAATCTATTTCCT-----TCT-----GGGAGCGCGAGTTCGAATCTCGCCGAGGTCG---
D00010238 Gallus_gallus Ser GCT -GATGAGGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTGCTAATCCATTGTGC-----TCT-----GCACGCGTGGGTTCGAATCCCACTCTCATCG---
D00010239 Gallus_gallus Ser GCT -GACGAGGTGGCCGAGT--GGTG-AAGGTGATGGACTGCTAATCCATTGTGC-----TCT-----GCACGCGTGGGTTCGAATCCCACCCTCGTCG---
D00010240 Gallus_gallus Ser GCT -GACGAGGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTGCTAATCCATTGTGC-----TCT-----GCACGCGTGGGTTCGAATCCCATCCTCGTCG---
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D00009833 Homo_sapiens Ser GCT -GGAGAGGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTGCTAATCCATTGTGC-----TCT-----GCACGCGTGGGTTCGAATCCCATCCTCGTC----
D00009834 Homo_sapiens Ser GCT -GACGAGGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTGCTAATCCATTGTGC-----TCT-----GCACACGTGGGTTCGAATCCCATCCTCGTC----
D00009835 Homo_sapiens Ser GCT -GACGAGGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTGCTAATCCATTGTGC-----TCT-----GCACGCGTGGGTTCGAATCCCATCCTCGTC----
D00009836 Homo_sapiens Ser GCT -GACGAGGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTGCTAATCCATTGTGC-----TCT-----GCACGCGTGGGTTCGAATCCCACCTTCGTC----
D00009837 Homo_sapiens Ser GCT -GACGAGGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTGCTAATCCATTGTGC-----TCT-----GCACGCGTGGGTTCGAATCCCACCCTCGTC----
D00002895 Nicotiana_rustica Ser GCT -GTCGCCTTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTGTGCCTGCTAAGTACATGGGG-----TTT-----CCCCGCGAGAGTTCGAATCTCTCAGGCGACG---
D00002896 Nicotiana_rustica Ser GCT -GTCGCTTTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGTGTGCCTGCTAAGTACATGGGG-----TTT-----CCCCGCGAGAGTTCGAATCTCTCAGGCGACG---
D00010280 Pan_troglodytes Ser GCT -GTCGAGGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTGCTAATCCATTGTGC-----TTT-----GCACGCGTGGGTTCGAATCCCATACTCGTCG---
D00010281 Pan_troglodytes Ser GCT -GACGAGGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTGCTAATCCGTTGTGC-----TCT-----GCACACATGGGTTCGAATCCCATCCTCGTCG---
D00010282 Pan_troglodytes Ser GCT -GACGAGGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTGCTAATCCATTGTGC-----TCT-----GCACGCGTGGGTTCGAATCCCACCCTCGCCG---
D00010283 Pan_troglodytes Ser GCT -GACGAGGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTGCTAATCCATTGTGC-----TCT-----GCACGCGTGGGTTCGAATCCCATCCTCGTCG---
D00010284 Pan_troglodytes Ser GCT -GACGAGGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTGCTAATCCATTGTGC-----TCT-----GCACGCATGGGTTCGAATCCCATCCTCGTCG---
D00010285 Pan_troglodytes Ser GCT -GACGAGGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTGCTAATCCATTGTGC-----TCT-----GCACGCGTGGGTTCGAATCCCACCTTCGTCG---
D00002868 Plasmodium_falciparum Ser GCT -AGAGAAATGACTGAGA--GGTTTATAGTTATAAATTGCTAATTTATTGTATATAT-AATAATATTATACCAAGGGTTCGAATCCCTTTTTCTCTA---
D00010220 Plasmodium_falciparum_3D7 Ser GCT -GATAACGTGCCCGAGT--GGTT-AAGGGGTTGGACTGCTAATCCAATGGGT-----TCT-----GCCCGCGCAGGTTCGATTCCTGCCGTTGTCG---
D00002878 Saccharomyces_cerevisiae Ser GCT -GTCCCAGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGCCCTGCTAAGGCATTGGGT-----TTT-----ACCTGCGCAGGTTCGAATCCTGTCTGTGACG---
D00009889 Saccharomyces_cerevisiae Ser GCT -GTCCCAGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGCCCTGCTAAGGCATTGGGT-----TTT-----ACCTGCGCAGGTTCGAATCCTGTCTGTGACG---
D00009901 Schizosaccharomyces_pombe Ser GCT -GACAACGTGGCCGAGT--GGTTTAAGGCGTTCGCCTGCTAAGCGGATTCCC-----TTT-----GGGAGCGCAGGTTCGAATCCTGCCGTTGTC----
D00010256 Takifugu_rubripes Ser GCT -GACGAGGTGGCCGAGA--GGTT-AAGGCGATGGACTGCTAATCCATTG-------------------TGCCTGGATTCGAATCCCATCCTCGTCG---
D00010257 Takifugu_rubripes Ser GCT -GATGAGCTGGCGGAGT--GGTG-AAGGCGATAGACTGCTAATCTATTGTGC-----TCT-----GCATGCATGGGTTCAAATCCCATCCTCATTG---
D00010258 Takifugu_rubripes Ser GCT -GATGAGGTGGCCGAGA--GGTT-AAGGCGATGGACTGCTAATCCATTGTGC-----TCT-----GCACGCGTGGGTTAGAATCCCATCCTCGTCG---
D00010259 Takifugu_rubripes Ser GCT -GATGAGGTGGCCGAGA--GGTT-AAGGCGATGGACTGCTAATCCATTGTGC-----TCT-----GCACGCGTGGGTTCGAATCCCATCCTCGTCG---
D00010260 Takifugu_rubripes Ser GCT -GACGAGGTGGCCGAGA--GGTT-AAGGCGATGGACTGCTAATCCATTGTGC-----TCT-----GCACGCATGGGTTCGAATCCCATCCTCGTTG---
D00010261 Takifugu_rubripes Ser GCT -GACGGGGTGGCCGAGA--GGTT-AAGGCGATGGACTGCTAATCCATTGTGC-----TCT-----GCACGCGTGGGTTCGAATCCCATCCTCGTCG---
D00010262 Takifugu_rubripes Ser GCT -GACGAGGTGGCCGAGA--GGTT-AAGGCGATGGACTGCTAATCCATTGTGC-----TCT-----GCACGCGTGGGTTCGAATCCCATCCTCGTCG---
D00010263 Takifugu_rubripes Ser GCT -GACGAGGTGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGATGGACTGCTAATCCATTGTGC-----TCT-----GCACGCGTGGGTTCGAATCCCATCCTCGTCG---
D00010270 Pan_troglodytes Ser ACT -GGGGGTATAGCTCAGGG-GGT--AGAGCAATTGACCACTAATCAAGAG-------------------GAGCCCGGTTCAAGTCCGGGTGCCCCCT---
D00010271 Pan_troglodytes Ser ACT -GGCCGGTTAGCTCAGTT-GGTT-AGAGCGTGGTGCTACTAACGCCAAG-------------------GTCGCGGTTTCGATCCCCGTACGGGCCA---
D00002634 Borrelia_burgdorferi Ser GCA -GGCGCTGTACCCAAGT--GGCT-AAGGGAGAAGTCTGCAAAACTTTGA-------------------TTCGCCGGTTCGATTCCGGTCAGCGCCT---
D00002874 Candida_albicans Ser CAG -GATACGATGGCCGAGT--GGTT-AAGGCGAAGGATGCAGGTTCCTTTGGGC-----ATT-----GCCCGCGCAGGTTCGAACCCTGCTCGTGTCG---
D00002886 Candida_cylindracea Ser CAG -GACACCGTGGCCCAGT--GGTT-ACGGCGTTGGACGCAGAATCCATTGAG------CTTG-----CTCGCGCGGGTTCGAATCCCGTCGGTGTCT---
D00009027 Aeropyrum_pernix_K1 Arg CCG -GGGCCCGTAGCTCAGCCAGGAT-AGAGCGCCGGCCTCCGGAGCCGGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGCCCGCC-
D00002412 Archaeoglobus_fulgidus Arg CCG -GGGCCCGTGGGGTAGT--GGAT-ATCCTGGAGGTCTCCGGAACCTCCG-------------------A-CCCGGGTTCAATTCCCGGCGGGCCCG---
D00009032 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Arg CCG -GGGCCCGTGGGGTAGT--GGAT-ATCCTGGAGGTCTCCGGAACCTCCG-------------------A-CCCGGGTTCAATTCCCGGCGGGCCCG---
D00009037 Halobacterium_sp._NRC-1 Arg CCG -GGGCGCGTAGCTCAGC--GGAC-AGAGCACTTGGTTCCGGACCAAGAT-------------------GTCAGGGGTTCAAATCCCTTCGCGCCCG---
D00011909 Methanosarcina_acetivorans_C2A Arg CCG -AGGTCTGTGGTGTAGA--GGAT-ATCACTGGAGCCTCCGGAGCTCCGA-------------------A-CCTGGGTTCGATTCCCAGCAGACCTG---
D00009167 Methanosarcina_mazei_Go1 Arg CCG -AGGTCTGTGGTGTAGA--GGAT-ATCACTGGAGCCTCCGGAGCTCCGA-------------------A-CCTGGGTTCGATTCCCAGCAGACCTG---
D00011932 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Arg CCG -GCCCCGGTAGGGTAGA--GGAT-ATCCTTGGAGCCTCCGGAGCTTTAG-------------------A-CCTGGGTTCAAGTCCCAGCCGGGGCG---
D00009054 Pyrococcus_abyssi_GE5 Arg CCG -GGGCCGGTAGTTTAGCCAGGAT-AGAACGCCGCCCTCCGGAGGCGGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGCCC----
D00009059 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Arg CCG -GGGCCGGTAGTTTAGCCAGGAG-AGAACGCCGCCCTCCGGAGGCGGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGCCCGCC-
D00009064 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Arg CCG -GGGCCGGTAGTTTAGCCAGGAT-AGAACGCCGCCCTCCGGAGGCGGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGCCCGCCA
D00012013 Staphylothermus_marinus_F1 Arg CCG -GGGCCCGTAGCCTAGCCAGGAA-AGGGCGCCGGCCTCCGGAGCCGGAG-------------------ATCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGCCCG---
D00012063 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Arg CCG -GGACCCGTAGCTTAGCCAGGAC-AGAGTGCCAGTCTCCGGAACTGGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGTCCG---
D00009069 Sulfolobus_solfataricus_P2 Arg CCG -GGACCCGTAGCTCAGCCAGGAT-GGAGCGCCGGCCTCCGGAGCCAGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGTCC----
D00009199 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Arg CCG -GGGCCCGTAGCTTAGCCAGGAC-AAAGCACGGGTCTCCGGAACCCGAG-------------------ATCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGCCCG---
D00009074 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Arg CCG -GGGCCCGTAGTGTAAAC-GGAT-ATCACAGGGGCCTCCGGAGCCCCTA-------------------A-TCCGGGTTCGATTCCCGGCGGGCCCGCCA
D00009078 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Arg CCG -GGGCCCGTAGTGTAAAC-GGAT-ATCACAGGGGCCTCCGGAGCCCCTA-------------------A-TCCGGGTTCGATTCCCGGCGGGCCCG---
D00009493 Acinetobacter_sp._ADP1 Arg CCG -GCGCTCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGTACAGGTTTCCGAAGCCTGGG-------------------GTCGTGGGTTCGATCCCCGCCGAGCGCACCA
D00002456 Aeromonas_hydrophila Arg CCG -GCGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGCTGCCCTCCGGAGGCAGAG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCTGTCGGGCGCACCA
D00009016 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Arg CCG -GCACCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTGTTGGATTCCGATTCCAAAG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCTGTCGGGTGCGCCA
D00008948 Aquifex_aeolicus_VF5 Arg CCG -GTGCCCGTAGCTCAGGT-GGAC-AGAGCACGGGGCTCCGGACCCCGGG-------------------GTCGCGGGTTCAAGTCCCGCCGGGCACA---
D00009381 Bacillus_anthracis_str._Ames Arg CCG -GCGCCCATAGCTCAGTC-GGAT-AGAGCGGTGGTTTCCGGTACCACGT--------CT---------GCCGGGGGTTCGAATCCCTCTGGGCGCG---
D00009419 Bacillus_anthracis_str._Sterne Arg CCG -GCGCCCATAGCTCAGTC-GGAT-AGAGCGGTGGTTTCCGGTACCACGT--------CT---------GCCGGGGGTTCGAATCCCTCTGGGCGCG---
D00009463 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Arg CCG -GCGCCCATAGCTCAGTC-GGAT-AGAGCGGTGGTTTCCGGTACCACGT--------CT---------GCCGGGGGTTCGAATCCCTCTGGGCGCG---
D00009335 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Arg CCG -GCGCCCATAGCTCAGTC-GGAT-AGAGCGGTGGTTTCCGGTACCACGT--------CT---------GCCGGGGGTTCGAATCCCTCTGGGCGCG---
D00009275 Bacillus_halodurans_C-125 Arg CCG -GCGCCTATGGTGAAAG--GGAT-ATCACACGAGATTCCGGTTCTCGCG-------------------T-TGTGGGTTCGAATCCTGCTAGGCGCGCCA
D00008818 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Arg CCG -GCGCTCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCGGTGGTTTCCGGTACCACGT--------CT---------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCGAGCGCG---
D00009498 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Arg CCG -GCGCCCATAGCTCAGTC-GGAT-AGAGCGGTGGTTTCCGGTACCACGT--------CT---------GCCGGGGGTTCGAATCCCTCTGGGCGCG---
D00009372 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Arg CCG -GGCCCCGTAGCTTAGT--GAAT-AGAGCGTCAGATTCCGGTTCTGAAG-------------------GTCGTGCGTTTGAATCGCACCGGGGTCA---
D00009383 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Arg CCG -GCACCCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCGCTGCCCTCCGAAGGCAGAG-------------------GTCACAGATTCGAATTCTGTCGGGTGCACCA
D00009503 Bartonella_quintana_str._Toulouse Arg CCG -GCACCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGCTGCCCTCCGAAGGCAGAG-------------------GTCACAGATTCGAATTCTGTCGGGTGCACCA
D00009230 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Arg CCG -GGGTTTGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGCGTCTGTCTCCGGAACAGAAG-------------------GTCGTGGGTTCGATCCCCATCAAGCCCACCA
D00009278 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Arg CCG -GCACCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGTTGCCCTCCGAAGGCAAAG-------------------GTCACACGTTCGAATCGTGTCGGGTGCGCCA
D00008983 Brucella_melitensis_16M Arg CCG -GCACCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGCTGCCCTCCGAAGGCAGAG-------------------GCCACAGGTTCGAATCCTGTCGGGTGCGCCA
D00008822 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Arg CCG -GCGCTCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCGCTACCCTCCGAAGGTAGAG-------------------GTATCAGGTTCAAATCCTGTCGAGCGCA---
D00009338 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Arg CCG -GCGCTTGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCGCTACCCTCCGAAGGTAGAG-------------------GCCTCAGGTTCGAATCCTGTCAAGCGCA---
D00009174 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Arg CCG -GCGCTCGTAGCTCATTTTGGAT-AGAGCGCTATCTTCCGAAGGTAGAG-------------------GTATCAGGTTCAAATCCTGTCGAGCGCA---
D00009506 Candidatus_Blochmannia_floridanus Arg CCG -GCGTCCGTAGCTTAATT-GGAT-AGAGCATTGCCCTCCGAAGGCAAAG-------------------GTGTCAGGTTCGATCCCTGTCGGGCGCA---
D00008906 Caulobacter_crescentus_CB15 Arg CCG -GCACCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGTTGCCCTCCGAAGGCAAAG-------------------GTCACACGTTCGAATCGTGTCGGGTGCGCCA
D00009161 Chlorobium_tepidum_TLS Arg CCG -GCCCTTGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGCAGCAGTTTCCGGAACTGAAG-------------------GTCGGCAGTTCGAATCTGTCCAAGGGCG---
D00009391 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Arg CCG -GTCTCCGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGCATTGGTTTCCGGTACCAAAG-------------------GTCGCAAGTTCGAATCTTGTCGGGGACA---
D00009237 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Arg CCG -GCCTCCGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGCACCGGTTTCCGGTACCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCGACTCCTATCGGGGGCA---
D00009181 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Arg CCG -GCCTCCGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGCACCGGTTTCCGGTACCGAAG-------------------GTCGTAGGTTCGACTCCTATCGGGGGCA---
D00008910 Deinococcus_radiodurans_R1 Arg CCG -GCACTCGTAGCTCAGGT-GGAT-AGAGCGTTGGCCTCCGGAGCCAAAG-------------------GCCACTGGTTCGAGTCCAGTCGAGTGCACCA
D00009469 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Arg CCG -GGGCAATTAGCTCAGAT-GGAT-AGAGCGTTGGCCTCCGGAGCCAAAG-------------------GCCGCAAGTTCGAATCTTGCATTGCCCACCA
D00009287 Enterococcus_faecalis_V583 Arg CCG -GCGCCCTTAGTGTAGT--GGAT-ATCACGTAAGATTCCGGTTCTTGAG-------------------A-CGGGGGTTCGATTCCCTCAGGGCGCG---
D00002450 Escherichia_coli Arg CCG -GCGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGCTGCCCTCCGGAGGCAGAG-------------------GTCTCAGGTTCGAATCCTGTCGGGCGCGCCA
D00009345 Escherichia_coli_CFT073 Arg CCG -GCGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGCTGCCCTCCGGAGGCAGAG-------------------GTCTCAGGTTCGAATCCTGTCGGGCGCGCCA
D00008857 Escherichia_coli_K12 Arg CCG -GCGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGCTGCCCTCCGGAGGCAGAG-------------------GTCTCAGGTTCGAATCCTGTCGGGCGCGCCA
D00008861 Escherichia_coli_O157:H7 Arg CCG -GCGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGCTGCCCTCCGGAGGCAGAG-------------------GTCTCAGGTTCGAATCCTGTCGGGCGCGCCA
D00008874 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Arg CCG -GCGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGCTGCCCTCCGGAGGCAGAG-------------------GTCTCAGGTTCGAATCCTGTCGGGCGCGCCA
D00009426 Geobacter_sulfurreducens_PCA Arg CCG -GGGCGGTTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCGCAGGCCTCCGAAGCCTGAG-------------------GTCGCTGGTTCGAATCCAGTATCGCCCGCCA
D00002458 Haemophilus_influenzae Arg CCG -GCGTTCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCGTTGGCCTCCGGAGCCAAAG-------------------GTCGCAAGTTCGAATCTTGTCGAGCGCGCCA
D00008896 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Arg CCG -GCGTTCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCGTTGGCCTCCGGAGCCAAAG-------------------GTCGCAAGTTCGAATCTTGTCGAGCGCGCCA
D00009291 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Arg CCG -GCGCCCGTGGTGTAAT--GGAT-AGCACGTAAGATTCCGGTTCTTGAG-------------------A-TGGGGGTTCGATTCCCTCCGGGCGCA---
D00009431 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Arg CCG -GCCCCCATAGCTCAGG--GGAT-AGAGCGTCTGCCTCCGGAGCAGAAG-------------------GCCGTAGGTTCAAATCCTACTGGGGGCA---
D00009242 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Arg CCG -GTACCTATAGCTCAAC--GGAT-AGAGTACAGGCCTCCGGAGCCTGTG-------------------G-TCCGGGTTCGAGTCCCGGTAGGTACA---
D00008954 Listeria_innocua_Clip11262 Arg CCG -GCCCTCGTGGTGCAAC--GGAT-AGCACGTAAGATTCCGGTTCTTAAA-------------------A-TGGGGGTTCGATTCCCTCCGAGGGCA---
D00008958 Listeria_monocytogenes_EGD-e Arg CCG -GCCCTCGTGGTGCAAC--GGAT-AGCACGTAAGATTCCGGTTCTTAAA-------------------A-TGGGGGTTCGATTCCCTCCGAGGGCA---
D00009473 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Arg CCG -GCCCTCGTGGTGCAAC--GGAT-AGCACGTAAGATTCCGGTTCTTAAA-------------------A-TGGGGGTTCGATTCCCTCCGAGGGCA---
D00008988 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Arg CCG -GCACCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGCTGCCCTCCGAAGGCAGAG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCTGTCGGGTGCGCCA
D00009320 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Arg CCG -GCCCCCGTAGCTCAGG--GGAT-AGAGCGTCTGCCTCCGGAGCAGAAG-------------------GCCGCAGGTTCGAATCCTGCCGGGGGCA---
D00008846 Mycobacterium_leprae_TN Arg CCG -GCCCCCGTAGCTCAGG--GGAT-AGAGCATCTGCCTCCGGAGCAGAAG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCCGGGGGCACCA
D00008825 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Arg CCG -GCCCCCGTAGCTCAGG--GGAT-AGAGCGTCTGCCTCCGGAGCAGAAG-------------------GCCGCAGGTTCGAATCCTGCCGGGGGCA---
D00009396 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Arg CCG -GCCCCCGTAGCTCAGG--GGAT-AGAGCGTCTGCCTCCGGAGCAGAAG-------------------GCCGCAGGTTCGAATCCTGCCGGGGGCA---
D00008830 Neisseria_meningitidis_MC58 Arg CCG -GCACCCATAGCTCAGTT-GGA--AGAGTGTCAGTTTCCGAAGCTGGAG-------------------GTCACAGGTTCGATCCCTGTTGGGTGCGCCA
D00009367 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Arg CCG -GCGCCCATAGCTCAGT--GGAT-AGAGTACTGCCCTCCGAAGGCAGGG-------------------GTCACACGTTCGAATCGTGTTGGGCGCGCCA
D00009009 Nostoc_sp._PCC_7120 Arg CCG -GGGCGCGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGCAACAGATTCCGGTTCTGTGG-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCTCCGCGCTCG---
D00009244 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Arg CCG -GCGCCCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCACTGGTTTCCGGTACCAGGT--------TT---------GCCGGGGGTTCGAATCCCTCCGGGCGCG---
D00008922 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Arg CCG -GCGCTCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCGTTGGCCTCCGGAGCCAAAG-------------------GTCGCAGGTTCAAATCCTGTCGAGCGCGCCA
D00009406 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Arg CCG -GCGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGCTGCCCTCCGGAGGCAGAG-------------------GTCTCAGGTTCGAATCCTGTCGGGCGCGCCA
D00009434 Porphyromonas_gingivalis_W83 Arg CCG -GGCCTGGTAGCTTAGC--TGAATAGAGCGTCAGATTCCGGTTCTGAAG-------------------GTCGCGGGTTTGAATCCCGCCCGGGTCA---
D00009477 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Arg CCG -GCTCCCGTAGCTCAGG--GGAT-AGAGCACCGCCCTCCGGAGGCGGGA-------------------G-CGAGGGTTCGAATCCCTCCGGGAGCG---
D00008931 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Arg CCG -GCATCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTGCCCTCCGAAGGCAGGG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCGCCGGATGCGCCA
D00009374 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Arg CCG -GCACCAGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTGCCCTCCGAAGGCAGGG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCGCCTGGTGCACCA
D00009004 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Arg CCG -GCGCCCGTAGCTCAAT--GGAT-AGAGTACTGCCCTCCGAAGGCAGGG-------------------GTTGCTGGTTCGATCCCAGCCGGGCGCGCCA
D00009361 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Arg CCG -GCACCCGTGGCACAATT-GGAT-AGCGCGTCGGCCTCCGAAGCCGAAG-------------------GTTGTGGGTTCGAACCCCGCCGGGTGTA---
D00009409 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Arg CCG -GCACCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGTTGCCCTCCGAAGGCAAAG-------------------GTCACACGTTCGAATCGTGTCGGGTGCGCCA
D00008979 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Arg CCG -GCATTCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGTTGCCCTCCGAAGGCAAAG-------------------GTCGTTGGTTCAAATCCAATCGAATGCA---
D00009176 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Arg CCG -GCATTCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCATTGCCCTCCGAAGGCAAAG-------------------GTCATTGGTTCAAATCCAATCGAATGCACCA
D00009438 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Arg CCG -GCATTCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCATTGCCCTCCGAAGGCAAAG-------------------GTCATTGGTTCAAATCCAATCGAATGCACCA
D00009023 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Arg CCG -GCGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGCTGCCCTCCGGAGGCAGAG-------------------GTCTCAGGTTCGAATCCTGTCCGGCGTACCA
D00009356 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Arg CCG -GCGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGCTGCCCTCCGGAGGCAGAG-------------------GTCTCAGGTTCGAATCCTGTCGGGCGTACCA
D00002454 Salmonella_typhimurium Arg CCG -GCGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGCTGCCCTCCGGAGGCAGAG-------------------GTCTCAGGTTCGAATCCTGTCGGGCGTACCA
D00009000 Salmonella_typhimurium_LT2 Arg CCG -GCGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGCTGCCCTCCGGAGGCAGAG-------------------GTCTCAGGTTCGAATCCTGTCGGGCGTACCA
D00009251 Shewanella_oneidensis_MR-1 Arg CCG -GCGCCCATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGCACCCCTCCGGAGGGTGAG-------------------GCCGAAGGTTCGAATCCTTTTGGGCGCACCA
D00009263 Shigella_flexneri_2a_str._301 Arg CCG -GCGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGCTGCCCTCCGGAGGCAGAG-------------------GTCTCAGGTTCGAATCCTGTCGGGCGCGCCA
D00009413 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Arg CCG -CTCCTTGTGGTGTAAT--GGAT-AACACGTAAGATTCCGGTTCTTAAG-------------------A-TAGGGGTTCGATTCCCTTCAAGGAGG---
D00009184 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Arg CCG -CTCCTTGTGGTGTAAT--GGAT-AACACGTAAGATTCCGGTTCTTAAG-------------------A-TAGGGGTTCAATTCCCTTCAAGGAGG---
D00008843 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Arg CCG -CTCCTTGTGGTGTAAT--GGAT-AACACGTAAGATTCCGGTTCTTAAG-------------------A-TAGGGGTTCAATTCCCTTCAAGGAGG---
D00009295 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Arg CCG -CCCCTCGTAGTGTAAT--GGAT-AACACATAAGATTCCGGTTCTTAAA-------------------A-TAGAGGTTCGATTCCTCTCGAGGGGG---
D00009269 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Arg CCG -CCATCTTTAGTGTAAT--GGAT-ATCACACAAGATTCCGGTTCTTGGG-------------------A-TAGGGGTTCGATTCCCTTAAGATGGA---
D00009189 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Arg CCG -CCATCTTTAGTGTAAT--GGAT-ATCACACAAGATTCCGGTTCTTGGG-------------------A-TAGGGGTTCGATTCCCTTAAGATGGA---
D00009272 Streptococcus_mutans_UA159 Arg CCG -CCACCTTTAGTGTAAT--GGAT-ATCACGTAAGATTCCGGTTCTTGAG-------------------A-TGGGGGTTCGATTCCCTCAAGGTGGA---
D00008971 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Arg CCG -CCACCCTTAGTGTAAT--GGAT-ATCACGTAAGATTCCGGTTCTTGAG-------------------A-TGGGGGTTCGATTCCCTCAGGGTGGA---
D00008969 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Arg CCG -CCACCTTTAGTGTAAT--GGAT-ATCACGTAAGATTCCGGTTCTTGAG-------------------A-TGGGGGTTCGATTCCCTCAAGGTGGA---
D00009193 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Arg CCG -CCACCTTTAGTGTAAT--GGAT-ATCACGTAAGATTCCGGTTCTTGAG-------------------A-TGGGGGTTCGATTCCCTCAAGGTGGA---
D00009325 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Arg CCG -CCACCTTTAGTGTAAT--GGAT-ATCACGTAAGATTCCGGTTCTTGAG-------------------A-TGGGGGTTCGATTCCCTCAAGGTGGA---
D00009346 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Arg CCG -GCCCCCGTAGCTCAGG--GGAT-AGAGCAACGGCCTCCGGAGCCGTGT-------------------G-CGCAGGTTCGAATCCTGCCGGGGGCA---
D00009250 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Arg CCG -GCCCCCGTAGCTCAGG--GGAT-AGAGCAACGGCCTCCGGAGCCGTGT-------------------G-CGCAGGTTCGAATCCTGCCGGGGGCA---
D00009444 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Arg CCG -GCGCCCGTAGCTCAGC--GGAT-AGAGCGCTTGCCTCCGGAGCAAGAG-------------------GTCGTAGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCA
D00009446 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Arg CCG -GTGCCTATAGCTCAGT--GGAC-AGAGCGCTTGCCTCCGGAGCAAGAG-------------------GTCCCAGGTTCGAATCCTGGTAGGCACGCCA
D00002464 Synechocystis_sp. Arg CCG -GGACACGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGCATCAGGTTCCGGTCCTGAGG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCGTGTTCG---
D00008935 Synechocystis_sp._PCC_6803 Arg CCG -GGACACGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGCATCAGGTTCCGGTCCTGAGG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCGTGTTCG---
D00009207 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Arg CCG -GCGCCTGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGCGTTCGGCTCCGGACCGAAAG-------------------GTCGCAGGTTCGACTCCTGTCAGGCGCACCA
D00009198 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Arg CCG -GGACGTGTGGCTCAGT--GGATTAGAGCATCGGATTCCGGTTCCGAGG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCACGTCCG---
D00008938 Thermotoga_maritima_MSB8 Arg CCG -GTGCCTGTAGCTCAAC--GGAT-AGAGCGCTGGACTCCGGATCCAGAG-------------------GTTGCGGGTTCGAGTCCCGCCAGGCACACCA
D00009482 Thermus_thermophilus_HB27 Arg CCG --CGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGTCGGCCTCCGGAGCCGAAG-------------------GTCAGAGGTTCGAGTCCTCTCGGGCGCGCCA
D00002434 Treponema_pallidum Arg CCG -GGAAGATTAGCTCATTC-GGAT-AGAGCGTTGGCCTCCGGAGCCAAAG-------------------GCGGTGGGTTCAAATCCCGCATCTTCCA---
D00008924 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Arg CCG -GGAAGATTAGCTCATTC-GGAT-AGAGCGTTGGCCTCCGGAGCCAAAG-------------------GCGGTGGGTTCAAATCCCGCATCTTCCA---
D00009300 Tropheryma_whipplei_str._Twist Arg CCG -GCCCCCATAGCTCAGG--GGAT-AGAGCGTCTGCCTCCGGAGCAGAAG-------------------GCCGTGGGTTCAAATCCCGCTGGGGGCG---
D00009304 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Arg CCG -GCCCCCATAGCTCAGG--GGAT-AGAGCGTCTGCCTCCGGAGCAGAAG-------------------GCCGTGGGTTCAAATCCCGCTGGGGGCG---
D00008839 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Arg CCG -GCGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGTTGGCCTCCGGAGCCAAAG-------------------GTCGAAGGTTCAAATCCTTTCGGGCGCGCCA
D00009490 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Arg CCG -GCGCTTGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCGTTGCCCTCCGGAGGCAAAG-------------------GCCGTGGGTTCGAATCCCTCCAAGCACA---
D00009212 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Arg CCG -GCGCTCGTAGCTCAGCC-GGAT-AGAGTAGTGGCTTCCGAAGCCATTG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCGGGCGCACCA
D00009208 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Arg CCG -GCGCTCGTAGCTCAGCC-GGAT-AGAGTAGTGGCTTCCGAAGCCATTG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCGGGCGCACCA
D00008944 Xylella_fastidiosa_9a5c Arg CCG -GCGCTCGTAGCTCAGT--GGATAAGAGTAGTGGCTTCCGAAGCCATTG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCGGGCGCGCCA
D00009307 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Arg CCG -GCGCTCGTAGCTCAGT--GGATAAGAGTAGTGGCTTCCGAAGCCATTG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCGGGCGCGCCA
D00009451 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Arg CCG -GCGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGCTGCCCTCCGGAGGCAGAG-------------------GTCTCAGGTTCGAATCCTGTCGGGCGCACCA
D00008994 Yersinia_pestis_CO92 Arg CCG -GCGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGCTGCCCTCCGGAGGCAGAG-------------------GTCTCAGGTTCGAATCCTGTCGGGCGCACCA
D00009220 Yersinia_pestis_KIM Arg CCG -GCGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGCTGCCCTCCGGAGGCAGAG-------------------GTCTCAGGTTCGAATCCTGTCGGGCGCACCA
D00009452 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Arg CCG -GCGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGCTGCCCTCCGGAGGCAGAG-------------------GTCTCAGGTTCGAATCCTGTCGGGCGCACCA
D00009106 Arabidopsis_thaliana Arg CCG -GACCGCGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGCTCGCCTCCGGAGCGGGAG-------------------ATTGTGGGTTCGAGTCCCACCGTGGTC----
D00009107 Arabidopsis_thaliana Arg CCG -GTTTGCGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGCTCGCCTCCGAAGCGGGAG-------------------ATTGTGGGTTCGAATCCCATCGCGAAC----
D00009108 Arabidopsis_thaliana Arg CCG -GATCCCATAGCGGAGT--GGAT-ATCGCGTTAGACTCCGAATCTAAAG-------------------GTCGTGGGTTCGATTCCCACTGGGATC----
D00009126 Caenorhabditis_elegans Arg CCG -GCCCGCGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCACCGGACTCCGGAACCGGGA-------------------A-TGGGGGTTCGAGTCCCCCCGCGAGC----
D00009127 Caenorhabditis_elegans Arg CCG -GCTCGCGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCACCGGACTCCGGAACCGGGA-------------------A-TGGGGGTTCAAGTCCCTCCGCGAGC----
D00009459 Candida_glabrata_CBS_138 Arg CCG -GCCCTTTTAGTGCAAT--GGTT-AGCATACATTTTTCCGGTGGATGTG-------------------A-TCCGGGTTCGAGTCCCGGGAGGGGCT---
D00009514 Gallus_gallus Arg CCG -GGCCCAGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCATCAGCCTCCGGAGCTGGGG-------------------ATTGTGGGTTCAAGTCCCATCTGGGTCG---
D00009084 Homo_sapiens Arg CCG -GGCCGCGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCTGATTCCGGATCAGAAG-------------------ATTGAGGGTTCGAGTCCCTTCGTGGTC----
D00009554 Pan_troglodytes Arg CCG -GCATTGGTTGTTCAGT--AGT--AGAATTCTCGCCTCCGACGTGGGAG-------------------A-GCCGGGTTCAATTCCCGGCCAATGAA---
D00009555 Pan_troglodytes Arg CCG -GACCCAGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCATCAGCCTCCGGAGCTGGGG-------------------ATTGTGGGTTCGAGTCCCATCTGGGTCG---
D00009556 Pan_troglodytes Arg CCG -GGCCGCGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCTGATTCCGGATCAGAAG-------------------ATTGAGGGTTCGAGTCCCTTCGTGGTCG---
D00009141 Saccharomyces_cerevisiae Arg CCG -GCTCCTCTAGTGCAAT--GGTT-AGCATGCATTCTTCCGGTGGCTGTG-------------------A-TCCGGGTTCGAGTCCCGGGAGGAGC----
D00009154 Schizosaccharomyces_pombe Arg CCG -GGCCTCGTGGCCTAGA--AGT--AAGGCGTTGGTTTCCGGCGCCAAAG-------------------ATCGCGAGTGCAAATCTCGCCGTGGTC----
D00009528 Takifugu_rubripes Arg CCG -AACCCAGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCATCAGCCTCCGGAGCTGGGG-------------------ATTGTGGGTTCAAGTCCCACCTGGGTTG---
D00009529 Takifugu_rubripes Arg CCG -GACCCAGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCATCAGCCTCCGGAGCTGGGG-------------------ATTGTGGGTTCGAGTCCCATCTGGGTCG---
D00009530 Takifugu_rubripes Arg CCG -GGCCCAGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGTATCAGCCTCCGGAGCTGGGG-------------------ATTGTGGGTTCAAGTCCCACCTGGGTCG---
D00009030 Aeropyrum_pernix_K1 Arg TCG -GGGCCCGTAGCTCAGCCAGGACCAGAGCGCCGGCCTTCGGAGCCGGCG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGCCCGCC-
D00002413 Archaeoglobus_fulgidus Arg TCG -GCCCCCGTGGGGTAGG--GGAC-ATCCTGGTGGCCTTCGGAGCCACAG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGCGGGGGCG---
D00009035 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Arg TCG -GCCCCCGTGGGGTAGG--GGAC-ATCCTGGTGGCCTTCGGAGCCACAG-------------------A-CCCGGGTTCGATTCCCGGCGGGGGCG---
D00009040 Halobacterium_sp._NRC-1 Arg TCG -GGGCGCTTAGCTCAGCTTGGAC-AGAGCACTTGGCTTCGGACCAAGAT-------------------GCCGCGGGTTCAAATCCTGCAGCGCCCA---
D00002416 Methanocaldococcus_jannaschii Arg TCG -GCCCTGGTGGTGTAGA--GGAT-ATCACGGGGGACTTCGGATCCCCAA-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCAGGGCC---
D00009047 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Arg TCG -GCCCTGGTGGTGTAGA--GGAT-ATCACGGGGGACTTCGGATCCCCAA-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCAGGGCC---
D00011848 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Arg TCG -GGGCTCGTGGTTTAGTCTGGAT-ATGATACTGGACTTCGGATCCAGTG-------------------ATCGGGGGTTCGAATCCCTCCGAGCTCG---
D00009050 Methanococcus_maripaludis Arg TCG -GGGCCCGTGGTTTAGCTTGGAT-AGAATACAGGGCTTCGGACCCTGTG-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCTCCGGGCTC----
D00009225 Methanopyrus_kandleri_AV19 Arg TCG -GGGCCGGCAGCTCAGTCTGGAC-AGAGCGCGGGCCTTCGGAGCCCCGT--------G----------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGCCCA---
D00011914 Methanosarcina_acetivorans_C2A Arg TCG -GGGCTCGTGGGGTAGCCAGGAT-ATCCTAATGGGCTTCGAACCCATTG-------------------A-CTCGTGTTCGAATCGCGGCGGGCCCG---
D00009170 Methanosarcina_mazei_Go1 Arg TCG -GGGCTCGTGGGGTAGCCAGGAT-ATCCTAATGGGCTTCGAACCCATTG-------------------A-CTCGTGTTCGAATCGCGGCGGGCCCG---
D00011944 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Arg TCG -GGATCCATAGGGTAGC--GGAT-ATCCTACCGGGCTTCGGACCCGGAG-------------------A-CGTGGGTTCGATTCCCACTGGATCCG---
D00009044 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Arg TCG -GGGCCCGTAGTCTAGCCTGGAATATGACGTGGGACTTCGGATCCCAAG-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCCCCCGGGTCCG---
D00011998 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Arg TCG -GGGCCGTTAGCTCAGCCAGGT--AGAGCGGCGGGCTTCGGACCCGCAG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCCCACGGCCCG---
D00009052 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Arg TCG -GGGCCCGTGGCTCAGCCTGGT--AGAGCGGCGGCCTTCGGAGCCGTAG-------------------GTCGTGGGTTCAAATCCCACCGGGCCCGCCA
D00009057 Pyrococcus_abyssi_GE5 Arg TCG -GGGCCCGTGGCCTAGTCTGGAG-AGGGCGTCGGCCTTCGGAGCCGAAG-------------------GTCGCGGGTTCAAATCCCGCCGGGCCC----
D00009062 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Arg TCG -GGGCCGGTGGCCTAGCCTGGAT-GGGGCGTCGGCCTTCGGAGCCGAAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGCCCGCC-
D00009067 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Arg TCG -GGGCCGGTGGCCTAGCCTGGAT-GGGGCGTCGGCCTTCGGAGCCGAAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGCCCGCCA
D00012016 Staphylothermus_marinus_F1 Arg TCG -GGGCCCGTAGCCTAGCCCGGATCAGGGCGCCGGCCTTCGGAGCCGGAG-------------------ACCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGCCCG---
D00012070 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Arg TCG -GGACCCGTAGCTCAGCCAGGAC-AGAGCGCTGGCCTTCGGAGCCAGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGTCCG---
D00009072 Sulfolobus_solfataricus_P2 Arg TCG -GGACCCGTAGCTCAGCTAGGAT-GGAGCGCCGGCCTTCGGAGCCGGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGTCC----
D00009202 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Arg TCG -GGACCCGTAGCTCAGCCAGGAT-AGAGCGCCGGCCTTCGGAGCCGGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGTCCG---
D00009387 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Arg TCG -GCAGTCGTAGTTCAAT--GGAT-AGAGCACTTGGCTTCGAACCAAGGG-------------------GTTGCAGGTTCGAGTCCTGCCGACTGCACCA
D00002438 Borrelia_burgdorferi Arg TCG -GCATTCATAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGGCGGACTTCGAATCCGAAG-------------------GTTGCAGGTTCGACTCCTGCTGAGTGCG---
D00008899 Borrelia_burgdorferi_B31 Arg TCG -GCATTCATAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGGCGGACTTCGAATCCGAAG-------------------GTTGCAGGTTCGACTCCTGCTGAGTGCG---
D00009421 Borrelia_garinii_PBi Arg TCG -GCATTCATAGCTCAATT-GGAT-AGAGCAGTGGACTTCGAATCCGAAG-------------------GTTGCAGGTTCGAGTCCTGCTGAGTGCG---
D00009280 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Arg TCG -GCGCTCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCATCGGATTTCGATTCCGAGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTTCCGAGCGCGCCA
D00008903 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Arg TCG -GCGCTCGTAGCTCAACT-GGAT-AGAGCGACAGACTTCGGATCTGTAG-------------------GTTATGGGTTCGATTCCTATCGGGCGCACCA
D00009401 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Arg TCG -GCACCGATAGCTCAAT--GGAT-AGAGTACCCGGCTTCGAACCGGGTG-------------------GTTAGAGGTTCGAGCCCTCTTCGGTGCA---
D00008964 Chlamydia_muridarum_Nigg Arg TCG -GCACCGATAGCTCAACT-GGAT-AGAGTACCTGGCTTCGGACCAGGTG-------------------GTTGGAGGTTCGAACCCTCTTCGGTGCG---
D00008815 Chlamydia_trachomatis Arg TCG -GCACCGATAGCTCAATT-GGAT-AGAGTACCTGGCTTCGGACCAGGTG-------------------GTTGGAGGTTCGAGCCCTCTTCGGTGC----
D00008811 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Arg TCG -GCACCGATAGCTCAACT-GGAT-AGAGTACCTGGCTTCGGACCAGGTG-------------------GTTGGAGGTTCGAACCCTCTTCGGTGCG---
D00008804 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Arg TCG -GCACCGATAGCTCAATT-GGAT-AGAGTACCTGGCTTCGGACCAGGTG-------------------GTTGGAGGTTCGAGCCCTCTTCGGTGCG---
D00008808 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Arg TCG -GCACCGATAGCTCAATT-GGAT-AGAGTACCTGGCTTCGGACCAGGTG-------------------GTTGGAGGTTCGAGCCCTCTTCGGTGCG---
D00008854 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Arg TCG -GCACCGATAGCTCAATT-GGAT-AGAGTACCTGGCTTCGGACCAGGTG-------------------GTTGGAGGTTCGAGCCCTCTTCGGTGCG---
D00008977 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Arg TCG -GTGCCCATAGCTCAGTT-GGAT-AGAGTCGCAGACTTCGAATCTGAAG-------------------GTCGGGGGTTCGATTCCCTCTGGGTGCACCA
D00008961 Clostridium_perfringens_str._13 Arg TCG -GCATCTATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGTTGGACTTCGAATCCACAG-------------------GTCGCGAGTTCGAATCTTGCTAGGTGCACCA
D00009284 Clostridium_tetani_E88 Arg TCG -GCGCCCATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTTACGGACTTCGAATCCGGAG-------------------GTCACAGGTTCGACTCCTGTTGGGCGCACCA
D00009331 Coxiella_burnetii_RSA_493 Arg TCG -GCGCCCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGTAACCGGCTTCGAACCGGTTG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCGGGCGCGCCA
D00009341 Escherichia_coli_CFT073 Arg TCG -CCGCCATTAGCTCATCA-GGAA-AGAGCGCCAGCTTTCGAAGCTGGTT-------------------GCGCGGAGTTCGGGTCCCCGATGGTGGTCCA
D00008863 Escherichia_coli_O157:H7 Arg TCG -CCGCCATTAGCTCATC--GGGATAGAACGCCAGCCTTCGAAGCTGGTT-------------------TCGCGGGGTTCGAGTCTCCGATGGCGGTCCA
D00008864 Escherichia_coli_O157:H7 Arg TCG -CCGCCATTAGCTCATC--GGGACAGAGCGCCAGCCTTCGAAGCTGGCT-------------------GCGCGGGGTTCGAGTCCTCGATGGCGGTCCA
D00008876 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Arg TCG -CCGCCATTAGCTCATC--GGGATAGAACGCCAGCCTTCGAAGCTGGTT-------------------TCGCGGGGTTCGAGTCTCCGATGGCGGTCCA
D00008877 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Arg TCG -CCGCCATTAGCTCATC--GGGACAGAGCGCCAGCCTTCGAAGCTGGCT-------------------GCGCGGGGTTCGAGTCCTCGATGGCGGTCCA
D00009165 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Arg TCG -GCACTCATAGCTTAACT-GGAT-AGAGCATCTGACTTCGGATCAGAGG-------------------GTTGTGGGTTCAAGTCCTACTGGGTGTGCCA
D00009315 Helicobacter_hepaticus_ATCC_51449 Arg TCG -GCGTTCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCACCAGACTTCGGATCTGGGG-------------------GTTAGGGGTTCGACTCCCTTCGGGCGTGCCA
D00002445 Helicobacter_pylori Arg TCG -GCGTTCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCACCAGACTTCGGATCTGGGG-------------------GTTAGGGGTTCGACTCCCTTCGGGCGTACCA
D00008888 Helicobacter_pylori_26695 Arg TCG -GCGTTCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCACCAGACTTCGGATCTGGGG-------------------GTTAGGGGTTCGACTCCCTTCGGGCGTACCA
D00008892 Helicobacter_pylori_J99 Arg TCG -GCGTTCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCACCAGACTTCGGATCTGGGG-------------------GTTAGGGGTTCGACTCCCTTCGGGCGTACCA
D00009314 Mycoplasma_gallisepticum_R Arg TCG -GCGCCCATAGTTCAATT-GGAT-AGAACATCTGACTTCGGATCAGACG-------------------GTTATAGGTTCAAGTCCTATTGGGCGCGCCA
D00002424 Mycoplasma_genitalium Arg TCG -GCGCCCATAGCTCAATC-GGAT-AGAGTGTCTGGCTTCGGACCAGAAG-------------------GTTATGGGTTCAAGTCCTATTGGGCGCGCCA
D00008915 Mycoplasma_genitalium_G37 Arg TCG -GCGCCCATAGCTCAATC-GGAT-AGAGTGTCTGGCTTCGGACCAGAAG-------------------GTTATGGGTTCAAGTCCTATTGGGCGCGCCA
D00002428 Mycoplasma_pneumoniae Arg TCG -GCGCCCATAGCTCAATT-GGAT-AGAGTGTCTGGCTTCGGACCAGAAG-------------------GTTATGGGTTCAAGTCCTATTGGGCGCGCCA
D00008919 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Arg TCG -GCGCCCATAGCTCAATT-GGAT-AGAGTGTCTGGCTTCGGACCAGAAG-------------------GTTATGGGTTCAAGTCCTATTGGGCGCGCCA
D00009012 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Arg TCG -GCGTTAGTAGCTCAACT-GGAT-AGAGTACTTGGTTTCGGCCCAAGAG-------------------GTTAGGGGTTCAAGTCCTCTCTAGCGCGCCA
D00009359 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Arg TCG -GCATCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCATCGGTCTTCGGAACCGAGG-------------------GTTGGGGGTTCGAATCCCTCCGGGTGTA---
D00009411 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Arg TCG -GCGCTCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCATCGGATTTCGATTCCGAGG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTTCCGAGCGCGCCA
D00008941 Thermotoga_maritima_MSB8 Arg TCG -GCGCCCGTAGCTCAACT-GGAT-AGAGCGTCGGACTTCGGATCCGATG-------------------GTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGGCGCGCCA
D00009486 Treponema_denticola_ATCC_35405 Arg TCG -GCGCCTGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCATCGGACTTCGAATCCGCAG-------------------GTCGCACGTTCGAATCGTGTCGGGCGCA---
D00002435 Treponema_pallidum Arg TCG -GCGCTCGTAGCTCAGGT-GGAT-AGAGCAACAGACTTCGAATCTGTAG-------------------GTCGCACGTTCAAGTCGTGTCGGGCGCA---
D00008927 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Arg TCG -GCGCTCGTAGCTCAGGT-GGAT-AGAGCAACAGACTTCGAATCTGTAG-------------------GTCGCACGTTCAAGTCGTGTCGGGCGCA---
D00008850 Ureaplasma_parvum_serovar_3 Arg TCG -GCACCCATAGTTCAATT-GGTT-AGAATATATGCCTTCGAAGCATAGG-------------------GTTAGGAGTTCGAGTCTCTTTGGGTGCGCCA
D00009113 Arabidopsis_thaliana Arg TCG -GACCGCATAGCGCAGT--GGATTAGCGCGTCTGACTTCGGATCAGAAG-------------------GTCGTGGGTTCGACTCCCACTGTGGTC----
D00009114 Arabidopsis_thaliana Arg TCG -GACCGCATAGCGCAGT--GGATTAGCGCGTTTGACTTCGGATCAAAAG-------------------GTCGTGGGTTCGACTCCCACTGTGGTC----
D00002594 Caenorhabditis_elegans Arg TCG -GGCCGCGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCACCAGACTTCGAATCTGGGG-------------------ATTGCAGGTTCGAGTCCTGCCGTGGTCG---
D00009130 Caenorhabditis_elegans Arg TCG -GGTCGCGTCGCCTAAT--GGAT-AAGCCACCAGACTTCGAATCTGGGG-------------------ATTACAGGTTCGATCCCTGCCGTGGTC----
D00009131 Caenorhabditis_elegans Arg TCG -GGCCGCGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCATCAGACTTCGAATCTATGG--------GG---------ATTGCAGGTTCGATCCCTGCCGTGGTC----
D00009132 Caenorhabditis_elegans Arg TCG -GGCCGCGTGGCTAATG--GAT--AAGGCATCAGACTTCGAATCTGGGG-------------------ATTGCAGGTTCGATCCCTGCCGTGGTC----
D00009133 Caenorhabditis_elegans Arg TCG -GGCCGCGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCATCAGACTTCGAATCTGGGG-------------------ATTGCAGGTTCGATCCCTGCCGTGGTC----
D00009134 Caenorhabditis_elegans Arg TCG -GGCCGCGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCACCAGACTTCGAATCTGGGG-------------------ATTGCAGGTTCGAGTCCTGCCGTGGTCG---
D00009135 Caenorhabditis_elegans Arg TCG -GGCCGCGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCACCAGACTTCGAATCTGGGG-------------------ATTGCAGGTTCGATCCCTGCCGTGGTCG---
D00002596 Drosophila_melanogaster Arg TCG -GACCGTGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCGGACTTCGGATCCGAAG-------------------ATTGCAGGTTCGAATCCTGTCACGGTCG---
D00002597 Drosophila_melanogaster Arg TCG -GACCGTGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCGGACTTCGGATCCGAAG-------------------ATTGCAGGTTCGAGTCCTGTCACGGTCG---
D00009146 Drosophila_melanogaster Arg TCG -GACCGTGTGGCCTAAA--GGAT-AAGGCGTCGGACTTCGAATCCGAAG-------------------ATTGCAGGTTCGAGTCCTGTCACGGTCG---
D00009147 Drosophila_melanogaster Arg TCG -GACCGTGTGGCCCAAT--GGAT-AAGGCGTCGGACTTCGGATCCGAAG-------------------ATTGCAGGTTCGAGTCCTGTCACGGTCG---
D00009148 Drosophila_melanogaster Arg TCG -GACCGTGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCGGACTTCGGATCCGAAG-------------------ATTGCAGGTTCGAGTCCTGTCACGGTCG---
D00009149 Drosophila_melanogaster Arg TCG -GACCGTGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCGGACTTCGGATCCGAAG-------------------ATTGCAGGTTCGAATCCTGTCACGGTCG---
D00002598 Drosophila_simulans Arg TCG -GACCGTGTGGCCCAAT--GGAT-AAGGCGTCGGACTTCGGATCCGAAG-------------------ATTGCAGGTTCGAGTCCTGTCACGGTCG---
D00009217 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Arg TCG -GGGTCCTTAGTATAAT--GGT--AGAACACTTGGCTTCGGACCAAATA-------------------G-TCCGGGTTCGAATCCCGGAGGACTCG---
D00009518 Gallus_gallus Arg TCG -GACCACGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCTGACTTCGGATCAGAAG-------------------ATTGAGGGTTCGAGTCCCTTCGTGGTTG---
D00009519 Gallus_gallus Arg TCG -GACCGCGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCTGACTTCGGATCAGAAG-------------------ATTGAGGGTTCGAGTCCCTTCGTGGTCG---
D00002600 Homo_sapiens Arg TCG GGACCACGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCTGACTTCGGATCAGAAG-------------------ATTGAGGGTTCGAATCCCTTCGTGGTT----
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D00009092 Homo_sapiens Arg TCG -GACCACGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCTGACTTCGGATCAGAAG-------------------ATTGAGGGTTCGAATCCCTTCGTGGTT----
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D00009094 Homo_sapiens Arg TCG -GGCCGCGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCTGACTTCGGATCAGAAG-------------------ATTGCAGGTTCGAGTCCTGCCGCGGTC----
D00002581 Leishmania_tarentolae Arg TCG -GGCCTCTTGGCGCAAT--GGA--AGCGCATCAGACTTCGGATCTGAGG-------------------G-TTGCAGTTCGATCCTGCAGGGGGTCG---
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D00009566 Pan_troglodytes Arg TCG -GACCACGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCTGACTTCGGATCAGAAG-------------------ATTGAGGGTTCGAATCCCTCCGTGGTTA---
D00009567 Pan_troglodytes Arg TCG -GGCCGCGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCTGACTTCGGATCAGAAG-------------------ATTGCAGGTTCGAGTCCTGCCGCGGTCG---
D00009500 Plasmodium_falciparum_3D7 Arg TCG -GACGGCGTAGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCGGTCTTCGGAACCGAAG-------------------ATTGCGGGTTCGAGTCCCGTCGTCGTTA---
D00009156 Schizosaccharomyces_pombe Arg TCG -GGGTGTGTAGCCTAAT--GGTT-AAGGCGTTGGTTTTCGGCACCAAAG-------------------ACTGCAGGTTCGAGTCCTGTCACACTC----
D00009537 Takifugu_rubripes Arg TCG -GACCGCGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCTAACTTCGAATTAGAAG-------------------ACTGAGGGTTTGAGTCCCTTCGTGGTTG---
D00009538 Takifugu_rubripes Arg TCG -GACCATGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCTGACTTCGGATCAGAAG-------------------ATTGAGGGTTCGAGTCCCTTCATGGTTG---
D00009539 Takifugu_rubripes Arg TCG -GACCATGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCTGACTTCGGATCAGAAG-------------------ATTGAGGGTTCGAGTCCCTTCATGGTTA---
D00009540 Takifugu_rubripes Arg TCG -GGCTACGTGGCCTAAT--GGAG-AAGGCGTCTGACTTCGGATCAGAAG-------------------ATTGAGGGTTCGAGTCCCTTCGTGGTCA---
D00009541 Takifugu_rubripes Arg TCG -GACCGCGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCTGACTTCGGATCAGAAG-------------------ATTGAGGGTTCGAGTCCCTTCGTGGTCG---
D00009542 Takifugu_rubripes Arg TCG -GGTCACGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCTGACTTCGGATCAGAAG-------------------ATTGAGGGTTCGAGTCCCTTCGTGATCA---
D00009543 Takifugu_rubripes Arg TCG -GACCGCGTGGCCTAAT--GGAT-AAGGCGTCTGACTTCGGATCAGAAG-------------------ATTGCAGGTTCGAGTCCTGTCGCGGTCG---
D00009029 Aeropyrum_pernix_K1 Arg GCG -GGGCCCGTAGCTCAGCCAGGACCAGAGCGCCGGCCTGCGGAGCCGGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGCCCGCC-
D00002411 Archaeoglobus_fulgidus Arg GCG -GCCCCCGTGGGGTAGC--GGAT-ATCCTGAGGGGCTGCGGACTCCTCG-------------------A-CCCGGGTTCAACTCCCGGCGGGGGCA---
D00009034 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Arg GCG -GCCCCCGTGGGGTAGC--GGAT-ATCCTGAGGGGCTGCGGACTCCTCG-------------------A-CCCGGGTTCAACTCCCGGCGGGGGCA---
D00009039 Halobacterium_sp._NRC-1 Arg GCG -GTCCGGATAGGGTAGT--GGACTATCCTCTTGGCTTGCGGAGCCAGGG-------------------A-CCGGCGTTCAAATCGCCGTCCGGACG---
D00002417 Methanocaldococcus_jannaschii Arg GCG -GCCCGGGTCGCCTAGCCAGGAT-AGGGCGCTGGCCTGCGGAGCCAGTT--------TT---------TTCAGGGGTTCAAATCCCCTCCCGGGCG---
D00009046 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Arg GCG -GCCCGGGTCGCCTAGCCAGGAT-AGGGCGCTGGCCTGCGGAGCCAGTT--------TT---------TTCAGGGGTTCAAATCCCCTCCCGGGCG---
D00011876 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Arg GCG -GCTCCTGTGGGTTAGTTAGGAT-ATGCTTGCGAACTGCGGATTCGCAG-------------------A-CTCGGGTTCAAATCCCGGCAGGAGCG---
D00009049 Methanococcus_maripaludis Arg GCG -GCCCTCATGGGGTAGCTAGGAT-ATCCTCGCGGACTGCGGATCCGTGG-------------------A-CTCGGGTTCAAATCCCGATGGGGGC----
D00011902 Methanosarcina_acetivorans_C2A Arg GCG -GTCCCGATAGGGTAGT--GGAT-ATCCTTGAGGCCTGCGGAGCCTTAG-------------------A-CCTGAGTTCAAGTCTCAGTCGGGACG---
D00009169 Methanosarcina_mazei_Go1 Arg GCG -GTCCCGATAGGGTAGT--GGAT-ATCCTTGAGGCCTGCGGAGCCTTAG-------------------A-CCTGAGTTCAAGTCTCAGTCGGGACG---
D00011973 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Arg GCG -GTCCCGGTAGGGTAGT--GGAT-ATCCTAGAAGCCTGCGGAGCTTTTG-------------------A-CCTGGGTTCAAGTCCCAGCCGGGACG---
D00009043 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Arg GCG -GCCCTGATAGTGTAGC--GGAT-ATCACGTAGGACTGCGGATCCTATT-------------------A-CCCGGGTTCAAGTCCCGGTCAGGGCA---
D00011980 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Arg GCG -GGGCCCGTAGCTTAGCTAGGT--AAAGCGCCGGGTTGCGGACCCGGAG-------------------ATCGCGGGTTCGAATCCCGCCGGGCCCG---
D00009056 Pyrococcus_abyssi_GE5 Arg GCG -GCCCCGGTGGCCTAGCCTGGAT-AGGGCGCGAGGCTGCGGACCTCGAG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCCGGGGCGCC-
D00009061 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Arg GCG -GCCCCGGTGGCCTAGCCTGGAT-AGGGCGCGAGGCTGCGGACCTCGAG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCCGGGCGCC--
D00009066 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Arg GCG -GCCCCGGTGGCCTAGCCTGGAT-AGGGCGCGAGGCTGCGGACCTCGAG-------------------GTCCGGGGTTCAAATCCCCGCCGGGGCGCCA
D00012048 Staphylothermus_marinus_F1 Arg GCG -GGGCCCGTAGCCTAGCCTGGAT-AGGGCGCCGGCCTGCGGAGCCGGAG-------------------GCCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGCCCG---
D00012071 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Arg GCG -GGACCCGTAGCTTAGCCAGGAC-AGAGTGCTGGCCTGCGGAGCCAGTG-------------------GTCCCGGGTTCAAATCCCGGCGGGTCCG---
D00009071 Sulfolobus_solfataricus_P2 Arg GCG -GGACCCGTAGCTCAGCCAGGAC-GGAGCGCCGGCCTGCGGAGCCGGAG-------------------GTCCCGGGTTCAAGTCCCGGCGGGTCC----
D00009201 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Arg GCG -GGACCCGTAGCTCAGCCAGGAT-AGAGCGCCGGCCTGCGGAGCCGGCG-------------------GTCCCGGGTTCAAGTCCCGGCGGGTCCG---
D00009076 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Arg GCG -GCCCGAGTGGGGTAATTTGGAT-ATCCTGGAGGCCTGCGGAGCCTCAG-------------------A-TCCGGGTTCAAATCCCGGCCCGGGCA---
D00009080 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Arg GCG -GCCCGAGTGGGGTAATTTGGAT-ATCCTGGAGGCCTGCGGAGCCTCAG-------------------A-TCCGGGTTCGAATCCCGGCCCGGGCA---
D00002437 Borrelia_burgdorferi Arg GCG -GTGTCCATAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCGTTAGATTGCGATTCTTAAG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCTTGGACACG---
D00008898 Borrelia_burgdorferi_B31 Arg GCG -GTGTCCATAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCGTTAGATTGCGATTCTTAAG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCTTGGACACG---
D00009420 Borrelia_garinii_PBi Arg GCG -GTGTCCATAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCGTTAGATTGCGATTCTTAAG-------------------GTCGGAGGTTCAAGTCCTCTTGGACACG---
D00008902 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Arg GCG -GCGCTCATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCATTTGATTGCGGTTCAAAAG-------------------GCCAGAGGTTCGAATCCTCTTGAGCGCACCA
D00009318 Helicobacter_hepaticus_ATCC_51449 Arg GCG -GTGCTCGTAGCTCAGCT-GAAT-AGAGCAACAGGTTGCGGTCCTGTAG-------------------GTCGGGGGTTTGAATCCCTCCGAGCACGCCA
D00002448 Helicobacter_pylori Arg GCG -GTGCTCGTAGCTCAGCT-GAAT-AGAGCAACAGGTTGCGGTCCTGTAG-------------------GTCGGGGGTTTGAATCCCTCCGAGCACACCA
D00008887 Helicobacter_pylori_26695 Arg GCG -GTGCTCGTAGCTCAGCT-GAAT-AGAGCAACAGGTTGCGGTCCTGTAG-------------------GTCGGGGGTTTGAATCCCTCCGAGCACACCA
D00008891 Helicobacter_pylori_J99 Arg GCG -GTGCTCGTAGCTCAGCT-GAAT-AGAGCAACAGGTTGCGGTCCTGTAG-------------------GTCGGGGGTTTGAATCCCTCCGAGCACACCA
D00009311 Mycoplasma_gallisepticum_R Arg GCG -GTCGGCATAGCTCAACT-GGAT-AGAGAATCAGTTTGCGGAACTGAAG-------------------GTTACAGGTTCAAGTCCTGTTGTCGACGCCA
D00009312 Mycoplasma_gallisepticum_R Arg GCG -GTCGGCATAGCTCAACT-GGAT-AGAGCATCAGTTTGCGGAACTGAAG-------------------GTTACAGGTTCAAGTCCTGTTGTCGACGCCA
D00002422 Mycoplasma_genitalium Arg GCG -GTCATCATAGCTCAATA-GGAC-AGAGTATCAGCTTGCGGAGCTGAGG-------------------GTTACAGGTTCGATTCCTGTTGGTGACGCCA
D00008914 Mycoplasma_genitalium_G37 Arg GCG -GTCATCATAGCTCAATA-GGAC-AGAGTATCAGCTTGCGGAGCTGAGG-------------------GTTACAGGTTCGATTCCTGTTGGTGACGCCA
D00002427 Mycoplasma_pneumoniae Arg GCG -GTCATCATAGCTCAATA-GGAC-AGAGTATCAGCTTGCGGAGCTGAGG-------------------GTTACAGGTTCGATTCCTGTTGGTGACGCCA
D00008918 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Arg GCG -GTCATCATAGCTCAATA-GGAC-AGAGTATCAGCTTGCGGAGCTGAGG-------------------GTTACAGGTTCGATTCCTGTTGGTGACGCCA
D00009011 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Arg GCG -GCACTCATAGCTCAACT-GGAT-AGAGTACTAGGTTGCGGTCCTAGAG-------------------GTTAGGGGTTCAAGTCCTCTTGAGTGCGCCA
D00009362 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Arg GCG -GTTCTCGGAGTGTGCC--GGAATAGCACGCGACTTTGCGAAGGTCGTA-------------------G-ACCAGGTTCGATTCCTGGCGAGAGCA---
D00008940 Thermotoga_maritima_MSB8 Arg GCG -GTGCCCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCGCCAGACTGCGGATCTGGAG-------------------GTTGGGGGTTCGAATCCCCCCGGGCACGCCA
D00009484 Treponema_denticola_ATCC_35405 Arg GCG -GAGGCTATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGTCAGATTGCGGATCTGAAG-------------------GTCGGCAGTTCGAACCCGCCTAGCCTCG---
D00002432 Treponema_pallidum Arg GCG -GAGACTATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTGTCAGATTGCGGATCTGAAG-------------------GTCGACGGTTCGAATCCGCCTAGTCTCA---
D00008926 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Arg GCG -GAGACTATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTGTCAGATTGCGGATCTGAAG-------------------GTCGACGGTTCGAATCCGCCTAGTCTCA---
D00009561 Pan_troglodytes Arg GCG -GCCGTGATCGTATAGT--GGTT-AGTACTCTGCGTTGCGGCTGCAGCA-------------------A-CCTCGGTTCGAATCCGAGTCACGGCA---
D00009536 Takifugu_rubripes Arg GCG -ACCCTGGTGGTCTCGT--GGTC-AGGATTCAGCCCTGCGGCAGCTGCG-------------------G-CCTGGGTTCGACTCCCAGTCAGGGAA---
D00009492 Acinetobacter_sp._ADP1 Arg ACG -GCGCTCATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCACTTGGCTACGAACTAAGGG-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCTCTGAGCGCACCA
D00009014 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Arg ACG -GCACCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCACCAGACTACGAATCTGGGG-------------------GTCAGGAGTTCGAATCTCTTCGGGTGCGCCA
D00008947 Aquifex_aeolicus_VF5 Arg ACG -CGGGCTGTAGCTCAACT-GGAT-AGAGCGCGGGACTACGGATCCCGAG-------------------GTTGCGGGTTCGACTCCCGCCAGCCCGGCCA
D00009378 Bacillus_anthracis_str._Ames Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGTTTGACTACGGATCAAGAG-------------------GTTAGGGGTTCGACTCCTCTCGGGCGCGCCA
D00009379 Bacillus_anthracis_str._Ames Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGTTTGACTACGGATCAAGAG-------------------GTTAGGGGTTCGACTCCTCTCGGGCGCG---
D00009416 Bacillus_anthracis_str._Sterne Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGTTTGACTACGGATCAAGAG-------------------GTTAGGGGTTCGACTCCTCTCGGGCGCGCCA
D00009417 Bacillus_anthracis_str._Sterne Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGTTTGACTACGGATCAAGAG-------------------GTTAGGGGTTCGACTCCTCTCGGGCGCG---
D00009460 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGTTTGACTACGGATCAAGAG-------------------GTTAGGGGTTCGACTCCTCTCGGGCGCGCCA
D00009461 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGTTTGACTACGGATCAAGAG-------------------GTTAGGGGTTCGACTCCTCTCGGGCGCG---
D00009462 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGTTTGACTACGGATCAAGAG-------------------GTTAGGGGTTCGACTCCTCTCGGGCGCG---
D00009332 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGTTTGACTACGGATCAAGAG-------------------GTTAGGGGTTCGACTCCTCTCGGGCGCG---
D00009333 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGTTTGACTACGGATCAAGAG-------------------GTTAGGGGTTCGACTCCTCTCGGGCGCGCCA
D00009274 Bacillus_halodurans_C-125 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGTTTGACTACGGATCAAAAG-------------------GTTAGGGGTTCGACTCCTCTCGGGCGCGCCA
D00002449 Bacillus_subtilis Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGTTTGACTACGGATCAAAAG-------------------GTTAGGGGTTCGACTCCTCTCGGGCGCGCCA
D00008817 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGTTTGACTACGGATCAAAAG-------------------GTTAGGGGTTCGACTCCTCTCGGGCGCGCCA
D00009496 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGTTTGACTACGGATCAAGAG-------------------GTTAGGGGTTCGACTCCTCTCGGGCGCG---
D00009497 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGTTTGACTACGGATCAAGAG-------------------GTTAGGGGTTCGACTCCTCTCGGGCGCGCCA
D00009369 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Arg ACG -GGTCGCGTAGCTCAACT-GAAT-AGAGTAGCTGACTACGGATCAGCCG-------------------GTTACAGGTTTGAATCCTGTCGCGATCACCA
D00009370 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Arg ACG -GGCCGCGTAGCTCAACT-GAAT-AGAGTAGCTGACTACGGATCAGCCG-------------------GTTACAGGTTTGAATCCTGTCGCGGTCA---
D00009371 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Arg ACG -GGTCGCGTAGCTCAACT-GAAT-AGAGTAGCTGACTACGGATCAGCCG-------------------GTTACAGGTTTGAATCCTGTCGCGATCA---
D00009382 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Arg ACG -GCACCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCACCAGACTACGAATCTGGGG-------------------GTCAGGAGTTCGAATCTCTTCGGGTGCGCCA
D00009502 Bartonella_quintana_str._Toulouse Arg ACG -GCACCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCACCAGACTACGAATCTGGGG-------------------GTCAGGAGTTCGAATCTCTTCGGGTGCGCCA
D00009386 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Arg ACG -GCACTCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACATGACTACGAATCATGTG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGAGTGCACCA
D00009227 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Arg ACG -GCGCCAGTAGCCCAGC--GGATTAGAGCAGCTGACTACGGATCAGCAG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTGGCGCA---
D00009281 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCATCAGACTACGAATCTGAGG-------------------GTCGGACGTTCGAATCGTTCCGGGCGCGCCA
D00008985 Brucella_melitensis_16M Arg ACG -GCACCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCACCAGACTACGAATCTGGGG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCA
D00009231 Brucella_suis_1330 Arg ACG -GCACCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCACCAGACTACGAATCTGGGG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCA
D00008821 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Arg ACG -GCATCCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTTCCGGATGCA---
D00009336 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Arg ACG -GCATCCGTAGTTCAGTT-GGAT-AGAGCACTCGGCTACGAACCGAGAG-------------------GTCGGAGGTTCAAATCCTTCCGGATGCA---
D00009172 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Arg ACG -GCATCCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTTCCGGATGCA---
D00009505 Candidatus_Blochmannia_floridanus Arg ACG -GCACCCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCACTCGGCTACGAACCGAGAG-------------------GTCGGGGGTTCAAATCCTCTCGGGTGTA---
D00009399 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Arg ACG -GCACTGGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGTACCCGGCTACGAACCGGGCG-------------------GTTAGAGGTTCGAATCCTCTCCGGTGCA---
D00008905 Caulobacter_crescentus_CB15 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCATCAGACTACGAATCTGAGG-------------------GTCGGACGTTCGAATCGTTCCGGGCGCGCCA
D00008965 Chlamydia_muridarum_Nigg Arg ACG -GCACCAGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGTACCTGGCTACGAACCAGGTG-------------------GTCAGAGGTTCAAATCCTCTCTGGTGCG---
D00008813 Chlamydia_trachomatis Arg ACG -GCACCAGTAGCTCAGTC-GGAT-AGAGTACCTGGCTACGAACCAGGTG-------------------GTCAGAGGTTCGAGTCCTCTCTGGTGC----
D00008810 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Arg ACG -GCACCAGTAGCTCAGT--GGAT-AGAGTACCTGGCTACGAACCAGGTG-------------------GTCAGAGGTTCAAATCCTCTTTGGTGCG---
D00008802 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Arg ACG -GCACCAGTAGCTCAGTC-GGAT-AGAGTACCTGGCTACGAACCAGGTG-------------------GTCAGAGGTTCGAGTCCTCTCTGGTGCG---
D00008806 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Arg ACG -GCACCAGTAGCTCAGTC-GGAT-AGAGTACCTGGCTACGAACCAGGTG-------------------GTCAGAGGTTCGAGTCCTCTCTGGTGCG---
D00008852 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Arg ACG -GCACCAGTAGCTCAGTC-GGAT-AGAGTACCTGGCTACGAACCAGGTG-------------------GTCAGAGGTTCGAGTCCTCTCTGGTGCG---
D00009159 Chlorobium_tepidum_TLS Arg ACG -GCACCCGTAGCTCAACT-GGAT-AGAGCATCTGACTACGGATCAGAAG-------------------GTTAGGGGTTCGAATCCTCTCGGGTGTACCA
D00008975 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Arg ACG -GCGATAGTACCTCAACT-GGAT-AGAGGACTCGGCTACGAACCGAGGC-------------------GCTGCGGGTTCGACTCCTGCCTGTCGCACCA
D00008959 Clostridium_perfringens_str._13 Arg ACG -GCGGTGGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTAGTCGGCTACGAACCGATTG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCTCTTCGCCGCACCA
D00009283 Clostridium_tetani_E88 Arg ACG -GCACCGGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGTAGCTGGCTACGAACCAGTTG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCTCTCCGGTGTACCA
D00009389 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAAC--GGAT-AGAGCATCTGACTACGGATCAGAAG-------------------GTTGGGGGTTCGAATCCCTCCGGGCGCA---
D00009234 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAAC--GGAT-AGAGCATCTGACTACGGATCAGAAG-------------------GTTGGGGGTTCGAATCCCTCCGGGCGCACCA
D00009235 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAAC--GGAT-AGAGCATCTGACTACGGATCAGAAG-------------------GTTGGGGGTTCGAATCCCTCCGGGCGCA---
D00009178 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAAC--GGAT-AGAGCATCTGACTACGGATCAGAAG-------------------GTTGGGGGTTCGAATCCCTCCGGGCGCA---
D00009179 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAAC--GGAT-AGAGCATCTGACTACGGATCAGAAG-------------------GTTGGGGGTTCGAATCCCTCCGGGCGCA---
D00009329 Coxiella_burnetii_RSA_493 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGTACCTGGCTACGAACCAGGCG-------------------GTCGGCGGTTCGAATCCGTCCGGGCGCGCCA
D00008909 Deinococcus_radiodurans_R1 Arg ACG -GTGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGTCTGACTACGGATCAGAAG-------------------GCCAGGAGTTCGAATCTCTTCGGGCACACCA
D00009464 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Arg ACG -GCGCTGGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCAACAGGCTACGAACCTGTAG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTTCCCAGCGCGCCA
D00009465 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Arg ACG -GCGCCGGTAGCCCAGCT-GGAT-AGAGCAACAGGCTACGAACCTGTAG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTTCCCGGCGCGCCA
D00009466 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Arg ACG -GCGCCGGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGCAACAGGCTACGAACCTGTAG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTTCCCGGCGCACCA
D00009286 Enterococcus_faecalis_V583 Arg ACG -GCACCCATAGCTCAACT-GGAT-AGAGTGTTTGACTACGAATCAAAAG-------------------GTTAGGGGTTCGACTCCCTTTGGGTGCA---
D00002452 Escherichia_coli Arg ACG -GCATCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCCCGGATGCACCA
D00009344 Escherichia_coli_CFT073 Arg ACG -GCATCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCCCGGATGCACCA
D00008856 Escherichia_coli_K12 Arg ACG -GCATCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCCCGGATGCACCA
D00008860 Escherichia_coli_O157:H7 Arg ACG -GCATCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCCCGGATGCACCA
D00008872 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Arg ACG -GCATCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCCCGGATGCACCA
D00008873 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Arg ACG -GCATCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCGGARGTTCGAATCCTCCCGGATGCACCA
D00009166 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Arg ACG -GCATCTGTGGCTCAATT-GGAT-AGAGCATCTGACTACGGATCAGAGG-------------------GTTGTGGGTTCGACTCCTGCCAGGTGCGCCA
D00009423 Geobacter_sulfurreducens_PCA Arg ACG -GCGCTCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCACCAGACTACGAATCTGGGG-------------------GTCAGGAGTTCGAATCTCTTCGAGCGCGCCA
D00002460 Haemophilus_influenzae Arg ACG CGCACCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCA
D00002461 Haemophilus_influenzae Arg ACG -GCACCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGCGAG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCA
D00002462 Haemophilus_influenzae Arg ACG -GCACCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCA
D00008894 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Arg ACG -GCACCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCA
D00008895 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Arg ACG -GCACCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCA
D00002443 Lactobacillus_delbrueckii_subsp._bulgaricus Arg ACG -GCACCCATAGCGCAACT-GGAT-AGAGTGTCTGACTACGAATCAGAAG-------------------GTTGTAGGTTCAAGTCCTACTGGGTGCA---
D00009429 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Arg ACG -GCACCCTTAGCGCAACT-GGAT-AGAGTGTCTGACTACGAATCAGAAG-------------------GTTGAAGGTTCAAATCCTTCAGGGTGCA---
D00009292 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Arg ACG -GCACCCATAGCGCAATT-GGAT-AGAGTGTCTGACTACGAATCAGAAG-------------------GTTGTAGGTTCGACTCCTACTGGGTGCA---
D00009430 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Arg ACG -GCGCCACTAGCTCAAC--GGAT-AGAGCATCTGACTACGGATCAGAAG-------------------GTTGGGGGTTCGAATCCCTCGTGGCGCA---
D00009240 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Arg ACG -GCGCCCATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGTCTGACTACGGATCAGAAG-------------------GTCGGAGGTTCGACTCCTTCTGGGCGCGCCA
D00008951 Listeria_innocua_Clip11262 Arg ACG -GCGCCCATAGCTCAACT-GGAT-AGAGTACTTGACTACGAATCAAGCG-------------------GTTAGAGGTTCGACTCCTCTTGGGCGCA---
D00008955 Listeria_monocytogenes_EGD-e Arg ACG -GCGCCCATAGCTCAACT-GGAT-AGAGTACTTGACTACGAATCAAGCG-------------------GTTAGAGGTTCGACTCCTCTTGGGCGCA---
D00009470 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Arg ACG -GCGCCCATAGCTCAACT-GGAT-AGAGTACTTGACTACGAATCAAGCG-------------------GTTAGAGGTTCGACTCCTCTTGGGCGCA---
D00009474 Mesoplasma_florum_L1 Arg ACG -GCGCCCGTAGATCAATT-GGAT-AGATCGTTTGACTACGGATCAAAAG-------------------GTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCGGGCGCACCA
D00008987 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCACCAGACTACGAATCTGGGG-------------------GTCAGGAGTTCGAATCTCTTCGGGCGCGCCA
D00009322 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAAC--GGAT-AGAGCATCTGACTACGGATCAGAAG-------------------GTTGGGAGTTCGAATCTCTTCGGGCGCG---
D00008845 Mycobacterium_leprae_TN Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAAC--GGAT-AGAGCATCTGACTACGGATCAGAAG-------------------GTTAGGGGTTCGAATCCCTTCGGGCGCG---
D00008824 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAAC--GGAT-AGAGCATCTGACTACGGATCAGAAG-------------------GTTGGGAGTTCGAATCTCTTCGGGCGCG---
D00009398 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAAC--GGAT-AGAGCATCTGACTACGGATCAGAAG-------------------GTTGGGAGTTCGAATCTCTTCGGGCGCG---
D00002419 Mycoplasma_capricolum Arg ACG -GCGCCCGTAGATCAATT-GGAT-AGATCGCTTGACTACGGATCAAAAG-------------------GTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCGGGCGCACCA
D00002425 Mycoplasma_mycoides Arg ACG -GCGCCCGTAGATCAATT-GGAT-AGATCGCTTGACTACGGATCAAAAG-------------------GTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCGGGCGCACCA
D00008828 Neisseria_meningitidis_MC58 Arg ACG -GCACCCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGTATCTGGCTACGAACCAGAGG-------------------GTCGGGCGTTCGAATCGCTCCGGGTGCGCCA
D00008829 Neisseria_meningitidis_MC58 Arg ACG -GCACCCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGTATCTGGCTACGAACCAGAGG-------------------GTCGGGCGTTCGAATCGCTCCGGGTGCGCCA
D00008833 Neisseria_meningitidis_Z2491 Arg ACG -GCACCCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGTATCTGGCTACGAACCAGAGG-------------------GTCGGGCGTTCGAATCGCTCCGGGTGCGCCA
D00009365 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGTACTTGGCTACGAACCAAGGG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCTGCCGGGCGCGCCA
D00009006 Nostoc_sp._PCC_7120 Arg ACG -GAGAACGTGGTGTAACT-GGAT-TGCATCTCAGATTACGAACCTGAAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCCTCCGTTCTCG---
D00009010 Nostoc_sp._PCC_7120 Arg ACG -GGGCGTGTAGCTCAGT--GGACTAGAGCACGTGGCTACGGACCACGGT-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCTCGCCCG---
D00009246 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Arg ACG -GCGCCTGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGTTTGACTACGGATCAAGAG-------------------GTTAGGGGTTCGACTCCTCTCAGGCGCGCCA
D00009394 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M Arg ACG -GCACCCATAGCTCAATT-GGAT-AGAGCATCTGACTACGGATCAGAAG-------------------GCTAGGGGTTCAAATCCTCTTGGGTGTGCCA
D00008921 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Arg ACG -GCACCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCA
D00009403 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Arg ACG -GCATCCATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTTCTGGATGCGCCA
D00009435 Porphyromonas_gingivalis_W83 Arg ACG -GGCCGCGTAGCTCAACT-GAAT-AGAGTAGCTGACTACGGATCAGCCG-------------------GTTACAGGTTTGAATCCTGTCGCGGTCA---
D00009479 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Arg ACG -GCGCCCGTGGCTCAAC--GGAT-AGAGCATCTGACTACGGATCAGAAG-------------------GTTGGGGGTTCGAATCCCTCCGGGCGCG---
D00008929 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Arg ACG -GGTTCGATAGCTCAGCCTGGT--AGAGCAACCATCCACGAAATGGTCT-------------------GTCGCGGGTTCGACTCCCGCTCGAACGT---
D00008930 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Arg ACG -GCACTCATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCCTGAGTGCGCCA
D00009375 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Arg ACG -GCACTCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCACAGGTTCGAATCCTGTCGAGTGCACCA
D00009003 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Arg ACG -GCGGCTGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGTACTTGGCTACGAACCAAGGG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCTGCCAGCCGCGCCA
D00009358 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Arg ACG -GCACCCCTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCATCGGTCTACGAAACCGAAG-------------------GTTACTGGTTCGAATCCAGTGGGGTGTA---
D00009408 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCACCAGACTACGAATCTGGGG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTTTCGGGCGCGCCA
D00008980 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Arg ACG -GCACCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGTATATGACTACGGATCATAAG-------------------GTTAGGGGTTCGACTCCTCTCGGGTGCGCCA
D00009175 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Arg ACG -GCACCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGTATATGACTACGGATCATAAG-------------------GTTAGGGGTTCGACTCCTCTCGGGTGCGCCA
D00009439 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Arg ACG -GCACCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGTATATGACTACGGATCATAAG-------------------GTTAGGGGTTCGACTCCTCTCGGGTGCGCCA
D00009021 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Arg ACG -GCATCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCCCGGATGCACCA
D00009022 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Arg ACG -GCATCCGTAGCTTCAGCTGGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCCCGGATGCACCA
D00009354 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Arg ACG -GCATCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCCCGGATGCACCA
D00009355 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Arg ACG -GCATCCGTAGCTTCAGCTGGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCCCGGATGCACCA
D00002455 Salmonella_typhimurium Arg ACG -GCATCCGTAGCTCAGCT-GGAT-CGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCCCGGATGCACCA
D00008999 Salmonella_typhimurium_LT2 Arg ACG -GCATCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCCCGGATGCACCA
D00009252 Shewanella_oneidensis_MR-1 Arg ACG -GCGCGTGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACCTGGCTACGAACCAGGCG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTTCCACGCGCACCA
D00009253 Shewanella_oneidensis_MR-1 Arg ACG -GCGCGTGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACCTGGCTACGAACCAGGCG-------------------GTCGGAGGTTCGACTCCTTCCACGCGCACCA
D00009254 Shewanella_oneidensis_MR-1 Arg ACG -GCGCATGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACCTGGCTACGAACCAGGCG-------------------GTCGGAGGTTCGACTCCTTCCATGCGCACCA
D00009255 Shewanella_oneidensis_MR-1 Arg ACG -GCGCATGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACCTGGCTACGAACCAGGCG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTTCCACGCGCACCA
D00009264 Shigella_flexneri_2a_str._301 Arg ACG -GTATCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCCCGGATGCACCA
D00009265 Shigella_flexneri_2a_str._301 Arg ACG -GCATCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCGGAGGTTCGAATCCTCCCGGATGCACCA
D00009024 Sinorhizobium_meliloti_1021 Arg ACG -GCACCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCACCAGACTACGAATCTGGGG-------------------GGCAGGAGTTCGAATCTCTTCGGGTGCGCCA
D00002431 Spiroplasma_melliferum Arg ACG -GCGCCCATAGATCAATT-GGAT-AGATCGTTTGACTACGGATCAAAAG-------------------GTTGAGGGTTCGATTCCTTCTGGGCGCGCCA
D00002442 Staphylococcus_aureus Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGTTTGACTACGGATCAAGAG-------------------GTTATGGGTTCGACTCCTATCGGGCGCG---
D00009412 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGTTTGACTACGGATCAAGAG-------------------GTTATGGGTTCGACTCCTATCGGGCGCGCCA
D00009415 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGTTTGACTACGGATCAAGAG-------------------GTTATGGGTTCGACTCCTATCGGGCGCG---
D00009183 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGTTTGACTACGGATCAAGAG-------------------GTTATGGGTTCGACTCCTATCGGGCGCGCCA
D00009186 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGTTTGACTACGGATCAAGAG-------------------GTTATGGGTTCGACTCCTATCGGGCGCG---
D00008841 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGTTTGACTACGGATCAAGAG-------------------GTTATGGGTTCGACTCCTATCGGGCGCG---
D00008842 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGTTTGACTACGGATCAAGAG-------------------GTTATGGGTTCGACTCCTATCGGGCGCGCCA
D00009297 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAACT-GGAT-AGAGCGTTTGACTACGGATCAAGAG-------------------GTTATGGGTTCGACTCCTATCGGGCGCG---
D00009298 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAACT-GGAT-AGAGCGTTTGACTACGGATCAAGAG-------------------GTTATGGGTTCGACTCCTATCGGGCGCGCCA
D00009266 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Arg ACG -GCACCCTTAGCTCAACT-GGAT-AGAGTACCTGACTACGAATCAGGCG-------------------GTTAGAGGTTCGACTCCTCTAGGGTGCA---
D00009187 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Arg ACG -GCACCCTTAGCTCAACT-GGAT-AGAGTACCTGACTACGAATCAGGCG-------------------GTTAGAGGTTCGACTCCTCTAGGGTGCA---
D00009271 Streptococcus_mutans_UA159 Arg ACG -GCACCCTTGGCTCAACT-GGAT-AGAGTACCTGACTACGAATCAGGCG-------------------GTTGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGTGCA---
D00008973 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Arg ACG -GCACCCTTAGCTCAACT-GGAT-AGAGTACCTGACTACGAATCAGGCG-------------------GTTAGAGGTTCGACTCCTCTAGGGTGCA---
D00008966 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Arg ACG -GCACCCTTAGCTCAACT-GGAT-AGAGTACCTGACTACGAATCAGGCG-------------------GTTAGAGGTTCGACTCCTCTAGGGTGCA---
D00008967 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Arg ACG -GCACCCTTAGCTCAACT-GGAT-AGAGTACCTGACTACGAATCAGGCG-------------------GTTAGAGGTTCGACTCCTCTAGGGTGCA---
D00009191 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Arg ACG -GCACCCTTAGCTCAACT-GGAT-AGAGTACCTGACTACGAATCAGGCG-------------------GTTAGAGGTTCGACTCCTCTAGGGTGCA---
D00009323 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Arg ACG -GCACCCTTAGCTCAACT-GGAT-AGAGTACCTGACTACGAATCAGGCG-------------------GTTAGAGGTTCGACTCCTCTAGGGTGCA---
D00009324 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Arg ACG -GCACCCTTAGCTCAACT-GGAT-AGAGTACCTGACTACGAATCAGGCG-------------------GTTAGAGGTTCGACTCCTCTAGGGTGCA---
D00009348 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Arg ACG -GCACTCGTAGCTTAAC--GGAT-AGAGCATCTGACTACGGATCAGAAG-------------------GTTGCAGGTTCGAATCCTGCCGAGTGCA---
D00009248 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Arg ACG -GCACTCGTAGCTTAAC--GGAT-AGAGCATCTGACTACGGATCAGAAG-------------------GTTGCAGGTTCGAATCCTGCCGAGTGCA---
D00002440 Streptomyces_lividans Arg ACG -GCACTCGTAGCTTAAC--GGAT-AAAGCATCTGACTACGGATCAGAAG-------------------GTTGCAGGTTCGAATCCTGCCGAGTGCA---
D00009443 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Arg ACG -GCGCCGGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGTACCTGACTACGAATCAGGTG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTGCCCGGCGCGCCA
D00009445 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Arg ACG -GCGCCGGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACCTGACTACGAATCAGGCG-------------------GTCGCAGGTTCGAATCCTGCCCGGCGCGCCA
D00002467 Synechocystis_sp. Arg ACG -GGGCTTGTAGCTTAGT--GGATTAGAGCGCGTGGCTACGGACCACGAG-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCCTCCAAGCCCG---
D00008934 Synechocystis_sp._PCC_6803 Arg ACG -GGGCTTGTAGCTTAGT--GGATTAGAGCGCGTGGCTACGGACCACGAG-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCCTCCAAGCCCG---
D00009204 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAATT-GGAT-AGAGCGCCTGACTACGGATCAGAAG-------------------GCTGGGGGTTCGAGTCCCTCCGGGCGCACCA
D00009196 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Arg ACG -GGGCTTGTAGCTTAGT--GGATTAGAGCGGCTGACTACGGATCAGCAG-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCCTCCAAGCCCG---
D00009481 Thermus_thermophilus_HB27 Arg ACG TGGGCCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGCGGCTGACTACGGATCAGCAG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCTCCCGGGCCCGCCA
D00009302 Tropheryma_whipplei_str._Twist Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAAC--GGAT-AGAGCATCTGACTACGGATCAGAAG-------------------GTTGGGGGTTCGAATCCCTTCGGGCGCG---
D00009306 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAAC--GGAT-AGAGCATCTGACTACGGATCAGAAG-------------------GTTGGGGGTTCGAATCCCTTCGGGCGCG---
D00008849 Ureaplasma_parvum_serovar_3 Arg ACG -GCATCCTTAGCTCAATT-GGAC-AGAGCGTCTGGCTACGGACCAGAAG-------------------GTTAAGGGTTCGACTCCTTTAGGGTGCGCCA
D00008836 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Arg ACG -GCGTCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACCTGTCTACGAACCAGGCG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGACGCGCCA
D00008837 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Arg ACG -GCGCTCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACCTGGCTACGAACCAGGCG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGAGCGCGCCA
D00008838 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Arg ACG -GCGTCCGTAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACCTGGCTACGAACCAGGCG-------------------GTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGACGCGCCA
D00009488 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Arg ACG -GCACCCTTAGCTCAGTT-GGATTAGAGCATTTGACTACGGATCAAAAG-------------------GTCGGGCGTTCAAGTCGCTCAGGGTGCGCCA
D00009214 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGTACCTGGCTACGAACCAGGCG-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCTCCGGGCGCACCA
D00009210 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAGTT-GGAT-AGAGTACCTGGCTACGAACCAGGCG-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCTCCGGGCGCACCA
D00008943 Xylella_fastidiosa_9a5c Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAGTT-GGATTAGAGTACCTGGCTACGAACCAGGCG-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCTCCGGGCGCGCCA
D00009309 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Arg ACG -GCGCCCGTAGCTCAGTT-GGATTAGAGTACCTGGCTACGAACCAGGCG-------------------GTCGGGAGTTCGAATCTCTCCGGGCGCGCCA
D00009447 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Arg ACG -GCACCCATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCGGAAGTTCGAATCTTCCTGGGTGCACCA
D00009448 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Arg ACG -GCACCCATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACTGAGCG-------------------GTCGGAAGTTCGAATCTTCCTGGGTGCACCA
D00008992 Yersinia_pestis_CO92 Arg ACG -GCACCCATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACTGAGCG-------------------GTCGGAAGTTCGAATCTTCCTGGGTGCACCA
D00008993 Yersinia_pestis_CO92 Arg ACG -GCACCCATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCGGAAGTTCGAATCTTCCTGGGTGCACCA
D00009221 Yersinia_pestis_KIM Arg ACG -GCACCCATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCGGAAGTTCGAATCTTCCTGGGTGCACCA
D00009222 Yersinia_pestis_KIM Arg ACG -GCACCCATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACTGAGCG-------------------GTCGGAAGTTCGAATCTTCCTGGGTGCACCA
D00009453 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Arg ACG -GCACCCATAGCTCAGCT-GGAT-AGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCG-------------------GTCGGAAGTTCGAATCTTCCTGGGTGCACCA
D00009100 Arabidopsis_thaliana Arg ACG -GACTCCATGGCCCAAT--GGAT-AAGGCGCTGGTCTACGAAACCAGAG-------------------ACTCTGGGTTCGATCCCCAGTGGAGTC----
D00009101 Arabidopsis_thaliana Arg ACG -GACTTCATGGCCCAAT--GGAT-AAGGCGCTGGTCTACGAAACCAGAG-------------------ATTCTGGGTTCGATCCCCAGTGAAGTC----
D00009102 Arabidopsis_thaliana Arg ACG -GACTCTGTGGCCCAAT--GGAT-AAGGCGCTGGTCTACGAAACCAGAG-------------------ATTCTGGGTTCGATCCCCAGCAGAGTC----
D00009103 Arabidopsis_thaliana Arg ACG -GGTTCCATGGCCCAAT--GGAT-AAGGCGCTGGTCTACGAAACCAGAG-------------------ATTCTGGGTTCGATCCCCAGTGGAATC----
D00009104 Arabidopsis_thaliana Arg ACG -GACTCCATGGCCCAAT--GGAT-AAGGCGCTGGTCTACGAAACCAGAG-------------------ATTCTGGGTTCGATCCCCAGTGGAGTC----
D00009105 Arabidopsis_thaliana Arg ACG -GACTCCGTGGCCCAAT--GGAT-AAGGCGCTGGTCTACGAAACCAGAG-------------------ATTCTGGGTTCGATCCCCAGCGGAGTC----
D00002591 Caenorhabditis_elegans Arg ACG -GGCCGCGTGGCGCAAT--GGAT-AACGCGTCTGCCTACGGAGCAGAAG-------------------ATTGCAGGTTCGAATCCTGCCGTGGTCG---
D00002592 Caenorhabditis_elegans Arg ACG -GGCCGCGTGGGCCAAT--GGAT-AACGCGTCTGCCTACGGAGCAGAAG-------------------ATTGCAGGTTCGAATCCTGCCGTGGTCG---
D00009121 Caenorhabditis_elegans Arg ACG ---GGCCGTGGCGCAAT--GGAT-AACGCGTCTGCCTACGGAGCAGAAG-------------------ATTGTAGGTTCGAATCCTGCCGTGGTC----
D00009122 Caenorhabditis_elegans Arg ACG -GGCCGCGTGGGGCAAT--GGAT-AACGCGTCTGCCTACGGAGCAGAAG-------------------ATTGTAGGTTCGAATCCTGCCGTGGTCG---
D00009123 Caenorhabditis_elegans Arg ACG -GGCCGCGTGGCGCAAT--GGAT-AACGCGTCTGCCTACGGAGCAGAAG-------------------ATTGTAGGTTCGAATCCTGCCGTGGTCG---
D00009124 Caenorhabditis_elegans Arg ACG -GGCCGCGTGGCGCAAT--GGAT-AACGCGTCTGCCTACGGAGCAGAAG-------------------ATTGTAGGTTCGAATCCTACCGTGGTCG---
D00009125 Caenorhabditis_elegans Arg ACG -GGCCGCGTGGCGCAAT--GGAT-AACGCGTCTGCCTACGGAGCAGAAG-------------------ATTGCAGGTTCGAATCCTGCCGTGGTCG---
D00009456 Candida_glabrata_CBS_138 Arg ACG -TTCCTCGTGGCCCAAT--GGTC-ACGGCGTCTGGCTACGAACCAGAAG-------------------ATTCCAGGTTCGAGTCCTGGCGGGGAAG---
D00002582 Dictyostelium_discoideum Arg ACG -GGGACTATAGTTTAGTT-GGAT-ATAACGACCGGCTACGAACCGGTAG-------------------GTCTCAGGTTCGACCCCTGATGGTCTCG---
D00002595 Drosophila_melanogaster Arg ACG -GGTCCTGTGGCGCAAT--GGAT-AACGCGTCTGACTACGGATCAGAAG-------------------ATTCCAGGTTCGACTCCTGGCAGGATCG---
D00009144 Drosophila_melanogaster Arg ACG -GGTCCTGTGGCGCAAT--GGAT-AACGCGTCTGACTACGGATCAGAAG-------------------ATTCCAGGTTCGACTCCTGGCAGGATCG---
D00009216 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Arg ACG -GGCCTCATAGCTCAAT--GGTT-AGAGTGTCGGCCTACGGAGCCGAAG-------------------GCTGAGGGTTCGAGTCCCTCTGGGGTCG---
D00009509 Gallus_gallus Arg ACG -GGGCCAGGGGCGCAAG--GGAT-AACGCGTCTGACTACGGATCAGAAG-------------------ATTCTAGGTTCGACTCCTGGCTGGCTCG---
D00009510 Gallus_gallus Arg ACG -GGGCCAGGGGCGCAAT--GGAT-AACGCGTCTGACTACGGATCAGAAG-------------------ATTGTAGGTTCGACTCCTGCCTGGCTCG---
D00009511 Gallus_gallus Arg ACG -GGGCCAGTGGCGCAAT--GGAT-AACGCGTCTGACTACGGATCAGAAG-------------------ATTGTAGGTTCGACTCCTGCCTGGCTCG---
D00009512 Gallus_gallus Arg ACG -GGGCCAGTGGCGCAAT--GGAT-AACGCGTCTGACTACGGATCAGAAG-------------------ATTCTAGGTTCGACTCCTGGCTGGCTCG---
D00009513 Gallus_gallus Arg ACG -GGGCCAGTGGCGCAAT--GGAT-AACGCGCCTGACTACGGATCAGGAG-------------------ATTGCAGGTTCAACTCCTGCCTGGCTCG---
D00002599 Homo_sapiens Arg ACG -GGGCCAGTGGCGCAAT--GGAT-AACGCGTCTGACTACGGATCAGAAG-------------------ATTCCAGGTTCGACTCCTGGCTGGCTCG---
D00009082 Homo_sapiens Arg ACG -GGGCCAGTGGCGCAAT--GGAT-AACGCGTCTGACTACGGATCAGAAG-------------------ATTCTAGGTTCGACTCCTGGCTGGCTCG---
D00009083 Homo_sapiens Arg ACG -GGGCCAGTGGCGCAAT--GGAT-AACGCGTCTGACTACGGATCAGAAG-------------------ATTCCAGGTTCGACTCCTGGCTGGCTCG---
D00002580 Leishmania_tarentolae Arg ACG -GTCCGTGTGGCTCAAT--GGA--AGAGCATCTGACTACGGATCAGAGG-------------------GTTGCAGGTTCGAATCCTGTCACGGATG---
D00002584 Neurospora_crassa Arg ACG -GGTCCGCTGGCTCAAT--GGC--AGAGCGTCTGACTACGAATCAGGAG-------------------GTTCCAGGTTCGACCCCTGGGTGGATCG---
D00009552 Pan_troglodytes Arg ACG -GGGCCAGTGGCGCAAT--GGAT-AACGCGTCTGACTACGGATCAGAAG-------------------ATTCTAGGTTCGACTCCTGGCTGGCTCG---
D00009553 Pan_troglodytes Arg ACG -GGGCCAGTGGCGCAAT--GGAT-AACGCGTCTGACTACGGATCAGAAG-------------------ATTCCAGGTTCGACTCCTGGCTGGCTCG---
D00002575 Plasmodium_falciparum Arg ACG -AAACTTGTAATTTAAT--GGAT-AAAATATATAAATACGAATTATAAA-------------------A-TAAAAGTTCAATTCTTTTCAAGTTTA---
D00002585 Saccharomyces_cerevisiae Arg ACG -TTCCTCGTGGCCCAAT--GGTC-ACGGCGTCTGGCTACGAACCAGAAG-------------------ATTCCAGGTTCAAGTCCTGGCGGGGAAG---
D00009139 Saccharomyces_cerevisiae Arg ACG -TTCCTCGTGGCCCAAT--GGTC-ACGGCGTCTGGCTACGAACCAGGAG-------------------ATTCCAGGTTCGAGTCCTGGCGGGGAAG---
D00009140 Saccharomyces_cerevisiae Arg ACG -TTCCTCGTGGCCCAAT--GGTC-ACGGCGTCTGGCTACGAACCAGAAG-------------------ATTCCAGGTTCAAGTCCTGGCGGGGAAG---
D00002588 Schizosaccharomyces_pombe Arg ACG -GGTCTCGTGGCCCAAT--GGTT-AAGGCGCTTGACTACGAATCAAGAG-------------------ATTCCAGGTTCGACTCTTGGCGGGATCG---
D00002589 Schizosaccharomyces_pombe Arg ACG -GGTCTCGTGGCCCAAT--GGTT-AAGGCGCTTGACTACGGATCAAGAG-------------------ATTCCAGGTTCGACTCCTGGCGGGATCG---
D00009153 Schizosaccharomyces_pombe Arg ACG -GGTCTCGTGGCCCAAT--GGTT-AAGGCGCTTGACTACGGATCAAGAG-------------------ATTCCAGGTTCGACTCCTGGCGGGATCG---
D00009524 Takifugu_rubripes Arg ACG -GGGCCAGTGGAGCAAT--GGAT-AACGCGTCTGACTACGGATCAGAAG-------------------ATTCTAGGTTCGACTCCTGGCTGGCTCG---
D00009525 Takifugu_rubripes Arg ACG -GGGCCAGTGGCGCAAT--GGAT-AACGCGTCTGACTACGGATCAGAAG-------------------ATTCTAGGTTCGACTCCTGGCTGGTCGG---
D00009526 Takifugu_rubripes Arg ACG -GGGCCAGTGGCGCAAT--GGAT-AACGCGTCTGACTACGGATCAGAAG-------------------ATTCTAGGTTCGACTCCTGGCTGGCTCG---
D00009527 Takifugu_rubripes Arg ACG -GGGCCAGTGGCGCAAT--GGAT-AACGCGTCTGACTACGGATCAGAAG-------------------ATTCCAGGTTCGACTCCTGGCTGGCTCG---
D00002590 Toxoplasma_gondii Arg ACG -GAGTCAATAGCTCAGTT-GGA--AGAGTATGTGGCTACGGACTACAAT-------------------GACGGGGGTTCAAATCCCTCTTGACTCT---
D00002579 Trypanosoma_brucei Arg ACG -GTCCGTGTGGCTCAAT--GGA--AGAGCATCTGACTACGGATCAGAGG-------------------GTTGCAGGTTCGAATCCTGTCACGGATG---
D00002444 Helicobacter_pylori Arg GTT -TCCAGATTAGCTCAGC--GGT--AGAGTAGGCGGCTGTTAACCGCTTG-------------------GTCGTAGGTTCGAATCCTACATCTGGAGCCA
D00003269 Archaeoglobus_fulgidus Trp CCA -GGGGTCGTGGCGTAGCCAGGA--AGCGCGGCGGGCTCCAGACCCGCCA-------------------GTCGTGGGTTCAAATCCCACCGGCCCCA---
D00011339 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Trp CCA -GGGGTCGTGGCGTAGCCAGGA--AGCGCGGCGGGCTCCAGACCCGCCA-------------------GTCGTGGGTTCAAATCCCACCGGCCCCA---
D00011340 Halobacterium_sp._NRC-1 Trp CCA -GGGGCTGTGGCCAAGCCAGGC--ATGGCGACTGACTCCAGATCAGTCG-------------------ATCGGGGGTTCAAATCCCTCCGGCCCCA---
D00003270 Haloferax_mediterranei Trp CCA -GGGGCTGTGGCCAAGCCCGGC--ATGGCGACTGACTCCAGATCAGTCG-------------------ATCGGGGGTTCAAATCCCTCCGGCCCCA---
D00003271 Haloferax_volcanii Trp CCA -GGGGCTGTGGCCAAGCCCGGC--ATGGCGACTGACTCCAGATCAGTCG-------------------ATCGGGGGTTCAAATCCCTCCGGCCCCA---
D00003272 Methanocaldococcus_jannaschii Trp CCA -GGGGGTGTGGTGTAGCCAGGTCTATCATCGGGGACTCCAGATCCCTGG-------------------A-CCTGGGTTCAAATCCCAGCACCCCCA---
D00011342 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Trp CCA -GGGGGTGTGGTGTAGCCAGGTCTATCATCGGGGACTCCAGATCCCTGG-------------------A-CCTGGGTTCAAATCCCAGCACCCCCACC-
D00011861 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Trp CCA -GGGGATATGGTGTAGCCTGGCCTATCATTGGGGACTCCAAATCCCTAG-------------------A-CCTGGGTTCAAATCCCAGTATCCCCA---
D00011343 Methanococcus_maripaludis Trp CCA -GGGAGTATGGTGTAGTCTGGTCTATCATCGGGGACTCCAAATCCCTGG-------------------A-CCTGGGTTCAAATCCCAGTACTTCC----
D00011921 Methanosarcina_acetivorans_C2A Trp CCA -GGGGCTGTGGCCTAGCCCGGC--ATGGCGATGGGCTCCAGACCCGTCG-------------------ATCGTGAGTTCGAATCTCACCAGCCCCA---
D00011371 Methanosarcina_mazei_Go1 Trp CCA -GGGGCTGTGGCCTAGCCCGGC--ATGGCGATGGGCTCCAGACCCGTCG-------------------ATCGTGAGTTCGAATCTCACCAGCCCCT---
D00011942 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Trp CCA -GGGGTCGTGGCCTAGTCCGGC--ATGGCGACGGGCTCCAGACCCGTCG-------------------ATCGTGAGTTCAAATCTCACCGACCCCA---
D00011341 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Trp CCA -GGGGTCATGGTGTAACCAGGCT-ATCATCTGGGACTCCAGATCCTAGG-------------------A-TCTGGGTTCAAATCCCAGTGACCCCA---
D00011344 Pyrobaculum_aerophilum_str._IM2 Trp CCA -GGGGCCGTAGCTCAGCCAGGC--AGAGCGGCGGGCTCCAGACCCGTAG-------------------GGCGGGGGTTCAAATCCCTCCGGCCCCACCA
D00011345 Pyrococcus_abyssi_GE5 Trp CCA -GGGGGCGTGGTGTAGCCTGGTCTATCATCGCGGGCTCCAGACCCGCGG-------------------A-CCGGGGTTCAAATCCCCGCGCCCCCACC-
D00011346 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Trp CCA -GGGGGCGTGGTGTAGCCTGGTCCATCATCGCGGGCTCCAGACCCGCGG-------------------A-CCGGGGTTCAAATCCCCGCGCCCCCACC-
D00011347 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Trp CCA -GGGGGCGTGGTGTAGCCTGGTCCATCATCGCGGGCTCCAGACCCGCGG-------------------A-CCGGGGTTCAAATCCCCGCGCCCCCACCA
D00012098 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Trp CCA -GGGCCCATAGCTCAGCCAGGT--AGAGTGCCGGGCTCCAGACCCGGTG-------------------GTCCGGGGTTCAAGTCCCCGTGGGCCCA---
D00011348 Sulfolobus_solfataricus_P2 Trp CCA -GGGCCCGTAGCTTAGCCAGGT--AGAGTACTGGGCTCCAGACCCAGTG-------------------GTCGCGGGTTCGAGTCCCGCCGGGCCC----
D00011379 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Trp CCA -GGGCCCATAGCTCAGCTAGGT--AGAGTGCCGGGCTCCAGACCCGGTG-------------------GTCCGGGGTTCAAGTCCCCGTGGGCCCA---
D00011349 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Trp CCA -GGGGACATGGGGTAAT--GGC--ATCCTGACGGGCTCCAGACCCGTAG-------------------A-TCTGGGTTCAACTCCCAGTGTCCCCA---
D00011350 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Trp CCA -GGGGACATGGGGTAAT--GGC--ATCCTGACGGGCTCCAGACCCGTAG-------------------A-TCTGGGTTCAACTCCCAGTGTCCCCA---
D00003280 Acholeplasma_laidlawii Trp CCA -GGGGGCATGGTGTCAAC-GGT--AGCACACAGGTCTCCAAAACCTTTA-------------------G-TGTGGGTTCGAATCCTGCTGCCCTCGCCA
D00011460 Acinetobacter_sp._ADP1 Trp CCA -AGAGGATTGGTGTAAT--GGT--AGCATGACGGTCTCCAAAACCGTTC-------------------G-TCAAGGTTCGAGTCCTTGATCCTCTGCCA
D00011461 Acinetobacter_sp._ADP1 Trp CCA -AGGTCAGTAGTTCAATT-GGT--AGAGCGTCGGTCTCCAAAACCGAAT-------------------GTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCTGGCCTGCCA
D00011336 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Trp CCA --GGGGTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGGCGGTCTCCAAAACCGCAG-------------------GTCGTAAGTTCGAGCCTTACTGCCCCTGCCA
D00011319 Aquifex_aeolicus_VF5 Trp CCA -GGGGCTGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCGCGGGACTCCAAATCCCGTG-------------------GGTGGGGGTTCGAGTCCTCCCAGCCCCGCCA
D00011427 Bacillus_anthracis_str._Ames Trp CCA -AGGGGCATAGTTTAAA--GGT--AGAACTGAGGTCTCCAAAACCTCCA-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCCTGCCA
D00011428 Bacillus_anthracis_str._Ames Trp CCA -AGGGGCATAGTTTAAA--GGT--AGAACTGAGGTCTCCAAAACCTCCA-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCCTG---
D00011438 Bacillus_anthracis_str._Sterne Trp CCA -AGGGGCATAGTTTAAA--GGT--AGAACTGAGGTCTCCAAAACCTCCA-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCCTGCCA
D00011439 Bacillus_anthracis_str._Sterne Trp CCA -AGGGGCATAGTTTAAA--GGT--AGAACTGAGGTCTCCAAAACCTCCA-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCCTG---
D00011451 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Trp CCA -AGGGGCATAGTTTAAA--GGT--AGAACTGAGGTCTCCAAAACCTCCA-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCCTGCCA
D00011452 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Trp CCA -AGGGGCATAGTTTAAA--GGT--AGAACTGAGGTCTCCAAAACCTCCA-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCCTG---
D00011414 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Trp CCA -AGGGGCATAGTTTAAA--GGT--AGAACTGAGGTCTCCAAAACCTCCA-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCCTGCCA
D00011415 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Trp CCA -AGGGGCATAGTTTAAA--GGT--AGAACTGAGGTCTCCAAAACCTCCA-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCCTG---
D00011416 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Trp CCA -GGGGGTATAATTTAAG--GGT--AAAACAGGGGCCTCCAGAACCTCTG-------------------A-TGTGGGTTCAATTCCCGCCATCCACT---
D00011397 Bacillus_halodurans_C-125 Trp CCA -AGGGGCATAGTTTAAC--GGT--AGAACAGAGGTCTCCAAAACCTCCG-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCCTGCCA
D00003288 Bacillus_subtilis Trp CCA -AGGGGCATAGTTTAAC--GGT--AGAACAGAGGTCTCCAAAACCTCCG-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCCTGCCA
D00011290 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Trp CCA -AGGGGCATAGTGTAAC--GGT--AGAACAGAGGTCTCCAAAACCTCCG-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCCTGCCA
D00011462 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Trp CCA -AGGGGCATAGTTTAAA--GGT--AGAACTGAGGTCTCCAAAACCTCCA-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCCTG---
D00011463 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Trp CCA -AGGGGCATAGTTTAAA--GGT--AGAACTGAGGTCTCCAAAACCTCCA-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCCTGCCA
D00011424 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Trp CCA -ACGGGAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGT-------------------GTCGGGAGTTCGAGCCTCTCCTCCCGTG---
D00011425 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Trp CCA -ACGGGAGTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGT-------------------GTCGGGAGTTCGAGCCTCTCCTCCCGTG---
D00011429 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Trp CCA -AGGGGTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGGCGGTCTCCAAAACCGCAG-------------------GTCGCGGGTTCGAGCCCTGCTGCCCCTGCCA
D00011465 Bartonella_quintana_str._Toulouse Trp CCA -AGGGGTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGGCGGTCTCCAAAACCGCAG-------------------GTCGCGGGTTCAAGCCCTGCTGCCCCTGCCA
D00011430 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Trp CCA -AGGGGTGTAGCTCCAGC-GGT--AGAGCGAACGACTCCAAATCGTTAG-------------------GTCGTGGGTTCGAATCCCTCCGCCCCTGCCA
D00011385 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Trp CCA -ATGCGCGTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCGGCGGTCTCCAAAACCGCAG-------------------GTCGTCGGATCGAAGCCAACCGCGCAAT---
D00011386 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Trp CCA -AGGGAAGTGGCGCAATT-GGT--AGCGCAACGGTCTCCAAAACCGTAG-------------------GTTGTGGGTTCGAGTCCCGCCTTCCCTGCCA
D00003284 Borrelia_burgdorferi Trp CCA -AGGTCAGTAGTTCCAAC-GGT--AGAACGACAGTCTCCAAAACTGTAT-------------------GCTGGGGGTTCGAATCCCTCCTGACCTG---
D00011306 Borrelia_burgdorferi_B31 Trp CCA -AGGTCAGTAGTTCCAAC-GGT--AGAACGACAGTCTCCAAAACTGTAT-------------------GCTGGGGGTTCGAATCCCTCCTGACCTG---
D00011440 Borrelia_garinii_PBi Trp CCA -AGGTCAGTAGTTCCAAC-GGT--AGAACGACAGTCTCCAAAACTGTAT-------------------GCTGGGGGTTCGAATCCCTCCTGACCTG---
D00011398 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Trp CCA -AGGAGTGTAGCTCAATT-GGT--AGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAGCCCTGCCACTCCTGCCA
D00011329 Brucella_melitensis_16M Trp CCA -AGGGGTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGACGGTCTCCAAAACCGTAG-------------------GTCGCGGGTTCGAACCCTGCTGCCCCTGCCA
D00011387 Brucella_suis_1330 Trp CCA -AGGGGTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGACGGTCTCCAAAACCGTAG-------------------GTCGCGGGTTCGAACCCTGCTGCCCCTGCCA
D00011291 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Trp CCA -AGGGGTGTAGTTCAATTTGGT--AGAGCATCGGTCTCCAAAACCGAAA-------------------GTTGTAGGTTCAAATCCTTCCACCCCTG---
D00011417 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Trp CCA -AGGGATGTAGCTCAATT-GGT--AGAGTATCGGTCTCCAAAACCGAAT-------------------GTTGGGGGTTCAATTCCCTCCATCCCTG---
D00011372 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Trp CCA -AGGGGTGTAGTTCAATTTGGT--AGAGCATCGGTCTCCAAAACCGAAA-------------------GTTGTAGGTTCAAGTCCTTCCACCCCTGCCA
D00011307 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Trp CCA -AGGGCAATAGCTCCAAC-GGT--AGAGCGCCGGATTCCAAATCCGATG-------------------GTTGGGGGTTCGAATCCCTCTTGCCCTGCCA
D00011466 Candidatus_Blochmannia_floridanus Trp CCA -AGGGGTGTAGTTCAAT--GGT--AGAATATCGGTCTCCAAAACCGAGG-------------------GTTGGGAGTTCAAGTCTCTTCACCCCTG---
D00011434 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Trp CCA -GGGTGTGTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCAACGGTCTCCAAAGCCGTCG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCGCACTCG---
D00011308 Caulobacter_crescentus_CB15 Trp CCA -AGGAGTGTAGCTCAGCT-GGT--AGAGCATCGGTCTCCAAAACCGAGG-------------------GCCGGGGGTTCGAGTCCCTCCACTCCTGCCA
D00011324 Chlamydia_muridarum_Nigg Trp CCA -GGGTGTGTAGCTTAGAT-GGT--AGAGCAGTGGCCTCCAAAGCCGCCG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCGCACTCG---
D00003407 Chlamydia_trachomatis Trp CCA -GGGTGTGTAGCTTAGAT-GGT--AGAGCAGTGGCCTCCAAAGCCGCCG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCTTCACCG----
D00011289 Chlamydia_trachomatis Trp CCA -GGGTGTGTAGCTTAGCT-GGT--AGAGCAGTGGCCTCCAAAGCCGCCG-------------------GTCGGGGGTTCGATTCCCTTCGCACCC----
D00011288 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Trp CCA -GGGTGTGTAGCTTAGAT-GGT--AGAGCAGTGGCCTCCAAAGCCGCCG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCTCCGCACTCG---
D00011286 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Trp CCA -GGGTGTGTAGCTTAGCT-GGT--AGAGCAGTGGCCTCCAAAGCCGCCG-------------------GTCGGGGGTTCGATTCCCTTCGCACCCG---
D00011287 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Trp CCA -GGGTGTGTAGCTTAGCT-GGT--AGAGCAGTGGCCTCCAAAGCCGCCG-------------------GTCGGGGGTTCGATTCCCTTCGCACCCG---
D00011299 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Trp CCA -GGGTGTGTAGCTTAGCT-GGT--AGAGCAGTGGCCTCCAAAGCCGCCG-------------------GTCGGGGGTTCGATTCCCTTCGCACCCG---
D00011369 Chlorobium_tepidum_TLS Trp CCA -ACGTCAGTAGCTTAATT-GGT--AGAGCAGCGGTCTCCAAAACCGCAG-------------------GTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCTGACGTA---
D00011327 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Trp CCA -AGGGGTATAGCTCAATT-GGT--AGAGTAACGGTCTCCAAAACCGTCG-------------------GTTGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCCTGCCA
D00011322 Clostridium_perfringens_str._13 Trp CCA -AGGGGTATGGCTCAATT-GGT--AGAGTAGTGGTCTCCAAAACCATTG-------------------GTTGTGGGTTCAAGTCCTACTGCCCCTGCCA
D00011323 Clostridium_perfringens_str._13 Trp CCA -AGGGGTATGGCTCAATT-GGT--AGAGTAGTGGTCTCCAAAACCATTG-------------------GTTGTGGGTTCGAGTCCTACTGCCCCTGCCA
D00011399 Clostridium_tetani_E88 Trp CCA -AGGGGTATAGCTCAATT-GGT--AGAGTAGCGGTCTCCAAAACCGTTG-------------------GTTCCGGGTTCAAGTCCTCGTGCCCCTGCCA
D00011431 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Trp CCA -AGGGGCGTAGTTCAATT-GGT--AGAGCAACGGTCTCCAAAACCGTAG-------------------GTTGCAGGTTCAAGTCCTGTCGCCCCTG---
D00011388 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Trp CCA -AGGGGCGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCAACGGTCTCCAAAACCGTAG-------------------GTTGCAGGTTCAAGTCCTGTCGCCCCTG---
D00011374 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Trp CCA -AGGGGCGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCAACGGTCTCCAAAACCGTAG-------------------GTTGCAGGTTCGATTCCTGTCGCCCCTG---
D00011413 Coxiella_burnetii_RSA_493 Trp CCA -AGGCCAGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCAGCGGTCTCCAAAACCGCAG-------------------GTTGGGGGTTCGATTCCCTCCTGGCCTGCCA
D00011309 Deinococcus_radiodurans_R1 Trp CCA -GGGTTCTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGGCGGTCTCCAAAACCGTAG-------------------GTCGAGGGTTCAAGTCCTTCAGGGCCCGCCA
D00011453 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Trp CCA -AGGGCAGTAGCTCTAAC-GGCT-AGAGCGCCGGTCTCCAAAACCGGAT-------------------GTTGGGGGTTCGAATCCCTCCTGCCCTGCCA
D00011400 Enterococcus_faecalis_V583 Trp CCA -TGGAGCATAGATTAATT-GGT--AGAGCAGCGGTCTCCAAAACCATCA-------------------G-TATAGGTTCAATCCCCATTGTTCGTAGCA
D00011401 Enterococcus_faecalis_V583 Trp CCA -AGGGGCATAGTTTAAA--GGT--AGAACAACGGTCTCCAAAACCGTTG-------------------G-TGTGGGTTCAATTCCTGCTGCCCCTGCCA
D00011402 Enterococcus_faecalis_V583 Trp CCA -TGGGATATAGCTTAACT-GGT--AGAGCAGTGGTCTCCAAAACCGTCG-------------------G-TATAGGTTCGACTCCTATTGTTCCAG---
D00011403 Enterococcus_faecalis_V583 Trp CCA -TGGAGCATAGCTTAATC-GGC--AGAGCAGCGGTCTCCAAAACCGTTG-------------------G-TATAGGTTCGAGTCCTATTGTTCCAG---
D00003289 Escherichia_coli Trp CCA -AGGGGCGTAGTTCAATT-GGT--AGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGT-------------------GTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCA
D00011418 Escherichia_coli_CFT073 Trp CCA -AGGGGCGTAGTTCAATT-GGT--AGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGT-------------------GTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCA
D00011300 Escherichia_coli_K12 Trp CCA -AGGGGCGTAGTTCAATT-GGT--AGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGT-------------------GTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCA
D00011301 Escherichia_coli_O157:H7 Trp CCA -AGGGGCGTAGTTCAATT-GGT--AGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGT-------------------GTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCA
D00011302 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Trp CCA -AGGGGCGTAGTTCAATT-GGT--AGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGT-------------------GTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCA
D00011370 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Trp CCA -AGGTCAATGGCTCAATT-GGT--AGAGCATCGGTCTCCAAAACCGAGG-------------------GTTGGGGGTTCGAGTCCCTCTTGACCTGCCA
D00011441 Geobacter_sulfurreducens_PCA Trp CCA -AGGCCAGTAGCTCTAAC-GGCT-AGAGCGCCGGTCTCCAAAACCGGAT-------------------GTTGGGGGTTCGAATCCCTCCTGGCCTGCCA
D00003291 Haemophilus_influenzae Trp CCA -AGGGGCGTAGTTCAATT-GGT--AGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGT-------------------GTTGGGAGTTCGAGCCTCTCCGCCCCTGCCA
D00011305 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Trp CCA -AGGGGCGTAGTTCAATT-GGT--AGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGT-------------------GTTGGGAGTTCGAGCCTCTCCGCCCCTGCCA
D00003287 Helicobacter_pylori Trp CCA -AGGTCAGTAGCTCCAAT-GGT--AGAGCGTCGGTCTCCAAAACCGGTT-------------------GTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCTGGCCTGCCA
D00011303 Helicobacter_pylori_26695 Trp CCA -AGGTCAGTAGCTCCAAT-GGT--AGAGCGTCGGTCTCCAAAACCGGTT-------------------GTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCTGGCCTGCCA
D00011304 Helicobacter_pylori_J99 Trp CCA -AGGTCAGTAGCTCCAAT-GGT--AGAGCGTCGGTCTCCAAAACCGGTT-------------------GTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCTGGCCTGCCA
D00011442 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Trp CCA -AGGGATATCGTATAAA--GGT--AGTACATCGGTCTCCAAAACCGCTA-------------------G-TGTGGGTTCAATTCCTACTATCCCTG---
D00011404 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Trp CCA -AGGGATATAGTTTAAT--GGT--AGAACAACGGTCTCCAAAACCGTCG-------------------G-TGTGGGTTCAACTCCTACTATCCCTGCCA
D00011405 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Trp CCA -GCAGATATGATCTAATT-GGC--AAGATGGCGGTCTCCAAAACCGTCT-------------------A-TGTTGGTTCAAATCCAGCTATCTGTG---
D00011443 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Trp CCA -AGGGCGGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCAGCGGTCTCCAAAACCGCAG-------------------GTTGCAGGTTCGATTCCTGTCCGCCCTG---
D00011389 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Trp CCA -AGGCCTGTAGTTTAGT--GGT--AGAACTAGGATCTCCAAAGTCCTTG-------------------G-TGGGAGTTCGATTCTCTCCGGGCCTG---
D00011320 Listeria_innocua_Clip11262 Trp CCA -AGGGGCATAGTTTAAA--GGT--AGAACTGAGGTCTCCAAAACCTCCA-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCCTGCCA
D00011321 Listeria_monocytogenes_EGD-e Trp CCA -AGGGGCATAGTTTAAA--GGT--AGAACTGAGGTCTCCAAAACCTCCA-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCCTGCCA
D00011454 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Trp CCA -AGGGGCATAGTTTAAA--GGT--AGAACTGAGGTCTCCAAAACCTCCA-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCCTGCCA
D00011455 Mesoplasma_florum_L1 Trp CCA -AGAGGTATAGTTCAGAT-GGT--AGAACATCGGTCTCCAAAACCGAGT-------------------GTCACGAGTTCGAGTCTTGTTACCTCTGCCA
D00011330 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Trp CCA -ACGGGCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGGCGGTCTCCAAAACCGCAG-------------------GTCGTAGGTTCGAGCCCTGCTGCCCGTGCCA
D00011411 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Trp CCA -AGGGGCGTAGCTCAACT-GGC--AGAGCAGCGGTCTCCAAAACCGCAG-------------------GTTGCAGGTTCAAGTCCTGTCGCCCCTG---
D00011297 Mycobacterium_leprae_TN Trp CCA -AGGGGCGTAGCTCAACT-GGC--AGAGCAGCGGTCTCCAAAACCGCAG-------------------GTTGCAGGTTCAAATCCTGTCGCCCCTG---
D00011292 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Trp CCA -AGGGGCGTAGCTCAACT-GGC--AGAGCAGCGGTCTCCAAAACCGCAG-------------------GTTGCAGGTTCAAGTCCTGTCGCCCCTG---
D00011433 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Trp CCA -AGGGGCGTAGCTCAACT-GGC--AGAGCAGCGGTCTCCAAAACCGCAG-------------------GTTGCAGGTTCAAGTCCTGTCGCCCCTG---
D00003275 Mycoplasma_capricolum Trp CCA -AGGAGAGTAGTTCAAT--GGT--AGAACGTCGGTCTCCAAAACCGAGC-------------------GTTGAGGGTTCGATTCCTTTCTCTCCTGCCA
D00011410 Mycoplasma_gallisepticum_R Trp CCA -AGGGGTGTAGTTCAAT--GGT--AGAACTAGGGTCTCCAAAACCTTCG-------------------A-TGCGGGTTCGATTCCTGTCACCCCTGCCA
D00003276 Mycoplasma_genitalium Trp CCA -GGGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AGAACAACAGTCTCCAAAACTGTCT-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTTCCACCCCCGCCA
D00011310 Mycoplasma_genitalium_G37 Trp CCA -GGGGGTGTAGTTTAGT--GGT--AGAACAACAGTCTCCAAAACTGTCT-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTTCCACCCCCGCCA
D00003278 Mycoplasma_pneumoniae Trp CCA -GGGGGTGTAGTTTAGT--GGC--AGAACAACAGTCTCCAAAACTGTCT-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTTCCACCCCCGCCA
D00011311 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Trp CCA -GGGGGTGTAGTTTAGT--GGC--AGAACAACAGTCTCCAAAACTGTCT-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTTCCACCCCCGCCA
D00011335 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Trp CCA -GGGAGATTAGTATAAT--GGT--AGTACTACAGATTCCAAACCTGTTT-------------------G-CGTGGGTTCGATTCCTACATCTCTCGCCA
D00011293 Neisseria_meningitidis_MC58 Trp CCA -AGGCCAATAGCTCAATT-GGT--AGAGTATCGGTCTCCAAAACCGAGG-------------------GTTGGGGGTTCGAGACCCTCTTGGCCTGCCA
D00011294 Neisseria_meningitidis_Z2491 Trp CCA -AGGCCAATAGCTCAATT-GGT--AGAGTATCGGTCTCCAAAACCGAGG-------------------GTTGGGGGTTCGAGACCCTCTTGGCCTGCCA
D00011423 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Trp CCA -AGGCCAGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCGTCGGTCTCCAAAACCGAAG-------------------GTTGGGGGTTCGATGCCCTCCTGGCCTGCCA
D00011334 Nostoc_sp._PCC_7120 Trp CCA -GCGCTCTTAGTTCAGTT-GGT--AGAACGCAGGTCTCCAAAACCTGAT-------------------GTCGGGGGTTCAAGTCCTCCAGGGCGCG---
D00011390 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Trp CCA -AGGGGTATAGTTTAAT--GGT--AAAACGAAGGTCTCCAAAACCTTTG-------------------A-TGTGGGTTCGATTCCTACTACCCCTGCCA
D00011432 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M Trp CCA -AGGGATATGATGTCAAT-GGT--AGCATAACGGTCTCCAAAACCGCTC-------------------G-TTCGGGTTCGAATCCTGATATCCCTGCCA
D00011312 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Trp CCA -AGGGGCGTAGTTCAATT-GGT--AGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGT-------------------GTTGGGAGTTCGAGCCTCTCCGCCCCTGCCA
D00011435 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Trp CCA -AGGGGCGTAGTTCAATT-GGT--AGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGT-------------------GTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCA
D00011444 Porphyromonas_gingivalis_W83 Trp CCA -ACGGGTTTAGCTCAGTT-GGT--AGAGCATTGGTCTCCAAAACCAAGT-------------------GTCGGGAGTTCGAGTCTCTCAACCCGTG---
D00011456 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Trp CCA -AGGGCACTAGCTCAATT-GGC--AGAGCAGCGGTCTCCAAAACCGCAG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCCTCGTGCCCTG---
D00011314 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Trp CCA -AGGCCAGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCGGCGGTCTCCAAAACCGCAG-------------------GTTGGGGGTTCGATTCCCTCCTGGCCTGCCA
D00011426 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Trp CCA -AGGTCAGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCGACGGTCTCCAAAACCGTAG-------------------GTTGGGGGTTCGATTCCCTCCTGACCTGCCA
D00011333 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Trp CCA -AGGGGTATAGCTCAACT-GGC--AGAGCGTCGGTCTCCAAAACCGAAG-------------------GTTGGGGGTTCGATTCCCTCTGCCCCTGCCA
D00011421 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Trp CCA -AGGGGCGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCACTGGTTTCCAAAACCAGCG-------------------GTTGTGAGTTCGACTCTCGCCGCCCCTG---
D00011422 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Trp CCA -ACGTCTCTGGTGTAAC--GGT--AGCACTACTGATTCCAAACCAGTTA-------------------G-TCAGGGTTCAAATCCTTGGGGACGTG---
D00011436 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Trp CCA -AGGAGTGTAGCTCAATT-GGT--AGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGG-------------------GTCGCAGGTTCGAGCCCTGCCACTCCTGCCA
D00011328 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Trp CCA -AGGAGTGTAGCTCAATT-GGT--AGAGCGCCGGTCTCCAAAACCGGAG-------------------GTTGCGGGTTCGATACCTGTCGCTCCTGCCA
D00003290 Rickettsia_prowazekii Trp CCA -AGGAGTGTAGCTCAATT-GGT--AGAGCGCCGGTCTCCAAAACCGGAG-------------------GTTGCGGGTTCGATTCCTGTCGCTCCTGCCA
D00011373 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Trp CCA -AGGAGTGTAGCTCAATT-GGT--AGAGCGCCGGTCTCCAAAACCGGAG-------------------GTTGCGGGTTCGATTCCTGTCGCTCCTGCCA
D00011445 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Trp CCA -AGGAGTGTAGCTCAATT-GGT--AGAGTGCCGGTCTCCAAAACCGGAG-------------------GTTGCGGGTTCGATTCCTGTCGCTCCTGCCA
D00011337 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Trp CCA -AGGGGCGTAGTTCAATT-GGT--AGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGT-------------------GTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCA
D00011420 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Trp CCA -AGGGGCGTAGTTCAATT-GGT--AGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGT-------------------GTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCA
D00011332 Salmonella_typhimurium_LT2 Trp CCA -AGGGGCGTAGTTCAATT-GGT--AGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGT-------------------GTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCA
D00011392 Shewanella_oneidensis_MR-1 Trp CCA -AGGGGTGTAGTTCCAATTGGT--AGAACAGCGGTCTCCAAAACCGATG-------------------GTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCACCCCTGCCA
D00011393 Shigella_flexneri_2a_str._301 Trp CCA -AGGGGCGTAGTTCAATT-GGT--AGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGT-------------------GTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTG---
D00011338 Sinorhizobium_meliloti_1021 Trp CCA -AGGGGTATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCGGCGGTCTCCAAAACCGCAG-------------------GTCGGGGGTTCGAGCCCCTCTGCCCCTGCCA
D00003282 Spiroplasma_citri Trp CCA -AGGGGTGTAGTTTAAT--GGT--AGAACAGCGGTCTCCAACACCGTAC-------------------GTTGTGGGTTCAAGTCCTGTCACCCCTGCCA
D00003286 Staphylococcus_aureus Trp CCA -AGGGGCATAGTTCAAC--GGT--AGAATAGAGGTCTCCAAAACCTTTG-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCCTGCCA
D00011437 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Trp CCA -AGGGGCATAGTTCAAC--GGT--AGAATAGAGGTCTCCAAAACCTTTG-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCCTGCCA
D00011375 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Trp CCA -AGGGGCATAGTTCAAC--GGT--AGAATAGAGGTCTCCAAAACCTTTG-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCCTGCCA
D00011296 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Trp CCA -AGGGGCATAGTTCAAC--GGT--AGAATAGAGGTCTCCAAAACCTTTG-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCCTGCCA
D00011406 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Trp CCA -AGGGGCATAGTTCAAC--GGT--AGAATAGAGGTCTCCAAAACCTTTG-------------------A-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCCTGCCA
D00011394 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Trp CCA -ACGGGCATAGTTTAAA--GGT--AGAACTAAGGTCTCCAAAATCTTCA-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCGTG---
D00011395 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Trp CCA -ACGGGCATAGTTTAAA--GGT--AGAACTAAGGTCTCCAAAACCTTCA-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCGTG---
D00011376 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Trp CCA -ACGGGCATAGTTTAAA--GGT--AGAACTAAGGTCTCCAAAACCTTCA-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCGTG---
D00011396 Streptococcus_mutans_UA159 Trp CCA -ACGGGCATAGTTTAAA--GGT--AGAACTAAGGTCTCCAAAACCTTCA-------------------G-TGTGGGTTCAATTCCTACTGCCCGTG---
D00011326 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Trp CCA -ACGGGCATAGTTTAAA--GGT--AGAACTAAGGTCTCCAAAACCTTCA-------------------G-TGTGGGTTCAATTCCTACTGCCCGTG---
D00011325 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Trp CCA -ACGGGCATAGTTTAAA--GGT--AGAACTAAGGTCTCCAAAACCTTCA-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCGTG---
D00011377 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Trp CCA -ACGGGCATAGTTTAAA--GGT--AGAACTAAGGTCTCCAAAACCTTCA-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCGTG---
D00011412 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Trp CCA -ACGGGCATAGTTTAAA--GGT--AGAACTAAGGTCTCCAAAACCTTCA-------------------G-TGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCGTG---
D00011419 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Trp CCA -AGGGTCGTAGCTCAATT-GGT--AGAGCACTGGTCTCCAAAACCAGCG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCCTCCGGCCCTG---
D00011391 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Trp CCA -AGGGTCGTAGCTCAATT-GGT--AGAGCACTGGTCTCCAAAACCAGCG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCCTCCGGCCCTG---
D00003285 Streptomyces_griseus Trp CCA -AGGGTCGTAGCTCAATT-GGT--AGAGCACTGGTCTCCAAAACCAGCG-------------------GTTGGGGGTTCAAGTCCCTCCGGCCCTG---
D00011446 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Trp CCA -AGGGGCATAGCTCAATT-GGT--AGAGCAACGGTCTCCAAAACCGTAG-------------------GTTGTGGGTTCGAGTCCTACTGCCCCTGCCA
D00011447 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Trp CCA -AGGGGCGTAGCTCAACT-GGT--AGAGCAACGGTCTCCAAAACCGTAG-------------------GTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGCCCCTGCCA
D00003292 Synechocystis_sp. Trp CCA -GCGTCCTTAGTTCAGTT-GGT--AGAACGCAGGTCTCCAAAACCTGAT-------------------GTCGGGGGTTCAAGTCCTCCAGGGCGCG---
D00011315 Synechocystis_sp._PCC_6803 Trp CCA -GCGTCCTTAGTTCAGTT-GGT--AGAACGCAGGTCTCCAAAACCTGAT-------------------GTCGGGGGTTCAAGTCCTCCAGGGCGCG---
D00011380 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Trp CCA -AGGGGAGTAGCTCAACT-GGT--AGAGCAACGGTCTCCAAAACCGTGG-------------------GCTGCGGGTTCAAGTCCTGTCTCCCCTGCCA
D00011378 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Trp CCA -GCGTCCTTAGTTCAGTT-GGT--AGAACGTCGGTCTCCAAAACCGGAT-------------------GTCGGGGGTTCGAGTCCTCCAGGGCGCG---
D00003273 Thermotoga_maritima Trp CCA -AGGGCCGTAGCTCAACT-GGT--AGAGCGCCGGTCTCCAAAACCGGTG-------------------GTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGCCCTACCA
D00011316 Thermotoga_maritima_MSB8 Trp CCA -AGGGCCGTAGCTCAACT-GGT--AGAGCGCCGGTCTCCAAAACCGGTG-------------------GTTGCGGGTTCGAGTCCTGCCGGCCCTGCCA
D00011457 Thermus_thermophilus_HB27 Trp CCA --GGCCGTTAGCTCAACT-GGC--AGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGG-------------------GTTGGAGGTTCGAGTCCTTCACGGCCCGCCA
D00011458 Treponema_denticola_ATCC_35405 Trp CCA -AGGTCAGTAGCTCCAAT-GGT--AGAGCGTCGGTCTCCAAAACCGAAT-------------------GTTGAGGGTTCGAGTCCTTCCTGGCCTG---
D00003283 Treponema_pallidum Trp CCA -GGGTCAGTAGCTCTAAT-GGC--AGAGCGTCGGTCTCCAAAACCGAAT-------------------GTTGAAGGTTCGAGTCCTTCCTGGCCTG---
D00011313 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Trp CCA -GGGTCAGTAGCTCTAAT-GGC--AGAGCGTCGGTCTCCAAAACCGAAT-------------------GTTGAAGGTTCGAGTCCTTCCTGGCCTG---
D00011407 Tropheryma_whipplei_str._Twist Trp CCA -AGGGCGGTGGCTCAATT-GGT--AGAGCAGCGGTCTCCAAAACCGCAG-------------------GTTGCAGGTTCAAGTCCTGTCCGCCCTG---
D00011408 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Trp CCA -AGGGCGGTGGCTCAATT-GGT--AGAGCAGCGGTCTCCAAAACCGCAG-------------------GTTGCAGGTTCAAGTCCTGTCCGCCCTG---
D00011298 Ureaplasma_parvum_serovar_3 Trp CCA -AAGGGTATAGTTCAATT-GGT--AGAACAGCAGACTCCAAATCTGCGT-------------------GTTGCGGGTTCGAGTCCTGTTACCCTTGCCA
D00011295 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Trp CCA -AGGGGTGTAGCTCCAATTGGC--AGAGCAGCGGATTCCAAATCCGCGT-------------------GTTGGGAGTTCGAATCTCTCCACCCCTGCCA
D00011459 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Trp CCA -AGGAGTGTAGCTCAATT-GGT--AGAGCGCTGGTCTCCAAAACCAGAG-------------------GTTGTAGGTTCAATTCCTATCGCTCCTG---
D00011382 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Trp CCA -ACGCCAGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCAGCGGTCTCCAAAACCGCAG-------------------GTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCTGGCGTGCCA
D00011381 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Trp CCA -ACGCCAGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCAGCGGTCTCCAAAACCGCAG-------------------GTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCTGGCGTGCCA
D00011317 Xylella_fastidiosa_9a5c Trp CCA -GCGTCAGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCAGCGGTCTCCAAAACCGCAG-------------------GTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCTGGCGCGCCA
D00011318 Xylella_fastidiosa_9a5c Trp CCA -AGGGGCGTAGTTCAATT-GGT--AGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGT-------------------GTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCA
D00011409 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Trp CCA -GCGTCAGTAGCTCAATT-GGC--AGAGCAGCGGTCTCCAAAACCGCAG-------------------GTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCTGGCGCGCCA
D00011448 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Trp CCA -AGGGGCGTAGTTCAATT-GGT--AGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGT-------------------GTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCA
D00011331 Yersinia_pestis_CO92 Trp CCA -AGGGGCGTAGTTCAATT-GGT--AGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGT-------------------GTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCA
D00011384 Yersinia_pestis_KIM Trp CCA -AGGGGCGTAGTTCAATT-GGT--AGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGT-------------------GTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCA
D00011449 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Trp CCA -AGGGGCGTAGTTCAATT-GGT--AGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGT-------------------GTTGGGAGTTCGAGTCTCTCCGCCCCTGCCA
D00003408 Arabidopsis_thaliana Trp CCA -GGATCCGTGGCGCAAT--GGT--AGCGCGTCTGACTCCAGATCAGAAG-------------------GTTGCGTGTTCGATTCACGTCGGGTTCACCA
D00003409 Arabidopsis_thaliana Trp CCA -GGATTCGTGGCGCAAT--GGT--AGCGCGTCTGACTCCAGATCAGAAG-------------------GTTGCGTGTTCGATTCACGTCGGGTTCACCA
D00011357 Arabidopsis_thaliana Trp CCA -GCGCTCTTAGTTCAGTTCGGT--AGAACGTGGGTCTCCAAAACCCAAT-------------------GTCGTAGGTTCAAATCCTACAGAGCGTG---
D00011358 Arabidopsis_thaliana Trp CCA -GGATTCGTGGCGCAAT--GGT--AGCGCGTCTGACTCCAGATCAGAAG-------------------GTTGCGTGTTCGATTCACGTCGGGTTC----
D00011359 Arabidopsis_thaliana Trp CCA -GGATCCGTGGCGCAAT--GGT--AGCGCGTCTGACTCCAGATCAGAAG-------------------GTTGCGTGTTCGATTCACGTCGGGTTC----
D00003410 Caenorhabditis_elegans Trp CCA -GACTGCTTGGCGCAAT--GGT--AGCGCGTTCGACTCCAGATCGAAAG-------------------GTTGGGCGTTCGATCCGCTCAGTGGTCA---
D00011360 Caenorhabditis_elegans Trp CCA -GACTGCTTGGCGCAAT--GAT--AGCGCGTTCGACTCCAGATCGAAAG-------------------GTTGGGCGTTCGATCCGCTCAGTGGTCA---
D00011361 Caenorhabditis_elegans Trp CCA -GACTGCTTGGCGCAAT--GGT--AGCGCGTTCGACTCCAGATCGAAAG-------------------ATTGGGCGTTCGATCCGCTCAGTGGTCA---
D00011362 Caenorhabditis_elegans Trp CCA -GACTGCTTGGCGCAAT--GGT--AGCGCGTTCGACTCCAGATCGAAAG-------------------GTTGGGCGTTCGATCCGCTCAGTGGTCA---
D00011363 Caenorhabditis_elegans Trp CCA -GGTTGTTTGGCCGAGC--GGTCTAAGGCGCCTGATTCCAGCTCACGTATC------GTAA-----GATGCAAGAGTTCGAATCTCTTAGCAACCA---
D00011450 Candida_glabrata_CBS_138 Trp CCA -GAAGCGGTGGCTCAAT--GGT--AGAGCTTTCGACTCCAAATCGAAGG-------------------GTTGCAGGTTCAATTCCTGTCCGTTTCA---
D00003402 Dictyostelium_discoideum Trp CCA -GACTCCTTAGCATAGT--GGTTTATTGTAATTGTCTCCAAAGCAGTTG-------------------GTCCAGGGTTCAACTCCCTGAGGGGTCT---
D00011365 Drosophila_melanogaster Trp CCA -GACTCCGTGGCGCAAC--GGT--AGCGCGTCTGACTCCAGATCAGAAG--------G----------TTGCGGTGTTCAAATCACGTCGGGGTC----
D00011366 Drosophila_melanogaster Trp CCA -GACTCCGTGGCGCAAC--GGT--AGCGCGTCTGACTCCAGATCAGAAG-------------------GTTGCGTGTTCAAATCACGTCGGGGTC----
D00011367 Drosophila_melanogaster Trp CCA -GACTCCGTGGCGCAAC--GGT--AGCGCGTCCGACTCCAGATCGGAAG-------------------GTTGCGTGTTCAAATCACGTCGGGGTC----
D00011383 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Trp CCA -GACGGTGTGGCGCAAC--GGT--AGCGCGTCGGATTCCAGTCCCGAAG-------------------GTTCTAGGTTCAAATCCTGGCTCCGTCA---
D00003411 Gallus_gallus Trp CCA -GACCTCGTGGCGCAAC--GGT--AGCGCGTCTGACTCCAGATCAGAAG-------------------GCTGCGTGTTCGAATCACGTCGGGGTCA---
D00011467 Gallus_gallus Trp CCA -GACCTCGTGGCGCAAC--GGT--AGCGCGTCTGACTCCAGATCAGAAG-------------------GCTGCGTGTTCGAATCACGTCGGGGTCA---
D00011468 Gallus_gallus Trp CCA -GACCTCGTGGCGCAAG--GGT--AGCGCGTCTGACTCCAGATCAGAAG-------------------GTTATGTGTTCAAATCACATCGGGGTCA---
D00011469 Gallus_gallus Trp CCA -GACCTCGTGGCGCAAT--GGT--AGCGCGTCTGACTCCAGATCAGAAG-------------------GCTGTGTGTTCAAATCACACCGGGGTCA---
D00011351 Homo_sapiens Trp CCA -GACCTCGTGGCGCAAC--GGC--AGCGCGTCTGACTCCAGATCAGAAG-------------------GTTGCGTGTTCAAATCACGTCGGGGTC----
D00011352 Homo_sapiens Trp CCA -GACCTCGTGGCGCAAC--GGT--AGCGCGTCTGACTCCAGATCAGAAG-------------------GCTGCGTGTTCGAATCACGTCGGGGTCA---
D00011353 Homo_sapiens Trp CCA -GACCTCGTGGCGCAAC--GGT--AGCGCGTCTGACTCCAGATCAGAAG-------------------GTTGCGTGTTCAAATCACGTCGGGGTCA---
D00011354 Homo_sapiens Trp CCA -GACCTCGTGGCGCAAT--GGT--AGCGCGTCTGACTCCAGATCAGAAG-------------------GTTGCGTGTTCAAGTCACGTCGGGGTCA---
D00011355 Homo_sapiens Trp CCA -GGAAGGATGGCCAAGCT-GGA--AAGCCTGTGGGCTCCACAGTCATGT-------------------G-CCTGGGTTCAATTCCCAGTTCTGCA----
D00011356 Homo_sapiens Trp CCA -GGCAGAGGGGTGCAGTT-GGC--AGCCTGTCCAAGTCCAGATGGGATG-------------------GTCCTGGGTTCAAACCCCAGCTGCGCC----
D00003401 Leishmania_tarentolae Trp CCA -GGGGGCTTAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTGGATTCCAAATCCAGGG-------------------GTCGTAGGTTCAATCCCTGCAGCTCTCA---
D00011479 Pan_troglodytes Trp CCA -GACCTCGTGGCGCAAC--GGT--AGCGCGTCTGACTCCAGATCAGAAG-------------------GCTGCGTGTTCGAATCACGTCGGGGTCA---
D00011480 Pan_troglodytes Trp CCA -GACCTCGTGGCGCAAC--GGT--AGCGCGTCTGACTCCAGATCAGAAG-------------------GTTGCGTGTTCAAATCACGTCGGGGTCA---
D00011481 Pan_troglodytes Trp CCA -GACCTCGTGGCGCAAT--GGT--AGCGCGTCTGACTCCAGATCAGAAG-------------------GTTGCGTGTTCAAGTCACGTCGGGGTCA---
D00011482 Pan_troglodytes Trp CCA -GGCCTCGTGGCGCAAC--GGT--AGCGCGTCTGACTCCAGATCAGAAG-------------------GTTGCGTGTTCAAATCACGTCGGGGTCA---
D00003400 Plasmodium_falciparum Trp CCA -ATGTCTTTAATTTAAA--GTA--AAAATATAAATTTCCAAAATTTATA-------------------A-TAAAGGTTCGAATCCTTTAGGACAT----
D00011464 Plasmodium_falciparum_3D7 Trp CCA -AGGGGTATAGCTCAATT-GGC--AGAGCGTCGGTCTCCAAAACCGAAG-------------------GTTGTAGGTTCGATTCCTACTGCCCCTG---
D00003403 Saccharomyces_cerevisiae Trp CCA -GAAGCGGTGGCTCAAT--GGT--AGAGCTTTCGACTCCAAATCGAAGG-------------------GTTGCAGGTTCAATTCCTGTCCGTTTCA---
D00003404 Saccharomyces_cerevisiae Trp CCA TGAAGCGGTGGCTCAAT--GGT--AGACGTTTCGACTCCAATTCGAAGG-------------------GTTGCAGGTTCAATTCCTGTCCGTTTCA---
D00011364 Saccharomyces_cerevisiae Trp CCA -GAAGCGGTGGCTCAAT--GGT--AGAGCTTTCGACTCCAAATCGAAGG-------------------GTTGCAGGTTCAATTCCTGTCCGTTTCA---
D00003405 Schizosaccharomyces_pombe Trp CCA -GGCCCCTTAACTCAGTT-GGT--AGAGTGTGAGATTCCAAATCTCAAA-------------------GTCAAGTGTTCAAGTCACTTAGGGGTCA---
D00011368 Schizosaccharomyces_pombe Trp CCA -GGCCCCTTAACTCAGTT-GGT--AGAGTGTGAGATTCCAAATCTCAAA-------------------GTCAAGTGTTCAAGTCACTTAGGGGTCA---
D00011470 Takifugu_rubripes Trp CCA -GGCCTTGTGGTGCAAT--GGG--ATCACATCTGACCCCAGATCGGATG-------------------TTTGTGCGTTCAACTCACGTCAAGGGCT---
D00011471 Takifugu_rubripes Trp CCA -GGCTCTGTGGGGCAAG--GGT--AGCACAGCTGACTCCAGATCAGCAG-------------------GTTCTGTGTTCAATTCACACCAGAGTCA---
D00011472 Takifugu_rubripes Trp CCA -GACCTCGTGGCGCAAC--GGT--AGCGCATCTGACTCCAGATCAGAAG-------------------GCTGCGTGTTCAAATCACGTCGGGGTCA---
D00011473 Takifugu_rubripes Trp CCA -GACCTTGTGGCGCAAC--GGT--AGCGCATCTGACTCCAGATCAGAAG-------------------GTTGCGTGTTCAAATCACGTCGGGGTCA---
D00011474 Takifugu_rubripes Trp CCA -GACCTTGTGGCGCAAT--GGT--AGCGCGTCTGACTCCAGATCAGAAG-------------------GTTGCGTGTTCAAATCACGTCGGGGCCA---
D00011475 Takifugu_rubripes Trp CCA -GACCTCGTGGCGCAAC--GGT--AGCGCGTCTGACTCCAGATCAGAAG-------------------GTTGCGTGTTCAAATCACGTCGGGGTCA---
D00011476 Takifugu_rubripes Trp CCA -GACCTTGTGGCGCAAT--GGT--AGCGCGTCTGACTCCAGATCAGAAG-------------------GTTGCGTGTTCAAATCACGTCAGGGTCA---
D00011477 Takifugu_rubripes Trp CCA -GACCTCGTGGCGCAAT--GGT--AGCGCGTCTGACTCCAGATCAGAAG-------------------GTTGCGTGTTCAAATCACGTCGAGGTCA---
D00011478 Takifugu_rubripes Trp CCA -GGTAGCGTGGCCGAGC--GGTCCAAGCGTGTAGGCTCCAGCTCTTCGG--------G----------GGCGTGGGTTCGAATCCCACCGCTGCCA---
D00003406 Toxoplasma_gondii Trp CCA -ACGTTTTTAGTTTAAT--GGT--AGAATAAAGGTCTCCAAAATCTAAG-------------------G-TGAAAGTTCAACTCTTTCAAAACGTG---
D00003274 Mycoplasma_capricolum Trp TCA -AGGGGCATAGTTCAGTA-GGT--AGAACATCGGTCTTCAAAACCGAGT-------------------GTCACGAGTTCGAGTCTTGTTGCCCCTGCCA
D00003277 Mycoplasma_genitalium Trp TCA -AGGGGTATAGTTCAAA--GGT--AGAACATCTGTCTTCAAAATAGAGT-------------------GTTGTGGGTTCGAGTCCTGCTACCCCTGCCA
D00003279 Mycoplasma_pneumoniae Trp TCA -AGGGGTATAGTTCAAA--GGT--AGAACATCTGTCTTCAAAATAGAGT-------------------GTTGTGGGTTCGAGTCCTGCTACCCCTGCCA
D00003281 Spiroplasma_citri Trp TCA -AGGGGTATAGTTCAATC-GGT--AGAACACCGGACTTCAAATCCGGGT-------------------GTTGTGGGTTCAAGTCCTGCTACCCCTGCCA
D00003672 Methanocaldococcus_jannaschii Sec TCA -GGCGCG_TACCGGGCTT-GGTAGCCCGGGGCGGACTTCAGATCCGTCGAGGGC---GAG---AGCCTC-C-GGGGTTCGATTCCCC-_TGCGCCG---
D00011825 Methanococcus_maripaludis Sec TCA -CACGGGGT_TATCTT---GGT--AGATGGGCGGACTTCAGATCCGTCGTCC-----GTT-----GGAATTCGGGGTTCGATTCCC_CCTGCG------
D00011830 Methanopyrus_kandleri_AV19 Sec TCA -GCCGCCGC_CCGGGGT--GGTC-CCCGGGCCGGACTTCAGATCCGGCGCGCCC---CGA---GTGGGGCGCGGGGTTCAATTCCCCGCGGCGGCC---
D00011820 Aquifex_aeolicus_VF5 Sec TCA GGAAGATCGTCGTCTCC--GGTG-AGGCGGCTGGACTTCAAATCCAGTTGGGGCCG-CCAGCGGTCCCG-GGCAGGTTCGACTCCTGTGATCTTC----
D00011814 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Sec TCA -GGAAGATTAGCGTATCT-GGTG-ATCGCCACTGACTTCAAATCAGATAAGGATAG-TTGACTATTCTTTGGGGAGTTCGATTCTCTCATCTTCTCGC-
D00003674 Desulfomicrobium_baculatum Sec TCA -GGAA_GTATCGTCACC--GGTG-TGGCGCCCGGTCTTCAAAACCGGTGGAAGGTC-GAG-AGGTCTTC-GGTAGGTTCGACTCCTATAC_TTCCGCCA
D00011839 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Sec TCA -GGAAGCG_TTCTATCC--GGTG-ATAGGCCCGGTCTTCAAAACCGGTGGTAGGT--CGAG-AGGTCTACGGTAGGTTCGACTCCTA_CGCTTCC----
D00003675 Escherichia_coli Sec TCA -_AAGATCGTCGTCTCC--GGTG-AGGCGGCTGGACTTCAAATCCAGTTGGGGCCG-C_G-CGGTCCCG-GGCAGGTTCGACTCCTGTGATCTT_GCCA
D00011833 Escherichia_coli_CFT073 Sec TCA -GGAAGATCGTCGTCTCC-GGTG-AGGCGGCTGGACTTCAAATCCAGTTGGGGCCG-CCAGCGGTCCCG-GGCAGGTTCGACTCCTGTGATCTTCC---
D00011810 Escherichia_coli_K12 Sec TCA GGAAGATCGTCGTCTCC--GGTG-AGGCGGCTGGACTTCAAATCCAGTTGGGGCCG-CCAGCGGTCCCG-GGCAGGTTCGACTCCTGTGATCTTC----
D00011811 Escherichia_coli_O157:H7 Sec TCA GGAAGATCGTCGTCTCC--GGTG-AGGCGGCTGGACTTCAAATCCAGTTGGGGCCG-CCAGCGGTCCCG-GGCAGGTTCGACTCCTGTGATCTTC----
D00011812 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Sec TCA GGAAGATCGTCGTCTCC--GGTG-AGGCGGCTGGACTTCAAATCCAGTTGGGGCCG-CCAGCGGTCCCG-GGCAGGTTCGACTCCTGTGATCTTC----
D00011836 Geobacter_sulfurreducens_PCA Sec TCA -GGAGGTAC_CGGTCGCT-GGTG-GGCCGCCCGGTCTTCAAAACCGGTGTGGGGGTTGAGAAAACTCCCAGGTGGGTTCGATTCCCA_TACCTCC----
D00003676 Haemophilus_influenzae Sec TCA -GGAGGGGCGTCATCTCC-GGTG-AGGTGGCAGGATTTCAAATCCTGTTGAGGACG-CCAGCGTTCTTG-GGTGGGTTCAACTCCCATTCCCCTCC---
D00011813 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Sec TCA GGAGGGGCGTCATCTCC--GGTG-AGGTGGCAGGATTTCAAATCCTGTTGAGGACG-CCAGCGTTCTTG-GGTGGGTTCAACTCCCATTCCCCTCC---
D00011840 Mesoplasma_florum_L1 Sec TCA -AGGGGCATAGTTCAGTT-GGC--AGAACATCGGTCTTCAAAACCGAGT-------------------GTCGCGAGTTCGAGTCTTGCTGCCCCTGCCA
D00003673 Moorella_thermoacetica Sec TCA -GGGG_GGATCGGGCCT--GGTG-GCTTGCCTGGACTTCAAATCCAGT_CGCGCC--_AAC-_GGGCGC-GGTGGGTTCGATTCCCACA_CTCCCGCCA
D00011815 Mycoplasma_genitalium_G37 Sec TCA -AGGGGTATAGTTCAAA--GGT--AGAACATCTGTCTTCAAAATAGAGT-------------------GTTGTGGGTTCGAGTCCTGCTACCCCTGCCA
D00011816 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Sec TCA -AGGGGTATAGTTCAAA--GGT--AGAACATCTGTCTTCAAAATAGAGT-------------------GTTGTGGGTTCGAGTCCTGCTACCCCTGCCA
D00011823 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Sec TCA -AGGAGTATAGTTCAAT--GGT--AGAACAACGGGCTTCAACCCCGTGT-------------------GTTATGGGTTCGAGTCCTGTTACTCCTGCCA
D00011817 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Sec TCA GGAGGAGCGTCGTTTCC--GGTG-AAGCGGCAGGACTTCAAATCCTGTTGAGGTTG-CCAGCAATCTCG-GGTGGGTTCGACTCCCATTCTCCTC----
D00011835 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Sec TCA -GGAAGATC_CGTCCCC--GGTG-GGGCGGCTGGACTTCAAATCCAGATGGGGCCG-CCA-GCGGTCTT-GGCAGGTTCGACTCCTG_ATCTTCCGCCA
D00011818 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Sec TCA GGAAGGCAATCACGCCC--GGTG-GCGTGGCCGGACTTCAAATCCGGTGGGGGCGG-CAG-CCGTTCCTGGGTGGGTTCGACTCCCACTGCCTTC----
D00011824 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Sec TCA -GGAAGATC_CGTCTCC--GGTG-AGGCGGCTGGACTTCAAATCCAGTTGGGGCCG-CCAGCGGTCCCG-GGCAGGTTCGACTCCT_GATCTTC-----
D00011834 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Sec TCA -GGAAGATCGTCGTCTCC-GGTG-AGGCGGCTGGACTTCAAATCCAGTTGGGGCCG-CCAGCGGTCCCG-GGCAGGTTCGACTCCTGTGATCTTCC---
D00011822 Salmonella_typhimurium_LT2 Sec TCA -GAAGATCGTCGTCTCC--GGTG-AGGCGGCTGGACTTCAAATCCAGTTGGGGCCG-CCAGCGGTCCCG-GGCAGGTTCGACTCCTGTGATCTTC----
D00011831 Shewanella_oneidensis_MR-1 Sec TCA -GGAAGAAC_CGTCTCC--GGTG-AGGCGTCCGGATTTCAAATCCGGGTAGGGCTG-CCAGCAGTCCTG-GGTAGGTTCGACTCCT_GTTCTTCCGCCA
D00011832 Shigella_flexneri_2a_str._301 Sec TCA -GGAAGATC_CGTCTCC--GGTG-AGGCGGCTGGACTTCAAATCCAGTTGGGGCCG-CCAGCGGTCCCG-GGCAGGTTCGACTCCT_GATCTTCCGCCA
D00011837 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Sec TCA -GGGAGTAG_CGGGTCCT-GGTG-GCCCGCACGGTCTTCAAAACCGCTTGAGCCGTAGTGATCCTGCGGC_GTGGGTTCGATTCCCA_TACTCCCGC--
D00011809 Ureaplasma_parvum_serovar_3 Sec TCA -AGGGGTATAGTTCAAT--GGT--AGAACTGCGGACTTCAAATCCGCGT-------------------GTTGTGGGTTCGAGTCCTGCTACCCCTGCCA
D00011819 Xylella_fastidiosa_9a5c Sec TCA GGAAGATCGTCGTCTCC--GGTG-AGGCGGCTGGACTTCAAATCCAGTTGGGGCCG-CCAGCGGTCCCG-GGCAGGTTCGACTCCTGTGATCTTC----
D00011838 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Sec TCA -GGAAGATC_CGTCCCC--GGTG-GGGCGGCTGGACTTCAAATCCAGATGGGGCCG-CCAGCGGTCCCT-GGCAGGTTCGACTCCTG_ATCTTCC----
D00011821 Yersinia_pestis_CO92 Sec TCA -GGAAGATC_CGTCCCC--GGTG-GGGCGGCTGGACTTCAAATCCAGATGGGGCCG-CCAGCGGTCCCT-GGCAGGTTCGACTCCT_GATCTTC-----
D00011829 Yersinia_pestis_KIM Sec TCA -GGAAGATC_CGTCCCC--GGTG-GGGCGGCTGGACTTCAAATCCAGATGGGGCCG-CCAGCGGTCCCT-GGCAGGTTCGACTCCT_GATCTTCC----
D00003679 Bos_taurus Sec TCA -GCCCGGAT_CCTCAGT--GGTC-TGGGGTGCAGGCTTCAAACCTGTAGCTGT----CTA----GCGACAGAGTGGTTCAATTCCA_TTTCGGGCG---
D00003677 Caenorhabditis_elegans Sec TCA -GCCCGGAT_CCATGGC--GGTC-TGTGGTGCAGACTTCAAATCTGTAGGCGG----TTA----GCGCCGCAGTGGTTCGACTCCA_TTTCGGGTG---
D00011828 Caenorhabditis_elegans Sec TCA -GCCCGGAT_CCATGGC--GGTC-TGTGGTGCAGACTTCAAATCTGTAGGCGG----TTA----GCGCCGCAGTGGTTCGACTCCA_TTTCGGGT----
D00003678 Drosophila_melanogaster Sec TCA -GCCCCACT_CTTCGGT--GGTC-CGGGGTGCGGACTTCAAATCCGTAGTCGA----TTT----GCGTCGAAGTGGTTCGATTCCA_TGGGGGGCG---
D00003681 Gallus_gallus Sec TCA -GCCCGGAT_CCTCAGT--GGTC-TGGGGTGCAGGCTTCAAACCTGTAGCTGT----CTA----GCGACAGAGTGGTTCAATTCCA_TTTCGGGCG---
D00011841 Gallus_gallus Sec TCA -GCCCGGAT_CCCTCAGT-GGTC-TGGGGTGCAGGCTTCAAACCTGTAGCTGT----CTA----GCGACAGAGTGGTTCAATTCCAC_TTCGGGC----
D00011826 Homo_sapiens Sec TCA -GCCCGGAT_CCTCAGT--GGTC-TGGGGTGCAGGCTTCAAACCTGTAGCTGT----CTA----GCGACAGAGTGGTTCAATTCCA_TTTCGGG-----
D00011827 Homo_sapiens Sec TCA -GCTCGGAT_CCTCAGT--GGTC-TGGGGTGCAGGCTTCAAACCTGTAGCTGT----CTA----GTGACAGAGTGGTTCAATTCCA_TTTGTAG-----
D00011842 Pan_troglodytes Sec TCA -TAGAACGTGGTGTGGTA-GGT--CACATGGAGAATTTCAGATTCTCAG-------------------G-GATAGGTTCAATTCCTATAGTTCTAG---
D00011843 Pan_troglodytes Sec TCA -GACCGTGTGGCCTTAAT-GGAT-AAGGTGTCTGACTTCAGATCAGAAG-------------------ATTGAGGGTTTGAGTCCCTTTGTGGTCA---
D00011844 Pan_troglodytes Sec TCA -GCCCGGAT_TCCTCAGT-GGTC-TGGGGTGCAGGCTTCAAACCTGTAGCTGT----CTA----GCGACAGAGTGGTTCAATTCCAC_TTCGGGC----
D00003680 Xenopus_laevis Sec TCA -GCCCGGAT_CCTCAGT--GGTC-TGGGGTGCAGGCTTCAAACCTGTAGCTGT----CTA----GCGACAGAGTGGTTCAATTCCA_TTTCGGGCG---
D00004198 Aeropyrum_pernix_K1 Cys GCA -GCCGGGGTGGCCGAGC--GGTCTAAGGCGGCGGGCTGCAGACCCGTTA--------G----------TTCCCGGGTTCGAATCCCGGCCCCGGCTCC-
D00000244 Archaeoglobus_fulgidus Cys GCA -GCCAGGGTGGCAGAGG--GGCT-A-TGCGGCGGACTGCAGATCCGCTT-------------------TACCCCGGTTCGAATCCGGGCCCTGGCT---
D00004199 Archaeoglobus_fulgidus_DSM_4304 Cys GCA -GCCAGGGTGGCAGAGG--GGCT-A-TGCGGCGGACTGCAGATCCGCTT-------------------TACCCCGGTTCGAATCCGGGCCCTGGCT---
D00000245 Halobacterium_salinarum Cys GCA -GCCAAGGTGGCAGAGTTCGGCCTAACGCGGCGGCCTGCAGAGCCGCTC-------------------ATCGCCGGTTCAAATCCGGCCCTTGGCT---
D00004200 Halobacterium_sp._NRC-1 Cys GCA -GCCAAGGTGGCAGAGTTCGGCCTAACGCGGCGGCCTGCAGAGCCGCTC-------------------ATCGCCGGTTCAAATCCGGCCCTTGGCT---
D00000246 Haloferax_volcanii Cys GCA -GCCAAGGTGGCAGAGTTCGGCCCAACGCATCCGCCTGCAGAGCGGAAC-------------------C_CGCCGGTTCAAATCCGGCCCTTGGCTCCA
D00000247 Methanocaldococcus_jannaschii Cys GCA -GCCGGGGTAGTCTAGG--GGC--TAGGCAGCGGACTGCAGATCCGCCT-------------------TACGTGGGTTCAAATCCCACCCCCGGCT---
D00004202 Methanocaldococcus_jannaschii_DSM_2661 Cys GCA -GCCGGGGTAGTCTAGG--GGC--TAGGCAGCGGACTGCAGATCCGCCT-------------------TACGTGGGTTCAAATCCCACCCCCGGCTCC-
D00011854 Methanococcus_aeolicus_Nankai-3 Cys GCA -GCCAAGGTAGTCTAGTCCGGC--GAGGCAGCGGACTGCAGATCCGCTT-------------------CAGAAGGGTTCAAATCCCTTCCTTGGCT---
D00004203 Methanococcus_maripaludis Cys GCA -GCCAAGGTAGTCTAGTCCGGC--GAGGCAGCGGACTGCAGATCCGCTT-------------------CAGAGGGGTTCAAATCCCTTCCTTGGC----
D00004272 Methanopyrus_kandleri_AV19 Cys GCA -GCCGCGGCAGCCTAGCCTGGC--TGGGCGCGGGACTGCAGCTCCCGTT-------------------A-CCCGGGTTCAAATCCCGGCCGCGGCTCCA
D00011900 Methanosarcina_acetivorans_C2A Cys GCA -GCCAAGATGGCGGAGC--GGC--TACGCAATCGCCTGCAGAGCGATTC-------------------CATTCCGGTTCGAATCCGGATCTTGGCT---
D00011901 Methanosarcina_acetivorans_C2A Cys GCA -GCCAAGATGGCGGAGC--GGC--TACGCAATCGCCTGCAGAGCGATTT-------------------CATTCCAGTTCGAATCTGGATCTTGGCT---
D00011913 Methanosarcina_acetivorans_C2A Cys GCA -GTCAGAATGGCAGAGT--GGC--TATGCTTCCGGCTGCAACCCGGAAT-------------------TACGTGAGTTCGATTCTCACTTCTGACT---
D00004256 Methanosarcina_mazei_Go1 Cys GCA -GCCAAGGTGGCGGAGC--GGT--CACGCAATCGCCAGCAGAGCGATTC-------------------AGTCCTGGTTCAAATCCGGACCTTGGCT---
D00004257 Methanosarcina_mazei_Go1 Cys GCA -GCCAAGATGGCGGAGC--GGC--TACGCAATCGCCTGCAGAGCGATAC-------------------CATTCCGGTTCGAATCCGGATCTTGGCT---
D00004258 Methanosarcina_mazei_Go1 Cys GCA -GCCAAGGTGGCGGAGC--GGC--TACGCAATCGCCTGCAGAGCGATAC-------------------CATTCCGGTTCGAATCCGGACCTTGGCT---
D00011943 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Cys GCA -GCCAAGATGGCGGAGC--GGC--CACGCGGCTGACTGCAGATCAGCTA-------------------CACTCCGGTTCAAATCCGGATCTTGGCT---
D00011966 Methanospirillum_hungatei_JF-1 Cys GCA -GCCGGTGTGGCAGAGT--GGCTGAATGCCTTCGCCTGCAAAGCGAATG-------------------TTTGGGGGTTCGATTCCCTCCGCCGGCG---
D00004201 Methanothermobacter_thermautotrophicus_str._Delta_H Cys GCA -GCCAAGGTAGCTTAGT--GGC--GAAGCGGTGGACTGCAGATCCATTA-------------------CACGTGAGTTCAAATCTCACCCTTGGCT---
D00011975 Nanoarchaeum_equitans_Kin4-M Cys GCA -GCCGCCGTGCCCGAGC--GGCCAAAGGGGTCGGGCTGCAGACCCGATG-------------------GTCGGGGGTTCGAATCCCCCCGGCGGCT---
D00004204 Pyrococcus_abyssi_GE5 Cys GCA -GCCGGGATAGCCTAGA--GGC--CAGGCGGGGGACTGCAGATCCCCTC-------------------TACCCGGGTTCAAATCCCGGTCCCGGCTCC-
D00004205 Pyrococcus_furiosus_DSM_3638 Cys GCA -GCCGGGATAGCCTAGA--GGC--CAGGCGGGGGACTGCAGATCCCCTT-------------------TACCCGGGTTCAAATCCCGGTCCCGGCTCC-
D00004206 Pyrococcus_horikoshii_OT3 Cys GCA -GCCGGGATAGCCTAGA--GGC--CAGGCGGGGGACTGCAGATCCCCTT-------------------TACCCGGGTTCAAATCCCGGTCCCGGCTCCA
D00012040 Staphylothermus_marinus_F1 Cys GCA -GCCGGGGTGGCCGAGC--GGTCTAAGGCGGCGGGCTGCAGACCCGCTT--------T----------ACCGCGGGTTCGAATCCCGCCCCCGGCTCCA
D00012084 Sulfolobus_acidocaldarius_DSM_639 Cys GCA -GCCGGGGTGGCCGAGC--GGTCTAAGGCGGCGGGCCGCAGACCCGTTA--------TT---------TTCGCGGGTTCAAATCCCGCCCCCGGCT---
D00004266 Sulfolobus_tokodaii_str._7 Cys GCA -GCCGGGGTGGCCGAGA--GGTT-AAGGCGGCGGGCCGCAGACCCGTTA--------T----------TTCGCGGGTTCAAGTCCCGCCCCCGGCT---
D00004207 Thermoplasma_acidophilum_DSM_1728 Cys GCA -GGATAGGTGGCAGAGA--GGT--CATGCGTGGGACTGCAGATCCCATC-------------------TACTAGGGTTCGAATCCCTACCTATCCT---
D00004208 Thermoplasma_volcanium_GSS1 Cys GCA -GGATAGGTGGCAGAGT--GGT--CATGCGTGGGACTGCAGATCCCATT-------------------TACTAGGGTTCAATTCCCTACCTATCCT---
D00004340 Acinetobacter_sp._ADP1 Cys GCA -GGCGGGGTGGCAGAGT--GGT--CATGCAGCGGACTGCAACTCCGTGT-------------------A-CGCCGGTTCGATTCCGACCTCCGCCTCCA
D00004195 Agrobacterium_tumefaciens_str._C58 Cys GCA --GCCTCGTGGCGGAGT--GGT--GACGCAGAGGACTGCAAATCCTTGT-------------------A-CCCCGGTTCAATTCCGGGCGAGGCCTCCA
D00004178 Aquifex_aeolicus_VF5 Cys GCA -GGCGACGTGGCCGAGC--GGT--TAGGCGGGGGACTGCAAATCCCCTT-------------------TACGGCGGTTCGAATCCGCCCGTCGCCTCCA
D00004341 Bacillus_anthracis_str._A2012 Cys GCA -GGCGGCATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTTTA-------------------T-CACCGGTTCAAATCCGGTTGCCGCCT---
D00004310 Bacillus_anthracis_str._Ames Cys GCA -GGCGGCATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTTTA-------------------T-CACCGGTTCAAATCCGGTTGCCGCCT---
D00004320 Bacillus_anthracis_str._Sterne Cys GCA -GGCGGCATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTTTA-------------------T-CACCGGTTCAAATCCGGTTGCCGCCT---
D00004332 Bacillus_cereus_ATCC_10987 Cys GCA -GGCGGCATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTTTA-------------------T-CACCGGTTCAAATCCGGTTGCCGCCT---
D00004298 Bacillus_cereus_ATCC_14579 Cys GCA -GGCGGCATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTTTA-------------------T-CACCGGTTCAAATCCGGTTGCCGCCT---
D00004283 Bacillus_halodurans_C-125 Cys GCA -GGCGGCATAGCCAAGT--GGT--AAGGCACGGGTCTGCAAAACCCTTA-------------------T-CCCCGGTTCGAATCCGGGTGCCGCCT---
D00000257 Bacillus_subtilis Cys GCA -GGCGGCATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTTTA-------------------T-CCCCGGTTCGAATCCGGGTGTCGCCTCCA
D00004149 Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168 Cys GCA -GGCGGCATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTTTA-------------------T-CCCCGGTTCGAATCCGGGTGTCGCCT---
D00004342 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Cys GCA -GGCGGCATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTTTA-------------------T-CACCGGTTCAAATCCGGTTGCCGCCT---
D00004343 Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27 Cys GCA -GGCGATATAGCCAAAT--GGT--AAGGCAAAGGTCTGCAAAACCTTGA-------------------T-CGCCGGTTCAAATCCGGCTATCGCCT---
D00004308 Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482 Cys GCA -GGTTCCTTGGATGAGT--GGCT-TAGTCAGCGGTCTGCAAAACCGTGT-------------------A-CGGCGGTTCGAATCCGCCAGGAACCT---
D00004311 Bartonella_henselae_str._Houston-1 Cys GCA -GGCCTCGTGCGGGAAT--GGT--TACGCAGAGGACTGCAAATCCTTGT-------------------A-TCCCGGTTCGATCCCGGGCGAGGCCTCCA
D00004345 Bartonella_quintana_str._Toulouse Cys GCA -GGCCTCGTGGCGGAAT--GGT--TACGCAGAGGACTGCAAATCCTTGT-------------------A-TCCCGGTTCGATTCCGGGCGAGGCCTCCA
D00004312 Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100 Cys GCA -GGTGATGTGGCCGAGG--GGT--TAGGCTCAGCTCTGCAAAAGCTGCT-------------------A-CAGCGGTTCAAATCCGCTCGTCACCTCCA
D00004273 Bifidobacterium_longum_NCC2705 Cys GCA -GGTGGGTTAGCCAAGC--GGT--TAGGCAGCGGCCTGCAAAGCCGTAT-------------------A-GACGAGTTCGACTCTCGTACCCACCT---
D00004166 Borrelia_burgdorferi_B31 Cys GCA -GGCGCTGTACCCAAGT--GGCT-AAGGGAGAAGTCTGCAAAACTTTGA-------------------TTCGCCGGTTCGATTCCGGTCAGCGCCT---
D00004321 Borrelia_garinii_PBi Cys GCA -GGCGCTGTACCCAAGT--GGCT-AAGGGAGAAGTCTGCAAAACTTTGA-------------------TTCGCCGGTTCGATTCCGGTCAGCGCCT---
D00004284 Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110 Cys GCA -GGCCACGTGGCGGAGT--GGT--TACGCGCCGGTCTGCAAAACCGTTT-------------------A-CTCGGGTTCGAGTCCCGACGTGGCCTCCA
D00004187 Brucella_melitensis_16M Cys GCA -GGCCTCGTGGCGGAGT--GGT--TACGCAGAGGACTGCAAATCCTTGC-------------------A-CCCCGGTTCGATTCCGGGCGAGGCCTCCA
D00004274 Brucella_suis_1330 Cys GCA -GGCCTCGTGGCGGAGT--GGT--TACGCAGAGGACTGCAAATCCTTGC-------------------A-CCCCGGTTCGATTCCGGGCGAGGCCTCCA
D00004150 Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum) Cys GCA -GGCGTGTTGACAGATT--GGA--TATGTAGCGGACTGCAAATCCGTGC-------------------A-ACCCGGTTCGATTCCGGGATACGCCT---
D00004299 Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae) Cys GCA -GGCGCGTTGACAGATT--GGT--TATGTAGCGGATTGCAAATCCGCCT-------------------A-GCCCGGTTCAATTCCGGGATGCGCCT---
D00004259 Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum) Cys GCA -GGCGTGTTGACAGATT--GGC--TATGTAGCGGACTGCAAATCCGTAT-------------------A-ACCCGGTTCGATTCCGGGATACGCCT---
D00004167 Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168 Cys GCA -GGCGACATAGCCAAGC--GGT--AAGGCATGGGCCTGCAAAGCCTTGA-------------------T-CTCCGGTTCGAATCCGGATGTCGCCTCCA
D00004346 Candidatus_Blochmannia_floridanus Cys GCA -GGCGCGTTAACAAAGT--GGT--AATGTAGCGGACTGCAAATCCGTAT-------------------A-GCTCGGTTCGAATCCGAGACGCGCCT---
D00004316 Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25 Cys GCA -GGTGGCATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAAGCCTGCAAAGCTTCCA-------------------TCCCCCAGTTCGAATCTGGGTGCCACCT---
D00004168 Caulobacter_crescentus_CB15 Cys GCA -GGCCCGGTGGCGGAGT--GGT--GACGCAGCGGACTGCAAATCCGTGC-------------------A-CGCCGGTTCGATTCCGGCCCGGGCCTCCA
D00004182 Chlamydia_muridarum_Nigg Cys GCA -GGTGGCATCGCCAAGC--GGT--AAGGCCGAGGCCTGCAAAGCCTCTA-------------------T-CCCCGGTTCGATTCCGGGTGCCACCT---
D00004148 Chlamydia_trachomatis Cys GCA -GGTGGCATAGCCAAGC--GGT--AAGGCCGAGGCCTGCAAAGCCTCTA-------------------T-CCCCGGTTCGATTCCGGGTGCCACC----
D00004147 Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX Cys GCA -GGTGGCATCGCCAAGC--GGT--AAGGCCGAGGCCTGCAAAGCCTCTA-------------------T-CCCCGGTTCGATTCCGGGTGCCACCT---
D00004145 Chlamydophila_pneumoniae_AR39 Cys GCA -GGTGGCATAGCCAAGC--GGT--AAGGCCGAGGCCTGCAAAGCCTCTA-------------------T-CCCCGGTTCGATTCCGGGTGCCACCT---
D00004146 Chlamydophila_pneumoniae_CWL029 Cys GCA -GGTGGCATAGCCAAGC--GGT--AAGGCCGAGGCCTGCAAAGCCTCTA-------------------T-CCCCGGTTCGATTCCGGGTGCCACCT---
D00004159 Chlamydophila_pneumoniae_J138 Cys GCA -GGTGGCATAGCCAAGC--GGT--AAGGCCGAGGCCTGCAAAGCCTCTA-------------------T-CCCCGGTTCGATTCCGGGTGCCACCT---
D00004254 Chlorobium_tepidum_TLS Cys GCA -GGTGAAGTGGCCGAGT--GGC--TAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTCGT-------------------A-CAGCGGTTCGAATCCGCTCTTCACCTCCA
D00004185 Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824 Cys GCA -GGCGCTATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTTTA-------------------T-CCCCAGTTCAAATCTGGGTGGCGCCTCCA
D00004181 Clostridium_perfringens_str._13 Cys GCA -GGCGCTATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTTTA-------------------TTCCCCGGTTCAAATCCGGGTGGCGCCTCCA
D00004285 Clostridium_tetani_E88 Cys GCA -GGCGCTATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTCTA-------------------TTCCCCGGTTCAAATCCGGGTGGCGCCTCCA
D00004286 Clostridium_tetani_E88 Cys GCA -GGCACTATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTCTA-------------------TTCCCCAGTTCAAATCTGGGTGGTGCCTCCA
D00004313 Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129 Cys GCA -GGTGGAATGGCCGAGT--GGT--GAGGCAACGGTCTGCAAAACCGTGC-------------------A-CACGGGTTCGATTCCCGTTTCCACCT---
D00004275 Corynebacterium_efficiens_YS-314 Cys GCA -GGTGGAATGGCCGAGT--GGT--GAGGCAACGGTCTGCAAAACCGTGC-------------------A-CACGGGTTCGATTCCCGTTTCCACCT---
D00004261 Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032 Cys GCA -GGTGGAATGGCCGAGT--GGT--GAGGCAACGGTCTGCAAAACCGTGC-------------------A-CACGGGTTCGATTCCCGTTTCCACCT---
D00004297 Coxiella_burnetii_RSA_493 Cys GCA -GGCTGGGTGGCAGAGT--GGT--CATGCAGCGGCCTGCAAAGCCGCGT-------------------A-CGCCGGTTCGATTCCGGCCTCAGCCT---
D00004169 Deinococcus_radiodurans_R1 Cys GCA -GGCGCTGTAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTCCA-------------------C-CACCGGTTCGAGTCCGGTCAGCGCCTCCA
D00004333 Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough Cys GCA -GGCGGCGTAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTCCA-------------------TTCTCCGGTTCAAATCCGGACGCCGCCTCCA
D00004287 Enterococcus_faecalis_V583 Cys GCA -GGCGGTATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTTCA-------------------T-CACCGGTTCAAATCCGGTTACCGCCT---
D00004288 Enterococcus_faecalis_V583 Cys GCA -GTATCTATGGCGAAGT--GGC--AACGCTCTAGTTTGCAAAACTAGCA-------------------TTCGTGGGTTCGAATCCCACTAGATACT---
D00000258 Escherichia_coli Cys GCA -GGCGCGTTAACAAAGC--GGT--TATGTAGCGGATTGCAAATCCGTCT-------------------A-GTCCGGTTCGACTCCGGAACGCGCCTCCA
D00004301 Escherichia_coli_CFT073 Cys GCA -GGCGCGTTAACAAAGC--GGT--TATGTAGCGGATTGCAAATCCGTCT-------------------A-GTCCGGTTCGACTCCGGAACGCGCCTCCA
D00004160 Escherichia_coli_K12 Cys GCA -GGCGCGTTAACAAAGC--GGT--TATGTAGCGGATTGCAAATCCGTCT-------------------A-GTCCGGTTCGACTCCGGAACGCGCCTCCA
D00004161 Escherichia_coli_O157:H7 Cys GCA -GGCGCGTTAACAAAGC--GGT--TATGTAGCGGATTGCAAATCCGTCT-------------------A-GTCCGGTTCGACTCCGGAACGCGCCTCCA
D00004162 Escherichia_coli_O157:H7_EDL933 Cys GCA -GGCGCGTTAACAAAGC--GGT--TATGTAGCGGATTGCAAATCCGTCT-------------------A-GTCCGGTTCGACTCCGGAACGCGCCTCCA
D00004255 Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586 Cys GCA -GGCGACGTCGCCAAGC--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAATCTCCA-------------------T-CACCAGTTCGAATCTGGTCGTCGCCTCCA
D00004322 Geobacter_sulfurreducens_PCA Cys GCA -GGCGGCGTCGCCAAGT--GGT--AAGGCAAAGGTCTGCAAAACCTTTA-------------------TTCACCGGTTCAAATCCGGTCGCCGCCTCCA
D00000259 Haemophilus_influenzae Cys GCA -GGCGTGTTAGCAAAGC--GGT--TATGCACTGGATTGCAAATCCATGT-------------------A-GCTCGGTTCGACTCCGGGACAGCCTCCA-
D00004165 Haemophilus_influenzae_Rd_KW20 Cys GCA -GGCGTGTTAGCAAAGC--GGT--TATGCACTGGATTGCAAATCCATGT-------------------A-GCTCGGTTCGACTCCGGGACACGCCTCCA
D00000256 Helicobacter_pylori Cys GCA -GGCGACATAGCCAAGT--GGT--AAGGCATGGGTCTGCAAAACCTTGA-------------------TTCCCCGGTTCGAATCCGGGTGTCGCCTCCA
D00004163 Helicobacter_pylori_26695 Cys GCA -GGCGACATAGCCAAGT--GGT--AAGGCATGGGTCTGCAAAACCTTGA-------------------TTCCCCGGTTCGAATCCGGGTGTCGCCTCCA
D00004164 Helicobacter_pylori_J99 Cys GCA -GGCGACATAGCCAAGT--GGT--AAGGCATGAGTCTGCAAAACTTTGA-------------------TCCCCCGGTTCGAATCCGGGTGTCGCCTCCA
D00004323 Lactobacillus_johnsonii_NCC_533 Cys GCA -GGCGGTGTAGCCAAGT--GGT--AAGGCACGGGTCTGCAAAACCCTAA-------------------T-CATCGGTTCAAATCCGATCACCGCCT---
D00004289 Lactobacillus_plantarum_WCFS1 Cys GCA -GGCGGTATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTTCA-------------------T-CACCGGTTCAAATCCGGTTACCGCCT---
D00004324 Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07 Cys GCA -GGTGGATTGGCCGAGA--GGC--GAGGCAGCGGCCTGCAAAGCCGTAT-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTATCCACCT---
D00004276 Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601 Cys GCA -GGCGTCGTGGCCAAGT--GGT--AAGGCATGGCTCTGCAAAAGCTTGA-------------------T-CCCCGGTTCGAATCCGGGCGACGCCT---
D00004179 Listeria_innocua_Clip11262 Cys GCA -GGCGCCATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTTTA-------------------T-CACCGGTTCAAATCCGGTTGGCGCCTCCA
D00004180 Listeria_monocytogenes_EGD-e Cys GCA -GGCGCCATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTTTA-------------------T-CACCGGTTCAAATCCGGTTGGCGCCTCCA
D00004334 Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365 Cys GCA -GGCGCCATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTTTA-------------------T-CACCGGTTCAAATCCGGTTGGCGCCTCCA
D00004335 Mesoplasma_florum_L1 Cys GCA -GGCGGCATAGCCAAGT--GGCT-AAGGCATGGGTCTGCAACACCCTGA-------------------T-CATCGGTTCGAATCCGATTGCCGCCTCCA
D00004188 Mesorhizobium_loti_MAFF303099 Cys GCA -GGCCTCGTGGCGGAGT--GGT--TACGCAGAGGACTGCAAATCCTTGC-------------------A-CCCCGGTTCGATTCCGGGCGAGGCCTCCA
D00004295 Mycobacterium_bovis_AF2122/97 Cys GCA -GGTGGAGTGGCCGAGT--GGT--GAGGCAACGGCCTGCAAAGCCGTGC-------------------A-CACGGGTTCGATTCCCGTCTCCACCTCCA
D00004157 Mycobacterium_leprae_TN Cys GCA -GGTGGAGTGGCCGAGT--GGT--GAGGCAACGGCCTGCAAAGCCGTGC-------------------A-CACGGGTTCGATTCCCGTCTCCACCT---
D00004151 Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551 Cys GCA -GGTGGAGTGGCCGAGT--GGT--GAGGCAACGGCCTGCAAAGCCGTGC-------------------A-CACGGGTTCGATTCCCGTCTCCACCTCCA
D00004315 Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv Cys GCA -GGTGGAGTGGCCGAGT--GGT--GAGGCAACGGCCTGCAAAGCCGTGC-------------------A-CACGGGTTCGATTCCCGTCTCCACCTCCA
D00000248 Mycoplasma_capricolum Cys GCA -GGCAACATGGCCAAGC--GGCT-AAGGCATGGGTCTGCAACACCCTGA-------------------T-CATCGGTTCGAATCCGATTGTTGCCTCCA
D00004294 Mycoplasma_gallisepticum_R Cys GCA -GGTGCCTTAGTCAAGT--GGT--AAGGCTTGGAGCTGCAACCTCCACA-------------------T-CGTCAGTTCGATTCTGACAGGCACCTCCA
D00000249 Mycoplasma_genitalium Cys GCA -GGTGCCTTAGCCAAGTG-GACTCAAGGCCTGGAGCTGCAACCTCCATA-------------------T-CGTCAGTTCGAATCTGACAGGCACTCCA-
D00004170 Mycoplasma_genitalium_G37 Cys GCA -GGTGCCTTAGCCAAGTG-GACTCAAGGCCTGGAGCTGCAACCTCCATA-------------------T-CGTCAGTTCGAATCTGACAGGCACCTCCA
D00000250 Mycoplasma_pneumoniae Cys GCA -GGTGCCTTAGCCAAGTG-GATTCAAGGCCTGGAGCTGCAACCTCCATA-------------------T-CGTCAGTTCGAATCTGACAGGCACCTCCA
D00004171 Mycoplasma_pneumoniae_M129 Cys GCA -GGTGCCTTAGCCAAGTG-GATTCAAGGCCTGGAGCTGCAACCTCCATA-------------------T-CGTCAGTTCGAATCTGACAGGCACCTCCA
D00004194 Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP Cys GCA -GGCACCATAGCCAAAT--GGGC-AAGGCATGGGTCTGCAACACCCTGA-------------------T-TACCGGTTCGAGTCCGGTTGGTGCCTCCA
D00004152 Neisseria_meningitidis_MC58 Cys GCA -GGCGAGATAGCAAAGT--GGT--TATGCAGCGGATTGCAAATCCGTCT-------------------A-CGCCGGTTCGATTCCGACTCTCGCCTCCA
D00004153 Neisseria_meningitidis_Z2491 Cys GCA -GGCGAGATAGCAAAGT--GGT--TATGCAGCGGATTGCAAATCCGTCT-------------------A-CGCCGGTTCGATTCCGACTCTCGCCTCCA
D00004307 Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718 Cys GCA -GGCGGGGTGGCAGAGT--GGT--TATGCAGCGGCCTGCAAAGCCGTCT-------------------A-CGCCGGTTCGATTCCGACCCCCGCCTCCA
D00004193 Nostoc_sp._PCC_7120 Cys GCA -GGCGGCATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTCCA-------------------TCCCCCGGTTCAAATCCGGGTGCCGCCT---
D00004277 Oceanobacillus_iheyensis_HTE831 Cys GCA -GGCGGTATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTTTA-------------------T-CACCGGTTCAAATCCGGTTACCGCCTCCA
D00004314 Onion_yellows_phytoplasma_OY-M Cys GCA -GGCCCTGTAGCCAAGT--GGT--AAGGCATGGCTCTGCAAAAGCTTGA-------------------T-CAACGGTTCAAATCCGTTCAGGGCCTCCA
D00004172 Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70 Cys GCA -GGCGTGTTAGCAAAGC--GGT--TATGCACTGGATTGCAAATCCATGT-------------------A-GCTCGGTTCGACTCCGGGACACGCCTCCA
D00004317 Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1 Cys GCA -GGCGCGTTGGCAGAGT--GGC--CATGCAGCGGATTGCAAATCCGTCA-------------------A-CCTCGGTTCGACTCCGGGACGCGCCTCCA
D00004325 Porphyromonas_gingivalis_W83 Cys GCA -GGTTCGTTGGCCGAGT--GGT--TAGGCAACGGTCTGCAAAACCGTCT-------------------A-CGGCGGTTCGAGTCCGCCACGAACCT---
D00004336 Propionibacterium_acnes_KPA171202 Cys GCA -GGTGGAGTGGCCGAGA--GGC--GAGGCAACGGACTGCAAATCCGTGT-------------------A-CACGGGTTCAAATCCCGTCTCCACCT---
D00004174 Pseudomonas_aeruginosa_PAO1 Cys GCA -GGCTGAGTAGCAGAGT--GGT--TATGCACCGGATTGCAAATCCGTGA-------------------A-CGCCGGTTCGATTCCGACCTCAGCCTCCA
D00004309 Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000 Cys GCA -GGCCGAGTAGCAAAAT--GGT--TATGCAGCGGATTGCAAATCCGCCT-------------------A-CGCCGGTTCGATTCCGACCTCGGCCTCCA
D00004191 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Cys GCA -GGCGGGGTGGCAGAGT--GGTC-AATGCTGCGGCTTGCAAAGCCGTAT-------------------A-AGTCGGTTCGATTCCGTTCCCCCGCC---
D00004192 Ralstonia_solanacearum_GMI1000 Cys GCA -GGCGGGGTGGCAGAGT--GGT--CATGCAGCGGCCTGCAAAGCCGTGT-------------------A-CGCCGGTTCGATTCCGACCCCCGCCTCCA
D00004305 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Cys GCA -AACGCTGGAGCCAGAT--GGC--TAGGCGGCCGGCTGCAACCCGGTTT-------------------A-AGTGGGTTCGACTCCCACCAGCGTTT---
D00004306 Rhodopirellula_baltica_SH_1 Cys GCA -GGCGACGTGGCCAAGT--GGCT-AAGGCGAAGGATTGCAAATCCTTTA-------------------TTCGTGGGTTCGAATCCCACCGTCGCCT---
D00004318 Rhodopseudomonas_palustris_CGA009 Cys GCA -GGCCACGTGGCGGAGT--GGT--TACGCAACGGTCTGCAAAACCGTGT-------------------A-CACCAGTTCAATTCTGGTCGTGGCCTCCA
D00004186 Rickettsia_conorii_str._Malish_7 Cys GCA -GGCTGGGTAGCAAAGT--GGT--AATGCCGTGGACTGCAAATCCTCTA-------------------TTCGTCGGTTCGATTCCGACCCTGGCCTCCA
D00004260 Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E Cys GCA -GGCTGGGTAGCAAAGT--GGT--AATGCCGTGGACTGCAAATCCTCTA-------------------TTCGTCGGTTCGATTCCGACCCTGGCCTCCA
D00004326 Rickettsia_typhi_str._Wilmington Cys GCA -GGCTGGGTAGCAAAGT--GGT--AATGCCGTGGACTGCAAATCCTCTA-------------------TTCGTCGGTTCGATTCCGACCCTGGCCTCCA
D00004196 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18 Cys GCA -GGCGCGTTAACAAAGC--GGT--TATGTAGCGGATTGCAAATCCGTCT-------------------A-GTCCGGTTCGACTCCGGAACGCGCCTCCA
D00004304 Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2 Cys GCA -GGCGCGTTAACAAAGC--GGT--TATGTAGCGGATTGCAAATCCGTCT-------------------A-GTCCGGTTCGACTCCGGAACGCGCCTCCA
D00004190 Salmonella_typhimurium_LT2 Cys GCA -GGCGCGTTAACAAAGC--GGT--TATGTAGCGGATTGCAAATCCGTCT-------------------A-GTCCGGTTCGACTCCGGAACGCGCCTCCA
D00004279 Shewanella_oneidensis_MR-1 Cys GCA -GGCGCGATGGCAGAAT--GGC--TATGCTGCGGATTGCAAATCCGTCG-------------------A-TCTCGGTTCGACTCCGGGTCGCGCCTCCA
D00004280 Shigella_flexneri_2a_str._301 Cys GCA -GGCGCGTTAACAAAGC--GGT--TATGTAGCGGATTGCAAATCCGTCT-------------------A-GTCCGGTTCGACTCCGGAACGCGCCTCCA
D00004197 Sinorhizobium_meliloti_1021 Cys GCA -GGCCTCGTGGCGGAGT--GGT--GACGCAGAGGACTGCAAATCCTTGT-------------------A-CGCCGGTTCAATTCCGGCCGAGGCCTCCA
D00000252 Spiroplasma_melliferum Cys GCA -GGCACTATAGCCAAGGT-GGCT-AAGGCATGGGACTGCAACTCCCCGA-------------------T-CGTCGGTTCGAATCCGACTAGTGCCTCCA
D00000255 Staphylococcus_aureus Cys GCA -GGCGGCATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTTTA-------------------T-CACCGGTTCAAATCCGGTTGCCGCCTCCA
D00004319 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252 Cys GCA -GGCGGCATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTTTA-------------------T-CACCGGTTCAAATCCGGTTGCCGCCTCCA
D00004262 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2 Cys GCA -GGCGGCATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTTTA-------------------T-CACCGGTTCAAATCCGGTTGCCGCCTCCA
D00004156 Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315 Cys GCA -GGCGGCATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTTTA-------------------T-CACCGGTTCAAATCCGGTTGCCGCCTCCA
D00004290 Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228 Cys GCA -GGCGGCATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTTTA-------------------T-CACCGGTTCAAATCCGGTTGCCGCCTCCA
D00004281 Streptococcus_agalactiae_2603V/R Cys GCA -GGCGGTATAGCCAAGT--GGT--AAGGCACGGCTCTGCAAAAGCTTGA-------------------T-CGTCGGTTCAAATCCGTCTACCGCCT---
D00004263 Streptococcus_agalactiae_NEM316 Cys GCA -GGCGGTATAGCCAAGT--GGT--AAGGCACGGCTCTGCAAAAGCTTGA-------------------T-CGTCGGTTCAAATCCGTCTACCGCCT---
D00004282 Streptococcus_mutans_UA159 Cys GCA -GGCGGTATAGCCAAGT--GGT--AAGGCACGGCTCTGCAAAAGCTTGA-------------------T-CGTCGGTTCAAATCCGTCTACCGCCT---
D00004184 Streptococcus_pneumoniae_TIGR4 Cys GCA -GGCGGTATAGCCAAGT--GGT--AAGGCACGGCTCTGCAAAAGCTTGA-------------------T-CGTCGGTTCAAATCCGTCTACCGCCT---
D00004183 Streptococcus_pyogenes_M1_GAS Cys GCA -GGCGGTATAGCCAAGT--GGT--AAGGCACGGCTCTGCAAAAGCTTGA-------------------T-CGTCGGTTCAAATCCGTCTACCGCCT---
D00004264 Streptococcus_pyogenes_MGAS315 Cys GCA -GGCGGTATAGCCAAGT--GGT--AAGGCACGGCTCTGCAAAAGCTTGA-------------------T-CGTCGGTTCAAATCCGTCTACCGCCT---
D00004296 Streptococcus_pyogenes_SSI-1 Cys GCA -GGCGGTATAGCCAAGT--GGT--AAGGCACGGCTCTGCAAAAGCTTGA-------------------T-CGTCGGTTCAAATCCGTCTACCGCCT---
D00004302 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Cys GCA -GGCCGTGTGCCCGAGT--GGCT-TAGGGACTCGCCTGCAAAGCGAGGT-------------------A-CGTGGGTTCAATTCCCGCCACGGCCT---
D00004303 Streptomyces_avermitilis_MA-4680 Cys GCA -GGTGGAGTGGCCGAGA--GGC--GAGGCAACGGCCTGCAAAGCCGTCT-------------------A-CACGGGTTCAAATCCCGTCTCCACCTCCA
D00004278 Streptomyces_coelicolor_A3(2) Cys GCA -GGTGGAGTGGCCGAGA--GGC--GAGGCAACGGCCTGCAAAGCCGTCT-------------------A-CACGGGTTCAAATCCCGTCTCCACCTCCA
D00000254 Streptomyces_lividans Cys GCA -GGTGGAGTGGCCGAGA--GGC--GAGGCAACGGCCTGCAAAGCCGTCT-------------------A-CACGGGTTCAAATCCCGTCTCCACCTCCA
D00004327 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Cys GCA -GGTGGGTTGGCGAAGG--GGT--AACGCGGCGGTCTGCAAAACCGTTA-------------------TCCGTGGGTTCGAATCCCACACCCACCTCCA
D00004328 Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863 Cys GCA -GGTGGGTTGGCGAAGT--GGT--AACGCGGCGGTCTGCAAAACCGTTA-------------------TCCGTGGGTTCAAATCCCACACCCACCTCCA
D00000260 Synechocystis_sp. Cys GCA -GGCGGCATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAATCTTTA-------------------C-CCCCAGTTCGAATCTGGGTGCCGCCT---
D00004175 Synechocystis_sp._PCC_6803 Cys GCA -GGCGGCATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAATCTTTA-------------------C-CCCCAGTTCGAATCTGGGTGCCGCCT---
D00004267 Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4 Cys GCA -GGCGACATAGCCAAGC--GGT--AAGGCAGGGGTCTGCAAAACCCCGA-------------------TTCCCCGGTTCGAATCCGGGTGTCGCCTCCA
D00004265 Thermosynechococcus_elongatus_BP-1 Cys GCA -GGCGGCATAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTTTA-------------------TTCCCCGGTTCGAATCCGGGTGCCGCCT---
D00004176 Thermotoga_maritima_MSB8 Cys GCA -GGCGGCGTAGCCAAGC--GGTCAAAGGCGGGGGTCTGCAAAATCCCTA-------------------TTCGTGGGTTCGAATCCCACCGCCGCCTCCA
D00004337 Thermus_thermophilus_HB27 Cys GCA -GGCGCCGTAGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTCCA-------------------TTCGCCGGTTCGAATCCGGCCGGCGCCTCCA
D00004338 Treponema_denticola_ATCC_35405 Cys GCA -GGCGCCGTACCCAAGT--GGT--AAGGGACAGGTCTGCAAAACCTTCA-------------------TTCATCAGTTCGATTCTGATCGGCGCCT---
D00000253 Treponema_pallidum Cys GCA -GGCGCCGTGCCCAAGT--GGT--AAGGGAGAGGTCTGCAAAACCTTTA-------------------TGCATCAGTTCGATTCTGATCGGCGCCT---
D00004173 Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols Cys GCA -GGCGCCGTGCCCAAGT--GGT--AAGGGAGAGGTCTGCAAAACCTTTA-------------------TGCATCAGTTCGATTCTGATCGGCGCCT---
D00004291 Tropheryma_whipplei_str._Twist Cys GCA -GGTGGCGTGGCCGAGA--GGT--GAGGCAGCAGCCTGCAAAGCTGTGT-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTCGCCACCT---
D00004292 Tropheryma_whipplei_TW08/27 Cys GCA -GGTGGCGTGGCCGAGA--GGT--GAGGCAGCAGCCTGCAAAGCTGTGT-------------------A-CACGGGTTCGAATCCCGTCGCCACCT---
D00004158 Ureaplasma_parvum_serovar_3 Cys GCA -GGTGCCATAGCCAAGT--GGT--AAGGTCAGGAGCTGCAACCTCCTTA-------------------TTCGTCAGTTCGAATCTGACTGGCACCTCCA
D00004154 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Cys GCA -GGCGCGTTGGCAGAGT--GGC--CATGCAGCGGATTGCAAATCCGTGA-------------------A-CCTCGGTTCGACTCCGGGACGCGCCTCCA
D00004155 Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961 Cys GCA -GGCGCGTTGGCAGAGT--GGC--CATGCAGCGGATTGCAAATCCGTGG-------------------A-CCTCGGTTCGACTCCGGGACGCGCCTCCA
D00004339 Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster Cys GCA -GGCTGGGTGGCAGAAT--GGCT-TATGCGGAGGACTGCAAATCCTTTT-------------------A-TACCGGTTCAATTCCGGTCCCGGCCT---
D00004269 Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306 Cys GCA -GGCCTGGTGGTAGAGT--GGT--TATGCAGCGGACTGCAAATCCGCGT-------------------A-CGCCGGTTCAATTCCGGCCCAGGCCTCCA
D00004268 Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913 Cys GCA -GGCCTGGTGGTAGAGT--GGT--TATGCAGCGGACTGCAAATCCGCGT-------------------A-CGCCGGTTCAATTCCGGCCCAGGCCTCCA
D00004177 Xylella_fastidiosa_9a5c Cys GCA -GGCCTGGTGGCAGAGT--GGT--CATGCAGCGGATTGCAAATCCGTGT-------------------A-CGCCGGTTCGATTCCGACCCAGGCCTCCA
D00004293 Xylella_fastidiosa_Temecula1 Cys GCA -GGCCTGGTGGCAGAAT--GGT--CATGCAGCGGATTGCAAATCCGTGT-------------------A-CGCCGGTTCGATTCCGACCCAGGCCTCCA
D00004329 Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001 Cys GCA -GGCGCGTTGGCAGAGT--GGC--CATGCTACGGATTGCAAATCCGTCT-------------------A-CCTCGGTTCGACTCCGGGACGCGCCTCCA
D00004189 Yersinia_pestis_CO92 Cys GCA -GGCGCGTTGGCAGAGT--GGC--CATGCTACGGATTGCAAATCCGTCT-------------------A-CCTCGGTTCGACTCCGGGACGCGCCTCCA
D00004271 Yersinia_pestis_KIM Cys GCA -GGCGCGTTGGCAGAGT--GGC--CATGCTACGGATTGCAAATCCGTCT-------------------A-CCTCGGTTCGACTCCGGGACGCGCCTCCA
D00004330 Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953 Cys GCA -GGCGCGTTGGCAGAGT--GGC--CATGCTACGGATTGCAAATCCGTCT-------------------A-CCTCGGTTCGACTCCGGGACGCGCCTCCA
D00000374 Arabidopsis_thaliana Cys GCA -GGGTCCATAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCACCGGTTCGAACCCGGTTGGGCCCT---
D00004233 Arabidopsis_thaliana Cys GCA -GGCTAGGTAACATAAT--GGA--AATGTATCGGACTGCAAATCCTGTA-------------------A-TGACGGTTCGACTCCGTCCTTGGCCT---
D00004234 Arabidopsis_thaliana Cys GCA -AGGTCCATAGCTCAGT--GGT--AGAGCAATTGACTGCAGATCAATAG-------------------GTCACCGGTTTGAACCTGGTTGGGCCC----
D00004235 Arabidopsis_thaliana Cys GCA -AGGTCCATAGCTCAGT--GGT--AGAGCAATTGACTGCAGATCAATAG-------------------GTCACCGGTTCGAACCCGATTGGGCCC----
D00004236 Arabidopsis_thaliana Cys GCA -GGGTCCATAGCTCAGT--GAT--AGAGCAATTGACTGCAGATCAATAG-------------------GTCACCGGTTCGAACCCGGTTGGGCCC----
D00004237 Arabidopsis_thaliana Cys GCA -GGGCCCATAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTCGACTGCAGATCGAGAG-------------------GTCACCGGTTCGAACCCGGTTGAGCCC----
D00004238 Arabidopsis_thaliana Cys GCA -GGGTTCATAGCTCAGT--GGT--AGAGCAATTGACTGCAGATCAATAG-------------------GTCACCGGTTCGAACCCGGTTGGGCCC----
D00004239 Arabidopsis_thaliana Cys GCA -GGGCTCATAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTCGACTGCAGATCGAGAG-------------------GTCACCGGTTCGAACCCGGTTGGGCCC----
D00004240 Arabidopsis_thaliana Cys GCA -GAGCCTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCAATTGACTGCAGATCAATAG-------------------GTCACCGGTTCGAATCCGGTTGGGCTC----
D00004241 Arabidopsis_thaliana Cys GCA -GGGTCCTTAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCACCGGTTCGAACCCGGTAGGGCCCT---
D00004242 Arabidopsis_thaliana Cys GCA -GGGTCCATAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCACCGGTTCGAACCCGGTTGGGCCCT---
D00004243 Arabidopsis_thaliana Cys GCA -GGGTCCATAGCTCAGT--GGT--AGAGCAATTGACTGCAGATCAATAG-------------------GTCACCGGTTCGAACCCGGTTGGGCCCT---
D00004244 Arabidopsis_thaliana Cys GCA -GGGTCCTTAGCTCAGT--GGT--AGAGCAATTGACTGCAGATCAATAG-------------------GTCACCGGTTCGAATCCGGTAGGGCCC----
D00004245 Caenorhabditis_elegans Cys GCA -TGGGGTATAGCTCAGT--GGC--AGAGCATTCGATTGCAGATCGAGAG-------------------GTCCCTGGTTCAACTCCGGGTGCCCCC----
D00004246 Caenorhabditis_elegans Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGT--GGC--AGAGCATTCGACTGCAGATCGAGAG-------------------GTCCCTGGTTCAACTCCGGGTGCCCCC----
D00004331 Candida_glabrata_CBS_138 Cys GCA -GCTCGTATGGCGCAGT--GGT--AGCGCAGCAGATTGCAAATCTGTTG-------------------GTCCTTAGTTCGAACCTGAGTGCGAGCT---
D00000377 Cyanidium_caldarium Cys GCA -GGCGGCATGGCCAAGT--GGT--AAGGCAGAGGATTGCAAATCCTTTA-------------------TCCCCCAGTTCGAATCTGGGTGCCGCCT---
D00004248 Drosophila_melanogaster Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGG--GGC--AGAGCATTCGACTGCAGATCGAGAG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGTGCCCCC----
D00004249 Drosophila_melanogaster Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCATTCGACTGCAGATCGAGAG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGTGCCCCC----
D00004250 Drosophila_melanogaster Cys GCA -GGGGGCATAGCTCAGG--GGT--AGAGCGTTCGACTGCAGATCGACAG-------------------GTCCCTGGTTCAAATCCGGGTGCCCCC----
D00004251 Drosophila_melanogaster Cys GCA -GGGGATATAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTCGACTGCAGATCGAGAG-------------------GTCCCCGGTTCAAACCCGGGTGTCCCCT---
D00004270 Encephalitozoon_cuniculi_GB-M1 Cys GCA -GGGTCCGTAGCTCAGC--GGT--AGAGCAATTGATTGCAGATCAATCG-------------------GTCACAGGTTCGATTCCTGTCGTGCCCT---
D00000381 Euplotes_octocarinatus Cys GCA -GGGTCAATAGCTCAGT--GGT--AGAGCAGCAGATTGCAGATCTGTAG-------------------GTCACCGGTTCGATCCCGGTTTGGCCCT---
D00004347 Gallus_gallus Cys GCA -GGGGGTACAGCCCACT--GTT--GGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCTGGTTCAACTCCAGGTGCCCCCT---
D00004348 Gallus_gallus Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCGGTTCAACTCCAGGTGCCCCCT---
D00004349 Gallus_gallus Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGTGCCCCCT---
D00004350 Gallus_gallus Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCTGGTTCAACTCCAGGTGCCCCCT---
D00004351 Gallus_gallus Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGTGCCCCCT---
D00000376 Glycine_max Cys GCA -GGGTCCATAGCTCAGT--GG---TAGAGATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------G-TCACGGTTCGAACCCGGTTGGGCCCT---
D00004209 Homo_sapiens Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCCAGAA-------------------GTCCCCGGTTCAAAnTCCGGTGCCCCC----
D00004210 Homo_sapiens Cys GCA -GGGGGTAGGGCTCAGG--GAT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCGGTTCGAATCTAGGTGCCCCC----
D00004211 Homo_sapiens Cys GCA -GGGGGTATAGCTCACA--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGTTACTCCC----
D00004212 Homo_sapiens Cys GCA -GGGCGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCAGTTCAAATCTGGGTGCCCAC----
D00004213 Homo_sapiens Cys GCA -GGGGGTATAGCTCACA--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCTGGGTGCCCCC----
D00004214 Homo_sapiens Cys GCA -GGGCGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCAGTTCAAATCTGGGTGCCCCC----
D00004215 Homo_sapiens Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCATTTGACTGCAAATCAAGAG-------------------GTCCCTGATTCAAATCCAGGTGCCCCCT---
D00004216 Homo_sapiens Cys GCA -GGGGGTATAGTTCAGG--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCTGGTTCAAATCCAGGTGCCCCCT---
D00004217 Homo_sapiens Cys GCA -GGGGATATAGCTCAGG--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGTGCCCCC----
D00004218 Homo_sapiens Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCACTTGACTGCAGATCAAGAA-------------------GTCCTTGGTTCAAATCCAGGTGCCCCC----
D00004219 Homo_sapiens Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCTCTGGTTCAAATCCAGGTGCCCCCT---
D00004220 Homo_sapiens Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGT--GGGT-AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCAGGTGCCCCC----
D00004221 Homo_sapiens Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCAGTTCAAATCTGGGTGCCCCC----
D00004222 Homo_sapiens Cys GCA -GGGGGTATAGCTTAGG--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAAAG-------------------GTCCCTGGTTCAAATCCAGGTGCCCCT----
D00004223 Homo_sapiens Cys GCA -GGGGGTATAGCTTAGC--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGTGCCCCC----
D00004224 Homo_sapiens Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCTGGTTCAAATCCAGGTGCCCCCC---
D00004225 Homo_sapiens Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCTGGTTCAAATCCAGGTGCCCCCT---
D00004226 Homo_sapiens Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGTGCCCCCT---
D00004227 Homo_sapiens Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGGT-GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGTGCCCCC----
D00004228 Homo_sapiens Cys GCA -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCTGGTTCAAATCCAGGTGCCCCCT---
D00004229 Homo_sapiens Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCTGGTTCAAATCCGGGTGCCCCCT---
D00004230 Homo_sapiens Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCACTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCTGGTTCAAATCCAGGTGCCCCCT---
D00004231 Homo_sapiens Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGTGCCCCC----
D00004232 Homo_sapiens Cys GCA -GGGGGCATAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCTGGTTCAAATCCAGGTGCCCCCT---
D00000379 Mus_musculus Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGGG-GT---AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCTGGTTCAAATCCAGGTGCCCCCT---
D00000380 Mus_musculus Cys GCA -GCGGGTATAGCTCAGGG-GT---AGAATATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCTTGTTCGAATTCAGGTGCCCTCT---
D00000375 Nicotiana_rustica Cys GCA -GGGTCCTTAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCACCGGTTCGAACCCGGTAGGGCCCT---
D00004360 Pan_troglodytes Cys GCA -GGGGGTATAGCTGAGG--GGT--AAACCATTTGGCTGCAGATCAAGTG-------------------GTCCCTGGTTCAAATCTGGGTGCCCTCT---
D00004361 Pan_troglodytes Cys GCA -GGGGGTATGGCTCAGG--GAT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCTAGGTGCCCCCT---
D00004362 Pan_troglodytes Cys GCA -GGGCGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCAGTTCAAATCTGGGTGCCCCCT---
D00004363 Pan_troglodytes Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCACTTGACTGCAGATCAAGAA-------------------GTCCTTGGTTCAAATCCAGGTGCCCCCT---
D00004364 Pan_troglodytes Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCTCTGGTTCAAATCCAGGTGCCCCCT---
D00004365 Pan_troglodytes Cys GCA -GGGGGTGTAGCTCAGG--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGTGCCCCCT---
D00004366 Pan_troglodytes Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCAGTTCAAATCTGGGTGCCCCCT---
D00004367 Pan_troglodytes Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAA-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGTACCCCCT---
D00004368 Pan_troglodytes Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAAAG-------------------GTCCCTGGTTCAAATCCAGGTGCCCCTT---
D00004369 Pan_troglodytes Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCTGGTTCAAATCCAGGTGCCCCCT---
D00004370 Pan_troglodytes Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGG--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGTGCCCCCT---
D00004371 Pan_troglodytes Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGGT-GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGTGCCCCCT---
D00004372 Pan_troglodytes Cys GCA -GGGGGTGTAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCTGGTTCAAATCCAGGTGCCCCCT---
D00004373 Pan_troglodytes Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGC--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGTGCCCCCT---
D00004374 Pan_troglodytes Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCTGGTTCAAATCCGGGTGTCCCCT---
D00004375 Pan_troglodytes Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCTGGTTCAAATCCGGGTGCCCCCT---
D00004376 Pan_troglodytes Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCTGGTTCAAATCCAGGTGCCCCCT---
D00004377 Pan_troglodytes Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGTGCCCCCT---
D00000371 Plasmodium_falciparum Cys GCA -AATGATATAACTTAATT-GAT--AAAGTAAATAATTGCAAATTATTAT-------------------A-TTTCAGTTTGAATCTGAATATCATTT---
D00004344 Plasmodium_falciparum_3D7 Cys GCA -GGGCCGGTAGCTCAGC--GGT--AAGACAGCTGACTGCAAATCAGCGG-------------------GCCCTGGGTACAATTCCTGGCGCGCCCT---
D00000378 Podocoryne_carnea Cys GCA -GGGGATATAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTCGACTGCAGATCGAGAG-------------------GTCCCTGGTTCAAACCCGGGTGTCCCCT---
D00000372 Saccharomyces_cerevisiae Cys GCA -GCTCGTATGGCGCAGT--GGT--AGCGCAGCAGATTGCAAATCTGTTG-------------------GTCCTTAGTTCGATCCTGAGTGCGAGCT---
D00004247 Saccharomyces_cerevisiae Cys GCA -GCTCGTATGGCGCAGT--GGT--AGCGCAGCAGATTGCAAATCTGTTG-------------------GTCCTTAGTTCGATCCTGAGTGCGAGCT---
D00000373 Schizosaccharomyces_pombe Cys GCA -GGGGTCATAGCTCAGT--GGTT-AGAGTGAGGGATTGCAGATCCCCAG-------------------GTCGCTGGTTCAAATCCGGCTGGTCCCT---
D00004252 Schizosaccharomyces_pombe Cys GCA -GGGGTCATAGCTCAGT--GGTT-AGAGTGAGGGATTGCAGATCCCCAG-------------------GTCACTGGTTCAAATCCGGTTGGTCCCT---
D00004253 Schizosaccharomyces_pombe Cys GCA -GGGGTCATAGCTCAGT--GGTT-AGAGTGAGGGATTGCAGATCCCCAG-------------------GTCGCTGGTTCAAATCCGGCTGGTCCCT---
D00004352 Takifugu_rubripes Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGC--GGC--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCAGTTCAACTCTGGGTGCCCCCT---
D00004353 Takifugu_rubripes Cys GCA -GGGGGTATATCTCAGT--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCTCTGGTTCAAATCCAGGTGCCCCCT---
D00004354 Takifugu_rubripes Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGC--GGC--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCAGTTCAAATCTGGGTGCCCCCT---
D00004355 Takifugu_rubripes Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGT--GGC--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCAGTTCAAATCTGGGTGCCCCCT---
D00004356 Takifugu_rubripes Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCTCTGGTTCAAATCCAGATGCCCCCT---
D00004357 Takifugu_rubripes Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCTCCGGTTCAAATCCGGATGCCCCCT---
D00004358 Takifugu_rubripes Cys GCA -GGGGGTATAGCTCAGT--GGT--AGAGCATTTGACTGCAGATCAAGAG-------------------GTCCCCGGTTCAAATCCGGGTGCCCCCT---
D00004359 Pan_troglodytes Cys ACA -GGGGGTATAGCTCAGG--GGGT-AGAGCAATTGACCACAGATCAAGAG-------------------GAGCCCGGTTCAAGTCCGGGTGCCCCCT---
D00000251 Acholeplasma_laidlawii Cys CTT -GCATCCATAGCTCAGTT-GGT--AGAGCAACAGACTCTTAATCTGTGG-------------------GTCCACGGTTCGAGCCCGTGTGGGTGTACCA
D00004300 Escherichia_coli_CFT073 Cys ACC -CCGCCATTAGCTCATCA-GGA--AGAGCAGACGACAACCAGGATTGTTG-------TAT-------GGTACGGGGTTCGAGGCCTCGATGGCGGTCCA
-------------------------------------------------
0      input database // 0=Leipzig, 1=UCSC, 2=Poznan, 3=testLeipzig, 4=testUCSC
D      acidType // R means tRNAs, D means tRNA genes (=tDNAs)
1      ARCHAEA_ARE_INCLUDED // 1 = yes, 0 = no
1      BACTERIA_ARE_INCLUDED
1      EUKARYOTES_ARE_INCLUDED
0      VIRUSES_ARE_INCLUDED // only for tRNA genes of database 0
0      SPECIES_ARE_SELECTED
0      numOfSpecies
       species
-----------------------------------------------------------
3      function // 0=FindLUCA,1=FindScores,2=FindNonStartAAs,3=FindNonGlobAAs,4=GlobOptimizeGroups,5=TestData
0      FIRST_AA_IS_TESTED // 1=all AAs are tested at the 1st position, 0=>see the next row
M      firstAA // only when FIRST_AA_IS_TESTED = 0
-----------------------------------------------------------
0      modified_nucleotides // 1=are distinguished (only for tRNAs), 0=not, 2=combined
0      topology // 0 = periodic code
0      aaRS_class // 0 = amino acids of both classes are included, 1 = type I, 2 = type II
1      X_IS_INCLUDED // Ini, i.e., initiation signals
1      O_IS_INCLUDED // Sup, i.e., termination signals
1      U_IS_INCLUDED // Sec, i.e., selenocisteine
1      MX_MOVE_TOGETHER // 1=Met and fMet/Met-ini move together, 0=no
1      NONSTANDARD_ASSIGNMENTS // are 0=ignored or 1=processed according to amino acids
-----------------------------------------------------------
4      numOfOptimizableGroups
2      numOfOneElementGroups
G P    oneElementGroups
1      groupWeight // vs. familyWeight=1
-----------------------------------------------------------
0      numOfNonStartAAs
       nonStartAAs
-----------------------------------------------------------
1      GLOBAL_ADAPTATION
0      numOfNonGlobAAs
       nonGlobAAs
3      globStart // numbering starts from 1
----------------------if-database=1------------------------
1      ISOTYPE_MUST_BE_BEST_MODEL
0      primary
----------------if-database=1-&-function!=1----------------
67     score cutoff min
150    score cutoff max
0      isoscore cutoff min
150    isoscore cutoff max
0      isoscore_ac cutoff min
150    isoscore_ac cutoff max
----------------if-database=1-&-function=1-----------------
0.5    scoreStep[0]  // min score
65     scoreStart[0]
110    scoreStop[0]
1      scoreStep[1]  // min isoscore
0      scoreStart[1]
0      scoreStop[1]
1      scoreStep[2]  // min isoscore_ac
0      scoreStart[2]
0      scoreStop[2]
1      scoreStep[3]  // max score
150    scoreStart[3]
150    scoreStop[3]
1      scoreStep[4]  // max isoscore
150    scoreStart[4]
150    scoreStop[4]
1      scoreStep[5]  // max isoscore_ac
150    scoreStart[5]
150    scoreStop[5]
-----------------------------------------------------------
2      NumOfMatingsAndMutations
16     numOfTrimmedClassifications 2 4 8 16 32 48 64
0      softwareBruteForce // 0 = basic level, 1,2 = more brute force
0      hardwareBruteForce // 0 = basic level, 1,2 = more brute force
-----------------------------------------------------------
0      ISOACCEPTORS //1=similarities among isoacceptor tRNAs/tDNAs are also computed, 0=no
0      isoWeight // vs. alloacceptorWeight=1   // only when ISOACCEPTORS = 1 
16     min number of assignments
15     max number of non-starting AAs
1      SAVE_DATA // save x_tRNA.txt or x_tDNA.txt on a harddisk
0      PRINT_UNRECOMMENDED_DETAILS // if function < 4, the ouput files can get too long 
-----------------if-DOMAINS_ARE_WEIGHTED=1-----------------
1      archaealWeight // default=1
1      bacterialWeight // default=1
1      eukaryoticWeight // default=1
0      virusesWeight // default=0, when some is not default or function=0, then DOMAINS_ARE_WEIGHTED=1 
0      BACTERIAL_AND_EUKARYOTIC_WEIGHTS_STAY_EQUAL // only for function = 0
-----------------------if-function=0-----------------------
1      domainStep[0]  // archaeal weight
1      domainStart[0]
3      domainStop[0]
1      domainStep[1]  // bacterial weight
1      domainStart[1]
3      domainStop[1]
1      domainStep[2]  // eukaryotic weight
1      domainStart[2]
3      domainStop[2]
1      domainStep[3]  // viral weight
0      domainStart[3]
0      domainStop[3]
-----see-the-bottom-for-a-check-of-included-positions------
0      included_parts // 0=Giege,1=E.coli,2=S.cerevisiae,3=blocks,4=Lin,5=custom
3      IE cutoff min // only when included_parts < 3		 
       =0(all), =1(identity elements (IEs)), =3(effective IEs), =5(major IEs), =10(most MIEs) 
--------------------if-included_parts=3--------------------
1      IS_ACCEPTOR_STEM
3      IECutOffMin3[0]
1      IS_D-ARM
3      IECutOffMin3[1]
1      IS_ANTICODON_ARM
3      IECutOffMin3[2]
1      IS_VARIABLE_LOOP
3      IECutOffMin3[3]
1      IS_T-ARM
3      IECutOffMin3[4]
1      IS_8th_SITE
3      IECutOffMin3[5]
1      IS_9th_SITE
3      IECutOffMin3[6]
1      IS_26th_SITE
3      IECutOffMin3[7]
1      IS_73rd_SITE
3      IECutOffMin3[8]
1      IS_74th_SITE
3      IECutOffMin3[9]
1      IS_75th_SITE
3      IECutOffMin3[10]
1      IS_76th_SITE
3      IECutOffMin3[11]
1      IS_ANTICODON
1      IS_INTERSECTION_WITH_GIEGE
0      IS_INTERSECTION_WITH_E.COLI
0      IS_INTERSECTION_WITH_S.CEREVISIAE
--------------------if-included_parts=4--------------------
0      ARE_SITES_UBIQUITOUS
0      ARE_SITES_NEAR_UBIQUITOUS
1      ARE_SITES_ISOTYPE_DISCRIMINATORS
0      ARE_SITES_CLADE_ISOTYPE_DISCRIMINATORS
0      ARE_SITES_ISOTYPE_SPECIFIC
0      ARE_SITES_TERTIARY_INTERACTING
0      ARE_SITES_A_BOX
0      ARE_SITES_B_BOX
--------------------if-included_parts=5--------------------
   11111111       Acceptor stem 5'->3' // 1 = included, 0 = excluded
11111111111       3'->5'
11111111111111111 D-arm 5'->3'
  1111            3'->5'
1111111111111     Anticodon arm 5'->3'
111111            3'->5'
1111111111111     Variable loop 5'->3'
1111111111        3'->5'
111111111111      T-arm 5'->3'
11111             3'->5'
333               a check of consistency
---------------a-check-of-included-positions---------------
Included sites of tDNAs (written only after the start of the program): 
Acceptor stem:   01111100   D-arm:00110101000001000
              00011111100           1101
Anticodon arm:0000000011111 Variable loop:1111111111111 T-arm:000000000000
              100000                      1111111111          00000
-----------------------------------------------------------